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Identificação de gêneros arbóreos de Fabaceae, Lauraceae e Myrtaceae do Estado de São Paulo utilizando o marcador molecular rbcL / Identification of Fabaceae, Lauraceae and Myrtaceae São Paulo State\'s tree genera using the molecular marker rbcL

Barroso, Renata Moreira 28 July 2017 (has links)
O Brasil, como país detentor da maior biodiversidade mundial de plantas, possui um importante papel no desenvolvimento de pesquisas que auxiliem ou viabilizem a identificação de sua diversidade vegetal, como o estudo de marcadores moleculares adequados a esta tarefa. Fabaceae, Lauraceae e Myrtaceae são as famílias mais importantes da Flora Brasileira por apresentarem grande diversidade de gêneros e espécies e serem consideradas de difícil identificação pela taxonomia tradicional. Tendo em vista o potencial do rbcL na identificação molecular de plantas, este trabalho propôs estudar a eficiência deste marcador em identificar gêneros e espécies das três principais famílias de árvores da Flora do Estado de São Paulo. Foi criado um banco de sequências de rbcL contendo 160 espécies, o qual foi testado quanto sua eficiência de identificação através de um teste cego contendo as sequências inteiras (maior que 400 pares de base) e as sequências de tamanho reduzido em 300, 200 e 100 pb. O teste cego também foi realizado no banco de sequências mundial Boldsystems. Para a análise dos resultados foi utilizado o programa BLAST que busca similaridades entre as sequências. Os resultados evidenciaram a viabilidade do método ao mostrar que o rbcL identificou 100% dos gêneros arbóreos de Fabaceae e Myrtaceae, porém não podemos dizer o mesmo para identificar gêneros de Lauraceae e nem em nível específico para qualquer uma das famílias, já o teste de identificação com as sequências reduzidas mostrou que a sequência de rbcL da espécie a ser analisada deve conter mais que 400 pares de base para não comprometer a correta identificação de gênero. / Brazil, as the country with the greatest biodiversity in the world, has an important role in the development of research to help or enables the identification of its plant diversity, such as the study of suitable molecular markers for this task. Fabaceae, Lauraceae and Myrtaceae are the most important families of the Brazilian Flora because they present a large diversity of genera and species and are considered difficult to identify by the traditional taxonomy. Considering the potential of rbcL in the molecular identification of plants, this work aims to study the efficiency of this marker in identifying genera and species of the three main tree families of São Paulo State\'s Flora. A rbcL sequence Bank containing 160 tree species was created in order to test its efficiency through a blind test with whole and reduced sequences using the BLAST program that searches for similarities between sequences. The blind identification test was also performed using the Boldsystems database. The results showed that the rbcL can´t be indicated to identify Lauraceae tree genera, but can be indicated to successfully identify tree genera of Fabaceae and Myrtaceae. The test identification with reduced sequences showed that the analized specie must have at least 400pb to not compromise the correct genera identification.
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Atividade antioxidante e hepatoprotetora de plantas brasileiras, contendo compostos fenólicos.

