The present study characterized the deep-sea gastropods community collected on whale bones and wood parcels artificially implanted in the deep Southwest Atlantic Ocean at 1500 and 3300 m depth for 23 months. A total of 5493 gastropods were collected and their distribution, abundance and diversity on substrates, depths and latitudes were calculated. Species richness and abundance of gastropods were higher in whale bones and deeper sites. Latitude did not seem to influence the distribution of mollusks. Five species were selected due to their abundance and possible ecological importance for further studies. Three were new species of the superfamily Abyssochrisoidea and were morphologically and genetically described (two Rubyspira and one Cordesia). The other two were Hyslogyrina rissoela (Heterobranchia) and Lusitanops cingulatus (Neogastropoda). To understand their feeding behavior and dispersal strategies were conduced stable isotopes analyzes, observations of gut content, and radular and larval shell morphology. Larval shell of most species suggested planktotrophic development. Animals on different growth stages were found. Gastropods presented a diversity of feeding strategies, such as bacterial mats grazing, predation and specialized bone eating. The overlap of this fauna with other chemosynthetic environments and with other basins corroborate with the ecological stepping stone hypothesis. Besides that, phylogenetic studies about Abyssochrysoidea were made. Their phylogenetic position within the Caenogastropoda are still uncertain but this group is considered closely related with Littorinidae. These snails are endemic from chemosynthetic environments, such as deep-sea hydrothermal vents, cold seeps and organic falls in the deep-sea. The genus Rubyspira is not settled at family level and no molecular studies were made for Cordesia. The present study also attempts to assign these groups phylogenetically. Concatenated COI, 16S, 18S and 28S and individual gene trees were constructed for maximum likelihood and Bayesian analysis. In all analyses the family Newtoniellidae were a sister group of Abyssochrysoidea. Morphological and genetic evidences suggest that Rubyspira and Cordesia are closer related to Abyssochrysos than to other provannid snails. The most accepted hypothesis is that Provannidae is paraphyletic. However, there are other ideas that indicates Rubyspira and Cordesia could be included in Abyssochrysidae or the Provannidae should be considered Abyssochrysidae. A morphologic revision of the superfamily should be made to better understand the relation within the group. Clades within the Abyssochrysoidea were always well supported and similar to those found in the literature. The position of Rubyspira and Cordesia within Abyssochrysoidea suggest whale bones and wood parcels did not play an evolutionary role as stepping stones for this group. / O presente estudo caracterizou a comunidade de gastrópodes de mar profundo coletados em carcaças de baleia e parcelas de madeira artificialmente implantadas no Sudoeste do Oceano Atlântico profundo a 1500 e 3300 m de profundidade por 23 meses. Um total de 5493 gastrópodes foram coletados e sua distribuição, abundância e biodiversidade nos substratos, profundidades e latitudes foram calculados. A riqueza e abundância dos gastrópodes foi maior nos ossos de baleia e em maiores profundidades. A latitude parece não ter influenciado na distribuição dos moluscos. Cinco espécies foram selecionadas devido à abundância e possível importância ecológica. Três são novas espécies da superfamília Abyssochrysoidea que foram descritas morfologicamente e filogeneticamente (duas Rubyspira e uma Cordesia). As outras duas foram Hyalogirina rissoela (Heterobranchia) e Lusitanops cingulatus (Neogastropoda). Para compreender os hábitos alimentares e de dispersão desses animais análises de isótopos estáveis, observações do conteúdo do trato digestório, da morfologia das rádulas e das conchas larvais foram realizadas. A concha larval da maioria das espécies sugere um desenvolvimento planctotrófico. Os moluscos encontrados apresentaram diversos tipos de hábitos alimentares como raspadores de carpete bacteriano, predadores