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Modélisation de données de surveillance épidémiologique de la faune sauvage en vue de la détection de problèmes sanitaires inhabituels

Warns-Petit, Eva 09 February 2011 (has links) (PDF)
Des études récentes ont montré que parmi les infections émergentes chez l'homme, env. 40% étaient des zoonoses liées à la faune sauvage. La surveillance sanitaire de ces animaux devrait contribuer à améliorer la protection de leur santé et aussi celle des animaux domestiques et des hommes. Notre objectif était de développer des outils de détection de problèmes sanitaires inhabituels dans la faune sauvage, en adoptant une approche syndromique, utilisée en santé humaine, avec des profils pathologiques comme indicateurs de santé non spécifiques. Un réseau national de surveillance des causes de mortalité dans la faune sauvage, appelé SAGIR, a fourni les données. Entre 1986 et 2007, plus de 50.000 cas ont été enregistrés, représentant 244 espèces de mammifères terrestres et d'oiseaux, et attribués à 220 différentes causes de mort. Le réseau a d'abord été évalué pour sa capacité à détecter précocement des événements inhabituels. Des classes syndromiques ont ensuite été définies par une typologie statistique des lésions observées sur les cadavres. Les séries temporelles des syndromes ont été analysées en utilisant deux méthodes complémentaires de détection : un algorithme robuste développé par Farrington et un modèle linéaire généralisé avec des termes périodiques. Les tendances séculaires de ces syndromes et des signaux correspondent a des excès de cas ont été identifiés. Les signalements de problèmes de mortalité inhabituelle dans le bulletin du réseau ont été utilisés pour interpréter ces signaux. L'étude analyse la pertinence de l'utilisation de la surveillance syndromique sur ce type de données et donne des éléments pour des améliorations futures.
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Tumeurs du système nerveux central et expositions agricoles aux pesticides / Central nervous system tumours and agricultural exposures to pesticides

Piel, Clément 26 November 2018 (has links)
Dans la littérature internationale, les expositions agricoles aux pesticides constituent une hypothèse privilégiée pour expliquer l’excès de tumeurs cérébrales observé chez les agriculteurs. L’objectif de cette thèse, élaborée à partir des données de la cohorte Agrican, était d’investiguer le rôle des expositions agricoles aux pesticides dans l’incidence des principaux types histologiques de tumeurs du système nerveux central. Avec plus de 180 000 participants suivis depuis 2005, la cohorte Agrican est une des plus grandes études sur la santé en milieu agricole. En tenant compte des principaux facteurs de confusion, des comparaisons internes ont fait apparaitre des augmentations de risque chez les agriculteurs, plus marquées chez les utilisateurs de pesticides, et avec de fortes variations selon les types de cultures et d’élevages. Suite à ces premières analyses, un travail de priorisation a permis d’identifier les pesticides carbamates comme prioritaires à étudier en lien avec les tumeurs cérébrales. La poursuite du développement de la matrice Pestimat a ensuite permis de reconstituer l’historique des utilisations de carbamates depuis 1950 dans les principaux contextes agricoles français. À l’issue de ces étapes intermédiaires, des analyses de survie menées chez les participants d’Agrican ont fait apparaître des augmentations de risque de gliomes et de méningiomes en lien avec les expositions professionnelles à des matières actives (dithio/thio)-carbamates, en particulier avec celles dont l’utilisation a été recommandée en viticulture, en arboriculture et sur cultures de pomme de terre et de betterave. Ces résultats renforcent les preuves de cancérogénicité pour les pesticides déjà suspectés pour d’autres cancers et attirent l’attention sur d’autres matières actives, moins documentées dans la littérature mais relativement homogènes au niveau des structures chimiques. Aussi, sur la base de ces résultats et dans un objectif de santé publique, il paraît essentiel de poursuivre les efforts engagés pour réduire les expositions aux pesticides des agriculteurs. / In the international literature, agricultural exposures to pesticides have been put forward as a key hypothesis to explain the excess of brain tumours observed in farmers. The aim of this thesis, based on data from the Agrican cohort, was to investigate the role of agricultural exposures to pesticides in the incidence of the main histological types of central nervous system tumours. With more than 180,000 participants followed since 2005, the Agrican cohort is one of the largest studies on health in agriculture. Internal comparisons adjusted for the main important confounders showed increases in risk among farmers, more pronounced risk among pesticide users, and with strong variations according to the types of crop and livestock farming. Following these initial analyses, work identified carbamate pesticides as a priority to study in relation to brain tumours. Next, further development of the Pestimat served to reconstitute the history of carbamate uses since 1950 in the main French agricultural contexts. After these intermediate steps, survival analyses conducted among Agrican participants showed increased risks of glioma and meningioma in farmers exposed to (dithio/thio)-carbamates, particularly with those recommended for use on vineyards, fruits, potatoes and beets. These findings reinforce the evidence of carcinogenicity among pesticides already suspected for other cancers, and draw attention to other active ingredients, less documented in the literature but relatively homogeneous in terms of chemical structures. Therefore, on the basis of these conclusions and with a public health objective in mind, it seems essential to pursue efforts to reduce farmers' exposure to pesticides.
