Widespread, high levels of tree mortality, termed forest die-off, associated with drought and rising temperatures, are disrupting forests worldwide. Drought will likely become more frequent with climate change, but even without more frequent drought, higher temperatures can exacerbate tree water stress. The temperature sensitivity of drought-induced mortality of tree species has been evaluated experimentally for only single-step changes in temperature (ambient compared to ambient + increase) rather than as a response surface (multiple levels of temperature increase), which constrains our ability to relate changes in the driver with the biological response. Here we show that time-to-mortality during drought for seedlings of two western United States tree species, Pinus edulis (Engelm.) and Pinus ponderosa (Douglas ex C. Lawson), declined in continuous proportion with increasing temperature spanning a 7.7 degrees C increase. Although P. edulis outlived P. ponderosa at all temperatures, both species had similar relative declines in time-to-mortality as temperature increased (5.2% per degrees C for P. edulis; 5.8% per. C for P. ponderosa). When combined with the non-linear frequency distribution of drought duration-many more short droughts than long droughts-these findings point to a progressive increase in mortality events with global change due to warming alone and independent of additional changes in future drought frequency distributions. As such, dire future forest recruitment patterns are projected assuming the calculated 7-9 seedling mortality events per species by 2100 under business-as-usual warming occur, congruent with additional vulnerability predicted for adult trees from stressors like pathogens and pests. Our progressive projection for increased mortality events was driven primarily by the non-linear shape of the drought duration frequency distribution, a common climate feature of drought-affected regions. These results illustrate profound benefits for reducing emissions of carbon to the atmosphere from anthropogenic sources and slowing warming as rapidly as possible to maximize forest persistence.

Mollusks growth is a very important and sensitive response to environmental stresses sincethey are good indicators of the available amount of contaminants in the water; reduced growth represents adverse environmental effects and possible effects on the population.Sweden has about 3,000 Natural Reserves and 28 National Parks. Kosterhavets is the first National Marine Park and it is located on the west coast of Sweden, it is also considered one of the most vulnerable areas since 6000 marine species can be found here and about200 are found nowhere else. It is not only a touristic destination; it is also a home and a work place to many people. The type of pollutants and environmental impacts that areproduced by recreation activities on marinas on such park depend very much on the amount of boats. Mytilus edulis has been widely used to monitor the biological effects of contamination by different ways, such as chemical analysis and biological responses. Themain goal of this project was to assess the status of three different marinas with high and low boat traffic and use the shell length of the blue mussel M. edulis as a potential bioindicator to detect effects from boating activities pressures. The main findings arising from this study are that the sizes of the mussels from the three areas with high boat traffic are significantly smaller than the area with little boat traffic. / <p>www.ima.kth.se</p>

京都大学 / 新制・課程博士 / 博士(農学) / 甲第23950号 / 農博第2499号 / 新制||農||1091(附属図書館) / 学位論文||R4||N5385(農学部図書室) / 京都大学大学院農学研究科森林科学専攻 / (主査)准教授 岡田 直紀, 教授 井鷺 裕司, 教授 柴田 昌三 / 学位規則第4条第1項該当 / Doctor of Agricultural Science / Kyoto University / DFAM

A Euterpe edulis (palmeira juçara) é uma espécie de alta densidade na Floresta Atlântica e sofre processo de extinção devido ao desmatamento e ao corte ilegal para a extração do palmito. Uma alternativa para conservação é o manejo sustentável, utilizando seus frutos para a produção de polpa. O objetivo do trabalho é fornecer subsídios de mensuração para um sistema de manejo, visando à produção de frutos e polpa, através de modelos preditivos e, avaliação da estrutura, dinâmica e a regeneração natural das palmeiras. O levantamento foi realizado no Sertão do Ubatumirim, Ubatuba-SP, em uma área de bananal e uma de floresta secundária, durante 2011 e 2012. Para a construção dos modelos, foram selecionadas matrizes produtoras acompanhadas durante o período de frutificação. Foram coletadas medidas dendrométricas e os frutos maduros foram colhidos, pesados, despolpados e analisada sua massa seca. Foi avaliada qualitativamente a luminosidade recebida pelas matrizes. Foram ajustados e selecionados modelos para a predição da biomassa dos frutos e polpa seca. As variáveis preditoras foram: DAP, altura, e as indicadoras: área, ano e luz, com efeito simples e de interação. As variáveis resposta foram modeladas por regressão linear, com e sem transformação logarítmica. Os critérios de seleção dos modelos foram o coeficiente de determinação ajustado e o valor do Critério de Informação de Akaike (AIC). Para o levantamento das populações, em cada área foram locadas dez