Cette recherche vise l'évaluation de la fluorescence induite par UV pour la discrimination en temps réel des mauvaises herbes dans un contexte d'application localisée d'herbicides. Des spectres de fluorescence ont été acquis sur de jeunes plants vivants de 3 groupes : (1) maïs, mauvaises herbes (2) monocotylédones et (3) dicotylédones. La dimensionnalité des spectres a été réduite par analyse en composante principale. Les composantes principales ont servies à développer des modèles discriminants (analyse linéaire discriminante et méthode SEVICA) pour classifier les plantes selon 3 groupes. Les résultats ont montré que la variabilité intragroupe associée à l'âge des plants et la position de la mesure sur le plant est nettement inférieure à la variabilité intergroupe. Globalement, le classement en 3 groupes a été réalisé avec un taux de succès de 93%. La fluorescence induite présente donc un bon potentiel pour la discrimination en temps réel entre plante cultivée et mauvaises herbes.

Malgré les demandes pour l’intégration de préoccupation sociétales dans les processus d’homologation des aliments dérives de la biotechnologie (ADB), la plupart des cadres réglementaires à l’échelle internationale s’identifient avec la représentation scientifique du risque. Cette représentation considère comme un risque tout événement négatif susceptible d’atteindre la santé humaine ou animale, ou l’environnement. Lors des processu d’homologation, les évaluateurs du risque et les décideurs se concentrent notamment sur ce trois types de risques. D’autres considérations comme la justice sociale, la sécurité alimentaire, les impacts économiques sur les agriculteurs sont, entre autres, négligées. Nonobstant, les évaluateurs du risque ou les décideurs canadiens peuvent-ils se montrer ouverts à tenir compte d’une ou plusieurs de ces considérations et cela malgré le fait que le cadre réglementaire canadien s’aligne avec la représentation scientifique du risque? À partir d’une série d’entrevues, deux caractéristiques de la culture organisationnelle (CO) de ces fonctionnaires étaient identifiées. Il s’agit des rapports à l’autorité et à la vérité. Le rapport à l’autorité des évaluateurs du risque se caractérise pour un respect absolu du cadre réglementaire canadien. Ils se montrent ainsi pas ou peu disposés à agir en dehors des termes du cadre. Dissemblablement, les décideurs sont plus flexibles notamment en raison de son obligation de protéger d’autres objectifs en même temps que la santé humaine et animale, et l’environnement. Le rapport à la vérité des évaluateurs du risque est constitué notamment par la science. Ainsi, l’existence d’un risque est déterminée uniquement à travers des preuves scientifiques. Le rapport à la vérité des décideurs est beaucoup plus large. En effet, ils établissent ce qu’est la vérité non seulement à l’aide de la science mais aussi avec d’autres informations fournies par les acteurs politiques. La CO de ces fonctionnaires fédéraux permet de conclure qu’au Canada, les évaluateurs du risque se concentreront uniquement dans l’identificacion des risques pour la santé humaine ou animale et pour l’environnement. Contrairement les décideurs se monteront ouverts à tenir compte de certaines préoccupations sociétales mais de manière indirecte. Ce faisant, le Canada peut encore se vanter de respecter ses engagements et obligations au niveau international. / Despite calls for the integration of societal concerns in the approval process of genetically modified (GM) foods, most regulatory frameworks internationally identify with scientific representation of risk. This representation considers as a risk any negative event that could reach human or animal health or the environment. During approval process, risk assessors and decision makers focus especially on these three types of risk. Other considerations such as social justice, food security, economic impacts on farmers among others are neglected. Nevertheless, can Canadian risk assessors or decision-makers be open to take into account one or more of these considerations and it despite the fact that the Canadian regulatory framework aligns with scientific representation of risk? From a series of interviews, two features of the organizational culture (OC) of these officials were identified: authority relationship and assumptions about truth. The authority relationship of risk assessors is characterized by an absolute compliance with the Canadian regulatory framework. They show little or no inclination to act beyond the powers conferred by the regulatory framework. Although decision-makers are also required to abide the Canadian regulatory framework, they are more flexible notably because of their obligation to protect other objectives at the same time that human and animal health and the environment. The assumptions about truth of risk assessors are notably constituted by the science. Thus, the existence of a risk is determined solely through scientific evidence. For the decision-makers their assumptions about truth are much broader than that of risk assessors. Indeed, they establish what is the truth not only by means of the science but also with the other information provided by the political actors. The OC of these federal civil servants allows to conclud that in Canada, the risk assessors will concentrate only in the identification of risk for human or animal health and for environment. Contrary, the decision makers will amount open to take into account certain societal concerns in an indirect way. In doing so, Canada can still boast to meet its commitments and obligations at the international level.

