Made available in DSpace on 2014-07-29T16:24:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ANGEL jose.pdf: 1885350 bytes, checksum: 8203e3220392d36d98c1cc30c0439590 (MD5) Previous issue date: 2005-08-30 / The araticunzeiro (Annona crassiflora Mart.) is a tropical fruit tree species from the Cerrado (Brazilian Savannah) with high economic potential. The strong degradation of the Cerrado, allied to the predatory extractivism that threatens the species, points out to the necessity of development of research to support future conservation programs. With the aim to furnish information about the genetic status of this species and to guide future conservation strategies, 82 individuals from 11 natural populations were submitted to genetic analysis. The coalescent based analysis of the polymorphism present in the trn-L cpDNA allowed the detection of high levels of genetic diversity in the species. In spite of the high level of genetic similarity among different populations the results produced suggested that, , there is an incipient, but statistically significant, increasing differentiation process taking place due to current status of geographical isolation and genetic drift. The genetic differentiation coefficient estimated was equal to 7.3%. The spatial genetic divergence analyses suggested that the genetic distances are not associated to geographical distances between populations, evidencing the absence of current gene flow between adjacent populations. The coalescent based approach allowed the identification of different evolutionary scenes to the investigated populations. Among sampled populations cases from well conserved status to dangerous low levels of genetic diversity were detected. Results obtained by the use of coalescent models to infer the divergence time between populations suggested that natural populations of A. crassiflora were, until recently, part of a great regional continuum. These findings suggest that the low levels of genetic diversity among different populations must be due to the small time since isolation. / O araticunzeiro (Annona crassiflora Mart.) é uma espécie de árvore frutífera nativa do bioma Cerrado com elevado potencial de utilização econômica. A forte degradação desse bioma, aliada ao extrativismo predatório a que a espécie vem sendo submetida, justifica a necessidade de desenvolvimento de pesquisas que subsidiem a sua conservação. Objetivando obter informações que indiquem o status genético dessa espécie e orientem futuras estratégias de conservação, 82 indivíduos provenientes de 11 populações naturais foram analisados geneticamente. A análise do polimorfismo presente em seqüências da região trn-L do genoma cloroplastidial e posterior aplicação dos modelos associados à teoria da coalescência permitiram a detecção de elevados níveis de diversidade genética para a espécie. Os resultados obtidos indicam que, embora as populações amostradas tenham demonstrando elevada similaridade genética entre si, há uma incipiente, mas significativa, diferenciação genética entre elas, que tende a aumentar progressivamente devido ao efeito do isolamento geográfico e à força da deriva. O coeficiente de diferenciação genética entre as populações analisadas foi de 7,3%. A análise de divergência entre as populações amostradas não evidenciou a existência de associação significativa dos padrões de diferenciação genética com a distância geográfica entre elas. As informações obtidas pela análise baseada no modelo de coalescência permitiram a identificação de diferentes cenários evolutivos para as populações estudadas. Dentre as populações amostradas, foram identificadas desde populações em bom estado de conservação até populações com baixíssimos níveis de diversidade genética. Os resultados obtidos pela utilização do modelo coalescente para se inferir o tempo de divergência entre as populações sugeriram que as populações se A. crassiflora até há muito pouco tempo se constituíam em um grande contínuo populacional, sendo a baixa diversidade encontrada entre as populações atribuída ao pequeno tempo de divergência entre elas.

Esta pesquisa aborda o episódio histórico do grupo que institucionalizou a genética de populações com drosófilas no Brasil, a partir de 1943. Este grupo fez parte do Departamento de Biologia Geral da antiga Faculdade de Filosofia Ciências e Letras da Universidade de São Paulo (FFCL/USP), e teve como expoentes André Dreyfus (1897-1952) e Theodosius Dobzhansky (1900-1975). O objetivo desta pesquisa é analisar este episódio mediante o cotejamento de uma síntese, fruto de estudos anteriores realizados por este autor (SIÃO, 2007; SIÃO 2008), com cinco entrevistas realizadas com docentes do atual Departamento de Genética e Biologia Evolutiva do Instituto de Biociências da USP, que tiveram contato direto ou indireto com os pesquisadores que atuaram no referido grupo, entre as décadas de 1940 e 1950. A opção metodológica adotada para as entrevistas foi a da História Oral conforme proposto por Meihy e Holanda (2010). Segundo essa abordagem, as entrevistas passam por um tratamento composto de três fases, a saber, transcrição, textualização e transcriação. Em seguida, é realizada a devolutiva social, que é a devolutiva da transcriação ao colaborador entrevistado para validá-la mediante carta de cessão e autorização de o que vem a constituir a apresentação pública do material e serve de subsídio para a elaboração da narrativa histórica da pesquisa. As entrevistas tiveram como objetivos analisar os seguintes aspectos: o percurso histórico dos docentes entrevistados no Departamento de Genética e Biologia Evolutiva; a percepção dos docentes entrevistados sobre o episódio da parceria entre Dobzhansky e Dreyfus para o desenvolvimento da genética no Instituto de Biociências da USP e no Brasil, nas décadas de 1940 e 1950; as contribuições específicas que o grupo teria realizado naquele período; o papel do ensino de genética de populações a alunos do ensino médio da educação básica; e, por fim, o papel da História da Ciência no Brasil na educação científica. Na análise das entrevistas pode-se constatar que os colaboradores, incluindo os que não tiveram contato direto com os pesquisadores da época, mostraram conhecimento do histórico do Departamento, apresentando detalhes que correspondem aos dados das fontes escritas. Ressaltaram a relevância da parceria entre Dreyfus e Dobzhansky à institucionalização da genética animal no Brasil, bem como, apresentaram outros temas de pesquisa desenvolvida à época que consideram terem sido importantes na consolidação do grupo. Entre as pesquisas, mencionaram os estudos de polimorfismo e preferência nutricional desenvolvidos por Antonio Brito da Cunha (1925-), os estudos com a Rhynchosciara realizados por Crodowaldo Pavan (1919-2009) e Martha Erps Breur (1902-1977), o envolvimento de alguns membros com a genética humana, como foi o caso de Oswaldo Frota-Pessoa (1917- 2010), Newton Freire-Maia (1918 -2003) e Francisco Mauro Salzano (1928-). Sobre o ensino, apontaram algumas dificuldades em trabalhar, por exemplo, o tema de genética de populações com alunos da Educação Básica. Todos os colaboradores disseram que a história da ciência tem papel relevante no ensino de ciências. Além dos resultados específicos, a pesquisa propiciou um recurso documental em história oral, as entrevistas, para ser utilizado por professores e pesquisadores como fonte às pesquisas em história da ciência no Brasil. / This research addresses the historical episode of the group which institutionalized the population genetics with Drosophila in Brazil, from 1943. This group was part of the Department of General Biology of the old Philosophy, Sciences and Letters Faculty of the University of São Paulo (FFCL/USP), and had as exponents André Dreyfus (1897-1952) and Theodosius Dobzhansky (1900-1975). The objective of this research is to analyze this episode through the comparison of a synthesis, fruit of earlier studies accomplished by this author (SIÃO, 2007; SIÃO, 2008), and five interviews with professors of the current Department of Genetics and Evolutionary Biology of Biosciences Institute of USP, who had direct or indirect contact with those researchers who worked in the mentioned group between the decades of 1940s and 1950s. The methodology adopted for the interviews was the Oral History as proposed by Meihy and Holanda (2010). According to this approach, the interviews undergo a treatment which consists of three phases, namely, transcription, textualization and transcreation. Subsequently, the social feedback is done, which is the devolution of the transcreation to the interviewee for him to validate it by letter of cession and also an authorization of what can come to be the public presentation of the material, and serve as the preparation of the historical narrative of this research. The interviews had as objectives to analyze the following aspects: the historical background of the professors interviewed in the Department of Genetics and Evolutionary Biology; the professor\"s perception of the partnership between Dobzhansky and Dreyfus episode for the development of the genetics at Biosciences Institute of USP and in Brazil, in the decades of 1940s and 1950s; the specific contributions that the group should have made in that period; the role of the population genetics teaching to high school students of basic education; and, finally, the role of the History of Science in Brazil in scientific education. In the analysis of the interviews, it\"s evident that the contributors, including those who had no direct contact with the researchers of that time, showed knowledge of the history of the Department, presenting details that match the data of the written sources. The importance of the partnership between Dreyfus and Dobzhansky to the institutionalization of the animal genetics in Brazil was pointed out, as well as other research topics developed at that time, which were considered relevant to the consolidation of the group. Among the researches, some were mentioned: the studies with polymorphism and the nutritional preference developed by Antonio Brito da Cunha (1925-), the studies with Rhynchosciara conducted by Crodowaldo Pavan (1919-2009) and Martha Erps Breur (1902-1977), the engagement of some members with human genetics, such as the case of Oswaldo Frota-Pessoa (1917-2010), Newton Freire-Maia (1918 -2003) and Francisco Mauro Salzano (1928-). Concerning teaching, some difficulties in working were pointed out, for example, the issue of population genetics with basic education students. All contributors have said that the history of science has an important role in science teaching. Besides the specific results, the survey has provided a document resource on oral history, the interviews, to be used by teachers and researchers as a source to the research in the history of science in Brazil.

Introdução - A malária é uma das principais doenças humanas do mundo e afeta principalmente as populações pobres em regiões tropicais e subtropicais onde as condições ambientais são favoráveis tanto para a proliferação dos agentes etiológicos como dos mosquitos vetores. No Brasil, An. darlingi é considerado vetor primário de plasmódios humanos. Devido à importância médica, esse inseto tem sido objeto de campanhas de controle populacional. No entanto, não foi considerada a ocorrência de microevolução em An. darlingi e consequentemente, a possibilidade de populações diferentes apresentarem características biológicas distintas. Objetivo Verificar a presença de variabilidade genética e morfológica em populações de An. darlingi no Brasil. Metodologia - Foram analisados e comparados 26 atributos da morfologia externa de ovos de nove populações, bem como a morfometria geométrica da forma alar de espécimes de 10 localidades diferentes de Anopheles darlingi. Além disso, foram empregadas sequências do gene mitocondrial citocromo oxidase subunidade I (COI) para analisar a estrutura populacional de An. darlingi. Resultados e Conclusão Apesar dos atributos dos ovos apresentarem variação, somente as amostras de Tocantins e Pará foram diferenciadas das demais populações. As variações nas estruturas externas dos ovos são provavelmente adaptativas, com influência de fatores ambientais, como temperatura, umidade e disponibilidade de alimento para as fêmeas. A comparação da morfometria geométrica da asa demonstrou que existe maior similaridade entre as populações da costa (estados do Espírito Santo , do cerrado (estados de Goiás e Tocantins), do norte do rio Amazonas (estados do Amazonas e Amapá), e do sul do rio Amazonas (estados de Mato Grosso e Pará). As análises de COI demonstraram diferenciação das populações da costa da Mata Atlântica em relação às demais populações do Brasil central, Amazônia e Mata Atlântica do Interior. O padrão da diversidade de haplótipos de COI, os testes de neutralidade e a distribuição de diferenças pareadas indicaram recente expansão demográfica. A distância geográfica, as ecorregiões e fatores ambietais podem provavelmente limitar a dispersão da espécie, tendo alguma influência sobre a estrutura populacional de An. darlingi / Introduction Malaria is a major human disease that primarily affects poor persons in tropical and subtropical regions where environmental conditions are favorable to the proliferation of the etiological agent as well as vector mosquitoes. In Brazil, Anopheles darlingi is considered a primary vector of human plasmodia and has been the target of control campaigns because of its medical importance. However, the occurrence of microevolution in An. darlingi was not considered and, consequently, the possibility of different populations exhibit distinct biological characteristics. Objective Verify the presence of morphological and genetic variability in Brazilian