Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Curso de Pós-Graduação em Genética / Made available in DSpace on 2012-10-15T21:36:10Z (GMT). No. of bitstreams: 0Bitstream added on 2013-07-16T16:57:15Z : No. of bitstreams: 1 264420.pdf: 3236585 bytes, checksum: 94c74bb4a6881dc90f76f88805e7341c (MD5)

Proefschrift Universiteit van Amsterdam. / Met bibliogr., lit. opg. - Met samenvatting in het Nederlands.

Proefschrift Universiteit Maastricht. / Met bibliogr., lit. opg. - Met samenvatting in het Nederlands.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-10-19Bitstream added on 2014-06-13T20:46:47Z : No. of bitstreams: 1 mendonca_ff_dr_botib.pdf: 1283042 bytes, checksum: 8a80c771f6e7095e9d6a43bb354b173b (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Os tubarões representam atualmente um importante recurso para a pesca mundial. No entanto, a falta de informações básicas tais como características populacionais, definições taxonômicas precisas e avaliações dos volumes capturados têm favorecido a contínua e intensiva exploração de espécies e populações que já podem estar apresentando declínios em níveis críticos para a manuntenção da sustentabilidade. Pertencente à família Carcharhinidae, o gênero Rhizoprionodon é constituído por sete espécies de tubarões de pequeno porte distribuídas em praticamente todos os mares e devido seus hábitos associados às regiões costeiras, frequentemente representam uma grande parcela dos volumes desembarcados. Destas espécies, três apresentam-se distribuídas no Atlântico Ocidental (R. terraenovae, R. porosus e R. lalandii) com ocorrências desde o Norte dos EUA até a América do Sul, onde a pesca tem sido intensa, principalmente no Brasil. No presente estudo, utilizando marcadores moleculares do DNA mitocondrial, foram analisadas as estruturas populacionais das espécies R. porosus e R. lalandii, desde o Mar do Caribe até a região sul do Brasil, foi buscada a distinção espécie-específica entre R. terraenovae e R. porosus e foram desenvolvidos protocolos de identificação forense para espécies de tubarões amplamente explorados pela pesca na costa brasileira. Na análise utilizando sequencias da região controladora do mtDNA de amostras de R. porosus foram encontrados 53 halótipos com forte estruturação populacional (FST=0.271, P<0,0001), caracterizando a existência de duas populações distintas, separadas pela Corrente Marítima do Equador. Entre os tubarões da espécie R. lalandii foram encontrados 30 haplótipos também com forte estruturação (FST=0.254, P<0,0001) entre as populações do Caribe e as demais populações da costa brasileira. Provavelmente... / Not available

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-03-02Bitstream added on 2014-06-13T19:05:53Z : No. of bitstreams: 1 voltolin_ta_dr_botib.pdf: 2147115 bytes, checksum: 09f04075f90553f16abaa9ae38b53084 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A família Prochilodontidae apresenta uma extraordinária estabilidade dos caracteres morfológicos e merísticos, o qual pode estar relacionado ao fato de efetuarem grandes migrações com propósito reprodutivo, dispersando-se em grandes áreas. Sob o ponto de vista citogenético, apresenta uma constituição cariotípica bastante conservada com 2n=54 cromossomos dos tipos metacêntrico e submetacêntrico com número fundamental igual a 108. Além disso, a presença de microcromossomos supranumerários em algumas espécies do gênero Prochilodus tornou-se a base para diversos estudos citogenéticos. Diante disso, este trabalho objetivou realizar um estudo pormenorizado sobre a origem, herança e estrutura dos cromossomos supranumerários em Prochilodus. Para isto, foram realizados estudos citogenéticos envolvendo alguns exemplares deste gênero, portadores (Prochilodus lineatus e Prochilodus nigricans) e não-portadores de supranumerários (Prochilodus argenteus, Prochilodus brevis e Prochilodus costatus). Em todos os indivíduos analisados citogeneticamente foi constatado um número diploide de 54 cromossomos dos tipos metacêntrico e submetacêntrico, além da presença cromossomos B em P. lineatus e em P. nigricans. A utilização de marcadores citogenéticos convencionais (Giemsa, NOR e Banda C) e citogenéticos- moleculares (FISH) com sondas de genes ribossômicos 5S e 18S confirmaram uma constituição cariotípica conservada apenas para o número e morfologia cromossômica nestas cinco espécies. A localização das Regiões Organizadoras de Nucléolo (NOR) foi evidenciada no braço longo do segundo par de cromossomo submetacêntrico em P. brevis, P. costatus, P. lineatus e P. nigricans. Em P. argenteus somente um cromossomo