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Análise cladística de táxons atribuídos aos peixes euteleósteos basais / Cladistic analysis of taxa assigned to basal euteleosteans fishesAline Francisca Paineiras Delarmelina 18 February 2011 (has links)
Os teleósteos são o grupo mais diversificado entre os vertebrados e seu registro mais
antigo data do Jurássico. Sua atual classificação inclui quatro clados, dentre os quais Euteleostei é
o mais avançado e variado. Apesar de todos os trabalhos a respeito do grupo, ele ainda não possui
diagnose, definição e composição precisas. A discordância entre autores é ilustrada pelas nove
diferentes propostas filogenéticas elaboradas nos últimos 30 anos. Muitos fósseis do Cretáceo são
classificados como euteleósteos basais por falta de conhecimento morfológico, enquanto outros
fósseis possuem classificação sistemática controversa ou compartilham aspectos estruturais com
euteleósteos basais. Nesse contexto, os objetivos da presente dissertação são avaliar o
monofiletismo de euteleósteos basais e recuperar relações filogenéticas de táxons do Nordeste do
Brasil, África, Europa, Ásia e América do Norte atribuídos aos euteleósteos basais. Sete táxons
brasileiros (i.e., Beurlenichthys ouricuriensis, Britoichthys marizalensis, Clupavus
brasiliensis, Santanasalmo elegans, Santanichthys diasii, Scombroclupeoides scutata e novo
euteleósteo da Bacia de Pelotas) e 14 táxons de localidades estrangeiras (i.e., Avitosmerus
canadensis, Barcarenichthys joneti, Chanoides macropoma, Clupavus maroccanus,
Gaudryella gaudryi, Humbertia operta, Kermichthys daguini, Leptolepides spratiiformis,
Lusitanichthys characiformis, Nybelinoides brevis, Orthogonikleithrus leichi, Pattersonella
formosa, Wenzichthys congolensis e Tchernovichthys exspectatum) foram analisados através de
observação direta, fotografias, desenhos e descrições e submetidos a uma análise de Sistemática
Filogenética utilizando o princípio da parcimônia. Três espécies recentes (i.e., Elops saurus,
Hoplias malabaricus e Salmo trutta) foram usadas como grupo externo. Sessenta e dois
caracteres foram selecionados e, como resultado, seis árvores igualmente parcimoniosas foram
obtidas com 325 passos, índice de consistência (CI) de 0,2523 e índice de retenção (RI) de
0,4309. O consenso estrito é representado pela seguinte topologia: ((C. marocanus), (C.
brasiliensis, (H. malabaricus + S. diasii))) ((G. gaudryi, (C. macropoma + L. characiformis)), (K.
daguini), ((A. canadensis, (novo euteleósteo, (S. elegans + W. congolensis), (B. ouricuriensis + B.
marizalensis)), (L. spratiiformis, (S. scutata, (N. brevis + P. formosa))), (B. joneti), (O. leichi),
(H. operta + T. exspectatum), indicando que euteleósteos basais não formam um grupo
monofilético e que as atuais sinapomorfias propostas são insuficientes para suportar o grupo. / Teleostei is the most diversified group among vertebrates and its oldest record dates from
the Jurassic. It is currently divided into four clades, from which Euteleostei is the most derived
and varied one. Despite all the studies on this group, precise diagnosis, definition, and
composition are still lacking. The nine different phylogenetic hypotheses proposed in the last 30
years demonstrate the disagreement among authors. Several Cretaceous fossil fishes are assigned
to basal euteleosteans due to the lack of morphological data, whereas some others possess a
controversial taxonomic classification, and/or share anatomical features with basal euteleosteans.
In this context, the goals of the present dissertation are to verify the monophyly of basal
euteleosteans and to recover phylogenetic relationships within the taxa from Northeastern Brazil,
Africa, Europe, Asia, and North America assigned to basal euteleosteans. Seven Brazilian taxa
(i.e., Beurlenichthys ouricuriensis, Britoichthys marizalensis, Clupavus brasiliensis,
Santanasalmo elegans, Santanichthys diasii, Scombroclupeoides scutata, and new
euteleostean from the Pelotas Basin) and 14 from foregoing localities (i.e., Avitosmerus
canadensis, Barcarenichthys joneti, Chanoides macropoma, Clupavus maroccanus,
Gaudryella gaudryi, Humbertia operta, Kermichthys daguini, Leptolepides spratiiformis,
Lusitanichthys characiformis, Nybelinoides brevis, Orthogonikleithrus leichi, Pattersonella
formosa, Wenzichthys congolensis, and Tchernovichthys exspectatum) were analyzed by direct
observation, as well as by means of photographs, drawings, and descriptions. After that, these
taxa were submitted to a cladistic analysis using the principle of parsimony. Three living species
(i.e., Elops saurus, Hoplias malabaricus, and Salmo trutta) were chosen to the outgroup. Sixtytwo
characters were selected and, as a result, six equally parsimonious trees were obtained, with a
length of 325 steps, consistency index (CI) of 0.2523, and retention index (RI) of 0.4309. The
strict consensus tree is represented by the following topology: ((C. marocanus), (C. brasiliensis,
(H. malabaricus + S. diasii))) ((G. gaudryi, (C. macropoma + L. characiformis)), (K. daguini),
((A. canadensis, (new euteleostean, (S. elegans + W. congolensis), (B. ouricuriensis + B.
marizalensis)), (L. spratiiformis, (S. scutata, (N. brevis + P. formosa))), (B. joneti), (O. leichi),
(H. operta + T. exspectatum), indicating that basal euteleosteans are not a monophyletic group
and that the current synapomorphies are insufficient to support it.