e especialistas de ossos. A sobreposição dessa fauna com a de outros ambientes quimiossintéticos e de outras bacias oceânicas colabora com a hipótese ecológica das \"stepping stones\" no mar profundo. Além disso, estudos sobre a posição filogenética dos Abyssochrysoidea foi feita. Sua posição nos Caenogastropoda ainda é incerta, mas são considerados próximos aos Littorinidae. Esses animais são endêmicos de ambientes quimiossintéticos, como fontes hidrotermais de mar profundo, fontes frias e quedas orgânicas. O gênero Rubyspira não está atribuído à nenhuma Família e não foram realizados estudos moleculares para Cordesia. Esse estudo também tenta organizar esses grupos filogeneticamente. Árvores concatenadas e individuais dos genes COI, 16S, 18S e 28S foram construídas para máxima verossimilhança e análise bayesiana. Em todos resultados a família Newtoniellidae foi um grupo irmão dos Abyssochrysoidea. Evidências morfológicas e genéticas s para que sugerem que Rubyspira e Cordesia então mais próximos dos Abyssochrysos do que de outros provannides. A teoria mais aceita é de que os Provannidae são parafileticos. Porém há outras ideias de que Rubyspira e Cordesia poderiam ser inclusos em Abyssochrysidae, ou que os Provannidae fossem considerados Abyssochrysidae. Uma revisão dessa superfamilia deveria se feita para entender as relações desse grupo. Os clados de Abyssochrysoidea sempre foram bem suportados como na literatura. A posição de Rubyspira e Cordesia nos Abyssochrysoidea. aponta que os ossos de baleia e parcelas de madeira possam não terem servido como \"stepping stones\" evolutivas para esses gastrópodes.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:55:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 443777 bytes, checksum: aa47df0593f4494e3ed6277403324b28 (MD5) Previous issue date: 2007-02-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The objective of this study was mapping QTL on pig chromosomes 16, 17 and 18 and associate them to performance, carcass, internal organs, viscera, carcass cuts and meat quality traits. A F2 population was produced by crossing two naturalized Brazilian Piau sires and 18 commercial dams (Landrace x Large White x Pietrain). The population was genotyped for 11 microsatellite markers. After the genotype scoring, it was constructed the linkage map for these markers in the population. The microsatellites markers were considered appropriate for quantitative trait analysis. It was analyzed their values for observed heterogosity (Ho), expected heterozigosity (He) and polymorphic information content (PIC). The evaluation of the four loci amplified in the SSC16 found average values of Ho, He; and PIC of 0,67, 0,57 and 0,50, respectively. In the SSC17 the average values for Ho, He and PIC of 0,72, 0,61 and 0,56, respectively for the four amplified loci. And in the SSC18, average values of Ho, He and PIC were 0,67, 0,63 and 0,59, respectively for each one of three loci. Data were analyzed by multiple regressions by F2 mapping method using the QTLEXPRESS software. Eleven QTL were mapped and not yet described in the literature: teat number, cooking loss, redness, lower backfat thickness after last lumbar vertebrae, bacon depth, heart weight and lung weight on SSC16. QTL for weight at 63 and 77 days of age were assigned on chromosome 17. QTL for weight at 21 days of age and slaughter age were identified on SSC18. Four QTL Already described in another populations were also identified: weight at 21 days of age on SSC16, backfat thickness after last lumbar vertebrae and after the last rib (at 6,5 cm from the midline ) on SSC17 backfat thickness after last lumbar vertebrae and after the last rib (at 6,5 cm from the midline) and total loss on SSC18. The generated information of significant QTL is useful for future studies dealing with fine mapping to identify genes that could provide a better understanding of the production traits in pigs. / O objetivo ao realizar este trabalho foi o mapeamento de QTL nos cromossomo 16,17 e 18 de suínos e a associação destes a característica de desempenho, de carcaça, órgãos internos e vísceras, de cortes de carcaça e de qualidade de carne. Foi construída