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Revisão taxonômica e análise cladística de Ligyra s.l. (Diptera, Bombyliidae, Anthracinae, Exoprosopini) com ênfase na fauna do Novo Mundo / Taxonomic review and phylogenetic analysis of the New World species of Ligyra s.l. (Diptera, Bombyliidae, Anthracinae, Exoprosopini)Acero, Ángela Sabrina Márquez 15 March 2016 (has links)
Bombyliidae é uma das maiores famílias de Diptera com mais de 4822 espécies descritas ao redor do mundo, divididas em 16 subfamílias e 18 tribos. A tribo Exoprosopini dividem-se em 11 gêneros, dos quais Exoprosopa e Ligyra tem distribuição cosmopolita. O gênero Ligyra Newman s.l. objeto deste estudo, possui 109 espécies, das quais 20 têm sido descritas no Novo Mundo. Uma revisão taxonômica das espécies neárticas e neotropicais de Ligyra é feita no presente estudo, incluindo redescrições e registros fotográficos das mesmas. Após a revisão taxonômica, quatro espécies foram sinonimizadas (L. fenestella syn. nov. e L. maracaensis syn. nov. são consideradas sinônimos júnior de Gen. nov. harpyia; L. guerinii syn. nov. foi considerado sinônimo júnior de Gen. nov. latreilli; L. klugii syn. nov. foi considerado sinônimo júnior de Gen. nov. proserpina e a subespécie Ligyra cerberus trifigurata foi considerada sinônimo júnior de Gen. nov. cerberus). Uma chave para identificação destas espécies, baseada em caracteres morfológicos diagnósticos, de fácil observação, também é apresentada. Além da revisão taxonômica uma análise cladística de Ligyra no Novo Mundo foi feita a fim de testar se essas espécies, que atualmente estão incluídas no gênero, pertencem, de fato, a este grupo ou se precisam ser realocadas em algum outro gênero de Exoprosopini ou ainda em um novo gênero. Para tal, neste estudo foi utilizada uma matriz de caracteres morfológicos disponível em literatura, que já vem sendo utilizada para inferir a filogenia dos Exoprosopini. A análise cladística contou com 92 táxons terminais e 207 caracteres morfológicos obtendo-se como resultado, após análise com algoritmos de novas tecnologias a partir do software TNT, 12 árvores mais parcimoniosas cujo consenso estrito possui L=3089, CI: 15 e RI: 49. Os resultados apontam que Ligyra s.l. forma um grupo monofilético composto pelos gêneros: Ligyra s. str. (spp. Australianas), Euligyra (spp. Afrotropicais) e Gênero novo (spp. do Novo Mundo). As espécies de Ligyra s.l. no Novo Mundo foram realocadas em um gênero novo suportado por uma sinapomorfia e quatro homoplasias. / Bombyliidae is one of the largest families of Diptera with more than 4800 species, known worldwide, divided in 16 subfamilies and 18 tribes. The tribe Exoprosopini is divided into 11 genera, of which Exoprosopa Macquart and Ligyra Newman has cosmopolitan distribution. The genus Ligyra s.l., main subject of this study, has 109 species, of which 20 were described to the New World. A taxonomic review of the Nearctic and Neotropical species of Ligyra is implemented in this study, including redescription and photographic records of them. After the taxonomic review, four species were synonymized (L. fenestella syn. nov.and L. maracaensis syn. nov. are considered junior synonym of Gen. nov. harpyia; L. guerinii syn. nov. is considered junior synonym of Gen. nov. latreilli; L. klugii syn. nov .is considered junior synonym of Gen. nov. proserpina and the subspecies Ligyra Cerberus trifigurata is considered junior synonym of Gen. nov. cerberus). An identification key for these species, based on morphological diagnostic characters, easily seen, is also presented. Besides the taxonomic revision a cladistics analysis of the New Worlds Ligyra is implemented in order to test whether these species, which are currently included in the genus, belong, in fact, to this group or if they need to be relocated at some other genus of Exoprosopini or even to a new genus. For this purpose, we used a matrix of morphological characters available in the literature, which is already being used to infer the phylogeny of Exoprosopini. The cladistic analysis included 92 terminal taxa and 207 morphological characters. After analysis with algorithms of new technologies from the software TNT, 12 more parsimonious trees, whose strict consensus has L = 3089, CI 15 and RI: 49, are obtained. The results show that Ligyra s.l. constitutes a monophyletic group composed by the following genera: Ligyra s. str. (Australian spp.), Euligyra (Afrotropical spp.) and New Genus (New World spp.). The species of Ligyra s.l. in the New World are relocated into a new genus, which monophyly is supported by one synapomorphy and four homoplasies.