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Estudos morfológicos e filogenéticos de Sebastiania Spreng. (Hippomaneae, Euphorbiaceae) / Morphological and phylogenetics studies at Sebastiania Spreng. (Hippomaneae, Euphorbiaceae)SOUZA, Sarah Maria Athiê de 11 February 2011 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-07-04T14:28:23Z
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Previous issue date: 2011-02-11 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Hippomaneae (Euphorbiaceae) has 33 genera standing out Sebastiania including about 25 species. Sebastiania is a promising group to realize a phylogenetical studies, because of the representativeness in the Brazilian flora, morphological complexity, imprecise specific composition and because is polyphyletic. The aims of this work were understand Sebastiania circumscription through phylogenetical hypothesis and to supply morphological characters of the fruits and seeds useful for determination of the affinities in the American genera of the Hippomaneae. For the morphological and molecular analysis were used 30 species of Sebastiania (19) Colliguaja (1), Dendrocousinsia (1), Gymnanthes (3), Hippomane (1), Microstachys (3), Pleradenophora (1) and Spirostachys (1). The phylogenetic study of Sebastiania based on individual and combined morphological and trnL-F. The maximal parcimony analysis morphological+trnL-F resulted in 2000 trees similarly parcimonious with a consistence index (CI) = 0,45 and retention index (RI) = 0,63. Sebastiania it show polyphyletic because some of its species grouped together to the Gymnanthes and Spirostachys and other occurred in basal position in the phylogeny. However, a clade which includes the majority of the species of Sebastiania (Sebastiania s. str.) is monophyletic when are included Microstachys ramosissima and Gymnanthes integra and is sustained by sinapomorphies: absence of stamens sepals covering to the anthers in pre-anthesis, septum fruit shaped, mericarp with separate basal triangle, columella apex shaped, projection fleshy adhered to the columella after fruit dehiscence, seed smooth and without caruncle. It’s suggested the transfer of species S. lottiae, S. membranifolia, S. panamensis and S. tikalana of the Sebastiania circumscription. Besides, attributes such as type and dehiscence of fruit,surface texture, mericarp with separate basal triangle, columella apex shaped, presence of caruncle and aril were useful for the delimitation of the Hippomaneae genera. / Hippomaneae (Euphorbiaceae) abrange 33 gêneros destacando Sebastiania com cerca de 25 espécies. Sebastiania mostra-se como um grupo promissor para a condução de um estudo filogenético, pela considerável representatividade na flora brasileira, complexidade morfológica, imprecisa composição específica e por ser polifilético. Dessa forma, o presente trabalho teve como objetivos avaliar a circunscrição de Sebastiania a partir de uma hipótese filogenética e fornecer caracteres morfológicos de frutos e sementes úteis para delimitações genéricas em Hippomaneae. As análises filogenéticas moleculares e morfológicas incluíram 30 espécies dos gêneros Sebastiania (19), Colliguaja (1), Dendrocousinsia (1), Gymnanthes (3), Hippomane (1), Microstachys (3), Pleradenophora (1) e Spirostachys (1). O estudo filogenético de Sebastiania baseou-se em análises individuais e combinadas, incluindo morfologia e trnL-F. A análise cladística morfológica + trnL-F de máxima parcimônia resultou em 2000 árvores igualmente parcimoniosas com índice de consistência (IC) = 0,45 e índice de retenção (IR) = 0,63. Sebastiania foi apontado como polifilético em função de algumas de suas espécies se agruparem com Dendrocousinsia, Gymnanthes e Spirostachys ou por terem surgido em posição basal na filogenia. Um clado que reúne a maioria das espécies de Sebastiania (Sebastiania s. str.) é monofilético pela inclusão de Microstachys ramosissima e Gymnanthes integra, e teve como sinapomorfias: glândulas foliares restritas ao ápice das indentações marginais do limbo, anteras não recobertas pelas sépalas estaminadas na préantese, fruto com septo interno em forma de C e sem fenda oblíqua triangular na porção inferior da valva, columela com ápice claviforme e com excrescência carnosa aderida após a deiscência do fruto, sementes sem carúncula e com testa lisa. Sugere-se a transferência de S. lottiae, S. membranifolia, S. panamensis e S. tikalana da circunscrição deste gênero. Além disso, caracteres como o tipo de fruto, comprimento do estilete, forma do septo interno do mericarpo, formato da ala e do ápice da columela, presença de carpidióforo, presença de arilo, presença e forma da carúncula e ornamentação da superfície da semente foram úteis para delimitações genéricas em Hippomaneae.