Sabir, Syed Mubashar 07 June 2010 (has links)
Plants from Brazilian flora were chosen and studied for their in vitro and in vivo antioxidant and in vivo hepatoprotetive activity, especially in relation to phenolic compounds which have several health benefits. These plants include Phyllanthus niruri, Solanum fastigiatum, Solidago microglossa and Baccharis trimera. The aqueous extracts of leaves showed inhibition against thiobarbituric acid reactive species (TBARS), induced by different pro-oxidants (10 μM FeSO4 and 5 μM sodium nitroprusside) in rat liver and brain homogenates. The extracts also lowered the formation of TBARS in phospholipid extracted from egg yolk. On the lipid peroxidation assay the order of antioxidant activity was Solidago microglossa>Phyllanthus niruri> Solanum fastigiatum> Baccharis trimera. The free radical scavenging activities of the extract were determined by the quenching of a stable 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl (DPPH) radical. The IC50 value of Solidago microglossa (3.8± 0.1 μg/ml), Phyllanthus niruri (43.4 ± 1.45 μg/ml), Solanum fastigiatum (68.96±1.25 μg/ml) and Baccharis trimera (415.2±15.2 μg/ml) indicates that the order of antioxidant activity is Solidago microglossa > Phyllantus niruri > Solanum fastigiatum > Baccharis trimera. The hepatoprotective activity of the extracts were also demonstrated in vivo against paracetamol-induced liver damage, as evidenced by the decrease in serum glutamate oxaloacetate transaminase (GOT), and glutamate pyruvate transaminase (GPT), and decreased catalase activity in the liver in treatment groups, compared to the control. The aqueous extract also showed significant (p<0.05) hepatoprotective activity that was evident by enzymatic examination and brought back the altered levels of TBARS, non-protein thiol and ascorbic acid to near the normal levels in a dose dependent manner. Acute toxicity studies of Solanum fastigiatum revealed that the LD50 value of the extract is more than the dose 4 g/kg body weight of mice whereas, the genotoxicity of Solidago microglossa was tested using comet assay. The results obtained on the comet assay revealed that under the experiment used the extract was not genotoxic to human lymphocytes at a relatively high concentration of 0.5 mg/ml. The content of phenolics was determined using Folin Ciocalteu,s assay. The phenolic content was found to be the highest in Solidago microglossa and the lowest in Baccharis trimera. Phytochemical analysis of these plants was carried out on the basis of TLC/HPLC. The TLC analysis showed the presence of rutin in aqueous extract of Phyllanthus niruri, while, Solanum fastigiatum showed the presence of rutin and quercetin. The Phenolic profile of Solidago microglossa and Baccharis trimera was determined by using High performance liquid chromatography. On the basis of the HPLC data, quercetin (254.88±5.1 μg/ml), rutin (342.2±7.1 μg/ml) and gallic acid (2320.8±13.2 μg/ml) have been identified and quantified in the ethanolic extract of Solidago microglossa. Whereas, HPLC analysis revealed the presence of gallic acid (76.8±7.2 μg/ml) as a major compound while, rutin (20.1±2.5 μg/ml) and quercetin (10.1±1.4 μg/ml) relatively showed minor contribution in the aqueous extract of Baccharis trimera. In conclusion, the crude extract of these plants showed high antioxidant and free radical scavenging activities which are related to the presence of phenolic compounds. These results may have implications in the use of the extracts as a therapeutic agent in the prevention of oxidative stress related diseases. / Plantas da flora Brasileira foram escolhidas e estudadas por sua atividade antioxidante tanto in vivo como in vitro e também por sua atividade hepatoprotetora in vivo, especialmente relacionadas a compostos fenólicos que possuem inúmeros benefícios para a saúde. Essas plantas incluem Phyllanthus niruri, Solanum fastigiatum, Solidago microglossa e Baccharis trimera. O extrato aquoso destas folhas mostraram inibição contra a produção de espécies reativas ao ácido tiobarbitúrico (TBARS), induzidas por diferentes prooxidantes (10 μM FeSO4 e 5 μM de nitruprussiato de sódio) em homogeneizado de fígado e cérebro de ratos.Esses extratos também diminuiram a formação de TBARS em fosfolipídios extraídos de gema de ovo. No ensaio para peroxidação lipídica a ordem de atividade antioxidante foi Solidago microglossa> Phyllanthus niruri > Solanum fastigiatum > Baccharis trimera. A atividade detoxificante de radicais livres dos extratos foi determinada pela quelação do radical 2,2-difenil-1-picrilhydrazil (DDPH). Os valores de IC50 para Solidago microglossa (3.8 ± 0.1 μg/ml), Phyllanthus niruri (43.4 ± 1.45 μg/ml), Solanum fastigiatum (68.96 ± 1.25 μg/ml) e Baccharis trimera (415.2 ± 15.2 μg/ml) indicam que a ordem de atividade antioxidante é Solidago microglossa> Phyllanthus niruri > Solanum fastigiatum > Baccharis trimera. Também foi demonstrada a atividade hepatoprotetora dos extratos contra o dano hepático induzido por paracetamol in