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Sistemática de Bruggmanniella Tavares, 1909 (Diptera, Cecidomyiidae) / Systematics of Bruggmanniella Tavares, 1909 (Diptera, Cecidomyiidae)Garcia, Carolina de Almeida 03 August 2018 (has links)
A tribo Asphondyliini, pertencente à família Cecidomyiidae, conta com 521 espécies divididas em 44 gêneros com distribuição cosmopolita. Os Asphondyliini estão inseridos na subfamília Cecidomyiinae, que é a maior subfamília em número de espécies, 5100, e se encontra dividida em quatro supertribos: Brachineuridi, Stromatosematidi, Cecidomyiidi e Lasiopteridi. As larvas de Cecidomyiinae possuem hábito micetófago, predador e galhador, sendo que este último aparece nas supertribos Cecidomyiidi e Lasiopteridi. Os galhadores são os organismos indutores responsáveis por malformações de porções dos tecidos ou órgãos das plantas, conhecidas como galhas. A relação entre os insetos galhadores e suas plantas hospedeiras é de alta especificidade e devido a isso, para as espécies descritas, é possível identificá-las pelo seu tipo de galha induzida no hospedeiro. O gênero Bruggmanniella Tavares, 1909, possui 11 espécies com distribuição majoritária na região Neotropical (oito espécies) e representantes descritos para as regiões Neártica (uma espécie) e Oriental (duas espécies). Neste trabalho foi realizada a primeira análise cladística para compreensão da relação de parentesco entre as espécies de Bruggmanniela, a descrição de uma espécie nova do Estado de São Paulo, Brasil, além da atualização da chave de identificação das espécies de Bruggmanniella. Na análise cladística foram levantados 56 caracteres morfológicos para 26 táxons terminais. Entre esses, 15 pertencem ao grupo-externo e 11 ao interno. A análise utilizando busca heurística de pesos iguais resultou em uma única árvore mais parcimoniosa com comprimento igual a 148 passos (IC=0.443 e IR=0.565) e a de busca por pesagem implícita também gerou uma única árvore com 149 passos (IC=0.440 e IR=0.561). O gênero Bruggmanniella tem sua monofilia suportada principalmente pela ausência do espessamento da margem cefálica da pupa. B. byrsonimae ainda possue posicionamento incerto por falta de conhecimenro do estágio larval. As duas espécies orientais descritas originalmente em Bruggmanniella, B. actinodaphnes e B. cinnamomi, posicionaram-se no ramo do grupo-irmão Pseudasphondylia, ensejando a proposição de duas novas combinações: P. actinodaphnes comb. nov e P. cinnamomi comb. nov. Apresentamos ainda, uma discussão acerca da distribuição geográfica das espécies de Bruggmanniella e Pseudasphondylia e a ocupação dos hospedeiros. / The tribe Asphondyliini, belonging to the family Cecidomyiidae, has 521 species divided into 44 genera with cosmopolitan distribution. The Asphondyliini are included in the subfamily Cecidomyiinae, which is the largest subfamily in number of species, 5100, and is divided into four supertribes: Brachineuridi, Stromatosematidi, Cecidomyiidi and Lasiopteridi. The larvae of Cecidomyiinae have mycethophagous, predatory and galling habit, the latter appearing in the supertribes Cecidomyiidi and Lasiopteridi. Gallers are the inducing organisms responsible for malformations of portions of the tissues or organs of plants, known as gall. The relation between the galling insects and their host plants is of high specificity and due to this, for the described species, it is possible to identify them by their type of host-induced gall. Bruggmanniella Tavares, 1909 has 11 species with major distribution in the Neotropical region (eight species) and representatives described for the regions Neartica (one species) and Oriental (two species). In this work, the first cladistic analysis was carried out to understand the kinship relationship between the Bruggmanniela species, the description of a new species from São Paulo State, Brazil. Bruggmanniela species identification key was also updated. In the cladistic analysis, 56 morphological characters were collected for 26 terminal taxa. Of these, 15 belong to the external group and 11 to the internal group. The analysis using heuristic search of equal weights resulted in a single more parsimonious tree with length equal to 148 steps (IC = 0.443 and IR = 0.565) and the search for implicit weighing also generated a single tree with 149 steps (CI = 0.440 and IR = 0.561). The genus Bruggmanniella has its monophyly supported mainly by the absence of thickening of the cephalic margin of the pupa. B. byrsonimae still has uncertain position due to lack of larval stage. The two eastern species originally described in Bruggmanniella, B. actinodaphnes and B. cinnamomi, were placed in the branch of the sister-group Pseudasphondylia, indicating two new combinations: P. actinodaphnes comb. nov and P. cinnamomi comb. nov. We also argue the geographical distribution of Bruggmanniella and Pseudaphondylia species and the occupation of the hosts.
