Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Centro de Desenvolvimento Sustentável, 2013. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2013-08-19T16:09:03Z No. of bitstreams: 1 2013_MarcoAurelioPavarino.pdf: 1681337 bytes, checksum: 2fbeaecdc6fb268e42837beac071c2b2 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-08-20T11:22:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_MarcoAurelioPavarino.pdf: 1681337 bytes, checksum: 2fbeaecdc6fb268e42837beac071c2b2 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-20T11:22:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_MarcoAurelioPavarino.pdf: 1681337 bytes, checksum: 2fbeaecdc6fb268e42837beac071c2b2 (MD5) / O presente trabalho analisa a representação e a participação dos agricultores familiares, povos e comunidades tradicionais nos espaços institucionais brasileiros que tem relação com a Convenção sobre Diversidade Biológica – CDB. Parte do pressuposto de que esses grupos sociais são, em tese, os mais vulneráveis à regulamentação das políticas para a implantação dos três objetivos da CDB: a conservação da biodiversidade, o uso sustentável dos seus componentes e o acesso aos recursos genéticos e repartição equitativa dos benefícios gerados a partir desses acessos. O estudo analisa três espaços institucionais que tratam dos temas afetos à CDB: a Comissão Nacional de Biodiversidade – Conabio, a Comissão Técnica Nacional de Biossegurança – CTNBio e a Comissão de Gestão de Patrimônio Genético – Cgen. A análise da evolução da representação dos grupos sociais estudados é feita nos três espaços, enquanto a análise da participação centra sua análise na Conabio. Para os fins dessa pesquisa, representação é entendida como a garantia formal nos espaços institucionais para os grupos sociais estudados. A participação constitui-se na atuação dos representantes formalmente designados nesses espaços por meio das intervenções que foram realizadas nas reuniões. A pesquisa utiliza-se da análise documental, da realização de entrevistas semiestruturadas com treze dois vinte conselheiros da Conabio e também da vivência do autor como representante institucional na Conabio. Conclui-se que a representação só está assegurada em dois dos espaços estudados e que, mesmo assegurada a representação, a participação desses grupos sociais no espaços analisados ainda é frágil, impactando negativamente na possibilidade de interferir nas deliberações de políticas que visam a manutenção da biodiversidade, dos conhecimentos tradicionais associados ao uso da biodiversidade. Da mesma forma, impacta na manutenção e garantia de seus direito.s A pesquisa conclui, ainda, que os arranjos institucionais adotados pelo estado brasileiro deixa clara a opção de dividir as responsabilidades de cada um dos três objetivos da CDB entre as instituições estudadas. Tal fato, aliada à ausência de interação entre essas instituições, acaba por enfraquecer o papel deliberativo da Conabio. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / This work analyses the representation and participation of social groups integrated by family farmers and traditional communities in Brazilian institutional areas related to the Convention on Biological Diversity - CBD. It is assumed that these social groups are, theoretically, more vulnerable to the policy regulations for the implementation of the three objectives of the CBD: the conservation of biodiversity, the sustainable use of its components and the access to genetic resources and equitable sharing of the benefits generated from this access. Thus, the study analyzes three institutional spaces that deal with the topics related to the CBD: Comissão Nacional de Biodiversidade (National Biodiversity Commission) – Conabio; Comissão Técnica Nacional de Biossegurança (National Biosecurity Technical Commission) – CTNBio; and Comissão de Gestão de Patrimônio Genético (Genetic Heritage Management Commission) – Cgen. The analysis of the representation of the social groups is undertaken in all three spaces, while the analysis concerning participation focuses on the Conabio. The analysis of the representation of the social groups is undertaken in all three spaces, while the analysis concerning participation focuses on the Conabio. In this research, representation is understood as the guarantee of a formal presence in the institutional space for the social groups. Participation is assumed as the role of formally designated representatives who occupy these spaces through the interventions that were made at the meetings. The research uses analysis of documents, semi-structured interviews with thirteen of the twenty two Conabio counselors and also the experience of the author as an institutional representative of the Ministry of Agrarian Development in Conabio. The study concludes that representation is only assured in two institutional spaces and, even when the representation is ensured, the participation of those social groups is still fragile. This situation negatively impacts their ability to interfere in policy deliberations aimed at maintaining biodiversity and traditional knowledge associated with the use of biodiversity. Likewise affects the maintenance of their rights. The research also concludes that the institutional arrangements adopted by Brazilian State clearly illustrate the option to share the responsibilities of each of the three objectives of the CBD between the institutions studied. Associated with the lack of interaction between these institutions, the result is the weakening of the deliberative role of Conabio.

