MARTINS, René Duarte. Efeitos renais e vasculares do extrato bruto da anêmona marinha Bunodosoma caissarum e sua fração fosfolipase A2 : estudo dos mediadores envolvidos. 2008. 242 f. Tese (Doutorado em Farmacologia) - Universidade Federal do Ceará. Faculdade de Medicina, Fortaleza, 2008. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2012-10-01T13:36:35Z No. of bitstreams: 1 2008_tese_rdmartins.pdf: 2488941 bytes, checksum: 48aedf1ec35acc89a4e97decf2688bd1 (MD5) / Approved for entry into archive by Eliene Nascimento(elienegvn@hotmail.com) on 2012-10-01T16:28:48Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_tese_rdmartins.pdf: 2488941 bytes, checksum: 48aedf1ec35acc89a4e97decf2688bd1 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-10-01T16:28:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_tese_rdmartins.pdf: 2488941 bytes, checksum: 48aedf1ec35acc89a4e97decf2688bd1 (MD5) Previous issue date: 2008 / Sea anemones contain a variety of biological active compounds including some potent toxins. For this reason, many investigators have focused their studies in these proteins, isolated from sea anemones, such as Bunodosoma caissarum. The aim of this work was to study the mechanism of functional alterations produced by the crude extract and the PLA2 fraction of B. caissarum in the isolated rat kidney and arteriolar mesenteric bed. Isolated kidneys from Wistar rats, weighing 250-300g, were perfused with Krebs-Henseileit solution containing 6% of bovine serum albumin for 120 min. B. caissarum crude extract (BcE) and PLA2 were added to the system 30 min after the beginning of each experiment (internal control) and Tezosentan (TZN) and Indomethacin (IND) were administered in the initial period of each experiment (T=0min). The mesenteric bed, kept warmed at 37°C, was perfused with Krebs solution at a constant flow, (4mL/min) but with a variable perfusion pressure, measured for 80 min. mRNA expression of TNF-α, IL-1β, rennin and adenosine receptors (A1, A2a, A2b and A3) was evaluated by PCR using 18S mRNA as reference gene. The data were analyzed by Student’s t-test (p<0.05). BcE altered kidney function increasing perfusion pressure (PP), renal vascular resistance (RVR), urinary flow (UF), glomerular filtration rate (GFR) and sodium, potassium and chloride excretion, especially with the intermediary concentração. Tezosentan inhibited these effects only partially. However, indomethacin presented a blockage more expressive that TZN. The PLA2 of B. caissarum showed a higher increase of PP at 60 minutes (Control= 104,17±3,72; PLA2(0,1) = 130,9±5,6*; PLA2(0,3) = 165,1±12,6*; PLA2(1,0) = 142,3±9,6*, *p<0,5) and increased RVR, UF, GFR, sodium, potassium and chloride excretion and urinary osmolarity, with descrease of Na+, K+ and Cl- distal transports.. The blockage of IND was more expressive on the smallest PLA2 concentração and TZN showed a modest effect, blocking more efficiently the intermediary concentração. Neither BcE, nor PLA2 altered the basal perfusion pressure of the isolated arteriolar mesenteric bed. PLA2 increased the gene expression of TNF-α (Control = 1,00 ± 0,00 vs. PLA2 = 1,116 ± 0,033*, com p<0,0001)and upnregulated the expression of adenosine receptors A2a (Control = 1,0 ± 0,01 vs. PLA2 = 1,238 ± 0,043*, com p<0,0001). These results suggest that BcE and PLA2 exert significative actions in the isolated perfusion kidney, without vascular effects in the arteriolar mesenteric bed. COX-2 and endothelin appear to be important mediators of the effects of BcE and PLA2. In addition, adenosine is also involved in the mechanism of action of B. caissarum. / Anêmonas marinhas contêm uma variedade de compostos biologicamente ativos incluindo potentes toxinas. Por esta razão, muitos investigadores têm centrado seus estudos nestas proteínas, isoladas de anêmonas marinhas, como Bunodosoma caissarum. O objetivo deste trabalho foi estudar o mecanismo das alterações funcionais produzidas pelo extrato bruto e da fração PLA2 de B. caissarum em rim isolado de rato e leito vascular mesentérico. Rins isolados de ratos Wistar, pesando 250-300g, foram perfundidos durante 120 min com solução de Krebs-Henseileit contendo 6% de albumina bovina. O extrato bruto de B. caissarum (BcE) e PLA2 foram adicionados ao sistema, em diferentes concentrações, 30 minutos após o início de cada experimento (controle interno) e Tezosentan (TZN) e Indometacina (IND) foram administrados no período inicial de cada experimento (T = 0 min). O leito vascular mesentérico, mantido aquecido a 37 ° C, foi perfundido com solução de Krebs em um fluxo constante (4mL/min) e a pressão medida por 80 min. A expressão de mRNA TNF-α, IL-1 β, renina e receptores de adenosina (A1, A2a, A2b e A3) foi avaliada por PCR utilizando como referência o mRNA do gene 18S. Os dados foram analisados por teste t de Student (p <0,05). BcE alterou a função renal elevando a pressão de perfusão (PP), a resistência vascular renal (RVR), fluxo urinário (UF), taxa de filtração glomerular (TFG) e excreção de sódio, de potássio e cloreto, especialmente com a concentração