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Sistemática do gênero Amasonia L. nom. cons. (Lamiaceae)SANTOS, Juliana Silva dos 15 February 2011 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-07-05T16:36:24Z
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Previous issue date: 2011-02-15 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Amasonia L. (Lamiaceae - Ajugoideae), there is the difficult distinction between its species, which makes it complex, and also because little is known about its relationship with related genera. This study aimed to perform a morphological cladistic analysis of the Amasonia genus, to contribute with understanding of its interspecific relationships, and provide subsidies for the correct identification of its taxa. For the taxonomic study were analyzed voucher specimens and from collections held in the Central West region of Brazil. For the cladistic analysis were selected 42 characters of 13 species, of which eight belong to the Amasonia, three Aegiphila and a representative of the genus Clerodendrum and other of Tetraclea. The morphological matrix was developed through the program Nexus Data Editor, version 5.0 and analyzed by Paup 4.0 by the method of maximal parsimony. Were found three equally parsimonious trees with consistence index (CI) = 0, 6852 and a retention index (RI) = 0,7018. Were recognized eight species in the genus: A. angustifolia, A. arborea, A. calycina, A. campestris, A. hirta, A. lasiocaulis, A. obovata and A. spruceana, mainly dispersed in the savanna formation in Midwest Brazil and in the forests of the Amazon domain. Three synonyms were proposed: Amasonia campestris var. surinamensis Moldenke synonymized to A. campestris; A. hirta var. paraensis Moldenke and A. lasiocaulis var. macrophylla Moldenke synonymized to A. lasiocaulis. Amasonia emerged as a monophyletic genus and it had the clade formed by Tetraclea and Clerodendrum as the closest sister group. Amasonia hirta was pointed as a basal group and sister group to the other species. Aegiphila was shown as paraphyletic, but due to its low sampling in this study, few inferences about the genus could be done. / Amasonia L. (Lamiaceae - Ajugoideae), destaca-se pela difícil distinção entre suas espécies, o que o torna complexo, e também pelo pouco conhecimento sobre sua relação com gêneros afins. Este trabalho objetivou conhecer a filogenia do gênero Amasonia com base em dados morfológicos a fim de contribuir para um maior entendimento das relações interespecíficas do gênero, bem como fornecer subsídios para a correta identificação de seus táxons. Para o estudo taxonômico foram analisadas coleções de herbários e espécimes provenientes de coletas realizadas na região Centro-Oeste do Brasil. Para a análise cladística foram levantados 42 caracteres de 13 espécies, das quais oito pertencentes a Amasonia, três a Aegiphila e um representante dos gêneros Clerodendrum e Tetraclea. A matriz morfológica foi desenvolvida através do programa Nexus Data Editor, versão 5.0 e analisada pelo Paup 4.0 pelo método de máxima parcimônia. Foram encontradas três árvores igualmente parcimoniosas com índices de consistência (IC) = 0, 6852 e retenção (IR) = 0, 7018. Foram reconhecidas oito espécies para o gênero: A. angustifolia, A. arborea, A. calycina, A. campestris, A. hirta, A. lasiocaulis, A. obovata e A. spruceana, distribuídas principalmente no cerrado da região Centro-Oeste do Brasil e nas florestas de domínio amazônico, incluindo ambientes savanóides. Três sinonimizações são propostas: Amasonia campestris var. surinamensis Moldenke sinonimizada à A. campestris; A. hirta var. paraensis Moldenke e A. lasiocaulis var. macrophylla Moldenke sinonimizadas à A. lasiocaulis. Amasonia emergiu como um gênero monofilético e teve como grupo irmão o clado formado por Clerodendrum e Tetraclea. Amasonia hirta foi apontada como espécie basal e grupo irmão das demais espécies. Aegiphila surgiu como um grupo parafilético, mas devido a sua baixa amostragem neste trabalho, poucas inferências sobre o gênero puderam ser feitas.
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Revisão do gênero Neogonodactylus Manning, 1995 e análise filogenética da superfamília Gonodactyloidea Giesbrecht, 1910 (Crustacea: Stomatopoda)ALBUQUERQUE, Débora Lucatelli de 02 1900 (has links)
Submitted by Caroline Falcao (caroline.rfalcao@ufpe.br) on 2017-05-18T18:34:42Z
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Previous issue date: 2014-02 / Gonodactyloidea é considerada a segunda maior superfamília de Stomatopoda em número de
espécies. A complexidade morfológica e a grande representatividade de exemplares,
principalmente do gênero Neogonodactylus, em águas brasileiras, chamou a atenção para
importância de estudar este grupo. Este gênero possui distribuição anfi-americana e é registrado
em ambos os hemisférios. A monofilia da superfamília, família e gênero ainda não havia sido
comprovada, o que gerou o interesse e necessidade de reavaliar o grupo. Portanto, o presente
trabalho teve como objetivo testar a monofilia da superfamília, bem como da família
Gonodactylidae, com enfoque principal no gênero Neogonodactylus, que foi analisado quanto à
sua taxonomia, sistemática e filogenia. O material utilizado proveio principalmente das coleções
carcinológicas do Museu de Oceanografia Petrônio Alves Coelho (Brasil) e National Museum of
Natural History (EUA), abrangendo mais de mil exemplares de 38 espécies. O presente trabalho
foi realizado a partir da construção de duas matrizes de caracteres geradas no programa DELTA
1.0-RC4, uma para avaliação da superfamília e família, contendo dezoito taxa e 59 caracteres; e
outra para análise de Neogonodactylus, incluindo suas 22 espécies mais uma de Gonodactylus
como grupo externo com 54 caracteres. As análises filogenéticas foram geradas com base nessas
matrizes, através do programa PAUP 4.0, pelo método de busca heurística, com 1000 réplicas,
onde os caracteres não foram pesados nem ordenados. Os índices de Bremer e Bootstrap foram
utilizados para avaliar a consistência dos ramos. Apesar dos índices filogenéticos não
apresentarem valores altos, a monofilia da superfamília Gonodactyloidea surge com a retirada de
Alainosquillidae da mesma. Esta era a única família a possuir espécies do grupo funcional
spearers, porém a posição desta família não ficou clara na presente análise. Desta forma, o
presente trabalho traz uma proposta de monofilia tanto de Gonodactyloidea, quanto de
Gonodactylidae. Pela primeira vez foi realizada a filogenia do gênero Neogonodactylus
englobando todas as espécies existentes, desta forma o gênero começa a ser mais bem
compreendido. Redescrições, desenhos e chave de identificação para o gênero Neogonodactylus
foram confeccionados. Variações e informações adicionais também foram analisadas e
fornecidas para cada espécie. Assim o presente trabalho contribuiu de forma inédita para a
melhor compreensão de Gonodactyloidea, da família Gonodactylidae e de Neogonodactylus. / Gonodactyloidea is considered the second largest superfamily within Stomatopoda regarding the
number of species. The morphological complexity and the representativeness of specimens,
mainly of the genus Neogonodactylus, in Brazilian waters brought attention to the importance of
studying this group. Neogonodactylus has an amphi-american distribution and it has been
registered in both hemispheres. The monophyly of the superfamily, family and genus have not
been proved yet, generating the interest and the necessity to review the group. Therefore, the
present work aimed to test the monophyly of the superfamily Gonodactyloidea, as well as of the
family Gonodactylidae, with a main focus on the genus Neogonodactylus, which was analyzed
based on its taxonomy, systematic and phylogeny. The material was mainly provided from the
carcinological collections of Museu de Oceanografia Petrônio Alves Coelho (Brazil) e National
Museum of Natural History (EUA), covering more than one thousand specimens of 38 species.
