Dissertação (mestrado)-Universidade de Brasília, Departamento de Ecologia, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2011. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2011-11-11T13:28:12Z No. of bitstreams: 1 2011_AnaCarolinaGomesCorrea.pdf: 5465335 bytes, checksum: 86d5719c243423356305ff4461f84fc7 (MD5) / Approved for entry into archive by Elzi Bittencourt(elzi@bce.unb.br) on 2011-11-23T14:14:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_AnaCarolinaGomesCorrea.pdf: 5465335 bytes, checksum: 86d5719c243423356305ff4461f84fc7 (MD5) / Made available in DSpace on 2011-11-23T14:14:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_AnaCarolinaGomesCorrea.pdf: 5465335 bytes, checksum: 86d5719c243423356305ff4461f84fc7 (MD5) / A comunidade planctônica é um importante componente dos ecossistemas aquáticos lênticos e sua estruturação ocorre a partir das interações entre seus próprios membros e com diferentes comunidades, além das relações estabelecidas entre todas e o ambiente. Tendo em vista esses aspectos, o objetivo deste trabalho foi desenvolver modelos qualitativos que explicam como algumas dessas relações e as variações tróficas influenciam na dinâmica das comunidades planctônicas. Os modelos qualitativos construídos expressam as relações de causalidade entre os componentes do sistema usando a linguagem de modelagem oferecida pela Teoria Qualitativa dos Processos, uma das mais importantes abordagens em Raciocínio Qualitativo, uma área de pesquisa e desenvolvimento da Inteligência Artificial. A estrutura do sistema e as relações de causalidade entre seus componentes determinam a dinâmica das comunidades planctônicas como resultado da interação com vários fatores naturais e ações antropogênicas. A validação do modelo foi realizada com uma série histórica de dados sobre o Lago Paranoá (Brasília, DF). As simulações geradas apresentaram respostas satisfatórias e condizentes com o observado no sistema natural. Além disso, mostraram como ocorre a variação das comunidades planctônicas em diferentes estados de trofia de um reservatório, evidenciando o potencial dos modelos qualitativos para dar suporte a elucidação de problemas e gerar predições sobre o comportamento do sistema representado pela comunidade planctônica. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The plankton community is an important component of lentic aquatic ecosystems and its structure depends on the interactions involving its own elements and interactions with different communities, as well as on relations established between them and the environment. Considering these aspects, the objective of the work described here was to develop qualitative models that explain how these relationships and trophic changes influence the dynamics of planktonic communities. Qualitative models express the cause-effect relations among the system components using the modeling language provided by the Qualitative Process Theory, one of the most important approaches in Qualitative Reasoning, a research and development area of Artificial Intelligence. The structure of the system and the causal relations among its components determine the dynamics of planktonic communities as a result of the interaction with several natural and anthropogenic factors. Model validation was done with a historical series of data from the Paranoá Lake (Brasília, DF). The simulations showed satisfactory responses and in accordance with observations in the natural system. Furthermore, they demonstrated the variation of planktonic communities in different trophic states of a reservoir. This work shows the potential of qualitative models to elucidate problems and to generate predictions about the planktonic community system behavior.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2011. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2012-03-06T14:52:59Z No. of bitstreams: 1 2011_MiguelCampeloMeloFerraz.pdf: 2183258 bytes, checksum: 1c17fabbfdac60368588a51256fe7807 (MD5) / Approved for entry into archive by Marília Freitas(marilia@bce.unb.br) on 2012-03-07T12:35:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_MiguelCampeloMeloFerraz.pdf: 2183258 bytes, checksum: 1c17fabbfdac60368588a51256fe7807 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-03-07T12:35:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_MiguelCampeloMeloFerraz.pdf: 2183258 bytes, checksum: 1c17fabbfdac60368588a51256fe7807 (MD5) / Fonsecaea pedrosoi é um fungo dimórfico, caracterizado pelas formas aprofítica/reprodutiva (micélio/conídio) e infecciosa (corpos escleróticos), pertencente à família Dematiceae. Habita o solo, plantas e matéria orgânica em decomposição. Encontra-se em todos os continentes, mais comumente em regiões tropicais e subtropicais da América, Ásia e África. F. pedrosoi é o principal agente etiológico da cromoblastomicose, uma doença infecciosa