parcelas circulares, com 14m de raio, sendo mensuradas e identificadas as espécies arbóreas com DAP >= 5cm. Dentro das parcelas instituiu-se subparcelas para a amostragem da regeneração natural da juçara; com raio de 4,5m para os estádios de desenvolvimento das varas e arvoretas e raio de 3m para plântulas e mudas. Foi estimada a taxa de mortalidade de toda população e das palmeiras adultas. De cada estádio estimou-se os indivíduos por hectare e taxa de mudança anual. A regeneração encontrada foi comparada com uma estrutura padrão, sem ações antrópicas. Foi estimada a biomassa de frutos e de polpa da juçara nas áreas estudadas através de modelos lineares. Os modelos com transformação logarítmica apresentaram bons ajustes sendo os mais adequados os que utilizaram a combinação da variável indicadora altura ou variável combinada (diâmetro ao quadrado vezes altura). Os resultados mostraram efeito de interação da variável combinada e variável ano, o que indicou efeito nulo no ano de alta produtividade. Independente do tamanho das palmeiras, a produção foi igual, e efeito positivo crescente no ano de baixa produtividade. Os levantamentos mostraram que a área de formação secundária possui maior riqueza de espécies que a do bananal, com uma área basal duas vezes maior e menor taxa de mortalidade. Em ambas as áreas, os estádios plântulas e regeneração não se assemelham à população padrão, resultados estes mais drásticos na área do bananal. Isto pode levar à redução da população, com risco de desaparecimento. Na estimativa produtiva dos frutos por matriz, verificou-se o aumento entre os anos de produção. Quando se considera a produção por hectare, ocorre diminuição da produção na área do bananal devido a elevada mortalidade. / Euterpe edulis (juçara palm) occurs in hight density populations in the Atlantic Forest, but due the illegal exploration of its heart palm is a extinction threaten species. An alternative for its conservation is the sustainable management of its populations for fruit production. This study aims to provide measurement and biometric information for the development of a sustainable management system for fruit harvest. Prediction models for fruit and fruit pulp production were developed and the structure and natural regeneration of two populations were studied. The study was carry out in \"Sertão do Ubatumirim\", Ubatuba, in the state of São Paulo, where a banana plantation and a secondary forest were surveyed in the years 2011 and 2012. In order to develop the fruit prediction models, producing fruit palm trees were monitored throughout the period of fructification. Height and diameter measurements were taken in these trees and the ripe fruits were harvested, weighted, pulped and the fruit pulp dry weight was determined. The light intensity received by each tree was qualitatively determined by a ordinal scale with 5 levels. Prediction models for fruit biomass and fruit pulp dry weight were fitted by linear regression. Prediction quantitative variables were diameter (DBH) and height, while prediction qualitative variables, add to the model as indicator variables, were: forest type (banana plantation and secondary forest), harvest year (2011 and 2012) and light intensity. The criteria for selection of the models were adjusted coefficient of determination and the value of the Akaike Information Criteria (AIC). For the population surveys, circular plots of 14m radius were located in the study area, and all trees with DBH equal or greater than 5cm were measured and had its species identified. For the survey of juçara natural regeneration, circular subplots of 4.5m radius, concentric to adult tree plots, were established to enumerate small trees and saplings, and circular subplots of 3m radius were established to enumerate seedlings and small seedlings. Mortality rate was estimated of the entire population and adult juçara palms. For each plant development stage (tree, small tree, sapling, seedling and small seedling), the number of individuals and the annual change rate were also estimated. Best prediction models for individual palm tree fruit and fruit pulp production were logarithmic models, and prediction variable was tree height, followed by the combined variable (squared diameter times height). There was a clear interaction effect of the quantitative prediction variable (combined variable) and the qualitative prediction variable year, as indicator variable. In the hight production year, the quantitative prediction variable was not relevant for fruit and fruit pulp prediction, while in the low production year, there was a positive relationship between production and the quantitative prediction variable. Study sites were very different in forest structure and dynamics. As expected, the secondary forest site had higher species richness than the banana plantation site, as well lower mortality rate and twice its basal area. Compared to what is expected to sustainable juçara populations without human influence, both sites showed lower number of regenerating individuals (seedlings and small seedlings). Over the years, this fact, combined to the harvest of fruits for fruit pulp production, can represent risk to the sustainability of juçara populations in the study sites.