Anopheles darlingi populations. Methods Twenty six attributes of external egg morphology were analyzed and compared in nine populations. Similarly, the geometric morphometry of wing shape was evaluated in ten An. darlingi localities. In addition, the mitochondrial gene cytochrome oxidase subunit I (COI) was employed to analyze the population structure of An. darlingi. Results and Conclusion - Although, egg attributes showed variation, only samples from Tocantins and Pará were differentiated from other populations. Variation in external egg structure is arguably adaptive in light of environmental factors such as temperature, humidity and food availability for females. Comparisons of wing geometric morphometry indicated that there is greater similarity between Coastal (Espírito Santo and Rio de Janeiro states) and Inner (São Paulo and Paraná states) populations of the Atlantic Forest, and differentiation of those from (Goiás and Tocantins states) and regions both north (Amazonas and Amapá states) and south (Pará and Mato Grosso states) of the Amazon Region. Cytochrome oxidase I analyses indicated differentiation between coastal Atlantic Forest populations (Espírito Santo and Rio de Janeiro states) and those from the cerrado, the Amazon and the interior Atlantic Forest. The pattern of COI haplotype diversity, neutrality tests and distribution of pairwise differences suggest a recent demographic expansion. Geographical distance, ecoregions and potentially environmental constraints may limit the species´ dispersal and influence the population structure of An. darlingi

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3078.pdf: 3949929 bytes, checksum: 0375aaec7134412a51147cc0d80c7620 (MD5) Previous issue date: 2010-05-21 / The State of Maranhão is considered as a transitional area between northeastern semiarid and amazonian rainforest. Various perennial rivers such as the rivers Parnaíba, Itapecuru, Mearim, Pindaré and Gurupi are found in Maranhão. Distribution patterns analysis indicated the region as an endemism area for Neotropical freshwater fishes. However, only few studies have been performed in the region. Therefore the relationships between the hidrographic set and the respective neighbour areas are not fully comprehended. One complication is the insufficient cientific knowledge about the endemism level in the region due to insufficient establishment of taxonomic bounds for several species in the area. This study examines the hypothesis that freshwater fishes from Maranhão rivers are valid taxonomic unities, and whether its hydrographic set can be considered as an endemism area for Neotropical fishes. The study is focused on the analsis of genetic differentiation of Hoplias malabaricus and Prochilodus lacustris. The geographic variation of H. malabaricus was studied using sequences of the DNAmt control region as well by geometric morphometrics. Besides the mitochondrial marker, the variation analyses of P. lacustris employed sequences of the S7 intron 1. Both species exhibited high genetic variability which may be related to its own ecological features. The genetic diversity of H. malabaricus, a sedentary species, is influenced by drainage architeture. On the other hand, the migratory behavior of P. lacustris and the results obtained had suggested that the variability found was influenced by historical factors. Because the most resolution of the P. lacustris data, the molecular clock hypothesis was tested and divergence times between populations sampled were estimated. These estimates matching with geological informations enabled us to identify several putative events that may play an important role in differentiation of the maranhense ichthyofauna. Under the taxonomic point of view, the hypothesis that H. malabaricus is a species complex was reinforced and the analyses suggested that putative criptic species occur in the region. The P. lacustris specimens constitute a taxonomic unit, but did not support the hypothesis that the species is endemic for the Parnaíba and Mearim rivers. Considering these results, we suggest that the most closely indication of endemism areas could be the ecoregions established by Secretaria de Recursos Hídricos from Ministério do Meio Ambiente. / O Estado do Maranhão é geralmente considerado uma área de transição entre o semiárido nordestino e a floresta amazônica, onde está localizado um conjunto de rios perenes, tais como, Parnaíba, Itapecuru, Mearim, Pindaré e Gurupi. Análises baseadas em padrões de distribuição têm indicado que a região constitui uma área de endemismo para peixes neotropicais. No entanto, devido ao reduzido número de estudos, as interrelações desse conjunto hidrográfico com áreas vizinhas são pouco compreendidas. Uma das dificuldades que surge do esquálido conhecimento científico é a identificação do nível de endemismo que a região abriga, uma vez que há problemas na definição dos limites taxonômicos de várias espécies com ocorrência registrada na área. Assim, este trabalho teve como objetivo testar as hipóteses de que as espécies de peixes dos rios do Maranhão são unidades taxonômicas válidas e, consequentemente, o conjunto hidrográfico pode ser considerado uma área de endemismo. O estudo foi centrado na análise de diversidade genética das espécies Hoplias malabaricus e Prochilodus lacustris. Em H. malabaricus a variação geográfica foi estudada usando sequências da região controle do DNAmt e através de morfometria geométrica. Além do marcador mitocondrial, na análise da variação em P. lacustris foram utilizadas sequências do íntron 1 do gene S7. Ambas as espécies apresentaram alta variabilidade genética que parece estar associada às características ecológicas de cada uma. H. malabaricus, sendo sedentária, teve sua diversidade genética influenciada por arquitetura de drenagem. Por outro lado, dado o comportamento migratório de P. lacustris, os resultados sugeriram que a variabilidade observada foi influenciada por fatores históricos. A maior resolução dos dados em P. lacustris permitiu testar a hipótese de relógio molecular e estimar tempos de divergências entre as populações amostradas. Estas estimativas foram combinadas com informações geológicas disponíveis, possibilitando a identificação de vários eventos que provavelmente exerceram papéis importantes na diferenciação da ictiofauna maranhense. Do ponto de vista taxonômico, as análises reforçaram a hipótese de que H. malabaricus é um complexo de espécie, sugerindo a possibilidade de ocorrência de espécies crípticas na área. As amostras de P. lacustris, por sua vez, constituem uma unidade taxonômica, mas não são consistentes com a hipótese de que a espécie é endêmica para os rios Parnaíba e Mearim. Diante dos resultados obtidos, sugerimos que a indicação mais aproximada de áreas de endemismo seja a de ecorregiões definidas pela Secretaria de Recursos Hídricos do Ministério do Meio Ambiente.

