PORTUGAL, A. B. Estrutura das comunidades bentônicas sésseis em recifes de arenito na Costa Oeste do Ceará, Nordeste do Brasil: variação espacial e índice relativo de pressão ambiental. 2016. 166 f. Tese (Doutorado em Ciências Marinhas Tropicais), Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2016. / Submitted by Geovane Uchoa (geovane@ufc.br) on 2017-03-07T15:24:51Z No. of bitstreams: 1 2016_tese_abportugal.pdf: 12337625 bytes, checksum: a4aaffb56988dccdd334e6f04e996acd (MD5) / Approved for entry into archive by Nadsa Cid (nadsa@ufc.br) on 2017-04-24T15:59:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_tese_abportugal.pdf: 12337625 bytes, checksum: a4aaffb56988dccdd334e6f04e996acd (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-24T15:59:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_tese_abportugal.pdf: 12337625 bytes, checksum: a4aaffb56988dccdd334e6f04e996acd (MD5) Previous issue date: 2016 / Tropical sandstone reefs are being affected by multiple human stressors and information about environmental degradation are alarming. However, knowledge about possible impacts on sandstone reefs in the tropical zone of the planet is still insufficient. The study added multiple factors of anthropogenic pressure through the relative environmental pressure index (REPI) and related to species richness, diversity of Shannon-Wiener and evenness of Pielou, furthermore the variation of the benthic community in intertidal over the west coast of Ceará was assessed. The original research was conducted in five sandstone reefs distributed on the west coast of Ceará, Northeastern Brazil (Tropical Southwestern Atlantic). The reefs are distant westbound from the city of Fortaleza. The collections of samples were carried out in the dry season in low-water spring tide. Sessile benthic communities in intertidal zone were sampled quali-quantitatively by nondestructive method - the percentage coverage of species - using the fotoquadrat. The results show greater richness and diversity in the lower areas of the reef, as well as was identified that there is a significant negative correlation (R² = 0.82, p = 0.03) between the REPI and richness of species. We observe that in areas with the highest number of human activities, we had lower number of species. The most active factors to lower biodiversity were urbanized area, the jetties to control coastal erosion, the kiosks and restaurants on the beachfront and storm sewers due clandestine sewage connections. Thus, we suggest to future work on multiple anthropogenic impacts about biological communities that aggregate indicators should be used (such as REPI) and be identified which factors have more influence on local biodiversity. The tropical zone is important, due to increased urbanization and anthropogenic pressures and is considered one of the areas of greatest marine biodiversity on the planet. The present results point to the need for better planning of infrastructure and the need for strict monitoring because the areas under greater influence of multiple human pressures are those with lower biodiversity. / Os recifes de arenito tropicais estão sendo afetados por múltiplos estressores humanos e as informações sobre a degradação ambiental são alarmantes. Entretanto, o conhecimento sobre possíveis impactos nos recifes de arenito na zona tropical do planeta ainda é insuficiente. O presente estudo integrou múltiplos fatores de pressões antrópicas através do índice relativo de pressão ambiental (REPI) e o relacionou com a riqueza de espécies, diversidade de Shannon-Wiener e equitabilidade de Pielou, assim como avaliou a variação da comunidade bentônica no entremarés ao longo da costa oeste do Ceará. A pesquisa inédita foi conduzida em cinco recifes de arenito distribuídos na costa oeste do Ceará, Nordeste do Brasil (Atlântico Sudoeste Tropical). Os recifes se distanciam no sentido oeste da cidade de Fortaleza. As coletas das amostras foram realizadas no período seco em baixamar de sizígia. As comunidades bentônicas sésseis da zona entremarés foram amostradas quali-quantitativamente através do método não destrutivo - a porcentagem de cobertura das espécies - utilizando o fotoquadrat. Os resultados mostram maior riqueza e diversidade nas zonas inferiores dos recifes, assim como foi identificado que existe uma relação negativa significativa (R2 = 0.82, p = 0.03) entre o REPI e a riqueza de espécies. Foi observado que a medida que aumenta o valor do REPI diminui o valor da riqueza de espécies. Os fatores antrópicos mais atuantes para a menor riqueza de espécies foram o percentual da área urbanizada, os molhes para controle da erosão costeira, as barracas e restaurantes na orla da praia e as galerias pluviais devido ligações clandestinas de esgoto. Desta forma, sugerimos aos trabalhos futuros sobre múltiplos impactos antrópicos nas comunidades biológicas sejam utilizados indicadores agregados (como o REPI) e identificados quais fatores apresentam mais influência sobre a biodiversidade local. A zona tropical é importante, devido ao aumento da urbanização e das pressões antrópicas e ser considerada uma das zonas de maior biodiversidade marinha do planeta. Os presentes resultados apontam para a necessidade de um melhor planejamento de infra-estruturas e a necessidade de um monitoramento rigoroso, porque as áreas sob maior influência das múltiplas pressões humanas são aqueles com menor biodiversidade.