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Approche longitudinale et quantitative de l'exposition aux médicaments dans les études de pharmaco-épidémiologie : développement méthodologique et application aux expositions au cours de la grossesse dans la cohorte EFEMERIS / Lungitudinal and quantitative approach to drug exposure in pharmacoepidemiology studies : methodological development and application to exposures during pregnancy in EFEMERIS cohort

Hurault-Delarue, Caroline 31 March 2016 (has links)
Des études de pharmaco-épidémiologie ont montré le rôle de la dose et de la durée d'exposition à un médicament dans la survenue d'effets indésirables. Toutefois, ces différents paramètres sont rarement pris en compte simultanément dans les travaux visant à étudier le risque lié à une exposition médicamenteuse, notamment au cours de la grossesse. Les bases de données administratives de santé permettent d'appréhender ces paramètres et de retracer de façon précise l'historique de l'exposition de chaque patient aux médicaments. L'objectif de ce travail est de développer une nouvelle méthode de mesure d'exposition visant à classifier les individus en tenant compte de l'intensité et de l'évolution de cette exposition au cours du temps. L'application en pharmaco-épidémiologie permet une approche quantitative de l'exposition des patients (à travers la prise en compte des doses de médicaments délivrés) et longitudinale au cours du temps définissant ainsi des trajectoires individuelles d'exposition. La classification des individus en groupes homogènes selon ces trajectoires est mise en oeuvre grâce à l'utilisation d'une méthode de classification non supervisée fondée sur le principe de la méthode des K-means adaptée aux données longitudinales. Cette " Méthode des Trajectoires d'Exposition " a été appliquée à l'exposition aux psychotropes au cours de la grossesse, en utilisant les données de la cohorte EFEMERIS. Elle a mené, lors d'une première phase, à la constitution de clusters aux profils d'exposition homogènes. Lors de la deuxième phase d'application, les clusters issus de la classification des femmes exposées aux anxiolytiques et hypnotiques ont pu être utilisés comme variable explicative dans l'étude des risques pour le nouveauné et l'enfant liés une exposition in utero à ces médicaments. La mise en évidence d'une relation de type dose-effet au sein des 4 clusters identifiés laisse penser qu'un niveau élevé d'exposition à ces médicaments au cours de la grossesse augmenterait notamment le risque de pathologie néonatale. En opposition, les résultats concernant les femmes exposées ponctuellement ou à de faibles doses étaient rassurants. L'application à des données réelles a été l'occasion de valider cette méthode et de montrer l'intérêt de la prise en compte de l'intensité et de l'évolution des expositions médicamenteuses au cours du temps dans les études de pharmaco-épidémiologie. La méthode proposée peut être adaptée à d'autres populations, d'autres classes de médicaments mais également d'autres types d'exposition. Cette approche " trajectorielle " de l'exposition ouvre de nouvelles perspectives pour les futures études épidémiologiques. / The intensity and duration of drug exposure may contribute to the occurrence of drug adverse effects. However, these parameters are rarely simultaneously addressed in studies of risks associated to drug exposure, in particular during pregnancy. Administrative databases give the opportunity to apprehend these parameters and to reconstruct the history of patient drug exposure. The aim of this research is to develop a new method of exposure measurement in order to cluster individuals, taking into account both the intensity and the evolution of exposure. The application to pharmaco-epidemiological studies allow a quantitative approach of drug exposure and longitudinal over time defining individual trajectories of exposure. We used an unsupervised clustering method based on an implementation of K-means adapted to longitudinal data analysis to cluster individuals in homogeneous groups according to their trajectories. This "trajectory method" was applied to psychotropic drug exposure during pregnancy, using EFEMERIS database. The first phase of this application led to the identification of clusters with homogeneous profiles. During the second phase, clusters of women exposed to anxiolytic and hypnotic drugs were used as independent variables to study the effects of in utero exposure to these drugs on newborns and children. The study especially indicates a dose-response relationship between the 4 clusters and an increased risk of neonatal pathologies after an exposure to a heavy drug burden. By contrast, results concerning women punctually exposed or exposed to a light drug burden were reassuring. This application to real-clinical-data has validated this method and demonstrates the interest value of considering intensity and evolution of drug exposure over time in pharmaco-epidemiological studies. The proposed method could be adapted to other populations, classes of drugs and other types of exposure. This "trajectorial" approach of exposure opens up new prospects for future epidemiological studies.
