FALCÃO, L. H. O. Subsídios para a conservação de vertebrados marinhos: identificação molecular e monitoramento do comércio online. 2017. 81 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Marinhas Tropicais) - Instituto de Ciências do Mar, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2017. / Submitted by Geovane Uchoa (geovane@ufc.br) on 2017-05-31T12:46:05Z No. of bitstreams: 1 2017_dis_lhofalcao.pdf: 2926405 bytes, checksum: 7eb88d25abc7f7eb60079322832cae55 (MD5) / Approved for entry into archive by Nadsa Cid (nadsa@ufc.br) on 2017-07-07T16:32:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_dis_lhofalcao.pdf: 2926405 bytes, checksum: 7eb88d25abc7f7eb60079322832cae55 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-07T16:32:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_dis_lhofalcao.pdf: 2926405 bytes, checksum: 7eb88d25abc7f7eb60079322832cae55 (MD5) Previous issue date: 2017 / According to the International Union for the Conservation of Nature (IUCN) there is currently 12,221 endangered species and another 11,029 vulnerable species, globally. Some of these species are highly valuable. Whale meet, elephant ivory, rhino horn, sawfish rostrum, and shark fin are examples of illegally traded items. The fact that these trades are based on animal parts makes difficult the monitoring of species involved. This is because animal parts lack most of diagnostic characters that may permit species identification. In the case of highly valuable frozen fish fillet, as for example the one from the Caribbean Snapper, this lack of diagnostic characters permits a substitution fraud. In this kind of fraud, a low valuable species is trade under the name of a highly valuable species. Moreover, this trade does not only occur in marketplaces or so. It also occurs through virtual or online trade. Given this threatening situation, the development of research on identification of animal parts and trade monitoring are needed. In this context, the goal of the present study was to provide new tools against illegal trade of endangered marine vertebrates, with emphasis on cetaceans, snappers and the batoids known as sawfish. The present study presents mitochondrial DNA Cytochrome c Oxidase subunit I (COI) DNA sequences useful for identification of seven cetacean species from the West Atlantic (Canada and Brazil). In addition, prospective Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polimorphism (PCR-RFLP) molecular markers are also described for identification of the Caribbean Red Snapper (Lutjanus purpureus) from northern and northeastern Brazil. About the sawfish, here it is described the current status of an ongoing online trade of isolated rostra. Based on roughly one year of monitoring and 402 isolated rostra recorded, it was found that sawfish rostra involved in this kind of trade cost US$ 676.80 a piece, in average. The trade website eBay is responsible for most of the sawfish rostra that is illegally available for international delivery. Keywords: endangered species, illegal trade, conservation, cetacean, Red snapper, sawfish / Segundo a União Internacional para a Conservação da Natureza (UICN), existem atualmente um total de 12.221 espécies em situação de ameaça e outras 11.029 espécies consideradas vulneráveis, globalmente. Algumas dessas espécies possuem alto valor comercial. Produtos como carne de baleia, marfim do elefante, chifre do rinoceronte, rostro de peixe-serra e barbatanas de tubarão são exemplos de produtos comercializados de forma ilegal. O fato desse comércio ser voltado para partes de animais (barbatanas, carne, filés congelados, etc) dificulta a fiscalização dessa atividade. Isto porque espécimes nestas condições estão desprovidos de suas principais características morfológicas, o que frequentemente impede uma identificação. No caso dos filés congelados de peixes com elevado interesse comercial (Ex. pargo), a falta de caracteres morfológicos no produto final permite a ocorrência de fraude de substituição, onde uma espécie menos valorizada (mais barata) é comercializada com o nome de outra espécie de maior valor. E este comércio se dá não apenas de forma presencial ou física, mas também através de comércio virtual - em lojas e sites online. Dada as situações de ameaça, pesquisas que visem a produção de ferramentas que auxiliam a identificação de partes animais e monitoramento de comércio são necessárias. Dentro desse contexto, o objetivo do presente estudo foi fornecer subsídios para o combate contra o comércio ilegal de animais marinhos ameaçados, com ênfase nos cetáceos, no pargo e nas raias conhecidas como peixes-serra. Este estudo contribui com sequências do gene Citocromo c Oxidase subunidade I (COI) de sete espécies de cetáceos do Atlântico Oeste (Canadá e Brasil) que são úteis para identificação de espécies. Adicionalmente, marcadores moleculares do tipo PCR-RFLP (Reação da Cadeia em Polimerase - Polimorfismo no Comprimento de Fragmentos de Restrição) também são descritos para identificar o pargo (Lutjanus purpureus) da costa norte do Brasil. Quanto ao peixe-serra, aqui está descrito o estado atual de um comércio online de rostros isolados. Baseado em aproximadamente um ano de monitoramento e 402 rostros isolados registrados, foi observado que rostros de peixe-serra envolvidos nesse tipo de comércio custam em média US$ 676,80 a unidade. O site de comércio online eBay é responsável pela maior parte dos rostros de peixe-serra que estão ilegalmente disponíveis para entrega internacional. Palavras-chave: espécies ameaçadas, comércio ilegal, conservação, cetáceos, pargo e peixeserra.