PAIVA, Carolina Cerqueira de. Distribuição de recrutas e adultos de cinco espécies de peixes recifais do Atol das Rocas. 2008. 76f. Dissertação(Mestrado em engenharia de Pesca) - Centro de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2008. / Submitted by Maria Naires Souza (marianaires@ufc.br) on 2011-12-02T23:07:47Z No. of bitstreams: 1 2008-dis-ccpaiva.pdf: 3925479 bytes, checksum: c5d5fc9f1c2ec9e4662e821839088cba (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Nascimento(vieiraaline@yahoo.com.br) on 2011-12-08T12:07:01Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008-dis-ccpaiva.pdf: 3925479 bytes, checksum: c5d5fc9f1c2ec9e4662e821839088cba (MD5) / Made available in DSpace on 2011-12-08T12:07:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008-dis-ccpaiva.pdf: 3925479 bytes, checksum: c5d5fc9f1c2ec9e4662e821839088cba (MD5) Previous issue date: 2008-10-02 / The success in the recruitment of reef fish depends on the number of individuals who survive after larvae have entered in the reef environment. Different post-recruitment processes are responsible for the distribution of recruits and adults and consequently, for the structure of their populations. The distribution of Abudefduf saxatilis, Stegastes rocasensis, Thalassoma noronhanum, Acanthurus chirurgus and Acanthurus coeruleus recruits and adults were assessed through visual censuses in the Atol das Rocas. 13 sample stations with contrasting features were pooled in five categories: nine pools, a tidal pond formation, a patch reef formation, a sandstone reef and an algae crest. Pools were classified as connected (Barretinha, Barreta Falsa and Podes Crer) and non-permanently connected (Farol 2, Garoupinha, Cemitério, Âncoras, Abrolhos and Tartarugas) with the ocean. Non-connected pools were classified in shallow (Farol 2, Garoupinha and Cemitério) and deep (Âncoras, Abrolhos and Tartarugas). Unifactorial analysis of variance revealed that tidal ponds and pools were the most preferred categories among recruits, while the majority of adults avoided tidal ponds. Independent t-tests per groups demonstrated that the type of pool connectivity with the ocean affected the distribution of the largest part of recruits, however to a much lesser extent in the case of adults. Non-connected pool depth affected the distribution of most recruits and all adults. Migratory movements, structural complexity, reef substrate coverage, the presence of conspecifics, food availability and predator presence are post-recruitment processes that probably affected recruit and adult distribution. Depth may have also influenced A. chirurgus, A. saxatilis recruits and A. coeruleus adults to a certain extent. No A. coeruleus recruits have been observed. / O sucesso no recrutamento de peixes recifais depende do número de indivíduos que sobrevivem após a entrada das larvas no ambiente recifal. Diversos processos pós-recrutamento são responsáveis pela distribuição de recrutas e adultos e, conseqüentemente, pela estruturação da população destes. A partir da realização de censos visuais subaquáticos foi caracterizada a distribuição dos recrutas e adultos de Abudefduf saxatilis, Stegastes rocasensis, Thalassoma noronhanum, Acanthurus chirurgus e Acanthurus coeruleus no Atol das Rocas. Foram amostradas 13 estações com características contrastantes, formando cinco categorias: nove piscinas, uma formação de poças de maré, uma formação de recifes em mancha, um recife de arenito e uma crista algálica. As piscinas foram classificadas em conectadas (Barretinha, Barreta Falsa e Podes Crer) e não conectadas (Farol 2, Garoupinha, Cemitério, Âncoras, Abrolhos e Tartarugas) permanentemente com o oceano. As piscinas não conectadas, por sua vez, foram classificadas em rasas (Farol 2, Garoupinha e Cemitério) e fundas (Âncoras, Abrolhos e Tartarugas). Análises de variância unifatoriais revelaram que as poças de maré e as piscinas foram as categorias de maior preferência entre os recrutas enquanto as poças de maré foram evitadas pela maioria dos adultos. Testes-t independente por grupos demonstraram que o tipo de conectividade das piscinas com o oceano interferiu na distribuição da maior parte dos recrutas, mas nem tanto na dos adultos. Já a profundidade das piscinas não conectadas influenciou a distribuição da maioria dos recrutas e de todos os adultos. Movimentos migratórios, complexidade estrutural e cobertura do substrato, presença de outros indivíduos da mesma espécie, disponibilidade de alimento e presença de predadores são os processos pós-recrutamento que provavelmente influenciaram a distribuição de recrutas e adultos. Além disso, a profundidade também pode ter exercido alguma interferência na distribuição de A. chirurgus, dos recrutas de A. saxatilis e dos adultos de A. coeruleus. Não foram observados recrutas de A. coeruleus