uma população F2 provenientes do cruzamento de dois varrões da raça naturalizada Brasileira Piau com 18 fêmeas da linha comercial (Landrace x Large White x Pietrain). Foram utilizados onze marcadores microssatélites distribuídos nos SSC16, SSC17 e SSC18. Com o resultado da genotipagem foi construído o mapa de ligação específico dos marcadores para a população desenvolvida. Os marcadores de microssatélites foram considerados adequados para estudos de características quantitativas, quando foram analisadios os valores de heterozigosidade observada (Ho), heterozigosidade esperada (He) e conteúdo de informação polimórfica (PIC). A avaliação dos quatro locos amplificados no SSC16 forneceu valores das médias da Heterozigosidade observada (Ho) e esperada (He); e do Conteúdo de informação polimórfica (PIC) de 67,62%, de 57,71% e 0,50, respectivamente. No SSC17 foram encontrados os resultados das médias de Ho, He e PIC de 72,20%, 61,40% e 0,56, respectivamente para os 4 locos utilizados. E no SSC18, o valor das médias de Ho, He e de PIC foram 67,80% 63,54% e 0,59, respectivamente utilizando 3 locos. Foi utilizado o método de regressão por intervalo de mapeamento, e as análises foram realizadas por meio do programa QTLEXPRESS. Foram detectados 11 QTL não descritos na literatura: número de tetas, índice de vermelho; perda por cozimento, menor espessura de toucinho na região acima da última vértebra lombar na linha dorso-lombar, espessura de bacon, peso do coração e do pulmão no SSC16; peso aos 63 dias de idade e peso aos 77 dias de idade no SSC 17; peso aos 21 dias e idade de abate no SSC18; e quatro QTL já descritos em outras populações foram também identificados, como para peso aos 21 dias de idade no SSC16, espessura de toucinho medida imediatamente após a última costela, a 6,5 cm da linha dorso-lombar no SSC17, espessura de toucinho medida imediatamente após a última costela, a 6,5 cm da linha dorsolombar e perda total no SSC18. As informações dos QTL significativos encontrados servem como base de estudos futuros de mapeamento fino para identificação de genes permitindo o melhor entendimento das características de produção em suínos.

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:07:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao2008_Leonado_Franca.pdf: 610450 bytes, checksum: 1fc7bfc6096780687d2226f632e6aa85 (MD5) Previous issue date: 2008-08-28 / Intending to stipulate the parcel of Listeria spp. and L. monocytogenes in several sources, using the PCR techicic, 360 samples were analyzed in the period between november 2006 and february 2008, proceeding from 25 commercial abattoirs of five companies all licensed to export from some Brazilian States. Primers U1/LI1 for Listeria spp. and LM1/LM2 and LL5/LL6 for L. monocytogenes. Listeria spp. was detected in 19,72% of the samples, with percentage of 23% in the bone rooms, cold chamber and half carcass, 15% in beef cuts and 10% in the slaughter rooms. In the slaughterhouses it was detected in 19,42% in the A, 17,72% in the B, 22,95% in the C and 20% in the D and E. Analyzing the states, 16,34% in São Paulo, 23,94% in Mato Grosso do Sul, 14,06% in Goiás, 32% in Mato Grosso, 27,27% in Bahia and 14,28% in Pará were positive for its genus. No matter the pair of ‟primers‟‟ used for amplication, L. monocytogenes were detected in 14,72% of the samples, 20% in cold chambers, 15,83% in bone rooms, 13.33% in halfcarcass and in beef cuts and 10% in slaughter rooms. In the slaughterhouse A, 12,57% of the samples were detected positive‟, 11,39% in B, 21,31% in C and 13,33% in D e E. The bacterium was detected in São Paulo in 12,42% of positive samples, 14,08% in Mato Grosso do Sul, 12,30% in Goiás, 24%, in Mato Grosso, 27,27% in Bahia and 14,28% in Pará. The pair of primer LM1/LM2 revealed better efficience than the LL5/LL6 and although this last one has presented low efficiency to detection, the total of positive samples of L. monocytogenes of this research only was possible by the association of both. Listeria spp. and L. monocytogenes are largely propagated in the sources and studied places, and, therefore, disseminated in all slaughterhouses and analyzed States, excepting Minas Gerais. The