Submitted by Caroline Falcao (caroline.rfalcao@ufpe.br) on 2017-05-22T17:32:45Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese__Aschenbrenner_versão_Definitiva.pdf: 1827049 bytes, checksum: 2b2e0b82d6dc856801226f7368d28b5b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-22T17:32:45Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese__Aschenbrenner_versão_Definitiva.pdf: 1827049 bytes, checksum: 2b2e0b82d6dc856801226f7368d28b5b (MD5) Previous issue date: 2014-11-25 / O objetivo geral desta tese foi avaliar a conectividade entre ecossistemas costeiros e plataforma continental para a espécie L. alexandrei e estudar a utilização destas áreas em diferentes estágios do ciclo de vida para L. alexandrei e L. jocu na região costeira de PE. Para entender melhor a movimentação entre estas áreas, foram utilizados diferentes métodos combinados: (1) a estrutura etária e de tamanho de L. alexandrei foi determinada para áreas estuarinas (profundidades < 5m) e costeiras (profundidades entre 30 a 60 m) metros da plataforma continental; (2) a assinatura química de otólitos de indivíduos de L. alexandrei capturados em áreas estuarinas e costeiras foi analisada para evidenciar a variação ontogenética na permanência entre os diferentes habitats; (3) a presença em áreas estuarinas e recifes rasos adjacentes a costa em diferentes estágios do ciclo de vida foi detectada e quantificada para L. alexandrei e L. jocu através de censos visuais subaquáticos. Amostras biológicas (otólitos) de L. alexandrei foram coletadas através do acompanhamento de desembarques da pesca de Camboa em regiões estuarinas e pesca de rede e armadilhas em regiões costeiras entre o litoral dos estados de Pernambuco e Alagoas. As coletas foram realizadas durante três anos consecutivos (2010-2012). Otólitos de indivíduos juvenis e adultos foram extraídos, emblocados em resina, seccionados utilizando uma serra metalográfica e analisados inicialmente quanto à sua estrutura etária. Em uma segunda etapa, secções de otólitos foram analisadas com relação à sua assinatura química através de um espectrômetro de massa com ablação a laser. Observações subaquáticas foram realizadas em mangues (duas localidades) e recifes de coral adjacentes (três localidades) (a partir de 90 transectos de 10 x 2 m para cada localidade) durante os meses de novembro a março (2012- 13). Resultados da analise de distribuição etaria mostram que para áreas estuarinas indivíduos apresentaram idades de 0 a 4 anos, enquanto indivíduos coletados em áreas costeiras mais profundas foram mais velhos,entre 3 a 22 anos, indicando que uma mudança entre habitats ocorre aproximadamente entre idades 3 e 4. A frequência do tipo de borda ao longo de um ano utilizado para validar a deposição anual de anéis etários indica que, a formação da banda opaca ocorre no período chuvoso, entre abril e setembro. Dados de crescimento revelam que L. alexandrei possui um crescimento rápido durante os estágios iniciais de vida, atingindo em média 50% de seu tamanho assintótico com idade 2. Parâmetros da curva do modelo de crescimento de von Berlalanffy encontrados para L. alexandrei foram L∞ = 31 cm , k = 0.24, t0 = -1.26, r2 = 0.97. A taxa de mortalidade estimada para indivíduos coletados em áreas costeiras foi Z = 0.22 com sobrevivência de S = 0.78 year-1 . Para a analise microquímica dos otólitos foram medidos seis elementos: 7 Li, 24Mg, 55Mn, 59Co, 88Sr and 137Ba para indivíduos de L. Alexandrei. A analise de material recentemente depositado na borda de otólitos revelou que concentrações na razão elemento:Ca não variaram significativamente ao longo dos três anos testados. Similarmente, com exceção de dois elementos (Ba, Co), a razão elemento:Ca para indivíduos maiores habitando águas costeiras também foi estável, não apresentando diferenças para as diferentes regiões costeiras investigadas. Contrariamente, assinaturas químicas em otólitos de L. alexandrei de tamanhos similares provenientes da região estuarina e áreas costeiras foram distintas. Concentrações de Mn:Ca e Ba:Ca em otólitos foram ambos significativamente maiores para L. alexandrei coletados na região estuarina comparados a peixes coletados na região costeira adjacente, enquanto que para Sr:Ca uma tendência oposta foi observada. Dadas as diferenças pronunciadas na assinatura química entre áreas estuarina e costeiras, transectos de elemento:Ca foram construídos desde a região do núcleo até a margem em otólitos de indivíduos coletados em áreas costeiras para determinar o tempo de movimento (migração ontogenética) entre estuário e áreas costeiras. Concentrações de Mn:Ca