A Bacia do Tucano Central, localizada no estado da Bahia, consiste em um meio-gráben alongado norte, cuja assimetria é gerada por uma falha de borda principal. O presente trabalho tem por objetivo a caracterização sedimentológica e estratigráfica detalhada dos depósitos deltaicos do Grupo Ilhas, acumulados durante a fase rifte. A partir de levantamentos de perfis colunares, elaboração de fotomosaicos e a análise de paleocorrentes, foram identificadas para o intervalo estudado doze litofácies, que podem ser agrupadas em quatro associações de fácies: prodelta, frente deltaica distal, frente deltaica proximal e planície deltaica. A partir do estudo do empilhamento estratigráfico dos afloramentos estudados, associados à análise de poços, foi possível determinar diferentes padrões de empilhamento. É possível dizer que a base do Grupo Ilhas apresenta padrão retrogradacional, indicando um trato de sistema tectônico de clímax de rifte. A porção superior, por sua vez, é caracterizada por um padrão progradacional, configurando o trato de sistemas tectônico de final de rifte. Através da interpretação do diagrama de paleocorrentes é possível identificar dois padrões distintos de alimentação fluvial dos deltas do Grupo Ilhas: um principal para S-SE, proveniente da borda axial, e outro secundário para E-SE, oriundo da borda flexural. A distribuição regional das paleocorrentes e o mapa de razão arenito/pelito sugerem um amplo meio-graben com depocentro a sul. / Depositional Model, Facies Architecture and Stratigraphic Evolution of the Deltaic Systems of Ilhas Group, Tucano Central Basin – BA. The Tucano Central Basin, located in the northeastern portion of the Bahia State, consists in an S-N elongated half-graben, which asymmetry is generated by a main border fault. The present work aims to a detailed sedimentological and stratigraphic characterization of the deltaic deposits of the Ilhas Group, accumulated during the rift phase. From sedimentary logs, preparation of photomosaics and paleocurrent analysis were identified twelve lithofacies, which can be grouped into four facies associations: pro-delta, distal deltaic front, proximal deltaic front and deltaic plain. Through the investigation of the stratigraphic succession of the studied outcrops associated with the analysis of wells, was possible to define distinctive stacking pattern. It is possible to consider that the base of the Ilhas Group presents a retrogradational pattern, indicating a rift climax tectonic system tract. The upper portion, on its turn, is characterized by a progradational pattern, configuring the rift ending tectonic system tract. By the interpretation of the paleocurrent diagram it’s possible to identify two distinct fluvial feeding patterns of the deltaic systems of the Ilhas Group: a main one with S-SE vector indication, which sediments are from axial border, and another one with E-SE vector indication, which sediments are from the flexural margin. The regional distribution of paleocurrent and the map of the sandstone/mudstone ration suggest a wide half graben basin with depocenter in the south part.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, Florianópolis, 2015. / Made available in DSpace on 2016-04-19T04:06:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 337975.pdf: 1443328 bytes, checksum: d32d6958bbdcf0613cdc0ef33ea883ae (MD5) Previous issue date: 2015 / Áreas recifais marginais estão sendo consideradas em todo mundo como áreas prioritárias para conservação, já que essas áreas possuem um grande potencial evolutivo das espécies. Tem sido vista também uma ampliação de distribuição de espécies tropicais nessas áreas, em função das mudanças ambientais. Recentemente, foi encontrado o único banco de corais rolados (banco de coralitos) do Atlântico Subtropical na Reserva Biológica Marinha do Arvoredo, no litoral de Santa Catarina ? Brasil. Os recifes rochosos de Santa Catarina são considerados o limite sul de distribuição de várias espécies tropicais de peixes, ascídias, esponjas e corais, entre outros. O banco é formado por colônias livres roladas do coral Madracis decactis, que estruturam um ambiente diferente dos costões rochosos adjacentes. O presente estudo avalia o recrutamento dos organismos sésseis associados ao banco de coralitos e sua composição. O recrutamento dos organismos foi avaliado com experimento ?in situ? ao longo de 12 meses com placas de recrutamento em inclinações, distâncias do costão e tempos de submersão das placas de recrutamento distintos. Conjuntos de placas foram retirados com 3, 6 e 12 