intermediária. Tezosentan inibiu estes efeitos apenas parcialmente. No entanto, indometacina apresentou um bloqueio mais expressivo que TZN. A PLA2 de B. caissarum elevou a pressão de perfusão (PP) já aos 60 minutos (controle = 104,17 ± 3,72; PLA2 (0,1) = 130,9 ± 5,6 *; PLA2 (0,3) = 165,1 ± 12,6 *; PLA2 (1,0) = 142,3 ± 9,6 *, *p <0,5), revelando também elevações de RVR , UF, TFG, excreção de eletrólitos e osmolaridade urinária, com diminuição dos transportes distais de Na+, K+ e Cl-. O bloqueio com IND foi mais expressivo sobre a menor concentração de PLA2, enquanto TZN mostrou um efeito discreto. BcE e PLA2 não alteraram a pressão de perfusão basal do leito vascular mesentérico. PLA2 aumentou a expressão relativa de TNFα (C = 1,00 ± 0,00 vs. PLA2 = 1,116 ± 0,033*, com p<0,0001) e do receptor de adenosina A2a (C = 1,0 ± 0,01 vs. PLA2 = 1,238 ± 0,043*, com p<0,0001).Estes resultados sugerem que BcE e PLA2 exercem ações significativas na perfusão de rim isolado, sem efeitos vasculares diretos no leito mesentérico. COX-2 e endotelina parecem ser importantes mediadores dos efeitos da BcE e PLA2. Além disso, adenosina também parece estar envolvida no mecanismo de ação da PLA2 de Bunodosoma caissarum.

Orientadora : Profª Drª Maria Angélica Haddad / Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Zoologia. Defesa: Curitiba, 21/02/2017 / Inclui referências : f. 113-128 / Area de concentração: Zoologia / Resumo: Os impactos decorrentes da presença de espécies onde previamente não ocorriam têm motivado um interesse crescente em compreender os processos que diminuem a vulnerabilidade das comunidades à invasão. Muitos mecanismos ecológicos que modulam o processo de invasão estão associados à capacidade das comunidades receptoras de resistir ao invasor, isto é, à resistência biótica. As interações bióticas que limitam os organismos não-nativos dependem da composição da comunidade residente, da disponibilidade de recursos e da heterogeneidade dos fatores abióticos. Compreender a vulnerabilidade de comunidades marinhas à invasão e os possíveis impactos resultantes da presença de uma espécie exótica foram os motivos do presente estudo, que teve por objetivo avaliar a habilidade da comunidade incrustante de substratos artificiais da Foz do rio Itiberê, Baía de Paranaguá, Paraná, em resistir à colonização e ao estabelecimento de Podocoryna loyola, um hidroide provavelmente introduzido na área portuária de Paranaguá e em outros estuários do sul do Brasil. Para isto, placas experimentais permaneceram submersas por 24 meses e foram submetidas a diferentes tratamentos. A resistência da comunidade ao recrutamento bimestral de P. loyola foi avaliada comparando-se o número e a cobertura inicial das colônias do hidroide entre substratos limpos e previamente ocupados (capítulo 1). Observou-se que a comunidade residente não foi capaz de impedir a presença do hidroide, mas limitou a cobertura dos recrutas. Comparando-se comunidades com e sem P. loyola (respectivamente, colônias permaneciam nas placas ou eram removias quinzenalmente) (capítulo 2), foi possível avaliar a resistência dos organismos residentes pelo grau de estabilidade na composição e na estrutura da comunidade, durante sua formação e desenvolvimento. A composição e a cobertura das espécies foram comparadas entre os tratamentos. Não foram observadas muitas diferenças devido à presença de P. loyola, somente um morfotipo teve redução, em um curto intervalo de tempo. Esse resultado não reflete inibição do hidroide ao longo da sucessão, mas pode ser consequência da exclusão ineficiente da espécie do tratamento pareado, ou também da sazonalidade ambiental, que pode ter fornecidos nichos temporais favoráveis ao estabelecimento de P. loyola. A resistência da comunidade ao desenvolvimento de P. loyola, durante o processo de sucessão, foi avaliada comparando comunidades intactas com experimentos em que os organismos, exceto o hidroide, eram removidos quinzenalmente (capítulo 3). As altas e rápidas taxas de crescimento registradas para as colônias do hidroide, nos dois tratamentos, revelaram que a comunidade residente não representa uma barreira contra a expansão das colônias. Conclui-se que a comunidade incrustante da foz do rio Itiberê exerce fraca resistência ao estabelecimento de P. loyola. Somente durante as exposições bimestrais das placas registrou-se uma limitação ao recrutamento de P. loyola, provavelmente devido à ocupação prévia do espaço pelos organismos residentes. Em estágios sucessionais mais avançados, a comunidade não foi capaz de inibir P. loyola, que dominou a comunidade nos períodos de outono-inverno. Os experimentos indicam que a superioridade competitiva do hidroide, ou o aproveitamento de nichos temporais fornecidos pela sazonalidade ambiental, estão associados ao estabelecimento bem sucedido de P. loyola. As diferenças na resistência da comunidade à P. loyola, entre o recrutamento e a sucessão, exemplificam a complexidade de mecanismos que determinam o sucesso das invasões e destacam a importância de avaliar a resistência biótica em distintas escalas temporais. Palavras-chave: Podocoryna loyola, bioinvasão, resistência biótica, recrutamento, sucessão, crescimento, sazonalidade. / Abstract: The impacts resulting from the presence of species where previously did not occur have motivated an increasing interest in understanding the processes that reduce the vulnerability of the communities to the invasion. Many ecological mechanisms that modulate the invasion process are associated with the ability of receptor communities to resist the invader, that is, biotic resistance. The biotic interactions that will limit non-native organisms depend on the composition of the resident community, the availability of resources and the heterogeneity of the abiotic factors. Understanding the vulnerability of marine communities to the invasion and the possible impacts resulting from the presence of an exotic species were the reasons of the present study, whose objective was to evaluate the ability of the fouling community of artificial substrates at the mouth of the Itiberê River in Paranaguá Bay, Paraná, in resisting the colonization and establishment of Podocoryna loyola, a hydroid probably introduced in the port area of Paranaguá and in other estuaries of southern Brazil. For this, experimental plates were submerged for 24 months and were submitted to different treatments. Community resistance to bimonthly recruitment of P. loyola was assessed by comparing the number and initial coverage of the hydroid colonies between clean and previously occupied substrates (Chapter (chapter 1). It was observed that the resident community was not able to prevent the presence of the hydroid, but limited the coverage of the recruits. Comparing communities with and without P. loyola (colonies remained on the plates or were removed biweekly) (chapter 2), it was possible to evaluate the resistance of resident organisms by the degree of stability in the composition and structure of the community during its formation and development. The composition and coverage of the species were compared between treatments. No differences were observed due to the presence of P. loyola, only one morphotype was reduced in a short period of time. This result does not reflect hydroid inhibition throughout the succession, but may be a consequence of the ineffective exclusion of the species on paired treatment, or also the environmental seasonality, which may have provided temporal niches favorable to the establishment of P. loyola. Community resistance to the development of P. loyola, during the succession process was evaluated comparing intact communities with experiments in which organisms, except hydroid, were removed biweekly (Chapter 3). The high and rapid growth rates recorded for the colonies of the hydroid, in both treatments, revealed that the resident community does not represent a barrier against the colonies' expansion. It is concluded that the fouling community at the mouth of the Itiberê River exerts a weak resistance to the establishment of P. loyola. Only during the bimonthly exposures of the plates was there a more notable limitation to the recruitment of P. loyola, probably due to the previous occupation of the space by the resident organisms. In more advanced successional stages, the community was not able to inhibit P. loyola, which dominated the community in the autumn-winter periods. The experiments indicate that the competitive superiority of the hydroid, or the utilization of temporal niches provided by the environmental seasonality, are associated to the successful establishment of P. loyola. The differences in community resistance to P. loyola, between recruitment and succession, exemplify the complexity of mechanisms that determine the success of invasions and highlight the importance of evaluate the biotic resistance at different time scales. Key words: Podocoryna loyola, bioinvasion, biotic resistance, recruitment, succession, growth, seasonality

Submitted by Daniella Sodre (daniella.sodre@ufpe.br) on 2015-04-13T13:19:50Z No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO Érica Patricia de Lima.pdf: 1787249 bytes, checksum: e0335492c8da48600443bd92bee0525e (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-13T13:19:50Z (GMT). No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO Érica Patricia de Lima.pdf: 1787249 bytes, checksum: e0335492c8da48600443bd92bee0525e (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2014-04-29 / FACEPE / Zoantídeos são cnidários comuns de águas rasas em todo o mundo e no Brasil compõe a maioria das comunidades de ambiente recifal, principalmente no nordeste brasileiro. Apesar de abundantes são ainda pouco estudados. Apresentam história taxonômica confusa e com descrições vagas. Dentre os gêneros mais comuns se destaca Protopalythoa (Zoanthidea: Sphenopidae) cujas espécies são abundantes dos recifes pernambucanos. O objetivo desse estudo é realizar a identificação das espécies do gênero Protopalythoa utilizando a integração de dados morfológicos, moleculares e ecológicos, para o esclarecimento de sua taxonomia. Foram realizadas coletas em oito praias de