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Estudo de perfil de sensibilidade / Resistência de cepas de Staphylococcus aureus MRSA do Hospital das Clínicas de PernambucoPereira Cordeiro, Risonildo January 2004 (has links)
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Previous issue date: 2004 / O surgimento de cepas Staphylococcus aureus resistentes a meticilina
(MRSA) a partir da década de setenta teve um rápido incremento em todo
mundo. Estas cepas multirresistentes são responsáveis por infecções nosocomiais
e comunitária de difícil tratamento. A resistência a meticilina é produzida pela
modificação de uma proteína que liga-se as penicilinas (PBP), a PBP2a
codificada pelo gene mecA. Cerca de 40 a 60% das cepas de S. aureus isolados
em hospitais de grande porte apresentam-se resistentes a meticilina e ainda,
relatos na literatura permitem constatar que tais infecções estão associadas a
clones específicos epidêmicos de Staphylococcus aureus multirresistentes,
muitas vezes unicamente sensíveis ao glicopeptídeo vancomicina. No Brasil a
partir de 1992 tem sido detectado um clone epidêmico designado como Clone
Epidêmico Brasileiro (CEB), amplamente disseminado em hospitais de diferentes
regiões do Brasil e outros países da América Latina e Europa. De outra parte a
heterogenicidade de resistência que apresentam muitos desses clones, levando
até mesmo a falhas no tratamento, justifica a preocupação de evidenciar sua
presença. No Recife, estudos sistemáticos dessa resistência do Staphylococcus
aureus não vinha ainda sendo realizados. No presente trabalho foram
desenvolvidas diferentes técnicas para determinar a resistência a meticilina e
estudos por biologia molecular para determinar a presença do gene mecA e
detectar a existência do clone epidêmico. Foram coletados 242 isolados clínicos
de Staphylococcus aureus de diferentes origens no período de janeiro de 2002
a julho de 2003 do Hospital Universitário (Hospital das Clinicas) de Recife
Pernambuco. Para determinar o perfil de sensibilidade/resistência, das cepas
devidamente identificadas , foi determinado um antibiograma padrão com oito
antibióticos: ciprofloxacina, vancomicina, oxacilina, gentamicina, penicilina,
sulfametropim, tetraciclina e eritromicina. A resistência à meticilina foi confirmada
pela técnica Agar screen de oxacilina, realizando paralelamente a determinação das CMI para oxacilina mediante um multiinoculador de Steers e a técnica de
Etest. Quanto a presença de gene mecA foi determinada por amplificação por
PCR. Dos resultados obtidos, 57 cepas (72%) dos 79 isolados Staphylococcus
aureus MRSA multirresistentes foram sensíveis apenas a vancomicina.
Quarenta e sete cepas de Staphylococcus aureus MRSA multirresistentes
escolhidas pelos seus padrões de resistência fenotipica foram estudadas pelo
método de eletroforeses de DNA em campos alternados (PFGE) determinandose
que 26 isolados eram subclones do Clone Epidêmico Brasileiro. Por outro
lado foi verificada a presença de oito subclones do Clone Pediátrico. Entre estes
o Staphylococcus aureus MRSA AM 824 , inicialmente considerado relacionado
ao clone New York foi classificado como clone pediátrico pela determinação do
mec elemento, SCCmec (tipo IV). Ainda foram detectados nove isolados
relacionados com Clones Epidêmicos Esporádicos. Os resultados encontrados
principalmente relativos ao CEB confirmam os dados citados na literatura para
centros hospitalares, do Brasil, de paises latinoamericanos como Argentina e
Uruguai, assim como países da Europa
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Detección de Escherichia coli O157:H7 en canales bovinas de camales de LimaAstuvilca Cupe, Carmen Rosa January 2015 (has links)
Las E. coli productoras de tipo shiga (STEC) son patógenas en el hombre y pueden provocarle colitis hemorrágica y síndrome urémico hemolítico. Dentro de este grupo, el serotipo E. coli O157:H7 es el que más se ha reportado como problema de salud pública. Las infecciones por este agente generalmente se producen por consumir alimento contaminado, siendo la carne de bovino el principal vehículo de este patógeno, en el Perú se ha reportado que es causante de diarreas y hospitalizaciones en niños. El objetivo del estudio es identificar la presencia de E. coli O157:H7 productora de toxinas shiga en canales de bovinos faenados en Lima. Para ello se recolectaron 180 muestras de 2 mataderos de Lima en 2 momentos del oreo; momento lavado (final del lavado e inicio de oreo) y momento oreo ( 2-3 h. en la playa de oreo). Se emplearon 2 metodologías, una técnica estándar para E. coli que requiere de medios tripticasa de soya (37°C por 24 h) y agar Mac conkey (37°C por 24 h) y una técnica microbiológica específica para la detección de E. coli no fermentadoras de sorbitol (característica de la E. coli O157:H7) usando los medios específicos EC con novobiocina (37°C por 24 h) y agar Mac conkey sorbitol (37°C por 24 h). Las colonias compatibles con E. coli se confirmaron con pruebas bioquímicas, luego se guardó a 2 °C una cepa de cada placa positiva para posteriormente y en conjunto realizar un PCR múltiple con la finalidad de identificar los factores de virulencia Stx1, Stx2, eaeA, rfbO157, hlyA y fliCH7. No se detectó E. coli O157:H7. Se encontró 29.4% (53/180) E. coli positivos, 5.6% (10/180) STEC, 1.1% (2/180) E. coli O157 y 0.5% (1/180) STEC O157. No se