Os opiliões são um bom modelo para o estudo da biogeografia histórica, especialmente na Mata Atlântica, onde existe a maior diversidade de espécies do grupo no mundo. A presente tese foi dividida em três capítulos: o primeiro objetiva a delimitação de áreas de endemismo para a Mata Atlântica, usando a ocorrência de espécies de Gonyleptidae; o segundo objetiva encontrar um padrão geral de relação histórica entre essas áreas de endemismo que explique a diversificação no bioma, usando as filogenias de sete subfamílias de Gonyleptidae; o terceiro é a revisão sistemática da subfamília Hernandariinae. Foram delimitadas 12 áreas de endemismo para a Mata Atlântica, usando a ocorrência de 109 espécies. Foram usados os métodos numéricos PAE (Análise de Parcimônia de Endemicidade) e NDM, e desenvolvidos seis Critérios Combinados para a avaliação e delimitação das áreas. Para procurar por um padrão geral histórico de relação entre essas áreas, foram usados os métodos de biogeografia cladística para construção de cladogramas gerais de áreas. As 12 áreas de endemismo se relacionam historicamente formando três blocos principais na Mata Atlântica, com a separação do componente norte (Pernambuco e Bahia) inicialmente e posterior separação do componente central (Rio de Janeiro e São Paulo) do componente sul (sul de São Paulo, Paraná e Santa Catarina). São discutidos os principais eventos históricos geológicos, climáticos e biológicos que determinaram essas divisões e a diversificação da fauna de opiliões no bioma. A subfamília Hernandariinae, após a presente revisão, é composto por 23 espécies em 6 gêneros. Nova classificação é proposta baseada em uma análise cladística usando 67 caracteres morfológicos. Quatro novas combinações foram propostas: Hernandaria armatifrons, H. una, Acrogonyleptes granulatus e A. pectinifemur. Três revalidações de espécies são propostas: A. granulatus, A. pectinifemur e A. spinifrons. Oito espécies novas são propostas: quatro de Hernandaria, duas de Acrogonyleptes e duas de Pseudotrogulus. Seis sinonímias são propostas: Proweyhia e Metaxundarava = Hernandaria, Apembolephaenus calcaratus = H. armatifrons, Paraproweyhia = Acrogonyleptes, Paraproweyhia curitibae = A. exochus, e Melloleitaniana curitibae = A. spinifrons. Ariaeus é transferido para Gonyleptinae. / Harvestmen are a good model to historical biogeography studies, especially in Atlantic Rain Forest of Brazil, where harbors the greatest species diversity of the group in the world. This thesis was divided in three chapters: the first one aimed to delimit areas of endemism for Atlantic Forest, using the occurrence of species of Gonyleptidae; the second one aimed to search for a general pattern of historical relationships among areas of endemism that explain the diversification of bioma, using phylogenies of seven Gonyleptidae subfamilies; the third one reviewed the subfamily Hernandariinae. Twelve areas of endemism were delimited for Atlantic Forest, using the occurrence of 109 species. Numerical methods PAE (Parsimony Analysis of Endemicity) and NDM were employed. Six Combined Criteria for evaluation and delimitation of areas were proposed. Methods of Cladistic Biogeography was used for constructing general cladograms of areas, which represent the general historic pattern. The 12 areas of endemism historically relate among them, forming three main components in Atlantic Forest, with separation of a northern component (Pernambuco and Bahia) firstly and a second separation of central component (Rio de Janeiro and São Paulo) from a southern component (south of São Paulo, Paraná, and Santa Catarina). The main geological, climatical and biological events which determined those divisions and the diversification of harvestmen in the Atlantic Forest were discussed. The subfamily Hernandariinae, after this review, is composed by 23 species in 6 genera. A new classification is presented based on an cladistic analysis, using 67 morphological characters. Four new combinations are proposed: Hernandaria armatifrons, H. una, Acrogonyleptes granulatus, and A. pectinifemur. Three species are revalidated: A. granulatus, A. pectinifemur, and A. spinifrons. Eight new species are proposed: four of Hernandaria, two of Acrogonyleptes, and two of Pseudotrogulus. Six synonimies are proposed: Proweyhia and Metaxundarava = Hernandaria, Apembolephaenus calcaratus = H. armatifrons, Paraproweyhia = Acrogonyleptes, Paraproweyhia curitibae = A. exochus, and Melloleitaniana curitibae = A. spinifrons. Ariaeus is transferred to Gonyleptinae.