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Approche épidémiologique du rôle des acides gras sur le vieillissement cutané dans le cadre de l’étude SU.VI.MAX / Epidemiological approach of the role of fatty acids on the skin photoaging in the context of the SU.VI.MAX Study

Latreille, Julie 13 June 2013 (has links)
L’éventuel effet photo-protecteur sur la peau des lipides a été jusqu’à présent peu examiné. L’objectif de cette thèse était d’étudier le lien entre l’apport alimentaire en acides gras mono-insaturés (AGMI) et en acides gras polyinsaturés (AGPI) n-3 et le photo-vieillissement cutané du visage chez une large population d’hommes et de femmes âgés entre 45 et 60 ans. Ces travaux ont mis en évidence un lien inverse entre les apports en en huile d’olive et la sévérité du photo-vieillissement. Lors de l’étude des AGPI n-3, un lien inverse a été mis en évidence entre la sévérité du photo-vieillissement et les apports en acide α-linolénique (ALA) des huiles végétales et des fruits et légumes chez les hommes. Chez les femmes un lien inverse a été trouvé avec les apports en acide eicosapentaénoïque (EPA) et une tendance avec les ALA des huiles végétales. Ces travaux soutiennent les recommandations en faveur d’un régime riche en huile d’olive et en AGPI n-3 comme celui du régime méditerranéen. / The possible effect of dietary lipids on the photoprotection of the skin has been few investigated so far. The aim of this thesis was to investigate the links between dietary monounsaturated fatty acids (MUFA) and n-3 polyunsaturated fatty acids (n-3 PUFAs) on facial skin photoaging in a large population of men and women aged between 45 and 60 years old. An inverse association was found between intakes of olive oil and the severity of photoaging. Concerning n-3 PUFAs, severe photoaging was inversely associated in men with intake of -linolenic acid (ALA) from both vegetable oil and fruits & vegetable. In women, an inverse relationship was found with the intake of eicosapentaenoic acid and a tendency with ALA from vegetable oil. These findings support the recommendations for a diet rich in olive oil and n-3 PUFAs such as the Mediterranean diet.
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Traitement de l'information issue d'un réseau de surveillance de la paralysie cérébrale : qualité et analyse des données / Information processing in a network of cerebral palsy : data quality and analysis

Sellier, Elodie 18 June 2012 (has links)
Le réseau européen de paralysie cérébrale nommé Surveillance of Cerebral Palsy in Europe (SCPE) est né de la volonté de différents registres européens de s’associer afin d’harmoniser leurs données et de créer une base de données commune. Aujourd’hui il compte 24 registres dont 16 actifs. La base contient plus de 14000 cas d’enfants avec paralysie cérébrale (PC) nés entre 1976 et 2002. Elle permet de fournir des estimations précises sur les taux de prévalence de la PC, notamment dans les différents sous-groupes d’enfants (sous groupes d’âge gestationnel ou de poids de naissance, type neurologique de PC). La thèse s’est articulée autour de la base de données commune du réseau SCPE. Dans un premier temps, nous avons réalisé un état des lieux de la qualité des données de la base commune, puis développé de nouveaux outils pour l’amélioration de la qualité des données. Nous avons notamment mis en place un retour d’informations personnalisé aux registres registre suite à chaque soumission de données et écrit un guide d’aide à l’analyse des données. Nous avons également mené deux études de reproductibilité de la classification des enfants. La première étude incluait des médecins visualisant des séquences vidéos d’enfants avec ou sans PC. La deuxième étude incluait différents professionnels travaillant dans les registres qui avaient à leur disposition une description écrite de l’examen clinique des enfants. L’objectif de ces études originales était d’évaluer si face à un même enfant, les différents professionnels le classaient de la même manière pour le diagnostic de PC, le type neurologique et la sévérité de l’atteinte motrice. Les résultats ont montré une reproductibilité excellente pour les pédiatres ayant visualisé les vidéos et bonne pour les professionnels ayant classé les enfants à partir de la description écrite. Dans un second temps, nous avons réalisé des travaux sur l’analyse des données à partir de deux études : l’analyse de la tendance du taux de prévalence de la PC chez les enfants nés avec un poids >2499g entre 1980 et 1998 et l’analyse du taux de prévalence de la PC associée à l’épilepsie chez les enfants nés entre 1976 et 1998. Ces travaux ont porté principalement sur les méthodes d’analyse des tendances dans le temps du taux de prévalence, et sur la prise en compte des interactions tendance-registre. / Several European Cerebral Palsy (CP) registers formed a collaborativenetwork of Cerebral Palsy in order to harmonize their data and to establish acommon database. At the present time, the network gathers 24 CP registers,with 16 being active. The common database includes