deste mesmo par foi marcado pela Prata, seu homólogo não exibiu marcações demonstrando inatividade... / The family Prochilodontidae shows morphological and meristic characters with an extraordinary degree of stability, which may be related to the great migrations accomplished for reproductive purposes, spreading over large areas. From the cytogenetic viewpoint, it presents a much conserved karyotypic constitution with 2n = 54 metacentric and submetacentric chromosomes with fundamental number equal to 108. Moreover, the presence of supernumerary microchromosomes in some species of the genus Prochilodus provided the basis for a range of cytogenetic studies. In light of the aforementioned, this study aimed to conduct a detailed investigation of the origin, inheritance, and structure of supernumerary chromosomes in Prochilodus. In this connection, we conducted cytogenetic studies involving a few specimens of this genus, bearers (Prochilodus lineatus and Prochilodus nigricans) and non-bearers of supernumerary (Prochilodus argenteus, Prochilodus brevis, and Prochilodus costatus). All subjects cytogenetically studied exhibited a diploid number of 54 metacentric and submetacentric chromosomes, besides revealing the presence B chromosomes in P. lineatus and P. nigricans. The use of conventional cytogenetic (Giemsa, NOR and C-Band) and molecular cytogenetic markers (FISH) with 5S and 18S ribosomal gene probes confirmed a conserved karyotypic constitution restricted only to the chromosome number and morphology in these five species. The location of Nucleolar Organizer Regions (NOR) was detected on the long arm of the second pair of a submetacentric chromosome in P. brevis, P. costatus, P. lineatus, and P. nigricans. In P. Argenteus, only one chromosome of that same pair was marked by silver staining, whereas its homologous did not show any markings, demonstrating inactivity in this region... (Complete abstract click electronic access below)

CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / Gastric cancer is a serious health problem. Several risk factors have been identified to contribute to its development, such as virulence genes of H. pylori, SNPs in hostâs key genes and epigenetic events. The aim of this study was to investigate the relationship between genes methylation in gastric cancer, its association with H. pylori virulence genes, and verify the influence of CDH1 and MLH1 SNPs in the methylation status and correlate methylation of the promoter of miR-34b/c expression of MET protein in those cases. The promoter genes methylation was assessed by MS-PCR and HRM (for miR-34b/c) techniques. H.pylori genes were detected by PCR and SNPs, by PCR-RFLP. H.pylori genes were detected by PCR and SNPs, by PCR-RFLP. The genes of higher and lower methylation frequency were MSH2 and MLH1, respectively. Patients aged &#8805; 50 had CDH1 more frequently methylated than those younger. The MLH1 gene was significantly less methylated in cardia tumors. As for the TNM, the CDH1-M gene was associated with advanced tumor extension, even when subdivided by subtype, since same association has been shown in tumors of intestinal subtype. Already the combination CDKN2A-M/MLH1-U was associated with absence of distant metastases. Taking into account the virulence genes of H. pylori, it was seen that patients infected vacAm1+ or cagG+ strains had a higher frequency of CDKN2A-U vacAs1 + was associated with COX-2-U and CDH1-U, while hopQII with MLH1-U. Patients infected with cagE+ and virB11+ strains had higher frequency of MSH2-M. It was also observed that less virulent strains tended to non-methylation for CDH1 and MLH1 genes. The classification trees made according to the histological subtype, showed that in tumors of diffuse subtype cagE+ and virB11 + strains (separately or together) were also attached to a methylator character of some of the analyzed genes. Already strains virB11+cagA+ did not lead to methylation in two genes. In intestinal subtype tumors was not observed a pattern having a variation in the combinations of H. pylori genes leading to the methylation. CDH1 SNPs presented no relation to the methylation of this gene, while the GA genotype of MLH1 SNP showed a tendency to not methylation of the gene. As regards the promoter methylation of miR-34b/c, the distribution percentage of the cases showed that the majority of cases presented methylation above 50%. The larger frequency among tumors of the intestinal subtype was in the methylation range of 50-75%, and to diffuse subtype from 75%. Already c-MET expression was positive in 86.36% of cases were not