crônica da pele e do tecido subcutâneo. No Brasil, essa doença é endêmica na região Amazônica. A infecção ocorre por implantação traumática transcutânea de conídios e fragmentos de hifa do fungo, acometendo principalmente trabalhadores rurais. Poucos são os dados a respeito da biologia molecular de F. pedrosoi disponíveis na literatura científica. Informações a respeito da expressão gênica são essenciais à compreensão do mecanismo de interação patógeno-hospedeiro e para o desenho de novas estratégias terapêuticas e de drogas específicas. Nesse sentido, o objetivo do presente trabalho foi a construção de uma biblioteca de cDNA de F. pedrosoi, seguido do sequenciamento de clones de cDNA dessa biblioteca e da respectiva geração de um banco de sequências expressas (ESTs, Expressed Sequence Tags). Dentre 480 ESTs analisadas, empregando ferramentas convencionais de bioinformática (pipeline disponível on-line: http://helix.biomol.unb.br/phph/index.html), 353 sequências de nucleotídeos distintas foram selecionadas segundo os parâmetros específicos estabelecidos (QV > 20 e extensão > 100 bases). Destas, 139 sequências apresentaram similaridade com sequências depositadas em banco de dados, dentre as quais destacam-se genes de transportadores de íons, transportadores de drogas, enzimas envolvidas na respiração celular, proteínas de parede celular e proteínas de choque térmico. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Fonsecaea pedrosoi is a dimorphic fungus, characterized by saprophytic/reproductive (mycelium/conidia) and infectious forms (sclerotic bodies) belonging to the family Dematiceae. Inhabits soil, plants and decaying organic matter. It is found in all continents, most commonly in tropical and subtropical America, Asia and Africa. F. pedrosoi is the major etiologic agent of chromoblastomycosis, a chronic infectious disease of the skin and subcutaneous tissue. In Brazil, this disease is endemic in the Amazon region. Infection occurs by traumatic transcutaneous implantation of conidia and hyphae fragments of the fungus, affecting mainly rural workers. There are few data regarding the molecular biology of F. pedrosoi available in scientific literature. Information on the gene expression is essential to understanding the mechanism of host-pathogen interaction and for designing new therapeutic strategies and specific drugs. Thus, the purpose of this study was to construct a cDNA library of F. pedrosoi, followed by sequencing of cDNA clones in this library and the generation of a database of expressed sequence tags (ESTs). Of 480 ESTs analyzed, using conventional tools of bioinformatics (pipeline available online: http://helix.biomol.unb.br/phph/index.html), 353 distinct nucleotide sequences were selected according to specific parameters established (QV > 20 and length > 100 bases). Of these, 139 sequences showed similarity to sequences stored in databases, among which stand out genes of ion transporters, drug transporters, enzymes involved in cellular respiration, cell wall proteins and heat shock proteins.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Química, 2011. / Submitted by Tania Milca Carvalho Malheiros (tania@bce.unb.br) on 2012-03-20T13:52:59Z No. of bitstreams: 1 2011_LuciliaZeymerAlvesCorrea.pdf: 10461549 bytes, checksum: 5e882c748c15f3ef071faa0b579dec08 (MD5) / Approved for entry into archive by Marília Freitas(marilia@bce.unb.br) on 2012-03-21T12:55:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_LuciliaZeymerAlvesCorrea.pdf: 10461549 bytes, checksum: 5e882c748c15f3ef071faa0b579dec08 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-03-21T12:55:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_LuciliaZeymerAlvesCorrea.pdf: 10461549 bytes, checksum: 5e882c748c15f3ef071faa0b579dec08 (MD5) / O vírus da imunodeficiência humana infecta linfócitos T, que possuem o receptor CD 4 na membrana plasmática. Inicialmente, o CD 4 é responsável pela entrada do vírus na célula hospedeira. Em um segundo momento, ocorre a modulação negativa do CD 4 pela proteína auxiliar Nef do vírus HIV-1, o que possibilita a saída do vírus para infectar outra célula. O antibiótico Ikarugamicina impede a modulação negativa do CD4 pela proteína auxiliar Nef e reestabelece o nível de CD 4 na membrana plasmática, mas é citotóxico em testes in vitro. Inibidores da proteína auxiliar Nef vêm sendo amplamente estudados como possíveis fármacos para o tratamento antirretroviral. O objetivo deste trabalho é a síntese de possíveis inibidores da proteína auxiliar Nef do vírus HIV -1. A partir de estudos de interação molecular, propusemos a síntese de seis moléculas, que contêm os grupos 3-amino-1,2,4-triazol, uracila ou 1,2,3-triazol, como possíveis inibidores da proteína auxiliar Nef do vírus HIV-1. Após análise retrossintética, diversas rotas foram propostas para a síntese das moléculas. Após várias tentativas de síntese, não se obteve sucesso na síntese da molécula com o grupo 3-amino-1,2,4-triazol, e da molécula com o grupo uracila. Um total de quatro moléculas contendo o anel 1,2,3-triazólico foram sintetizadas por rota sintética direta, obtendo-se excelentes rendimentos. A síntese envolveu a preparação do grupo azida, seguida por reação de Huisgen – reação click – e acoplamento com DCC/DMAP. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The human immunodeficiency virus infects T lymphocytes that have the CD4 receptor on the plasma membrane. Initially, CD4 is responsible for virus entry into the host cell. In a second stage, the CD 4 downregulation by the auxiliary protein of HIV-1 Nef occurs, allowing the exit of the virus to infect another cell. The antibiotic Ikarugamycin prevents downregulation of CD 4 by the Nef auxiliary protein and restores the level of CD4 at the plasma membrane, but in vitro tests it is cytotoxic. Nef inhibitors have been investigated as potential drugs for antiretroviral treatment. The aim of this work is the synthesis of potential inhibitors of auxiliary protein HIV-1 Nef. Based on studies of molecular interaction we proposed the synthesis of six molecules, which contain the groups 3-amino-1,2,4-triazole, 1,2,3-triazole or uracil as potential inhibitors of the auxiliary protein HIV -1 Nef. After retrosynthetic analysis, several routes have been proposed for the synthesis of these molecules. Several attempts to synthesize molecules with the 3-amino-1,2,4-triazole and uracil groups, were performed without success. The molecules containing 1,2,3-triazole ring were synthesized by a direct synthetic route with excellent yields. The synthesis involved the preparation of the azide group, followed by the Huisgen reaction – click reaction – and DCC/DMAP coupling.

Dissertação (mestrado)-Universidade de Brasília, Programa de Pós-Graduação em Patologia Molecular, 2011 / Submitted by Jaqueline Ferreira de Souza (jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-03-29T12:38:55Z No. of bitstreams: 1 2011_TatianeAraujoCosta.pdf: 899665 bytes, checksum: e7e2f53d213af3d0544e32927e5f28f7 (MD5) / Approved for entry into archive by Elzi Bittencourt(elzi@bce.unb.br) on 2012-03-29T14:31:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_TatianeAraujoCosta.pdf: 899665 bytes, checksum: e7e2f53d213af3d0544e32927e5f28f7 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-03-29T14:31:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_TatianeAraujoCosta.pdf: 899665 bytes, checksum: e7e2f53d213af3d0544e32927e5f28f7 (MD5) / Paracoccidioides brasiliensis, agente etiológico da paracoccidioidomicose, é um fungo termodimórfico e sua patogenicidade está ligada ao processo de transição dimórfica e a alterações na parede celular. Em P. brasiliensis, os principais polímeros que compõem a parede celular são a 1,3-?-glicana e a 1,3-?-glicana, responsáveis pela forma e integridade estrutural. Neste estudo investigou-se a região promotora do gene de 1,3-?-glicana sintase (PbFKS1). Foram encontrados na região regulatória de PbFKS1 dois sítios consensuais para a ligação do fator transcricional CreA, envolvido na repressão por glicose, e dois sítios de interação para o fator PacC, relacionado à regulação da expressão gênica mediada pelo pH extracelular em fungos. Experimentos de retardo de mobilidade eletroforética (EMSA) foram realizados com três sondas fluorescentes distintas: Pbfks1 (I), que apresenta um dos sítios CreA; Pbfks1 (II), que representa um sítio para PacC e Pbfks1 (III), na qual estão presentes um sítio para CreA e um sítio para PacC espaçados por sete nucleotídeos. Foram empregados, nos experimentos de EMSA, proteínas recombinantes contendo os domínios de ligação ao DNA de CreA e de PacC fusionados à glutationa-S-transferase, e extratos protéicos totais de P. brasiliensis nas fases de micélio e de levedura, crescido em pH ácido (5,0), neutro (7,0) ou alcalino (9,0). Os resultados de EMSA indicaram que os sítios de CreA do gene PbFKS1 não foram reconhecidos pela proteína rCreA-GST. Quando da incubação com extratos protéicos totais obtidos de células leveduriformes ou miceliais, houve a formação de complexos DNA-proteína, mas esses não envolviam o sítio de reconhecimento de CreA. Os experimentos realizados com as duas sondas que apresentam o motivo de reconhecimento de PacC indicaram a formação de complexos entre a proteína rPacC-GST e o motivo de reconhecimento específico. Os ensaios feitos com extratos protéicos totais resultaram na detecção de interação DNA-proteína específica no sítio PacC apenas na forma de levedura, cultivada em pH neutro ou alcalino. Os dados obtidos nesse trabalho indicam que o fator transcricional PacC possa estar envolvido na regulação da expressão do gene PbFKS1 quando do crescimento leveduriforme, forma celular em que ocorre no hospedeiro infectado. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Paracoccidioides brasiliensis, the etiological agent of paracocciodioidomycosis, is a thermodimorphic funjgs. Pathogenicity is linked to modifications of the cell wall during the dimorphic transition. P. brasiliensis major cell wall polymers are 1,3-β-glican and 1,3-α-glican, which are responsible for structural form and integrity. In this study the promoter region of the 1,3-β-glican synthase (PbFKS1) gene was investigated. In the PBFKS1 regulatory region we found two consensus binding sites for the CreA transcription factor PacC, which is related to the gene expression regulation mediated by extracellular ph in fungi. Electrophoretic mobility shift assays (EMSAs) were performed with tree distinct fluorescent probes: Pbfs1 (I), which presents one of the CreA recognition sites; Pbfs1 (I), wich represents a PacC are spaced by binding site; and Pbfks 1 (III), in wich one site for CreA and one for PAcC are spaced by seven nucleitides. For the EMSAs, we employed recombinant proteins containing the CreA or the PacC DNA-binding domaun fused to glutathione-S-transfere (rCreA-GST and rPacC-GST, respectively), as well as total proteins extractus obtained from P. brasiliensis mycelium and yeast cells grown in acidic (5.0), neutral (7.0) or alkaline (9.0) Ph. EMSAs results indicated that the CreA binding sites present in the PbFKS1 gene regulatory region were not recognized by the rCreA-GST protein. When probes were incubated with total protein extracts obtained either from yeast or mycelium cells, DNA-protein complxes were formed ; nevertheless, these complexes did not invole the CreA specific recognition site.Experiments performed with the two PacC probes indicated the formation of complexes between rPacC-GST and the Specific DNA_protein interactions in the PAcC binding site only in the yeast phase grown in neutral or alkaline ph.The data obtained in the work indicative that the transcriptions factor PacC can be involved in the regulations of PbFSk1 gene expression during the yeast phase growth, which is the cell form that occurs in the infected host.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2011. / Submitted by Tania Milca Carvalho Malheiros (tania@bce.unb.br) on 2012-03-26T13:07:53Z No. of bitstreams: 1 2010_ClaudioJoseOliveiraSouza_Parcial.pdf: 391277 bytes, checksum: cd10f63fe321539df90cc7a62492c131 (MD5) / Rejected by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br), reason: on 2012-03-26T15:29:10Z (GMT) / Submitted by Tania Milca Carvalho Malheiros (tania@bce.unb.br) on 2012-03-26T16:34:28Z No. of bitstreams: 1 2011_JorgeWilliamArboledaValencia_Parcial.pdf: 305137 bytes, checksum: d980502aca4c6f93fd3f9a478bcda6aa (MD5) / Approved for entry into archive by Elzi Bittencourt(elzi@bce.unb.br) on 2012-03-29T14:50:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_JorgeWilliamArboledaValencia_Parcial.pdf: 305137 bytes, checksum: d980502aca4c6f93fd3f9a478bcda6aa (MD5) / Made available in DSpace on 2012-03-29T14:50:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_JorgeWilliamArboledaValencia_Parcial.pdf: 305137 bytes, checksum: d980502aca4c6f93fd3f9a478bcda6aa (MD5) / A biotecnologia visa atender inúmeros problemas que afetam a humanidade e para isto muitas moléculas devem ser exploradas como ferramentas para construir soluções alternativas. Metabólitos como os produzidos por fungos apresentam geralmente duplicidade de ação, o que permite explorar seu potencial uso em aplicações industriais em diferentes áreas, como farmacologia, agroindústria, bioprocessos, tecnologia ambiental e bioconversão. Com o objetivo de estabelecer o potencial dos metabólitos produzidos pelo fungo Beauveria bassiana, toxinas puras (beauvericina, basianina, tenellina, oosporeina) e extratos brutos foram testados em diferentes ensaios de atividade citotóxica e antimicrobiana. Os resultados mostram que a produção de beauvericina (BEA) foi significativamente diferente entre todos os isolados e sugerem uma ativa participação desses metabólitos na morte do inseto, mostrando diferenças estatisticamente significativas entre a CC50 de BEA sobre a linhagem celular Spodoptera frugiperda SF-9 (2,81 e 6,94 μM) e os valores das outras micotoxinas (4,23 - 11,95 μM). Adicionalmente, demonstrou-se o efeito no desenvolvimento da ferrugem e redução na germinação. Todos os tratamentos dos metabólitos puros e dos extratos brutos provenientes do crescimento do fungo B. bassiana apresentaram efeitos inibitórios sobre as diferentes espécies de bactérias utilizadas nos ensaios mostrando atividade bactericida contra o gênero Proteus sp. e bacteriostática sobre os gêneros Staphylococcus sp., Klebsiella sp., Salmonella sp .e E. coli. Da mesma forma, as enzimas digestivas β-glicosidases e Leucina-aminopeptidase (LAP) da broca gigante da cana-de-açúcar Telchin licus