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Isolamento de micro-organismos endofíticos do Ipê Roxo (Tabebuia avellanedae) e avaliação da atividade antimicrobiana

FERREIRA, Luana Miguel dos Anjos 02 July 2012 (has links)
Submitted by Chaylane Marques (chaylane.marques@ufpe.br) on 2015-03-12T18:24:49Z No. of bitstreams: 2 Luana Ferreira_Completo.pdf: 1693618 bytes, checksum: c301fb5df53cc66816c58cab6f264254 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-12T18:24:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Luana Ferreira_Completo.pdf: 1693618 bytes, checksum: c301fb5df53cc66816c58cab6f264254 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012-07-02 / FACEPE / A ocorrência e o potencial farmacológico de metabólitos secundários de micro-organismos endofíticos de plantas, têm sido amplamente investigados. Tabebuia avellanedae, (ipê-roxo) é utilizada como analgésico, antiinflamatório, antibióticos e anti-mutagênico. Diante do potencial biotecnológico desta planta, o presente trabalho teve como objetivo isolar endofíticos de folhas de T. avellanedae e avaliar a atividade antimicrobiana. Foram isolados 166 endofíticos dos quais aproximadamente 74% (123) são fungos, 22% (36) bactérias e 4% (7) actinobactérias. Todas as actinobactérias foram identificadas como Streptomyces spp. Utilizou-se como micro-organismos testes bactérias Gram positivas, Gram negativas e leveduras patógenas oportunistas. Na seleção primária, actinobactérias (3) e fungos (9) apresentaram halos de inibição antimicrobiana. Destes endófitos na fermentação, aproximadamente 66,66% das actinobactérias tiveram atividade contra Staphylococcus aureus, Micrococcus luteus e Bacillus subtilis e 11,11% dos fungos contra Candida albicans. Para extração dos compostos biativos os melhores solventes, pHs, meios de cultura e tempo de cultivo foram, respectivamente, para Streptomyces sp. PCA 3: acetato de etila, pH 7, MPE, 96 horas; para Streptomyces sp. PCA 4: clorofórmio, pH 7 (extrato) e acetona, pH 2 (biomassa), MPE, 72 horas; e para o fungo PEF 6: acetato de etila, pH 7, cinco dias. Foram detectados nos extratos da planta e endofíticos bioativos ß-amirina, ß-sitosterol, ácido ursólico, flavonóides e alcalóides sendo constatado que os compostos produzidos pelo isolado Streptomyces sp. PCA 4 são mais semelhantes aos produzidos pela planta. Diante desses resultados, conclui-se que os endofíticos bioativos apresentam potencial farmacológico, porém outros estudos são necessários para comprovar a efetividade dos mesmos.
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Estabelecimento in vitro de Handroanthus impetiginosus (Mart. ex Dc.) Mattos (Bignoniaceae) e estudo da incidência de oídio (Oidium sp.) em plântulas obtidas in vitro / In vitro establishment of Handroanthus impetiginouses (Mart. ex Dc.) Mattos (Bignoniaceae) and study of incidence of powdery mildew (Oidium sp.) in vitro seedlings

Mamedes, Talita Cristina 02 April 2013 (has links)
Submitted by JÚLIO HEBER SILVA (julioheber@yahoo.com.br) on 2017-06-22T19:34:05Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Talita Cristina Mamedes - 2013.pdf: 960382 bytes, checksum: 686077b9e4ff166f99426931ebddf7e2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Cláudia Bueno (claudiamoura18@gmail.com) on 2017-07-07T20:21:23Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Talita Cristina Mamedes - 2013.pdf: 960382 bytes, checksum: 686077b9e4ff166f99426931ebddf7e2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-07T20:21:23Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Talita Cristina Mamedes - 2013.pdf: 960382 bytes, checksum: 686077b9e4ff166f99426931ebddf7e2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2013-04-02 / Handroanthus impetiginosus (Mart. ex DC.) Mattos is widely distributed woody species in Brazil. It has economic importance for its use as wood, medicinal, ecological and ornamental tree. There is great variation in the production of fruits and seeds over the years, many of the seeds are attacked by fungi and insects, and finally, the remaining intact seeds lose viability very quickly. Techniques of plant tissue culture can increase the rate of germination in woody species. The cultivation in nutrient medium under aseptic conditions, provides great production of seedlings in reduced time and space and at any time of year. Furthermore, in vitro propagation acts as a tool in the identification of microorganisms, studying their relationships and interactions with the host plant at genetic, cellular and physiological levels. The aim of this study was to establish a protocol for in vitro propagation of H. impetiginosus developed in three steps: decontamination and seed germination, induction of new shoots and roots. The protocol was based on direct organogenesis using plant material from seedlings germinated in vitro. For in vitro germination, seed surface contamination was controlled using 2 min. in 70% ethanol and 10 min. sodium hypochlorite with 2 % active chlorine. The germination rate was 99 % on MS medium. Induction and multiplication of new shoots were carried out with the aid of growth regulators 6 - benzylaminopurine (BAP) and naphthalene acetic acid (NAA) in different combinations. The results showed that for explants of H. impetiginosus all the tested amounts of BAP and NAA have the ability to regenerate shoots, callus and adventitious roots, it is necessary to improve the regeneration protocol to obtain greater number of new shoots. For in vitro rooting, cuttings responded positively to 6.0 mg L - 1 butyric acid (IBA), with 92 % rooting. However, the methods of decontamination of seeds did not control fungi of the genus Oidium. In order to identify the fungus and study the fungus - host relationship in H. impetiginosus cuts were made in vitro leaf fragments and the anatomical structure analyzed by optical microscope and scanning electron microscope. After the emergence of Oidium sp. on seedlings developed in vitro, methods of seeds disease control were tested for germination using different times and concentrations of ethanol, sodium hypochlorite, Chlorothalonil + tiophanate Methyl (systemic fungicid ) and Neem oil assessing the incidence and severity of each disease treatment. No treatment was effective in the control of powdery mildew, indicating the need for further studies. However, reduction of severity was observed in seeds treated with 70 % ethanol and sodium hypochlorite (2% active chlorine) and Neem oil immersion to 1.5 % for 10 minutes. / Handroanthus impetiginosus (Mart. ex DC.) Mattos é uma espécie arbórea de ampla distribuição no território brasileiro. Possui importância econômica por seu uso madeireiro, medicinal, ecológico e ornamental. Há grande variação na produção de frutos e sementes no decorrer dos anos, muitas das sementes produzidas são atacadas por fungos e insetos e, finalmente, as sementes que restam intactas perdem a viabilidade muito rapidamente. Técnicas de cultura de tecidos vegetais podem aumentar esta taxa de germinação em espécies arbóreas. O cultivo em meio nutritivo sob condições assépticas, proporciona grande produção de mudas em tempo e espaço reduzidos e em qualquer época do ano. Além disso, a propagação in vitro atua como ferramenta na identificação de microorganismos, estudando suas relações e interações com a planta hospedeira em níveis genético, celular e fisiológico. O objetivo deste trabalho foi estabelecer um protocolo de propagação in vitro de H. impetiginosus, desenvolvido em três etapas: descontaminação e germinação das sementes, indução de novos brotos e enraizamento. O protocolo foi baseado na organogênese direta, utilizando material vegetal de plântulas germinadas in vitro. Na germinação in vitro a contaminação superficial das sementes foi controlada utilizando 2 min. em etanol 70% e 10 min. em hipoclorito de sódio com 2% de cloro ativo. A taxa de germinação foi de 99 % em meio MS. A indução e multiplicação de novos brotos foram realizadas com o auxílio dos reguladores de crescimento 6-benzilaminopurina (BAP) e ácido naftalenoacético (ANA) em diferentes combinações. Os resultados mostraram que, para explantes de H. impetiginosus, todas as quantidades testadas de BAP e de ANA possuem a capacidade de regenerar brotos, calos e raízes adventícias, sendo necessário aperfeiçoar o protocolo de regeneração para obter número maior de novas brotações. No enraizamento in vitro, estacas caulinares responderam de maneira positiva a 6,0 mg.L-1 de ácido indolbutírico (AIB), com 92% de enraizamento. Porém, os métodos de descontaminação de sementes não controlaram fungos do gênero Oidium sp. Com o objetivo de identificar o fungo e estudar a relação fungo-hospedeiro em H. impetiginosus in vitro foram feitos cortes anatômicos de fragmentos foliares analisados com microscópio óptico e microscópio eletrônico de varredura. Após o aparecimento de Oidium sp. nas plântulas desenvolvidas in vitro, métodos de controle da doença em sementes foram testados para a germinação in vitro utilizando diferentes tempos e concentrações de etanol, hipoclorito de sódio, Clorotalonil + Tiofanato Metílico (fungicida sistêmico) e óleo de Nim avaliando a incidência e severidade desta doença em cada tratamento. Em nenhum tratamento houve o controle efetivo do oídio, indicando a necessidade de novos estudos. Porém, a redução da severidade foi observada em sementes tratadas com etanol 70% e hipoclorito de sódio (2% de cloro ativo) e imersão em óleo de Nim a 1,5% por 10 minutos.
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Efeito da suplementação nutricional no desenvolvimento de espécies florestais nativas do Cerrado, em viveiro / Effect of nutritional supplementation in the development of native forest species of Cerrado in nursery

Matias, Renan Augusto Miranda 21 February 2017 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Tecnologia, Departamento de Engenharia Florestal, 2017. / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2017-05-22T19:47:10Z No. of bitstreams: 1 2017_RenanAugustoMirandaMatias.pdf: 2354128 bytes, checksum: 08a04ae9c0db9ba2586ca5f51aac6077 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2017-06-06T19:03:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_RenanAugustoMirandaMatias.pdf: 2354128 bytes, checksum: 08a04ae9c0db9ba2586ca5f51aac6077 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-06T19:03:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_RenanAugustoMirandaMatias.pdf: 2354128 bytes, checksum: 08a04ae9c0db9ba2586ca5f51aac6077 (MD5) Previous issue date: 2017-06-06 / A exploração desordenada dos recursos naturais tem gerado a degradação de áreas em quase todo o território nacional, promovendo o aumento da demanda por produtos e serviços voltados à recuperação de áreas degradadas e, ou, perturbadas, em especial para produção de mudas de espécies florestais nativas. O presente trabalho teve como objetivo avaliar o efeito da fertilização do substrato e da suplementação nutricional via folha sobre o desenvolvimento de mudas de espécies florestais nativas do Cerrado em condições de viveiro, Kielmeyera coriacea Mart. & Zucc., Eugenia dysenterica (Mart.) DC., Handroanthus impetiginosus (Mart. ex DC.) Mattos e Myracrodruon urundeuva Allemão. O experimento foi implantado utilizando-se delineamento inteiramente casualizado (DIC), em esquema fatorial com dois fatores: o substrato em três níveis e a adubação foliar em três níveis, com dez repetições. Foram avaliados três tipos de substratos: 1 - Terra (Latossolo vermelho); 2 - Terra + esterco bovino na proporção 2:1; 3 - Terra + esterco bovino na proporção 2:1 + 2,2 Kg de NPK (10-10-10) por metro cúbico de substrato + 1,3 kg de calcário por metro cúbico de substrato. Tais substratos foram associados às três doses de adubação suplementar foliar (NPK aplicado semanalmente; NPK aplicado trimestralmente; e testemunha, sem aplicação de NPK foliar). Os tratamentos foram submetidos a análise de variância, avaliando os incrementos de altura, diâmetro e índice de qualidade de Dickson. Para a espécie Pau Santo é recomendado utilizar substrato composto apenas por Latossolo Vermelho, já para as espécies Cagaita e Ipê Roxo é recomendado utilizar substrato composto por Latossolo Vermelho com adição de esterco bovino na razão 2:1, não sendo recomendado realizar a adubação via foliar na produção de mudas para todas as espécies estudadas. A Aroeira não foi inserida nas análises, pois teve a incidência de “Tripes” nos primeiros meses pós transplantio, tendo seu crescimento prejudicado. Quanto a análise de solo, a matéria orgânica, quantidade de fósforo e cálcio foram determinantes na formação de grupos por meio da análise de componentes principais. A correlação das variáveis químicas do substrato não foi capaz de explicar com precisão as variáveis de medição e a distribuição das espécies em cada substrato no gradiente, por meio da análise de correspondência canônica. / The Disorganized exploration of natural resources has led to the degradation of areas in most of the national territory, thus increasing the demand for