found differences among the different locations and subtypes. There was no correlation between the methylation percentage of miR-34b/c and c-MET expression. Observing each case, it was seen that in most cases whose c-MET expression was negative (H-score 0) had a high percentage of methylation of miR-34b/c. In conclusion, the methylation status of the studied genes appear to be dependent on the tumor location and is also related to the TNM staging and tumor subtype. In addition, more virulent H. pylori strains may be involved in this process by increasing inflammatory response leading to methylation of these genes. Already c-MET is overexpressed in cases of gastric cancer and the promoter region of miR-34b/c hipermethylated, indicating a possible involvement of these factors in carcinogenesis of the stomach, although it was not found a direct relationship between the two variables. / O cÃncer gÃstrico constitui um sÃrio problema de saÃde pÃblica. Diversos fatores de risco parecem estar envolvidos na contribuiÃÃo para o seu desenvolvimento, tais como: genes de virulÃncia de H. pylori, SNPs em genes-chave no hospedeiro e eventos epigenÃticos. Assim, o objetivo desse estudo foi investigar a relaÃÃo entre a metilaÃÃo de genes em casos de cÃncer gÃstrico, sua associaÃÃo com genes de virulÃncia de H. pylori, verificar a influÃncia dos SNPs de CDH1 e MLH1 em seu status de metilaÃÃo, bem como correlacionar a metilaÃÃo do promotor de miR-34b/c e a expressÃo da proteÃna MET nesses mesmos casos. A metilaÃÃo dos genes foi obtida atravÃs da realizaÃÃo da tÃcnica MS-PCR e HRM (para miR-34b/c). Os genes de H. pylori foram detectados por PCR e os SNPs, por PCR-RFLP. Os genes de maior e menor frequÃncia de metilaÃÃo foram MSH2 e MLH1, respectivamente. O corte de idade mostrou que pacientes com idade &#8805; 50 anos tiveram CDH1 mais frequentemente metilado que aqueles mais jovens. O gene MLH1 foi significativamente menos metilado em tumores da cÃrdia. Quanto ao TNM, o gene CDH1-M foi associado à extensÃo tumoral avanÃada, inclusive quando subdividido por subtipo, jà que mesma associaÃÃo foi mostrada em tumores do subtipo intestinal. Jà a combinaÃÃo CDKN2A-M/MLH1-U foi associada à ausÃncia de metÃstase à distÃncia. Levando em consideraÃÃo os genes de virulÃncia de H. pylori, foi visto que pacientes infectados por cepas vacAm1+ ou cagG+ tiveram uma maior frequÃncia de CDKN2A-U, vacAs1+ foi associado com COX-2-U e CDH1-U, enquanto hopQII, com MLH1-U. Pacientes infectados por cepas cagE+ e virB11+ tiveram maior frequÃncia de MSH2-M. Foi observado tambÃm que cepas menos virulentas apresentaram uma tendÃncia à nÃo-metilaÃÃo para os genes MLH1 e CDH1. As Ãrvores de classificaÃÃo, feitas de acordo com o subtipo histolÃgico, mostraram que em tumores do subtipo difuso, cepas cagE+ e virB11+ (separados ou em concomitÃncia) tambÃm estavam associadas a um carÃter metilador em alguns dos genes analisados. Jà cepas virB11+cagA+ nÃo levavam à metilaÃÃo em dois genes. Nos tumores do subtipo intestinal, nÃo foi observado um padrÃo, havendo uma variaÃÃo nas combinaÃÃes dos genes de H. pylori que levavam à metilaÃÃo. Os SNPs de CDH1 e nÃo apresentaram relaÃÃo com a metilaÃÃo desses gene, enquanto o genÃtipo GA de MLH1 apresentou uma tendÃncia à nÃo metilaÃÃo do gene. Quanto à metilaÃÃo do promotor de miR-34b/c, a distribuiÃÃo dos casos por percentual mostrou que a maioria dos casos apresentou metilaÃÃo acima de 50%. A maior frequÃncia de casos entre os tumores do subtipo intestinal estava na faixa de metilaÃÃo de 50-75%, e para os do subtipo difuso, a partir de 75%. Jà a expressÃo de c-MET foi positiva em 86,36% dos casos, nÃo sendo encontradas diferenÃas entres as diferentes localizaÃÃes e subtipos. NÃo foi encontrada uma correlaÃÃo entre o percentual de metilaÃÃo de miR-34b/c e a expressÃo da proteÃna c-MET. Observando caso a caso, foi visto que na maioria dos casos cuja expressÃo de c-MET era negativa (H-score 0) possuia um elevado percentual de metilaÃÃo de miR-34b/c. Assim, pode-se concluir que os status de metilaÃÃo dos genes estudados parecem ser dependentes da localizaÃÃo tumoral e està relacionado tambÃm ao estadiamento TNM e ao subtipo tumoral. AlÃm disso, cepas de H. pylori mais virulentas podem estar envolvidas nesse processo, aumentando a resposta inflamatÃria e levando à metilaÃÃo desses genes. Jà a proteÃna c-MET està superexpressa em casos de cÃncer gÃstrico e a regiÃo promotora de miR-34b/c, hipermetilada, indicando um possÃvel envolvimento desses fatores na carcinogÃnese do estÃmago, embora nÃo tenha sido encontrada uma relaÃÃo direta entre as duas variÃveis.

Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-01-05T19:39:18Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_Jessica Motta de Sousa.pdf: 16274582 bytes, checksum: 070535e90da95d5052fdada5bc749d48 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-05T19:39:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação_Jessica Motta de Sousa.pdf: 16274582 bytes, checksum: 070535e90da95d5052fdada5bc749d48 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-06-18 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Several hypotheses have been formulated to explain Amazonian biodiversity patterns, whose biotic diversification has been seen as a result of historically complex scenarios covering a wide range of temporal and spatial scales. Anurofauna has the potential to enhance our understanding of the biogeographic patterns of diversification and processes of speciation, since it serves as a model for inferring historical events. However, the challenge for those seeking to elucidate the processes of diversification of Amazonian frogs is that large portion of its diversity is cryptic, which result in an inaccuracy of limits and distributions of species, which drastically alters our perception of structuring of biodiversity and obscures biogeographic patterns. One of the components of the Amazon anurofauna is the species Hypsiboas cinerascens, which was used as a model to investigate and contribute to the knowledge of the patterns of genetic distribution of anurofauna in the Amazon. Given its wide geographic distribution, some authors have indicated the existence of a species complex with molecular data (mitochondrial gene sequences and genomic data) providing of important tools for the delimitation of evolutionary lineages and their distributional limits, thus clarifying current taxonomy, and for the identification of cryptic species, and thus biogeographic patterns. Given the above, we used sequences of mitochondrial genes 16S RNA and cytochrome b together with the new8 generation sequences (ddRAD-tags) to study the distribution patterns of genetic diversity of H. cinerascens in the Amazon and so testing for cryptic lineages, and inferring biogeographic patterns of the lineages found. Through genetic distance analyses and formation of biological groups with 16S rRNA, concatenated phylogeny of the mitochondrial 16S rRNA and Cytochrome B genes, phylogenomic analyses of the ddRAD-tags, and estimating the time of divergence of both genomes, we identified the possible existence of nine evolutionary lineages in H. cinerascens that originated in the Miocene to the Pliocene: Japurá-Peru, Manaus-Juruti-Guyana, Matupiri-Purus, Santarém-Alta Floresta, Tefé-Jutaí, Morrinho-Rondônia, Uacari, French Guiana and Negro-Trombetas. The filogenomic analyzes confirmed the lineages found in the mtDNA, but with some discrepancies between the topologies. Due to the robustness of the dating of gDNA, we use it to infer the biogeographical history of the group. We suggested that the transcontinental formation of the Amazon River in the last 10 Ma may have been the precursor event for the diversification of the lineages, but due to the complexity of the relationships between groups and the lack of sampling throughout the complete distribution of the H. cinerascens species complex, possibly different historical and ecological factors events influenced their distributions, which can not be identified accurately with our data. The Negro-Trombetas lineage has a distinct biogeographic history of the other lineages of the complex, which may be associated with open forest environments in the region of Guyana. In the future a taxonomic revision of the group should be carried out to verify the existence of new species. / Diversas hipóteses foram formuladas para explicar os padrões de biodiversidade amazônica, cuja diversificação biótica tem sido vista como um produto que envolve cenários historicamente complexos e que abrangem uma ampla gama de escalas temporais e espaciais. A anurofauna possui o potencial de aprimorar o entendimento dos processos biogeográficos nos padrões de especiação e diversificação, já