A biogeografia estuda a distribuição dos organismos em relação ao espaço e ao tempo, favorecendo a compreensão dos mecanismos que geram e mantém a diversidade, especiação, extinção e dispersão das espécies. Dentre as florestas tropicais, a Mata Atlântica constitui um mosaico vegetal de grande diversidade, onde a filosfera representa um dos habitats mais comuns para os microrganismos. O objetivo do presente trabalho foi avaliar a estrutura e diversidade da comunidade bacteriana da filosfera de Maytenus robusta no Parque Estadual Carlos Botelho, Parque Estadual Ilha do Cardoso e Estação Ecológica de Assis, no estado de São Paulo, Brasil. As folhas foram coletadas em duas épocas do ano, seca e chuvosa. A estrutura da comunidade bacteriana foi avaliada através de PCR-DGGE da região V3 do gene rRNA 16S e a diversidade por sequenciamento da região V1-V3 do mesmo gene. A similaridade entre a estrutura de comunidades de Bacteria foi determinada com base na presença ou ausência das bandas detectadas no gel após PCR-DGGE. O agrupamento hierárquico gerado com o coeficiente de Jaccard e o método UPGMA mostrou a existência de comunidades bacterianas distintas na filosfera de M. robusta nas áreas amostradas. A existência de padrões biogeográficos foi determinada através de análises de regressão, usando os dados de similaridade da estrutura das comunidades bacterianas e os de distância geográfica entre as árvores amostradas. A correlação negativa observada nas avaliações fornece evidências para suportar a hipótese de que a similaridade entre as comunidades bacterianas da filosfera de plantas da mesma espécie diminui com o aumento da distância entre as árvores, dentro de um mesmo bioma. A avaliação espaço temporal da composição da comunidade bacteriana, realizada pela análise NMDS, demonstrou que houve efeito espacial mas no temporal na estrutura das comunidades bacterianas da filosfera de M. robusta. A afiliação taxonômica de 1.470 sequências de clones do gene rRNA 16S de Bacteria, obtidas da filosfera de M. Robusta, nas diferentes áreas e épocas, e a comparação múltipla das bibliotecas, mostraram que as comunidades bacterianas na filosfera foram distintas umas das outras, sendo os filos Proteobacteria e Acidobacteria os mais frequentes. Somente 1% das Unidades Taxonômicas Operacionais foram comuns entre os indivíduos avaliados. Com base nos resultados obtidos, pode-se inferir que, em cada bioma, plantas da mesma espécie possuem comunidades bacterianas únicas, sugerindo a existência de endemismo, altos níveis de especiação e baixa dispersão das comunidades bacterianas nas áreas avaliadas. / Biogeography studies the distribution of organisms in relation to space and time, favoring the understanding of the mechanisms that generate and keep the diversity, speciation, extinction and dispersion of species. Among the tropical forests, the Atlantic Forest constitutes a highly diverse vegetation mosaic, in which the phyllosphere represents one of the most common habitats for microorganisms. The goal of this work was to evaluate the structure and diversity of the bacterial community from the phyllosphere of Maytenus robusta in the Carlos Botelho State Park, Ilha do Cardoso State Park and Assis Ecologic Station, São Paulo state, Brazil. The leaves were collected in two different seasons of the year, dry season and rainy season. The structure of the bacterial community was evaluated through PCR-DGGE of the 16S rRNA gene V3 region, and the diversity by sequencing of the V1-V3 region of the same gene. The similarities between the structures of the bacterial community were determined based on the presence or absence of bands detected in the gels after PCR-DGGE. The hierarchical clustering generated using the Jaccard coefficient and the UPGMA method showed the existence of distinct bacterial communities in the M. robusta phyllosphere of the sampled areas. The existence of biogeographic patterns was determined through regression analyses, using the community structure similarity data geographic distance among the sampled trees. The negative correlation observed in most of the cases provides evidence to support the hypothesis that the similarity between the bacterial communities from phyllosphere of plants of the same species decreases as the distance among trees increased, within the same biome. The spacial-temporal evaluation of the structure of the bacterial communities, performed by the NMDS analyses, showed the occurrence of spacial but not temporal effects on the structure of the bacterial communities of M. robusta phyllosphere. The taxonomic affiliation of 1,470 bacterial 16S rRNA gene clones obtained from the M. robusta phyllosphere, in different areas and seasons, as well as the multiple comparisons of libraries showed that the bacterial communities in the phyllosphere were distinct from each other, and that Proteobacteria and Acidobacteria phyla were the most frequent. Only 1% of the bacterial Operational Taxonomic Units were common among the individuals evaluated. Based on the results obtained it is possible to conclude that, in each biome, plants of same species have unique bacterial communities, suggesting the existence of endemism, high levels of speciation and low dispersal of bacterial communities in the evaluated areas.

The plants of San Quintín (Baja California, Mexico) were documented through intensive fieldwork and the collection of herbarium specimens to create a checklist of species. This region is home to a diverse flora with high levels of local endemism and many rare plants. The flora documented in this study was compared to historical records from the region and shows the impact of agriculture and urbanization on the plants, including several extirpated species. A study of the perennial vegetation using a 1 km grid provides species distribution data for 140 native species, which were assessed to highlight areas of significant species richness for native, rare, and endemic taxa. Several non-native plants were also mapped to provide baseline data. Areas of conservation priority for the flora of Greater San Quintín are discussed in light of these combined findings.