Alterações na estrutura da vegetação exercem uma forte influência nas distribuições, interações e adaptações da avifauna. Este estudo avaliou se a diversidade, riqueza, composição de espécies e guildas da assembléia de aves respondem às diferenças estruturais de vegetação, assim como padrões de organização desta assembléia, com base na convergência (TCAP) e divergência (TDAP) de atributos em remanescentes da Mata Atlântica em diferentes estágios sucessionais. Pontos de escuta foram realizados para amostragem da avifauna em 12 unidades amostrais no período de Janeiro a Abril de 2011, caracterizados de acordo com 11 variáveis estruturais de vegetação. Atributos das espécies, como morfometria, hábito alimentar, estrato de forrageamento e do ninho foram compilados para avaliação dos padrões das assembléias. Vários parâmetros avaliados responderam às diferenças na estrutura da vegetação, com habitats mais heterogêneos abrigando maior diversidade e riqueza de aves, e algumas espécies e guildas restritas a determinados estágios de sucessão, causando diferença na composição de espécies e de guildas. Os resultados também indicaram que a assembléia de aves é estruturada por padrões simultaneamente relacionados com convergência e divergência de atributos funcionais. Ou seja, tanto fatores abióticos (filtros ambientais) quanto bióticos (limitação de similaridade) exercem efeitos distintos em assembléia de aves ao longo de um gradiente estrutural. Nas áreas com maior complexidade ambiental ocorreu uma complementaridade no uso dos recursos devido à divergência de atributos e, dessa forma, a um acréscimo na diversidade funcional.

Submitted by Danielle Karla Martins Silva (danielle.martins@ufpe.br) on 2015-03-12T17:45:16Z No. of bitstreams: 2 Thiago Nogueira de Vasconcelos Reis.pdf: 1277676 bytes, checksum: f7185ee21d4103680d240ab6e1295498 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-12T17:45:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Thiago Nogueira de Vasconcelos Reis.pdf: 1277676 bytes, checksum: f7185ee21d4103680d240ab6e1295498 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012 / CAPES / Os impactos ambientais causados pelo homem têm sido fonte de grande preocupação, tendo em vista as conseqüências negativas que afetam o equilíbrio ecológico do meio. A área apresenta uma variedade ambientes e agrega vários habitats, o que a torna um dos principais pontos de diversidade de algas no Estado Pernambucano. A partir dai surgiu à necessidade de realizar um estudo na região, com o objetivo de fazer um inventario das algas presentes em Suape, e assim, contribuir para o conhecimento sobre a comunidade ficológica da região, gerando subsídios para fins de preservação e futuros trabalhos de monitoramento. As coletas foram divididas em 2 etapas distintas, a primeira realizada no período de janeiro de 1998 a julho de 1999, apenas inventariando a flora, a segunda etapa, foi realizada trimestralmente, de Janeiro de 2009 a julho de 2010, inventariando minuciosamente a flora algológica da região e quantificando a biomassa das macroalgas dos recifes da região portuária de Suape. Nesta etapa foram coletadas 378 amostras para fins de biomassa e diversidade, sendo estas distribuídas em três transects, aleatoriamente. Foram coletados parâmetros abióticos concomitantemente (NO2, NO3, PO4, turbidez e Sólidos Totais Suspensos) Foram registradas Baia da região portuária de Suape um total de 136 taxa de macroalgas, o que a caracteriza como a área de maior riqueza desse grupo o litoral do estado de Pernambuco. É importante ressaltar o registro de um novo táxon para o litoral brasileiro Acetabularia farlowii e novas adições para a flora ficológica do litoral do estado de Pernambuco (Acetabularia myriospora, Ceratodictyon planicaule, Ceramium vagans e Laurencia oliveirana). A biomassa das algas encontradas na região variou de 181,3±20,7 no mês de Janeiro de 2009 a 62,5±6,0 no mês de Julho de 2010. Foi possível observar variações significativas entre o mês de janeiro de 2009 e Julho de 2009 (z=3.549; p<0,05), Janeiro de 2010 (z=3.523; p<0,05) e Julho de 2010 (z=3.6904; p<0,05), entre os meses de Abril 2010 e Julho de 2009 (z=3.1889; p<0,05), Janeiro de 210 (z=3.1632; p<0,05) e Julho de 2010 (z=3.3304; p<0,05). As diferenças encontradas foram, principalmente, observadas pela influência das dragagens e pela sazonalidade, tendo em vista que os únicos meses que apresentaram grandes biomassa foram os meses de Janeiro de 2009 (quando ainda não haviam dragado) e o mês de abril de 2010 (quando as dragagens estavam sendo finalizadas). O mês de julho de 2010 apresentou valores de biomassa baixos, provavelmente pela sazonalidade e pelo aumento de chuvas no período. Das espécies que constituem a comunidade de macroalgas na região, as Palisada perforata, Centrosceras clavulatum, Gelidiella acerosa e Acanthophora spicifera, foram as que apresentaram maiores freqüências, com 86, 47, 41 e 40% respectivamente. Com base nos dados obtidos, é possível afirmar que as comunidades de algas aparentam estar bem conservadas na região do Complexo portuário de Suape, tendo em vista o elevado número de taxa e a alta freqüência de espécies normalmente encontradas em outros recifes de arenito no litoral do estado.