products and services aimed at the recovery of degraded land and, especially, for the production of native forest species seedlings. The objective of this study was evaluate the effect of substrate fertilization and leaf nutritional supplementation on the development of seedlings of native Cerrado forest species in nursery conditions, Pau Santo (Kielmeyera coriacea Mart. & Zucc.), Cagaita Eugenia dysenterica (Mart.) DC.), Ipê Roxo (Handroanthus impetiginosus (Mart. Ex DC.) Mattos) and Aroeira (Myracrodruon urundeuva Allemão). The experiment was implemented using a completely randomized design (CRD), in a factorial scheme with two factors: the substrate with three levels and foliar fertilization with three levels, with ten replicates. Three types of substrates were evaluated: 1 - Land (Red Latosol); 2 - Land + bovine manure in the proportion of 2:1; 3 - Land + bovine manure in a ratio of 2:1 + 2.2 kg NPK (10-10-10) per cubic meter of substrate + 1.3 kg of limestone per cubic meter of substrate. These substrates were associated with three doses of foliar fertilization (NPK applied weekly, NPK applied quarterly, and control, without foliar NPK application). The treatments were submitted to analysis of variance, evaluating Dickson, height, diameter and quality index increments. For Pau Santo species, it is recommended to use a substrate composed only of red latosol, and for the species Cagaita and Ipê Roxo it is recommended to use a substrate composed of Red Latosol with addition of bovine manure in the proportion of 2:1 ratio, and it is not recommended to apply foliar fertilization In the production of seedlings for all species studied. Aroeira was not included in the analyzes, as it had the incidence of Tripes in the first months after transplanting, and its growth was impaired. Regarding soil analysis, organic matter, amount of phosphorus and calcium were determinants in the formation of groups by principal component analysis. The correlation of the substrate chemical variables was not able to accurately explain the measurement variables and the distribution of the species in each substrate in the gradient by canonical correspondence analysis.
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Utilização de lodo de esgoto associado a três espécies nativas do cerrado na recuperação de áreas degradadas

Oliveira, Lázaro Silva de 27 May 2015 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Tecnologia, Departamento de Engenharia Florestal, Programa de Pós-graduação em Ciências Florestais, 2015. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2015-11-20T13:46:36Z No. of bitstreams: 1 2015_LázaroSilvadeOliveira.pdf: 2760190 bytes, checksum: ceb300aa87d6067a327c4d528e546a16 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2016-01-05T12:43:08Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_LázaroSilvadeOliveira.pdf: 2760190 bytes, checksum: ceb300aa87d6067a327c4d528e546a16 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-05T12:43:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_LázaroSilvadeOliveira.pdf: 2760190 bytes, checksum: ceb300aa87d6067a327c4d528e546a16 (MD5) / Várias técnicas têm sido utilizadas com o objetivo de recuperar solos degradados, e a maioria combina práticas mecânicascom a adição de matéria orgânica. Inúmeras fontes de matéria orgânica também têm sido utilizadas, como a do lodo de esgoto, que favorece a formação de agregados, facilitando a penetração das raízes e a vida microbiana; aumenta a resistência do solo à erosão; além de fornecer nutrientes para as plantas, propiciando maior rendimento de matéria verde e seca. O objetivo deste trabalho foi avaliar o desenvolvimento das mudas de três espécies do Cerrado em relação à altura, diâmetro e copa, em diferentes épocas de plantio, inicio e final do período chuvoso, utilizando o lodo de esgoto; e assimtestar sua viabilidade como adubo orgânico na recuperação de uma superfície degradada. O lodo, cedido pelaCompanhia Ambiental do Distrito Federal (CAESB), foi submetido à análise química de macro e micronutrientes, pH, sólidos voláteis, umidade, relação C/N e metais pesados. As mudas utilizadas no experimento foram das espécies Schinus terebinthifolius Raddi(aroeira),Anadenanthera colubrina (Vellozo) Brenan(angico) e Handroanthus impetiginosus (Mart. ex DC) (Mart. ex DC) Mattos(ipê roxo). As três espécies apresentam crescimento superior no período de início da chuva. Por sua vez, o ipê roxo apresentou o maior crescimento em diâmetro em porcentagem nos dois períodos. Em relação à altura em porcentagem para o IC a espécie mais bem sucedida foi o ipê roxo e para o FC o angico. Em relação ao crescimento em copa a espécie que apresentou o maior crescimento para o IC foi o angico e a espécie mais bem sucedida para o FC foi a aroeira. Todas as espécies responderam de forma positiva ao uso do lodo de esgoto. / Various techniques have been used with the aim of restoring degraded soils, and most practical mechanical combines with the addition of organic matter. Many organic materials have also been used, such as sewage sludge, which favors the formation of aggregates, facilitating the penetration of roots and microbial life; increases the soil's resistance to erosion; in addition to providing nutrients for the plants, providing a higher yield of green and dry matter. The objective of this study was to evaluate the development of seedlings of three species of the Cerrado in relation to height, diameter and canopy at different planting dates, beginning and end of the rainy season, using sewage sludge; and thus test its viability as organic fertilizer in the recovery of a degraded surface. The sludge, assigned by the Environmental Company of the Federal District (CEBS), was subjected to chemical analysis of macro and micronutrients, pH, volatile solids, humidity, C/N and heavy metals. The seedlings used in the experiment were of the species Schinus terebinthifolius Raddi (Aroeira), Anadenanthera colubrina (Vellozo) Brenan (Angico) and Handroanthus impetiginosus (Mart. Ex DC) (Mart. Ex DC) Mattos (Ipê-roxo). The three species have higher growth in the rain early period. In turn, the Ipê-roxo showed the highest growth in diameter in percent in both periods. Regarding the time percentage for the IC the most successful species was Ipê-roxo and FC Angico. Compared with the growth in the canopy species that showed the highest growth for the IC was the Angico and the most successful species for FC was the Aroeira. All species responded positively to the use of sewage sludge.