e Ba:Ca mostraram um padrão semelhante ao esperado, com maiores concentrações para idades 1 e 2, com diminuição gradual para idades subsequentes. Este padrão sugere que espécimes de L. alexandrei começam a transição para habitats mais costeiros (e.g. menores concentrações de Mn e Ba) após a idade 2. Dados de observações subaquáticas corroboraram estes resultados, revelando que para ambas as espécies, indivíduos menores que 10 cm ocorrem exclusivamente em manguezais. Uma nítida mudança foi observada com um aumento de densidades para indivíduos acima de 10 cm em áreas recifais adjacentes. Para L. alexandrei a ocorrência de pos-assentantes, juvenis e subadultos foi registrada em manguezais enquanto que em recifes adjacentes apenas subadultos e adultos foram registrados. Padrão semelhante foi observado para L. jocu com individuos pos-assentantes, juvenis e subadultos em manguezais e juvenis e subadultos habitando recifes rasos adjacentes. Informações obtidas nesta Tese permitiram uma melhor compreensão dos padrões de crescimento e estrutura etária de L. alexandrei. Resultados sugerem ainda a movimentação ontogenética de L. alexandrei entre habitas costeiros e regiões costeiras mais profundas e permitem uma melhor compreensão da utilização de habitats costeiros em estágios iniciais de vida para as espécies de L. alexandrei e L. jocu. / Current objective of this thesis was to evaluate the connectivity among a shallow nursery area and deeper coastal ecossystems for L. alexandrei, and study utilization of such habitats in different life stages for L. alexandrei and L. jocu in the coastal areas of Pernambuco. In order to better understand movement between these areas, combined methods were applied: (1) initially age structure and size of L. alexandrei individuals were determined between estuarine (depths < 5 m) and deeper coastal areas (depths between 30 and 60 m); (2) otoliths microquimistry of L. alexandrei caught in estuarine and coastal areas were tested to evidence possible movement between these areas; (3) the utilization of mangroves and adjacent shallow reef areas in different life stages were studied through underwater visual census for L. alexandrei and L. jocu. Biological samples (otoliths) of L. alexandrei were collected through fishing landings of corral fisheries in estuarine areas and guillnets and traps for coastal areas between Pernambuco and Alagoas States. Data were collected during three consecutive years (2010- 2012). Otoliths of both juvenile and adult individuals were extracted, embedded in resin, sectioned with a low speed saw, then age structure were determined. In a second step, chemical concentrations of trace elements were analyzed in otolith sections using a laser ablation inductively coupled plasma mass spectrometer. Underwater observations (Total 90 transects of 10 x 2 m for each of the five locations) were performed along November to March (2012-13). Results show that inshore mangroves were comprised of individuals 0 to 4 years (mean: 2) while individuals in deeper reef environments were older (range: 3 to 22; mean: 8), indicating that an ontogenetic shift occurs at approximately age 3 or 4. Edge analysis was used to validate the annual deposition in the otoliths suggesting opaque growth rings were formed in the wet season between April and September. Growth data revealed that L. alexandrei display a faster growth in early life stages, reaching approximately 50% of its asymptotic size at age 2. Age at length data were used to predict growth rates of L. alexandrei using the von Bertalanffy growth model from where the following parameters were calculated: L∞ = 31 cm , k = 0.24, t0 = -1.26, r2 = 0.97. Mortality rates were estimated for coastal habitats, with Z = 0.22 and S = 0.78 year-1 . Concentrations of six trace elements were measure (7 Li, 24Mg, 55Mn, 59Co, 88Sr and 137Ba) in otoliths of L. alexadrei. Element:Ca ratios in the otoliths of juvenile and sub-adult L. alexadrei from estuaries were not significantly different among three consecutive years (2010, 2011 and 2012), suggesting that physicochemical conditions within the nursery investigated was temporally stable. Similarly, apart from two element (Ba, Co), element:Ca ratios for larger L. alexandrei inhabiting coastal waters were also similar. In contrast, otolith chemistry of similar sized L. alexandrei from estuarine and coastal areas was distinctly different (based on recently accreted material). Otolith Mn:Ca and Ba:Ca were both significantly higher for L. alexandrei collected in estuaries compared to fish from adjacent coastal reefs region, while