The present work was based on two characters matrixes, generated on DELTA 1.0-RC4
program, one to evaluate the superfamily and family based on eighteen taxa and 59 characters;
and the other to analyze the Neogonodactylus genus, including their own 22 species and one
Gonodactylus as out group with 54 characteres. Phylogenetic analysis were based on these
matrixes, through the PAUP 4.0 program, with heuristic source method, with 1000 replicates,
with characters not weighted neither ordinated. The Bremer and Bootstrap indexes were used to
evaluate the branch consistency. Despite the fact that phylogenetic indexes did not present high
values, the monophyly of the superfamily Gonodactyloidea raised with the exclusion of the
family Alainosquillidae. This was the only family to bear species from the functional group
spearers; however, the position of this family was still not clear in the current analysis. Thus the
present thesis proposes the monophyly of the Gonodactyloidea and Gonodactylidae. For the first
time, the phylogeny of the genus Neogonodactylus was performed, and since it encompassed all
the extant species, the genus began to be more understood. Redescriptions of species, figures and
a key for the genus Neogonodactylus were made. Variations and additional information were
also studied and released for each species. Thereby the present work contributed in a unique way
to a better understanding of Gonodactyloidea, Gonodactylidae and Neogonodactylus.
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Análise filogenética e morfológica da subfamília pangoniinae (Diptera: Tabanidae), com ênfase na tribo Scionini / Phylogenetic and morphological analysis of the subfamily Pangoniinae (Diptera: Tabanidae),with emphasis on the tribe ScioniniDaniel Dias Dornelas do Carmo 27 March 2014 (has links)
Tabanidae (Diptera: Brachycera), a maior família da infraordem Tabanomorpha, possui aproximadamente 4500 espécies válidas, que se distribuem por todas as regiões biogeográficas, com exceção da Antártica. São insetos cujo tamanho varia de quatro a trinta mm. As fêmas são hematófagas, e os machos visitam flores. A classificação de Tabanidae constitui um problema histórico, e apesar de um número grande de autores ter abordado o problema, poucos são os trabalhos que trataram do grupo dentro de uma perspectiva filogenética. Nesse contexto, este trabalho, junto com Lessard et al. (2013 Molec.Phylog.Evol. 68: 516540), são os primeiros tratados envolvendo a classificação da Tribo Scionini (Tabanidae: Pangoniinae) utilizando análises filogenéticas. Para o presente estudo, foram levantados caracteres da cabeça, asa e terminálias feminina e masculina dos espécimes analisados e esses caracteres foram compilados em uma matriz de 37 táxons por 44 caracteres. A matriz foi analisada com o auxílio do programa TNT. Desta análise foram obtidos quatro cladogramas igualmente parcimoniosos, sobre os quais foi utilizado o consenso estrito. No cladograma de consenso, duas subfamílias de Tabanidae são mostradas como grupos naturais (Tabaninae e Chrysopsinae), enquanto a monofilia de Pangoniinae permaneceu não resolvida na análise com pesos iguais. Quando utilizada pesagem implícita, todas as três famílias são mostradas como monofiléticas. Os Scionini se mostraram um grupo merofilético, assim como dois de seus gêneros, Scaptia e Fidena. A partir dos resultados aqui obtidos, é indicada a necessidade para a reformulação futura da delimitação dos Scionini, bem como é apontada a necessidade de revisão de alguns gêneros que compõem a subfamília Pangoniinae. / Tabanidae (Diptera: Brachycera), the most speciose family within the infraorder Tabanomorpha, comprises approximately 4500 valid species, distributed through all the biogeographical regions, except Antarctica. These insects range in length from four to tirty millimeters. Females are hematophagus and males visit flowers. The classification of Tabanidae constitutes an historical problem and, despite the fact that a great number of authors had addressed the problem, few are the works that treated the group from a phylogenetic perspective. In this context, this work, together with Lessard et al. (2013 Molec.Phylog.Evol. 68:526-540), are the first treatises dealing with the classification of the tribe Scionini (Tabanidae: Pangoniinae) based on a phylogenetic analysis. In the present work, characters from head, wing and both female and male terminalia were coded into a matrix of 37 taxa by 44 characters. The matrix was analyzed with the software TNT. From this analysis four equally parsimonious cladograms were obtained, over which the strict consensus was calculated. In the consensus cladogram, two subfamilies of Tabanidae are shown as natural groups (Tabaninae and Chrysopsinae), whereas the monophyly of Pangoniinae was not recovered with equal weights parsimony. When implied weighting was used however, all the three subfamilies are shown to be monophyletic groups. The Scionini were shown as merophyletic, as did two of its genera, Scaptia and Fidena. From the results herein obtained, it is indicated the need for the re-delimitation of Scionini. It is also argued that revisions of some genera comprised within Pangoniinae are urgent for achievement of improved taxonomic stability in this subfamily.