[Truncated abstract] The species-rich Southwest Australian Floristic Region (SAFR) is a global biodiversity hotspot. Characterised by a Mediterranean-type climate and nutrient deficient landscape, this region is endowed with 7380 native vascular plant species/sub species, of which 49% are endemic and 2500 are of conservation concern. Despite the global significance of this region, there is still only a poor understanding of the factors influencing high diversity and endemism, and especially the population genetic consequences of narrow endemism and naturally fragmented species distribution. Holly leaved banksia (Banksia ilicifolia R. Br.), although widespread through Southwest Western Australia (SWWA), has a naturally fragmented distribution, with generally small populations restricted to swales and wetland fringes with depth to groundwater less than 10 m. As such, it provides an excellent model to better understand the ecological genetic consequences of local endemism, population size and natural population fragmentation . . . Products of wide outcrossing (over 30 km) showed a heterosis effect over local outcrossing, indicating increased ecological amplitude of offspring following interpopulation mating. These results suggest that the breeding and mating biology of B. ilicifolia counters the negative genetic erosion effects of narrow ecological amplitude and small population size. Recent habitat fragmentation, and reductions in population size and increased isolation, is impacting on these processes, but further research is required to assess the ultimate consequences of these genetic effects for population viability.

?rea de concentra??o: Conserva??o e Restaura??o de Ecossistemas Florestais. / Submitted by Jos? Henrique Henrique (jose.neves@ufvjm.edu.br) on 2018-03-07T19:22:48Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) lelis_vaz_leite_oliveira.pdf: 2388952 bytes, checksum: 4d43bd58c8b2ec58bf2ad86b22291639 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2018-03-09T19:57:08Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) lelis_vaz_leite_oliveira.pdf: 2388952 bytes, checksum: 4d43bd58c8b2ec58bf2ad86b22291639 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-09T19:57:08Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) lelis_vaz_leite_oliveira.pdf: 2388952 bytes, checksum: 4d43bd58c8b2ec58bf2ad86b22291639 (MD5) Previous issue date: 2013 / Impactos ambientais comprometem direta ou indiretamente a riqueza e estrutura tr?fica da avifauna local e regional e informa??es sobre esta tem?tica s?o escassas para as forma??es do Cerrado, em especial para a o Espinha?o Meridional. Assim, este estudo busca fornecer informa??es sobre a conserva??o, endemismo e estrutura tr?fica da avifauna em forma??es sav?nicas (cerrado t?pico e cerrado rupestre), de tr?s ?reas que se encontram em diferentes est?dios de conserva??o na Serra do Espinha?o Meridional. Em cada ?rea foi pr?-estabelecido um transecto de 5 km, os quais foram visitados mensalmente. Cada uma dessas visitas teve dura??o de oito horas, totalizando 120 horas/ ?rea. Ao percorrer tais transectos, foram registradas todas as aves vistas e/ou ouvidas. Foi avaliado o status de degrada??o de cada ?rea estudada, por meio de uma matriz de impactos e a quantifica??o estrutural da paisagem foi feita por meio de ?ndices de composi??o e configura??o espacial. No Parque Estadual do Biribiri e antigo dep?sito de lixos de Diamantina (BL) foram registradas 123 esp?cies de aves distribu?das em 34 fam?lias. Para o RP foram registradas 88 esp?cies e 28 fam?lias e para a ?rea de Prote??o Ambiental Pau-de-Fruta (PF) foram registradas 76 esp?cies e 23 fam?lias. Considerando que o pior cen?rio de impactos poss?vel, no qual todos os crit?rios est?o com a maior pontua??o alcan??vel some 132, o RP atingiu 25% (33 pontos), o PF 26,5% (35 pontos) e o BL 60,6% (80 pontos). Em rela??o ? estrutura tr?fica n?o houve diferen?as significativas entre as ?reas estudadas tanto para todo o per?odo analisado (H = 5,670; p = 0,127), como para as duas esta??es seca (H = 5,436; p= 0,145) e chuvosa (H = 4,744; p = 0,191) e demonstrou um predom?nio de esp?cies inset?voras, seguidas por frug?voras e on?voras. A insetivoria foi a guilda mais predominante durante as duas esta??es em todos os ambientes estudados. Houve uma consider?vel similaridade da avifauna entre as ?reas. Os padr?es encontrados por este estudo refor?am a necessidade melhor compreens?o de ambientes antropizados, principalmente aqueles em ?reas de forma??es sav?nicas, onde a avifauna indica uma tend?ncia a apresentar maior plasticidade e amplitude ambiental. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Ci?ncia Florestal, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2013. / Environmental impacts directly or indirectly compromise the richness and trophic structure of local and regional avifauna and information on this subject are scarce for the formations of the Cerrado, especially to the southern Espinha?o. Thus, this study aims to provide information about conservation, endemism and trophic structure of the avifauna in savanna formations (typical cerrado and grasslands) of three areas that are at different stages of conservation in the southern Espinha?o. In each area was pre-established a transect of 5 km, which were visited monthly. Each of these visits lasted eight hours, totaling 120 hours/area. In such transects were recorded all birds seen and / or heard. The deterioration status of each studied by means of an array of structural impacts and quantification of the landscape area was made by compounding rates and spatial configuration was evaluated. In the Biribiri State Park and ancient deposit of waste from Diamantina (BL) 123 species of birds distributed in 34 families were recorded. RP for 88 species and 28 families were recorded and the Environmental Protection Area Pau-de-fruit (PF) 76 species and 23 families were recorded. . In the Biribiri State Park and ancient deposit of waste from Diamantina (BL) 123 species