O Brasil é o maior produtor mundial de maracujá azedo (Passiflora edulis f. flavicarpa) sendo esta a espécie de maior expressão comercial dentre as passifloras cultivadas. A bacteriose do maracujazeiro, causada por Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae (Xap), é uma das doenças mais severas da cultura, acarretando grandes prejuízos aos produtores. Atualmente, é incipiente o conhecimento sobre a interação maracujá azedo-Xap. Diante disso, a identificação e a caracterização dos genes envolvidos no processo de defesa são passos importantes para dar suporte ao desenvolvimento de variedades resistentes. Assim, o objetivo deste trabalho foi identificar e caracterizar genes de maracujá azedo diferencialmente expressos durante a resposta de defesa à Xap, bem como mensurar a sua expressão. Para isso, foram construídas duas bibliotecas subtrativas de cDNA (forward e reverse) usando o método SSH a partir de transcritos de folhas, que foram inoculadas com o patógeno ou solução salina (controle). Após o sequenciamento dos clones, o processamento e a montagem das sequências, as unisequências foram anotadas através da Plataforma PLAZA e do programa computacional Blast2GO. Genes envolvidos em diversos processos biológicos foram selecionados para a validação das bibliotecas por PCR quantitativo. Usando a Plataforma PLAZA, 78 % (764) das unisequências mostraram similaridade com proteínas de Arabidopsis thaliana, enquanto 87 % (866) delas apresentaram similaridade com proteínas putativas de diversas espécies vegetais, quando se utilizou Blast2GO. Na biblioteca forward, foram identificadas 73 proteínas relacionadas à resposta de defesa, dentre as quais estão proteínas envolvidas na sinalização intracelular, na ativação da transcrição e regulação da expressão de genes de defesa, bem como proteínas de defesa, de resistência e relacionadas à patogênese (PRs). Dentre os 22 transcritos validados, 95 % foram diferencialmente expressos em pelo menos um dos três períodos avaliados; os genes mais expressos em resposta à infecção pelo patógeno são os que codificam as enzimas lipoxigenase, (+)-neomentol desidrogenase e quitinase, as quais participam diretamente nas respostas de defesa vegetal. Dos genes cuja expressão foi mais reprimida, dois codificam proteínas relacionadas à fotossíntese e dois codificam proteínas envolvidas na detoxificação da amônia e do H2O2. Nossos resultados sugerem que a planta utiliza um arsenal de transcritos para responder à infecção; entretanto, este arsenal não é eficiente para impedir a ação do patógeno e, consequentemente, o desenvolvimento da bacteriose nas condições estudadas. Nosso estudo é inédito e gerou informações sobre a reprogramação transcricional durante a interação maracujá azedo-Xap, o que constitui um importante passo para o melhor entendimento sobre este patossistema. / Brazil is the main producer of yellow passion fruit (Passiflora edulis f. flavicarpa) worldwide, which is the most widely commercialized crop among the cultivated passifloras. The bacterial leaf spot induced by Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae (Xap) is one of the most severe diseases of the crop, causing great losses to producers. Currently, we understand very little about the yellow passion fruit-Xap interaction. Therefore, the identification and characterization of genes involved in the defense process are important steps to support the development of resistant varieties. Thus, the objective of this study was identify and characterize differentially expressed genes during the defense response to Xap, as well as to measure their expression. For that, we constructed two subtractive cDNA libraries (the forward and the reverse) by performing the SSH method from leaf transcripts, which were inoculated with the pathogen or saline solution (control). After sequencing the clones and sequence data processing, sequences were assembled into unique sequences, which were annotated using the PLAZA Platform and the computational program Blast2GO. Genes involved in several biological processes were selected to validate the libraries by quantitative PCR. When PLAZA was used for sequence similarity searches, 78 % (764) of the yellow passion fruit unique sequences showed similarity to proteins of Arabidopsis thaliana; when Blast2GO was used, 87 % (866) of the unique sequences showed similarities to putative proteins of several plant species. For the forward library, 73 proteins related to defense response were identified, such as those involved in intracellular signaling, transcription activation and regulation of defense gene expression, as well as defense and resistance proteins, and pathogenesis-related proteins (PRs). Of the 22 validated transcripts, 95 % were differentially expressed during at least one of the three periods evaluated; the genes up-regulated in response to the pathogen infection were those that code for the enzymes lipoxygenase, (+)-neomenthol dehydrogenase and chitinase, which participate directly in plant-defense responses. Out of down-regulated genes, two code for photosynthesis-related proteins, and two for ammonia and H2O2 detoxification. Our results suggest the plant uses an arsenal of transcripts to respond to infection; however, this arsenal is not effective to prevent pathogen action and consequently the occurrence of bacterial leaf spot under the evaluated conditions. The present study is the first to produce information on the transcriptional reprogramming during the passion fruit-Xap interaction, which represents an important step for a better understanding of this pathosystem.