vivo, evidenciado pela diminuição nos níveis séricos da glutamato oxaloacetato transaminase (GOT) e glutamato piruvato transaminase (GPT), decréscimo na atividade da catalase no fígado do grupo tratado em comparação com o controle. O extrato aquoso mostrou também significativa (p<0,05) atividade hepatoprotetora a qual foi evidenciada por verificação de atividade enzimática e restauração dos níveis de TBARS, além disso, restauração a valores normais de forma dose dependente dos níveis de tiol não-proteico e dos níveis de ácido ascórbico. Estudos sobre a toxicidade aguda da Solanum fastigiatum revelaram que o valor da LD50 para o extrato são maiores que 4 g/Kg de peso corporal de camundongos enquanto que a genotoxicidade da Solidago microglossa foi avaliada usando o teste do cometa. Os resultados obtidos no teste do cometa revelaram que nesta condição experimental o extrato não foi genotóxico para linfócitos humanos sob concentrações relativamente altas de 0.5 mg/ml. O conteúdo fenólico foi determinado usando o teste Folin Ciocalteu. A Solidago microglossa apresentou o maio teor fenólico enquanto que a Baccharis trimera apresentou a menor quantidade. Análises fitoquímicas dessas plantas foram realizadas através de TLC/HPLC. As análises TLC revelaram a presença de rutina no extrato aquoso de Phyllanthus niruri, enquanto que na Solanum fastigiatum foi observado à presença de rutina e quercetina. O perfil fenólico da Solidago microglossa e da Baccharis trimera foi determinado por cromatografia líquida de alto desempenho. Baseado nos dados do HPLC foi identificado: quercetina (254.88 ± 5.1 μg/ml), rutina (342.2 ± 7.1 μg/ml) e ácido gálico (2320.8 ± 13.2 μg/ml) no extrato etanólico da Solidago microglossa. Além disso, analises no HPLC revelaram a presença de ácido gálico (76.8 ± 7.2 μg/ml) como o principal constituinte, enquanto que a rutina (20.1 ± 2.5 μg/ml) e quercetina (10.1 ± 1.4 μg/ml) apresentaram uma menor contribuição no extrato aquoso de Baccharis trimera . Concluindo, o extrato cru dessas plantas apresentou alta atividade antioxidante e detoxificadora de radicais livres as quais estão relacionadas à presença de compostos fenólicos. Esses resultados implicam no uso dos extratos como agentes terapêuticos na prevenção de doenças relacionadas ao estresse oxidativo.
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Composição florística de um ambiente rochoso da Área de Proteção Ambiental (APA) do Cariri, Paraíba: diversidade, riqueza e fitogeografia / Floristic study of a rochy outcrop at the environment protected area (apa) in the region of Cariri, State of Paraíba: richness, similarity and phytogeography

Machado Filho, Hermes de Oliveira 09 December 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2015-09-25T12:18:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Hermes de Oliveira Machado Filho 1.pdf: 2104504 bytes, checksum: dfcc01815062ed00299a1488661319cf (MD5) Previous issue date: 2011-12-09 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A rocky environments is a geomorphological shape which holds richness and specific endemism, even more, taking as reference semiarid conditions. Based on this perspective, this work aims to present the study of the floristic composition, emphasizing diversity, richness, and biogeographic patterns on a rocky outcrop, in the Environment Protection Area (APA), in the region of Cariri , located between the municipalities of Boa Vista and Cabaceiras, state of Paraiba (Northeast from Brazil). Field works have been done aiming the collecting of botanic material and observations in loco , over all the area extension, in the period between March 2010 and October 2010. Based on APG (Angiosperm Phylogeny Group) III, the checklist was elaborated to the studied area. Moreover, it was made a binary matrix of presence/absence of the registered species, in order to detect the similarity of the flora together to other areas, focusing mainly floras installed in the Brazilian semiarid zone. It was also made another binary matrix to verify the geographic distribution patterns of its species and established relations of this flora together to other South American biogeographical provinces. The analyses of geographic distribution have been supported in searches to specialized bibliography and data basis of neotropical species as: taxonomic papers, local floras, W3 Tropicos (Missouri Botanical Garden) and the species list on line of the Brazilian flora. In the studied area, 127 species were registered, distributed in 53 flowering plant families. Fabaceae was the most representative, with 14 species, result in agreement with the vast majority of the floristic studies taken in the Brazilian semiarid zones. Other families highlighted in number of species were: Convolvulaceae, Malvaceae and Euphorbiaceae, with nine species each; Asteraceae, with seven; Cactaceae, with six; Bromeliaceae, with five and Rubiaceae, with six species. The herbaceous and subshrub components were predominant over the others in the local flora. The similarity analyzes