of birds distributed in 34 families were recorded. In the Rio Preto State Park (RP) 88 species and 28 families were recorded and at the Environmental Protection Area Pau-de-Fruta (PF) 76 species and 23 families were recorded. Whereas the worst possible impacts, where all criteria are reached with the highest score some 132, RP reached 25% (33 points), PF 26.5% (35 points) and 60.6% BL (80 points). Regarding the trophic structure there were no significant differences among the studied areas for the entire period analyzed both (H = 5.670, p = 0.127) and for the two dry seasons (H = 5.436, p = 0.145) and wet (H = 4,744 p = 0.191) and demonstrated a predominance of insectivores, followed by frugivorous and omnivorous species. The insectivorous guild was most prevalent during the two seasons in all environments studied. There was considerable similarity between the avifauna in the study areas. The patterns found in this study reinforce the need for better understanding of anthropogenic environments, especially those in areas of savanna formations where birdlife indicates a tendency to have higher plasticity and environmental amplitude.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:29:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3408.pdf: 3545548 bytes, checksum: f2abde5e4fc42729875ec59d311ddd2b (MD5) Previous issue date: 2010-12-02 / Financiadora de Estudos e Projetos / Understanding the factors related to the reproductive strategy of endemic fish species at spatial and a temporal scale is essential for their conservation and management. The present study investigated the reproductive strategy of Prochilodus brevis and Cichlasoma orientale in the River Assu, located in the semi-arid Northeastern Brazil. Population structure, sex proportion, length at first maturity, stages of gonadal development, gonadosomatic index, condition factor, reproductive period and limnological variables were determined. Temporal distribution of mean rainfall, water temperature, dissolved oxygen concentration, pH and electrical conductivity values were related to the reproductive period of P. brevis and C. orientale. The present study deals with the composition, species richness and endemism in fish species of River Assu. Analyses of GSI, K and size of oocytes indicate the reproduction of P. brevis occurs from January to March and that this species is a total spawner. Rainfall influenced alterations in limnological characteristics and the reproductive period of this species. The reproductive strategy of P. brevis is well adapted to the environmental characteristics of the semi-arid region. Cichlasoma orientale is a batch spawner with a reproductive period between the months March to June and in September, with a reproductive peak in the beginning of the rainy season. Multiple spawnings in one breeding season indicate that C. orientale is well adapted to the environmental characteristics of the semi-arid region. A total of 556 individuals were captured which were distributed in 3 orders, 10 families and 17 species, of which, 13 were endemic, 4 introduzed and one exotic. The orders more representatives in terms of number of fish species were Characiformes, Perciformes and Siluriformes. Among the families, Prochilodontidae was dominant followed by Cichlidae. P. brevis, an endemic species was most expressive followed by Trachelyopterus galeatus. Nine species were considered constant, five accessories and three accidental. The results demonstrate an elevated number of endemic species, among them the rheophilic fish which migrate to the head river to spawn, and a reduced number of introduced species. The presence of endemic species increases the importance of conservation and adequate management practice of this natural semi-arid ecosystem. / Compreender os fatores relacionados à ecologia reprodutiva de espécies de peixes endêmicos em escalas espaciais e temporais é essencial para a sua conservação e gestão. O presente estudo investigou a estratégia reprodutiva de Prochilodus brevis e Cichlasoma orientale no rio Assu, semi-árido do Nordeste brasileiro. A estrutura populacional, proporção sexual, comprimento da primeira maturação, estádios do desenvolvimento gonadal, índice gonadossomático, fator de condição e o período reprodutivo, juntamente com as variáveis limnológicas foram determinados. A distribuição temporal dos valores médios da precipitação, temperatura da água, concentração de oxigênio dissolvido, pH e condutividade elétrica foram relacionados com o período reprodutivo das espécies. Juntamente foi realizado o levantamento ictiológico do rio Assu, a fim de verificar o endemismo da comunidade de peixes e descrever os padrões de composição e riqueza das espécies. IGS e K de P. brevis indicam que a época de reprodução se estende de janeiro a março coincidindo com a época das chuvas e esta espécie apresenta desova total. A precipitação pluviométrica influenciou as alterações nas variáveis limnológicas, estando esta espécie bem adaptada às características ambientais da região semi-árida. Cichlasoma orientale apresenta desova parcelada, ocorrendo o período reprodutivo entre os meses de março a junho e em setembro, com o maior pico reprodutivo no início das chuvas. Várias desovas dentro de um período reprodutivo indicam que C. orientale é bem adaptada às características ambientais da região semi-árida. Foram capturados 556 espécimes, distribuídos em 3 ordens, 09 famílias e 17 espécies. Destas, treze são endêmicas com ocorrência somente no bioma Caatinga, três introduzidas de outras bacias do Brasil e uma exótica, introduzida de outro continente. As espécies mais abundantes em número foram Prochilodus brevis, Trachelyopterus galeatus, Cichlasoma orientale, Plagioscion squamosissimus e Pimelodella gracilis. O alto grau de endemismo constatado nesse rio deve ser contemplado nas ações de manejo futuras, especialmente pelo fato de os açudes e barragens nessa região serem dispostos em série e, portanto, potencializando os perigos de extinção local.

