Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aqüicultura, Florianópolis, 2009. / Made available in DSpace on 2012-10-24T13:38:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 271254.pdf: 980179 bytes, checksum: b39c20bd2905add945e031ef2820062f (MD5) / O efeito dos polissacarídeos sulfatados (PS), extraídos da macroalga Gracilaria birdiae, foi testado sobre a imunocompetência do camarão Litopenaeus vannamei através da alimentação dos animais com ração contendo 0,3% de PS, seguido por desafio experimental com o vírus da síndrome da mancha branca (WSSV) (0,35 DL50). A hemolinfa foi coletada nos dias 0, 3 e 14 pós-infecção com WSSV e utilizada para avaliar alguns parâmetros hemato-imunológicos. Os resultados sugerem uma aparente estimulação da atividade da fenoloxidase e da capacidade aglutinante no dia 14 pós-infecção. O número total de hemócitos (CTH) diminuiu (40%) nos camarões alimentados com a dieta controle (sem PS), mas manteve-se estável nos animais tratados com PS. A porcentagem de hemócitos granulares diminuiu (30%) em todos os grupos desafiados, independentemente da presença de PS. Esses resultados sugerem uma estimulação na produção de hemócitos hialinos associada ao tratamento com PS, uma vez que a CTH não foi alterada. Além disso, verificou-se um aumento na atividade da a2-macroglobulina e na produção de ânion superóxido em todos os camarões infectados (dias 3 e 14) independente do tratamento com PS. Embora a dieta contendo PS não tenha resultado em imunoestimulação importante nos camarões, os animais desafiados com WSSV apresentaram uma diminuição (11%) na mortalidade quando tratados com PS, em comparação aos da dieta controle. Curiosamente, o vírus não foi detectado nos animais desafiados com WSSV a partir do dia 3. Acredita-se que esse achado esteja relacionado ao fenômeno de interferência viral, já que os animais apresentaram-se infectados de forma latente pelo vírus da necrose hipodérmica e hematopoiética (IHHNV). Estudos futuros devem ser realizados para esclarecer tal fenômeno, bem como a atuação dos PS de G. birdiae na sobrevivência dos animais.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, Florianópolis, 2009. / Made available in DSpace on 2012-10-24T16:33:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 273860.pdf: 2877096 bytes, checksum: 3f6283aa90114783b89e2a4000ab45e8 (MD5) / O vírus da Síndrome da Mancha Branca (WSSV) é uma doença que afeta várias espécies de crustáceos, causando grandes mortalidades e perdas econômicas em regiões produtoras de camarão. Este trabalho teve como objetivo padronizar a metodologia de PCR em Tempo Real para a detecção do WSSV, genotipar isolados geográficos do vírus e isolar genes diferencialmente expressos em camarões de cultivo infectados com WSSV. Amostras positivas e negativas por PCR nested foram analisadas através de PCR em Tempo Real. A carga viral das amostras foi determinada e algumas amostras negativas por PCR nested foram positivas por PCR em Tempo Real, com baixa carga viral. Vírus isolados de camarões coletados em Santa Catarina e na Bahia foram comparados quanto ao padrão de três minissatélites, à presença de uma grande deleção e uma transposase. Todas as amostras de Santa Catarina tiveram o mesmo padrão para os minissatélites analisados.As amostras da Bahia apresentaram um padrão diferente para os loci analisados, indicando que existem dois genótipos de WSSV diferentes no Brasil. Os isolados brasileiros tem uma deleção de 10,780 bp na ORF 23/24 e não possuem a seqüência da transposase. O padrão de repetições para os três minissatélites analisados foi diferente entre os isolados brasileiros e de outros países da América. Entretanto, ao analisar apenas a ORF 94, Santa Catarina, México, Nicarágua, Honduras e Panamá têm mais de nove repetições, enquanto a Bahia e os EUA têm menos de nove repetições. Esta similaridade pode estar relacionada a uma similaridade em virulência. Aparentemente, os WSSVs encontrados na Bahia e em Santa Catarina originaram-se de diferentes fontes de contaminação ou o vírus sofreu mutações ao longo do tempo. mRNA foi extraído das brânquias de camarões infectados e não-infectados com o WSSV, reversamente transcrito e uma hibridização subtrativa (SSH) foi realizada. A Biblioteca 1 (genes induzidos) tem 300 clones dos quais foram formados 36 contigs e 36 singlets. Destas seqüências, 69 (88,4%) são similares a seqüências no GeneBank. Na Biblioteca 2 (genes reprimidos), de 403 clones, foram formados 23 contigs e 36 singlets e 40 (75,5%) são similares a seqüências conhecidas. Estes genes foram organizados em grupos, de acordo com a sua função. Dentre os genes induzidos há genes envolvidos na síntese de ATP, citoesqueleto, adesão celular, metabolismo e transporte de moléculas. Dentre os genes reprimidos, há genes envolvidos na