Esta pesquisa aborda o episódio histórico do grupo que institucionalizou a genética de populações com drosófilas no Brasil, a partir de 1943. Este grupo fez parte do Departamento de Biologia Geral da antiga Faculdade de Filosofia Ciências e Letras da Universidade de São Paulo (FFCL/USP), e teve como expoentes André Dreyfus (1897-1952) e Theodosius Dobzhansky (1900-1975). O objetivo desta pesquisa é analisar este episódio mediante o cotejamento de uma síntese, fruto de estudos anteriores realizados por este autor (SIÃO, 2007; SIÃO 2008), com cinco entrevistas realizadas com docentes do atual Departamento de Genética e Biologia Evolutiva do Instituto de Biociências da USP, que tiveram contato direto ou indireto com os pesquisadores que atuaram no referido grupo, entre as décadas de 1940 e 1950. A opção metodológica adotada para as entrevistas foi a da História Oral conforme proposto por Meihy e Holanda (2010). Segundo essa abordagem, as entrevistas passam por um tratamento composto de três fases, a saber, transcrição, textualização e transcriação. Em seguida, é realizada a devolutiva social, que é a devolutiva da transcriação ao colaborador entrevistado para validá-la mediante carta de cessão e autorização de o que vem a constituir a apresentação pública do material e serve de subsídio para a elaboração da narrativa histórica da pesquisa. As entrevistas tiveram como objetivos analisar os seguintes aspectos: o percurso histórico dos docentes entrevistados no Departamento de Genética e Biologia Evolutiva; a percepção dos docentes entrevistados sobre o episódio da parceria entre Dobzhansky e Dreyfus para o desenvolvimento da genética no Instituto de Biociências da USP e no Brasil, nas décadas de 1940 e 1950; as contribuições específicas que o grupo teria realizado naquele período; o papel do ensino de genética de populações a alunos do ensino médio da educação básica; e, por fim, o papel da História da Ciência no Brasil na educação científica. Na análise das entrevistas pode-se constatar que os colaboradores, incluindo os que não tiveram contato direto com os pesquisadores da época, mostraram conhecimento do histórico do Departamento, apresentando detalhes que correspondem aos dados das fontes escritas. Ressaltaram a relevância da parceria entre Dreyfus e Dobzhansky à institucionalização da genética animal no Brasil, bem como, apresentaram outros temas de pesquisa desenvolvida à época que consideram terem sido importantes na consolidação do grupo. Entre as pesquisas, mencionaram os estudos de polimorfismo e preferência nutricional desenvolvidos por Antonio Brito da Cunha (1925-), os estudos com a Rhynchosciara realizados por Crodowaldo Pavan (1919-2009) e Martha Erps Breur (1902-1977), o envolvimento de alguns membros com a genética humana, como foi o caso de Oswaldo Frota-Pessoa (1917- 2010), Newton Freire-Maia (1918 -2003) e Francisco Mauro Salzano (1928-). Sobre o ensino, apontaram algumas dificuldades em trabalhar, por exemplo, o tema de genética de populações com alunos da Educação Básica. Todos os colaboradores disseram que a história da ciência tem papel relevante no ensino de ciências. Além dos resultados específicos, a pesquisa propiciou um recurso documental em história oral, as entrevistas, para ser utilizado por professores e pesquisadores como fonte às pesquisas em história da ciência no Brasil. / This research addresses the historical episode of the group which institutionalized the population genetics with Drosophila in Brazil, from 1943. This group was part of the Department of General Biology of the old Philosophy, Sciences and Letters Faculty of the University of São Paulo (FFCL/USP), and had as exponents André Dreyfus (1897-1952) and Theodosius Dobzhansky (1900-1975). The objective of this research is to analyze this episode through the comparison of a synthesis, fruit of earlier studies accomplished by this author (SIÃO, 2007; SIÃO, 2008), and five interviews with professors of the current Department of Genetics and Evolutionary Biology of Biosciences Institute of USP, who had direct or indirect contact with those researchers who worked in the mentioned group between the decades of 1940s and 1950s. The methodology adopted for the interviews was the Oral History as proposed by Meihy and Holanda (2010). According to this approach, the interviews undergo a treatment which consists of three phases, namely, transcription, textualization and transcreation. Subsequently, the social feedback is done, which is the devolution of the transcreation to the interviewee for him to validate it by letter of cession and also an authorization of what can come to be the public presentation of the material, and serve as the preparation of the historical narrative of this research. The interviews had as objectives to analyze the following aspects: the historical background of the professors interviewed in the Department of Genetics and Evolutionary Biology; the professor\"s perception of the partnership between Dobzhansky and Dreyfus episode for the development of the genetics at Biosciences Institute of USP and in Brazil, in the decades of 1940s and 1950s; the specific contributions that the group should have made in that period; the role of the population genetics teaching to high school students of basic education; and, finally, the role of the History of Science in Brazil in scientific education. In the analysis of the interviews, it\"s evident that the contributors, including those who had no direct contact with the researchers of that time, showed knowledge of the history of the Department, presenting details that match the data of the written sources. The importance of the partnership between Dreyfus and Dobzhansky to the institutionalization of the animal genetics in Brazil was pointed out, as well as other research topics developed at that time, which were considered relevant to the consolidation of the group. Among the researches, some were mentioned: the studies with polymorphism and the nutritional preference developed by Antonio Brito da Cunha (1925-), the studies with Rhynchosciara conducted by Crodowaldo Pavan (1919-2009) and Martha Erps Breur (1902-1977), the engagement of some members with human genetics, such as the case of Oswaldo Frota-Pessoa (1917-2010), Newton Freire-Maia (1918 -2003) and Francisco Mauro Salzano (1928-). Concerning teaching, some difficulties in working were pointed out, for example, the issue of population genetics with basic education students. All contributors have said that the history of science has an important role in science teaching. Besides the specific results, the survey has provided a document resource on oral history, the interviews, to be used by teachers and researchers as a source to the research in the history of science in Brazil.