Orientador: Prof. Dr. Charles Morphy D. dos Santos / Tese (doutorado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Evolução e Diversidade, 2017. / O conhecimento da história da vida na Terra é fundamental para entender a atual distribuição dos organismos e para prevê-la no futuro. O estabelecimento de áreas de endemismo e a análise da estruturação filogenética dessas áreas são os primeiros passos para que se possa compreender a história evolutiva e as interações ecológicas entre organismo-espaço e organismo-organismo, a fim de fornecer subsídios para ações conservacionistas. A infraordem Tabanomorpha (Diptera, Brachycera), um grupo antigo, de distribuição global e pouca resolução biogeográfica, é um bom modelo de estudo para discutir a relação entre biodiversidade, padrões filogenéticos e conservação. Os objetivos desta tese foram: i) estudar aspectos biogeográficos dos grupos de Tabanomorpha, em particular identificar áreas de endemismo neotropicais e globais, e ii) estudar o índice de diversidade filogenética de Faith. Para isso, um banco de dados com registros de ocorrência de ~5.000 espécies de Tabanomorpha foi compilado. As áreas de endemismo foram delimitadas a partir de uma análise de endemicidade, utilizando o programa NDM/VNDM. Na região Neotropical, 13 áreas de endemismo foram identificadas, compreendendo cinco componentes: Norte da América do Sul (NSA), Sudeste da América do Sul (SESA), América Central (CA), Savana Brasileira (BS), Andes Central (CAn). De modo geral, estes componentes são congruentes com as propostas de regionalização mais recentes para a região Neotropical. Na análise global, 18 áreas de endemismo foram identificadas: seis áreas na região Neártica, duas na região Paleártica, as regiões Oriental, Australiana e Africana tiveram três áreas cada, e a região Neotropical apareceu como uma área única. Essas áreas foram comparadas com estudos realizados para diversos táxons, apresentando congruências e evidenciando a possibilidade de utilização dos insetos na determinação de padrões globais de endemismo. A partir dos resultados de ambas as análises de endemicidade, a família Rhagionidae foi utilizada como modelo para sugestão de um protocolo de análise de biogeografia histórica, utilizando três distintos de biogeografia cladística: (1) um método baseado em padrão (BPA), um método baseado em eventos (DIVA) e um método baseado em barreiras (SAV). O método baseado em padrão descreve o padrão geral das relações das áreas, com possíveis áreas problemáticas a serem explicadas pelo método baseado em eventos (sob interpretação de diferentes processos: vicariância, dispersão, duplicação, extinção). O método baseado em barreiras testa a história biogeográfica estabelecida pelos métodos anteriores, apontando possíveis barreiras. Essas informações biogeográficas mais amplas facilitam a incorporação subsequente da história evolutiva nas análises de diversidade. Por fim, foi realizada uma análise de diversidade filogenética da família Tabanidae nas áreas de endemismo identificadas na região Neotropical, baseada no Índice de Diversidade Filogenética de Faith. O resultado mostrou que a distribuição geral dos gêneros de tabanídeos é agrupada filogeneticamente, ou seja, constituída por gêneros estreitamente relacionados. A presente tese configura o início de um inventário de dípteros tabanomorfos em áreas neotropicais potencialmente favorável aos estudos de biogeografia da conservação por tratar explicitamente da determinação de áreas de endemismo Neotropicais baseadas na distribuição de Tabanomorpha, e avaliadas em sua diversidade filogenética em Tabanidae, a família mais abrangente da infraordem. / The knowledge of the history of life on Earth is fundamental to understand the current distribution of organisms and to predict it in the future. The establishment of areas of endemism and the analysis of the phylogenetic structure of these areas are the first steps in understanding the evolutionary history and the ecological interactions between organismspace and organism-organism, in order to provide subsidies for conservation actions. The infraorder Tabanomorpha (Diptera, Brachycera), an ancient group with a global distribution and low biogeographic resolution, is a good study model to discuss the relationship between biodiversity, phylogenetic patterns and conservation. The objectives of this PhD thesis were: i) to study biogeographical aspects of groups of Tabanomorpha, particularly identifying Neotropical and global areas of endemism, and ii) to study Faith's phylogenetic diversity index. For this purpose, a database with occurrence records of ~ 5,000 species of Tabanomorpha was compiled. The areas of endemism were delimited from an endemicity analysis of this database, using the NDM/VNDM program. In the Neotropical region, 13 areas of endemism were identified for the Neotropical region, comprising five components: Northern South America (NSA), Southeastern South America (SESA), Central America(CA), Brazilian Savannah (BS), and Central Andes (CAn). In general, those components are congruent with the most recent bioregionalization proposals of Neotropical region. In the global analysis, 18 areas of endemism were identified: six areas in Neartic region, two areas in Palearctic region, Oriental, Australian and African regions presented three areas each, and Neotropical region appeared as a single area. Those areas were compared with global studies carried out for several taxa, presenting congruencies and showing the possibility of using insects in the determination of global patterns of endemism. From the results of both analyzesof endemicity, the family Rhagionidae was used as a model to suggest a protocol for historical biogeography analyses using three distinct methods of cladistic biogeography: (1) a pattern based method (BPA), an event-based method (DIVA) and a barrier-based method (SAV). The pattern-based method depicts the general pattern of area relationships, with possible problematic areas to be explained by the event-based method (under interpretation of different processes: vicariance, dispersion, duplication, extinction). The barrier-based method tests the biogeographical