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Biogeografia de opiliões Gonyleptidae na Mata Atlântica, com revisão sistemática de Hernandariinae (Arachnida, Opiliones) / Biogeography of harvestmen of Atlantic Rainforest, with systematic review of the subfamily Hernandariinae (Arachnida: Opiliones)Silva, Marcio Bernardino da 27 March 2008 (has links)
Os opiliões são um bom modelo para o estudo da biogeografia histórica, especialmente na Mata Atlântica, onde existe a maior diversidade de espécies do grupo no mundo. A presente tese foi dividida em três capítulos: o primeiro objetiva a delimitação de áreas de endemismo para a Mata Atlântica, usando a ocorrência de espécies de Gonyleptidae; o segundo objetiva encontrar um padrão geral de relação histórica entre essas áreas de endemismo que explique a diversificação no bioma, usando as filogenias de sete subfamílias de Gonyleptidae; o terceiro é a revisão sistemática da subfamília Hernandariinae. Foram delimitadas 12 áreas de endemismo para a Mata Atlântica, usando a ocorrência de 109 espécies. Foram usados os métodos numéricos PAE (Análise de Parcimônia de Endemicidade) e NDM, e desenvolvidos seis Critérios Combinados para a avaliação e delimitação das áreas. Para procurar por um padrão geral histórico de relação entre essas áreas, foram usados os métodos de biogeografia cladística para construção de cladogramas gerais de áreas. As 12 áreas de endemismo se relacionam historicamente formando três blocos principais na Mata Atlântica, com a separação do componente norte (Pernambuco e Bahia) inicialmente e posterior separação do componente central (Rio de Janeiro e São Paulo) do componente sul (sul de São Paulo, Paraná e Santa Catarina). São discutidos os principais eventos históricos geológicos, climáticos e biológicos que determinaram essas divisões e a diversificação da fauna de opiliões no bioma. A subfamília Hernandariinae, após a presente revisão, é composto por 23 espécies em 6 gêneros. Nova classificação é proposta baseada em uma análise cladística usando 67 caracteres morfológicos. Quatro novas combinações foram propostas: Hernandaria armatifrons, H. una, Acrogonyleptes granulatus e A. pectinifemur. Três revalidações de espécies são propostas: A. granulatus, A. pectinifemur e A. spinifrons. Oito espécies novas são propostas: quatro de Hernandaria, duas de Acrogonyleptes e duas de Pseudotrogulus. Seis sinonímias são propostas: Proweyhia e Metaxundarava = Hernandaria, Apembolephaenus calcaratus = H. armatifrons, Paraproweyhia = Acrogonyleptes, Paraproweyhia curitibae = A. exochus, e Melloleitaniana curitibae = A. spinifrons. Ariaeus é transferido para Gonyleptinae. / Harvestmen are a good model to historical biogeography studies, especially in Atlantic Rain Forest of Brazil, where harbors the greatest species diversity of the group in the world. This thesis was divided in three chapters: the first one aimed to delimit areas of endemism for Atlantic Forest, using the occurrence of species of Gonyleptidae; the second one aimed to search for a general pattern of historical relationships among areas of endemism that explain the diversification of bioma, using phylogenies of seven Gonyleptidae subfamilies; the third one reviewed the subfamily Hernandariinae. Twelve areas of endemism were delimited for Atlantic Forest, using the occurrence of 109 species. Numerical methods PAE (Parsimony Analysis of Endemicity) and NDM were employed. Six Combined Criteria for evaluation and delimitation of areas were proposed. Methods of Cladistic Biogeography was used for constructing general cladograms of areas, which represent the general historic pattern. The 12 areas of endemism historically relate among them, forming three main components in Atlantic Forest, with separation of a northern component (Pernambuco and Bahia) firstly and a second separation of central component (Rio de Janeiro and São Paulo) from a southern component (south of São Paulo, Paraná, and Santa Catarina). The main geological, climatical and biological events which determined those divisions and the diversification of harvestmen in the Atlantic Forest were discussed. The subfamily Hernandariinae, after this review, is composed by 23 species in 6 genera. A new classification is presented based on an cladistic analysis, using 67 morphological characters. Four new combinations are proposed: Hernandaria armatifrons, H. una, Acrogonyleptes granulatus, and A. pectinifemur. Three species are revalidated: A. granulatus, A. pectinifemur, and A. spinifrons. Eight new species are proposed: four of Hernandaria, two of Acrogonyleptes, and two of Pseudotrogulus. Six synonimies are proposed: Proweyhia and Metaxundarava = Hernandaria, Apembolephaenus calcaratus = H. armatifrons, Paraproweyhia = Acrogonyleptes, Paraproweyhia curitibae = A. exochus, and Melloleitaniana curitibae = A. spinifrons. Ariaeus is transferred to Gonyleptinae.
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Taxonomia e análise filogenética das espécies historicamente associadas a Mallodeta Butler, 1876 (Lepidoptera, Noctuidae, Arctiinae, Eurochromiina) / Taxonomy and phylogenetic analysis of the species historically associated with Mallodeta Butler, 1876 (Lepidoptera, Noctuidae, Arctiinae, Euchromiina)Pinheiro, Lívia Rodrigues 01 June 2009 (has links)
O gênero Mallodeta Butler, exclusivamente neotropical, contava, no início deste estudo, com seis espécies: M. clavata (Walker) (espécie-tipo), M. sortita (Walker), M. consors (Walker), M. sanguipuncta Druce, M. cubana Gaede e M. simplex Rothschild. Estas espécies, mais Phoenicoprocta parthenii (Fabricius), outrora também considerada integrante daquele gênero, foram estudadas quanto às suas relações filogenéticas. A hipótese de monofiletismo de Mallodeta não foi corroborada, sendo as espécies historicamente associadas ao gênero doravante consideradas pertencentes a três clados: (i) Mallodeta, composto unicamente por sua espécie-tipo; (ii) Rezia Kirby gen. reval., composto por R. sortita comb. nov., R. consors comb. nov. e R. sanguipuncta, além de R. cardinale (Hampson), R. erythrarchos (Walker) comb. nov., R. cruenta (Perty) comb. nov. e R. hanga (Herrich-Schäffer) comb. nov., previamente tratadas em Cosmosoma Hübner; (iii) Antilleana gen. nov., composto por A. parthenii comb. nov., A. jamaicensis (Schaus) comb. nov., A. capistrata (Fabricius) comb. nov. e A. carminata (Hampson) comb. nov., todas anteriormente alocadas em Phoenicoprocta Druce. Dentre as conclusões taxonômicas, M. simplex foi tratada como sin. nov. de M. clavata, Glaucopis (Erruca) deyrolii Walker, 1854 sin. nov. de Rezia sortita, Laemocharis ignicolor Ménétriés sin. nov. de Rezia erythrarchos e M. cubana sin. nov. de A. capistrata. Todas as espécies tratadas no presente estudo foram redescritas, ilustradas e tiveram sua distribuição geográfica elucidada. / At the beginning of this study the genus Mallodeta Butler, exclusively neotropical, comprised six species: M. clavata (Walker) (type species), M. sortita (Walker), M. consors (Walker), M. sanguipuncta Druce, M. cubana Gaede and M. simplex Rothschild. These species besides Phoenicoprocta parthenii (Fabricius), formerly considered part of Mallodeta, had their phylogenetic relationships elucidated. The monophyly of Mallodeta was not corroborated, and the species historicaly associated to it should be considered, from now on, belonging to three different clades: (i) Mallodeta, composed exclusively by its type species; (ii) Rezia Kirby rev. gen, comprising R. sortita n. comb., R. consors n. comb. and R. sanguipuncta, plus R. cardinale (Hampson), R. erythrarchos (Walker) n. comb., R. cruenta (Perty) n. comb. and R. hanga (Herrich-Schäffer) n. comb., previously treated in the genus Cosmosoma Hübner; (iii) Antilleana n. gen., comprised by A. parthenii n. comb., A. jamaicensis (Schaus) n. comb., A. capistrata (Fabricius) n. comb. and A. carminata (Hampson) n. comb., formerly treated in Phoenicoprocta Druce. Among taxonomic conclusions we discovered M. simplex to be a n. syn. of M. clavata, Glaucopis (Erruca) deyrolii Walker, 1854 n. syn of Rezia sortita, Laemocharis ignicolor Ménétriés n. syn of Rezia erythrarchos and M. cubana n. syn. of A. capistrata. All species studied were redescribed, illustrated and had their geographical distribution elucidated.
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A re-evaluation of crinoid morphology and proposed relationship of crown groups, with insights from biogeographyWomack, Kyle Richard 04 October 2011 (has links)
Crinoids are the most primitive living members of the Phylum Echinodermata. Though still present in reduced numbers today, crinoids were the dominant echinoderms from the Ordovician to the Permian. The crinoid body plan consists of three major regions, the column, the calyx, and the arms. Each region serves important functions in crinoids. The column raises the rest of the body into the water column for more efficient feeding. The calyx contains the visceral mass and mouth. Arms extend out from the top of the calyx to trap microorgansisms and suspended organic particles in the water column. A re-evaluation of these functional units is undertaken to understand the importance of various structures and to obtain discrete characters for use in a cladistic analysis.
The relationship of crinoid crown groups has been an active area of research for the past couple of decades. With each proposed phylogenetic relationship, a new interpretation of thecal plate homology has been proposed. Here each study is re-examined in the light of new data. A review of functional morphology indicates a dual-reference system to be the most supported interpretation of plate homology. The two reference points in this system are the stem-cup and the cup-arm junctions, at the top and bottom of the calyx. The difference between a two-circlet and three-circlet crinoid is the presence or absence of the middle (basal) circlet. A new cladistic analysis is presented, with the topology of trees obtained giving support for the retention of Paleozoic crinoid stem and crown groups.
Crinoids appear abruptly in the fossil record. Questions pertaining to origins and ancestral stock abound. A biogeography study is employed to look at the distribution of crinoids from the Early to Middle Ordovician. Locality information, combined with an understanding of the movement of major plates, paleoclimate data, an understanding of larval distribution, and a review of similar studies carried out on different taxa, gives insight into possible radiation and dispersal patterns of crinoids from the first half of the Ordovician. / text
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Taxonomia e análise filogenética das espécies historicamente associadas a Mallodeta Butler, 1876 (Lepidoptera, Noctuidae, Arctiinae, Eurochromiina) / Taxonomy and phylogenetic analysis of the species historically associated with Mallodeta Butler, 1876 (Lepidoptera, Noctuidae, Arctiinae, Euchromiina)Lívia Rodrigues Pinheiro 01 June 2009 (has links)
O gênero Mallodeta Butler, exclusivamente neotropical, contava, no início deste estudo, com seis espécies: M. clavata (Walker) (espécie-tipo), M. sortita (Walker), M. consors (Walker), M. sanguipuncta Druce, M. cubana Gaede e M. simplex Rothschild. Estas espécies, mais Phoenicoprocta parthenii (Fabricius), outrora também considerada integrante daquele gênero, foram estudadas quanto às suas relações filogenéticas. A hipótese de monofiletismo de Mallodeta não foi corroborada, sendo as espécies historicamente associadas ao gênero doravante consideradas pertencentes a três clados: (i) Mallodeta, composto unicamente por sua espécie-tipo; (ii) Rezia Kirby gen. reval., composto por R. sortita comb. nov., R. consors comb. nov. e R. sanguipuncta, além de R. cardinale (Hampson), R. erythrarchos (Walker) comb. nov., R. cruenta (Perty) comb. nov. e R. hanga (Herrich-Schäffer) comb. nov., previamente tratadas em Cosmosoma Hübner; (iii) Antilleana gen. nov., composto por A. parthenii comb. nov., A. jamaicensis (Schaus) comb. nov., A. capistrata (Fabricius) comb. nov. e A. carminata (Hampson) comb. nov., todas anteriormente alocadas em Phoenicoprocta Druce. Dentre as conclusões taxonômicas, M. simplex foi tratada como sin. nov. de M. clavata, Glaucopis (Erruca) deyrolii Walker, 1854 sin. nov. de Rezia sortita, Laemocharis ignicolor Ménétriés sin. nov. de Rezia erythrarchos e M. cubana sin. nov. de A. capistrata. Todas as espécies tratadas no presente estudo foram redescritas, ilustradas e tiveram sua distribuição geográfica elucidada. / At the beginning of this study the genus Mallodeta