encontró diferencia significativa (p>0.05) entre la presencia de agentes (E. coli y STEC) y el momento de muestreo; ni con algunas de las técnicas microbiológicas. Los resultados obtenidos muestran la presencia de E. coli en las canales bovina desde su procesamiento primario, en los mataderos evaluados. Palabras claves: cepas, diarrogénicas, PCR, oreo, enfermedades transmitidas por alimentos / --- Shiga toxin producing E. coli (STEC) are pathogenic in humans and it can cause them hemorrhagic colitis and hemolytic uremic syndrome. Within this group, E. coli serotype O157: H7 is the most widely reported as a public health problem. Infections by this agent are generally produced by consuming contaminated food, being beef the main vehicle for this pathogen. In Peru it has been reported to be causing diarrhea and hospitalizations in children. The aim of the study is to identify the presence of E. coli O157: H7 shiga toxinproducing in cattle carcasses of slaughtered in Lima. For this purpose, 180 samples were collected of 2 slaughterhouses in Lima in 2 times of oreo; washing time (end of washing and beginning of oreo) and oreo time (2-3 h. in oreo). 2 methodologies were used, a standard technique for E. coli, which requires trypticase soy media (37°C for 24 h) and Mac Conkey agar (37°C for 24 h) and a specific microbiological technique for detecting E . coli non fermenting sorbitol (characteristic of E. coli O157: H7) using EC medium with specific novobiocina (37°C for 24 h) and Mac Conkey sorbitol agar (37°C for 24 h). Compatible colonies with E. coli were confirmed by biochemical tests, then stored at 2 °C one isolate from each positive plate, later and together make a multiple PCR for the purpose of identify virulence factors Stx1, Stx2, eaeA, rfbO157, hlyA and fliCH7. E. coli O157: H7 wasn´t detected. It was detected 29.4% (53/180) positive E. coli, 5.6% (10/180) STEC, 1.1% (2/180) E. coli O157 and 0.5% (1/ 180) STEC O157. No significant difference (p>0.05) was found between the presence of agents (E. coli y STEC) and the sampling time neither with some microbiological techniques. The results show the presence of E. coli in cattle from its primary processing, in slaughterhouses evaluated. Keywords : strains, diarrheagenic, oreo, foodborne diseases
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CAPACIDADE DE DETERIORAÇÃO DE CEPAS DE Eucalyptus spp. POR FUNGOS XILÓFAGOSSILVA, L. F. 15 December 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011-12-15 / SILVA, Luciana Ferreira da. Capacidade de deterioração de cepas de Eucalyptus spp. por fungos xilófagos. 2011. Dissertação (Mestrado em Ciências Florestais) - Universidade Federal do Espírito Santo, Alegre-ES Orientador: Prof. Dr. Waldir Cintra de Jesus Junior. Coorientador: Prof. Dr. Juarez Benigno Paes.
Na reforma do povoamento florestal, após o corte das árvores, as cepas remanescentes de Eucalyptus spp. devem ser retiradas. A degradação natural de cepas de eucalipto após o corte raso é lenta. A destoca mecânica eleva o custo de produção, envolve tráfego de máquinas sobre o solo favorecendo a sua compactação e dificultando o crescimento e a distribuição das raízes. Uma alternativa para retirada destas cepas remanescentes é o emprego de fungos decompositores. Objetivou-se com a pesquisa coletar, isolar, selecionar e identificar fungos com potencial de deteriorar madeira de eucalipto, a partir de fragmentos de cepas apodrecidas, para serem utilizados em um ensaio de apodrecimento acelerado e realizar a análise química de madeiras sadias e deterioradas pelos fungos isolados das cepas, que apresentaram maior capacidade de deterioração, para verificar, quais os componentes da madeira sofreram maiores alterações em função da deterioração causa pelos fungos. Amostras de cepas de eucalipto, em decomposição, foram coletadas em plantios comerciais, em três municípios, com microclimas e altitudes diferentes e acondicionadas em sacos de papel poroso e transportadas para o Laboratório de Ciência da Madeira (LCM), no Departamento de Engenharia Florestal (DEF), pertencente ao Centro de Ciências Agrárias (CCA) da Universidade Federal do Espírito Santo (UFES) no município de Jerônimo Monteiro, ES. No LCM foram retiradas amostras de madeira para realizar o isolamento dos fungos e posteriormente a obtenção de culturas puras, em meio de cultura Batata-Dextrose-Ágar (BDA). Nove culturas puras foram isoladas e identificadas, sendo, três fungos pertencentes à Classe dos Basidiomycetes (Basidiomicetos 1, 2 e 3), quatro do gênero Trichoderma, um Lasiodiplodia e um Penicillium. As culturas foram selecionadas, repicadas em placa de Petri e tubos de ensaio contendo BDA e armazenadas em sala climatizada a 25 ± 2 °C e utilizadas no ensaio de apodrecimento acelerado. Após 12 semanas de ensaio, pode-se concluir que os fungos isolados mais eficientes na deterioração da madeira foram os pertencentes à Classe dos Basidiomycetes (Basidiomiceto 1 e Basidiomiceto 2). A análise química da madeira pelos Basidiomicetos 1 e 2, revelou que houve um incremento no teor de extrativos totais na madeira, para ambos Basidiomicetos testados. Para a holocelulose (celulose + hemiceluloses), ocorreram pequenas diferenças entre as madeiras sadias e deterioradas (variações médias em torno de 1%). O Basidiomiceto 2 causou maior degradação da lignina quando comparado ao Basidiomiceto 1.