Submitted by Leonardo Freitas (leonardo.hfreitas@ufpe.br) on 2015-04-08T18:58:41Z No. of bitstreams: 2 TESE BIANCA DENISE DA SILVA.pdf: 8697607 bytes, checksum: 58418d794bfd083b00cab9461c647273 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-08T18:58:41Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TESE BIANCA DENISE DA SILVA.pdf: 8697607 bytes, checksum: 58418d794bfd083b00cab9461c647273 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013-02-26 / CAPES; PPBio / Os fungos gasteroides, também conhecidos como gasteromicetos, estão representados por diversas linhagens distintas de Agaricomycetes que, embora não compartilhem da mesma ancestralidade, possuem similaridades intrigantes, como os basidiomas angiocárpicos que apresentam liberação passiva dos basidiosporos. Análises filogenéticas recentes vêm provocando significativas alterações na classificação dos fungos gasteroides, especialmente, em níveis hierárquicos elevados, como classe e ordem. Atualmente, cerca de 250 espécies de gasteromicetos são registradas para o Brasil, sendo 62 conhecidas para região Nordeste. Neste trabalho foi realizado um novo inventário dos fungos gasteroides em áreas de Mata Atlântica e Caatinga localizadas em seis estados da região Nordeste (Bahia, Ceará, Paraíba, Pernambuco, Piauí e Rio Grande do Norte). Para isso, foram efetuadas coletas de maio de 2010 a agosto de 2012 e adicionalmente, foram realizadas revisões de coleções depositadas nos Herbários UFRN, URM e BPI. As análises das macro e microestruturas seguiram a metodologia utilizada tradicionalmente em estudos taxonômicos de gasteromicetos. Foram identificadas 71 espécies distribuídas em 17 gêneros [Abrachium (01), Bovista (07), Calvatia (05), Clathrus (05), Disciseda (05), Geastrum (24), Langermannia (01), Morganella (05), Mutinus (05), Myriostoma (01), Phallus (01), Podaxis (01), Pisolithus (01), Scleroderma (01), Staheliomyces (01), Tulostoma (05) e Vascellum (02)] e cinco famílias (Agaricaceae, Clathraceae, Geastraceae, Phallaceae e Sclerodermataceae). Destas, oito espécies são novas para a ciência, 24 constituem novos registros para o Brasil e 38 para o Nordeste. Agaricaceae (=Lycoperdaceae) esteve presente em todas as áreas, sendo a família mais representativa em número de gêneros e espécies, sete e 31 respectivamente. Geastrum foi o gênero mais representativo, com maior número de espécies, que predominaram nas áreas úmidas. Disciseda e Tulostoma predominaram na vegetação de Caatinga. Com estes resultados, temos um acréscimo de cerca de 37% no número de espécies de fungos gasteroides ocorrentes na micobiota nordestina. Assim, este estudo ampliou significativamente o conhecimento sobre os gasteromicetos no Nordeste brasileiro, nos domínios fitoecológicos da Caatinga e Mata Atlântica.