Butler, exclusively neotropical, comprised six species: M. clavata (Walker) (type species), M. sortita (Walker), M. consors (Walker), M. sanguipuncta Druce, M. cubana Gaede and M. simplex Rothschild. These species besides Phoenicoprocta parthenii (Fabricius), formerly considered part of Mallodeta, had their phylogenetic relationships elucidated. The monophyly of Mallodeta was not corroborated, and the species historicaly associated to it should be considered, from now on, belonging to three different clades: (i) Mallodeta, composed exclusively by its type species; (ii) Rezia Kirby rev. gen, comprising R. sortita n. comb., R. consors n. comb. and R. sanguipuncta, plus R. cardinale (Hampson), R. erythrarchos (Walker) n. comb., R. cruenta (Perty) n. comb. and R. hanga (Herrich-Schäffer) n. comb., previously treated in the genus Cosmosoma Hübner; (iii) Antilleana n. gen., comprised by A. parthenii n. comb., A. jamaicensis (Schaus) n. comb., A. capistrata (Fabricius) n. comb. and A. carminata (Hampson) n. comb., formerly treated in Phoenicoprocta Druce. Among taxonomic conclusions we discovered M. simplex to be a n. syn. of M. clavata, Glaucopis (Erruca) deyrolii Walker, 1854 n. syn of Rezia sortita, Laemocharis ignicolor Ménétriés n. syn of Rezia erythrarchos and M. cubana n. syn. of A. capistrata. All species studied were redescribed, illustrated and had their geographical distribution elucidated.
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Biogeografia de opiliões Gonyleptidae na Mata Atlântica, com revisão sistemática de Hernandariinae (Arachnida, Opiliones) / Biogeography of harvestmen of Atlantic Rainforest, with systematic review of the subfamily Hernandariinae (Arachnida: Opiliones)Marcio Bernardino da Silva 27 March 2008 (has links)
Os opiliões são um bom modelo para o estudo da biogeografia histórica, especialmente na Mata Atlântica, onde existe a maior diversidade de espécies do grupo no mundo. A presente tese foi dividida em três capítulos: o primeiro objetiva a delimitação de áreas de endemismo para a Mata Atlântica, usando a ocorrência de espécies de Gonyleptidae; o segundo objetiva encontrar um padrão geral de relação histórica entre essas áreas de endemismo que explique a diversificação no bioma, usando as filogenias de sete subfamílias de Gonyleptidae; o terceiro é a revisão sistemática da subfamília Hernandariinae. Foram delimitadas 12 áreas de endemismo para a Mata Atlântica, usando a ocorrência de 109 espécies. Foram usados os métodos numéricos PAE (Análise de Parcimônia de Endemicidade) e NDM, e desenvolvidos seis Critérios Combinados para a avaliação e delimitação das áreas. Para procurar por um padrão geral histórico de relação entre essas áreas, foram usados os métodos de biogeografia cladística para construção de cladogramas gerais de áreas. As 12 áreas de endemismo se relacionam historicamente formando três blocos principais na Mata Atlântica, com a separação do componente norte (Pernambuco e Bahia) inicialmente e posterior separação do componente central (Rio de Janeiro e São Paulo) do componente sul (sul de São Paulo, Paraná e Santa Catarina). São discutidos os principais eventos históricos geológicos, climáticos e biológicos que determinaram essas divisões e a diversificação da fauna de opiliões no bioma. A subfamília Hernandariinae, após a presente revisão, é composto por 23 espécies em 6 gêneros. Nova classificação é proposta baseada em uma análise cladística usando 67 caracteres morfológicos. Quatro novas combinações foram propostas: Hernandaria armatifrons, H. una, Acrogonyleptes granulatus e A. pectinifemur. Três revalidações de espécies são propostas: A. granulatus, A. pectinifemur e A. spinifrons. Oito espécies novas são propostas: quatro de Hernandaria, duas de Acrogonyleptes e duas de Pseudotrogulus. Seis sinonímias são propostas: Proweyhia e Metaxundarava = Hernandaria, Apembolephaenus calcaratus = H. armatifrons, Paraproweyhia = Acrogonyleptes, Paraproweyhia curitibae = A. exochus, e Melloleitaniana curitibae = A. spinifrons. Ariaeus é transferido para Gonyleptinae. / Harvestmen are a good model to historical biogeography studies, especially in Atlantic Rain Forest of Brazil, where harbors the greatest species diversity of the group in the world. This thesis was divided in three chapters: the first one aimed to delimit areas of endemism for Atlantic Forest, using the occurrence of species of Gonyleptidae; the second one aimed to search for a general pattern of historical relationships among areas of endemism that explain the diversification of bioma, using phylogenies of seven Gonyleptidae subfamilies; the third one reviewed the subfamily Hernandariinae. Twelve areas of endemism were delimited for Atlantic Forest, using the occurrence of 109 species. Numerical methods PAE (Parsimony Analysis of Endemicity) and NDM were employed. Six Combined Criteria for evaluation and delimitation of areas were proposed. Methods of Cladistic Biogeography was used for constructing general cladograms of areas, which represent the general historic pattern. The 12 areas of endemism historically relate among them, forming three main components in Atlantic Forest, with separation of a northern component (Pernambuco and Bahia) firstly and a second separation of central component (Rio de Janeiro and São Paulo) from a southern component (south of São Paulo, Paraná, and Santa Catarina). The main geological, climatical and biological events which determined those divisions and the diversification of harvestmen in the Atlantic Forest were discussed. The subfamily Hernandariinae, after this review, is composed by 23 species in 6 genera. A new classification is presented based on an cladistic analysis, using 67 morphological characters. Four new combinations are proposed: Hernandaria armatifrons, H. una, Acrogonyleptes granulatus, and A. pectinifemur. Three species are revalidated: A. granulatus, A. pectinifemur, and A. spinifrons. Eight new species are proposed: four of Hernandaria, two of Acrogonyleptes, and two of Pseudotrogulus. Six synonimies are proposed: Proweyhia and Metaxundarava = Hernandaria, Apembolephaenus calcaratus = H. armatifrons, Paraproweyhia = Acrogonyleptes, Paraproweyhia curitibae = A. exochus, and Melloleitaniana curitibae = A. spinifrons. Ariaeus is transferred to Gonyleptinae.