more than 14000 casesof children with CP, born between 1976 and 2002. Thanks to this largedatabase, the network can provide reliable estimates of prevalence rates ofchildren with CP, especially in the different CP subgroups (according togestational age or birthweight, neurological subtype).Our work was based on the SCPE common database. Firstly, we performeda survey on the data quality of the common database. Then we developednew tools to improve the quality of data. We provide now the registers witha feedback after the submission of their data and we wrote a data useguideline. We also conducted two studies to evaluate the reliability of theclassification of children with CP. The first study included pediatriciansseeing video-sequences of children with or without CP. The second studyincluded different professionals working in registers and who were given thewritten clinical description of the same children. The aim of these originalstudies was to evaluate whether the professionals classified a same child inthe same way concerning the diagnosis of CP, the neurological subtype andthe severity of gross and fine motor function. Results showed that interraterreliability was excellent for pediatricians seeing video-sequences andsubstantial for professionals reading the clinical description.Secondly, we worked on the analysis of data through two studies : theanalysis of the trend in prevalence rate of children with CP with abirthweight >2499g and born between 1980 and 1998 and the analysis of thetrend in prevalence rate of children with CP and epilepsy born between 1976and 1998. This work focused on the methods of trend analysis and on takinginto account the interaction between trend and register.
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Déterminants et perception de la santé orale des patients schizophrènes en Côte d'Or / Determinants and perception in oral health for persons with schizophrenia in Côte d'Or

Denis, Frédéric 20 October 2017 (has links)
Contexte : La schizophrénie est une pathologie qui concerne 1 % de la population mondiale. Les patients schizophrènes (PS) sont exposés à une surmortalité, à une surmorbidité. La mauvaise santé bucco-dentaire est souvent constatée par les soignants et les accompagnants. L’objectif de notre recherche est d’explorer les déterminants, les représentations et les perceptions de la santé orale des PS en Côte d’Or et de construire une échelle de qualité de santé orale spécifique à ces patients.Méthode : Un échantillon représentatif de 109 PS, tirés au sort en Côte d’Or, a permis d’explorer les déterminants sociodémographiques, dentaires, médicaux, liés au style de vie et associés à la santé orale. Une évaluation des caractéristiques psychométriques de l’échelle GOHAI (Global Oral Health Assessement Index) a également été réalisée. Puis, une étude qualitative basée sur 20 entretiens semi-directifs individuels de PS et de 6 soignants. Suivi d’entretiens de deux groupes (4 patients et 4 soignants) a permis d’explorer la perception et les représentations de la santé orale des PS observés et l’élaboration de la stucture hypothétique d’une échelle spécifique de mesure de la qualité de santé orale des PS.Résultats : Parmi les 109 patients inclus, 61.5 % sont des hommes. L'âge moyen est de 46.8 ans ± 12 ans. La majorité (78 %) ont fait des études secondaires (SE) et 79.8 % bénéficiaient d’un suivi ambulatoire. La durée moyenne de la maladie (DMM) était de 17.9 ans ± 9.4 ans, et 55.5 % étaient polymédicamentés. L’indice dentaire CAO (carie, absente, obturée) moyen est de 16.6 ± 8.1. Il y avait une relation significative entre SE, les indices de santé oraux, médicaux, la polymédicamentation, le style de vie et la DMM. Concernant la validation psychométrique de la GOHAI, la cohérence interne était excellente (α de Cronbach de 0.82). Les coefficients de corrélation intraclasse pour la fiabilité test-retest n'étaient pas significativement différents (p> 0.05). La validité de construction soutenue par 3 facteurs représente 60.94 % de la variance observée. La validité prédictive et concurrente a été validée. L’étude qualitative a permis de recueillir 3245 verbatims, candidats pour élaborer la structure hypothétique d’une nouvelle échelle, la SOHP, Schizophrenia Oral Health Profil. Les sélections successives des items issues des critères de décision du groupe d’expert et d’une étude de faisabilité auprès de 30 patients ont abouti à une échelle composée de 43 items et d’un module additionnel de 11 items.Conclusion : Nous avons montré l’intrication des problèmes de santé mentale et physique, de la santé orale et générale et la validité de la GOHAI chez les PS. Ce travail doit être poursuivi pour étudier la validation psychométrique de l’échelle SOHP sur une large population. / Background: Schizophrenia is a disease that affects 1 % of the world population. Persons with schizophrenia (PWS) are exposed to excess morbidity and mortality. Poor oral health among PWS is often observed by caregivers and accompanying persons. The objective of our study was to explore predictive