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Filogenia e evolução das espécies do gênero Phrynops (Testudines, Chelidae) / Phylogeny and evolution of the species of the genus Phrynops (Testudines, Chelidae)Natália Rizzo Friol 24 November 2014 (has links)
O gênero Phrynops abrange quatro espécies válidas, incluindo o complexo da espécies Phrynops geoffroanus, e apresenta uma filogenia historicamente mal compreendida. Esse projeto objetivou estudar este gênero, com ênfase especial nas populações de P. geoffroanus, através de análises morfométricas, morfológicas, osteológicas e moleculares, a fim de entender sua taxonomia e definir suas relações filogenéticas. Para tanto, foram coletados e emprestados espécimes das populações de P. geoffroanus de dez bacias hidrográficas brasileiras, além de P. tuberosus, P. williamsi e P. hilarii para compôr a análise. A partir disso, foi feita uma análise morfométrica linear dos espécimes das populações de P. geoffroanus, bem como uma comparação do padrão de coloração desses indivíduos com o intuito de definir as populações taxonomicamente distintas dentro da área de distribuição da espécie. Para as análises filogenéticas, foram preparados esqueletos completos e sequenciados os genes 12S, cytb, ND4, R35 e Rag 2 das espeçies de Phrynops e do seu grupo externo, considerando todos os gêneros e quase todas as espécies de Chelidae, bem como representantes de Podocnemididae e Pelomedusidae. Foram conduzidos três conjuntos distintos de análises filogenéticas com os dados moleculares e morfológicos obtidos durante este estudo: 1) uma análise de parcimônia da matriz morfológica; 2) uma análise de máxima verossimilhança das sequências moleculares; 3) uma análise de parcimônia dos dados morfológicos e moleculares concatenados. Como resultados, os dados morfométricos e osteológicos mostram que a população de P. geoffroanus da bacia do rio Paraná representa uma espécie nova, distinta das demais populações pertencentes ao complexo geoffroanus. Além disso, a população de P. geoffroanus do Rio Doce é claramente distinta das demais populações nas hipóteses moleculares. O exemplar de P. williamsi do Rio Iguaçu se distingue molecularmente do clado formado pelos demais exemplares de P. williamsi do Rio do Peixe. Os dados morfológicos e moleculares concatenados mostram que o gênero Phrynops representa um grupo monofilético. As populações de P. geoffroanus apresentaram evidências de agrupamento por bacias. Nas análises moleculares e concatenadas, P. hilarii se posiciona dentro do clado formado pelas populações de P. geoffroanus. O conjunto de dados osteológicos posiciona Mesoclemmys como grupo-irmão de Phrynops, porém, no conjunto de dados moleculares Phrynops aparece como grupo-irmão dos demais gêneros, exceto Hydromedusa e Chelus que encontram-se em uma posição mais basal nessa hipótese. Desta forma, não foi possível definir com clareza o grupo-irmão do gênero Phrynops neste estudo. Os caracteres osteológicos e moleculares evidenciaram Mesoclemmys como um grupo parafilético, pela não inclusão de Mesoclemmys hogei nesse gênero. Por fim, neste estudo, fica evidente que P. geoffroanus e P. tuberosus pertencem à calha norte do rio Amazonas e não se distinguem através do conjunto de dados osteológicos e morfométricos empregados aqui. Entretanto, uma amostragem das localidades específicas será necessária para definir objetivamente o status taxonômico de P. tuberosus / The genus Phrynops covers four valid species, including the species complex Phrynops geoffroanus. The genus has a confuse and poorly resolved taxonomic and phylogenetic history. This project aimed to study the genus Phrynops, with particular emphasis on populations of P. geoffroanus and P. tuberosus, through morphometric, morphological, osteological and molecular analyzes, in order to understand their taxonomy and provide a phylogenetic hypothesis for their interrelationships. Specimens representing populations of P. geoffroanus from ten Brazilian river basins, as well as P. tuberosus, P. williamsi and P. hilarii, were collected or loaned from institutions. A linear morphometric analysis and comparison of color patterns were performed in individuals belonging to the populations of P. geoffroanus in order to define taxonomically distinct populations within the range of the species. For the phylogenetic analyzes, complete skeletons were prepared and tissue samples were sequenced for the genes 12S, cytb, ND4, R35 and Rag 2, for most species of Phrynops and its outgroup taxa, considering all genera and almost all species of Chelidae, as well as representatives of Podocnemididae and Pelomedusidae. Three distinct sets of phylogenetic analyzes were performed with the molecular and morphological data obtained during this study:1) a parsimony analysis of the morphological matrix;2) a maximum likelihood analysis of molecular sequences;3) a parsimony analysis of the combined morphological and molecular data. As a result, the morphometric and osteological data show that the population of P. geoffroanus from the Paraná River basin is a distinct species, and therefore new. The population of P. geoffroanus from the Doce River is clearly distinct from other populations in the molecular hypotheses. The specimen of P. williamsi from the Iguaçu River separates molecularly from the clade formed by the remaining populations of P. williamsi from the Peixe River. The combined morphological and molecular data show that the genus Phrynops corresponds to a well supported monophyletic group.The sampled populations of P. geoffroanus showed evidence of grouping by distinct river basins. In both molecular and combined analyzes, P. hilarii is rooted within the clade formed by the populations of P. geoffroanus. The set of skeletal data supports Mesoclemmys as the sister group of Phrynops, while the molecular data set shows Phrynops as the sister group of a clade composed by all the remaining genera, except Hydromedusa and Chelus that are positioned more basally in the tree. Therefore, the present analysis failed to define without ambiguity the sister-group relationship of the genus Phrynops. Both osteological and molecular datasets showed Mesoclemmys as a paraphyletic group, with the exclusion of Mesoclemmys hogei from the genus. Finally, it seems evident that P. tuberosus and P. geoffroanus belong to the north region of the Amazon River and are not distinguishable by the set of osteological and morphometric data used in the present study. However, a larger sampling of specific locations will be required to objectively define the taxonomic status of P. tuberosus