meses de submersão e analisados para investigar a composição e variação no recrutamento. Observamos que há padrão na distribuição das espécies principalmente em relação ao tempo de submersão das placas, com as maiores variações na composição da comunidade entre as placas com 3 e 6 meses submersão, se estabilizando a partir das placas com 6 meses de submersão, sem grandes alterações quando comparadas as placas com 12 meses de submersão. O fator inclinação e a distância do costão também apresentaram valores significativos com relação a variação na taxa de recrutamento. Encontramos 14 grupos taxonômicose/ou funcionais durante o experimento sendo que desses grupos, cirripedia, biofilme e macroalga coriácea obtiveram maior correlação com o tempo de submersão em que as placas foram expostas. Os grupos ascidiacea, bryozoa e macroalga crostosa obtiveram maior correlação com relação a inclinação, onde a macroalga crostosa obteve as maiores porcentagens de cobertura nas placas com inclinação horizontal sendo que os outros grupos citados na inclinação vertical. Os grupos cirripedia e hydrozoa apresentaram maior correlação com o fator distância do costão, sendo encontrados em maior número nas placas mais afastadas do costão. A composição da comunidade se altera em função das condições ambientais e das relações interespecíficas, sendo independente da composição inicial. Os resultados vão de encontro com a teoria de sucessão, onde o tempo é o principal fator explicando as mudanças na composição da comunidade. Não foi observado nenhum recruta do coral M. decactis nas placas de recrutamento.. O estudo revela um ambiente vulnerável já que a espécie principal estruturadora do ambiente está em situação frágil no ponto de vista ecológico, com uma população pequena, de lento crescimento e aparentemente com pouca ou nenhuma contribuição da reprodução sexuada. Novas medidas de manejo devem ser adotadas para que haja efetividade na conservação desse ambiente único.<br> / Abstract : Marginal reef areas are now considered priority areas for conservation around the world because of the great evolutionary potential of associated species. Tropical species distributions have recently expanded in these areas as a result of environmental change. Recently, the only Atlantic subtropical coralith bed was found in the Arvoredo Marine Biological Reserve on the coast of Santa Catarina, Brazil. The rocky reefs of Santa Catarina are considered the southern boundary for distribution of various species of tropical fish, sea squirts, sponges, and corals, among others. The bank is formed by free colonies of the coral Madracis decactis, which structure an environment quite different from the adjacent rocky shores. This study evaluates the recruitment of sessile organisms associated with the coralith bed, and species composition. Recruitment was assessed via "in situ" experiments in which recruitment plates were placed on different slopes, distances from shore, and submersion times; results were evaluated over 12 months. Plate sets were removed at 3, 6 and 12 months post-submergence for investigation of variation in community composition and recruitment. We found the greatest differences in plate community composition between 3 and 6 months post-immersion; this difference stabilized at 6 months of submersion without further major differences. Different slope angles and distances from shore produced significant variation in recruitment rate. We found 14 taxonomic and/or functional groups during the experiment and of these groups, cirripeds, biofilm and coriaceous macroalgae showed the greatest correlations with plate submergence time. Ascidiacea, bryozoa and crustose algae were the groups most correlated with slope, and crustose macroalgae had the highest percentages of coverage on the plates with horizontal slopes, with the other groups were found in greater abundances on vertical slopes. Cirripeds and hydrozoa showed strong correlation with distance from the shore, with greater numbers on plates further from the rocky shore. Changes in community composition depended on environmental conditions and interspecific relationships, independent of initial composition. These results are in accordance with the succession theory,in which time is the primary explanatory factor for changes in community composition. New M. decactis recruits were not found on experimental plates. The study reveals a vulnerable environment as the main structuring species seems to be in an ecologic fragile situation, with a slow-growing, small population and poor or lack of sexual reproduction. . New management measures must be applied in order to promote effective conservation of this unique environment.