factors, representations and perceptions of oral health among PWS and to construct a specific oral health quality of life scale for PWS.Methods: In a randomly selected, representative sample of 109 PWS in the Côte d’Or Department, we recorded socio-demographic, dental, and medical and lifestyle factors associated with oral health. An evaluation of the psychometric characteristics of the Global Oral Health Assessment Index (GOHAI) scale was also performed, as well as a qualitative study based on semi-directive interviews with 20 PWS and 6 carers. Two focus groups (4 patients and 4 carers) enabled investigation of the perceptions and representations of oral health among PWS and building the first draft prototype of a specific tool to assess oral health quality of life of PWS.Results: Among 109 patients included, 61.5% were male, and average age was 46.8 ± 12.0 years. The majority (78%) had secondary level education and 79.8% received ambulatory care. The mean duration of schizophrenia was 17.9 ± 9.4 years, and 55.5% were taking several medications. The average DMFT (Decayed, Missing, and Filled Teeth) was 16.6 ± 8.1. There was a significant relationship between level of education and oral health, lifestyle, medical conditions, polypharmacy and DMI. Concerning the psychometric validation of the GOHAI, internal consistency was excellent (Cronbach α = 0.82). The intraclass correlation coefficients for test-retest reliability were not significantly different (p> 0.05). Construct validity was supported by three factors which accounted for 60.94% of the variance observed. Predictive and concurrent validity were validated. The qualitative study yielded 3245 candidate verbatims for the development of a new scale, namely the SOHP, Schizophrenia Oral Health Perception Profile. Successive selections of items from the expert panel decision criteria and based on a feasibility study in 30 patients resulted in a scale comprising 43 items and one additional module of 11 items.Conclusion: We show the intricate links existing between mental and physical, oral and general health and the GOHAI validity in PWS. Further research is necessary to validate the psychometric properties of the SOHP scale in a larger population.
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Epidemiology and dynamic of dengue and chikungunya in several provinces in Vietnam / Epidémiologie et dynamique des virus de la dengue et du chikungunya dans plusieurs provinces du Vietnam

Pham Thi, Kim Lien 15 December 2015 (has links)
La dengue et le chikungunya sont des maladies transmises par Aedes aegypti et Aedes albopictus pouvant causer des pathologies sévères et des atteintes incapacitantes chroniques. Ce sont aussi les maladies qui se diffusent le plus rapidement, en partie à cause du changement climatique. Le Vietnam est une zone d’hyperendémicité pour la dengue et à risque pour le chikungunya comme le Cambodge voisin qui est atteint par les deux maladies.et représente une source de diffusion. L’objectif de cette thèse est d’évaluer le statut de ces deux maladies et la présence du chikungunya, d’évaluer l’efficacité du système de surveillance et d’évaluer la diversité des populations de moustiques vecteurs et leurs rôles respectifs dans la transmission. Une première partie de la thèse est dévolue à une revue bibliographique. La seconde partie comprend trois chapitres associés à trois publications. Le premier chapitre est consacré à une étude de la surveillance à l’hôpital général de la province sud de Dong Thap. Une cohorte de 131 patents avec une fièvre aigue a été étudiée pour tester la présence de dengue et de chikungunya. 101 patients sur 131 ont été positifs pour la dengue et les quatre sérotypes ont été détectés avec une prédominance de DENV1 et DENV4. Aucun cas de chikungunya n’a été détecté. Une variation d’efficacité dans la détection sérologique de la dengue a été observée avec un passage de 29% lors de l’admission à 53% sept jours après admission. Il y a donc clairement un risque de sous-estimation de la dengue alors que le chikungunya, n’est pas du tout testé. Des changements dans la procédure de détection et de surveillance sont proposés pour améliorer l’efficacité de la surveillance et surveiller l’émergence du chikungunya. Le deuxième chapitre est consacré à l’étude du rôle respectif d’A. aegypti et A. albopictus dans l’épidémie de Dengue de 2011 à Hanoi. Seuls DENV1 et DENV2 ont été détectés chez les 140 patients étudiés. Une corrélation positive a été observée entre la densité de population d’A. aegypti et le nombre de cas humains et la durée des épidémies. Ceci n’a pas été observé chez A. albopictus. Trois lots d’A. aegypti se sont révélés positifs pour la dengue, deux pour DENV1 et un pour DENV2. Cette étude montre clairement le rôle d’A. aegypti dans l’épidémie de 2011 à Hanoi. Le dernier chapitre est consacré à une analyse transversale sur 5 provinces frontalières du Laos et du Cambodge. 