licus foram estudadas visando o controle da praga. Os resultados mostraram que as β–glicosidases da broca possuem uma Km e Vmax para p-nitrofenil-β-D-glicopiranosídeo (pNβG) de 1,74 mM e 0,005 mmol/min/mg de proteína respectivamente, a melhor atividade da enzima foi encontrada com pH 6,0 e 7,0 e temperatura entre 50 e 55° C. Do mesmo modo, demonstrou-se o efeito de diferentes inibidores e ativadores da enzima, registrando para Mg2+ o maior incremento em atividade. Na comparação da atividade especifica de LAPs com outros insetos, Hypothenemus hampei mostrou a maior atividade. T. licus licus possui 3 isoformas da enzima que são inibidas completamente com bestatin 0,1 mM a pH 7,0. Adicionalmente, um completo estudo da atividade holocelulase do fungo Schizophyllum commune demonstrou o efeito indutor do carboximetilcelulose (CMC) 1% e das diferentes fontes de carbono na produção das enzimas, aparentes Km e Vmax para pNβG das β–glicosidases de 0,303 mM e 0,504 mmol/min/mg de proteína, a melhor atividade da enzima foi a temperatura entre 50 - 60˚ C e pH 7,0. Finalmente, usando microscopia eletrônica de varredura (MEV) o mecanismo físico usado pelo fungo para degradar bambu (Guadua angustifolia) foi observado e o potencial dos metabólitos produzidos avaliado. Os dados aqui apresentados constituem uma valiosa ajuda no desenho de estratégias voltadas a geração de plantas resistentes aos insetos-praga estudados, na busca de novos compostos antibacterianos e no aproveitamento de resíduos lignocelulósicos para produção de álcool de segunda geração. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Biotechnology aims to address several problems affecting mankind. For this reason, many molecules should be explored as tool to develop new alternatives solutions. Metabolites produced by fungi have usually double action, which allow approach theirs potentials use in different industrial applications in areas such as pharmacology, agroindustry, bioprocess, environmental technology and bioconversion. In order to establish the potential of metabolites from Beauveria bassiana fungus, the cytotoxicity and antimicrobial activity of pures toxins (beauvericin, bassianin, tenellin, oosporein) and crude extracts were tested. The results show that beauvericin (BEA) production was significantly different among all isolates and suggest an active participation of these metabolites in the insect’s death. Statistical difference was found when BEA CC50 values on cell line Spodoptera frugiperda SF-9 (2.81 and 6.94 μM) were compared with those values from others mycotoxins (4.23 - 11.95 μM). Additionally, it was shown an effect on the development of rust, and reduced germination. All treatments of pure metabolites and crude extracts from B. bassiana growth showed inhibitory effects on different species of bacteria used in bioassays, showing bactericidal activity on the genus Proteus sp. and bacteriostatic effect on the genus Staphylococcus sp., Klebsiella sp., Salmonella sp. and E. coli. Likewise, digestive enzymes β-glucosidases and Leucine aminopeptidase (LAP) from sugarcane giant borer Telchin licus licus were studied in order to control the insect pest. The results showed apparent Km and Vmax towards p-nitrophenyl-β-D-glucopyranoside of 1.74 mM and 0.005 mmol/min/mg of protein respectively for β-glucosidases, the highest enzyme activity resulted with pH between 6.0 and 7.0 and temperature between 50 e 55 °C. Besides, it was shown an effect of activators and inhibitors on the enzyme with major increments with Mg2+. The LAP specific activity was compared among different insects and Hypothenemus hampei exhibited the highest activity. T. licus licus has three isoforms that are inhibited completely with 0.1 mM bestatin at pH 7.0. Finally, a complete study of holocellulase activity from Schizophyllum commune fungus showed inducing effect of 1% carboxymethyl-cellulose CMC and different carbon sources on enzyme production. Km and Vmax towards p-nitrophenyl-β-D- glucopyranoside (pNβG) of β-glucosidases were 0.303 mM and 0.504 mmol / min / mg protein respectively, the highest enzyme activity resulted with temperature between 50 - 60˚ C and pH 7.0. Finally, by using scanning electron microscopy (SEM), the physical mechanism used by the fungus to degrade bamboo (Guadua angustifolia) was observed and the potential of metabolites produced was evaluated. The data presented here constitute a valuable contribution in the design of strategies to generate plants resistant to insect pests, in search of new antibacterial compounds and the use of lignocellulosic residues for production of second generation biofuels.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2013. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-11-22T10:58:25Z No. of bitstreams: 1 2013_DaniloEliasdeOliveira.pdf: 310730292 bytes, checksum: 2a326f5fcd6c066d5969086f18300988 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-11-26T13:13:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_DaniloEliasdeOliveira.pdf: 310730292 bytes, checksum: 2a326f5fcd6c066d5969086f18300988 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-11-26T13:13:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_DaniloEliasdeOliveira.pdf: 310730292 bytes, checksum: 2a326f5fcd6c066d5969086f18300988 (MD5) / Muitas espécies de cupins ainda apresentam uma identificação difícil, devido, em grande parte, à ausência de revisões taxonômicas. Esse certamente é o caso das espécies do grupo Velocitermes. No presente estudo é apresentada a revisão taxonômica do grupo Velocitermes, que atualmente compreende os gêneros neotropicais Ngauratermes, Diversitermes e Velocitermes, sendo consideradas como válidas 18 espécies, incluindo uma fóssil. Foram examinadas cerca de 1500 amostras oriundas de quase todos os países da região Neotropical, especialmente o Brasil. São apresentadas a revalidação do gênero Uniformitermes, tendo Ngauratermes como sinônimo júnior; a descrição de seis espécies novas; a transferência de D. aporeticus para o gênero Velocitermes; e de V. laticephalus e V. barrocoloradensis para o gênero Uniformitermes. São propostas cinco novas sinonímias: Eutermes strelnicovi é considerado sinônimo júnior de D. diversimiles; D. needhami é considerado sinônimo júnior de V. heteropterus; D. eidmanni é considerado sinônimo júnior de D. castaniceps; V. paucipilis é considerado sinônimo júnior de V. melanocephalus; e N. arue é considerado sinônimo júnior de U. laticephalus, combinação nova. São apresentados mapas de distribuição e informações sobre a biologia de todas as espécies. São descritas, medidas e ilustradas todas as castas e subcastas conhecidas. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The identification of many termite species is still difficult due, mostly, to the lack of taxonomic revisions. This is certainly the case of species of Velocitermes group. In this work is shown the taxonomic revision of Velocitermes group, composed by the Neotropical genus Ngauratermes, Diversitermes and Velocitermes. 18 species are considered as valid, including a fossil species. It was examined about 1,500 samples from almost every country of Neotropical region, especially from Brazil. It is proposed the revalidation of the Uniformitermes genus, being the genus Ngauratermes considered the junior synonym; the description of six new species; the transference of D. aporeticus to Velocitermes; and V. laticephalus and V. barrocoloradensis to the Uniformitermes genus. It is proposed five new synonyms: Eutermes strelnicovi is considered junior synonym of D. diversimiles; D. needhami is considered junior synonym of D. castaniceps; V. paucipilis is considered junior synonym of V. melanocephalus; and N. arue is considered junior synonym of U. laticephalus, new combination For every species, are presented distribution maps and biological informations. All known castes and sub-castes are described, mesured and illustrated.

Os hidrocarbonetos aromáticos policíclicos (HAPs) são compostos mutagênicos e carcinogênicos aos humanos e aos animais que são introduzidos no ambiente em grandes quantidades, devido às atividades relacionadas à extração, ao transporte, ao refino, à transformação e à utilização do petróleo e de seus derivados. A utilização de enzimas para a biodegradação HAPs em efluentes líquidos é uma tecnologia promissora, porém existem vários problemas práticos na utilização das enzimas na forma livre, entre eles a instabilidade da sua estrutura. Diversos métodos têm sido desenvolvidos para aumentar a estabilidade enzimática, sendo a técnica de imobilização a de maior sucesso. Esse trabalho teve como objetivos obter e determinar as condições ambientais que interferem na atividade das enzimas, livres e imobilizadas, de degradação dos HAPs. Isolados de Mycobacterium fortuitum, de Gordonia polyisoprenivorans e de Naphtalene-utilizing bacterium foram crescidos em meio mineral e caldo LB contendo 250 mg L-1 antraceno ou fenantreno e suas células rompidas por sonicação. Com o extrato celular livre e imobilizado em alginato de sódio determinou-se as condições ótimas de pH (4,0-9,0, nos tampões acetato, fosfato e tris-HCl), de temperatura (5-80ºC) e de tempo de reação (10-90 min.) para as enzimas catecol 1,2-dioxigenase (C1,2O), catecol 2,3-dioxigenase (C2,3O) e protocatecol 3,4-dioxigenase (P3,4O). Avaliou-se também o efeito do Cu2+, Mg2+, Hg2+, Mn2+, Fe3+, K+ e NH4+ na atividade destas enzimas. Para a obtenção das enzimas, o caldo LB foi mais eficiente. A enzima C1,2O presente no extrato celular de M. fortuitum e de G. polyisoprenivorans apresentou maior atividade em pH 8,0 a 25ºC e manteve esta atividade durante 60min. A enzima C2,3O presente no extrato celular de M. fortuitum e