showed that the flora on rocky environments trends to form specific blocks, when compared to other formations. The species presented basically three patterns of geographic distribution: ample-continuous or tropical (CA), with 44% of total species; restrictcontinuous or pre-Andine sub-tropical (CR), with 34% and restrict (R), corresponding to the Caatinga/Savannah , with 22%. The analyzes of the flora similarity in the South American region has shown the close relation between floras in Caatinga and Savannah pattern, with level of meaning = 98,2 (Jaccard index). This result points to the existence, nowadays, of a floristic corridor among these vegetation types, this aspect probably features the Arc-Pleistocenic relict, when the Caatinga became a forest reduct and turning a floristic connection possible with the most diverse vegetation types, mainly with those which make the xeric corridor in South America. The obtained data through this study point to the existence of a diversified flora, showing biogeographic patterns closely related to the species distribution, several of them being endemic to Caatinga vegetation, as Allamanda blanchetti DC. (Apocynaceae). For all those reasons, the area dealt here, comes out as a center of great importance for local fauna and flora maintenance, as well as for the micro-region in the Cariri, Paraiba state, where it is located. / Os ambientes rochosos são feições geomorfológicas que abrigam riqueza e endemismo específico, ainda mais, tomando-se como referência condições de semi-aridez. Nesta perspectiva, o presente trabalho visa apresentar o estudo da composição florística, com ênfase à diversidade, riqueza e padrões biogeográficos em afloramentos rochosos na Área de Proteção Ambiental (APA) do Cariri, localizado entre os municípios de Boa Vista e Cabaceiras, Estado da Paraíba (Nordeste do Brasil). Foram realizados trabalhos de campo visando à coleta de material botânico e observações in loco&#8223; em toda a extensão da área no período entre Março/2010 e Outubro/2011. Baseando-se no APG (Angiosperm Phylogeny Group) III elaborou-se a lista florística da área estudada. Posteriormente, confeccionou-se uma matriz binária de presença/ausência das espécies registradas a fim de detectar a similaridade da flora com a de outras áreas, enfocando principalmente floras instaladas no domínio semiárido brasileiro. Também foi confeccionada uma matriz binária de presença/ausência desta vez englobando as províncias biogeográficas sul-americanas para verificar a distribuição geográfica dos táxons e estabelecer as relações da flora ora abordada com as demais províncias da América do Sul. As análises de distribuição geográfica foram apoiadas em consultas a bibliografia especializada e em bases de dados de espécies neotropicais, como: artigos de cunho taxonômico, floras locais, W 3 Tropicos (Missouri Botanical Garden) e na lista de espècies On line da flora do Brasil. Na área de estudo foram registradas 129 espécies distribuídas em 53 famílias de Angiospermas. Fabaceae foi a família mais representativa, com 14 espécies; corroborando com os resultados apontados na grande maioria dos estudos florísticos conduzidos em áreas do semiárido brasileiro. Outras famílias que se destacaram em número de espécies foram: Convolvulaceae, Malvaceae e Euphorbiaceae, com nove espécies cada; Asteraceae, com sete; Cactaceae, com seis; Bromeliaceae e Poaceae, com cinco e Rubiaceae, com quatro espécies. O componente herbáceo e o arbustivo foram predominantes sobre os demais componentes da flora local. A análise de similaridade evidenciou que, a flora de ambientes rochosos tende a formar blocos específicos quando comparados a outros tipos de formações. As espécies apresentaram basicamente três padrões de distribuição geográfica: contínuoamplo ou tropical (CA), com 44% do total de espécies; contínuo-restrito ou subtropical pré-andino (CR), com 34% e, restrito (R), correspondendo ao padrão Caatinga/Cerrado, com 22%. A análise de similaridade da flora da área no cenário sul-americano evidenciou a estreita relação entre as floras das Províncias da Caatinga e do Cerrado, com nível de significância = 98,2 (índice de Jaccard). Esse resultado aponta a existência, na atualidade, de um corredor florístico entre essas formações, aspecto este que provavelmente caracteriza o relicto ArcoPleistocênico; quando a Caatinga tornou-se um reduto florestal e possibilitou uma conexão florística com as mais diversas formações vegetacionais, principalmente com as que compõem o corredor xérico, da América do Sul. Os dados obtidos através da realização desse estudo apontam a existência de uma diversificada flora exibindo padrões biogeográficos intrinsecamente relacionados à distribuição das espécies, várias delas endêmicas da Caatinga, como Allamanda blanchetti DC. (Apocynaceae). Por estas razões, a área aqui abordada configura-se como um centro de fundamental importância para a manutenção da flora e fauna local, bem como para a microrregião do Cariri Paraibano, onde a mesma encontra-se inserida.