558 sérums collectés chez des patients admis pour fièvre aigue et de symptômes compatibles avec la dengue et chikungunya entre 2012 et 2014 dans des centres de médecine préventive. Les quatre sérotypes ont été détectés mais pas tous dans la même province. Seulement deux sérotypes ont été détectés au maximum dans une même province. Le chikungunya n’a pas été détecté. Un total de 1104 moustiques adultes a été prélevé dans les mêmes zones à l’intérieur et à l’extérieur des habitations. La densité de population de moustiques et les indices entomologiques ont été évalués suite à la capture de larves. Des densités très différentes ont été observées et la densité la plus importante a été obtenue dans la province de Long An, voisine du Cambodge. Le virus de la dengue a été détecté principalement chez A. albopictus. Le virus du chikungunya a également été détecté chez A. albopictus. L’analyse phylogénétique des moustiques collectés a montré une grande diversité génétique avec des génotypes décrits sur d’autres continents. Cette partie de la thèse met en évidence le rôle différentiel d’A. aegypti et A. albopictus, le rôle croissant de ce dernier et le transport anthropique des moustiques sur de grandes distances. Ce travail souligne le besoin de nouvelles approches de surveillance, au niveau clinique et au niveau entomologique, pour s’attaquer de façon efficace au risque épidémique de dengue et de chikungunya. / Dengue and chikungunya are both transmitted by Aedes aegypti and Aedes albopictus and can cause potentially severe and or debilitating chronic disease. They are the fastest spreading diseases, in part because of the climate change. Vietnam is a hyperendemicity country for dengue and is at risk to be like neighboring Cambodia affected both by dengue and chikungunya and be an overlapping area of distribution for both viruses. The aim of this PhD work was therefore to assess the status of single and dual infections all over the country, investigate the presence of chikungunya, assess the efficiency of the surveillance procedures routinely established and assess the diversity of mosquito populations and their potential respective role. A first part of the PhD dissertation is devoted to a bibliographic review. The second part comprises three chapters associated to three different publications. The first chapter is devoted to a surveillance study in the general hospital if the Southern Province of Dong Thap. A cohort of 131 patients with acute fever symptoms was investigated for the presence of dengue and chikungunya. 101 patients out of 131 were confirmed with dengue. All four dengue serotypes were detected with a predominance of DENV2 and DENV4. No chikungunya infection was detected although reported in neighboring Cambodia. A differential efficiency of serological dengue detection was observed. Efficiency was 29% upon admission and 53% after seven days on the same patients. There is thus a clear risk of dengue being underestimated while chikungunya is not systematically detected. Changes in detection and surveillance procedures are therefore proposed to increase the efficiency of dengue detection and continue the monitoring the emergence of CHIKV. The second Chapter is dedicated to the respective role of A. aegypti and A. albopictus in the 2011 outbreak in the Northern capital city of Hanoi. Only DENV-1 and DENV-2 serotypes were detected from the 140 patients hospitalized. A positive correlation was found between the population density of A. aegypti and the number of human cases and duration of outbreaks. This was not observed for A. albopictus. Three pools of A. aegypti were positive with dengue virus, two with DENV-1 and one with DENV-2. This work indicate clearly the role of A. aegypti in the 2011 Hanoi epidemics. The last chapter of the PhD is devoted to a crosscutting country wide survey in five provinces border with Lao PDR and Cambodia. In this work, a total of 558 serum samples were collected from patients admitted in the 2012-2014 period in five provincial preventive medicine centers with acute fever and symptoms compatible to DENV-CHIKV infection. All four dengue serotypes were found altogether but not in the same province. Only two serotypes were found at the maximum in a single province. No CHIKV was detected. A total of 1104 adult mosquitoes were collected inside and outside houses at the same place. Mosquito population density and vector indexes were assessed following capture of larvae. Differing densities of mosquito populations were found with the highest one being in the Long An province border with Cambodia. Dengue viruses were detected mostly in A. albopictus. CHIKV was also detected in A. albopictus mosquitoes. The phylogenetic analysis of the collected mosquitoes showed a large diversity of genotypes, all of them having been described in other parts of the world. This part of the PhD work underline the dual role of A. aegypti and A. albopictus, the increasing role of the latter and the high level of man-related very long distance mobility of mosquitoes. This work underlines the need of novel approaches for surveillance both at the clinical and at the entomological level to efficiently tackle the risk of dengue and chikungunya outbreaks.