A pele é exposta a inúmeros agentes, dentre os quais destaca-se a radiação ultravioleta (RUV), que pode energizar os cromóforos celulares da pele e estes reagindo com o oxigênio molecular podem resultar na geração das espécies reativas de oxigênio (EROs). Nestas circunstâncias, mesmo possuindo um sistema de defesa antioxidante, a concentração de radicais livres pode aumentar, rompendo o equilíbrio pró oxidante/antioxidante, levando ao estresse oxidativo na pele. Neste contexto, o uso tópico de formulações adicionadas de substâncias naturais tem sido um eficiente modo para enriquecer o sistema protetor cutâneo endógeno, reduzindo os danos oxidativos causados pela RUV na pele. Sendo assim, o presente trabalho teve como objetivo estudar o potencial fotoquimioprotetor do extrato e da fração de média polaridade de Inga edulis e desenvolver formulações estáveis física e quimicamente a fim de selecionar a que prover melhor liberação, penetração e retenção dos componentes do extrato e/ou da fração na epiderme viável. A partir do perfil cromatográfico foi possível observar que o extrato possui compostos comuns à fração e alguns deles foram identificados, sendo o composto vicenina-2 o escolhido para ser monitorado nos estudos de penetração e retenção cutânea. Dentre as formulações estudadas a formulação a base de Hostacerin SAF® adicionada da fração foi a que proveu a maior penetração/retenção do composto vicenina-2 e de compostos antioxidantes na epiderme viável e também foi considerada estável por todos os parâmetros avaliados no estudo de estabilidade preliminar. A fração de Inga edulis, veiculada por esta formulação, mostrou alta atividade antioxidante frente aos métodos estudados, apresentou baixa citotoxidade em cultura celular de fibroblastos, sendo a quantidade citotóxica estabelecida muito acima da quantidade de vicenina-2 retida na epiderme viável. A fração também apresentou fotoestabilidade frente a altas doses de radiação UVA e UVB quanto à citotoxidade, capacidade de reduzir o radical sintético DPPH? e de sequestrar o ânion superóxido in vitro. Assim, a formulação gel-creme com Hostacerin SAF® adicionada de 1% da fração de média polaridade do Inga edulis mostrou ser muito promissora e deve ser melhor estudada, visando futura aplicação como formulação fotoquimiopreventiva. / The skin is exposed to numerous agents, among which stands out the ultraviolet radiation (UVR) that can energize the chromophores of cell skin and these react with molecular oxygen resulting in the generation of reactive oxygen species (ROS). In these circumstances, the endogenous antioxidant defense system would be impaired leading to a pro oxidant state named oxidative stress. In this context, the topical formulations added with natural substances has been an efficient way to aid endogenous skin protective system, minimizing the oxidative damage caused by UV rays. Thus, the aim of the present work was to study the potential photochemopreventive activity of the extract and medium polarity fraction of Inga edulis and develop formulations physically and chemically stable in order to select the penetration and retention of the components of the extract and / or fraction oin the viable epidermis. The chromatographic profiles showed that the some compounds of the extract are also present in the fraction and some of them were identified. The compound vicenin-2 was chosen to be monitored in studies of cutaneous penetration and retention. Among the formulations studied, the formulation Hostacerin SAF® added to the fraction provided the highest penetration / retention of the compound vicenin-2 and antioxidant compounds in viable epidermis and also was considered stable at all parameters evaluated in the study of preliminary stability. The fraction of Inga edulis, conveyed by this formulation, showed strong antioxidant activity in the methods studied and showed low cytotoxicity in cell culture of fibroblasts. The cytotoxicity concentration was greater than the amount of vicenin-2 retained in viable epidermis. The fraction also showed photostability when it was exposed to high doses of UVA and UVB. The irradiated fraction showed no change in cytotoxicity and antioxidant activity. Thus, the formulation Hostacerin SAF® added with 1% of medium polarity fraction of Inga edulis proved very promising and should be further studied for a future application in photochemoprevention.

Atualmente tem-se dado grande ênfase aos alimentos funcionais, pois atuam na prevenção e auxiliam na recuperação de várias doenças, como doenças inflamatórias crônicas, cardiovasculares e câncer, por apresentarem principalmente flavonoides, que previnem lesões oxidativas, propiciando benefícios à saúde. O Brasil é o maior produtor mundial do maracujá, e em vista disto é de suma importância o desenvolvimento de métodos analíticos e estudos de atividade antioxidante e anti-inflamatória do fruto de maracujá, visando sua possível utilização como alimento funcional e produção de possíveis fármacos. Passiflora edulis Sims. f. flavicarpa Degener, conhecida como maracujá azedo ou amarelo é a espécie mais cultivada e comercializada no Brasil. Desta forma, os objetivos deste trabalho foram: desenvolver e validar um método analítico por CLAE-UV/DAD (cromatografia líquida de alta eficiência acoplada detector de arranjo de fotodiodos) para quantificação da flavona isoorientina, presente na polpa de P. edulis; quantificação dos flavonoides totais desta espécie, usando um padrão de baixo custo (rutina); comparar as técnicas CLAE e CCDAE (cromatografia em camada