Pernambuco, entre 2012 e 2013, e uma amostra do Arquipélago de São Pedro e São Paulo, coletada no ano de 2009, também foi analisada. No momento das coletas foram feitas fotografias das colônias e foi realizada a anotação de todas as características ecológicas e abióticas, como proximidade com outros organismos, profundidade das colônias e local onde foram coletadas. Foram mensuradas as dimensões dos pólipos (altura, diâmetro e quantidade de tentáculos), foram produzidas lâminas histológicas para análise da musculatura e foi realizado o cnidoma a partir dos tentáculos, da faringe e dos filamentos dos pólipos. Para análise molecular, foi realizada a extração, amplificação e sequenciamento do DNA das amostras utilizando os marcadores 12S, 16S e COI, a fim de construir relações filogenéticas entre os organismos. Os resultados moleculares e morfológicos revelaram a existência de três morfotipos para a espécie Protopalythoa variabilis na costa de Pernambuco e uma nova espécie Protopalythoa mínima nov. sp. descrita para o Arquipélago de São Pedro e São Paulo. Variação intraespecífica foi observada dentro da espécie P. variabilis, confirmada por dados moleculares, além de ampla distribuição, já que os morfotipos se mostraram presente em quase todas as praias e ao longo de toda a costa pernambucana. As análises integradas se revelam eficientes na capacidade de identificar e descrever espécies de zoantídeos.

Orientadores: Fabiano Lopes Thompson, Marcelo Brocchi / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-16T10:05:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tonon_LucianeAlessandraChimetto_D.pdf: 11157072 bytes, checksum: 9af9fa6e5b1ce542596bb28c5a9bf67e (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: Microrganismos têm um papel fundamental na saúde de cnidários, estabelecendo relações ecológicas diversas, de parasitismo até mutualismo. O conhecimento acerca da diversidade de procariontes associados com cnidários e corais no Brasil ainda é escasso. Este é o primeiro estudo enfocando a caracterização taxonômica de bactérias heterotróficas incluindo fixadoras de nitrogênio (N2) e especialmente vibrios isolados do muco do coral endêmico Mussismilia hispida e de zoantídeos simpátricos Palythoa caribaeorum, Palythoa variabilis e Zoanthus solanderi da região de São Sebastião-SP, Brasil. Ao todo, foram obtidos 488 isolados bacterianos destes cnidários, empregando-se os meios de cultivo Ágar Marinho (AM), Ágar Fixação de Nitrogênio (NFb) e Ágar Tiosulfato-Citrato-Bile-Sacarose (TCBS). Os cnidários foram coletados em três praias (Grande, Portinho e Preta) na região de São Sebastião em 2005 e 2006. A maioria dos isolados obtidos pertenciam à classe Gammaproteobacteria. Mais da metade foram identificados como vibrios com base em sequências parciais do gene 16S rRNA. Vibrios do grupo core corresponderam a 80 % das bactérias potencialmente fixadoras de N2 e revelaram alta similaridade de sequência no gene pyrH com V. harveyi e V. alginolyticus. Dezenove isolados representativos, pertencentes às espécies V. harveyi, V. alginolyticus, V. campbellii e V. parahaemolyticus foram capazes de crescer 6 vezes sucessivas em meio NFb e alguns deles mostraram forte atividade da nitrogenase pelo teste de redução de acetileno (ARA). Cerca de 150 vibrios isolados em TCBS foram caracterizados por meio de sequências de 16S rRNA, recA e pyrH. Os taxa mais abundantes foram V. harveyi, V. rotiferianus, V. campbellii, V. alginolyticus, V. mediterranei (=V. shillonii), V. chagasii, V. tubiashii e uma espécie nova de Vibrio. Com exceção de V. chagasii que foi encontrado apenas no muco de M. hispida, as demais espécies foram observadas nos diferentes hospedeiros, não havendo fortes evidências da presença de espécies hospedeiro-específicas. A variabilidade intra-específica dos vibrios foi avaliada por meio de padrões de banda de elementos palindrômicos extragênicos repetitivos (rep-PCR). Esta análise revelou alta diversidade genômica entre os isolados. Cada isolado apresentava um padrão de rep-PCR distinto, indicando uma grande diversidade de populações co-existindo no mesmo habitat. As identificações geradas pelo rep-PCR concordaram com as identificações obtidas pelo MLSA (Multilocus Sequence Analysis). Diversos isolados de diferentes grupos microbianos apresentaram menos de 97 % de similaridade em sequências do gene 16S rRNA com espécies conhecidas, indicando que elas seriam possíveis espécies novas. Ao todo, sete espécies novas foram descritas por meio da taxonomia polifásica: Marinobacterium coralli sp. nov., Marinomonas brasilensis sp. nov., Photobacterium swingsii sp. nov., P. jeanii sp. nov., Vibrio communis sp. nov., V. variabilis sp. nov. e V. marinum sp. nov. Os dados fenotípicos, quimiotaxonômicos, genotípicos e filogenéticos obtidos a partir da descrição das sete espécies novas demonstraram que há uma ampla variabilidade fenotípica intra-específica. Este estudo determinou a identidade dos principais grupos de bactérias cultivadas do muco de corais, sobretudo, os vibrios. Uma das espécies de vibrios mais abundantes no muco dos