No description available.

No description available.

Zugl.: Bern, Univ., Diss., 2007

No description available.

Background Hematopoietic stem cells located in the bone marrow interact with a specific microenvironment referred to as the stem cell niche. Data derived from ex vivo co-culture systems using mesenchymal stromal cells as a feeder cell layer suggest that cell-to-cell contact has a significant impact on the expansion, migratory potential and ‘stemness’ of hematopoietic stem cells. Here we investigated in detail the spatial relationship between hematopoietic stem cells and mesenchymal stromal cells during ex vivo expansion. Design and Methods In the co-culture system, we defined three distinct localizations of hematopoietic stem cells relative to the mesenchymal stromal cell layer: (i) those in supernatant (non-adherent cells); (ii) those adhering to the surface of mesenchymal stromal cells (phase-bright cells) and (iii) those beneath the mesenchymal stromal cells (phase-dim cells). Cell cycle, proliferation, cell division and immunophenotype of these three cell fractions were evaluated from day 1 to 7. Results Phase-bright cells contained the highest proportion of cycling progenitors during co-culture. In contrast, phase-dim cells divided much more slowly and retained a more immature phenotype compared to the other cell fractions. The phase-dim compartment was soon enriched for CD34+/CD38− cells. Migration beneath the mesenchymal stromal cell layer could be hampered by inhibiting integrin β1 or CXCR4. Conclusions Our data suggest that the mesenchymal stromal cell surface is the predominant site of proliferation of hematopoietic stem cells, whereas the compartment beneath the mesenchymal stromal cell layer seems to mimic the stem cell niche for more immature cells. The SDF-1/CXCR4 interaction and integrin-mediated cell adhesion play important roles in the distribution of hematopoietic stem cells in the co-culture system.

Le champ de la recherche scientifique et de la formation à la recherche est traversé depuis quelques dizaines d'années par plusieurs courants et discours associés au changement, mais peu de travaux empiriques permettent de comprendre ce qui change concrètement. C'est la contribution originale de cette thèse au champ de l'éducation, plus spécifiquement à l'étude sociologique de l'enseignement supérieur où sont concentrées les activités liées à la triade thématique du programme doctoral dans lequel elle a été produite : recherche, formation et pratique. L'enquête-terrain a été réalisée en 2009 et 2010 auprès de 808 répondants affiliés à 60 établissements au Québec et a produit un vaste matériau de nature mixte (données quantitatives et qualitatives). Un portrait de la nébuleuse biotechnologique qui touche les secteurs des sciences de la santé, des sciences naturelles et du génie a été réalisé. Ce domaine concerne des dizaines de disciplines et se révèle de nature transdisciplinaire, mais les pratiques n'y sont pas davantage marquées par le changement que celles d'autres domaines connexes. Les dynamiques sociales ont fait l'objet d'analyses comparatives dans quatre contextes: le choix des programmes, des objets et des méthodes, le financement, la diffusion et la planification de la carrière. Les résultats indiquent que les échanges entre les agents traditionnellement situés au coeur des activités de recherche dominent ces dynamiques dans tous les contextes étudiés. L'étude des représentations au fondement des pratiques a révélé l'existence de trois écoles de pensée qui coexistent dans le champ scientifique: académique, pragmatique et économiste. Ces écoles permettent de catégoriser les agents en fonction des zones de fractures qui marquent leurs oppositions tout en identifiant ce qu'ils ont en commun. Les représentations et les pratiques liées à la formation témoignent d'un habitus plutôt homogène, alors que les contradictions semblent plus souvent ancrées dans des luttes universitaires que scientifiques, concentrées sur la négociation du capital scientifique, symbolique et économique en jeu dans la formation doctorale, dans les carrières auxquelles elle mène, et dans les qualités du titre de Ph.D. Au final, la confusion entre des logiques opposées peut être réduite en réinterprétant le changement comme tradition du champ scientifique.