the opposite trend was observed for Sr:Ca. Given the pronounced differences in otolith chemistry between estuarine and coastal areas, element:Ca transects were constructed from the core to margin of the otoliths for adults (age 7+) collected on reefs to determine the timing of movement (ontogenetic migration) from estuarine to coastal areas. Based on observed patterns of decline for both Mn:Ca and Ba:Ca, it appears that L. alexandrei begin to transition to more coastal habitats (i.e., lower element:Ca ratios) after age 2. Underwater observations indicate that for both species, individuals smaller than 10 cm occurred exclusively in mangroves. A distinct shift was observed with higher densities for individuals larger than 10 cm in adjacent shallow reef areas. For L. alexandrei mangroves registered occurrence of (postsettlers, juveniles and subadults) while for shallow reefs only (subadults and adults) were observed. A similar pattern was observed for L. jocu with individuals (postsettlers, juveniles and subadults) in mangroves and (juveniles and subadults) inhabiting shallow reefs. General information provided in this thesis allow a better understanding of size structure and growth pattern for L. alexandrei. Yet results suggest ontogenetic migration for L. alexandrei between shallow coastal and deeper marine habitats as well as a better understanding of habitat utilization in early life stages for L. alexandrei and L. jocu.

O presente estudo teve como objetivo avaliar a desova induzida hormonalmente e a qualidade dos ovos do ariacÃ, Lutjanus synagris. Foram avaliadas as fecundidades absoluta e relativa, o diÃmetro dos ovos e de suas respectivas gotÃculas de Ãleo, a porcentagem de ovos flutuantes, a taxa de fecundaÃÃo, a taxa de eclosÃo e sobrevivÃncia das larvas apÃs consumo da reserva vitelÃnica. O estudo foi desenvolvido no Centro de Estudos Ambientais Costeiros (CEAC) do Instituto de CiÃncias do Mar (LABOMAR) da Universidade Federal do Cearà (UFC). IndivÃduos juvenis foram capturados na natureza por meio de pesca com anzol, levados ao laboratÃrio e mantidos sob quarentena. Para finalizar o processo de maturaÃÃo gonadal os indivÃduos foram transferidos para o sistema interno, mantidos sob fotoperÃodo de 14 horas de claro e alimentados alternadamente com sardinha, camarÃo e lula. ApÃs a verificaÃÃo da maturaÃÃo gonadal foi iniciado o perÃodo de induÃÃo hormonal. Os animais foram capturados, anestesiados, medidos e pesados. O critÃrio de maturidade utilizado foi liberaÃÃo de sÃmen para os machos e diÃmetro mÃdio dos ovÃcitos maior que 400 &#956;m para as fÃmeas. As induÃÃes ocorreram entre os meses de novembro de 2009 e marÃo de 2010 com injeÃÃes de gonadotrofina coriÃnica humana (hCG) na base da nadadeira peitoral. Foram utilizadas doses de 1.500 UI kg-1 e avaliados dois protocolos. No Protocolo 50/50 foram aplicadas duas injeÃÃes contendo 50% da dose total e no Protocolo 70/30 a primeira dose foi de 70% e a segunda de 30% da dose total. A segunda injeÃÃo foi aplicada 24 horas apÃs a primeira. Os machos receberam dose Ãnica de 750 UI de hCG kg-1 no momento da segunda injeÃÃo na fÃmea. A proporÃÃo sexual (fÃmea:macho) utilizada foi de 1:2. A porcentagem de ovos flutuantes apresentou diferenÃa significativa com valores mÃdios de 78,18  39,71% e 33,68  41,02% para os Protocolos 50/50 e 70/30, respectivamente. NÃo foi observada diferenÃa significativa para nenhum dos demais parÃmetros avaliados. Os valores mÃdios para fecundidade relativa foram de 306.815,10  135.218,18 Ãvulos kg-1 (Protocolo 50/50) 404.511,27  261.545,16 Ãvulos kg-1 (Protocolo 70/30). A fertilizaÃÃo dos ovos flutuantes variou entre 92 e 100% com diÃmetro mÃdio de 726,0  16,89 &#956;m a 795,0  19,43 &#956;m e da gotÃcula de Ãleo de 122,5  8,07 &#956;m a 141,5  11,89 &#956;m. A eclosÃo ocorreu em 16 horas sob temperatura mÃdia de 29,3  0,9oC. Ovos com mÃltiplas gotÃculas de Ãleo apresentaram eclosÃo e sobrevivÃncia similares Ãqueles com uma gotÃcula. O ariacà se mostrou uma espÃcie que se adapta bem ao cativeiro respondendo positivamente ao manejo e à induÃÃo hormonal. Os resultados positivos mostram que o hCG à eficaz na reproduÃÃo induzida desta espÃcie, contudo a variabilidade dos dados encontrados no presente estudo revela que a tÃcnica precisa ser aprimorada / The aim of this study was to evaluate the hormone induced spawn and egg quality of lane snapper, Lutjanus synagris. The absolute fecundity, relative fecundity, egg and oil globule diameter, percentage of floating eggs, percentage of fertilization, hatching rate and larval survival up to yolk consumption were