corais é V. communis sp. nov. A fixação de N2 representa um fenótipo comum entre as espécies de vibrios estudadas, sugerindo uma função positiva no holobionte. / Abstract: Microorganisms have a key role in the health of cnidarians establishing ecologic relationships, of parasitism to mutualism. The knowledge on the diversity of prokaryotes associated with corals in Brazil is very limited. This is the first study on the taxonomic characterization of heterotrophic bacteria, including putative N2-fixing and specially vibrios isolated from mucus of endemic coral Mussismilia hispida and the sympatric zoanthids Palythoa caribaeorum, Palythoa variabilis and Zoanthus solanderi. Cnidarian specimens were isolated in the beaches Grande, Portinho and Preta from São Sebastião region, SP, Brazil, in 2005 and 2006. A total of 488 isolates were obtained using different culture media, i.e. Marine Agar (MA), Nitrogen Fixation (NFb) and Thiosulphate-Citrate- Bile-Sucrose Agar (TCBS). The majority of the isolates fell within the class Gammaproteobacteria and more than half of them were vibrios based on 16S rRNA gene sequences. Based on pyrH gene sequences 80 % of the putative N2-fixing bacteria clustered with the Vibrio core species group (i.e. V. harveyi and V. alginolyticus). Nineteen representative isolates of V. harveyi, V. alginolyticus, V. campbellii and V. parahaemolyticus) were capable of growing six successive times in nitrogen-free medium and some of them showed strong nitrogenase activity by means of the acetylene reduction assay (ARA). About 150 vibrios isolated on TCBS were characterized by means of 16S rRNA, recA and pyrH gene sequences. The most abundant taxa were V. harveyi, V. rotiferianus, V. campbellii, V. alginolyticus, V. mediterranei (=V. shillonii), V. chagasii, V. tubiashii and a new Vibrio species. With the exception of V. chagasii which was found only in the mucus of M. hispida, the other species appeared in different hosts with no strong evidence for the presence of host-specific species. A high genomic diversity was observed using rep-PCR. Each vibrio isolate represented a different co-occuring population, suggesting huge intra-especific diversity. There was a complete agreement between the grouping based on rep-PCR and identification based on MLSA (Multilocus Sequence Analysis). Several isolates had less than 97 % similarity towards know species based on 16S rRNA gene sequence, indicating that they are possibly new species. In total, seven new species were described based on polyphasic taxonomy: Marinobacterium coralli sp. nov., Marinomonas brasilensis sp. nov. Photobacterium swingsii sp. nov., P. jeanii sp. nov., Vibrio communis sp. nov., V. variabilis sp. nov. and V. marinum sp. nov. The new species were characterized by polyphasic taxonomy. Based on phenotypic, chimiotaxonomic, genotypic and phylogenetic data obtained from description of new species, it was demonstrated a huge intra-specific phenotypic variability. This study determined the taxonomic identity of heterotrophic bacteria, especially Vibrio, isolates from cnidarians. V. communis sp. nov. is one of the most frequently found species in the corals. Nitrogen fixation is a common phenotypic trait among vibrios, suggesting that these bacteria may have a positive function in the holobiont. / Doutorado / Genetica de Microorganismos / Doutor em Genetica e Biologia Molecular

Made available in DSpace on 2014-06-12T23:13:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo3053_1.pdf: 2529352 bytes, checksum: ea122352da45d79a2b72d5634d4999af (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Faculdade de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco / O zoantídeo Palythoa caribaeorum é um cnidário colonial cujo os pólipos são conectados por um espesso tecido que possui partículas minerais incorporadas e habita extensas áreas dos recifes costeiros no Brasil. Este zoantídeo é popularmente conhecido por "baba-de-boi", por secretar um muco muito viscoso. O muco produzido por corais, animais que são filogeneticamente próximos ao zoantídeos, consiste de um conjunto complexo de Eukarya Archaea e Bacteria. O objetivo deste estudo foi realizar uma caracterização taxonômica da microbiota presente no muco de colônias saudáveis e branqueadas de P. caribaeorum. O muco foi coletado nos recifes costeiros de Porto de Galinhas e de Suape, litoral sul de Pernambuco, em 2010. O isolamento das bactérias foi realizada utilizando o meio Ágar Marinho. O PCR dos segmentos 16S rDNA foi realizado utilizando os primers universais 27F e 1492R. O Sequênciamento dos fragmentos foi realizado no sequênciador ABI 3100 e a qualidade das sequências foram verificadas usando o programa Sequencing analysis 3.4 e, então, comparadas com as sequencias depositadas no GenBank usando o algoritmo Blastn. Um total de 50 amostras de bactérias isoladas de colônias saudáveis e branqueadas foram analisadas. O grupo dominante foi -Proteobacteria com 36 isolados (72%), seguido por - Proteobacteria e Actinobacteria com seis isolados (12%) cada, e Firmicutes com dois isolados (4%). O gênero