delgada de alta eficiência) e analisar a isoorientina nas cascas dos frutos de P. edulis infectada com o vírus PWV e cascas sadias por CCDAE; quantificar as proteínas totais e avaliar as atividades antioxidantes e anti-inflamatória dos extratos de cascas de P. edulis e da polpa dos frutos de P. edulis e P. alata, empregando-se o método do DPPH&bull;, e os ensaios de QLluc (quimioluminescencia dependente de lucigenina), ELISA (Enzyme Linked Immunosorbent Assay), e SIEFED (Specific Immunologic Extraction Followed by Enzymatic Detection). Os resultados mostraram que o método desenvolvido por CLAE-UV/DAD foi adequado e eficiente para quantificação de isoorientina e de flavonoides totais na polpa de P. edulis, apresentando especificidade, linearidade, exatidão, precisão, dentro das faixas internacionalmente aceitas. Além disso, este método foi aplicado com sucesso nas análises de flavonoides em cascas de P. edulis e polpa de P. alata. O trabalho mostrou as vantagens da utilização da técnica CCDAE, como a realização de análises mais rápida e econômica, com baixo consumo de solvente e resíduos gerados frente à CLAE-UV/DAD. Por meio da técnica CL-EM/EM (cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massas em tandem) foi possível identificar as flavonas isoorientina e isovitexina na polpa de P. edulis. Os extratos de cascas de P. edulis apresentaram maior capacidade redutora de radicais (método do DPPH&bull;), seguido das polpas de P. edulis e P. alata, respectivamente. Os extratos de cascas também mostraram maior inibição da produção de EROs (espécies reativas de oxigênio) pelos neutrófilos ativados e da atividade da MPO (mieloperoxidase) isolada, porém verificou-se que todos os extratos testados não modificaram a desgranulação dos neutrófilos, não influenciando a liberação de MPO no plasma. Assim, concluiu-se que a atividade antioxidante pode estar diretamente relacionada com a concentração de isoorientina presente nos extratos. A grande quantidade de proteínas e isoorientina encontrada nas cascas de P. edulis, se comparada à polpa de P. edulis, aliada à elevada atividade antioxidante e anti-inflamatória, sugere o potencial das cascas de P. edulis como um alimento funcional, ou como possível fonte de flavonoides naturais para a produção de fármacos, sugerindo assim o aproveitamento deste grande resíduo industrial. / Functional foods have been the focus of many studies nowadays, because they act preventing and assisting in the recovery of several diseases, such as chronic inflammatory, cardiovascular and cancer, due to they have mainly flavonoids, which prevent oxidative damage, providing health benefits. Brazil is the largest producer of passion fruit; therefore, it is very important to develop analytical methods and studies of antioxidant and anti-inflammatory activities of passion fruit, intending to its use as a functional food and in the development of drugs. Passiflora edulis Sims. f. flavicarpa Degener, known as yellow passion fruit, is the most cultivated and marketed species in Brazil. Therefore, the objectives were: to develop and validate an analytical method by HPLC-UV/DAD (high-performance liquid chromatography with photo-diode array detection) for quantification of isoorientin present in the pulp of P. edulis and quantification of total flavonoids of this specie, using a low-cost standard (rutin); to compare HPLC and HPTLC (high-performance thin layer chromatographic) techniques and to analyze isoorientin in the peels of P. edulis fruits infected by PWV virus and healthy peels by HPTLC; to quantify the proteins and to evaluate the antioxidant and anti-inflammatory activities of the extracts of P. edulis peels and P. edulis and P. alata pulp, using the method of DPPH&bull;, QLluc (chemiluminescence dependent of lucigenin), ELISA (enzyme linked immunosorbent assay), and SIEFED (specific immunologic extraction followed by enzymatic detection). The results showed that the HPLC-UV/DAD method was suitable and efficient for isoorientin quantification and total flavonoids in the P. edulis pulp, with specificity, linearity, accuracy, precision, within internationally acceptable limits. Moreover, this method was successfully applied to the analysis of flavonoids in the P. edulis peels and P. alata pulp. The study presented the advantages of using the HPTLC technique such as to perform faster and cheaper analysis, with low solvent consumption and waste generated compared to HPLC-UV/DAD. Using LC-MS/MS technique (liquid chromatography with tandem mass spectrometry detection) the flavones isoorientin and isovitexin were identified in the pulp of P. edulis. The extracts of peels of P. edulis showed the higher radical scavenging ability (DPPH&bull; method), followed by P. edulis and P. alata pulps, respectively. The peels extracts also showed greater inhibition of ROS (reactive oxygen species) production by neutrophils activated and isolated MPO activity, but it was found that the extracts did not alter the neutrophils degranulation and does not influence the MPO release in the plasma. Therefore, it was concluded that the antioxidant activity might be directly related to the concentration of isoorientin present in the extracts. The high amount of protein and isoorientin found in the P. edulis fruit peels, compared with P. edulis pulp, and the high antioxidant and anti-inflammatory activities, suggests the potential of the P. edulis fruit peels as functional food or a possible source of natural flavonoids for drugs production, suggesting the use of this substantial industrial waste.