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Revisão taxonômica e análise cladística de Ligyra s.l. (Diptera, Bombyliidae, Anthracinae, Exoprosopini) com ênfase na fauna do Novo Mundo / Taxonomic review and phylogenetic analysis of the New World species of Ligyra s.l. (Diptera, Bombyliidae, Anthracinae, Exoprosopini)Ángela Sabrina Márquez Acero 15 March 2016 (has links)
Bombyliidae é uma das maiores famílias de Diptera com mais de 4822 espécies descritas ao redor do mundo, divididas em 16 subfamílias e 18 tribos. A tribo Exoprosopini dividem-se em 11 gêneros, dos quais Exoprosopa e Ligyra tem distribuição cosmopolita. O gênero Ligyra Newman s.l. objeto deste estudo, possui 109 espécies, das quais 20 têm sido descritas no Novo Mundo. Uma revisão taxonômica das espécies neárticas e neotropicais de Ligyra é feita no presente estudo, incluindo redescrições e registros fotográficos das mesmas. Após a revisão taxonômica, quatro espécies foram sinonimizadas (L. fenestella syn. nov. e L. maracaensis syn. nov. são consideradas sinônimos júnior de Gen. nov. harpyia; L. guerinii syn. nov. foi considerado sinônimo júnior de Gen. nov. latreilli; L. klugii syn. nov. foi considerado sinônimo júnior de Gen. nov. proserpina e a subespécie Ligyra cerberus trifigurata foi considerada sinônimo júnior de Gen. nov. cerberus). Uma chave para identificação destas espécies, baseada em caracteres morfológicos diagnósticos, de fácil observação, também é apresentada. Além da revisão taxonômica uma análise cladística de Ligyra no Novo Mundo foi feita a fim de testar se essas espécies, que atualmente estão incluídas no gênero, pertencem, de fato, a este grupo ou se precisam ser realocadas em algum outro gênero de Exoprosopini ou ainda em um novo gênero. Para tal, neste estudo foi utilizada uma matriz de caracteres morfológicos disponível em literatura, que já vem sendo utilizada para inferir a filogenia dos Exoprosopini. A análise cladística contou com 92 táxons terminais e 207 caracteres morfológicos obtendo-se como resultado, após análise com algoritmos de novas tecnologias a partir do software TNT, 12 árvores mais parcimoniosas cujo consenso estrito possui L=3089, CI: 15 e RI: 49. Os resultados apontam que Ligyra s.l. forma um grupo monofilético composto pelos gêneros: Ligyra s. str. (spp. Australianas), Euligyra (spp. Afrotropicais) e Gênero novo (spp. do Novo Mundo). As espécies de Ligyra s.l. no Novo Mundo foram realocadas em um gênero novo suportado por uma sinapomorfia e quatro homoplasias. / Bombyliidae is one of the largest families of Diptera with more than 4800 species, known worldwide, divided in 16 subfamilies and 18 tribes. The tribe Exoprosopini is divided into 11 genera, of which Exoprosopa Macquart and Ligyra Newman has cosmopolitan distribution. The genus Ligyra s.l., main subject of this study, has 109 species, of which 20 were described to the New World. A taxonomic review of the Nearctic and Neotropical species of Ligyra is implemented in this study, including redescription and photographic records of them. After the taxonomic review, four species were synonymized (L. fenestella syn. nov.and L. maracaensis syn. nov. are considered junior synonym of Gen. nov. harpyia; L. guerinii syn. nov. is considered junior synonym of Gen. nov. latreilli; L. klugii syn. nov .is considered junior synonym of Gen. nov. proserpina and the subspecies Ligyra Cerberus trifigurata is considered junior synonym of Gen. nov. cerberus). An identification key for these species, based on morphological diagnostic characters, easily seen, is also presented. Besides the taxonomic revision a cladistics analysis of the New Worlds Ligyra is implemented in order to test whether these species, which are currently included in the genus, belong, in fact, to this group or if they need to be relocated at some other genus of Exoprosopini or even to a new genus. For this purpose, we used a matrix of morphological characters available in the literature, which is already being used to infer the phylogeny of Exoprosopini. The cladistic analysis included 92 terminal taxa and 207 morphological characters. After analysis with algorithms of new technologies from the software TNT, 12 more parsimonious trees, whose strict consensus has L = 3089, CI 15 and RI: 49, are obtained. The results show that Ligyra s.l. constitutes a monophyletic group composed by the following genera: Ligyra s. str. (Australian spp.), Euligyra (Afrotropical spp.) and New Genus (New World spp.). The species of Ligyra s.l. in the New World are relocated into a new genus, which monophyly is supported by one synapomorphy and four homoplasies.