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2017-04-07T12:34:26Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Ferreira, D.M.C.-DELIMITAÇÃO DE ESPÉCIES E FILOGEOGRAFIA DO COMPLEXO Cryptanthus zonatus (Vis.) Vis. (BROMELIACEAE).pdf: 2597427 bytes, checksum: 104e86eeb5b9dc72d1a7d96ef9fa743f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-07T12:34:26Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Ferreira, D.M.C.-DELIMITAÇÃO DE ESPÉCIES E FILOGEOGRAFIA DO COMPLEXO Cryptanthus zonatus (Vis.) Vis. (BROMELIACEAE).pdf: 2597427 bytes, checksum: 104e86eeb5b9dc72d1a7d96ef9fa743f (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / CAPES / Cryptanthus Otto & A.Dietr. (Bromeliaceae, Bromelioideae) é um gênero endêmico do Brasil. Cryptanthus burle-marxii Leme e C. zonatus (Vis.) Vis. são restritas ao norte da Floresta Atlântica nordestina e não apresentam delimitação taxonômica bem definida, pois muitos de seus caracteres morfológicos se sobrepõem. Ambas as espécies compõem o complexo C. zonatus (Vis.) Vis.. O objetivo do presente estudo foi realizar a delimitação de espécies e descrever os padrões filogeográficos do complexo C. zonatus, utilizando dados morfológicos, moleculares e de modelagem de nicho ecológico. Para o estudo foram feitos testes de amplificação heteróloga em C. burle-marxii e C. zonatus, utilizando 38 locos de microssatélites nucleares de cinco espécies de Bromeliaceae. Dos 38 locos testados, 24 apresentaram amplificação positiva e 13 foram polimórficos. Dez locos polimórficos foram selecionados para serem amplificados e genotipados em 147 indivíduos de oito populações do complexo C. zonatus. O resultado da análise morfológica e de estrutura genética mostrou que C. burle-marxii e C. zonatus são dois nomes dados à mesma espécie. A análise filogeográfica mostrou que a distribuição geográfica e estrutura genética do complexo C. zonatus pode ter sofrido modificações no quaternário. No último máximo glacial a distribuição geográfica potencial do complexo era contínua e maior em algumas áreas que atualmente é mar, o que deve ter ocorrido provavelmente devido à regressão marinha neste local. No Holoceno médio houve a potencial separação da distribuição possivelmente devido a uma barreira ecológica que perdurou até o presente formando dois grupos geneticamente estruturados, um ao norte e outro ao sul. Para a conservação da espécie foram indicadas populações prioritárias para o estabelecimento de unidades de conservação. / Cryptanthus Otto & A.Dietr. (Bromeliaceae, Bromelioideae) is an endemic genus from Brazil. Cryptanthus burle-marxii Leme and C. zonatus (Vis.) Vis. are species restricted to the north of the northeastern Atlantic Forest and have no well-defined taxonomic delimitation due to overlaping of some morphological characters. Both species are included in the Cryptanthus zonatus complex. The main goal of this study was to delimit species boudaries and to describe the phylogeographic patterns of the complex C. zonatus using morphological, molecular and ecological niche modeling data. For this study were carried out cross-amplification tests in C. burle-marxii and C. zonatus using 38 loci of nuclear microsatellite of five species of Bromeliaceae. Of the 38 loci tested, 24 showed positive amplification and 13 were polymorphic. Ten polymorphic loci were selected to be amplified and genotypes in 147 individuals from eight populations of the complex C. zonatus. The results of the morphological and genetic structure analyses showed that C. burle-marxii and C. zonatus are two names given to the same species. The phylogeographic analysis showed that the geographic distribution and genetic structure of the complex C. zonatus may have been modified in the Quaternary. The potential geographic distribution of the complex in the last glacial maximum was continuous and larger in some areas which are sea in present, what have probably occurred due to marine regression at this location. In the middle Holocene, there was the potential separation of distribution, possibly due to an ecological barrier that lasted until the present, forming two genetically structured groups, one in the north and other in the south. For conservation of the species priority populations were indicated for the establishment of protected areas

Introdução - A malária é uma das principais doenças humanas do mundo e afeta principalmente as populações pobres em regiões tropicais e subtropicais onde as condições ambientais são favoráveis tanto para a proliferação dos agentes etiológicos como dos mosquitos vetores. No Brasil, An. darlingi é considerado vetor primário de plasmódios humanos. Devido à importância médica, esse inseto tem sido objeto de campanhas de controle populacional. No entanto, não foi considerada a ocorrência de microevolução em An. darlingi e consequentemente, a possibilidade de populações diferentes apresentarem características biológicas distintas. Objetivo Verificar a presença de variabilidade genética e morfológica em populações de An. darlingi no Brasil. Metodologia - Foram analisados e comparados 26 atributos da morfologia externa de ovos de nove populações, bem como a morfometria geométrica da forma alar de espécimes de 10 localidades diferentes de Anopheles darlingi. Além disso, foram empregadas sequências do gene mitocondrial citocromo oxidase subunidade I (COI) para analisar a estrutura populacional de An. darlingi. Resultados e Conclusão Apesar dos atributos dos ovos apresentarem variação, somente as amostras de Tocantins e Pará foram diferenciadas das demais populações. As variações nas estruturas externas dos ovos são provavelmente adaptativas, com influência de fatores ambientais, como temperatura, umidade e disponibilidade de alimento para as fêmeas. A comparação da morfometria geométrica da asa demonstrou que existe maior similaridade entre as populações da costa (estados do Espírito Santo , do cerrado (estados de Goiás e Tocantins), do norte do rio Amazonas (estados do Amazonas e Amapá), e do sul do rio Amazonas (estados de Mato Grosso e Pará). As análises de COI demonstraram diferenciação das populações da costa da Mata Atlântica em relação às demais populações do Brasil central, Amazônia e Mata Atlântica do Interior. O padrão da diversidade de haplótipos de COI, os testes de neutralidade e a distribuição de diferenças pareadas indicaram recente expansão demográfica. A distância geográfica, as ecorregiões e fatores ambietais podem provavelmente limitar a dispersão da espécie, tendo alguma influência sobre a estrutura populacional de An. darlingi / Introduction Malaria is a major human disease that primarily affects poor persons in tropical and subtropical regions where environmental conditions are