L’histoire de l’ostréiculture française met en évidence la fragilité de cette production face à la surexploitation des stocks et l’apparition de maladies. En particulier, la production d’huître plate, Ostrea edulis, a fortement diminué suite à l’apparition de deux maladies parasitaires dont la bonamiose. Les moyens de lutte contre la bonamiose sont relativement restreints. Ils sont essentiellement basés sur la surveillance de la santé des huîtres afin de limiter la dissémination et la propagation de la maladie. Cependant l’utilisation de modèles prédictifs de l’évolution de la maladie en zone infectée permettrait d’optimiser la gestion des stocks et minimiser l’impact des agents pathogènes. De plus, le développement d’animaux résistants à l’infection pourrait permettre de relancer cette production. Ces différentes approches nécessitent des outils diagnostiques adaptés, une bonne connaissance du cycle de vie de l’agent pathogène, et, plus particulièrement des interactions du parasite avec son hôte. Dans ce contexte, l’objectif principal du travail de thèse proposé est de comprendre les interactions entre l’huître plate Ostrea edulis et son parasite Bonamia ostreae, et, plus particulièrement les bases moléculaires de la résistance au parasite. Dans un premier temps, la réalisation d’une banque soustractive d’ADNc a permis d’identifier des ESTs différentiellement exprimées chez des hémocytes en réponse au parasite. L’expression de certains gènes dont une galectine a été mesurée en PCR en temps réel dans le contexte d’infections in vitro. En complément, la réponse cellulaire a été étudiée par cytométrie en flux et l’infection contrôlée en microscopie. Ces expériences ont montré une multiplication parasitaire dans les hémocytes au cours du temps associée à une diminution de la production d’EOR et d’estérases. Dans un second temps, il a été entrepris une étude comparative entre une population d’huîtres plates résistantes à la bonamiose et une population naturelle. Les résultats obtenus tendent à montrer qu’une modulation de l’apoptose et une diminution de la phagocytose seraient impliquées dans les mécanismes liés à la résistance à la bonamiose. Ce travail est le premier à étudier la réponse des hémocytes d’huîtres plates à une infection par le parasite Bonamia ostreae au niveau cellulaire et moléculaire. / The history of the French oyster production highlights the fragility of this production against overexploitation and disease outbreaks. In particular, the production of flat oyster, Ostrea edulis, has decreased following the emergence of two parasitic diseases including bonamiosis. The means to fight against bonamiosis are relatively limited. They are mainly based on oyster health surveillance to limit the spread of the disease. However, the use of predictive models of disease progression in infected area would help to improve stock management and minimize the impact pathogens. Moreover the development of resistant animals could help to revive this production. These different approaches require appropriate diagnostic tools, a good knowledge of the life cycle of the pathogen, and the interactions between the parasite and its host. In this context, the main objective of the phD work is to understand the interactions between the flat oyster Ostrea edulis and the parasite Bonamia ostreae, and particularly the molecular basis of the resistance to the parasite. In a first step, a subtractive cDNA bank allowed the identification of ESTs differentially expressed in haemocytes in response to the parasite. Expression of some genes, among which a galectin, was measured by Real Time PCR in the context of in vitro infections. In addition, the cellular response was investigated by flow cytometry and the infection was checked by microscopy. These experiments showed a multiplication of the parasite inside haemocytes associated with a decreased of esterases and of the production of ROS. In a second step, a comparative approach was carried out between a population of oysters resistant to bonamiosis and a natural population. Results suggest that modulation of apopotosis and decrease of phagocytosis could be involved in mechanisms related to resistance to bonamiosis. This work is the first study on the response of haemocytes of flat oysters to an infection with the parasite Bonamia ostreae at the cellular and molecular levels.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:40:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 372745 bytes, checksum: 6f1e60efc5a019ffb5aabeff2579b6ad (MD5) Previous issue date: 2007-07-13 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The objective of this work was to select superior genotypes of the yellow passion flower related to productivity and quality of the fruits. A population of 26 families of whole brothers was evaluated in the second year of production, in a design of random plots, with three repetitions, starting with four plants per plot. The experiment was carried out in the experimental area of Fruitculture in the Departamento de Fitotecnia of the Universidade Federal de Viçosa, in Viçosa, Minas Gerais State, Brazil. In the selection among and within the families, the efficiency of the direct and indirect selection as well as that based on the classical index was verified. The selection strategies among and within, combined, massal and stratified massal were compared. The results found by the selection among and within were compared with those obtained from the selection made in this same population in the first year of production. The characteristics measured were number of fruits per plant, estimated production per plant, length of the fruit, diameter of the fruit, weight of the fruit, weight of the peel, thickness of the peel, weight of the pulp, color of the pulp, percentage of the pulp, total content of soluble solids, titrable total acidity and the rate between the total soluble