history established by the previous methods, revealing possible barriers. This broader biogeographical information facilitates the subsequent incorporation of evolutionary history into diversity analyses. Finally, an analysis of the phylogenetic diversity of the family Tabanidae was carried out in the areas of endemism identified in the Neotropical region, based on Faith¿s Phylogenetic Divers ty index. The result of the analysis showed that the general distribution of the tabanid genera in the five main areas of endemism in theNeotropical region is phylogenetically clustered, that is, composed of closely related genera. The present thesis is the beginning of an inventory of dipterans of infraorder Tabanomorpha in Neotropical areas, potentially favorable to conservation biogeography studies by explicitly determining Neotropical areas of endemism based on the Tabanomorpha distribution, and evaluating their phylogenetic diversity in Tabanidae, the major family of the infraorder.

Made available in DSpace on 2014-07-29T16:21:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_eduardo_pacifico.pdf: 1146266 bytes, checksum: 35376f6282f701f0d901fd00680cea93 (MD5) Previous issue date: 2011-02-11 / Endemic species have higher risk of extinction and are the focus of conservation efforts because they are confined to specific areas. Evidently, extinction vulnerability variation among endemic species should be mainly explained by their range distribution. Because they have specific eco-physiological traits, anurans are particularly sensitive to global climate change (GCC). Thus, the goals of this study are to present a new anuran endemic species list of Cerrado, to discuss issues related to endemism and to determine if the current potential distribution is able to predict the species extinction vulnerability in GCC. We analyze anuran species that were considered endemic in previous studies plus recently described species. We used two modeling procedures (Maxent and Mahalanobis distance method), three climate models (CCCma, CSIRO and HadCM3) and two carbon emissions scenarios (A2 and B2). Analyses were performed separately for each set of conditions (method, model and scenario) and then we analyzed the emergent pattern. There are 33 Cerrado endemic anuran species, belonging to ten families, representing 20.4% of Cerrado s anurans and 3.8% of Brazilian anurans. Most species have few occurrence points (mean ± standard deviation: 4.9 ± 4.6). Twelve endemic species have all their occurence points near to the boundaries of Cerrado and twelve have all their occurence points in the center of the biome. Small changes in biome boundaries alter the number of endemic species. Therefore, the endemism concept is strongly linked to the biome definition, the sampling effort, the correct species identification and the existing information released. Using the biome limits defined by the Brazilian government, Cerrado endemic anurans with small range distribution have less overlap between the current and the future distributions than Cerrado endemic anurans with large range distribution, indicating that species with small range have a higher risk of extinction. Nevertheless, Cerrado endemic anurans with small range distribution have more proportional gain of suitable area in the future than Cerrado endemic anurans with large range distribution. Consequently, there will be adequate area for all species. However, only species that could move to suitable places will persist. Hence, species persistence, mainly for species with small range size, depends largely on the connectivity of suitable habitat and dispersal rates that allow the colonization of new areas. / Por estarem restritas a um determinado local, é esperado um maior risco de extinção para as espécies endêmicas, sendo elas o foco de ações conservacionistas. A variação da vulnerabilidade à extinção entre espécies endêmicas deve ser principalmente explicada pelo tamanho de suas distribuições. Por possuírem características eco-fisiológicas específicas, os anuros são especialmente sensíveis às mudanças climáticas globais (MCG). Assim, o objetivo geral é apresentar uma nova lista de espécies de anuros endêmicos do Cerrado, discutir questões relacionadas ao endemismo e determinar se a distribuição potencial atual é capaz de predizer a vulnerabilidade das espécies às MCG. Analisamos as espécies de anuros que foram consideradas endêmicas em estudos prévios e as espécies descritas recentemente. Utilizamos dois procedimentos de modelagem (Maxent e o método de distância de Mahalanobis), três modelos climáticos (CCCma, CSIRO e HADcm3) e dois cenários de emissão de carbono (A2 e B2). As análises foram feitas separadamente para cada conjunto de condições (método, modelo e cenário) e depois analisamos o padrão global. São 33 espécies de anuros endêmicos do Cerrado, de dez famílias, representando 20.4% das espécies que ocorrem no Cerrado e 3.8% das espécies que ocorrem no Brasil. A maioria das espécies possui poucos pontos de ocorrência (média de registros ± desvio padrão: 4.9 ± 4.6). Das espécies endêmicas, 12 têm distribuição exclusivamente marginal no bioma e 12 têm distribuição exclusivamente central. Pequenas mudanças nos limites do bioma alterariam o número de espécies endêmicas. Portanto, o conceito de endemismo está fortemente ligado à definição do bioma, ao esforço amostral, à correta identificação das espécies e à disponibilização e agrupamento das informações existentes. Para os anuros endêmicos do Cerrado, quanto menor o tamanho da distribuição atual da espécie, menor é a sobreposição com sua distribuição futura, indicando que estas espécies estarão expostas a um maior risco de extinção. Entretanto, quanto menor a distribuição atual, maior o ganho proporcional de área adequada no futuro e maior o deslocamento da distribuição em relação presente. Desta forma, existirá área adequada para as espécies, entretanto somente as que se deslocarem persistirão. Portanto, a persistência das espécies, principalmente as de menor tamanho de distribuição atual, dependerá em grande parte da conectividade dos habitats adequados e das taxas de dispersão que permitirão a colonização de novas áreas.