Palavras chave: Cepas apodrecidas. Culturas puras. Fungos xilófagos. Resistência natural.
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Caracterização e avaliação de Cepas autóctones de Bacillus thuringiensis para controle de Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae)Dijair Antonino de Souza Júnior, José January 2007 (has links)
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Previous issue date: 2007 / Bacillus thuringiensis (Bt) é uma bactéria gram-positiva, que produz um cristal,
durante a fase de esporulação, composto por proteínas (toxinas Cry) que possuem ação
entomocida principalmente para as ordens Lepidoptera, Diptera e Coleoptera. Spodoptera
frugiperda (J. E. Smith, 1797) é um lepidóptero neotropical polífago, praga, de milho,
algodão e arroz, responsável por perdas de até 30% na produção destas culturas. Este
trabalho teve por finalidade identificar e caracterizar genes em cepas de Bt da Paraíba e
Pernambuco, que possuíssem ação contra S. frugiperda. Foram utilizados 81
oligonucleotídeos (primers) das famílias cry1 a cry28 e cyt1 e cyt2 para as reações em
cadeia da DNA polimerase (PCR), bem como análise bioquímica através de SDS-PAGE.
Os fragmentos que foram obtidos no tamanho esperado foram purificados e seqüenciados.
Duzentas e uma cepas foram analisadas no presente trabalho, sendo 30 isoladas a partir de
amostras de solos de Pernambuco e 171 isolados da Paraíba. Os bioensaios foram
realizados avaliando-se quais cepas possuíam atividade tóxica para S. frugiperda e em
seguida, foram determinadas as concentrações letais (CL50) das cepas consideradas tóxicas.
Em bioensaios com os isolados de Pernambuco, a cepa I4A7 apresentou mortalidade
superior a 50% (94,3%) na concentração de 1x109 esporos/ml e CL50 de 76,58 μg/cm2
contra S. frugiperda. Esta cepa apresentou amplicons para os genes cry4Aa, cry4Ba,
cry10Aa, cry11Aa, cyt1Aa e cyt2Ba, e proteínas de 130, 70 e 29 kDa, perfis gênico e
protéico idênticos aos do B. thuringiensis israelensis (Bti), o qual é relatado na literatura
como tóxico para Diptera. Estes fragmentos foram seqüenciados e apresentaram homologia
de 99% a 100% com as seqüências dos genes originais depositadas no banco de dados. Nas
amostras da Paraíba, apenas dois isolados, BV-5 e AN2-3, apresentaram fragmentos de
tamanho esperado, ambos para o par de iniciadores gerais da família cry1. Estas cepas não
apresentaram toxicidade contra S. frugiperda. Através da seqüência parcial de nucleotídeos
e da seqüência deduzida de aminoácidos dos genes das cepas BV-5 e AN2-3, verificou-se
que estes genes possuem maior identidade com genes da família cry8. A seqüência parcial
de aminoácidos deduzida do gene da cepa BV-5 apresentou variabilidade na região do
domínio II, que é responsável pelo reconhecimento e ligação da toxina. A cepa I4A7 é
promissora, e poderá ser usada no manejo integrado de S. frugiperda e/ou manejo de
resistência a toxinas Cry. Já as cepas AN2-3 e BV-5 deverão ser testadas contra pragas da
ordem Coleoptera para determinar a especificidade das mesmas
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Seleção e isolamento de bactérias resistentes a Cromo Hexavalente Endêmicos do Igarapé do QuarentaTeles, Ydrielly Veras, 98240-9706 28 November 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-11-28 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / The accelerated expansion of the urban center of the city of Manaus has generated important impacts on the water resources of the region. In the middle of this scenario, the present work aims to isolate samples from the bacterial communities associated to the water of the Quarenta stream, evaluating their bioreduction potentials for hexavalent chromium. The methodology used includes the collection of water samples at strategic points along the Forty stream, evaluation of the isolates in culture medium with chromium (VI) concentrations varying from 0.01 mg / L to 320 mg / L, selecting from this the best strains and identifying them by molecular sequencing technique. After the selection of the isolate, the growth of the isolate at the concentration of 300 mg / L was evaluated over 72 hours compared to the control in medium without the metal. At the same time, a simulated environment with a concentration of 10 mg / L Cr (VI) was monitored with pH monitoring every 12 hours until the final time of 72 hours. Twenty-three strains resistant to the concentration of 300 mg / L of chromium (VI) were obtained, where 18 strains were selected to reduce Cr (VI) and later identified by sequencing the 16S region. Ten bacterial genera were identified, among them the genera Acidovorax sp., Acinetobacter sp., Alicycliphilus sp., Bacillus sp., Comamonas sp., Enterobacter sp., Micrococcus sp., Proteus sp., Serratia sp. and Vagococcus sp. The bacterium of the genus Vagococcus sp. reduced 96.8% Cr (VI) to 10 mg / L in only 24 hours. The growth of this strain at the concentration of 300 mg / L, despite being delayed by the amount of metal present, after 48 hours was equal to the control, showing that this genus has potential for remediation of environments impacted by metals. / A expansão