Submitted by Leonardo Freitas (leonardo.hfreitas@ufpe.br) on 2015-04-08T19:33:00Z No. of bitstreams: 2 TESE Lidiane Roberta.pdf: 4098007 bytes, checksum: 1d5178be0e4a13fb93c02de95203971a (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-08T19:33:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TESE Lidiane Roberta.pdf: 4098007 bytes, checksum: 1d5178be0e4a13fb93c02de95203971a (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013-02-26 / FACEPE / O Brasil é o país com a maior diversidade biológica, abrigando entre 15% e 20% do número total de espécies do planeta, sendo por isso considerado megadiverso. Dentre os biomas encontrados nesse país, estão a Mata Atlântica e a Caatinga. Dos fungos comumente isolados de solos destacam-se as espécies de Penicillium. A taxonomia desse gênero é bastante complexa e a dificuldade encontrada na identificação morfológica das espécies de Penicillium torna necessária a busca de novas ferramentas, tais como a microscopia eletrônica de varredura e a biologia molecular, que venham a complementar e validar a taxonomia clássica. Essas espécies possuem um largo potencial biotecnológico para a produção de enzimas de interesse industrial, como é o caso da tanase, que apresenta aplicação principalmente na produção de bebidas e fármacos. A produção industrial de tanase pode ser realizada através de Fermentação em Estado Sólido (FES) pela utilização de resíduos de frutos ricos em taninos, como o cajá, a manga e o umbu-cajá, visando minimizar os custos da produção. Apesar de excelentes produtores de enzimas de interesse biotecnológico, algumas linhagens de Penicillium produzem micotoxinas que podem apresentar ação carcinogênica, teratogênica, nefrotóxica, entre outras. Assim, torna-se necessária a avaliação da produção de tais metabólitos por linhagens de espécies de Penicillium que apresentem potencial para aplicação em processos biotecnológicos, principalmente nas indústrias farmacêutica e alimentícia. Os objetivos desta tese foram 1) isolar e avaliar a diversidade de espécies de Penicillium em solos das áreas da Caatinga e da Mata Atlântica no Estado de Pernambuco (Brasil), 2) determinar qualitativa e quantitativamente a produção de tanase por espécies de Penicillium atrravés da FES, utilizando resíduos de cajá, de manga e de umbu-cajá e 3) a caracterização desses isolados quanto aos seus perfis micotoxigênicos. Um total de 815 culturas de Penicillium foram isoladas, sendo 370 do solo da Caatinga e 445 do solo de Mata Atlântica. Trinta e uma espécies foram identificadas morfologicamente, sendo 23 provenientes da Caatinga e 17 da Mata Atlântica. Três isolados do solo da Caatinga foram identificados morfologicamente apenas ao nível de gênero. Destes, um foi posteriormente identificado através de análises morfológicas e filogenéticas como uma espécie nova, denominada Talaromyces pernambucanus. Um grupo de 3 isolados foi identificado como Penicillium bilaiae, porém apresentando um diferencial, a produção de esclerócios, sendo proposta a epitipificação dessa espécie.Todas as linhagens testadas foram produtoras de tanase, sendo que o isolado P. rolfssi URM 6216 o melhor produtor em resíduos de manga, com 96,22 U mL-l. Algumas linhagens de Penicillium avaliadas nesta tese, são possíveis produtoras das micotoxinas ocratoxina A e patulina. Contudo, nenhuma das micotoxinas avaliadas neste estudo foi observada para a maioria dos melhores produtores de tanase. O presente estudo revelou que os solos de Caatinga e Mata Atlântica apresentam alta diversidade de espécies de Penicillium, com a Caatinga apresentando espécies raras e uma espécie nova para a ciência. Tais linhagens apresentam um elevado potencial biotecnológico para a produção de tanase através da FES utilizando resíduos de cajá, de manga e de umbu-cajá como substratos.