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Montagem e anotação funcional de sequências Gênicas de handroanthus impetiginosus (mart. ex DC) Mattos / Assembly and functional annotation of gene sequences handroanthus impetiginosus (mart. ex DC) Mattos

Fernandes, Lanusse Andrade 29 June 2015 (has links)
Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2016-05-04T17:52:11Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lanusse Andrade Fernandes - 2015.pdf: 1698917 bytes, checksum: b237e0d0c80dfe44acee928225ef0aa4 (MD5) license_rdf: 19874 bytes, checksum: 38cb62ef53e6f513db2fb7e337df6485 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-05-05T12:45:38Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lanusse Andrade Fernandes - 2015.pdf: 1698917 bytes, checksum: b237e0d0c80dfe44acee928225ef0aa4 (MD5) license_rdf: 19874 bytes, checksum: 38cb62ef53e6f513db2fb7e337df6485 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-05T12:45:38Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lanusse Andrade Fernandes - 2015.pdf: 1698917 bytes, checksum: b237e0d0c80dfe44acee928225ef0aa4 (MD5) license_rdf: 19874 bytes, checksum: 38cb62ef53e6f513db2fb7e337df6485 (MD5) Previous issue date: 2015-06-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Handroanthus impetiginosus, known as ipê roxo, is a species present in several Brazilian biomes, with ecological and economic importance. The species has suffered strong exploration thanks to the quality of its wood. Despite of its ecological importance, economic value and medicinal potential, there is virtually no genomic study published with this species. This work aimed to take advantage of the large sequencing capacity of next generation platforms to generate, assemble and functional annotate the sequences of the entire transcriptome of H. impetiginosus. Seeds were collected from two trees on the Campus II of the Universidade Federal de Goiás. The seeds were germinated, their aerial tissues collected and the RNA extracted and sent to the University of Illinois to be sequenced on the HiSeq 2500 platform (Illumina). A total of 148,359,530 sequencing reads were generated. The adapters and low-quality sequences were removed. Contaminating sequences were detected and eliminated, and the remaining sequences were normalized. Sequences were then assembled, annotated and polymorphisms were detected. A total of 190,885 scaffolds were assembled from 23,002 genes. Mimulus guttatus was the species with the most Blast best hit against the sequences of H. impetiginosus. Of all the Gene Ontology (GO) annotated sequences, the majority had categories for Biological Process (50.94%), followed by Cellular Component (28.34%) and Molecular Function (20.72%). The most frequent GO categories related to Biological Process were metabolic and cellular processes, while in Cell Components the most frequent were cell and organelles. Catalytic activity and binding of ions and molecules were the most frequent annotated categories of Molecular Function. As the sequences were generated from a pool of RNA from four plants, 25,169 InDels and 278,121 SNPs were identified. As expected, InDels are depleted in coding regions (CDS) when compared to SNPs. These results will be important for future studies with an interest in gene expression of the species. Furthermore, the possible SNPs identified can facilitate genetic studies and genomic H. impetiginosus populations. / Handroanthus impetiginosus, conhecida como ipê-roxo, é uma espécie presente em vários biomas brasileiros, tendo importância ecológica e econômica. O ipê-roxo vem sofrendo forte exploração graças à qualidade de sua madeira. Apesar de sua importância ecológica, seu valor econômico e de seu potencial medicinal, inexistem estudos genômicos publicados com esta espécie. Assim, este trabalho teve como objetivo principal aproveitar a grande capacidade de sequenciamento das plataformas de nova geração para gerar, montar e fazer anotação funcional da sequência do transcritoma de Handroanthus impetiginosus. Foram coletadas sementes de duas árvores matrizes de H. impetiginosus dispersas pelo Campus II da Universidade Federal de Goiás. As sementes foram germinadas, seus tecidos aéreos coletados e o RNA foi extraído e enviado à Universidade de Illinois para ser sequenciado na plataforma HiSeq 2500 da Illumina. Foi gerado um total de 148.359.530 sequências. Os adaptadores e as sequências de baixa qualidade foram removidos. Em seguida, possíveis sequências contaminantes foram detectadas e eliminadas, e as sequências restantes foram normalizadas. Ao final da normalização, as sequências foram montadas, anotadas e os polimorfismos detectados. Foram montados 190.885 transcritos (scaffolds), totalizando 23.002 genes. Mimulus guttatus, popularmente conhecida como flor de macaco, foi a espécie com maior número de sequências mais similares às de Handroanthus impetiginosus. De todas as sequências anotadas com categorias GO (Gene Ontology) a maioria teve anotações para Processo Biológico (50.94%), seguido de Componente Celular (28.34%) e Função Molecular (20.72%). As sequências mais frequentes relacionadas à Processo biológico estão ligadas a processos metabólicos e celulares, em Componentes Celulares as sequências mais frequentes estão ligadas a célula e a organelas. Já em Função Molecular as sequências mais frequentes estão relacionadas a atividade catalítica e ligação de íons e moléculas. Como as sequências foram geradas a partir de amostras de RNA de quatro plantas, 25.169 InDels e 278.121 SNPs foram identificados. Como esperado, os InDels são significativamente mais deplecionados em regiões codantes (CDS) que os SNPs.Estes resultados serão importantes para futuros estudos com interesse na expressão gênica da espécie. Além disso, os possíveis SNPs identificados poderão facilitar estudos de genética e genômica de populações para H. impetiginosus.