defesa contra bactérias, transdução de sinal e biossíntese de ácidos nucléicos. A infecção pelo WSSV parece alterar várias rotas metabólicas diferentes. / White Spot Syndrome Virus (WSSV) is a disease that affects several species of crustaceans, causing high mortality rates, which has been causing great economical losses in shrimp farming regions. The aims of this study were to standardize the Real Time PCR methodology for WSSV detection, to genotype geographical isolates of the virus and to isolate differentially expressed genes in farmed shrimps infected with WSSV. Samples positives and negatives by nested PCR were analyzed by Real Time PCR. The viral load of the samples was determined and some samples negative by nested PCR were positive by Real Time PCR, with low viral load. The pattern of three minisatellite regions, the presence of a deletion and a transposase were compared in virus isolated from shrimp collected in Santa Catarina and Bahia. All Santa Catarina samples had the same pattern for the minisatellites analyzed. Bahia samples showed a different pattern for the loci, indicating that there are two different ORF 23/24 and do not have a transposase sequence. The repeat number pattern for the three minisatellite analyzed was different between the Brazilian isolates and isolates from America#s countries. However, when analyzing only ORF 94, South Brazil, Mexico, Nicaragua, Honduras and Panama have all more than nine repeats, while Northeast Brazil and USA samples have less than nine repeats. This similarity of repeats could be related to a similarity in virulence. Our results show that WSSV found in Bahia and Santa Catarina States have originated from different sources of contamination or the virus have undergone mutations during time. mRNA was extracted from gills of shrimps infected and non-infected with WSSV, reverse transcribed and a suppression subtractive hybridization (SSH) was performed. Library 1 (induced genes) has 300 clones, which formed 36 contigs and 36 singlets. Of these sequences, 69 (88,4%) are similar to sequences in GeneBank. Library 2 (repressed genes), has 403 clones, which formed 23 contigs and 36 singlets, and 40 sequences (75,5%) are similar to known sequences. These genes were organized in groups, according to their functions. Among the induced genes there are genes involved in ATP synthesis, cytoskeleton, cell adhesion, metabolism and molecule transport. Among the repressed genes, there are genes involved in antibacterial defence, signal transduction and nucleic acids biosynthesis. WSSV infection seems to alter several metabolic routes.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2010 / Made available in DSpace on 2012-10-25T00:48:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 279589.pdf: 892949 bytes, checksum: cbd88e9c44bb9ea284c521be963e43dc (MD5) / Este estudo teve como objetivo principal selecionar individualmente por Nested-PCR reprodutores de L. vannamei livres de WSSV e de IHHNV e a partir destes produzir pós-larvas livres destes patógenos virais por meio da prevenção da sua transmissão vertical. A partir de 2.650 camarões, foram selecionados fenotipicamente 1.600, destes 800 machos e 800 fêmeas. Os camarões foram marcados individualmente com anel numerado (487 fêmeas e 231 machos). As análises por Nested-PCR mostraram que 307 fêmeas (63%) e 127 machos (55%) estavam infectados com IHHNV. Os animais livres de IHHNV foram analisados para WSSV, os animais livres dos dois vírus, foram destinados a reprodução. As pós-larvas produzidas foram estocadas em 9 tanques berçário,para análise. Das 45 replicas analisadas apenas 2 estavam positivas para IHHNV e nenhuma positiva para WSSV, e os animais foram encaminhados posteriormente para fazendas. Ainda foi realizada uma análise comparativa em viveiros de engorda entre pós-larvas livres, produzidas localmente e pós-larvas do Nordeste provenientes da região de Canguaretama (RN) Os juvenis analisados, de pós-larvas locais, em fazenda apresentaram 1,25% de WSSV e IHHNV em 80 animais examinados. Por outro lado, as análises de juvenis do Nordeste revelaram que 10% dos examinados estavam infectados com WSSV e IHHNV. Além de juvenis de L. vannamei, foram examinados caranguejos (Chasmagnathus granulata), aplísias (Aplysia brasiliana) e siris (Callinectes sapidus) sendo 50% das aplísias e 67% dos siris infectados por WSSV. A comparação de sobrevivências em 3 fazendas mostrou sobrevivência média de 55% para pós-larvas locais contra 23,4% e para pós-larvas do Nordeste.