solids/titrable total acidity. Samples of 10 fruits of each plant were obtained to evaluate the qualitative characteristics of the fruits. The collection of the fruits for the analyses was made as they became yellowishgreen, during the second year of production, from January to July 2006. All the statistical analyses were made with the genetics and statistics software GENES. The selection gains were estimated based on a percentage of 24% among families and of 25% within families for all the characteristics measured. The selection criterium adopted for all the characteristics was the increase in peel their original mediuns, except for the weight and thickness of the peel for which a decrease was desired. For the characteristics choice that were part of the classic index of selection, the multicolinearity diagnosis was carried out, using the autovalues and the autovectors analyses. The selected characteristics to make up the index were estimated production per plant, diameter of the fruit, pulp percentage, pulp color and total titrable acidity. The use of the strategy of simultaneous selection of characters, based on the classic index showed estimations of gains greater than those of the other methodologies, in estimated production per plant and pulp percentage. In the direct selection, the estimations of gains were greater in pulp color and total titrable acidity. The combined selection, when compared to the among and within selection massal and stratified massal, provided the greatest estimations of gains in 11 out of 13 characteristics evaluated, except length and weight of the fruit, thus being the most suitable strategy for the breeding of the population studied. The evaluations made in the first year of production generated satisfactory results, which practically were reproduced in the second year, and therefore can be recommended, because of costs and time reduction of the selection cycle. / Com o objetivo de selecionar genótipos de maracujazeiro amarelo superiores quanto à produtividade e qualidade dos frutos, uma população constituída de 26 famílias de irmãos completos foi avaliada no segundo ano de produção, em delineamento de blocos casualizados, com três repetições e originalmente com quatro plantas por parcela. O trabalho foi realizado na área experimental de Fruticultura do Departamento de Fitotecnia da Universidade Federal de Viçosa, em Viçosa, MG. Verificou-se, na seleção entre e dentro de famílias, a eficiência da seleção direta, indireta e com base em índice clássico. Compararam-se as estratégias de seleção entre e dentro, combinada, massal e massal estratificada. Os resultados encontrados pela seleção entre e dentro foram confrontados com os obtidos em seleção realizada, nessa mesma população, no primeiro ano de produção. As características mensuradas foram número de frutos por planta, produção estimada por planta, comprimento do fruto, diâmetro do fruto, massa do fruto, massa da casca, espessura da casca, massa da polpa, coloração da polpa, porcentagem de polpa, teor de sólidos solúveis totais, acidez total titulável e relação entre teor de sólidos solúveis totais/acidez total titulável. Foi obtida amostra de 10 frutos de cada planta, para avaliação das características qualitativas dos frutos. A colheita dos frutos foi feita de forma parcelada durante o segundo ano de produção, de janeiro a julho de 2006. Os frutos destinados à análise foram colhidos a partir do estádio verde-amarelo . Todas as análises estatísticas foram realizadas com o aplicativo computacional em genética e estatística (GENES). Foram estimados os ganhos de seleção em função de uma porcentagem de seleção de 24% entre famílias e 25% dentro de famílias para todas as características mensuradas. O critério de seleção adotado para todas as características foi o acréscimo em suas médias originais, exceto em massa e espessura da casca, em que se buscou o decréscimo. Para escolha das características que fizeram parte do índice clássico de seleção, foi realizado o diagnóstico de multicolinearidade, empregando para isso a análise dos autovalores e autovetores. As características selecionadas para compor o índice foram produção estimada por planta, diâmetro do fruto, porcentagem de polpa, coloração da polpa e acidez total titulável. A utilização da estratégia de seleção simultânea de caracteres, com base no índice clássico apresentou estimativas de ganhos superiores às das outras metodologias em produção estimada por planta e porcentagem de polpa. Na seleção direta, as estimativas de ganhos foram superiores em coloração de polpa e acidez total titulável. A seleção combinada, quando comparada à seleção entre e dentro, massal e massal estratificada, proporcionou as maiores estimativas de ganhos em 11 das 13 características avaliadas, exceto comprimento e massa do fruto, sendo, assim, a estratégia mais apropriada para o melhoramento genético da população estudada. A realização das avaliações no primeiro ano de produção gera resultados satisfatórios, os quais praticamente, se reproduzem no segundo ano, podendo ser recomendada, por reduzir o custo e o tempo de realização do ciclo de seleção.