favorable to the proliferation of the etiological agent as well as vector mosquitoes. In Brazil, Anopheles darlingi is considered a primary vector of human plasmodia and has been the target of control campaigns because of its medical importance. However, the occurrence of microevolution in An. darlingi was not considered and, consequently, the possibility of different populations exhibit distinct biological characteristics. Objective Verify the presence of morphological and genetic variability in Brazilian Anopheles darlingi populations. Methods Twenty six attributes of external egg morphology were analyzed and compared in nine populations. Similarly, the geometric morphometry of wing shape was evaluated in ten An. darlingi localities. In addition, the mitochondrial gene cytochrome oxidase subunit I (COI) was employed to analyze the population structure of An. darlingi. Results and Conclusion - Although, egg attributes showed variation, only samples from Tocantins and Pará were differentiated from other populations. Variation in external egg structure is arguably adaptive in light of environmental factors such as temperature, humidity and food availability for females. Comparisons of wing geometric morphometry indicated that there is greater similarity between Coastal (Espírito Santo and Rio de Janeiro states) and Inner (São Paulo and Paraná states) populations of the Atlantic Forest, and differentiation of those from (Goiás and Tocantins states) and regions both north (Amazonas and Amapá states) and south (Pará and Mato Grosso states) of the Amazon Region. Cytochrome oxidase I analyses indicated differentiation between coastal Atlantic Forest populations (Espírito Santo and Rio de Janeiro states) and those from the cerrado, the Amazon and the interior Atlantic Forest. The pattern of COI haplotype diversity, neutrality tests and distribution of pairwise differences suggest a recent demographic expansion. Geographical distance, ecoregions and potentially environmental constraints may limit the species´ dispersal and influence the population structure of An. darlingi

Orientadores: Anete Pereira de Souza, Ângela Lúcia Bagnatori Sartori / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-26T12:24:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Alves_FabiodeMatos_D.pdf: 1133051 bytes, checksum: 2103a58113fa28c260e7ecbccd72f761 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: As áreas de Chaco em território sulamericano, representam a maior área de floresta seca contínua do continente. No Brasil, estas áreas são encontradas principalmente na porção sudeste do domínio, no estado de Mato Grosso do Sul, região sul-pantaneira. Talvez por serem áreas de pouca cobertura, o seu conhecimento ainda é incipiente. Embora novos projetos tenham sido realizados nestas áreas nos últimos anos, a sua crescente supressão pelas atividades de pecuária extensiva tem sido preocupante. Não há na região qualquer tipo de Unidade de Conservação a fim de preservar o patrimônio genético das espécies que lá ocorrem, muitas das quais têm sua distribuição limitada a esta fitofisionomia. Desta forma, estudos que visem o conhecimento da variabilidade genética ainda existente, principalmente em áreas em processo de degradação são fundamentais para o conhecimento da atual situação das populações existentes, para indicar métodos de conservação, bem como a propor políticas públicas visando a manutenção e conservação do Chaco brasileiro. A fim de efetuar estimativas da diversidade genética, o uso de marcadores moleculares tem sido empregado em diversos estudos de populações nas diversas formações vegetacionais, principalmente no Brasil. Os microssatélites (SSRs), tem se mostrado uma ferramenta versátil e confiável. O presente estudo teve por objetivo efetuar um estudo genético populacional de Prosopis rubriflora e P. ruscifolia em áreas de Chaco brasileiro, com distintos níveis de perturbação antrópica e ainda, avaliar o sistema de reprodução, pelo uso de progênies, em P. rubriflora, com o emprego de microssatélites. Inicialmente foi construída uma biblioteca enriquecida em microssatélites para P. rubriflora e P. ruscifolia, empregando-se DNA genômico extraído de material foliar. Foram obtidos 21 marcadores microssatélites polimórficos, sendo nove deles para P. rubriflora e 12 para P. ruscifolia. Posteriormente, foram amostrados indivíduos de ambas as espécies em 19 áreas remanescentes de Chaco em Mato Grosso do Sul, com diferentes níveis de perturbação. Uma área aparentemente conservada na região foi selecionada para a amostragem das progênies de P. rubriflora em dois anos consecutivos de amostragem. A genotipagem foi efetuada por meio de sequenciador automático ABI 3500 Genetic Analyzers. Os resultados da genotipagem foram utilizados para estimar os parâmetros de diversidade genética, tendo eles sido similares em ambos os táxons, como o He = 0,59 em P. rubriflora e He = 0,60 em P. ruscifolia. Foi detectado efeito de gargalo populacional em todos os remanescentes de P. rubriflora e na maioria de P. ruscifolia. Constatou-se ausência de estruturação genética intrapopulacional em P. rubriflora (FIS = 0,042), bem como estruturação genética interpopulações moderada (FST = 0,057) resultante da nítida separação dos remanescentes de Nioaque e Porto Murtinho. Em P. ruscifolia foi encontrado, indícios de estruturação ao nível intrapopulacional, e baixa estruturação interpopulacional (FIS = 0,138 e FST = 0,042). Identificou-se que P. rubriflora apresenta um sistema de reprodução preferencialmente alógamo e deve apresentar mecanismos bastante efetivos para evitar a endogamia, principalmente, devido a maioria dos polinizadores apresentarem baixa dispersão entre as plantas. As duas espécies deste estudo apresentam respostas relativamente distintas às perturbações ambientais nas áreas chaquenhas, sendo que P. ruscifolia parece ser mais vulnerável às degradações em comparação a P. rubriflora. Assim, espera-se que estes dados sirvam de apoio para medidas conservacionistas para as áreas chaquenhas, que são extremamente diminutas em território brasileiro / Abstract: Chaquenian areas in Brazil have a short range distribution and are found mainly in Mato Grosso do Sul county, South Pantanal region, and it comprehends a narrow coverage, is possibly the main reason for the poor knowledge of these areas. While new projects were conducted in these areas in recent years, the suppression of the remnant areas due to cattle breeding activities has been a source of concern, because there is no conservation units to protect the genetic heritage of the native species those counties, where the Chaco¿s remnants occur. In this scenario, studies aiming to increase the knowledge of the