Vibrio foi o mais comum (50%), corroborando trabalhos anteriores em que este gênero foi o mais comum associado aos cnidários. Sequências de alguns isolados foram relacionados ao nível de espécie (97%) aos já depositados no GenBank, entre elas, espécies com potencial biotecnológico interessante, como bactérias do gênero Alcanivorax, que usa hidrocarbonetos derivados do petróleo como fonte de carbono e energia; e bactérias dos gêneros Vibrio, Photobacterium, Pseudomonas, Micrococcus e Pseudoalteromonas, grupos conhecidos por produzir compostos antimicrobianos e potentes toxinas marinhas. Algumas das sequências dos isolados foram relacionados com patógenos de seres humanos como V. alginolyticus e V. proteolyticus, e outras relacionadas a espécies do gênero Pseudoalteromonas, que podem ter participação no fenômeno do branqueamento. Outros isolados podem representar novas espécies uma vez que suas seqüências mostrou uma baixa similaridade com os taxa já conhecidos e muitos deles foram registrados pela primeira vez no muco de P. caribaeorum. É importante intensificar os estudos de diversidade microbiana neste zoantídeo para entender melhor o papel dessas bactérias nas propriedades farmacológicas do muco

A evolução do veneno, uma das misturas mais complexas da natureza, tem sustentado o sucesso da diversificação de inúmeras linhagens de animais. Serpentes deslizantes ou medusas flutuantes utilizam o veneno, um coquetel de peptídeos farmacologicamente ativos, sais e moléculas orgânicas. Esses animais surpreendentes têm provocado grande fascínio ao longo da história humana. Nesta dissertação propomos um estudo da evolução dos venenos no filo Cnidaria, englobando dados proteômicos e genômicos. Este projeto teve como objetivos: (1) caracterizar e elucidar a evolução da composição do veneno em Cnidaria por meio da comparação de listas de proteínas; (2) testar a hipótese de que a variação na família de toxinas específica de cnidários tem sido o resultado de um regime de seleção positiva; e (3) determinar a extensão em que a duplicação de genes pode ser considerada como a principal razão para a diversificação de toxinas em Cnidaria. O capítulo \"Comparative proteomics reveals common components of a powerful arsenal in the earliest animal venomous lineage, the cnidarians\" propõe o estudo comparado mais completo sobre a composição do veneno de cnidários e uma hipótese sobre a montagem evolutiva do complexo arsenal bioquímico de cnidários e do veneno ancestral desse grupo basal. Vinte e oito famílias de proteínas foram identificadas. Destas, 13 famílias foram registradas pela primeira vez no proteoma de Cnidaria. Pelo menos 15 famílias de toxinas foram recrutadas no proteoma de veneno de cnidários antes da diversificação dos grupos Anthozoa e Medusozoa. Nos capítulos \"Evidence of episodic positive selection in the evolution of jellyfish toxins of the cnidarian venom\" e \"Gene duplications are extensive and contribute significantly to the toxic proteome of nematocysts isolated from Acropora digitifera (Cnidaria: Anthozoa: Scleractinia)\", nossas análises demonstram que as famílias de toxinas nos cnidários se diversificam amplamente mediante a duplicação de genes. Além disso, em contraste com as famílias de toxinas do veneno na maioria das linhagens animais; nós identificamos um padrão diferente na família de toxinas específica de cnidários, em que há uma seleção purificadora por longos períodos seguindo longos tempos de diversificação ou vice-versa / The evolution of venom, nature\'s most complex concoction, has underpinned the success and diversification of numerous animal lineages. Slithering serpents or buoyant jellyfishes employ venom, a cocktail of pharmacologically active peptides, salts, and organic molecules. These astonishing animals have generated a great fascination throughout human history. In this dissertation, we propose a study of the evolution of venoms in the phylum Cnidaria, encompassing proteomic and genomic data. This project aimed: (1) to characterize and elucidate the evolution of venom composition in Cnidaria by comparing protein lists; (2) to test the hypothesis that the variation in specific family of cnidarians toxins has been the result of a positive selection regime; and (3) to determine the extent to which the genes duplication may be regarded as the main reason for the diversity of toxins in Cnidaria. The chapter \"Comparative proteomics reveals common components of a powerful arsenal in the earliest animal venomous lineage, the cnidarians\" presents the most comprehensive comparative study on the cnidarians venom composition and a hypothesis about the evolutionary assembly of the complex biochemical arsenal of cnidarians and of the ancestral venom of this basal group. Twenty eight protein families were identified. Of these, 13 families were described for the first time in the proteome of Cnidaria. At least 15 types of toxin families were recruited in cnidarians venom proteome before the diversification of Anthozoa and Medusozoa groups. In the chapters \"Evidence of episodic positive selection in the evolution of jellyfish toxins of the cnidarian venom\" and \"Gene duplications are extensive and contribute significantly to the toxic proteome of nematocysts isolated from Acropora digitifera (Cnidaria: Anthozoa: Scleractinia)\", our analyses indicate that the families of toxins in cnidarians diversify broadly through gene duplication. Besides, in contrast to the families of venom toxins in most animals lineages, we identified a different pattern in the specific family of cnidarians toxins, where there is a purifying selection for periods long, followed by long periods of diversification or vice versa

Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2018-05-24T20:22:02Z No. of bitstreams: 1 273236.pdf: 8249989 bytes, checksum: 228941a9d93aeb88389dd37957d513c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-24T20:22:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 273236.pdf: 8249989 bytes, checksum: 228941a9d93aeb88389dd37957d513c7 (MD5) Previous issue date: 1998-07-24 / FAPERJ / FUJB / CAPES / Através de análises histológicas foi verificado o padrão reprodutivo de Mussismilia hispida, espécie zooxantelada de coral, endêmica na costa brasileira. Fragmentos provenientes de 2 colônias fixas, as quais foram marcadas no campo para que pudessem ser repetidamente amostradas, e de 1O colônias escolhidas ao acaso foram mensalmente obtidos no periodo de abril/89 a março/90, na Praia da Tartaruga, Búzios, Rio de Janeiro. Os resultados mostraram que M. hispida é uma espécie hermafrodita sequencial, cujo modo de reprodução envolve a liberação de gametas para fertilização e desenvolvimento externos. Células femininas surgiram antes das masculinas e foram inicialmente observadas em abril/89. O tamanho dos ovócitos de Estágio 1, parcialmente imersos na camada mesogleal, variou de 13,04μm a 19,56μm. Entre fevereiro/90 e março/90, ovócitos alcançaram o máximo de amadurecimento e estavam aptos para fertilização. O maior ovócito... / Through histological analysis the reproductive pattern of Mussismilia hispida, a zooxanthellate coral species endemic to the Brazilian coast was verified. Fragments from 2 tagged colonies, which were marked in the field in order to be repeatedly sampled, and 10 others haphazardly chosen were collected monthly, from April/89 to March/90, at Praia da Tartaruga, Buzios, Rio de Janeiro. The results showed that M. hispida is a sequential hermaphroditic species with a broadcast-spawning mode of reproduction, and external fertilization and development. Female cells developed prior to male cells, and were first observed in April/89. Size of Stage I oocytes partially immersed into mesogleal layer ranged from 13,04μm to 19,56μm. Between February/90 and March/90, oocytes reached maximum ripeness and were ready for fertilization. The largest Stage III oocyte...

Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2018-02-07T23:54:17Z No. of bitstreams: 1 278121.pdf: 8127899 bytes, checksum: 3473eb61a7feee420d01f0c085576985 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-07T23:54:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 278121.pdf: 8127899 bytes, checksum: 3473eb61a7feee420d01f0c085576985 (MD5) Previous issue date: 1998-08-28 / CAPES / FAPERJ / FUJB / #REVUSAR# CEPEG / A quantificação das comunidades coralíneas em três locais do Arquipélago dos Abrolhos, BA (Face Norte e Portinho, na Ilha de Santa Bárbara, e Ilha Siriba), foi realizada através de transectos de interseção de linha e de quadrados. Para as cinco espécies mais frequentes ou abundantes (Agaricia agaricites, Favia gravida, Mussismilia braziliensis, Porites branneri e Siderastrea stellata) foram avaliados os tamanhos e inclinações de colônias, distâncias entre ponto aleatório e colônias e entre colônias. Ao se comparar os resultados obtidos por quadrados e transectos, não se detectou diferença entre eles quanto à representação das comunidades ( contribuições de diferentes organismos para a cobertura da área). Entretanto, os transectos de interseção de linha detectaram um maior número de espécies, conferindo à amostra um maior poder de resolução do que o método de quadrados. Os organismos construtores dominantes em profundidades entre... / The quantification of coral communities in three areas in the Abrolhos Archipelago (northern and southern inshore areas in Santa Bárbara Island, and Siriba Island) was performed using quadrats and intercept line transect methods. Colony size and inclination, the distances from random points to the nearest colony and between nearest colonies of the same species were evaluated for the five most frequent or abundant coral species (Agaricia agaricites, Favia gravida, Mussismilia braziliensis, Porites branneri e Siderastrea stellata). No differences were detected in the representation of the community ( contributions of different organisms to coverage of an area) when the results of data from quadrats and transects were compared. However, intercept line transects detected more species, presenting higher resolution than quadrats. Dominant reef building organisms, between depths of...