assessed. The study was conducted at Centro de Estudos Ambientais Costeiros (CEAC) from Instituto de CiÃncias do Mar (LABOMAR) from the Universidade Federal do Cearà (UFC). Wild juveniles were captured by hook, took to the laboratory and held in a quarantine system. Fishes were transferred to the internal system to complete gonadal maturation under a 14h-light photoperiod and fed fish, shrimp and squid. After gonadal maturation, induced spawn period was started. Individuals were captured, anesthetized and measured. Maturity criteria were running milt for males and mean oocyte diameter greater than 400 &#956;m for females. Induced spawns were attempted in the period between November 2009 and March 2010, by using human chorionic gonadotropin (hCG) injections at the base of the pectoral fin. Total doses of 1.500 IU kg-1 were used and two experimental protocols were evaluated. In the Protocol 50/50, injections of hCG were given in two doses of 50% of total dose while in the Protocol 70/30, the first dose was 70% and the second was 30% total dose. The second injection was given after 24 hours. Males received only one injection of 750 IU kg-1, at the time of the second injection to females. The sex ratio (female:male) was 1:2. The percentage of floating eggs was significantly different, with mean values of 78.18  39.71% and 33.68  41.02% for Protocols 50/50 and 70/30, respectively. There were no significant differences in any other evaluated parameters. The mean values of relative fecundity were 306,815.10  135,218.18 egg kg-1 (Protocol 50/50) and 404,511.27  261,545.16 egg kg-1 (Protocol 70/30). The percentage of fertilization in floating eggs ranged from 92 to 100% with mean egg diameters from 726.0  16.89 &#956;m to 795.0  19.43 &#956;m and oil globule diameters from 122.5  8.07 &#956;m to 141.5  11.89 &#956;m in Protocols 50/50 and 70/30. Hatching occurred 16 hours after spawning at mean temperature of 29.3  0.9oC. Spawns with eggs having multiple oil globules had a similar hatching rate and larval survival than those with simple oil globule. Lane snapper can successfully adapt to captivity conditions and positively respond to handling and induced spawn. The positive results show that hCG induced spawn is feasible, however the variability of the found data in the present study reveals that this technique needs to be improved

La connectivité écologique se mesure via l'estimation des mouvements réalisés par les organismes au cours de leurs vie. Parmi les outils existants, seule la microchimie des otolithes est capable de reconstruire les mouvements des poissons au cours de leur vie entière, notamment lors des migrations ontogénétiques. Son utilisation au sein des milieux oligotrophes et chimiquement peu contrastés tels que les récifs coralliens reste cependant marginale. C'est dans ce contexte que s'inscrit ce travail sur la microchimie des otolithes des poissons des récifs coralliens et mangroves de Nouvelle-Calédonie. Il se divise en deux parties. La première, méthodologique, est axée sur l'estimation du potentiel de l'outil microchimie des otolithes en Nouvelle-Calédonie, avec un chapitre sur la détermination des signatures multi-élémentaires caractéristiques des différents habitats de la Grande Terre et un chapitre sur l'étude de la relation entre la microchimie de l'environnement et celle des otolithes. La seconde partie se concentre sur l'application de la méthodologie précédemment développée a des thématiques écologiques, avec un chapitre sur le rôle des mangroves sur le cycle de vie et la distribution géographique d'une espèce de Lutjanidae, Lutjanus fulviflamma, et un chapitre centré sur les mouvements réalisés au cours de la vie de cette espèce. Les résultats démontrent que la microchimie des otolithes présente un potentiel élevé en Nouvelle-Calédonie avec un fort pouvoir de discrimination entre la mangrove et les récifs coralliens. La relation entre la microchimie de l'environnement et celle des otolithes est complexe et dépend fortement des espèces considérées. Cependant, les contrastes chimiques marqués de l'environnement se retrouvent au sein des otolithes. Les résultats démontrent une connexion forte entre les différents habitats pour L.fulviflamma, particulièrement entre la mangrove et les récifs coralliens avec une importance cruciale de la mangrove comme zone de nurserie. Trois différents patrons de mouvements entre habitats ont été identifiés. Cette diversité illustre une forte variabilité de la connectivité écologique entre les individus, avec pour certains d'entre eux, une fréquentation de l'habitat juvénile durant