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Variabilidade genética entre e dentro de subpopulações de ipê-roxo Handroanthus Heptaphyllus (Vell.) Mattos e seu sistema reprodutivo

Mori, Neide Tomita [UNESP] 17 June 2010 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:30Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-06-17Bitstream added on 2014-06-13T19:50:20Z : No. of bitstreams: 1 mori_nt_me_botfca.pdf: 988090 bytes, checksum: 61ea693b25f67c44cb9358042b0c2f9c (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos, sinonímia Tabebuia heptaphylla ( Vell.) Toledo, popularmente conhecida por ipê-roxo, é uma espécie pertencente a família Bignoneaceae, muito apreciada pela sua beleza, madeira de excelente qualidade, além de algumas espécies dessa família possuírem substâncias as quais são usadas como produtos medicinais. A espécie é polinizada por abelhas, pássaros e outros visitantes que podem se alimentar das flores e dos frutos. Atualmente é utilizada em programas de reflorestamento de áreas degradadas, paisagismo e restauração. Ocorre em grande parte do Brasil, desde o Estado da Bahia até o Rio Grande do Sul, Minas Gerais, Mato Grosso do Sul, Santa Catarina e São Paulo, compreendendo as latitudes de 13ºS (BA) a 30ºS (RS). O trabalho teve como objetivos estudar a variabilidade genética entre e dentro das subpopulações de H. heptaphyllus, por meio de marcadores microssatélites e conhecer sobre o seu sistema reprodutivo. Para tanto, foram colhidas sementes de 30 árvores, na região de Botucatu, S.P., sendo grande parte na Fazenda Experimental Lageado pertencente a UNESP - Campus de Botucatu. As sementes foram semeadas no viveiro da UNESP e as folhas das mudas produzidas foram coletadas para a extração de DNA e posteriormente analisadas em géis de poliacrilamida. No total, foram estudados oito locos microssatélites polimórficos, que apresentaram desde seis alelos por loco (loco TAU22) a 14 alelos (locos TAU12, TAU30 e TAU31). A média de heterozigosidade esperada ( e H ˆ ) para as seis subpopulações foi de 0,732, sendo que a heterozigosidade observada ( o H ˆ ) foi de 0,618. Os índices médios de fixação variaram de -0,082 (subpopulação 4) a 0,255 (subpopulação 3), com média de 0,152. Os resultados das subpopulações estudadas mostraram os índices de fixação em níveis aceitáveis, com média de 15,2%, no entanto... / Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos, sinonímia Tabebuia heptaphylla (Velloso) Toledo, known as ipê-roxo, belongs to the Family Bignoniaceae. It is a very important Brazilian forest tree species because of its beautiful flowers, excellent wood quality, and medicinal properties. Its flowers are usually visited by animals, like bees, birds, bats, etc, for feeding and for pollination purposes. The species has also been used in programs of reforestation of degraded areas, landscaping, and restoration. The ipê-roxo is widespread throughout Brazil, from Bahia State to Rio Grande do Sul, Minas Gerais, Mato Grosso do Sul, Santa Catarina, and São Paulo States, from 13ºS (BA) to 30ºS (RS) latitudes. The research has as objectives to study the genetic diversity within and between subpopulations of H. heptaphyllus by microsatellite molecular markers and to understand its mating system. We collected seeds of 30 trees, through the Botucatu region, Brazil, mostly from the Lageado Experimental Station, São Paulo State University (UNESP) – Botucatu. The seeds were sown in a nursery and the leaves were collected, to extract the DNA, and analyzed through polyacrilamide gels. In a total of eight polymorphic microsatellite loci were analyzed that varied from six alleles (TAU22 locus) to 14 alleles (TAU12, TAU30, and TAU31 loci). The expected heterozygosity mean ( e H ˆ ) for the six subpopulations was 0.7318, the observed heterozygosity mean ( o H ˆ ) was 0.6183, and the average of fixation index (f) between pairs of the six population varied from -0,082 (subpopulation 4) to 0.255 (subpopulation 3), with an average of 0.152. The results of the studied subpopulations have shown acceptable levels of fixation index, presenting an average of 15.2%, therefore, the subpopulation 4 has shown a higher amount of heterozygous than expected. The total genetic diversity ( IT fˆ ) for the six subpopulations... (Complete abstract click electronic access below)