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Identificação de gêneros arbóreos de Fabaceae, Lauraceae e Myrtaceae do Estado de São Paulo utilizando o marcador molecular rbcL / Identification of Fabaceae, Lauraceae and Myrtaceae São Paulo State\'s tree genera using the molecular marker rbcL

Renata Moreira Barroso 28 July 2017 (has links)
O Brasil, como país detentor da maior biodiversidade mundial de plantas, possui um importante papel no desenvolvimento de pesquisas que auxiliem ou viabilizem a identificação de sua diversidade vegetal, como o estudo de marcadores moleculares adequados a esta tarefa. Fabaceae, Lauraceae e Myrtaceae são as famílias mais importantes da Flora Brasileira por apresentarem grande diversidade de gêneros e espécies e serem consideradas de difícil identificação pela taxonomia tradicional. Tendo em vista o potencial do rbcL na identificação molecular de plantas, este trabalho propôs estudar a eficiência deste marcador em identificar gêneros e espécies das três principais famílias de árvores da Flora do Estado de São Paulo. Foi criado um banco de sequências de rbcL contendo 160 espécies, o qual foi testado quanto sua eficiência de identificação através de um teste cego contendo as sequências inteiras (maior que 400 pares de base) e as sequências de tamanho reduzido em 300, 200 e 100 pb. O teste cego também foi realizado no banco de sequências mundial Boldsystems. Para a análise dos resultados foi utilizado o programa BLAST que busca similaridades entre as sequências. Os resultados evidenciaram a viabilidade do método ao mostrar que o rbcL identificou 100% dos gêneros arbóreos de Fabaceae e Myrtaceae, porém não podemos dizer o mesmo para identificar gêneros de Lauraceae e nem em nível específico para qualquer uma das famílias, já o teste de identificação com as sequências reduzidas mostrou que a sequência de rbcL da espécie a ser analisada deve conter mais que 400 pares de base para não comprometer a correta identificação de gênero. / Brazil, as the country with the greatest biodiversity in the world, has an important role in the development of research to help or enables the identification of its plant diversity, such as the study of suitable molecular markers for this task. Fabaceae, Lauraceae and Myrtaceae are the most important families of the Brazilian Flora because they present a large diversity of genera and species and are considered difficult to identify by the traditional taxonomy. Considering the potential of rbcL in the molecular identification of plants, this work aims to study the efficiency of this marker in identifying genera and species of the three main tree families of São Paulo State\'s Flora. A rbcL sequence Bank containing 160 tree species was created in order to test its efficiency through a blind test with whole and reduced sequences using the BLAST program that searches for similarities between sequences. The blind identification test was also performed using the Boldsystems database. The results showed that the rbcL can´t be indicated to identify Lauraceae tree genera, but can be indicated to successfully identify tree genera of Fabaceae and Myrtaceae. The test identification with reduced sequences showed that the analized specie must have at least 400pb to not compromise the correct genera identification.

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