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Rongeurs paléogènes d’Amazonie péruvienne : anatomie, systématique, phylogénie et paléobiogéographie / Paleogene rodents from Peruvian Amazonia : anatomy, systematics, phylogeny, and paleobiogeographyBoivin, Myriam 29 November 2017 (has links)
Les rongeurs caviomorphes constituent l’un des groupes de mammifères placentaires les plus diversifiés d’Amérique du Sud. Malgré la grande diversité actuelle et néogène du groupe, les premières phases de l’histoire évolutive des caviomorphes n’étaient documentées que par quelques localités à l’échelle de tout le continent sud-américain. Les recherches paléontologiques récentes menées en Amazonie péruvienne ont permis la découverte de 18 localités éocènes et oligocènes, livrant de nombreux restes dentaires de caviomorphes inédits. L’étude de ces fossiles a conduit à la description et à la comparaison de 52 taxons distincts, dont 11 nouveaux genres et 17 nouvelles espèces. Ce travail révèle une riche diversité alpha-taxonomique des caviomorphes en Amazonie péruvienne à la fin de l’Éocène moyen, mais surtout à l’Oligocène inférieur et à l’Oligocène supérieur, trois fenêtres temporelles jusqu’alors très peu documentées dans les régions de basses latitudes du continent sud-américain. Les localités étudiées de la fin de l’Éocène moyen livrent les plus anciens caviomorphes connus à ce jour. Dans ces localités, la faible diversité taxinomique, associée à une faible disparité morphologique, incluant des taxons caractérisés par des traits dentaires plésiomorphes, rappelant les formes hystricognathes sub-contemporaines de l’Ancien Monde. Cela suggère un intervalle de temps court entre l’arrivée en Amérique du Sud des hystricognathes pionniers et l’émergence des espèces étudiées. Les assemblages de caviomorphes des localités plus récentes montrent une disparité plus importante et livrent des représentants des éréthizontoïdes, octodontoïdes et chinchilloïdes. L’analyse approfondie du matériel d’étude et sa comparaison avec des spécimens provenant d’autres gisements sud-américains ont permis une meilleure compréhension de l’homologie et de l’évolution des structures dentaires chez les caviomorphes. Une analyse cladistique de grande ampleur, incluant un grand nombre de familles des quatre super-familles (i.e., Cavioidea, Erethizontoidea, Chinchilloidea et Octodontoidea) a été réalisée. Elle a permis pour la première fois la reconnaissance de groupes basaux des caviomorphes. Les régions de basses latitudes du continent sud-américain paraissent être le centre d’origine des caviomorphes et le lieu d’une première diversification basale du groupe à la fin de l’Éocène moyen. Les quatre super-familles émergeraient au cours de l’Éocène supérieur–Oligocène inférieur, illustrant ainsi une deuxième radiation majeure du groupe au cours du Paléogène. Durant cette période, les caviomorphes se seraient dispersés aux moyennes et hautes latitudes. L’origine géographique des super-familles reste quelque peu ambiguë, excepté pour les chinchilloïdes qui émergeraient dans les régions de basses latitudes. Nos résultats mettent également en évidence l’existence d’une troisième radiation autour de la limite Oligocène–Miocène. Cette troisième phase correspondrait à la diversification des chinchilloïdes, octodontoïdes, et éréthizontinés basaux et à l’émergence du groupe couronne des caviidés, des octodontoïdes et très probablement des chinchilloïdes. Ces trois événements de diversifications majeures au cours du Paléogène sont concomitants avec des évènements climatiques globaux et des périodes intenses de surrection andine. / Caviomorph rodents represent one of the most successful groups of placental mammals from South America. Despite their high modern and Neogene diversity, their early evolutionary history has long remained obscure. Recent paleontological investigations in Peruvian Amazonia allowed for the discovery of 18 Eocene and Oligocene localities yielding many new fossils of caviomorphs (mainly isolated teeth). Fifty-two taxa, including 11 new genera and 17 new species, are described here. This study reveals a rich alpha-taxonomic diversity of caviomorphs in Peruvian Amazonia during the late Middle Eocene, Early Oligocene and Late Oligocene. These three periods were until now poorly documented in the low-latitudes of South America. The late Middle Eocene localities yield the earliest representatives of the group. In these localities, the low taxonomical diversity, associated with a low morphological disparity including taxa that harbor very primitive dental features, reminiscent to those observed in coeval Old World hystricognaths, suggest that a short time range of caviomorph evolutionary history had undergone in South America prior the emergence of these rodents. The most recent caviomorph assemblages show a higher disparity and yield representatives of erethizontoids, octodontoids and chinchilloids. The exhaustive analysis of the material and its comparison with specimens from other South American localities further our understanding regarding the homology and the evolution of dentary structures in caviomorphs. A cladistic assessment with a comprehensive taxonomic sampling including most families of the four superfamilies (i.e., Cavioidea, Erethizontoidea, Chinchilloidea, and Octodontoidea) was undertaken. For the first time, several stem Caviomorpha were recognized. Low latitudes of South America are thus viewed as the cradle and the first diversity hotspot of early caviomorphs. A second radiation would have occurred during the Late Eocene–Early Oligocene and would correspond to the emergence of the four superfamilies. At this time, caviomorphs would disperse towards the middle and high latitudes. The geographic origin of modern superfamilies remains somewhat ambiguous, except for chinchilloids which would emerge in low-latitude regions. A third radiation would have also occurred, around the Oligocene–Miocene transition, corresponding to the more recent diversification of stem Chinchilloidea, Octodontoidea, Erethizontoidea and the emergence of crown Erethizontinae, Caviidae, Octodontoidea, and probably Chinchilloidea. It is noteworthy that these three Paleogene diversification phases were contemporaneous with global climatic events and intense Andean uplift events.