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Revisão taxonômica e análise cladística de Lepidophora Westwood, 1835 (Diptera, Bombyliidae, Ecliminae) / Taxonomic review and cladistic analysis of Lepidophora Westwood, 1835 (Diptera, Bombyliidae, Ecliminae)Paula Fernanda Motta Rodrigues 10 June 2011 (has links)
Atualmente os Bombyliidae encontram-se divididos em 16 subfamílias e 18 tribos. A subfamília Ecliminae inclui nove gêneros, três dos quais com ocorrência na Região Neotropical (Cyrtomyia Bigot, Lepidophora Westwood e Thevenetimyia Bigot). Uma revisão taxonômica do gênero Lepidophora é apresentada pelo presente estudo, com redescrições e ilustrações das espécies. São reconhecidas oito espécies válidas, duas exclusivamente neárticas (L. lepidocera Wiedemann, 1828 e L. lútea Painter, 1962), cinco exclusivamente neotropicais (L. acroleuca Painter, 1930, L. culiciformis Walker, 1850, L. cuneata Painter, 1939, L. secutor Walker, 1857 e L. trypoxylona Hall, 1981) e uma com distribuição registrada em ambas as regiões (L. vetusta Walker, 1857). Uma chave para identificação destas espécies, baseada em caracteres morfológicos diagnósticos de fácil e rápida observação, também é apresentada. O registro geográfico da maioria das espécies e do gênero está atualizado, com mapas de distribuição para cada espécie e para o gênero. Este estudo também apresenta uma hipótese filogenética para as espécies de Lepidophora, baseada na análise cladística de 106 caracteres morfológicos, obtendo como resultado, após busca heurística simples, uma única topologia bem resolvida com 198 passos. Lepidophora revela-se monofilético e divide-se em dois grupos monofiléticos, o mais basal formado pelas espécies exclusivamente neárticas (L. lepidocera e L. lútea) e o mais derivado formado pelas demais espécies (L. acroleuca, L. culiciformis, L. cuneata, L. secutor, L. trypoxylona e L. vetusta). O gênero Cyrtomyia, único da subfamília com distribuição exclusivamente Neotropical, também se mostra monofilético. Os resultados obtidos demonstram ainda que a espécie P. austeni (Paramonov, 1949) não pertence, de fato, ao gênero Lepidophora, corroborando a hipótese de François que em 1964 erigiu o gênero Palintonus para alocar tal espécie. Este gênero monotípico posiciona-se como grupo-irmão do clado Cyrtomyia + Lepidophora. Embora não seja possível apontar a posição filogenética de Lepidophora dentro da subfamília Ecliminae, os resultados deste estudo poderão contribuir para estudos futuros num nível mais abrangente, principalmente em relação à gama de novos caracteres levantados e utilizados pela primeira vez em uma análise cladística para Bombyliidae. / Currently the Bombyliidae are divided into 16 subfamilies and 18 tribes. The subfamily Ecliminae includes nine genera, three of which occurring in the Neotropical Region (Cyrtomyia Bigot, Lepidophora Westwood, and Thevenetimyia Bigot). A taxonomic review of the genus Lepidophora is provided by this study, with redescription and illustrations of the species. Eight valid species are recognized, two exclusively Neartic (L. lepidocera Wiedemann, 1828 and L. lutea Painter, 1962), five exclusively Neotropical (L. acroleuca Painter, 1930, L. culiciformis Walker, 1850, L. cuneata Painter, 1939, L. secutor Walker, 1857 and L. trypoxylona Hall, 1981) and one with distribution recorded in both regions (L. vetusta Walker, 1857). An identification key to the species based on diagnostics morphological characters, of easy and fast observation is also presented. The geographic record of most species and genus is updated with distribution maps for each species and for the genus. This study also presents a phylogenetic hypothesis of Lepidophora species based on cladistic analysis of 106 morphological characters, obtaining with the result, after simple heuristic search, a single well resolved topology with 198 steps. Lepidophora is shown to be monophyletic and is divided into two monophyletic group, the most basal formed by the species exclusively Neartic (L. lepidocera and L. lutea) and the most derived formed by remaining species (L. acroleuca, L. culiciformis, L. cuneata, L. secutor, L. trypoxylona and L. vetusta). The genus Cyrtomyia, single of subfamily with distribution exclusively Neotropical, is also shown to be monophyletic. The results also show that the species P. Austeni (Paramonov, 1949) does not belong, indeed, to the genus Lepidophora, supporting the Françoiss hypotesis that in 1964 erected the genus Palintonus to allocate this species. This monotypic genus is positioned as sister-group of the clade Cyrtomyia + Lepidophora. Although it is not possible to identify the phylogenetic position of Lepidophora within the subfamily Ecliminae, the results of this study may contribute to future studies on a broader level, especially by the new characters proposed and used for the first time in a cladistic analysis to Bombyliidae.