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:40:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 372745 bytes, checksum: 6f1e60efc5a019ffb5aabeff2579b6ad (MD5) Previous issue date: 2007-07-13 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The objective of this work was to select superior genotypes of the yellow passion flower related to productivity and quality of the fruits. A population of 26 families of whole brothers was evaluated in the second year of production, in a design of random plots, with three repetitions, starting with four plants per plot. The experiment was carried out in the experimental area of Fruitculture in the Departamento de Fitotecnia of the Universidade Federal de Viçosa, in Viçosa, Minas Gerais State, Brazil. In the selection among and within the families, the efficiency of the direct and indirect selection as well as that based on the classical index was verified. The selection strategies among and within, combined, massal and stratified massal were compared. The results found by the selection among and within were compared with those obtained from the selection made in this same population in the first year of production. The characteristics measured were number of fruits per plant, estimated production per plant, length of the fruit, diameter of the fruit, weight of the fruit, weight of the peel, thickness of the peel, weight of the pulp, color of the pulp, percentage of the pulp, total content of soluble solids, titrable total acidity and the rate between the total soluble solids/titrable total acidity. Samples of 10 fruits of each plant were obtained to evaluate the qualitative characteristics of the fruits. The collection of the fruits for the analyses was made as they became yellowishgreen, during the second year of production, from January to July 2006. All the statistical analyses were made with the genetics and statistics software GENES. The selection gains were estimated based on a percentage of 24% among families and of 25% within families for all the characteristics measured. The selection criterium adopted for all the characteristics was the increase in peel their original mediuns, except for the weight and thickness of the peel for which a decrease was desired. For the characteristics choice that were part of the classic index of selection, the multicolinearity diagnosis was carried out, using the autovalues and the autovectors analyses. The selected characteristics to make up the index were estimated production per plant, diameter of the fruit, pulp percentage, pulp color and total titrable acidity. The use of the strategy of simultaneous selection of characters, based on the classic index showed estimations of gains greater than those of the other methodologies, in estimated production per plant and pulp percentage. In the direct selection, the estimations of gains were greater in pulp color and total titrable acidity. The combined selection, when compared to the among and within selection massal and stratified massal, provided the greatest estimations of gains in 11 out of 13 characteristics evaluated, except length and weight of the fruit, thus being the most suitable strategy for the breeding of the population studied. The evaluations made in the first year of production generated satisfactory results, which practically were reproduced in the second year, and therefore can be recommended, because of costs and time reduction of the selection cycle. / Com o objetivo de selecionar genótipos de maracujazeiro amarelo superiores quanto à produtividade e qualidade dos frutos, uma população constituída de 26 famílias de irmãos completos foi avaliada no segundo ano de produção, em delineamento de blocos casualizados, com três repetições e originalmente com quatro plantas por parcela. O trabalho foi realizado na área experimental de Fruticultura do Departamento de Fitotecnia da Universidade Federal de Viçosa, em Viçosa, MG. Verificou-se, na seleção entre e dentro de famílias, a eficiência da seleção direta, indireta e com base em índice clássico. Compararam-se as estratégias de seleção entre e dentro, combinada, massal e massal estratificada. Os resultados encontrados pela seleção entre e dentro foram confrontados com os obtidos em seleção realizada, nessa mesma população, no primeiro ano de produção. As características mensuradas foram número de frutos por planta, produção estimada por planta, comprimento do fruto, diâmetro do fruto, massa do fruto, massa da casca, espessura da casca, massa da polpa, coloração da polpa, porcentagem de polpa, teor de sólidos solúveis totais, acidez total titulável e relação entre teor de sólidos solúveis totais/acidez total titulável. Foi obtida amostra de 10 frutos de cada planta, para avaliação das características qualitativas dos frutos. A colheita dos frutos foi feita de forma parcelada durante o segundo ano de produção, de janeiro a julho de 2006. Os frutos destinados à análise foram colhidos a partir do estádio verde-amarelo . Todas as análises estatísticas foram realizadas com o aplicativo computacional em genética e estatística (GENES). Foram estimados os ganhos de seleção em função de uma porcentagem de seleção de 24% entre famílias e 25% dentro de famílias para todas as características mensuradas. O critério de seleção adotado para todas as características foi o acréscimo em suas médias originais, exceto em massa e espessura da casca, em que se buscou o decréscimo. Para escolha das características que fizeram parte do índice clássico de seleção, foi realizado o diagnóstico de multicolinearidade, empregando para isso a análise dos autovalores e autovetores. As características selecionadas para compor o índice foram produção estimada por planta, diâmetro do fruto, porcentagem de polpa, coloração da polpa e acidez total titulável. A utilização da estratégia de seleção simultânea de caracteres, com base no índice clássico apresentou estimativas de ganhos superiores às das outras metodologias em produção estimada por planta e porcentagem de polpa. Na seleção direta, as estimativas de ganhos foram superiores em coloração de polpa e acidez total titulável. A seleção combinada, quando comparada à seleção entre e dentro, massal e massal estratificada, proporcionou as maiores estimativas de ganhos em 11 das 13 características avaliadas, exceto comprimento e massa do fruto, sendo, assim, a estratégia mais apropriada para o melhoramento genético da população estudada. A realização das avaliações no primeiro ano de produção gera resultados satisfatórios, os quais praticamente, se reproduzem no segundo ano, podendo ser recomendada, por reduzir o custo e o tempo de realização do ciclo de seleção.