Resumo: Ilhas costeiras abrigam comunidades biológicas diversas e grande riqueza de espécies. Os habitats subtidais das ilhas da costa sul do Brasil foram insuficientemente estudados, principalmente em relação às comunidades bênticas sésseis. A maior parte dos estudos centrou em inventários da fauna e flora. O objetivo deste trabalho é contribuir para o conhecimento da biodiversidade marinha do Estado de Santa Catarina, descrever a estrutura espacial e composição quali-quantitativa das comunidades sésseis e analisar a conectividade genética entre as ilhas. Através de mergulho autônomo, em profundidades entre 6 e 15 metros, métodos não-destrutivos baseados em fotografia digital foram aplicados para o estudo ecológico. Espécimens foram coletados para a taxonomia e biologia molecular. Cento e onze táxons foram identificados na área de estudo, dos quais cinquenta e sete são novos registros. As análises ecológicas detectaram diferenças em relação à cobertura bêntica entre as ilhas do norte (Galés, Arvoredo e Deserta) e as do sul (Campeche e Arquipélago de Moleques do Sul). Na análise de espécies indicadoras Porifera foi indicador de formação do grupo das ilhas do sul, e Anthozoa, do grupo de ilhas ao norte. Grupos orfofuncionais e locais específicos são recomendados para um futuro e necessário programa de monitoramento na região. Os resultados das análises genéticas da ascídia Didemnum granulatum Tokioka 1954 ugerem ausência de conectividade entre as ilhas, e dois morfotipos de cor submetidos à análise de divergência genética comprovaram fortes evidências da existência de subespécies. Os conhecimentos gerados são base para subsidiar planos gestores das ilhas da região, assim como o monitoramento das comunidades frente à compreensão de possíveis mudanças ambientais, garantindo a proteção à biodiversidade e ao atrimônio genético local.

Made available in DSpace on 2015-06-17T19:34:33Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-08-04. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:48:38Z : No. of bitstreams: 1 000828456_20160101.pdf: 422063 bytes, checksum: 8476834ceb55ae5bce2c637566dd5def (MD5) Bitstreams deleted on 2016-01-04T10:26:22Z: 000828456_20160101.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-01-04T10:28:15Z : No. of bitstreams: 1 000828456.pdf: 2122241 bytes, checksum: 622d6ebfa87551ddad978a95d5a84bc8 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A endometriose é uma doença crônica multifatorial, inflamatória, estrógeno-dependente, que afeta entre 8 a 10% das mulheres em idade reprodutiva e caracterizada por tecido similar ao endométrio (glândula e estroma) fora da cavidade uterina. Embora a sua etiologia seja pouco conhecida, evidências recentes indicam que alterações epigenéticas estão envolvidas na sua patofisiologia. Esta hipótese é apoiada pelos achados envolvendo padrões alterados de metilação do DNA em genes específicos, bem como pelos níveis alterados de expressão de componentes da maquinaria epigenética nas lesões endometrióticas, quando comparadas ao endométrio eutópico da mesma paciente ou ao endométrio de mulheres que não apresentam a doença. Assim, um melhor entendimento do papel dos mecanismos epigenéticos na patogênese e progressão da endometriose tem se tornado necessário, podendo contribuir para a identificação de marcadores diagnósticos e para o delineamento de novas abordagens terapêuticas, que trariam benefícios e melhor qualidade de vida para as mulheres que apresentam esta condição. Neste contexto, este estudo buscou a identificação de genes diferencialmente metilados candidatos a biomarcadores na endometriose. Os resultados obtidos foram organizados em dois artigos científicos. O primeiro artigo teve como objetivo investigar o perfil diferencial de metilação do DNA na endometriose intestinal em comparação com amostras pareadas de endométrio eutópico da mesma paciente. Para isso, foi empregada uma abordagem em larga escala baseada em microarranjos contendo 27.800 ilhas CpG, que resultou na identificação de 546 genes hipermetilados e 871 genes hipometilados. A análise in silico para a classificação funcional dos genes diferencialmente metilados permitiu identificar conjuntos de genes com funções de fatores de transcrição, remodeladores da cromatina entre outras classes funcionais. Após a realização de uma ... / The endometriosis is a multi-factorial and chronic disease affecting 5% to 10% of women in reproductive age