results of this research revealed the necessariness of adoption of urgent providences about the control of the pathogen in the bovine slaughterhouses in Brazil and must alert the possibility of occurrence of outbreak of listeriosis of nutritious transmission, considering the occurrence and the frequency repetition here verified in half-carcass and beef cuts / Objetivando determinar a distribuição de Listeria spp. e L. monocytogenes em fontes diversas, pela técnica de PCR, foram analisadas 360 amostras no período de novembro de 2006 a fevereiro de 2008, procedentes de 25 unidades frigoríficas de cinco empresas habilitadas para comércio internacional localizadas em alguns Estados. Foram utilizados os primers U1/LI1 para Listeria spp. e LM1/LM2 e LL5/LL6 para L. monocytogenes. Listeria spp. foi detectada em 19,72% do total analisado, com percentuais de 23% em salas de desossa, câmaras-frias e meiascarcaças, 15% em cortes cárneos e 10% em salas de matança. Nos matadouros frigoríficos foi identificada em 19,42% no A, 17,72% no B, 22,95% no C e 20% no D e E. Em relação aos Estados, 16,34% em São Paulo, 23,94% no Mato Grosso do Sul, 14,06% em Goiás, 32% no Mato Grosso, 27,27% na Bahia e 14,28% no Pará foram positivas para o gênero. Independente do par de primers utilizado para amplificação, L. monocytogenes foi detectada em 14,72% da amostragem, sendo 20% em câmaras-frias, 15,83% em salas de desossa, 13,33% em meiascarcaças e em cortes cárneos e 10% em salas de matança. Foram obtidas 12,57% de amostras positivas no matadouro-frigorifico A, 11,39% no B, 21,31% no C e 13,33% no D e E. A espécie foi detectada em São Paulo, com 12,42% de amostras positivas, 14,08% no Mato Grosso do Sul, 12,30% em Goiás, 24% no Mato Grosso, 27,27% na Bahia e 14,28% no Pará. O par de primer LM1/LM2 revelou maior eficiência que o LL5/LL6 e, apesar deste último ter apresentado baixa eficiência para detecção, a totalidade de amostras positivas para L. monocytogenes deste trabalho só foi possível com a associação de ambos. Listeria spp. e L. monocytogenes se encontram amplamente distribuídas nas fontes e sítios estudados, estando disseminadas em todos os matadourosfrigoríficos e Estados analisados, com exceção de Minas Gerais. Os resultados deste trabalho revelam a necessidade de adoção de medidas urgentes para o controle do patógeno nos estabelecimentos de abate de bovinos no Brasil e devem servir de alerta para a possibilidade de ocorrência de surtos de listeriose de veiculação alimentar, dadas as freqüências de ocorrência aqui verificadas em meias-carcaças e cortes cárneos

The goal of the present work was to analyze the Gompertz functions in order to describe the growth of hillbilly broilers Color Plume (CPK) subjected to different levels of digestible lysine. On the experiment were used 432 chickens from one day old, was divided into three stages: initial, growth and finale respectively corresponding to the ages from 1 to 21, from 22 to 77 days of age and from 78 to 84 days of age. During the initial phase, the birds were reared on shavings beds with access to water, food and a heating source until after 21 days of age, the birds had access to paddocks. After 21 days of age, the birds which were in terms of the medium weight were distributed randomly in four treatments of 27 birds, with four replicates each one and 10 birds per replication (5 males and 5 females) were chipped with microchip brand Animall TAG and dimensions 12x2 mm. Treatments were represented by different lysine levels (0.850, 0.970, 1.090; 1.210%) on the experimental diet. The diets used were based on corn and bran soybean, and were formulated to meet the nutritional requirements at each stage of creation, as suggested by Rostagno et al. (2011), except lysine. Diets and birds were weighed weekly to determine the performance (weight gain, feed intake and feed conversion). Gompertz curves adjusted showed good correlation coefficients above 90%, and good values of Durbin Watson test accurately, estimating the average weight gain, and the consumption ration of mixed batch of free range broiler chickens. After the tests comparison between Gompertz parameters of the model for each level of lysine