que serve como modelo para inferir eventos históricos. Porém, o desafio para quem busca elucidar o processo de diversificação de anuros amazônicos é que grande parcela de sua diversidade é críptica, que tem por consequência uma imprecisão de limites e distribuições das espécies, o que altera drasticamente a nossa percepção da estrutura da biodiversidade e oculta padrões biogeográficos. Um dos componentes da anurofauna amazônica é a espécie Hypsiboas cinerascens, que foi utilizada como modelo para investigar e contribuir com o conhecimento sobre os padrões de distribuição genética da anurofauna na Amazônia. Considerando sua ampla distribuição geográfica, alguns autores indicam a existência de um complexo de espécies e os dados moleculares (sequências de genes mitocondriais e dados genômicos) são importantes ferramentas para a delimitação de linhagens evolutivas e seus limites de distribuição, de forma a clarificar a taxonomia vigente, bem como para a identificação de espécies crípticas, e consequentemente a mostrar padrões biogeográficos. Conforme o exposto, utilizamos o sequenciamento dos genes mitocondriais 16S rRNA e Citocromo b juntamente com o sequenciamento de nova geração (ddRAD-tags), para estudar os padrões de distribuição da diversidade genética de H. cinerascens na Amazônia e assim testar a presença de linhagens crípticas, inferindo padrões biogeográficos sobre as linhagens encontradas. Por meio de análises de distâncias genéticas e formação de grupos biológicos com o 16S rRNA, filogenia concatenada dos genes mitocondriais 16S rRNA e Citocromo B, filogenômica dos ddrad-tags, e estimação do tempo de divergência de ambos genomas, definimos a possível existência de 9 linhagens evolutivas em H.. cinerascens que se originaram do Mioceno ao Plioceno: Japurá- Peru, Manaus-Juruti-Guiana, Matupiri-Purus, Santarém-Alta Floresta, Tefé-Jutaí, Morrinho- Rondônia, Uacari, Guiana Francesa e Negro-Trombetas. As análises filogenômicas confirmaram as linhagens encontradas com o mtDNA, porém com algumas discordâncias entre as topologias. Devido a maior robustez da datação do gDNA, a utilizamos para inferir a história biogegráfica do grupo. Sugerimos que a formação transcontinental do Rio Amazonas nos últimos 10 Ma pode ter sido o evento precursor da diversificação de linhagens, porém devido a complexidade das relações entre os grupos e a falta de amostragem da completa distribuição da espécie, possivelmente diferentes eventos históricos e fatores ecológicos influenciaram as suas distribuições, nos quais não podem ser definidos com exatidão com os nossos dados. A linhagem Negro-Trombetas possui uma história biogeográfica distinta das outras linhagens do complexo, que pode estar associada a ambientes florestais mais abertos na região das Guianas. Futuramente deve ser realizada a revisão taxonômica do grupo para verificar a existência de novas espécies.

Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-01-06T18:26:59Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_Sabrina Schumacker Zanca.pdf: 5039439 bytes, checksum: 5efe72ddb5b05b30355272db0d78ee68 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-06T18:26:59Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação_Sabrina Schumacker Zanca.pdf: 5039439 bytes, checksum: 5efe72ddb5b05b30355272db0d78ee68 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-05-26 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The Amazon species Duroia macrophylla Huber (Rubiaceae) produces triterpenes and alkaloids with activity against Mycobacterium tuberculosis and an indole alkaloid active against tumoral cell lines. Previous studies showed that different plant extracts had difference on the chemical composition. So, the present study aim to assess the seasonal production of secondary metabolites in Duroia macrophylla extracts, in two specimens for one year. Also, callus in vitro were obtained for phytochemical extraction and secondary metabolites production analysis. For the two plants phytochemical analysis, leaves were collected monthly from April/2013 to March/2014. Plant material was grounded and extracted with hexane