characterized by endometrium-like tissue (gland and stromma) outside uterine cavity. Although its etiology is poorly understood, recent evidences have indicated that epigenetic alterations are implicated in the pathophysiology. This hypothesis has been supported by findings surrounding altered DNA methylation pattern of specific genes, as well as by altered levels of expression of epigenetic machinery components in endometriotic lesions compared to eutopic endometrium from the same patient or endometrium of women free of disease. Thus, a better understanding of the role of epigenetic mechanisms in the pathogenesis and progression of endometriosis has become necessary and may contribute to the identification of diagnostic markers and for designing new therapeutic approaches that could benefit and improve the quality of life of women with this condition. In this context, this study aimed to identify differentially methylated genes as candidate biomarkers in endometriosis. The results could be organized in two papers. The first study aimed to investigate the profile of differential DNA methylation in intestinal endometriosis compared to eutopic endometrium of paired samples from the same patient. For this, we carried out a large-scale approach based on microarray containing 27,800 CpG islands, resulting in the identification of 546 genes as hypermethylated and 871 genes as hipomethylated. In silico analysis for the functional classification of differentially methylated genes enabled us to identify sets of genes with functions of transcription factors, chromatin remodeling, besides other functional classes. After conducting a comparative assessment with data available in other large-scale studies of literature, it was possible to recognize recurrent alteratons evolving 227 hypermethylated and 322 hypomethylated ...

A Fibrose cística (FC) é uma condição genética que predispõe os portadores a infecções crônicas repetidas do trato respiratório. O complexo Burkholderia cepacia (CBC), formado por espécies (variantes genômicas) intimamente relacionadas, são microorganismos comumente associados a essas infecções. A variante genômica do CBC envolvida na colonização de um determinado paciente influencia diretamente na progressão da sua doença e sobrevida. A identificação fenotípica do CBC é difícil por se tratar de um bacilo Gram-negativo não fermentador e a identificação de suas espécies é ainda mais complexa devido à similaridade fenotípica que existe entre elas. Os principais objetivos do estudo foram a padronização de uma técnica molecular de PCR-RFLP ("polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism") para identificação do CBC e de suas espécies e o estabelecimento da prevalência dessas espécies entre os pacientes com FC atendidos no Hospital de Clínicas de Porto Alegre no período de fevereiro a dezembro de 2006. Na análise por PCR foram utilizados iniciadores específicos para o gene recA (BCR1 e BCR2). Para o RFLP foram utilizadas as enzimas de restrição HaeIII e Mnll (New England Biolabs Inc., Hitchin, England). No período do estudo foram submetidas ao laboratório amostras de 244 pacientes com FC, sendo que em amostras de 26 pacientes foram identificadas bactérias pertencentes ao CBC. Nesse período, 10.6% (26/244) dos pacientes com fibrose cística que entraram no critério de inclusão estavam colonizados pelo CBC. A análise molecular do gene recA mostrou que B. cenocepacia foi isolada de 53.8% (14) dos pacientes, B. multivorans; 15.4% (4); B. vietnaminsis 7.7% (2) e B. ambifaria 7.7% (2). Dois pacientes 7.7% (2) estiveram colonizados por B. cenocepacia IIIA and IIIB em diferentes momentos. Em dois pacientes não foi possível realizar a identificação em nível de espécie. As técnicas moleculares, como PCR-RFLP são mais eficientes para a identificação do CBC e as únicas capazes de identificar suas variantes genômicas, o que é imprescindível para o acompanhamento clínico dos pacientes portadores de fibrose cística.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Humanas, Programa de Pós-Graduação em História, 2016. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-09-09T19:33:47Z No. of bitstreams: 1 2016_MaurineideAlvesdaSilva.pdf: 2482365 bytes, checksum: 3ca89dcd4c6290c87ecc148441ac930c (MD5) / Approved for entry into archive by Ruthléa Nascimento(ruthleanascimento@bce.unb.br) on 2016-10-04T18:55:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_MaurineideAlvesdaSilva.pdf: 2482365 bytes, checksum: 3ca89dcd4c6290c87ecc148441ac930c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-04T18:55:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_MaurineideAlvesdaSilva.pdf: 2482365 bytes, checksum: 3ca89dcd4c6290c87ecc148441ac930c (MD5) / A Guerra das Malvinas foi um conflito armado entre Argentina e Grã-Bretanha pela posse das denominadas Ilhas Malvinas localizadas no Atlântico Sul, tendo como desfecho a vitória britânica e o início de um conflito muito mais extenso dentro da própria sociedade argentina: o embate gerado pelas diferentes construções de memórias sobre a guerra. Com esse trabalho de pesquisa busco entender como se processa tal embate no campo das memórias da guerra, identificando quais os temas mais controversos e geradores de conflitos ao longo dos trinta e três anos após o seu desfecho e como diferentes grupos tem participado dessas discussões, seus argumentos e objetivos. No decorrer do trabalho, analiso as perspectivas dos principais participantes do processo de construções de memórias e do embate gerado por elas: veteranos e familiar de soldado morto no conflito, através dos seus relatos orais, intelectuais que pesquisam o tema, por meio de suas obras, e as duas narrativas fílmicas consideradas os marcos da representação dessa guerra no cinema, Los chicos de la guerra (1984) e Iluminados por el fuego (2005). A hipótese é que tal embate esteja plenamente enredado no fato de que a guerra foi empreendida por um governo da ditadura militar, sendo que tais construções de memórias estão estreitamente vinculadas às reivindicações que cada grupo tem demandado no momento em que estas memórias são elaboradas, ou seja, parece que elas têm maior relação com o contexto histórico de sua construção, do que com a própria guerra. Este trabalho de pesquisa, obviamente não visa compreender todos os aspectos do conflituoso campo de construções de memórias sobre a Guerra das Malvinas. É um campo bastante complexo e permeado por vários temas geradores de controvérsias, dos quais elegi como foco os mais polêmicos e conflituosos quando se trata de representar o que foi a guerra e os seus combatentes. Portanto, o objetivo é apresentar um dos inúmeros caminhos de compreensão possíveis do significado desse evento para a História da Argentina e a sua relação com o momento histórico vivido pelo país. ________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The Malvinas War was an armed conflict between Argentina and Britain over the possession of so-called Malvinas Islands located in the South Atlantic, with the outcome of the British victory and the beginning of a much larger conflict within the Argentine society: the shock generated by different constructions of memories about the war. With this work I seek research to understand how to process such clash in the field of memories of the war, identifying the most controversial issues and generating conflicts over the thirty-three years after the outcome and how different groups have taken part in these discussions, their arguments and objectives. During the work, analyze the perspectives of key players in the process memories of buildings and clash generated by them: veterans and family of soldier killed in the conflict, through their oral histories, intellectuals researching the topic, through their works, and the two filmic narratives considered landmarks of representation of war in cinema, Los chicos de la guerra (1984) and Iluminados por el fuego (2005). The hypothesis is that this clash is fully enmeshed in the fact that the war was waged by a government of the military dictatorship, and such constructions memories are closely linked to the claims that each group has demanded at the time that these memories are prepared, or is, it seems that they are more related to the historical context of its construction, than the war itself. This research aims obviously does not understand all the aspects of conflicting constructions field memories of the Malvinas War. It is a very complex field and permeated by various generative themes of disputes, of which I have chosen to focus on the most controversial and conflictive when it comes to represent what was the war and its combatants. Therefore, the aim is to present one of the many possible ways of understanding the significance of this event for the history of Argentina and its relation to the historical moment experienced by the country.

Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2017-10-18T22:03:09Z No. of bitstreams: 1 634866.pdf: 11331331 bytes, checksum: 886dc263b9466d639b7858976549bcce (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-18T22:03:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 634866.pdf: 11331331 bytes, checksum: 886dc263b9466d639b7858976549bcce (MD5) Previous issue date: 2004-11 / O padrão de recrutamento de famílias de corais verdadeiros (Scleractinia) e hidrocorais (Milleporidae) foi estudado nos recifes dos arcos internos do Banco dos Abrolhos, para ajudar a compreender aspectos dos processos de formação e manutenção das populações. A identidade e abundância dos recrutas, a cobertura de coral e a deposição de sedimentos, entre outras variáveis, foram investigadas em seis recifes. Foram triadas 140 placas, com um total de 2.532 recrutas identificados. Famílias incubadoras de larvas tiveram taxas de recrutamento mais altas que as liberadoras de gametas. Recrutas de Poritidae (29%) foram os mais abundantes, seguidos por Milleporidae (24%) e Faviidae (19%). Não foram observados recrutas de Mussidae, família composta principalmente por espécies liberadoras de gametas e de cobertura relativamente alta nos recifes estudados. Houve correlação significativa entre recrutamento de Milleporidae, Faviidae e Astrocoeniidae e a abundância de adultos destes táxons ou uma de suas espécies. Sugere-se que esta correlação possa estar associada a processos de atração de larvas e não a recrutamento local. Não houve correlação entre recrutamento e deposição de sedimento. / Recruitment pattem of different families of scleractinian corais and milleporids were studied at the inner reefs of the Abrolhos Bank, to improve our understanding of processes of population formation and maintenance. The identity and abundance of recruits, coral cover, and sediment deposition, among other variables, were investigated at six reefs. We recovered 140 plates with a total of 2,532 recruits identified. Brooders families had higher recruitment rates than broadcasters. Recruits were dominated by Poritidae (29%), followed by Milleporidae (24%) and Faviidae (19%). We did not observe recruits of Mussidae, family composed mainly by broadcaster species with relatively high adult cover at the studied reefs. There was a significant correlation between the recruitment of Milleporidae, Faviidae nd Astrocenidae and adult's abundance of these taxa or one of its species. We suggest such correlation may be associated with larval attraction processes and not with local recruitment. No correlation was found between recruitment rates and sediment deposition.

Submitted by Maike Costa (maiksebas@gmail.com) on 2017-07-03T13:42:30Z No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 2175297 bytes, checksum: 0d32244b68ce823204f52f4f1ca022de (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-03T13:42:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 2175297 bytes, checksum: 0d32244b68ce823204f52f4f1ca022de (MD5) Previous issue date: 2017-02-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Genomic islands (GIs) are regions of the bacterial and archaeal genomes that were acquired through the phenomenon of horizontal transfer. Usually, these regions provide important adaptations to these organisms, such as antibiotic resistance and pathogenicity, whose effects can be harmful to other species. For these reasons, many computational methodologies have been proposed for their prediction, however, none of them are capable to precisely identify the whole repertoire of islands present in a given genomic sequence. Therefore, the development of new approaches that explore different aspects of these regions is timely, allowing the identification of those not known. In this paper, it is proposed a novel method for the identification of GIs, built based on mean shift clustering algorithm, with the automatic bandwidth calculation, necessary to its operation. Test results with genomic island inserted in bacterial genomes show that the method is capable of identifying these regions, with sensitivity rates above 99%. Tests performed with bacterial genomes with known GIs revealed the potential of the method for their identification and for the discovery of new island. The detailed study of the new islands content pointed the presence of typical GIs elements, confirming its effectiveness in the prediction of these regions. / Ilhas genômicas (IGs) são regiões do genoma de bactérias e arqueas adquiridas por meio do fenômeno da transferência horizontal. Frequentemente, essas regiões proporcionam importantes adaptações a esses organismos, como resistência a antibióticos e patogenicidade, cujos efeitos podem ser danosos a outras espécies. Por essa razão, diversas metodologias computacionais foram propostas para a sua predição, porém nenhuma capaz de identificar o repertório completo de ilhas presentes em uma determinada sequência genômica. Portanto, torna-se oportuno o desenvolvimento de novas abordagens que explorem diferentes aspectos dessas regiões, permitindo a identificação daquelas não conhecidas. Nesse trabalho, propõe-se um novo método para a identificação de IGs, construído com base no algoritmo de agrupamento mean shift, com o cálculo automático da largura de banda, indispensável para o seu funcionamento. Resultados dos testes com ilhas genômicas inseridas em genomas de bactérias mostram que o método é capaz de identificar essas regiões com taxas de acerto acima de 99%. Testes realizados com genomas de bactérias com IGs conhecidas revelaram o potencial do método para a sua identificação e para a descoberta de novas ilhas. O estudo detalhado do conteúdo das novas ilhas apontou a presença de elementos típicos de IGs, confirmando a eficácia do método na predição dessas regiões.