Submitted by Leonardo Freitas (leonardo.hfreitas@ufpe.br) on 2015-04-09T19:22:41Z No. of bitstreams: 2 TESE MISAEL Costa.pdf: 1160200 bytes, checksum: e1ef241bd676a3f819a5690fdba2f8fe (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-09T19:22:41Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TESE MISAEL Costa.pdf: 1160200 bytes, checksum: e1ef241bd676a3f819a5690fdba2f8fe (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2006 / O presente trabalho objetivou conhecer de forma pioneira, a diversidade de leveduras presentes no solo de três municípios do semi-árido da Bahia, Mucugê, Ipirá e Paulo Afonso, caracterizando as mesmas nos níveis de fenotipagem e genotipagem através da análise filogenética. As amostras de solo foram coletadas nos períodos de seca e de chuvas, e analisadas quanto a temperatura e pH. A temperatura média das amostras de solo foi 27°C; o pH das mesmas amostras foi ácido, em torno de 5.31. Foram obtidas 130 amostras de leveduras; 100 foram identificadas através das características morfológicas e fisiológicas do sistema clássico; no entanto, 30 amostras foram identificadas através da taxonomia molecular, utilizando-se a região D1/D2 do 26S rDNA pela qual leveduras conhecidas encontram-se seqüenciadas. Esta região foi capaz de diferenciar quase todas as espécies testadas, o que indica o desenvolvimento de novos estudos de taxonomia molecular. Maior número de táxons foi obtido de amostras de solo do município de Mucugê, seguido de Ipirá e Paulo Afonso. Entre os táxons, 24 têem afinidade ascomicética, 26 basidiomicética e 04 com os leveduróides (black yeast). Foram identificadas as espécies Brettanomyces bruxellensis, Bullera alba, Candida catenulata, C.glabrata, C. parapsilosis, C. sake, C. zeylanoides, Cryptococcus humicola, C. laurentii, C. luteolus, Rhodotorula minuta, R. mucilaginosa, R. glutinis, Sporobolomyces roseus, Trichosporon pullulans. Entre 30 isolados submetidos à caracterização molecular, foram obtidas 22 seqüências; 12 grupos foram reconhecidos depois de submetidos à comparação das seqüências pelo GenBank usando o BLAST (NCBI). Com todos os isolados foi possível chegar a espécie com um alto grau de similaridade, a maioria acima de 90%. Os grupos foram: Hortaea Werneckii (I), Pichia guilliermondii (II), Candida parapsilosis (III), Rhodotorula glutinis (IV), Rhodotorula laryngis (V), Rhodotorula phylloplana (VI), Rhodotorula bacarum (VII), Rhodotorula slooffiae (VIII), Rhodotorula minuta (IX), Pseudozyma aphidis (X), Cryptococcus podzolicus (XI) e Rhodosporidium diobovatum (XII). Na árvore de consenso estrito pela análise filogenética foram evidenciados 20 grupos, na maioria com valor de bootstrap superior a 90% o que indica que as amostras pertencem realmente ao táxon dos grupos formados. Os resultados indicam que existe uma grande diversidade de leveduras no solo do Semi-árido da Bahia.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:06:32Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo532_1.pdf: 5130503 bytes, checksum: e33c8d155e5e443a6bfd70fd16a7cbcd (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Dentre as variedades de algodoeiro transgênico, o Bt (=Bacillus thuringiensis) oferece resistência aos principais lepidópteros pragas do algodoeiro por expressar a proteína Cry1Ac (=crystal protéico). Tendo em vista que a produção dessa proteína pelo vegetal geneticamente modificado pode influenciar a capacidade da planta em alocar fungos endofíticos, o objetivo do presente estudo foi investigar as possíveis alterações na composição de fungos endofíticos associados ao algodoeiro transgênico (Bt) em comparação ao não-transgênico (não-Bt). Desse modo, coletas foram realizadas nos estádios de desenvolvimento da planta. Em cada coleta foram selecionadas amostras de folhas, caules, raízes, flores e sementes de algodoeiro Bt e não-Bt, cultivados simultaneamente. Foram isolados 23 taxa de fungos endofíticos pertencentes aos grupos Zygomycota, Ascomycota, Coelomycetes, Hyphomycetes e Blastomycetes. E 17 gêneros foram encontrados: Acremonium, Cladosporium, Colletotrichum, Curvularia, Fusarium, Glomerella, Guignardia, Lecanicillium, igrospora, Pestalotiopsis, Phoma, Phomopsis, Rhizopus, Rhodotorula, Talaromyces, Tritirachium e Xylaria. As espécies mais frequentes de fungos de acordo com o órgão vegetal foram Phomopsis archeri em folhas e caules, Phoma destructiva em raízes, igrospora sphaerica em flores e Curvularia lunata var. aeria em sementes. A abundância e diversidade de fungos endofíticos associados ao algodoeiro Bt e ao não-Bt aumentam com o envelhecimento da planta, porém não houve diferença significativa entre a composição de fungos endofíticos associados aos dois tipos de algodoeiro, indicando que a expressão da proteína Cry1Ac não afeta a capacidade do algodoeiro em alocar os fungos endofíticos e que os efeitos detectados relacionados à composição da comunidade fúngica estão associados à idade e órgão da planta. A ocorrência de fungos endofíticos em sementes de algodoeiro sugere que há transmissão vertical desses microrganismos entre as plantas de uma geração para a outra. Dos fungos endofíticos obtidos, quarenta isolados foram avaliados quanto à produção qualitativa das enzimas hidrolíticas extracelulares lipase, protease e amilase. E o melhor resultado foi apresentado por isolados de Cladosporium cladosporioides obtidos de raiz de algodoeiro Bt e do não-Bt, que apresentaram um índice enzimático alto para duas das três enzimas testadas, sendo um microrganismo promissor a ser usado em diferentes setores da indústria biotecnológica