acelerada do centro urbano da cidade de Manaus, tem gerado impactos importantes nos recursos hídricos da região. Em meio a esse cenário, o presente trabalho, tem como objetivo isolar amostras das comunidades bacterianas associadas à água do igarapé do Quarenta, avaliando seus potenciais de biorredução para o cromo hexavalente. A metodologia utilizada inclui a coleta de amostras de água em pontos estratégicos ao longo do igarapé do Quarenta, avaliação dos isolados em meio de cultura com concentrações de cromo (VI) variando de 0,01 mg/L a 320 mg/L, selecionando desta forma, as melhores cepas e identificando-as por técnica molecular de sequenciamento. Após a escolha do isolado, avaliou-se o crescimento deste na concentração de 300 mg/L ao longo de 72 horas em comparação com o controle em meio sem o metal. Simultaneamente, foram realizados testes em meio ambiente simulado com concentração de 10 mg/L de Cr (VI) com monitoramento do pH a cada 12 horas até o tempo final de 72 horas. Obtiveram-se 23 cepas resistentes a concentração de 300 mg/L de cromo (VI), onde dessas cepas foram selecionadas 18 com capacidade de reduzir o Cr (VI) sendo posteriormente identificadas via sequenciamento da região 16S. Foram identificados 10 gêneros bacterianos, entre eles estão os gêneros Acidovorax sp., Acinetobacter sp., Alicycliphilus sp., Bacillus sp., Comamonas sp., Enterobacter sp., Micrococcus sp., Proteus sp., Serratia sp. and Vagococcus sp. A bactéria do gênero Vagococcus sp. reduziu 96,8 % de Cr(VI) a 10 mg/L em apenas 24 horas. O crescimento desta cepa na concentração de 300 mg/L, apesar de ter sido retardado pela quantidade de metal presente, após 48 horas se igualou ao controle, mostrando que esse gênero possui potencial para remediação de ambientes impactados por metais.
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Linhagens de til?pia do nilo sob diferentes densidades de estocagem / Strains of Nile tilapia under different stocking densitiesOtoni, Carlos Jos? 31 May 2015 (has links)
Submitted by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2016-01-12T10:34:15Z
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Previous issue date: 2015 / Funda??o de Amparo ? Pesquisa do Estado de Minas Gerais (FAPEMIG) / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / Banco do Nordeste do Brasil (BNB) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico (CNPq) / Objetivou-se avaliar o potencial produtivo de duas linhagens de til?pia do Nilo (Oreochromis niloticus), tailandesa e GIFT, nas etapas de desenvolvimento compreendidas entre juvenis e adultos, submetidas a densidades de estocagem, em sistema intensivo com biofiltra??o. Foram realizados dois experimentos, sendo que para o primeiro foi avaliada a densidade de estocagem no cultivo de juvenis de til?pias tailandesa e GIFT. Foram utilizados 2160 juvenis sexualmente revertidos para macho, contados individualmente. Em seguida, os peixes foram transferidos para 24 aqu?rios de 70 L com 30 L de ?gua cada, providos de aera??o constante e fotoper?odo natural. As til?pias foram submetidas a quatro densidades de estocagem: 1 peixe por litro (30 peixes/tanque); 2,3 peixes por litro (69 peixes/tanque); 3,7 peixes por litro (111 peixes/tanque) e 5 peixes por litro (150 peixes/tanque). Foi utilizado um delineamento experimental inteiramente casualizado com tr?s repeti??es cada. O sistema de recircula??o manteve a qualidade de ?gua dentro dos n?veis aceit?veis durante o per?odo experimental. N?o foram observadas intera??es entre as linhagens utilizadas e as densidades de estocagem, como tamb?m nenhuma diferen?a no desempenho entre as linhagens. Para o peso corporal final e ganho de peso foi verificado efeito linear em fun??o da densidade de estocagem. O aumento dessa promoveu uma redu??o no peso final e no ganho de peso. A densidade de 1 peixe por litro ganhou 67,48% mais peso que a densidade de 5 peixes por litro. Para a convers?o alimentar foi verificado efeito linear, havendo aumento com o aumento da densidade. Quanto ao fator de condi??o de Fulton (K) foi observado efeito linear em fun??o da densidade, em que a densidade 1 peixe por litro apresentou maiores resultados e a densidade 5 peixes por litro os menores. Para o ganho em biomassa foi verificado um aumento linear ? medida que se aumentou a quantidade de peixe por tanque. Para os outros par?metros estudados n?o foram verificados efeitos lineares em fun??o da densidade. Com isso, recomenda-se a densidade de 1 peixe por litro (30 peixes/tanque) para proporcionar um maior ganho de peso dos animais, e uma densidade de 2,3 peixes por litro (69 peixes/tanque) para se obter uma melhor convers?o alimentar e melhor ganho em biomassa, podendo ser utilizadas em ambas as linhagens avaliadas. Para o segundo experimento, densidade de estocagem na engorda de til?pias tailandesa e GIFT foram utilizados 1800 juvenis sexualmente revertidos para macho, contados individualmente. Em seguida, as til?pias foram transferidas para 18 caixas de 1000 L com 400 L de ?gua cada, providos de aera??o constante e fotoper?odo natural. Os peixes foram submetidos a tr?s densidades de estocagem: 0,15 peixe