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Substratos orgânicos para a produção de mudas de Tabebuia heptaphylla irrigadas com água potável e residuária / Substrate for organic production of Tabebuia heptaphylla irrigated seedlings with drinking water and wastewater

Caetano, Mayra Cristina Teixeira [UNESP] 24 May 2016 (has links)
Submitted by MAYRA CRISTINA TEIXEIRA CAETANO null (mayracae@hotmail.com) on 2016-06-08T19:27:49Z No. of bitstreams: 1 Tese - Mayra Caetano.pdf: 1059335 bytes, checksum: e108dcf3dc02d0f804596f8298f62a38 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-06-09T19:15:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 caetano_mct_dr_jabo.pdf: 1059335 bytes, checksum: e108dcf3dc02d0f804596f8298f62a38 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-09T19:15:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 caetano_mct_dr_jabo.pdf: 1059335 bytes, checksum: e108dcf3dc02d0f804596f8298f62a38 (MD5) Previous issue date: 2016-05-24 / É importante estudar compostos orgânicos na produção de mudas de T. heptaphylla, principalmente com resíduos considerados problemáticos como compostos a base de lixo urbano e restos vegetais oriundos de podas de árvores, bem como o tipo de água de irrigação utilizada. Com o trabalho o objetivo é analisar os substratos formados pela associação de doses de composto de lixo urbano e composto de poda de árvore, em condição de irrigação com água residuária e potável, nas características biométricas e na composição química foliar das mudas de Tabebuia heptaphylla. O delineamento experimental adotado foi em blocos casualizados em um esquema fatorial 8x2, sendo oito combinações de substratos (S): T1 (100% substrato comercial); T2 (100% C.P.A.); T3 (5% C.L. + 95% C.P.A.); T4 (10% C.L. + 90% C.P.A.); T5 (20% C.L. + 80% C.P.A.); T6 (40% C.L. + 60% C.P.A.); T7 (60% C.L. + 40% C.P.A.); e T8 (100% C.L.), associadas a irrigações com dois tipos de água (residuária e potável). As variáveis avaliadas foram: altura da parte aérea, diâmetro do coleto, massa de matéria seca da parte aérea e análise química foliar para determinação da concentração de macronutrientes. Os tratamentos que proporcionaram o melhor desenvolvimento das mudas de Tabebuia heptaphylla, foram os tratamentos 4 (10% CL + 90% CPA), 5 (20% CL + 80% CPA) e 6 (40% CL + 60% CPA). Sendo assim, os resultados permitem concluir que as combinações entre o composto de árvore e de lixo proporcionam resultados satisfatórios no desenvolvimento das mudas e que a utilização da água residuária influencia positivamente no desenvolvimento destas. / It is important to study organic compounds in the production of T. heptaphylla seedlings, especially with problematic considered as waste compounds to urban waste -based and plant remains derived from tree pruning, as well as the type of irrigation water used. The aim of this work was to analyze the biometric characteristics and the chemical composition of T. heptaphylla seedlings developed on different substrates formed by the association between different doses of urban waste compounds (CL) and compost of prunings trees (CPA) in irrigation condition with wastewater and drinking water. The experimental design was a randomized block in a 8x2 factorial design, with eight different combinations of substrates (S): S1 (100%) commercial substrate); S2 (C.P.A. 100%); S3 (5% + 95% C.L. C.P.A.); S4 (10% + 90% C.L. C.P.A.); S5 (20% + 80% C.L. C.P.A.); S6 (40% + 60% C.L. C.P.A.); S7 (60% + 40% C.L. C.P.A.); and S8 (100% C.L.) and with irrigation with two types of water (wastewater and potable). We evaluated the shoot height, stem diameter and leaf analysis to determine the concentration of macronutrients. Treatments that provided the best development of Tabebuia heptaphylla were treatments 4 (10% CL + 90 % CPA ), 5 (20 % CL + 80 % CPA) and 6 ( 40 % CL + 60 % CPA ) . The results obtained allow to conclude that the combination of the compound of tree and garbage provide satisfactory results development of the seedlings and the use of wastewater positively influences the development of these.