current genetic diversity, specially where environmental disturbing processes take place, provides important data to understand the current situation of the remaining populations. Moreover, with this study it is possible to indicate conservation measures and public politics aiming at the maintenance and conservation Brazilian chaquenian areas. In order to estimate the genetic diversity, molecular markers have been used in several population studies from different vegetation formations, mainly in Brazil. Microsatellites (SSRs) is one of the most popular molecular markers, considerated a versatile and reliable tool. This study aimed a population genetics study with Prosopis rubriflora and P. ruscifolia in Brazilian chaquenian areas with distinct disturbing levels and conducts a mating system study with P. rubriflora. Initially, we built an enriched library of microsatellites from P. rubriflora and P. ruscifolia using leaf tissue to extract genomic material, which allowed to obtain 21 polymorphic markers, where, nine markers were developed for P. rubriflora and 12 for P. ruscifolia. Then, we sampled individuals of both species in 19 remnant areas of Chaco in Mato Grosso do Sul¿s county, with different disturbance levels. We selected one apparently conserved remnant for sampling progenies of P. rubriflora, with two consecutive years of sampling. The genotyping procedure was performed using an automatic sequencer ABI 3500 Genetic Analyzers. Through the genotyped data, we estimated genetic diversity parameters and observed results He = 0.59 for P. rubriflora and He = 0.60 for P. ruscifolia. We were able to detect a bottleneck effect in all remnants of P. rubriflora and also, in most of P. ruscifolia remnant areas. We reported a not significant intrapopulation genetic structure in P. rubriflora (FIS = 0.042) although with moderated structure between-populations (FST= 0.057) was observed, with the separation of two distinct populations for the studied remnants. A low, but significant genetic structure within and a low genetic structure between populations (FIS = 0.138 and FST = 0.042), is reported for P. ruscifolia in this study. The analysis showed an outcrossing mating system for P. rubriflora suggesting a very effective mechanism to prevent inbreeding, even with the pollinators of predominently low dispersion. The species in this study presents a relatively distinct response to environmental disturbance caused by anthropic factors in chaquenhas areas, P. ruscifolia seems to be more vulnerable to degradations as compared to P. rubriflora. Despite this scenario, we hope that these available data will aid into conservation measures for chaquenhas areas, which is distributed in a narrow range in Brazilian¿s territory / Doutorado / Biologia Vegetal / Doutor em Biologia Vegetal

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The present study investigated the effect of different strata of tide on the abundance, size, sex ratio, population structure, relative growth, morphological sexual maturity, amount of ovigerous females and reproductive burrows in U. leptodactylus. To this end, monthly collections were made from January to December 2013 in two strata of the intertidal, estuaries of Sergipe river and Vaza-barris river, using a square with internal area of 90cm², launched ten times randomly within each strata. For each stratum monthly measures air temperature, substrate temperature, water temperature, salinity and samples episubstrate for the determination of particle size and composition of organic matter were taken. In the laboratory, crabs were sexed, measured and preserved in 70% alcohol. The monthly results were statistically compared between strata and estuaries, there are similarities in environmental factors analyzed between strata, with an analysis of the abundance, size, relative growth and sexual maturity divergent between the same strata.The abundance and size of crabs were higher in the open strata of both estuaries, with the estuary of Vaza-barris river more abundant than estuary of Sergipe river, which in turn showed higher crabs. The sex ratio was not significantly different between the strata of the estuary of Vaza-barris river, but presented to the estuary of Sergipe river, where in the open strata occurred more males and more females in the vegetated strata. Population structure showed 19 classes of size 0.5 mm with modal distribution of recent juveniles for vegetated strata and adults to open strata. Juvenile and adult crabs showed positive allometric growth between carapace width and length of the propodus and width of the abdomen, separately for each sex. The fiddler crabs vegetated strata matured in smaller sizes than that observed for the open strata in both estuaries, in the estuary of Vaza-barris river males and females matured with 6.18 and 5.26 mm and 4.94 and 4.91 mm carapace width in open and vegetated strata, respectively. In the estuary of Sergipe river males and females matured with 5.61 and 5.36 and 5.24 mm and 4.39 mm carapace width in open and vegetated strata respectively. The similarity in abiotic factors between open and vegetated strata, and differences in the abundance, population structure and reproductive biology have led to the consideration of the reproductive behavior of lekking for U. leptodactylus. Ovigerous females and reproductive burrows occurred primarily in the open strata, so these areas were considered reproductive arenas, while vegetated strata were considered priority areas in recruitment. / O presente trabalho investigou o efeito de diferentes estratos de maré sobre a abundância, tamanho, razão sexual, estrutura populacional, crescimento relativo, maturidade sexual morfológica, quantidade de fêmeas ovígeras e tocas reprodutivas em U. leptodactylus. Para tal, foram realizadas coletas mensais no período de Janeiro à Dezembro de 2013 em dois estratos do entremarés, nos estuários do rio Sergipe e rio Vaza-barris, utilizando-se um quadrado com área interna de 90cm², lançado dez vezes aleatoriamente em cada estrato. Para cada estrato mensalmente foram tomadas as medidas de temperatura do ar, temperatura do substrato, temperatura da água, salinidade e amostras do episubstrato, para a determinação do teor de matéria orgânica e composição granulometria. Em laboratório, os caranguejos foram sexados, medidos e conservados em álcool 70%. Os resultados obtidos mensalmente foram comparados estatisticamente entre estratos e estuários, observou-se semelhança nos fatores ambientais analisado entre os estratos, sendo a análise da abundância, tamanho, crescimento relativo e maturidade sexual divergente entre os mesmos estratos. A abundância e o tamanho dos caranguejos foram maiores nos estratos