Os opiliões são um bom modelo para o estudo da biogeografia histórica, especialmente na Mata Atlântica, onde existe a maior diversidade de espécies do grupo no mundo. A presente tese foi dividida em três capítulos: o primeiro objetiva a delimitação de áreas de endemismo para a Mata Atlântica, usando a ocorrência de espécies de Gonyleptidae; o segundo objetiva encontrar um padrão geral de relação histórica entre essas áreas de endemismo que explique a diversificação no bioma, usando as filogenias de sete subfamílias de Gonyleptidae; o terceiro é a revisão sistemática da subfamília Hernandariinae. Foram delimitadas 12 áreas de endemismo para a Mata Atlântica, usando a ocorrência de 109 espécies. Foram usados os métodos numéricos PAE (Análise de Parcimônia de Endemicidade) e NDM, e desenvolvidos seis Critérios Combinados para a avaliação e delimitação das áreas. Para procurar por um padrão geral histórico de relação entre essas áreas, foram usados os métodos de biogeografia cladística para construção de cladogramas gerais de áreas. As 12 áreas de endemismo se relacionam historicamente formando três blocos principais na Mata Atlântica, com a separação do componente norte (Pernambuco e Bahia) inicialmente e posterior separação do componente central (Rio de Janeiro e São Paulo) do componente sul (sul de São Paulo, Paraná e Santa Catarina). São discutidos os principais eventos históricos geológicos, climáticos e biológicos que determinaram essas divisões e a diversificação da fauna de opiliões no bioma. A subfamília Hernandariinae, após a presente revisão, é composto por 23 espécies em 6 gêneros. Nova classificação é proposta baseada em uma análise cladística usando 67 caracteres morfológicos. Quatro novas combinações foram propostas: Hernandaria armatifrons, H. una, Acrogonyleptes granulatus e A. pectinifemur. Três revalidações de espécies são propostas: A. granulatus, A. pectinifemur e A. spinifrons. Oito espécies novas são propostas: quatro de Hernandaria, duas de Acrogonyleptes e duas de Pseudotrogulus. Seis sinonímias são propostas: Proweyhia e Metaxundarava = Hernandaria, Apembolephaenus calcaratus = H. armatifrons, Paraproweyhia = Acrogonyleptes, Paraproweyhia curitibae = A. exochus, e Melloleitaniana curitibae = A. spinifrons. Ariaeus é transferido para Gonyleptinae. / Harvestmen are a good model to historical biogeography studies, especially in Atlantic Rain Forest of Brazil, where harbors the greatest species diversity of the group in the world. This thesis was divided in three chapters: the first one aimed to delimit areas of endemism for Atlantic Forest, using the occurrence of species of Gonyleptidae; the second one aimed to search for a general pattern of historical relationships among areas of endemism that explain the diversification of bioma, using phylogenies of seven Gonyleptidae subfamilies; the third one reviewed the subfamily Hernandariinae. Twelve areas of endemism were delimited for Atlantic Forest, using the occurrence of 109 species. Numerical methods PAE (Parsimony Analysis of Endemicity) and NDM were employed. Six Combined Criteria for evaluation and delimitation of areas were proposed. Methods of Cladistic Biogeography was used for constructing general cladograms of areas, which represent the general historic pattern. The 12 areas of endemism historically relate among them, forming three main components in Atlantic Forest, with separation of a northern component (Pernambuco and Bahia) firstly and a second separation of central component (Rio de Janeiro and São Paulo) from a southern component (south of São Paulo, Paraná, and Santa Catarina). The main geological, climatical and biological events which determined those divisions and the diversification of harvestmen in the Atlantic Forest were discussed. The subfamily Hernandariinae, after this review, is composed by 23 species in 6 genera. A new classification is presented based on an cladistic analysis, using 67 morphological characters. Four new combinations are proposed: Hernandaria armatifrons, H. una, Acrogonyleptes granulatus, and A. pectinifemur. Three species are revalidated: A. granulatus, A. pectinifemur, and A. spinifrons. Eight new species are proposed: four of Hernandaria, two of Acrogonyleptes, and two of Pseudotrogulus. Six synonimies are proposed: Proweyhia and Metaxundarava = Hernandaria, Apembolephaenus calcaratus = H. armatifrons, Paraproweyhia = Acrogonyleptes, Paraproweyhia curitibae = A. exochus, and Melloleitaniana curitibae = A. spinifrons. Ariaeus is transferred to Gonyleptinae.