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Efeito do manejo hídrico durante a rustificação em mudas de Gallesia integrifolia (Spreng.) Harms e Handroanthus impetiginosus (Mart. ex DC.) Mattos / Effects of hydric management during the rustification in seedlings of Gallesia integrifolia (Spreng.) Harms and Handroanthus impetiginosus (Mart. ex DC.) Mattos

Lima, Paulo Ricardo 21 February 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2017-07-10T17:36:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_Diss_Paulo_Ricardo_Lima.pdf: 1308778 bytes, checksum: fcc1fc80a1ef2f3cfecb3a398ecc76bb (MD5) Previous issue date: 2014-02-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The knowledge of Morphophysiological mechanisms that allow a plant tolerate water stress conditions constitutes important tool for analyzing the quality of seedlings, so it the work aimed to quantify the effects of water management in the period of rustification in seedlings of Handroanthus impetiginosus (Mart. ex DC.) Mattos and Gallesia integrifolia (Spreng.) Harms by means of foliar thermometry and parameters morphometric of quality and additionally analyze the performance of seedlings after the rustification, in soil sandy and loamy soil. The experiment was conducted in a protected ambient at the State University of West Paraná, campus Marechal Cândido Rondon - PR. The treatments were comprised of four hydric regimes: daily irrigation (control), every two, three and four days in 60 seedlings per treatment for four weeks. The mensurations involved the measurement of the leaf temperature (TF), the increments in height, the stem diameter, in the mass dry of root , in the mass dry of shoot and leaf area. The mensurations of TF occurred at the end of each irrigation management cycle and for the other variables were held measurements at the beginning and end of rustification. After the impositions of hydric managements, the seedlings were taken to pots containing sandy soil and clay soil to check the influence of different hydric management as well as soil type in the seedling survival. The analysis between the control treatment and irrigation every two days resulted in significant differences (P> 0,05) merely for leaf area, whereas in and both species studied presented decreased of leaf area with the increase of hydric restriction. Seedlings of H. impetiginosus with of irrigation cycles every three days, showed a reduction in the rate of growth in diameter of 29%, of 58% to increment the dry mass of shoots and 32% for leaf area compared to the management control. Seedlings of G. integrifolia irrigated every three days showed no significant differences (P> 0,05) compared with irrigated daily. The irrigation management every four days in seedlings of H. impetiginosus enabled higher speed of growth of the root system and reduced aerial growth, resulting in warming the leaf, whereas the irrigation management every four days in seedlings of G. integrifolia presented reduction in the rate of growth of the shoot and not presented difference (P> 0,05) in the root system growth and also resulted in leaf warming. The use of the infrared thermometry allows benchmarking the leaf temperature during rustification of seedlings of H. impetiginosus and G. integrifolia. Was no influence of soils in the seedling survival of H. impetiginosus and G. integrifolia, and symptoms of hydric deficit always if manifested first in clay soil, mainly in seedlings not adapted to hydric stress. In both species, the symptoms of hydric deficit presented by the seedlings of different management hydrics showed that seedlings submitted to the irrigation regimes every three and four days, were attenuating slowly the symptoms of hydric deficit compared with others hydrics management / O conhecimento dos mecanismos morfofisiológicos que permitem a uma planta tolerar as condições de estresse hídrico constitui importante ferramenta para analisar a qualidade de mudas. O trabalho objetivou quantificar os efeitos do manejo hídrico no período de rustificação em mudas de Handroanthus impetiginosus (Mart. ex DC.) Mattos e Gallesia integrifolia (Spreng.) Harms por meio da termometria foliar e por parâmetros morfométricos de qualidade e adicionalmente analisar o desempenho das mudas após a rustificação, em solo arenoso e argiloso. Conduziu-se o experimento em ambiente protegido na Universidade Estadual do Oeste do Paraná, campus de Marechal Cândido Rondon PR. Os tratamentos foram compostos por quatro regimes hídricos: irrigação diária (tratamento controle), a cada dois, três e a cada quatro dias, em 60 mudas por tratamento, durante quatro semanas. As mensurações envolveram a medição da temperatura foliar (TF), os incrementos na altura, no diâmetro de colo, na massa seca radicular, na massa seca da parte aérea e na área foliar. As mensurações da TF ocorreram ao final do ciclo de cada manejo de irrigação e para as demais variáveis realizaram-se as mensurações no início e final da rustificação. Após a imposição dos manejos hídricos, as mudas foram levadas para vasos contendo solo arenoso e argiloso, para verificar se há influencia dos diferentes manejos hídricos, bem como do tipo do solo na sobrevivência da muda. A análise entre os tratamentos controle e irrigação a cada dois dias resultou em diferenças (P> 0,05) apenas para área foliar, sendo que ambas as espécies estudadas apresentaram redução da área foliar com o aumento da restrição hídrica. Mudas de H. impetiginosus com ciclos de irrigação a cada três dias, apresentou redução na taxa de crescimento em diâmetro de 29%, de 58% para incremento da massa seca da parte aérea e de 32% para área foliar em comparação ao manejo controle. Mudas de G. integrifolia irrigadas a cada três dias não apresentaram diferenças significativas (P> 0,05) em relação às irrigadas diariamente. O manejo de irrigação a cada quatro dias em mudas de H. impetiginosus possibilitou maior velocidade de crescimento do sistema radicular e reduziu o crescimento aéreo, resultando no aquecimento foliar, enquanto que o manejo de irrigação a cada quatro dias em mudas de G. integrifolia apresentou redução na velocidade de crescimento da parte aérea e não apresentou diferença (P> 0,05) no crescimento do sistema radicular e também resultou no aquecimento foliar. O uso da termometria infravermelho permite aferir a temperatura foliar na rustificação de mudas de H. impetiginosus e G. integrifolia. Houve influência dos solos na sobrevivência das mudas de H. impetiginosus e G. integrifolia, e os sintomas de déficit hídrico sempre se manifestaram primeiro no solo argiloso, principalmente nas mudas não adaptadas ao estresse hídrico. Em ambas as espécies, as diferenças dos sintomas de déficit hídrico apresentadas pelas mudas dos diferentes manejos hídricos mostraram que mudas submetidas ao regime de irrigação a cada três e quatro dias, foram atenuando lentamente os sintomas de déficit hídrico em comparação aos demais manejos hídricos