G. polyisoprenivorans apresentou maior atividade em pH 7,0 a 30 e 35ºC e manteve esta atividade durante 90min. A enzima P3,4O apresentou maior atividade em pH 8,0 a 35ºC e manteve esta atividade durante 60min. O Fe3+ e Mn2+ aumentaram a atividade das três enzimas. A atividade das três enzimas foi reduzida na presença dos íons Cu2+, Mg2+, Hg2+, K+ e NH4+, com exceção da enzima C1,2O que apresentou aumento de atividade na presença de Hg2+. O extrato celular imobilizado contendo as enzimas C1,2O, C2,3O e P3,4O apresenta maior estabilidade às variações de pH, temperatura, tempo de reação, em relação ao extrato celular livre. / The polycyclic aromatical hydrocarbons (HAPs) are mutagenic and carcinogenic composites to the human beings and the animals that are introduced in the environment in great amounts, to its activities related to the extraction, the transport, the refining, the transformation and the use of the oil and of its derivatives. The enzyme use for the biodegradation HAPs in effluent liquids is a promising technology, however some practical problems in the use of enzymes in its free form exist, between them the instability of its structure. Many methods have been developed to increase the enzymatic stability, being the technique of immobilization of greater success. This work had as objective to get and to determine the environmental conditions that intervene with the enzymes activity, free and immobilized, of HAPS degradation. Isolated of Mycobacterium fortuitum, of Gordonia polyisoprenivorans e of Naphthalene-utilizing bacterium had been grown in half mineral and 250 broth LB I contend mg L anthracene or -1phenanthrene e its cells breached for sonication. With the free and immobilized cellular extract in alginate of sodium one determined the excellent conditions of pH (4,0-9,0, in the drain plugs acetate, phosphate and tris-HCl), of temperature (5-80ºC) and time of reaction (10-90 min.) for enzymes catechol 1,2-dioxigenase (C1,2O), catechol 2,3-dioxigenase (C2,3O) and protocatechol 3,4-dioxigenase (P3,4O). It was also evaluated the effect of the Cu, Mg, Hg, Mn, Fe, Ke NH in the activity of these enzymes. For the attainment of enzymes, broth LB was more efficient. Present enzyme C1,2O in the cellular extract of M. fortuitum e of G. polyisoprenivorans 25ºC presented greater activity in pH 8,0 and kept this activity during 60min. Present enzyme C2,3O in the cellular extract of M. fortuitum e G. polyisoprenivorans presented greater activity in pH 7,0 the 30 and 35ºC and kept this activity during 90min. Enzyme P3,4O presented greater activity in pH 8,0 35ºC and kept this activity during 60min. The Fe e Mn had increased the activity of three enzymes. The activity of three enzymes was reduced in the presence of ions Cu, Mg, Hg, Ke NH, with exception of enzyme C1,2O that presented increase of activity in the presence of Hg. The immobilized cellular extract having enzymes C1,2O, C2,3O and P3,4O present greater stability to the variations of pH, temperature, reaction time, comparing to the free cellular extract.

Considerando à lacuna sobre as informações da biologia reprodutiva dos crustáceos de água doce no Brasil, principalmente dos lagostins, a presente pesquisa teve como objetivo caracterizar aspectos da dinâmica da reprodução, como a descrição e desenvolvimento das gônadas, e analisar as variações bioquímicas do metabolismo intermediário de Parastacus varicosus Faxon, 1898 para relacioná-las ao período reprodutivo. Os animais foram amostrados de junho de 2004 a maio de 2005 em um arroio pertencente à Bacia do Rio Gravataí, localidade Cova do Touro, Gravataí, Rio Grande do Sul. As fêmeas foram separadas em três estágios gonadais de acordo com a maturação. Todos animais apresentaram os dois pares de aberturas e dutos genitais. Foram identificados histologicamente 40 machos, 32 fêmeas e 6 espécimes transicionais. Os índices gonadossomático (IG) e hepatossomático (IH) foram determinados. Ocorreu um aumento do IG e uma diminuição no IH, no período de passagem da primavera para o verão, indicando uma maior atividade reprodutiva no verão e uma possível transferência das reservas do hepatopâncreas para a gônada nesse período. Nas análises bioquímicas da hemolinfa, hepatopâncreas, músculo e gônadas os níveis de glicose, glicogênio, proteínas totais, colesterol e lipídeos totais foram quantificados. As variações sazonais observadas mostraram estar relacionada com o período reprodutivo, mostrando uma transferência de parte das reservas energéticas do hepatopâncreas e do músculo para o desenvolvimento das gônadas durante período reprodutivo. Nessa pesquisa portanto foi observada uma correlação entre os resultados obtidos das investigações das gônadas e das análises bioquímicas indicando assim uma conexão entre essas pesquisas e contribuindo para um melhor entendimento da biologia reprodutiva de P. varicosus.