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2010 / Made available in DSpace on 2012-10-25T08:39:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 281001.pdf: 351620 bytes, checksum: a787badcb57f40e0ac2c4922a581e174 (MD5) / O propósito desta pesquisa foi desenvolver um sistema de avaliação da qualidade de pós-larvas de L. vannamei, em laboratórios de produção, em escala comercial. Trata-se do desenvolvimento de uma metodologia de avaliação que reúne critérios de qualidade de pós-larvas e tomada de decisão. De forma aleatória, foram coletadas 1525 pós-larvas (Pl's), a partir de 61 tanques berçários, entre o estágio de PL 5 e 30, do Laboratório de Camarões Marinhos (LCM) da Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC) durante o período de 2005-2009. Para encontrar variáveis autocorrelacionadas, todos os dados coletados foram submetidos à análise estatística não paramétrica para o coeficiente de correlação de postos de Spearman. Os dados obtidos na análise do coeficiente de correlação de postos de Spearman foram submetidos à "Analytic Hierarchy Process" - AHP. Os resultados gerados pela matriz de Spearman demonstraram que todos os 17 critérios selecionados tinham, ao menos, uma correlação significativa (p<0,05). Foram selecionados para a "Analytic Hierarchy Process" - AHP os cinco critérios que possuíam mais correlações significativas. Com esse trabalho, podemos concluir que os critérios que atestam qualidade larval, são: tese de estresse, deformidade, atividade natatória, coloração do hepatopâncreas e peristaltismo intestinal. Foi possível desenvolver um sistema de avaliação da qualidade de pós-larvas de camarão marinho utilizando "Analytic Hierarchy Process" - AHP formulando uma ficha de avaliação contendo os critérios relevantes para a seleção de pós-larvas mais aptas as adversidades ao longo do cultivo.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2010 / Made available in DSpace on 2012-10-25T08:52:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 281262.pdf: 1362618 bytes, checksum: b0d7359b954700cb6a574a8c4e60618f (MD5) / O objetivo deste trabalho foi desenvolver um probiótico com bactérias oriundas do trato digestório de camarões marinhos (Litopenaeus vannamei) avaliando seu uso na larvicultura e engorda. Foram isoladas 10 cepas do trato digestório de camarões, e a cepa que apresentou os melhores resultados na seleção in vitro foi identificada como Lactobacillus plantarum. A adição desta cepa na dieta modificou a microbiota bacteriana intestinal de larvas e adultos de L. vannamei, diminuindo a população de Vibrio spp. Na larvicultura, a suplementação da dieta com L. plantarum resultou no aumento da sobrevivência e maior resistência das larvas ao desafio por Vibrio harveyi. Na engorda em água clara, camarões alimentados com dieta suplementada com L. plantarum apresentaram maior sobrevivência após o desafio com V. harveyi e maior contagem total de hemócitos e atividade aglutinante do soro. No cultivo comercial, houve aumento na sobrevivência e diminuição da conversão alimentar nos viveiros alimentados com dieta suplementada com L. plantarum após 75 dias de cultivo. O L. plantarum isolado pode ser utilizado como probiótico para L. vannamei, pois altera beneficamente a microbiota intestinal de larvas e adultos, aumenta a resistência dos animais ao desafio com V. harveyi e melhora a sobrevivência da larvicultura e engorda comercial.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2010 / Made available in DSpace on 2012-10-25T11:58:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 281559.pdf: 724745 bytes, checksum: 0263af8e3fa1aa4b1340292bd1b2db90 (MD5) / A proteção antiviral específica contra o vírus da síndrome da mancha branca (WSSV) induzida via RNA de interferência (RNAi) e sua influência na expressão de alguns genes imunológicos foram avaliados em Litopenaeus vannamei. Os animais foram injetados com dsRNA de sequência específica (vp28 do envelope viral), e posteriormente desafiados com o WSSV. Camarões tratados com dsRNA vp28 tiveram a infecção viral limitada, uma alta taxa de sobrevivência (73%) e ausência do vírus em 80% dos sobreviventes, confirmando a ativação do mecanismo antiviral específico via RNAi. Animais desafiados e não tratados com dsRNA vp28 tiveram uma queda significativa no hemograma (85%) e depleção gênica da argonauta, caspase-3, fator antilipopolissacarídeo (ALF), pró-fenoloxidase (proPO) e transglutaminase (TGase). Uma superexpressão gênica da proteína que reconhece LPS e ?-1,3-glicanas (LGBP) e do inibidor de proteases ?2-macroglobulina (?2M) foi verificada nesses animais, indicando o envolvimento destas proteínas na fase aguda da infecção por WSSV. O tratamento com dsRNA vp28 limitou a infecção e restabeleceu as condições imunológicas gerais dos animais através do aumento do hemograma e da modulação positiva dos genes argonauta, ALF, proPO e TGase, sugerindo a participação destas proteínas na defesa do organismo contra o WSSV. Os resultados deste estudo apontam para uma potencial utilização do dsRNA vp28 como agente terapêutico anti-WSSV e confirmam que a técnica de RNAi é uma abordagem preventiva promissora e efetiva para o controle das viroses de crustáceos.