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TECNOLOGIA DE SEMENTES E DESENVOLVIMENTO DE MUDAS DE Handroanthus heptaphyllus (Mart.) Mattos SOB DIFERENTES FORMAS DE MANEJO NO VIVEIRO E NO CAMPO / SEED TECNOLOGY AND DEVELOPMENT OF SEEDLINGS Handroanthus heptaphyllus (Mart.) Mattos UNDER DIFFERENT FORMS OF MANAGEMENT IN NURSERY AND FIELD

Tonetto, Thaíse da Silva 19 February 2014 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The Handroanthus heptaphyllus (ipê-roxo) species has ecological and commercial importance, being used for various purposes since timber purposes to environmental restoration, and medical purposes. Thus, the present study aimed to evaluate and establish appropriate technical knowledge for the production of forest seeds and seedlings of H. heptaphyllus process. The seeds collected in the municipality of Santa Maria (RS) formed the batch to be studied, this was divided into two portions, one for the experiment 1 and the other 2. In experiment 1, we assessed the degree of humidity - DH ( 4 replicates of 25 seeds ) and electrical conductivity - EC (two quantities of seeds - 25 and 50, and three volumes of distilled water - 25 , 50 and 75 mL). In addition to evaluating different substrates (blotting paper, filter paper, vermiculite, sand, both on and between the arrangements in addition to the scroll), to one with higher germination (G). In experiment 2, seeds were stored for 300 days in three environments (dry and cold room - SSF - 18°C and 49 % Relative Humidity (RH); clammy chamber - CUF - 8°C and 80% RH and, dry chamber and cold - CSF - 7.5ºC and 55% RH). After this period, it was determined DH, EC, G and health. Nursery evaluated the effect of two cartridge volumes (110 and 180 cm³) with four doses of controlled-release fertilizer (CRF), NPK (18-05-09) at doses of 0 (control), 2.5, 5.0 and 7.5 g.L-1. At 180 days after sowing the reviews of height (H), diameter Collectors (DC), H/DC, dry mass and leaf area. In the field underwent seedlings under light intensities of 0 (full sun - PS - control), 18, 50 and 70% shade, evaluated for 360 days checking the survival, H, DC, H/DC, total chlorophyll content, chlorophyll a/chlorophyll b, carotenoid content, initial fluorescence of the chlorophyll maximum photochemical efficiency of photosystem II. The germination of seeds of H. heptaphyllus can be done on sand with initial count (IC) seedlings at 16 and end (EnC) at 19 days after sowing. The storage of seeds of H. heptaphyllus for 300 days can be held in SSF and/or CSF, with the IC and EnC at 9 and 29 days and, at 14 and 23 days, respectively, and this represents an intermediate behavior in relation to desiccation. The CFS was the most suitable for reducing the incidence of pathogens environment. The species is nutritionally demanding responding to high dose of CRF, with a minimum dose of 7.2 g.L-1 to 110 cm³ and 6.1 g.L-1 to 180 cm³, with the potential to respond to doses higher than 7.5 g.L-1. Seedlings to field H. heptaphyllus have high survival and growth suitable for PS, however, not recommended 50 and 70 % shading. There were increased levels of total chlorophyll and carotenoids, and lower chlorophyll a fluorescence. The species in reforestation and restoration of degraded areas, including the PS is recommended. / A espécie Handroanthus heptaphyllus (ipê-roxo) possui importância ecológica e comercial, sendo utilizada em diversos fins desde fins madeireiros até recuperação ambiental, além de fins medicinais. Assim, o presente trabalho teve o objetivo de avaliar e estabelecer técnicas adequadas para o conhecimento do processo de produção de sementes e mudas florestais de H. heptaphyllus. As sementes coletadas no município de Santa Maria (RS)s formaram o lote a ser estudado, esse foi dividido em duas porções, uma destinada ao experimento 1 e outra ao 2. No experimento 1, avaliou-se o grau de umidade GU (4 repetições de 25 sementes) e a condutividade elétrica - CE (duas quantidades de sementes - 25 e 50 e, três volumes de água destilada 25, 50 e 75 mL). Além de avaliar diferentes substratos (papel mata-borrão, papel filtro, vermiculita, areia, ambos nos arranjos sobre e entre, além do rolo de papel), visando um com maior germinação (G). No experimento 2, as sementes foram armazenadas por 300 dias em três ambientes (sala seca e fria SSF 18ºC e 49% de Umidade Relativa (UR); câmara fria e úmida - CUF 8ºC e 80% UR e; câmara seca e fria CSF 7,5ºC e 55% UR). Após esse período, determinou-se o GU, CE, G e sanidade. Em viveiro avaliou-se o efeito de dois volumes de tubete (110 e 180 cm3) com quatro doses de fertilizante de liberação controlada (FLC), NPK (18-05-09), nas doses de 0 (testemunha), 2,5; 5,0 e 7,5 g.L-1. Aos 180 dias após o semeio as avaliações de altura (H), diâmetro coleto (DC), relação H/DC, massas secas e área foliar. No campo submeteu-se as mudas sob intensidades luminosas de 0 (pleno sol PS testemunha), 18, 50 e 70% de sombra, avaliadas durante 360 dias, verificando-se a sobrevivência, H, DC, H/DC, teor de clorofila total, relação clorofila a/clorofila b, teor de carotenoides, fluorescência inicial da clorofila a e eficiência fotoquímica máxima do fotossistema II. O teste de germinação de sementes de H. heptaphyllus pode ser realizado sobre areia, com contagem inicial (PC) de plântulas aos 16 dias após a semeadura e final (UC) aos 19. O armazenamento das sementes de H. heptaphyllus por 300 dias pode ser realizado em SSF e/ou CSF, sendo a PC e UC aos 9 e 29 dias e, aos 14 e 23 dias, respectivamente, sendo que esta apresenta comportamento intermediário em relação ao dessecamento. A CFS foi o ambiente mais adequado para redução da incidência de patógenos. A espécie é exigente nutricionalmente respondendo a elevada dose de FLC, com dose mínima de 7,2 g.L-1 para 110 cm³ e 6,1 g.L-1 para 180 cm³, com potencial para responder a doses superiores a 7,5 g.L-1. Mudas a campo de H. heptaphyllus apresentam sobrevivência elevada e crescimento adequado a PS, porém, não se recomenda 50 e 70% de sombreamento. Houve aumento dos níveis de clorofila total e carotenoides e, menor fluorescência da clorofila a. Recomenda-se a espécie em reflorestamento e recuperação de áreas degradadas, inclusive a PS.

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