Background The automated retrieval and integration of information about protein point mutations in combination with structure, domain and interaction data from literature and databases promises to be a valuable approach to study structure-function relationships in biomedical data sets. Results We developed a rule- and regular expression-based protein point mutation retrieval pipeline for PubMed abstracts, which shows an F-measure of 87% for the mutation retrieval task on a benchmark dataset. In order to link mutations to their proteins, we utilize a named entity recognition algorithm for the identification of gene names co-occurring in the abstract, and establish links based on sequence checks. Vice versa, we could show that gene recognition improved from 77% to 91% F-measure when considering mutation information given in the text. To demonstrate practical relevance, we utilize mutation information from text to evaluate a novel solvation energy based model for the prediction of stabilizing regions in membrane proteins. For five G protein-coupled receptors we identified 35 relevant single mutations and associated phenotypes, of which none had been annotated in the UniProt or PDB database. In 71% reported phenotypes were in compliance with the model predictions, supporting a relation between mutations and stability issues in membrane proteins. Conclusion We present a reliable approach for the retrieval of protein mutations from PubMed abstracts for any set of genes or proteins of interest. We further demonstrate how amino acid substitution information from text can be utilized for protein structure stability studies on the basis of a novel energy model.

Aus der Einführung: "Stehen wir am Rande einer bio-nanotechnologischen getriebenen Revolution, die unsere Art zu leben, zu arbeiten und miteinander umzugehen grundlegend verändern wird? Welchem gesellschaftspolitischen, wirtschaftlichen und technologischen Wandel haben wir uns zu stellen? Langfristige Entwicklungszyklen (Kondratieff, Schumpeter) führen zur nachhaltigen Weiterentwicklung der Zivilisation. Mittelfristige Entwicklungen wie die Trends Globalisierung, Urbanisierung, Digitalisierung (Miniaturisierung) und Humanisierung (Individualisierung), die immer stärker unser Umfeld und Handeln beeinflussen führen zu ganzheitlichen, weltumspannenden Grundtendenzen der gesellschaftlichen Weiterentwicklung. Die technologischen "Enabler" Computing, Biotechnology, Artifical Intelligence, Robotik, Nanotechnology, Additive Manufacturing und Design Thinking wirken beschleunigend auf die gesellschaftlichen Entwicklungen ein. Die technologischen Möglichkeiten beschleunigen sowohl gesellschaftspolitische Zyklen und zivilisatorische Anpassungen. Durch rasanten technologischen, wissenschaftlichen Fortschritt, zunehmende Globalisierungswirkungen, beschleunigte Urbanisierung und aber auch politischer Interferenzen sind die Veränderungsparameter eines dynamischen Geschäftsumfelds immer schnellere Transformationen ausgesetzt. Alle diese Richtungen zeigen das unsere gesellschaftliche Entwicklung inzwischen stark durch die Technik getrieben ist. Ob dies auch heißt, dass wir den Punkt der Singularität (Kurzweil) absehbar erreichen ist dennoch noch offen. ..."