was determined that: the only parameter that varied was A, since B = 0.0329 and C = 45.819 parameters presented not significant differences. At the level of digestible lysine 0.850%, A = 4870.3, 0.970% A = 4894.9, 4784.3 A = 1.09%, 1.21% A = 4740. Among them, the parameter A in 0.970% level, differed from the others, ie, showing a higher body weight at maturity. Based the performance results, it is recommended for free range broiler CPK chickens of both sexes, to use a level of digestible lysine up to 0.970% on the period 22-77 days of age. After comparison tests between the Gompertz parameters of the model for each lysine level was determined for female that: the only parameter that varied was A, since B = 0.0356 and C = 45.54 parameters presented not significant differences. In males it has been concluded that only a single equation may represent the growth in four levels of lysine. The lysine levels did not influence (P> 0.05) carcass variables, except the yield of abdominal fat, than for females improved quadratically up to the level of 1.064%, for males there was a quadratic effect. / O presente trabalho objetivou-se utilizar o modelo não linear de Gompertz para descrever o crescimento de frangos caipira da linhagem Colorcpk Plumé (CPK), de ambos os sexos e entre os sexos, submetidos a diferentes níveis de lisina digestível. Foram utilizados 432 frangos com um dia de idade, o experimento foi dividido em três fases: inicial, crescimento e final correspondendo respectivamente às idades de 1 a 21, 22 a 77 e 78 a 84 dias de idade. Na fase inicial as aves foram criadas sobre cama de maravalha com acesso a água, ração e fonte de aquecimento e uma única dieta. Aos 21 dias de idade, as aves em função do peso médio foram distribuídas num delineamento inteiramente casualizado, em quatro tratamentos com quatro repetições de 27 aves por unidade experimental, e dentre elas, 10 aves de cada repetição (5 machos e 5 fêmeas) foram chipadas com microchips da marca Animall TAG e dimensões de 12x2 mm. Os tratamentos foram representados pelos diferentes níveis de lisina digestível (0,850; 0,970; 1,090; 1,210%) na dieta experimental na fase de crescimento. As dietas foram à base de milho e farelo de soja e formuladas para atender as exigências nutricionais em cada fase de criação, conforme sugerido de Rostagno et al. (2011), exceto lisina digestível. As rações e as aves foram pesadas semanalmente para determinação do desempenho (ganho de peso, consumo de ração e conversão alimentar), as aves chipadas também eram pesadas individualmente a cada 7 dias. Aos 84 dias de idade as aves chipadas foram abatidas, totalizando 160 aves. As características de carcaça avaliadas foram calculadas em relação ao peso corporal após jejum. As curvas de Gompertz ajustadas apresentaram bons coeficientes de determinação, acima de 90%, e bons valores do teste de Durbin Watson, estimando com boa acurácia o peso médio, ganho de peso e consumo de ração dos frangos caipira. Após os testes de comparação entre os parâmetros do modelo de Gompertz para cada nível de lisina para o lote misto, determinou-se que somente o parâmetro A deveria variar, pois os parâmetros B=0,0329 e C=45,819 não apresentaram diferenças significativas. No nível de lisina digestível 0,850% A=4870,3; 0,970% A=4894,9; 1,09% A=4784,3; 1,21% A=4740; dentre eles o parâmetro A no nível 0,970% diferiu dos demais, ou seja, maior peso corporal a maturidade. Com base nos resultados de desempenho, recomenda-se, para aves caipiras da linhagem CPK de ambos os sexos o nível de lisina digestível na ração de 0,970% no período de 22 a 77 dias de idade. Após os testes de comparação entre os parâmetros do modelo de Gompertz para cada nível de lisina, determinou-se para fêmeas que somente o parâmetro A deveria variar, pois os parâmetros B=0,0356 e C=42,54 não apresentaram diferenças significativas. Para os machos concluiu-se que apenas uma única equação pode representar o crescimento nos quatro níveis de lisina digestível. Os níveis de lisina digestível não influenciaram (P>0,05) as variáveis de carcaça, exceto o rendimento de gordura abdominal, que para as fêmeas melhorou de forma quadrática até o nível estimado de 1,064%.