por litro (60 peixes/tanque); 0,25 peixe por litro (100 peixes/tanque) e 0,35 peixes por litro (140 peixes/tanque). Foi utilizado um delineamento experimental inteiramente casualizado, com tr?s repeti??es cada. O sistema de recircula??o manteve a qualidade de ?gua dentro dos n?veis aceit?veis durante o per?odo experimental. N?o foram observadas intera??es entre as linhagens utilizadas e as densidades de estocagem, como tamb?m nenhuma diferen?a no desempenho entre as linhagens. Para o peso corporal final e ganho de peso foi verificado efeito linear em fun??o da densidade. O aumento dessa promoveu uma redu??o no peso final e no ganho de peso. A densidade 0,15 peixe por litro ganhou 31,93% (aos 120 dias) e 41,86% (aos 240 dias) mais peso do que a densidade 0,35 peixe por litro. Para a convers?o alimentar tamb?m foi verificado efeito linear, para os dois per?odos, havendo aumento com o aumento da densidade. Quanto ao fator de condi??o de Fulton (K) foi observado efeito linear, para os 120 e 240 dias, em fun??o da densidade, em que a densidade 0,15 peixe por litro apresentou os maiores resultados e a densidade 0,35 os menores. Para o ganho em biomassa foi verificado um aumento linear ? medida que se diminuiu a quantidade de peixes por tanque. Para os outros par?metros estudados n?o foram verificados efeitos lineares em fun??o da densidade. Dessa forma, recomenda-se a densidade de 0,15 peixe por litro (60 peixes/tanque) para melhor ganho de peso e ganho em biomassa, bem como melhor convers?o alimentar, podendo ser utilizada em ambas as linhagens testadas. / Disserta??o (Mestrado Profissional) ? Programa de P?s-Gradua??o em Sa?de, Sociedade e Ambiente, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2015. / ABSTRACT
The productive potential of two strains of tilapia (Oreochromis niloticus), thai and GIFT, in development stages between juvenile and adults, submitted to different stocking densities in intensive system with biofiltration was evaluated. Two trials were conducted, being that the first was evaluated stocking density in Nile tilapia in youth culture, thai and Gift. 2160 sexually fingerlings reverted to male were counted individually. The fish were transferred to 24 L tanks 70 with 30 L of water each provided with constant aeration and natural photoperiod. Tilapias were submitted to four stocking densities: 1 fish/L (30 individuals/tank); 2.3fish/L (69 individuals/tank); 3.7 fish/L (111 individuals/tank) and 5 fish/L (150 individuals/tank). A completely randomized design with three replications was used. The recirculation system maintained the water quality within acceptable levels during the experimental period. There were not interactions between the strains used and the stocking densities. Also there was no difference in performance between the strains. The final weight and weight gain were observed linear effect according to the storage density. The increase of density promoted a reduction in the final weight and weight gain. The density 1 fish/L promoted 67.48% more weight than the density of 5 fish/L. For feed conversion was observed linear effect, getting worse with increasing density. Fulton?s condition factor (K) have a linear effect as a function of density. Biomass gain was observed linear effect with the increase of amount of fish per tank. Other parameters studied do not show an effect in density. Therefore, it is recommended 1 fish/L to provide a greater weight gain of fish, and a density of 2.3 fish/L to obtain a better feed conversion, and biomass gain. For the second trial, the influence of stocking density on the growth of two strains of Nile tilapia (Gift and Thai) was studied. One thousand and eight hundred Nile tilapia sexually reverted to male were used. Tilapias were transferred to 18 boxes with 400L water each provided of constant aeration and natural photoperiod. The fish were submitted to three stocking densities: 0.15 fish/L (60 individuals/tank); 0.25 fish/L (100 individuals/tank) and 0.35 fish/L (140 individuals/tank). A completely randomized design with three replications was used. The recirculation system maintained the water quality within acceptable levels during the experimental period. There were not interactions between the strains used and the stocking densities. Also there was no difference in performance between the strains. Linear effect was observed for final weight and weight gain as a function of density. With the increase of density occurred decrease in final weight and weight gain. The density of 0.15 fish/L increased in 31.93% (at 120 days) and 41.86% (240 days) the gain weight than compared at density of 0.35 fish/L. The feed conversion worse linearly with increase of density for both periods. As to Fulton condition factor (K), linear effect was observed to 120 and 240 days according with the density. For biomass gain, a linear increase was verified as it reduced the number of fish per tank. For the other parameters were not found effects for the two periods as a function of density. Thus, the density of 0.15 tilapia/L promotes better weight gain, biomass gain and feed conversion, which may be used both strains.