la phase adulte. / Ecological connectivity is defined by organism movements between habitats.Among the tools used to measure connectivity, otolith microchemistry is the only one able toreconstruct the fish movement throughout their entire lifetime, and thus include ontogeneticmigrations. However, it is seldom used in oligotrophic environments that typically show poorchemical contrasts such as coral reefs. In this context, this study focused on otolith microchemistryof coral reef and mangrove fishes of New Caledonia. This work comprises two parts. First, amethodological part to assess the potential of otolith microchemistry in New Caledonia, with onechapter on the determination of multi-elemental signatures of habitats from the Main Island and onechapter on the relationships between environmental and otoliths microchemistries. Second, thepreviously developed methodology was applied to ecological questions, with a chapter on theimportance of mangrove on the life cycle and the spatial distribution of a Lutjanidae, Lutjanusfulviflamma, and a chapter on the lifetime movement patterns of this species. Results revealed ahigh potential of otolith microchemistry in New Caledonia with a high power of discriminationbetween mangroves and coral reefs. Relationships between environmental and otolithmicrochemistries were complex and species-specific. However, strong chemical contrasts in theenvironment were traduced in the otoliths. Results showed a strong connection between differenthabitats for L. fulviflamma, in particular between mangroves and reefs with a crucial importance ofmangroves as nursery grounds. Three different patterns of lifetime movements among habitats wereidentified. This diversity illustrates a high variability of ecological connectivity patterns amongindividuals, with a possible return to the juvenile habitat during the adult stage.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-09T12:45:56Z No. of bitstreams: 1 Cezar Augusto Freire Fernandes.pdf: 2053584 bytes, checksum: e3987e91e201b925acf27f2cbd6aa6e8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-09T12:45:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cezar Augusto Freire Fernandes.pdf: 2053584 bytes, checksum: e3987e91e201b925acf27f2cbd6aa6e8 (MD5) Previous issue date: 2010-02-08 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The study presents information about the reproductive characteristics of baúna de fogo Lutjanus alexandrei. Ware obtained 540 samples of this species in north coast of Pernambuco state from 2004 to 2006. Ware realized 250 (150 females and 100 males) histological cuts and observations of the presents oocytes and spermatogonias, analyzed with microscopy to determine the stage of gonadal development. For females and males ware determined 5 maturational stages: immature, maturation, matures, spawned/ejaculating and resting. The standard length of the samples varied from 130 to 283 mm, and the sexual ratio was 1.6:1(male:female). A relation of Gonadosomatic Index associated with advanced maturation ware found in a long pulse from October to November, with points in November and February. The L50 for females was 147,2 mm SL and 147,8 mm SL for males. The spawning was in portions with assinchronic development of oocytes. The estimate fecundity through hidratated oocytes counting varied from 33.990 to 323.738 oocytes. / O presente estudo fez um levantamento sobre as características reprodutivas da baúna de fogo Lutjanus alexandrei. Para isso, foi obtido um total de 540 amostras de gônadas da espécie capturada na costa norte do estado de Pernambuco entre 2004 a 2009. Foram realizados 250 (150 fêmeas e 100 machos) cortes histológicos e observações dos ovócitos e espermatogônias presentes, analisados microscopicamente para determinação dos estádios de desenvolvimento gonadal. Para as fêmeas e machos foram definidos 5 estádios maturacionais: imaturo, em maturação, maduro, desovando/ejaculando e repouso. O comprimento padrão dos exemplares variou entre 130 mm a 283 mm, e a proporção sexual foi de 1,6 machos para uma fêmea. A relação entre o Índice Gonadosomático (IGS) e exemplares em maturação avançada mostrou que a baúna de fogo parece possuir atividade reprodutiva em um longo pulso de outubro a março, com maior intensidade em novembro e fevereiro. O tamanho de primeira maturação sexual para as fêmeas foi estimado em 174,2 mm de CP e 174,8 mm de CP para os machos. O tipo de desova apresentou padrão assincrônico e desova parcelada. E a fecundidade estimada a partir da contagem dos ovócitos hidratados variou de 33.990 a 323.738 ovócitos.