Orientador: Vidal Haddad Júnior / Banca: Fábio Lang da Silveira / Banca: Rafael Augusto Gregati / Resumo: O presente trabalho relata a composição, abundância e distribuição dos cnidários nas diferentes estações do ano, caracterizando as espécies dominantes da comunidade nas regiões amostradas, da costa do litoral norte do Estado de São Paulo (Ubatuba 23º26' 15''S e 45º03'45''W; Caraguatatuba 23º61'39"S e 45º32'56''W; São Sebastião 23º84' 94''S e 45º24'81''W), no período compreendido entre fevereiro de 2001 a dezembro de 2002. Foram encontradas 6 espécies de cnidários potencialmente causadores de acidentes, sendo 2 cubozoários: Tamoya haplonema (Müeller, 1859) e Chiropsalmus quadrumanus (Müeller, 1859); 2 hidrozoários: Nemalecium lighti (Hargitt, 1924) e Olindias sambaquiensis (F. Müller, 1861) e 2 cifozoários: Chrysaora lactea Eschscholtz, 1829 e Lychnorhiza lucerna Haeckel, 1880. As espécies de maior abundância e freqüência na comunidade foram C. lactea e O. sambaquiensis. Estas espécies também tiveram mais representatividade em análises de abundância além de sua distribuição espacial e temporal. T. haplonema foi uma espécie de ocorrência exclusiva apenas em outono e inverno e C. lactea foi uma espécie abundante de ocorrência no ano todo, com mais representantes nas estações de outono e inverno. Outro objetivo do estudo foi o registro de acidentes causados por algumas espécies de cnidários em banhistas da região de Ubatuba, além da identificação da espécie e associação às lesões dermatológicas e à provável etiologia dos acidentes, além da correlação da quantidade dos animais com a ocorrência de acidentes registrados em meses de veraneio. Foram registrados cento e vinte e oito pacientes, e desta forma, analisados sinais e sintomas, manifestações sistêmicas e extensões das lesões no corpo da vítima, comprovou-se uma associação entre as marcas cutâneas e a provável etiologia e gravidade dos acidentes. Além disso .... / Not available / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:12Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-25Bitstream added on 2014-06-13T21:00:29Z : No. of bitstreams: 1 mendes_pr_me_botib.pdf: 1465265 bytes, checksum: bbb67eb612b94d3451a49d78c65fbdd4 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O presente trabalho relata a composição, abundância e distribuição dos cnidários nas diferentes estações do ano, caracterizando as espécies dominantes da comunidade nas regiões amostradas, da costa do litoral norte do Estado de São Paulo (Ubatuba 23º26’ 15’’S e 45º03’45’’W; Caraguatatuba 23º61’39”S e 45º32’56’’W; São Sebastião 23º84’ 94’’S e 45º24’81’’W), no período compreendido entre fevereiro de 2001 a dezembro de 2002. Foram encontradas 6 espécies de cnidários potencialmente causadores de acidentes, sendo 2 cubozoários: Tamoya haplonema (Müeller, 1859) e Chiropsalmus quadrumanus (Müeller, 1859); 2 hidrozoários: Nemalecium lighti (Hargitt, 1924) e Olindias sambaquiensis (F. Müller, 1861) e 2 cifozoários: Chrysaora lactea Eschscholtz, 1829 e Lychnorhiza lucerna Haeckel, 1880. As espécies de maior abundância e freqüência na comunidade foram C. lactea e O. sambaquiensis. Estas espécies também tiveram mais representatividade em análises de abundância além de sua distribuição espacial e temporal. T. haplonema foi uma espécie de ocorrência exclusiva apenas em outono e inverno e C. lactea foi uma espécie abundante de ocorrência no ano todo, com mais representantes nas estações de outono e inverno. Outro objetivo do estudo foi o registro de acidentes causados por algumas espécies de cnidários em banhistas da região de Ubatuba, além da identificação da espécie e associação às lesões dermatológicas e à provável etiologia dos acidentes, além da correlação da quantidade dos animais com a ocorrência de acidentes registrados em meses de veraneio. Foram registrados cento e vinte e oito pacientes, e desta forma, analisados sinais e sintomas, manifestações sistêmicas e extensões das lesões no corpo da vítima, comprovou-se uma associação entre as marcas cutâneas e a provável etiologia e gravidade dos acidentes. Além disso.... / Not available