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-26T03:53:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 290971.pdf: 395139 bytes, checksum: 9165aa9aec07f6cb1eb3a5ed4beeee84 (MD5) / Nos últimos anos, a produção aquícola de camarões marinhos vem trabalhando no desenvolvimento de estratégias de cultivos super-intensivos sem troca de água. Um estudo de 39 dias foi realizado com intuito de avaliar o efeito de dois tipos de fertilizantes sobre o crescimento, sobrevivência e conversão alimentar de pós-larvas (PL 20) de Litopenaeus vannamei mantidas em sistema super-intensivo (150 cam.m-2) de bioflocos com zero troca de água. Foi elaborado um delineamento experimental bi-fatorial composto por quatro tratamentos (0,7 m3) com 3 réplicas cada (4x3), os quais foram condicionadas de forma aleatória em uma sala com ambiente controlado. Os fatores analisados foram o uso de Farelo de arroz (F) ou Melaço de cana (M) como fonte de carbono durante a fertilização inicial, utilizando duas taxas de aplicação, 25 mg.L-1 e 100 mg.L-1 (F25; F100; M25 e M100). Inicialmente à fertilização foi utilizado um monocultivo específico de Chaetoceros mulleri (5x104 cels.mL-1) e após o povoamento, foi utilizado melaço (na relação 6:1 C:N-NH4+ ) para controlar o acúmulo nas concentrações de amônia. Parâmetros de qualidade de água (O2, temperatura, pH, alcalinidade, N-AT, N-NO2, N-NO3, ortofosfato, turbidez, SST, SSV e clorofila-a), além da produção líquida do sistema (NEP), produtividade líquida (PPL) e a respiração da coluna d'água (R) foram monitorados durante as cinco semanas de estudo. Ao final da fertilização, as diferentes fontes de carbono demonstraram semelhante comportamento metabólico de degradação. As taxas de respiração (R) foram maiores nos tratamentos fertilizados com 100 mg.L-1 enquanto a produção líquida do sistema (NEP) foi menor nos mesmos tratamentos. Não houve diferença estatística nos parâmetros de qualidade de água entre os tratamentos ao final do experimento, exceto para turbidez. Em relação aos parâmetros zootécnicos, os tratamentos não apresentaram diferenças estatísticas entre si, apenas para conversão alimentar aparente. Os resultados demonstram que o farelo de arroz pode ser utilizado como fertilizante inicial da água e que diferentes dosagens de aplicação não causaram efeito no crescimento inicial de pós-larvas de L. vannamei cultivadas em sistema super-intensivo com bioflocos.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Aqüicultura. / Made available in DSpace on 2012-10-23T13:18:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 270043.pdf: 647538 bytes, checksum: 530cd54fda9ce885cab8f2843037d9d2 (MD5)

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Aquicultura. / Made available in DSpace on 2012-10-24T00:18:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 262533.pdf: 987968 bytes, checksum: 513ec97a854807d0eadaec8588845db4 (MD5)

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-graduação em Aquicultura / Made available in DSpace on 2012-10-24T05:01:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 256483.pdf: 291386 bytes, checksum: 565f2630e08f694ecf154e0ea2db6eaa (MD5) / O presente estudo avaliou a viabilidade econômica do policultivo de peixes (Oreochromis niloticus) e camarões (Litopenaeus vannamei) em diferentes densidades de estocagem, focalizando os seus preços de mercado e rendimentos econômicos. Foram testados sete tratamentos com três repetições cada: T1 (grupo controle 1 - monocultivo com 1 peixe/m2), T2 (grupo controle 2 - monocultivo com 10 camarões/m2), T3 (policultivo com 1 peixe/m2 e 5 camarões/m2), T4 (policultivo com 1 peixe/m2 e 10 camarões/m2), T5 (policultivo com 1 peixe/m2 e 15 camarões/m2), T6 (policultivo com 0,5 peixes/m2 e 10 camarões/m2) e T7 (policultivo com 2 peixes/m2 e 10 camarões/m2). Os peixes e camarões foram cultivados por 87 e 79 dias, respectivamente. Com exceção de T2, apenas os peixes foram alimentados com ração comercial balanceada, ficando os restos alimentares e fezes dos mesmos como suplemento alimentar aos camarões. O custo dos alevinos e pós-larvas chegaram a representar o principal item de custo nos T5 e T6 em função do baixo tamanho médio de comercialização dos camarões e baixa produtividade de peixes, respectivamente. Nos demais, a ração foi o principal item de custo. Os resultados revelaram que o preço de venda pode determinar a atratividade do sistema de policultivo e que o aumento da produtividade de peixes foi proporcional à rentabilidade do investimento. Os resultados de Valor Presente Líquido (VPL) mais satisfatórios foram encontrados em T4 e T7, apontando que o sistema integrado de policultivo não reduziu a rentabilidade do investimento.