Os venenos de serpentes são misturas complexas com composição variada, possuindo constituintes orgânicos e inorgânicos. Dentre os compostos orgânicos, destacam-se as proteínas, tóxicas e/ou com altas atividades enzimáticas. Desta forma, os venenos desenvolvem importante papel na captura de presas e auxílio à digestão. Venenos de serpentes da família Viperidae apresentam ampla e variada gama de ações biológicas, como proteólise, coagulação, hemorragia, neurotoxicidade e miotoxidade. Populações de serpentes habitantes endemicamente em ilhas são bons modelos para estudos de evolução, especialmente quando comparadas a espécies de mesmo gênero que habitam o continente. Espécies ancestrais de serpentes do gênero Bothrops sofreram isolamento geográfico cerca de 9 mil anos atrás, quando no Período Pleistoceno porções de terra na região Sudeste do Brasil foram isoladas do continente, levando a formação de ilhas costeiras, devido a elevação do nível do mar. Tal isolamento deu origem a novas espécies insulares pertencentes ao gênero Bothrops. Estudos relacionados aos venenos destas espécies, suas especificidades e diferenças com relação a serpentes continentais são escassos. O Arquipélago de Alcatrazes localiza-se no litoral de São Paulo, distando aproximadamente 35 Km da costa. Não há relatos da existência de mamíferos na ilha, com exceção de morcegos. Serpentes adultas da espécie Bothrops alcatraz, endêmica da Ilha de Alcatrazes, apresentam características encontradas em serpentes juvenis do grupo das jararacas, como a dieta baseada exclusivamente em animais ectotérmicos e a composição diferenciada do veneno. O presente trabalho tem como objetivo caracterizar as principais ações do veneno da serpente B. alcatraz, espécie endêmica e ilhoa, isolando cromatograficamente suas frações. Resultados indicam no veneno de B. alcatraz apresenta as atividades coagulante sobre plasma humano, fosfolipásica, miotóxica e edematogênica mais ativas quando comparadas com as ações do veneno de B. jararaca do continente. As ações proteolítica, hemorrágica e toxicidade para camundongos são mais potentes no veneno de B. jararaca. A presença de ação neurotóxica específica para artrópodes no veneno de B. alcatraz sugere a ação de uma fosfolipase A2, a qual foi isolada cromatograficamente. As propriedades e composição do veneno de B. alcatraz indicam uma provável evolução de toxinas adaptadas a seu tipo de presa/alimento. / Snakes venoms are complex mixtures with varied composition constituted by organic and inorganic molecules. The main organic components are proteins, which can be toxic and show high enzymatic activities, thus playing important role in prey capture and digestion in snakes. Viperidae snakes family show wide range of biological actions, as proteolytic, coagulant, hemorrhagic, neurotoxic and myotoxic activities. Snake populations inhabiting endemically islands are useful models for evolution studies, specially when compared to their congeneric continental species. Bothrops species ancestors from Southeastern Brazil underwent geographic isolation about 9 thousand years ago, during the Pleistocene Period, when land portions were separated from the continent by the sea. The isolation originated new (island endemic) Bothrops species. Studies related to those snake venoms, its specialties and differences among continental species of the genera Bothrops are scarce. The Alcatrazes Archipelago is located in São Paulo coast, 35 kilometer far from the continent. There are no register of mammals in those islands, except for bats. Bothrops alcatraz is endemic from the Alcatrazes Island. Adults show some similarities to young specimens from the continental jararaca group. They feed exclusively on ectothermic animals and their venom shows a different composition. The aim of this study was to analyze the endemic island snake, B. alcatraz, venom, isolating by chromatography the venom fractions. Results indicated that B. alcatraz venom presents coagulant, phospholipase, myotoxic and edema forming activities higher than continental B. jararaca venom. The proteolytic, haemorrhagic and mice toxicity are higher on B. jararaca venom. The specific neurotoxic action in arthropods of B. alcatraz venom suggests a phospholipase A2 action, which was isolated bt cromatography. The properties and composition of B. alcatraz venom indicates a possible evolution of toxins adapted to the prey kinds.