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Preliminary investigations into the phylogenetic relationships in the genus Erica L.Lester, Ntsikelelo Blessings 12 1900 (has links)
Thesis (MSc)--University of Stellenbosch, 2006. / ENGLISH ABSTRACT: Erica is a genus of about 860 species world wide, with 700 of these found in South Africa’s
southwestern and southern Cape, making it by far the most speciose genus in the Cape Floristic
Region. This poses a particular challenge in the construction of a molecular phylogeny of the
genus. The choice of suitably variable gene regions is a crucial decision on which the successful
phylogenetic reconstruction of this important genus is critically dependent.
The aim of this project was therefore to determine which DNA regions, both chloroplast and
nuclear, would be sufficiently variable to give adequate informative characters that may be useful
at the species level phylogenetic reconstruction. A subset of 30 species, representing the range of
morphological diversity and pollinator preference within Erica, was selected for study. For each of
these species the variability in eight chloroplast regions (trnL-F, matK, trnS-G, rps12- rpl20, psbAtrnH,
trnC-D, rps4-trnT and trnT-L) and the nuclear ITS region was investigated.
The psbA-trnH, trnC-D, rps4-trnT and trnT-L chloroplast regions were found to be problematic to
amplify and to possess too few Parsimony Informative Characters to be of use in phylogenetic
reconstruction. Four of the chloroplast regions, trnS-G, trnL-F, matK and rpS12-rpL20 and the
nuclear ITS region could be amplified and sequenced with success. The ITS region was found to
be reasonably variable, with the chloroplast genes showing less variability.
The DNA extraction method employed showed itself to be of critical importance in the success of
the study. Two DNA extraction protocols, both modified from the original Doyle and Doyle (1987)
method, were tested. The one included double the amount of β-mercaptoethanol and
Polyvinylpyrrolidone (PVP) and the other included an extended phenol: chloroform: isoamylalcohol
step. These variables, together with the effectiveness of these methods on fresh vs. silica dried
plant samples, were investigated to determine which of the two would yield high quantities and
qualities of DNA and result in the best method for the extraction of DNA from Erica species. / AFRIKAANSE OPSOMMING: Erica is ‘n genus van omtrent 860 spesies wêreldwyd, met 700 van hierdie spesies aanwesig in die
suidwes en suid Kaap van Suid Afrika, wat dit by verre die mees spesieryke genus in die Kaapse
Floristiese Streek maak. Dit stel ’n besondere uitdaging in die konstruksie van ’n molekulêre
filogenie van die genus. Die keuse van geskikte variërende geen-areas is ‘n belangrike besluit
waarvan die suksesvolle filogenetiese rekonstruksie van hierdie belangrike genus krities afhanklik
sal wees.
Die doel van hierdie projek was dus om te bepaal watter DNS areas, buide chloroplas en kern,
genoegsaam varieer om voldoende informatiewe kenmerke te lewer om bruikbaar te wees in ’n
spesie-vlak molekulêre rekonstruksie. ’n Subgroep van 30 spesies, wat die reeks van morfologiese
diversiteit en bestuiwer voorkeure in Erica verteenwoordig, is dus vir die studie geselekteer. Vir elk
van hierdie spesies is die variasie in agt chloroplast areas (trnL-F, matK, trnS-G, rps12- rpl20,
psbA-trnH, trnC-D, rps4-trnT en trnT-L) en die kern ITS area ondersoek.
Dit was problematies om die psbA-trnH, trnC-D, rps4-trnT en trnT-L chloroplast areas te
amplifiseer, en daar is gevind dat hulle te min Parsimonie Informatiewe Kenmerke besig om
bruikbaar te wees in filogenetiese rekonstruksie. Vier van die chloroplas areas, trnS-G, trnL-F,
matK en rpS12-rpL20 en die kern ITS kon suksesvol geamplifiseer word en die basisvolgordes kon
suksesvol bepaal word. Daar is gevind dat die ITS area redelik variërend is, terwyl chloroplas
areas minder variasie getoon het.
Die DNS ekstraksie metode wat gebruik is het die kritiese belang van die ekstraksie metode in die
sukses van die studie bewys. Twee DNS protokolle, beide gemodifiseer van die oorspronklike
Doyle en Doyle (1987) metode, is getoets. Die een het dubbel die hoeveelheid β-mercaptoetanol
en Polyvinylpyrrolidone (PVP) bevat, en die het ’n uitgebruide fenol: chloroform: isoamylalkohol
stap ingesluit. Hierdie veranderlikes, saam met die effektiwiteit van hierdie metodes op vars
teenoor silika-gedroogde plant monsters, is ondersoek om vas te stel watter een van die twee die
hoogste kwaliteit en kwantiteit DNS sou lewer en dus sal lei tot die beste DNS ekstraksie metode
vir Erica spesies.
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