Made available in DSpace on 2018-08-01T21:35:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_12084_Dissertação_Diego Prado Ventorim.pdf: 2553859 bytes, checksum: 18056a943ffcba4f96c37b60d75fed08 (MD5) Previous issue date: 2018-03-05 / A febre chikungunya é uma arbovirose altamente debilitante, causada pelo vírus chikungunya, o qual é transmitido pela picada de mosquitos do gênero Aedes. Em 2014 foram registrados os primeiros casos da doença no Brasil, sendo constatada a presença dos genótipos asiático e Leste/Centro/Sul africano do vírus. No final de 2015, pela primeira vez, foram reportados casos no Espírito Santo (ES) e entre 2016-2017 o estado enfrentou um surto da doença. Diante disso, nós, juntamente à Secretaria Estadual de Saúde/ES e ao Laboratório Central/ES objetivamos identificar qual linhagem do vírus circula no ES; analisar características genéticas virais nas amostras estudadas e levantar dados epidemiológicos sobre a doença no estado. As amostras do estudo foram provenientes do Laboratório Central/ES e referentes ao período de março/2016 - dezembro/2017. O diagnóstico viral foi realizado por sorologia ou por técnicas moleculares. Vinte e sete amostras (diagnosticadas molecularmente) foram utilizadas na amplificação parcial e sequenciamento de dois genes codificantes de proteínas do envelope viral, E1 e E2. Seis dessas amostras foram utilizadas nas análises filogenéticas. Os resultados epidemiológicos demonstraram que no período do estudo foram reportados 2.021 casos suspeitos da febre chikungunya, sendo 412 (20,38%) confirmados. Além disso, a distribuição geográfica desses casos constatou que Vitória e Vila Velha representaram mais de 50% de todos os casos do estado. Os achados mostraram que a frequência da infecção pelo vírus chikungunya, em relação ao número de amostras referenciadas ao Laboratório Central/ES, pode ser considerada baixa. No entanto, constatou-se que a doença apresenta relevância epidemiológica e grande distribuição no estado. Os resultados filogenéticos evidenciaram que o vírus circulante pertence à linhagem Leste/Centro/Sul africana, a qual também foi constatada em diversos surtos na Europa, África e Ásia. Além disso, a caracterização molecular dos fragmentos das proteínas E1 e E2 não mostraram a presença das mutações adaptativas E1-K211E; E1-A226V; E2-L210Q e E2-I211T. Esse resultado permite sugerir que o vírus circulante no ES apresenta um potencial de disseminação menor em comparação aos vírus circulantes em grandes epidemias mundiais recentes. Devido à falta de uma vacina e à dificuldade no controle populacional do mosquito vetor, estudos sobre a diversidade genética como este tornam-se alternativas viáveis em busca de melhor entendimento e controle da febre chikungunya no Brasil e, especificamente, no ES.

Orientador: Ladaslav Sodek / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-21T00:59:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sawazaki_HaikoEnok_D.pdf: 11307939 bytes, checksum: f7d33caedc7a92c8cac710c0e2d968ac (MD5) Previous issue date: 1995 / Resumo: Estudou-se, mediante polimorfismo enzimático em gel de poliacrilamida e polimorfismo de DNA baseado na amplificação de segmentos de DNA ao acaso denominado RAPD, a variabilidade genética em citros, palmeiras e couve. Em citros, as espécies e cultivares de laranja doce Hamlim, Natal, Valência, Pêra, Baianinha (C. sinensis); laranja azeda (C. aurantim); tangerinas clementina, sunki, cleópatra e poncã (C. Clementina, sunki, reshni, reticulata); lima da pérsia (C. limettioides); limão galego (C. aurantifolia); limão-cravo (C. limonia) e trifoliata (Poncirus trifoliata). Em palmeiras, as espécies e ecótipos de açaí (E. oleracea) itajobi, pariquera, danilo; juçara (Euterpe edulis); euterpe Tadeu; híbrido açaí x juçara; pupunhas yurimaguas, benjamim Constant, branca uma, t2s1, EEU, ceplac 10, Walter (Bactris gasipae); dendê hermes (Elaeis guineensis); gariroba (Syagrus oleraceae).Em couve as variedades de couve manteiga ribeirão pires 2620; 1811; roxa; são roque; gigante 915; 916; crespa piracicaba; ribeirão pires 2446, crespa capão bonito; tupi; jundiaí; Mococa; são josé; roxa monte alegre; verde escura. Os