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Bioconversión de carbohidratos de macroalgas pardas en ácido hialurónicoutilizando una cepa de Escherichia Coli recombinanteMeza Trujillo, Jorge Ignacio January 2017 (has links)
Magíster en Ciencias de la Ingeniería, Mención Química.
Ingeniero Civil en Biotecnología / En la actualidad, se realizan grandes esfuerzos en aplicar nuevos métodos de producción de compuestos novedosos de alto valor agregado. Un ejemplo de esto es el ácido hialurónico, que tiene importantes y nuevos usos, especialmente en el área de la salud, y su demanda se encuentra en alza.
El presente trabajo de tesis tiene como objetivo generar una nueva cepa recombinante de Escherichia coli que sea capaz de producir ácido hialurónico a partir de fuentes de carbono novedosos, como es el caso de los carbohidratos de algas pardas. Esto se debe a que estas algas presentan varias ventajas, como su gran abundancia y relativa facilidad de obtención de los azúcares presentes. Este trabajo se enfoca en el uso de los carbohidratos alginato y manitol, principales azúcares presentes en estas macroalgas.
Como punto de partida se utilizó la cepa recombinante BAL 1611. Esta cepa tiene incorporados los genes necesarios para el transporte y degradación del alginato, además de estar optimizado para la producción anaeróbica de etanol. A esta cepa se le realizó modificaciones para disminuir la producción de etanol y se le incorporó los genes necesarios para producir ácido hialurónico. En la primera etapa del trabajo se obtuvo una cepa con resistencia al antibiótico cloranfenicol y con la producción de etanol disminuida. Luego, la cepa se transformó con un plasmidio que contiene los genes necesarios para la síntesis de ácido hialurónico. La síntesis de las proteínas codificadas en el vector recombinante se indujo con L-arabinosa para iniciar la producción. Además, en este proyecto se diseñó un método para cuantificar la concentración de ácido hialurónico utilizando la enzima hialuronidasa. Se logró obtener un microorganismo recombinante que produce ácido hialurónico a partir de alginato y manitol con una concentración de 20 [g/l] de azúcares totales, con una proporción de 2:1 en peso. El rendimiento obtenido fue de 3,67 [mg AH/l/gDW]. Finalmente, se introdujo modificaciones a un modelo matemático del metabolismo de E. coli, para introducir las reacciones correspondientes a la degradación de alginato y de la síntesis de ácido hialurónico. Se realizó un análisis de balance de flujo a partir de los datos generados de un cultivo con un medio definido, aplicando variaciones en las condiciones in silico. A partir de este análisis se concluyó que es necesario controlar la cantidad de oxígeno presente en el cultivo. Por otro lado, la presencia de los genes de Z. mobilis no presenta impacto en la producción de biomasa ni de ácido hialurónico. Además, debido al alto costo energético de producir ácido hialurónico y el desbalance de óxido-reducción que produce la metabolización de alginato hace que los rendimientos de AH sean bajos. Esto da pie a implementar nuevas estrategias para optimizar la producción de AH a partir de este carbohidrato.