and methanol, with ultrasound bath. The concentrated extracts were analyzed by thin layer chromatography (TLC) and 1H-nuclear magnetic resonance (1H-NMR). The NMR spectra were compared by principal component analysis (PCA). The in vitro tissue cultures were established from young leaves with 50% of asepsis after several assays and with different immersion times of the chemical reagents: 70% etanol, 2% sodium hypochlorite and biocide solution. In vitro explants were induced to callus formation process by adding the growth regulators kinetin and 2,4-D, on Murashige & Skoog media, and then extracted with hexane and methanol. The production of secondary metabolites was analysed by TLC and 1H-NMR. All hexane and methanol extracts of two Duroia macrophylla individuals showed evidence of the presence of alkaloids and terpenes during a year. The PCA analysis showed seasonal variation on the chemical composition of the hexane extracts of Duroia macrophylla’s leaves, where the production of alkaloids increased during the rainy season. Regarding the methanol extracts of the leaves, the extract from November showed a lower alkaloid content. Being November the flowering species period, we can infer that the plant is redirecting its biosynthetic route for the production of less polar indole alkaloids or other metabolites. D. macrophylla callus extracts showed terpenes but not alkaloids production, and showed no antioxidant, toxic and antibacterial activities in the performed assays. / A espécie amazônica Duroia macrophylla Huber (Rubiaceae) é produtora de triterpenos e alcaloides com atividades sobre Mycobacterium tuberculosis e um alcaloide com atividade tumoral. Entretanto, coletas realizadas em épocas diferentes mostraram diferença na composição química de diferentes indivíduos. Assim, o presente trabalho teve como objetivo avaliar a sazonalidade da produção de metabólitos secundários em extratos de Duroia macrophylla, durante um ano, em dois espécimes. Também foram obtidos calos in vitro da espécie para extrações fitoquímicas e análise da produção dos metabólitos secundários. Para as análises fitoquímicas dos dois indivíduos foram utilizadas folhas coletadas mensalmente de abril/2013 a março/2014. O material vegetal foi submetido à extração com hexano e metanol, em banho de ultrassom. Os extratos foram concentrados e posteriormente analisados por cromatografia em camada delgada comparativa (CCDC) e ressonância magnética nuclear (RMN) de 1H. Os espectros foram comparados por meio de uma análise de componentes principais. As culturas de tecidos in vitro foram estabelecidas com 50% de assepsia, após vários testes, a partir de explantes provindos de folhas jovens e com diferentes tempos de imersão dos reagentes químicos: etanol 70%, hipoclorito de sódio 2% e solução biocida. Depois de estabelecidos, os explantes in vitro foram induzidos ao processo de calogênese através da adição dos reguladores de crescimento cinetina e 2,4-D, em meio Murashige & Skoog. Os calos foram posteriormente extraídos com hexano e metanol e a produção dos metabólitos secundários foi avaliada por análise em CCDC e RMN de 1H. Os extratos hexânicos e extratos metanólicos obtidos dos dois indivíduos de Duroia macrophylla apresentaram indícios da presença de alcaloides e terpenos em todos os meses, durante um ano. A análise de componentes principais demonstrou que há uma variação sazonal na composição química dos extratos hexânicos de folhas de Duroia macrophylla, onde o teor de alcaloides indólicos foi maior na época mais chuvosa. Nos extratos metanólicos das folhas, o mês de novembro apresentou teores significativamente menores de alcaloides indólicos em relação aos outros meses, para os dois indivíduos estudados. Sendo o mês de novembro a época de floração da espécie, pode-se inferir que a planta está redirecionando a sua rota biossintética para a produção de alcaloides indólicos menos polares e também para a produção de outros metabólitos. Os extratos dos calos de D. macrophylla apresentaram terpenos, mas não alcaloides, e não apresentaram atividades antioxidante, tóxica e antibacteriana nos ensaios realizados.

Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-01-06T19:28:43Z No. of bitstreams: 2 Tese_Natalia Dayane Moura Carvalho.pdf: 6463489 bytes, checksum: 97adced66113479245624ef1a4a4624c (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-06T19:28:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese_Natalia Dayane Moura Carvalho.pdf: 6463489 bytes, checksum: 97adced66113479245624ef1a4a4624c (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-10-13 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / Macroteiids Neotropical lizards Teiidae family. Classical cytogenetic approaches in this group revealed karyotype variation with diploid numbers ranging 34-52 chromosomes, as well as differences in the distribution patterns of heterochromatin and composition thereof. However, the physical chromosomal mapping of repetitive DNA and comparative analysis of these elements is incipient fundamental to the understanding of the dynamics, organization and carioevolution this group of lizards. In that sense, this study mapped different classes of sequences of repetitive DNA, such as 5S rDNA, telomeric sequences, genes of tropomyosin 1 and retrotransposons Rex 1 and SINE and repetitive fraction Cot1-DNA in chromosomes of five species of Ameiva ameiva, Cnemidophorus sp.1, Kentropyx calcarata, Kentropyx pelviceps and Tupinambis teguixin. The mapping of repetitive sequences revealed a distinct pattern in Cnemidophorus sp.1, while the remaining species showed all sequences associated with each other in the heterochromatic region. The chromosomal physical mapping of tropomyosin 1 gene was first performed in lizards and revealed that in addition to being functional, has a structural function similar to the other mapped repetitive elements (rDNA 5S, telomeric sequences, retrotransposons Rex 1 and SINE) being located preferably in the centromeric regions of chromosomes and terminals. The FISH Cot1-DNA isolated from both Ameiva ameiva much Cnemidophorus sp.1 showed that these sequences are mainly located in the regions heterochromatic centromeric and telomeric chromosome of Ameiva ameiva, Kentropyx calcarata, Kentropyx pelviceps and Tupinambis teguixin. In Cnemidophorus sp.1 the Cot1-DNA probe isolated from Ameiva ameiva had multiple interstitial markings on chromosomes, while the mapping Cot1-DNA isolated from the species itself marked centromeric regions of some chromosomes, highlighting the centromeric differential composition in this species. The cloning and sequencing oh the repetitive fraction showed that different microsatellites, transposons, retrotransposons and some gene families also make up the fraction of moderately and highly repetitive DNA in the species teídeos. The results of this study demonstrated that different classes of repetitive DNA are part of the genome of Ameiva ameiva, Cnemidophorus sp.1, Kentropyx calcarata, Kentropyx pelviceps and Tupinambis teguixin, being interspersed heterochromatin and differences in the composition of this repetitive fraction between teideos are evident. These sequences plays an important role in the functional and structural organization of the centromere and telomere these species. / Macroteídeos são lagartos Neotropicais da família Teiidae, a qual apresenta variação cariotípica quanto ao número diploide e diferenças nos padrões de distribuição da heterocromatina. Contudo, o mapeamento físico cromossômico de DNAs repetitivos bem como análises comparativas destes elementos são incipientes no grupo, sendo fundamentais para o entendimento da dinâmica, organização e a carioevolução destes lagartos. Diante disto, o presente estudo isolou e mapeou diferentes classes de sequências de DNAs repetitivos, tais como fração repetitiva Cot1-DNA, DNAr 5S, sequências teloméricas, genes da tropomiosina 1 e os retroelementos Rex 1 e SINE em cromossomos mitóticos de cinco espécies de teídeos amazônicos: Ameiva ameiva, Cnemidophorus sp.1, Kentropyx calcarata, Kentropyx pelviceps e Tupinambis teguixin. O mapeamento das sequências repetitivas revelou um padrão diferenciado em Cnemidophorus sp.1, enquanto que as demais espécies apresentaram todas as sequências associadas entre si na região heterocromática. O mapeamento físico cromossômico do gene da tropomiosina 1 foi realizado pela primeira vez em lagartos e revelou que, além de ser funcional, este possui função estrutural semelhante aos demais elementos repetitivos mapeados, estando localizados preferencialmente nas regiões centroméricas e terminais dos cromossomos. A FISH com Cot1-DNA isoladas tanto de Ameiva ameiva quanto de Cnemidophorus sp.1 evidenciou que estas sequências estão localizadas principalmente nas regiões heterocromáticas centroméricas e teloméricas dos cromossomos de Ameiva ameiva, Kentropyx calcarata, Kentropyx pelviceps e Tupinambis teguixin. Em Cnemidophorus sp.1 a sonda de Cot1-DNA isolada de Ameiva ameiva apresentou múltiplas marcações intersticiais nos cromossomos, enquanto que o mapeamento do Cot1-DNA isolado da própria espécie marcou regiões centroméricas de alguns cromossomos, ressaltando a composição centromérica diferencial nesta espécie. A clonagem e o sequenciamento do Cot1-DNA evidenciou que diferentes microssatélites, transposons, retrotransposons e algumas famílias gênicas também compõe a fração de DNA moderada e altamente repetitiva nas espécies de teídeos. Assim, os resultados obtidos neste estudo demonstraram que diversas classes de DNAs repetitivos fazem parte do genoma das espécies analisadas, estando estes intercalados e alocados na heterocromatina, especialmente em regiões centroméricas e teloméricas, indicando que estes desempenham papel importante na organização funcional e estrutural.

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