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Análise cladística de Titanoecidae e revisão sistemática dos gêneros Anuvinda e Goeldia (Arachnida: Araneae) / Cladistic analysis of Titanoecidae and revision of the genera Goeldia and Anuvinda (Arachnida: Araneae)Lina Maria Almeida Silva 03 March 2009 (has links)
Titanoecidae foi proposta por Lehtinen para agrigar cinco gêneros: Titanoeca Thorell (31 spp.), Nurscia Simon (4 spp.), Goeldia Keyserling, (8 spp.), Pandava Lehtinen (2 spp.) e Anuvinda Lehtinen (1 sp.). A família é diagnosticada pela presença de uma dobra dorso-apical complexa na tíbia do palpo dos machos e recentes hipóteses filogenéticas reportam seu parentesco com Phyxelididae, porém as relações internas na família permanecem desconhecidas. Realizamos uma análise cladística com 92 caracteres morfológicos e baseada em parcimônia para Titanoecidae e revisamos os gênero Anuvinda e Goeldia. O grupo-interno contém 32 táxons terminais, incluindo as espécies-tipo dos gêneros, e totalizando 15 espécies de Goeldia, 6 de Titanoeca, 4 de Nurscia, uma de Anuvinda e uma de Pandava. Como grupo-externo foram utilizadas espécies de Phyxelididae (3 spp.) Amaurobiidae (1sp.) Tengellidae (1 sp.) Zoropsidae (1sp.) e de Nicodamidae (2 sp.). Os resultados mostram que Titanoecidae pode ser divididade em dois clados: um formado por Goeldia e Anuvinda como grupo-irmão de Pandava aqui denominado Goeldinae subfam. nov. e outro formado por Titanoeca e Nurscia chamsdo Titanoecinae, Lehtinen, 1967. A revisão de Goeldia revelou sete espécies novas para Brasil (4), Colômbia (1) e Peru (1). Titanoeca guayaquilensis do Equador é transferida para Goeldia Geoldia guayaquilensis comb. nov. e pela primeira vez são descritos o macho de G. nigra e a fêmea de G. guayaquilensis. / The family Titanoecidae was proposed by Lehtinen to include five genera: Titanoeca Thorell (31 spp.), Nurscia Simon (4 spp.), Goeldia Keyserling, (8 spp.), Pandava Lehtinen (2 spp.) and Anuvinda Lehtinen (1 sp.). The family is diagnosed by the presence of a complex dorso-apical fold on the tibia of the male palp. Recent phylogenetic analyses point towards a close relationship between Titanoecidae and Phyxelididae but knowledge on the relations between its genera and species remain uncertain. A cladistic analysis for Titanoecidae was carried out based on parsimony and using 92 morphological characters. The in-group comprised 32 taxa, including the type species of all genera plus 15 species of Goeldia, six Titanoeca, four Nurcia, one Anuvinda and one Pandava. The out-group included species of Phyxelididae (3 spp.) Amaurobiidae (1sp.) Tengellidae (1 sp.) Zoropsidae (1sp.) and Nicodamidae (2 sp.).Results show that Titanoecidae is a monophyletic group and can be divided in two major clades: one including Goeldia and Anuvinda sister to Pandava, herein denominated Goeldinae subfam. nov. and the other, Titanoecinae Lehtinen, including Titanoeca and Nurscia. Based on the results of the cladistic analysis Titanoeca guayaquilensis, from Ecuador, is transferred to Goeldia. In addition The genera Anuvinda and Goeldia are revised. The male of Goeldia nigra and the female of G. guayaquilensis are described for the first time and seven species of Goeldia are newly described: four from Brazil, one from Colombia and one from Peru.
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Análise cladística do gênero neotropical Mesabolivar González-Sponga, 1998 (Araneae: Pholcidae) / Cladistic analysis of the Neotropical genus Mesabolivar González-Sponga, 1998 (Araneae: Pholcidae)Éwerton Ortiz Machado 08 May 2007 (has links)
O gênero Mesabolivar González-Sponga, 1998 é composto atualmente por 36 espécies de distribuição restrita à América do Sul. O gênero foi dividido tentativamente em quatro grupos operacionais de espécies sensu Huber: grupo norte 1, incluindo M. eberhardi Huber, M. huanuco Huber, M. aurantiacus (Mello-Leitão), M. cyaneus (Taczanowski); grupo norte 2, incluindo M. pseudoblechroscelis, M. huambisa Huber, M. locono Huber, M. junin Huber, M. paraensis (Mello-Leitão), M. exlineae(Mello-Leitão); grupo sul, incluindo M. cyaneomaculatus (Keyserling), M. spinulosus (Mello-Leitão), M. ceruleiventris (Mello- Leitão), M. tandilicus (Mello-Leitão), M. iguazu Huber, M. argentinensis (Mello-Leitão), M. brasiliensis (Mello-Leitão), M. togatus (Keyserling), M. guapiara Huber, M. maxacali Huber, M. botocudo Huber, M. cyaneotaeniatus (Keyserling), M. azureus (Badcock & Oxon), M. fluminensisi (Mello-Leitão), M. nigridentis (Mello-Leitão) e o grupo miscelânea, incluindo M. luteus (Keyserling), M. simoni (Moenkhaus), M. difficilis (Mello-Leitão), M. banksi (Moenkhaus), M. levii Huber, M. cambridgei (Mello-Leitão), M. xingu Huber. Até o momento não existia uma filogenia intragenérica estabelecida, e estes grupos não representam grupos com bases filogenéticas. Foi realizada no presente trabalho uma análise cladística com uma busca heurística usando os métodos ratchet, drift, sectorial search e tree fusing combinados. Foram incluídas 10 espécies novas descritas aqui e 26 espécies já descritas de Mesabolivar, com o intuito de elucidar a relação entre as espécies e avaliar o monofiletismo dos grupos pré-existentes. Foram usados 53 terminais no total, sendo 17 terminais usados como grupo externo. Foram usados 64 caracteres e foram encontrados 8 cladogramas mais parcimoniosos de L=203, CI=43 e RI=74. Os resultados mostraram que três espécies de Mesabolivar são relacionadas a outros gêneros. Destas, M. cambridgei foi transferida para o gênero Carapoia e M. luteus e