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Isolamento e caracterização de cepas de Trypanosoma cruzi Chagas,1909 (Kinetoplastida, Trypanosomatidae) a partir de triatomíneos silvestres do Estado do Rio Grande do SulMartins, Luciamáre Perinetti Alves [UNESP] 14 October 2005 (has links) (PDF)
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martins_lpa__dr_arafcf.pdf: 1228013 bytes, checksum: 5934b003d49e4880c1d0e8c2f03123b7 (MD5) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Embora a incidência da doença de Chagas tenha diminuído, os estudos sobre o Trypanosoma cruzi devem continuar, dada a dificuldade para o efetivo controle dos seus vetores. Triatoma infestans o principal vetor da doença de Chagas está praticamente eliminado no Brasil, entretanto outras espécies de Triatominae estão em processo de domiciliação, como o Triatoma rubrovaria no Rio Grande do Sul, constituindo-se em um fator de risco para o recrudescimento da infecção chagásica. Com o intuito de caracterizar cepas de T. cruzi que circulam na área rural, foram feitas buscas ativas de triatomíneos para isolamento desse protozoário em bairros do município de Quaraí, RS. Para tanto as fezes dos triatomíneos coletados foram obtidas por compressão abdominal para pesquisa de tripomastigotas metacíclicos. As fezes que se encontraram positivas foram inoculadas em animais de experimentação e em meio de cultura (LIT). Foram isoladas cinco cepas de T. cruzi, assim denominadas: QB1, QJ1, QJ3, QM1 e QM2, que apresentaram as seguintes características: predominância de formas tripomastigotas intermediárias após mensuração no 15º dia pósinfecção, picos parasitêmicos ao redor do17º dia pós-infecção, miotropismo na fase aguda e miosite na fase crônica da infecção. A análise do DNA que codifica a fração 24Sa do rRNA mostrou fragmentos de 110 pb, agrupando-as em T. cruzi I. Os serviços de vigilância epidemiológica foram informados sobre os resultados obtidos. / Although the decrease in the incidence of Chagas' disease, the studies concerning T. cruzi shall continue, due to the difficulty in controlling its vector. Triatoma infestans the main vector of Chagas'disease is nearly eliminated in Brasil, nevertheless other Triatominae species are on domiciliate process, like Triatoma rubrovaria in Rio Grande do Sul State, representing a hazard factor for increasing Chagas infection. In order to characterize T. cruzi strains that naturally occur in the rural area, active searches were performed in order to isolated these strains in the district of Quarai, RS. Triatomine feces were collected by abdominal compression and the presence of metacyclic tripomastigotes was evaluated. The feces positive for metacyclic triatomines were inoculated in experimental animals and in the culture medium (LIT). Five T. cruzi strains were isolated: QB1, QJ1, QJ3, QM1 and QM2. The strains displayed a predominance of intermediate forms on 15th day post-infection. Parasitimia peak occurred on 17th day post-infection. Myotropism during acute phase and myositis in the chronic phase was oberved. The DNA analysis coding the 24 Sa r RNA fraction has displayed fragments of 110 pb, grouping them in T. cruzi I. The Epidemiologic Vigilance Services have been warmed about the achieved results.
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Estudo biométrico de formas epimastigotas e tripomastigotas de quatro cepas de trypanosoma cruzi, Chagas 1909 (Kinetoplastidae, Trypanosomatidae)Rossi, Leila Regina Lima [UNESP] 26 November 2007 (has links) (PDF)
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rossi_lrl_me_arafcf.pdf: 682047 bytes, checksum: 215bd6a830c595069af77cb75cbaee6d (MD5) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Este estudo visou mensurar formas tripomastigotas e epimastigotas de Trypanosoma cruzi das cepas Bolívia, QM2, S.I.9 e Y por meio de microscópio óptico acoplado a um analisador de imagens e programa Leica QWin. Para tanto utilizou-se os parâmetros definidos por DIAS, FREITAS FILHO (1943) e BARRETO (1965): distâncias da extremidade posterior ao meio do núcleo (PN), do meio do núcleo à extremidade anterior do corpo (NA), comprimento do flagelo (FL), comprimento total (T), largura (L), Área do Cinetoplasto (AC), Área do Núcleo (NA) e Índice Nuclear (IN). Mensurou-se 360 formas tripomastigotas sanguíneas, 120 formas epimastigotas de meio de cultura LIT e 120 formas epimastigotas de fezes de triatomíneo de T. cruzi de cada uma das cepas Bolívia, QM2, S.I.9 e Y. Os oito parâmetros definidos para caracterização das formas tripomastigotas sanguíneas foram mensurados anteriormente ao pico de parasitemia, durante o pico e posteriormente ao pico de parasitemia para as formas tripomastigotas sanguíneas. As quatro cepas de T. cruzi mostraram percentual distinto de formas finas, intermediárias e largas das formas tripomastigotas sanguíneas. De acordo com os parâmetros morfométricos as formas foram classificadas em fina, intermediária e larga no que se refere à largura e curta, intermediária e longa com relação ao comprimento. As mensurações das formas tripomastigotas sanguíneas de T. cruzi das cepas Bolívia, QM2, S.I.9 e Y quanto a largura mostraram os seguintes resultados: as formas finas variaram entre 0,6 e 1,3μm; intermediárias entre 1,4 e 2,1μm; largas entre 2,2 e 5,5μm. Quanto ao comprimento total obtevese para a forma curta variação entre 13,5 e 19,5μm; para a forma intermediária entre 19,6 e 24,7μm; para a forma longa entre 24,8 e 43,8μm. As formas epimastigotas de meio de cultura LIT apresentaram... / This study aimed the measurement of trypomastigotes and epimastigote of Trypanosoma cruzi from Bolivia strains, QM2, S.I.9 and Y by means of an optical microscope coupled to an image analyses program called Leica QWin. The following parameters defined for DIAS, FREITAS FILHO (1943) & BARRETO (1965) were used for these measurements: distance from the posterior extremity to the middle of the nucleus (PN), from the middle of the nucleus to the anterior extremity of the body (NA), flagellum length (FL), total length (T), width (L), kinetoplast area (AC), nucleus area (NA) and nuclear index (IN). 