As mucopolissacaridoses (MPS) constituem um grupo de doenças lisossômicas caracterizadas pela deficiência de uma das enzimas responsáveis pela degradação das glicosaminoglicanos. A expressão neurológica da doença varia de acordo com cada deficiência enzimática, mas o retardo mental é característico da MPS III e de formas graves das MPS I, II e VII. Vários estudos com ressonância magnética (RM) demonstraram que atrofia cerebral, lesões na substância branca (SB) e hidrocefalia são freqüentemente observados em pacientes com MPS. Entretanto a correlação entre a RM, anormalidades bioquímicas e gravidade do quadro neurológico ainda não foi descrita na literatura. Além disso, a comparação dos achados de espectroscopia de prótons por RM (ERM) com a RM convencional é desconhecida. O objetivo deste trabalho foi analisar a aplicação da RM e da ERM na investigação de pacientes com MPS. Sessenta crianças com MPS tipos I, II, IV e VI foram avaliadas com RM e ERM. Os resultados foram comparados com tempo de doença, anormalidades bioquímicas e disfunção cognitiva. Os exames de RM foram realizados em equipamento de alto campo magnético (1.5 T). Pacientes com maior tempo de doença tiveram mais lesões na SB. A atrofia cerebral e o grau de dilatação ventricular não foram afetados pelo tempo de doença ou idade dos pacientes. Pacientes com MPS II e disfunção cognitiva apresentaram maior atrofia cerebral, hidrocefalia, lesões mais severas na substância branca e aumento da relação mioinositol/creatina na ERM. Estas informações podem ser úteis para o melhor entendimento da fisiopatogenia das MPS e do papel da RM na sua investigação. / The mucopolysaccharidosis are a group of lysosomal diseases characterized by enzymatic deficiency which leads incomplete degradation of glycosaminoglycans. Neurological expression varies according to each enzyme but mental compromise is characteristic of MPS III and the severe forms of MPS I, II and VII. Studies with magnetic resonance imaging (MRI) demonstrated that brain atrophy, white matter (WM) lesions and hydrocephalus are common in MPS patients. However, correlation among MRI, biochemical changes and severity of neurological deficit was not published so far. In addition, comparison between MR spectroscopy (MRS) and MRI is controversial. The purpose of this study was to analyze MRI and MRS findings in MPS patients. Sixty patients with MPS types I, II, IV and VI were evaluated with MRI and MRS. Results were compared with disease duration, biochemical changes and cognitive impairment. MRI exams were performed in high field MRI scanner (1.5 T). Patients with longer disease duration had more WM lesions. Brain atrophy and hydrocephalus were not affected by disease duration or patient´s age. Patients with MPS II and cognitive impairment had more brain atrophy, hydrocephalus, severe WM lesions and elevated myoinositol/creatine at MRS. These results can be useful to better understand the pathogenic process and to increase the applicability of MRI in the disease investigation.

Tuberculosis (TB) is a neglected disease, which continue to be major cause of morbidity and mortality worldwide, killing together around 5 million people each year. Mycolic acids, the hallmark of mycobacteria, are high-molecular-weight α-alkyl, β-hydroxy fatty acids. Biochemical and genetic experimental data have shown that the product of the M. tuberculosis inhA structural gene (InhA) is the primary target of isoniazid mode of action, the most prescribed anti-tubercular agent. InhA was identified as an NADH-dependent enoyl-ACP(CoA) reductase specific for long-chain enoyl thioesters and is a member of the Type II fatty acid biosynthesis system, which elongates acyl fatty acid precursors of mycolic acids. M. tuberculosis is a target for the development of anti-tubercular agents. Here we present a brief description of the mechanism of action of, and resistance to, isoniazid. In addition, data on inhibition of mycobacterial enoyl reductase by triclosan are presented. We also describe recent efforts to develop inhibitors of M. tuberculosis enoyl reductase enzyme activity.