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Outdoor air pollutants and cardiovascular diseases in Lebanon

Nasser, Zeina 08 January 2016 (has links)
Outdoor air pollution is increasingly considered as a serious risk factor for cardiovascular diseases (CVD). High levels of airborne particulate matter (PM) constitute the greatest international air pollution threat. The purpose of this thesis is to broaden our knowledge regarding the relationship between outdoor air pollution and cardiovascular diseases in the Middle Eastern countries, specifically in Lebanon. Moreover, we aimed to develop a scale as CVD screening tool among the Lebanese population. To achieve these goals, we conducted three studies. The first was a systematic review of the literature aiming to assess levels and sources of PM across the Middle East area and to search for an evidence of relationship between PM exposure and CVD (Paper I).The second manuscript was a multicenter case-control study investigating the association between outdoor pollutants and cardiovascular diseases among Lebanese adults (Paper II) while the third study was conducted to develop a score that can be used as a screening tool in clinical and epidemiological settings among the Lebanese adults (Paper III).The annual average values of PM pollutants in the Middle East region are considered to be much higher than the WHO 2006 tolerated levels (PM2.5 = 10 µg/m3, PM10 = 20 µg/m3). We uncovered evidence of an association between PM and CVD in 4 Middle East countries: Iran, Kingdom of Saudi Arabia, Qatar and the United Arab Emirates. Ambient PM pollution is considered a potential risk factor for platelet activation and atherosclerosis. Moreover, it was associated with CVD and found to be linked with an increased risk for mortality and hospital admissions (Paper I). Increased risk of CVD with an odds ratio OR of 5.04, 95% CI (4.44-12.85) for living near busy highway and 4.76, 95% CI (2.07-10.91) for living close to local diesel generator was noticed among population exposed to outdoor air pollution (Paper II). In addition, our results highlight the importance of scale generation, which includes air pollution as predictive factor, as screening tool for patients at risk of CVD. This scale can foresee the cardiovascular disease outcomes better than the established score which use the traditional CVD risk factors (Paper III).In conclusion this study brings new evidence regarding the effects of particulate matter on cardiac diseases, points out the harmful role of diesel exhaust on health and suggest a an important role of traffic exhaust particles in exacerbating heart diseases in the Middle East Region. The developed scale could detect persons at high risk for CVD in the clinical and epidemiological settings. In addition, it serves as an essential public health screening tool for the primary prevention of CVD. / Doctorat en Santé Publique / info:eu-repo/semantics/nonPublished
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Outdoor air pollutants and cardiovascular diseases in Lebanon

Nasser, Zeina 08 January 2016 (has links)
Outdoor air pollution is increasingly considered as a serious risk factor for cardiovascular diseases (CVD). High levels of airborne particulate matter (PM) constitute the greatest international air pollution threat. The purpose of this thesis is to broaden our knowledge regarding the relationship between outdoor air pollution and cardiovascular diseases in the Middle Eastern countries, specifically in Lebanon. Moreover, we aimed to develop a scale as CVD screening tool among the Lebanese population. To achieve these goals, we conducted three studies. The first was a systematic review of the literature aiming to assess levels and sources of PM across the Middle East area and to search for an evidence of relationship between PM exposure and CVD (Paper I).The second manuscript was a multicenter case-control study investigating the association between outdoor pollutants and cardiovascular diseases among Lebanese adults (Paper II) while the third study was conducted to develop a score that can be used as a screening tool in clinical and epidemiological settings among the Lebanese adults (Paper III).The annual average values of PM pollutants in the Middle East region are considered to be much higher than the WHO 2006 tolerated levels (PM2.5 = 10 µg/m3, PM10 = 20 µg/m3). We uncovered evidence of an association between PM and CVD in 4 Middle East countries: Iran, Kingdom of Saudi Arabia, Qatar and the United Arab Emirates. Ambient