360 blood-stream forms were measured, 120 epimastigote forms in the LIT culture mean and 120 epimastigote forms from triatomine feces of T. cruzi for each of the Bolivia strains, QM2, S.I.9 and Y. All eight defined parameters for trypomastigote forms characterization were measured before the parasitemia peak, during the peak and after the parasitemia peak. The four T. cruzi strains showed to be distinct when comparing the percentage in the thin, intermediary and large forms of trypomastigotes. According the morphometric parameters the forms were classified as thin, intermediary and wide regarding width, and short, intermediary and long regarding length. The measurements of trypomastigote blood stream forms of T. cruzi from Bolivia strains QM2, S.I.9 and Y regarding width showed the following results: the thin form varied from 0.6 to 1.3μm; the intermediary from 1.4 to 2.1μm; wide from 2.2 to 5.5μm. Now the total length obtained for the short form varied from 13.5 to 19.5μm; for the intermediary form from 19.6 to 24.7μm; for the long form from 24.8 to 43.8μm. The epimastigote forms in the LIT culture mean presented the following measurements related to width: thin forms between 1.1 and 1.7μm, intermediary forms between 1.8 and 2.8μm.
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Isolamento e caracterização de cepas de Trypanosoma cruzi Chagas,1909 (Kinetoplastida, Trypanosomatidae) a partir de triatomíneos silvestres do Estado do Rio Grande do Sul /Martins, Luciamáre Perinetti Alves. January 2005 (has links)
Resumo: Embora a incidência da doença de Chagas tenha diminuído, os estudos sobre o Trypanosoma cruzi devem continuar, dada a dificuldade para o efetivo controle dos seus vetores. Triatoma infestans o principal vetor da doença de Chagas está praticamente eliminado no Brasil, entretanto outras espécies de Triatominae estão em processo de domiciliação, como o Triatoma rubrovaria no Rio Grande do Sul, constituindo-se em um fator de risco para o recrudescimento da infecção chagásica. Com o intuito de caracterizar cepas de T. cruzi que circulam na área rural, foram feitas buscas ativas de triatomíneos para isolamento desse protozoário em bairros do município de Quaraí, RS. Para tanto as fezes dos triatomíneos coletados foram obtidas por compressão abdominal para pesquisa de tripomastigotas metacíclicos. As fezes que se encontraram positivas foram inoculadas em animais de experimentação e em meio de cultura (LIT). Foram isoladas cinco cepas de T. cruzi, assim denominadas: QB1, QJ1, QJ3, QM1 e QM2, que apresentaram as seguintes características: predominância de formas tripomastigotas intermediárias após mensuração no 15º dia pósinfecção, picos parasitêmicos ao redor do17º dia pós-infecção, miotropismo na fase aguda e miosite na fase crônica da infecção. A análise do DNA que codifica a fração 24Sa do rRNA mostrou fragmentos de 110 pb, agrupando-as em T. cruzi I. Os serviços de vigilância epidemiológica foram informados sobre os resultados obtidos. / Abstract: Although the decrease in the incidence of Chagas' disease, the studies concerning T. cruzi shall continue, due to the difficulty in controlling its vector. Triatoma infestans the main vector of Chagas'disease is nearly eliminated in Brasil, nevertheless other Triatominae species are on domiciliate process, like Triatoma rubrovaria in Rio Grande do Sul State, representing a hazard factor for increasing Chagas infection. In order to characterize T. cruzi strains that naturally occur in the rural area, active searches were performed in order to isolated these strains in the district of Quarai, RS. Triatomine feces were collected by abdominal compression and the presence of metacyclic tripomastigotes was evaluated. The feces positive for metacyclic triatomines were inoculated in experimental animals and in the culture medium (LIT). Five T. cruzi strains were isolated: QB1, QJ1, QJ3, QM1 and QM2. The strains displayed a predominance of intermediate forms on 15th day post-infection. Parasitimia peak occurred on 17th day post-infection. Myotropism during acute phase and myositis in the chronic phase was oberved. The DNA analysis coding the 24 Sa r RNA fraction has displayed fragments of 110 pb, grouping them in T. cruzi I. The Epidemiologic Vigilance Services have been warmed about the achieved results. / Orientador: João Aristeu da Rosa / Coorientador: Márcia Aparecida Sperança / Banca: Mara Cristina Pinto / Banca: Márcia Aparecida Silva Graminha / Banca: José Clóvis do Prado Júnior / Banca: Sérgio Albuquerque / Doutor
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