extratos de folhas foram analisados para as isoenzimas de malato desidrogenase (MDH), enzima málica (ME), leucinoaminopeptidase (LAP), glutamato oxaloacetato transaminase (GOT), fosfoglucoisomerase (PGI), fosfoglucomutase (PGM), isocitrato desidrogenase (IDH), peroxidase (PRX), esterase (EST), e para os marcadores RAPD utilizando os quarenta primers do kit A e B da Operon Technologies. Verificou-se grande variabilidade genética interespecífica, comprovada pelos dendrogramas UPGMA, para citros, e palmeiras couve, com reconhecimento de híbridos nas palmeiras, porém nenhum polimorfismo entre os cultivares de laranjas doces. Foram observadas bandas além das referidas pela literatura em gel de amido. As relações filogenéticas entre as espécies e cultivares ficaram de acordo com a literatura existente. Foi comprovada a maior eficácia dos marcadores RAPD em relação aos de isoenzimas ,pois possibilita facilmente a análise de grande número de marcadores genéticos, de especial interesse nos casos em que as isoenzimas não expressam interesse nos polimorfismo / Abstract: Genetic diversity was studied by means of polymorphism using polyacrilamide gel electrophoresis a DNA polymorphism assay based on the amplification of random DNA segments denominated RAPD, for citrus, palm and cabbage plants. The following citrus species were analyzed: sweet orange (C.sinensis), Hamlin, Natal, Valencia, Pera and Baianinha; clementine, sunki, cleopatra and mandarin tangerines (C. clementina, C .sunki, C .cleopatra, C. reticulata); Palestine lime (C. limettioides); West Indian lime (C.aurantifolia); Rangpur lime (C.limonia) ; Sour orange (c. aurantium) ; citron (C. medica) and Poncirus trifoliata. For palms species the following were studied: Euterpe oleracea varieties, , açaí, açaí itajobi, pariquera, danilo; Euterpe edulis varieties, juçara; euterpe tadeu; hybrids from E. edulis x E.oleracea; Syagrus oleracea var gariroba; Elaeis guineensis var dendê hermes; Bactris gasipae, varieties E.E.U., t2s1, branca una, uurimaguas, ceplac 10, benjamim contant and walter. For cabbage, fifteen varieties of Campinas Agronomic Institute were studied. Citrus, palm and cabbage leaf extracts were analysed for isozymes of malate dehydrogenase (MDH) , malic enzyme (ME) , leucine aminopeptidase (LAP), glutamate oxaloacetate transaminase isomerase (GOT), phosphoglucose isomerase (PGI), phosphoglucose mutase (PGM), isocitrate dehydrogenase (IDH) , peroxidase (PRX) and esterase (EST). Polymorphism was also investigated by the RAPD technique using forty primers obtained from Operon Technologies. Interespecific differences were observed in citrus, palms and cabbage as well as distinctive patterns for palm hybrids; on the other hand, no variation between intraespecific C. sinensis cultivars was observed. Some bands were observed in addition to those cited in the literature where starch gel electroporesis was used for enzymatic polymorphism. The conclusions with regard to polymorphic patterns obtained using the RAPD technique confirmed those observed with isozymes, with the advantages of its greater efficiency and ability to process a large number of samples / Doutorado / Doutor em Ciências Biológicas

Orientador: Fernando Roberto Martins / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-29T02:23:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CieloFilho_Roque_M.pdf: 6122103 bytes, checksum: 1573cc8dbfc52ac97e609a5aba53c0eb (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo: Em um trecho da Floresta Estacional Semidecídua (Mata Ribeirão Cachoeira, Campinas SP), foram detenninadas a precisão e suficiência amostral da estimativa dos parâmetros fitossociológicos usuais e identificados os fatores que influenciam na precisão. As implicações do erro amostral na análise visual do rol de abundância foram discutidas. As distribuições de abundância desta, e de outras 5 comunidades arbóreas tropicais, foram testadas contra as distribuições geradas por quatro modelos matemáticos: série geométrica, série logarítmica, nonnal logarítrnico e vara quebrada ("broken stick"). O objetivo foi avaliar as relações estabelecidas empiricamente entre esses modelos com equilíbrio e riqueza elevada (nonnal logaritmico), estresse, perturbação e baixa riqueza (série logaritrnica e série geométrica) e a inadequação do modelo da vara quebrada para vegetação. Outras características comunitárias (concentração de dominância e equabilidade), também foram avaliadas neste sentido. Em uma área de 6,474 ha na Mata Ribeirão Cachoeira, foram instaladas, aleatoriamente, 100 parcelas de 10 x 10m, e estimados os parâmetros de densidade, dominância, freqüência e IVI das espécies arbóreas (critério de inclusão de 5 cm de diâmetro à altura do peito). Para as espécies com cinco ou mais indivíduos, foi calculado o erro amostral dessas estimativas e o número de parcelas necessárias para não