PM pollution is considered a potential risk factor for platelet activation and atherosclerosis. Moreover, it was associated with CVD and found to be linked with an increased risk for mortality and hospital admissions (Paper I). Increased risk of CVD with an odds ratio OR of 5.04, 95% CI (4.44-12.85) for living near busy highway and 4.76, 95% CI (2.07-10.91) for living close to local diesel generator was noticed among population exposed to outdoor air pollution (Paper II). In addition, our results highlight the importance of scale generation, which includes air pollution as predictive factor, as screening tool for patients at risk of CVD. This scale can foresee the cardiovascular disease outcomes better than the established score which use the traditional CVD risk factors (Paper III).In conclusion this study brings new evidence regarding the effects of particulate matter on cardiac diseases, points out the harmful role of diesel exhaust on health and suggest a an important role of traffic exhaust particles in exacerbating heart diseases in the Middle East Region. The developed scale could detect persons at high risk for CVD in the clinical and epidemiological settings. In addition, it serves as an essential public health screening tool for the primary prevention of CVD. / Doctorat en Santé Publique / info:eu-repo/semantics/nonPublished
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La situation de l'allaitement maternel en Wallonie et à Bruxelles au travers d'enquêtes de couverture vaccinale

Robert, Emmanuelle 07 September 2016 (has links)
Face au peu de données représentatives de l’allaitement maternel exclusif (AME) en Wallonie et à Bruxelles, au manque de données concernant les durées d’allaitement maternel (AM), face à la difficulté de recouper les données d’AM avec les caractéristiques sociodémographiques des parents, face à l’inexistence de données considérant la volonté de durée d’AM de la mère, etc. un module spécifique sur l’AM a été introduit dans les enquêtes de couverture vaccinales (ECV) ayant eu lieu en Wallonie et à Bruxelles. Plus de 520 familles d’enfant de 18 à 24 mois ont répondu en 2012 et en 2015 à une vingtaine de questions sur l’AM. Les taux wallons restent parmi les plus bas des régions à hauts revenus, alors que ceux de Bruxelles sont parmi les plus élevés. En Wallonie, 82% des mères ont initié l’allaitement dont 73% de façon exclusive. Ces chiffres étaient respectivement de 93% et 83% à Bruxelles. En Wallonie, une diminution significative était observée entre les taux d’AM à la naissance et à la sortie de la maternité, ce qui n’était pas le cas à Bruxelles. Seuls 13% des enfants en Wallonie et 26% à Bruxelles ont été allaités exclusivement pendant une période de 6 mois, durée recommandée par l’OMS. Hormis les facteurs « classiques » associés à l’AM retrouvés dans les différentes enquêtes (niveau d’études, origine étrangère, âge supérieur de la mère, primiparité, enfant né par voie basse, à terme, ), avoir un conjoint soutenant, connaître les durées idéales de l’AM, ne pas avoir rencontré de difficulté lors de la mise en place de l’allaitement les premières semaines, ne pas travailler ou avoir pris un congé parental étaient des facteurs favorisant la durée de l’allaitement maternel exclusif. Près de 60% des mères dans les deux régions étaient insatisfaites de la durée de l’AM réalisée. Une mère sur deux a présenté des difficultés lors de la mise en place de l’allaitement les premières semaines. Près de 45% des mères ignoraient avant de les vivre que de telles difficultés étaient inhérentes à l’AM. Les premiers mois, la perception de manque de lait était responsable d’un pourcentage important de sevrage, il en était de même pour les difficultés tels qu’engorgement, crevasse, mastite, mauvaise prise du sein par le nourrisson. Plus de 20% des mères ont déclaré avoir obtenu des informations contradictoires sur l’AM (positions, durées entre 2 tétées, ) à la maternité. En plus de dresser la situation épidémiologique de l’AM en lui donnant une perspective historique (mise en nourrice, féminisme, textes internationaux, …) le travail a permis d’émettre des recommandations sur la qualité des méthodes de recherche sur le sujet (définitions à utiliser, formulation des questions, …) et permis de savoir quels sont les indicateurs d’allaitement qui peuvent ou non continuer à être utiliser en routine en Fédération Wallonie-Bruxelles. / Doctorat en Santé Publique / info:eu-repo/semantics/nonPublished

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