M. levii foram transferidas para um gênero novo, Kaiowa gen. n.. As demais espécies de Mesabolivar estudadas formam um grupo monofilético suportado pelo procurso curvado dorsalmente, pela presença de uma projeção transparente ventral na divisão embólica e pela presença de projeções no epígino. Nenhum dos grupos sensu Huber foi plenamente corroborado. Após o exame das coleções nacionais, ficou claro que o gênero Mesabolivar é muito diverso, especialmente no Brasil, região pouco estudada em relação aos folcídeos, e desta forma, importante para a resolução de problemas na filogenia da família, especialmente o Clado Novo Mundo. / The genus Mesabolivar González-Sponga, 1998 includes presently 36 species and is restricted to South America. The genus was tentatively divided into four operacional species groups by Huber: northern group 1, including M. eberhardi Huber, M. huanuco Huber, M. aurantiacus (Mello-Leitão), M. cyaneus (Taczanowski); northern group 2, including M. pseudoblechroscelis, M. huambisa Huber, M. locono Huber, M. juninHuber, M. paraensis (Mello-Leitão), M. exlineae (Mello-Leitão); southern group, including M. cyaneomaculatus (Keyserling), M. spinulosus (Mello-Leitão), M. ceruleiventris (Mello-Leitão), M. tandilicus (Mello-Leitão), M. iguazu Huber, M. argentinensis (Mello-Leitão), M. brasiliensis (Mello- Leitão), M. togatus (Keyserling), M. guapiara Huber, M. maxacali Huber, M. botocudo Huber, M. cyaneotaeniatus (Keyserling), M. azureus (Badcock & Oxon), M. fluminensisi (Mello-Leitão), M. nigridentis (Mello-Leitão); and the miscellaneous group, including M. luteus (Keyserling), M. simoni (Moenkhaus), M. difficilis (Mello-Leitão), M. banksi (Moenkhaus), M. levii Huber, M. cambridgei (Mello-Leitão), M. xingu Huber. Until now, no intrageneric phylogeny was carried out, and the proposed groups were not constructed under a phylogenetic approach. In the present work, a cladistic analysis was conducted, performing a heuristc search combined with the methods ratchet, drift, sectorial search and tree fusing. The study includes 26 described and 10 new species species of Mesabolivar, intending to define the relashionship among the species and evaluate the monophyly of the previously defined groups. The analysis was carried out using a total of 53 species, using 17 terminals for the outgroup. The matrix was based on 64 characters, and 8 most parsimonious trees were found (L=203, CI=43; RI=74). The results indicated that three species of Mesabolivar are related to other genera. Therefore, M. cambridgei was transferred to the genus Carapoia; M. luteus and M. levii were transferred to a newly described genus, Kaiowa new genus. The remaining species of Mesabolivar were supported as a monophyletic group by three synapomorphies: dorsally curved procursus, a transparent projection on the bulb and the epigynal projections. None of the groups sensu Huber was completely corroborated. After the examination of the brazilian collections, Mesabolivar was discovered to be very diverse, especially in Brazil, a region scarcely studied concerning pholcids, and then, very important to the resolution of phylogenetic problems in the family, specially the clado New World.
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An essay on morphology and phylogenetic relationships of the family athericidae (diptera:brachycera)Sampronha, Stephanie January 2018 (has links)
Orientador: Prof. Dr. Charles Morphy Dias dos Santos / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Evolução e Diversidade, Santo André, 2018. / A família Athericidae (Diptera, Brachycera) foi criada e posicionada como o grupo irmão
da família Tabanidae por Stuckenberg (1973), incluindo vários gêneros anteriormente
associados a Rhagionidae. Ainda não há estudo formal que discuta as relações filogenéticas
entre as espécies de Athericidae. Portanto, as relações entre os gêneros permanecem
incertas. Além disso, a recente descoberta de espécies fósseis previamente atribuídas à
família traz à tona a importância de um correto posicionamento filogenético desse grupo. O
objetivo deste projeto foi contribuir para o conhecimento taxonômico e filogenético da
família, especialmente para a região neotropical, e também resolver as questões de
posicionamento das espécies fósseis em relação à Athericidae. Este estudo possui grande
relevância no sentido de reconstruir as relações entre as espécies da família, bem como
fornecer informações filogenéticas que podem ser úteis para entender mais profundamente
a evolução do grupo. / The family Athericidae (Diptera, Brachycera) was erected and positioned as the sistergroup
of the family Tabanidae by Stuckenberg (1973), including several genera previously
associated with Rhagionidae. There is still no formal study discussing the phylogenetic
relationships among the species of Athericidae. Hence, the position of most athericid
genera remains unclear. Besides that, the recent discovery of fossil species previously
assigned to the family brings to light the importance of a correct phylogenetic positioning
of this group. The aim of this project was to contribute to the taxonomic and phylogenetic
knowledge of the family, especially to the neotropical region, and also to solve the issues of
positioning of the fossil species in relation to Athericidae. This study has great relevance in
the reconstruction of the relationships among the species of the family, as well as to
provide phylogenetic information that can be useful to understand more deeply the
evolution of the group.
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