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2016-12-05T12:31:08Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao_AnalisesPopulacionaisL.Purpureus.pdf: 2353749 bytes, checksum: 4e42a8beef4fdc3a4441691c75184517 (MD5) / Rejected by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br), reason: Corrigir as palavras-chaves, iniciar com letra maiusculas. Corrigir na citação após o (mestrado) inserir - e não ponto. Incluir ponto no final da citação. Renomear pdf para AnalisesPopulacionaisLutjanus Acrescentar a palavra Programa antes de Pós-Graduação no final da citação. on 2016-12-05T15:26:25Z (GMT) / Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-01-03T11:27:04Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AnalisesPopulacionaisL.Purpureus.pdf: 2357106 bytes, checksum: 7f3ac8ad14a67fd29b0baca8fcc42b59 (MD5) / Rejected by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br), reason: Renomear pdf Verificar na citação a ausência da palavra Programa. on 2017-01-03T13:07:55Z (GMT) / Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-01-04T12:14:34Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AnalisesPopulacionaisLutjanus.pdf: 2357106 bytes, checksum: 7f3ac8ad14a67fd29b0baca8fcc42b59 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-01-06T15:40:42Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AnalisesPopulacionaisLutjanus.pdf: 2357106 bytes, checksum: 7f3ac8ad14a67fd29b0baca8fcc42b59 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-06T15:40:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AnalisesPopulacionaisLutjanus.pdf: 2357106 bytes, checksum: 7f3ac8ad14a67fd29b0baca8fcc42b59 (MD5) Previous issue date: 2015-03-02 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Organismos marinhos com ampla distribuição são excelentes modelos para o entendimento de padrões de conectividade genética histórica. Lutjanus purpureus, ou pargo, como a espécie é popularmente conhecida, é um Teleósteo marinho pertencente à família Lutjanidae. A espécie distribui- se desde Cuba até o Nordeste do Brasil, sendo frequentemente encontrada sobre fundos rochosos e arenosos. Possui elevada importância econômica, no entanto poucos são os estudos disponíveis acerca da arquitetura genética da espécie. Dos principais objetivos do presente estudo, o primeiro trata do desenvolvimento e caracterização de iniciadores do tipo EPIC, para abordagens populacionais em L. purpureus, e outros teleósteos marinhos. A caracterização de regiões genômicas com polimorfismo suficiente para análises populacionais torna-se fundamental para estudos genéticos com múltiplas regiões não ligadas. Foram obtidos oito iniciadores, boa parte deles possuindo altos níveis de variação genética. Iniciadores EPIC possuem a vantagem de serem aplicáveis em um vasto nível taxonômico, assim estes iniciadores foram testados e amplificados em organismos de outros agrupamentos taxonômicos, portanto um indicativo de que podem ser usuais em abordagens intraespecíficas para vários grupos de peixes marinhos. O segundo objetivo principal foi avaliar questões sobre diversidade genética, demografia e conectividade genética histórica para L. purpureus, utilizando múltiplos loci (DNA mitocondrial e nuclear). Encontrou-se elevados índices de diversidade genética, provavelmente correlacionados a um elevado tamanho efetivo apresentado pela espécie. O pargo, aparentemente, demonstra elevados níveis de homogeneidade genética ao longo da região estudada, o que é coerente com traços biológicos da espécie tais como desova em mar aberto e desenvolvimento pelágico. Em relação a aspectos da demografia histórica, é apresentado um cenário de crescimento populacional, cujo início é datado de aproximadamente 170 mil anos, sendo esse período congruente com um período de máxima glacial para a região do Atlântico ocidental. / Marine organisms with wide distribution are excellent models for the understanding of historical genetic connectivity patterns. Lutjanus purpureus, or Caribbean snapper, as the species is popularly known, is a marine Teleost belonging to the Family Lutjanidae. The species distribution is from Cuba to the Northeast of Brazil, being often found on rocky and sandy bottoms. It has high economic importance, however there are few studies available on the genetic architecture of the species. Of major goals of this study, the first deals with the development and characterization of the EPIC primers, for population approaches in L. purpureus, and others marine teleosts. The characterization of genomic regions with sufficient polymorphism to population analysis is fundamental for genetic studies with multiple unlinked regions. Were obtained eight primers, and the majority has high levels of genetic variation. EPIC primers have the advantage of being applicable on a wide taxonomic level, thereby these primers were tested and amplified in other taxonomic groups of organisms, so that an indication can be useful in various approaches to intraspecific groups of marine fish. The second main objective was to evaluate issues of genetic diversity, demographics and historical genetic connectivity for L. purpureus using multiple loci (mitochondrial and nuclear DNA). It was found high levels of genetic diversity, probably related to a high effective size presented by species. The Caribbean snapper apparently shows high levels of genetic homogeneity along of the study area, which is consistent with biological traits of species such as spawning in offshore and larval pelagic development. In relation to aspects of historical demography, a population growth scenario is presented, whose beginning is dated about 170,000 years, this period being congruent with a period of glacial maximum to the region of the western Atlantic.