abertos de ambos os estuários, sendo o estuário do rio Vaza-barris mais abundante do que o estuário do rio Sergipe, que por sua vez apresentou caranguejos maiores. A razão sexual não apresentou diferença significativa entre os estratos para o estuário do rio Vaza-barris, porém apresentou para o estuário do rio Sergipe, onde no estrato aberto ocorreram mais machos e nos estratos vegetados mais fêmeas. A estrutura populacional apresentou 19 classes de tamanho de 0,5 mm, com distribuição modal de juvenis recentes para os estratos vegetados e de adultos para os estratos abertos. Os caranguejos juvenis e adultos apresentaram crescimento alométrico positivo entre a largura da carapaça e comprimento do própodo e largura do abdômen, separadamente para cada sexo. Os chama-marés dos estratos vegetados maturaram em tamanhos menores do que o observado para os estratos abertos de ambos os estuários, no estuários do rio Vaza-barris os machos e fêmeas maturaram com 6,18 e 5,26 mm e 4,94 e 4,91 mm de largura da carapaça nos estratos aberto e vegetado, respectivamente. No estuário do rio Sergipe os machos e fêmeas maturaram com 5,61 e 5,36 mm e 5,24 e 4,39 mm de largura da carapaça nos estratos aberto e vegetado, respectivamente. A semelhança nos fatores abióticos entre os estratos abertos e vegetados, e as divergências na abundância, estrutura populacional e biologia reprodutiva, levaram à consideração do comportamento reprodutivo de lekking para U. leptodactylus. As fêmeas ovígeras e tocas reprodutivas ocorreram prioritariamente nos estratos abertos, portanto essas áreas foram consideradas arenas reprodutivas, enquanto os estratos vegetados foram considerados áreas prioritárias no recrutamento.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3280.pdf: 5102569 bytes, checksum: f511b08e43998ea79e0f9b0ac5ed969b (MD5) Previous issue date: 2010-08-06 / Universidade Federal de Sao Carlos / Population genetic parameters and genetic relatedness estimates were carried out for Roseate Spoonbill (Platalea ajaja), Wood Stork (Mycteria americana) and Great Egret (Ardea alba egretta) reproductive colonies in Amapa, Pantanal and Rio Grande do Sul (RS), Brazil. Microsatellite genotypes were used to investigate kinship patterns between nestlings sampled inside the same nests, using a variety of analytical approaches. Unrelated nestling-pairs were observed in Roseate Spoonbill nests (6.12% of analyzed nests) and in Wood Stork nests (11.34%); half-siblings were present in Roseate Spoonbill nests as well (1.36%). Only full-siblings were detected inside Great Egret nests. Conspecific brood parasitism (CBP) and extra-pair paternity were proposed to account for the presence of unrelated nestmates and half-siblings, respectively, in Roseate Spoonbill and Wood Stork nests. Those results suggest the occurrence of a mating system different than genetic monogamy in natural populations of those waterbirds. Genetic relatedness was also investigated for adults and offspring, as well as for supposed siblings in Roseate Spoonbill families kept in three zoological facilities in the U.S. Paternity and maternity allocation analyses through maximum-likelihood revealed that errors were present in zoo‟s studbooks in relation to the familial records. We also identified mating between related individuals that were not detected previously by zookeepers. Population genetic parameters were also estimated and demographic processes were assessed for Great Egret reproductive colonies in the Pantanal and Rio Grande do Su, Brazil. Bayesian clustering analyses, assignment tests, analysis of molecular variance, F-statistics estimates, allelic frequency distribution and the G-W index revealed that: i) Pantanal reproductive colonies are genetically differentiated from Rio Grande do Sul colonies; ii) an IBD-like pattern alone cannot explain that differentiation; and iii) genetic signal of a reduction of population size was present for two colonies in the Pantanal and one in Rio Grande do Sul. Results were discussed considering a metapopulation dynamic and also considering that populations from both Brazilian regions represent distinct units and deserve to be treated separately when planning and carrying out conservation and management programs that aim to preserve the species‟ genetic diversity. / Estudos de genética de populações e de parentesco genético foram desenvolvidos em colhereiro (Platalea ajaja), cabeça-seca (Mycteria americana) e garça-branca-grande (Ardea alba egretta), de colônias reprodutivas do Amapá, Pantanal e Rio Grande do Sul (RS), Brasil. Genótipos em locos de microssatélites foram utilizados para se investigar os padrões de relacionamento entre ninhegos amostrados dentro dos mesmos ninhos com diferentes metodologias de análise. Pares de ninhegos não-relacionados foram encontrados nos ninhos de colhereiro (6,12% dos pares analisados) e de cabeça-seca (11,34%); meio-irmãos foram observados nos ninhos de colhereiro (1,36%). Em garça branca grande foi detectada apenas a presença de irmãos-completos dentro dos ninhos. Parasitismo de ninho intraespecífico e paternidade extra-par podem explicar a presença de ninhegos não-relacionados e meio-irmãos nos ninhos de colhereiro e cabeça-seca, o que indica a presença de um sistema de acasalamento diferente da monogamia genética nas populações naturais dessas espécies. Relações de parentesco entre adultos e filhotes e entre supostos irmãos foram determinadas em famílias de colhereiro de três zoológicos dos EUA. Análises de atribuição de maternidade e paternidade por máxima verossimilhança revelaram erros nos registros dos zoológicos quanto às relações progenitor-progênie e identificaram acasalamentos entre indivíduos aparentados que não tinham sido registrados. Parâmetros genético-populacionais e processos demográficos foram investigados em populações de garça-branca-grande do Pantanal e do Rio Grande do Sul. Análises Bayesianas, testes de alocação de indivíduos, análises de variância molecular, estimativa de estatísticas F, exame da distribuição das freqüências alélicas e cálculo do índice de G-W permitiram identificar que: i) há diferenciação genética significativa entre colônias reprodutivas do Pantanal e do Rio Grande do Sul; ii) o padrão de isolamento pela distância não explica essa diferenciação; e iii) duas populações no Pantanal e uma população no RS apresentaram sinais genéticos de redução demográfica. Os resultados foram discutidos considerando que as populações de garça-branca-grande localizadas no Pantanal e no Rio Grande do Sul são unidades populacionais independentes e devem se tratar separadamente no planejamento e desenvolvimento de programas de manejo para a conservação da diversidade genética total da espécie.