ultrapassar um erro amostral de 20%. A avaliação das relações entre os modelos de distribuição de abundância, concentração de dominância e equabilidade com riqueza, estresse e perturbação levou em consideração dados de abundância de quatro levantamentos de Florestas Estacionais Semidecíduas (duas em bom estado de conservação e duas perturbadas por fogo), e duas Florestas Higrófilas (estresse anaeróbico), todas de uma mesma região. A freqüência é o descritor que apresentou a maior precisão, enquanto a menor precisão coube à dominância. A precisão das estimativas da densidade, freqüência e dominância é influenciada pelo número de indivíduos amostrados e padrão espacial das espécies; a da dominância é influenciada, adicionalmente, pela variação da área basal entre indivíduos; e a do M, por todos esses fatores combinados. Com base na literatura e dados apresentados sugere-se um esforço amostral mínimo de 110 parcelas de 10 x 10m para estimativa de parâmetros fitossociológicos em Florestas Estacionais Semidecíduas. Com exceção de Esenbeckia leiocmpa não foi possível diferenciar as posições das espécies no rol de abundância, o que invalida as comparações entre esta e outras comunidades com base na posição ocupada pelas espécies no rol, ou entre espécies dentro da comunidade. Os modelos de distribuição de abundância não apresentaram relações consistentes com riqueza, perturbação ou estresse, enquanto a concentração de dominância foi maior nas comunidades submetidas a estresse e perturbação. O modelo da vara quebrada não ajustou para nenhuma comunidade. Nossos resultados sugerem que estes modelos de distribuição de abundância não são apropriados, ou pelo menos não são as melhores ferramentas, para detectar padrões relacionados à riqueza, estresse ou perturbação em comunidades arbóreas tropicais / Abstract: In a stand ofthe Semi-deciduous Forest (Mata Ribeirão Cachoeira, Campinas - SP), the precision, the sampling suíficiency and the factors that influence the precision ofthe estimate of the usual phytosocioIogical parameters were investigated. The implications of the sampling error to the visual analysis of the abundance rank were discussed. The abundance distributions of this, and of other five tropical arboreal communities, were tested against the distributions generated by four mathematical models: geometric, log-series, lognormal and broken stick. The objective was to evaIuate the relationships established empirically among those models with equilibrium and high richness (lognormal), stress, disturbance and low richness (logseries and geometric) and the inadequacy of the broken stick mo deI for vegetation. Other community characteristics (dominance concentration and evenness), were also evaluated in this sense. In an area of6,474 ha of the Mata Ribeirão Cachoeira, one-hundred 10 x 10m plots were randornIy located. The density, dominance, frequency and M parameters were estimated for the arboreal species (trees PBH _ 15 cm) and, for those with five or more individuaIs, the sampling error of those estimates and the number of plots necessary for not exceed a sampling error of 20% were calculated. The evaluation of the relationships among the rnodels of abundance distribution, dominance concentration and evenness with richness, stress and disturbance took into consideration data of abundance of four surveys in Semi-deciduous Forests (two in good conservation state and two disturbed by fire), and two Hygrophyllous Forests (anaerobic stress), all in the same region. Frequency is the parameter that presented the largest precision, while the smallest precision was that of the dorninance. The estimate' s precision of the density, frequency and dominance is influenced by the number of sampled individuaIs and spatial partem of the species; the one of the dominance is influenced, additionally, by the variation of the basal area among individuaIs; and the one ofIVI, for all those combined factors. A number of 110 sample units of 1 O x 10m seems a good general recommendation for phytosocio1ogical surveys ofthe Semi-deciduous Forest. Except for Esenbeckia leiocarpa it is not possib1e to differentiate the positions of the species in the abundance rank, what invalidates the comparisons among these and other communities based in the position occupied by the species in the rank, or among species into the community. The mode1s of abundance distribution did not present consistent re1ationships with richness, disturbance or stress, while the dominance concentration was 1arger in communities submitted to stress or disturbance. The broken stick model did not fitted for any community. Our resu1ts suggest that these mode1s of abundance distribution are not appropriate, or at least not the best too1s, for detection of pattems related to richness, stress or disturbance in tropical tree communities / Mestrado / Mestre em Biologia Vegetal