Although closed seasons, bag limits and quotas are used to manage fishes within the Grouper/Snapper Complex off the southeastern United States, size limits are the cornerstone of fisheries management. Because fishers must release all undersized fishes despite fish condition, this regulation has created a mandatory catch and release system. Inherent in this management strategy is the supposition that these undersized fish survive in sufficient numbers so as to justify this regulation. To satisfy this criteria fish mortality must be low and released fish must also experience minimal sub-lethal effects. Determination of sublethal effects and evaluation of their potential impairment and duration of injury are required to develop effective physiology-based criteria to evaluate the efficacy of the minimum size rule. The goal of this research was to evaluate some aspects of the efficacy of the minimum size rule in the red grouper and red snapper fisheries off Florida by collecting traditional fisheries data and analyzing it in light of fish physiology, ecomorphology and behavior. Study objectives included 1) determination of the causes for the differences of hook mortality for red grouper and red snapper in the recreational and recreational-for-hire fisheries by necropsy of acute and latent mortalities, analysis of tag and recapture data for both J and circle hooks, determination of fish dentition and any differences in feeding behavior, 2) examination of the effects of rapid depression from depth on fish survival by inspection and comparison of the red grouper and red snapper swim bladders in both healthy and swim bladder ruptured fish from various water depths, comparison of tag and recapture data, investigation of the effects of fish venting, and laboratory simulations using fish hyperbaric chambers to determine healing and survival from rapid depression trauma, 3) analysis of movement patterns of tagged fish and 4) evaluation of some of the consequences imposed by the minimum size limit based on study results.

Estimation of natural mortality within statistical catch-at-age models has been relatively unsuccessful and is uncommon within stock assessments. The models I created estimated population-dynamics parameters, including natural mortality, through Metropolis-Hastings algorithms from Gulf of Mexico red-snapper Lutjanus campechanus data. I investigated the influences of assumptions regarding model configuration of natural mortality and selectivity-at-age parameters by comparing multiple models. The results of this study are preliminary due to parameter estimates being bounded by uniform priors and thus a potential lack of convergence to the posterior distribution. Estimation of a natural-mortality parameter at age 0 or a Lorenzen natural-mortality parameter could be confounded with selectivity-at-age-1 parameters for bycatch from the shrimp fisheries. The Lorenzen natural-mortality curve was calculated by dividing the parameter by red snapper length at age. An age-1 natural-mortality parameter might not be estimable with the currently available data. Values of the natural-mortality parameter for ages 2 and older appear to be slightly less influenced by assumptions regarding selectivity-at-age parameters. We conducted a simulation study to determine the accuracy and precision of natural-mortality estimation assuming the selectivity-at-age-1 parameter for bycatch from the shrimp fisheries equaled 1.0 and a Lorenzen natural-mortality curve. The simulation study indicated that initial abundance-at-age parameters may be inestimable within the current model and may influence other parameter estimates. The preliminary simulation results showed that the Lorenzen natural-mortality parameter was consistently slightly underestimated and apical-fishing-mortality parameters were considerably underestimated. The estimation of natural mortality within a statistical catch-at-age model for Gulf of Mexico red snapper has many caveats and requires additional investigation. / Master of Science

Made available in DSpace on 2011-03-23T21:19:49Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Growth, mortality, biometry and reproduction of the red snapper, Lutjanus purpureus was researched from samples obtained from landings of commercial catches in the northern Brazilian coast with auspicious of REVIZEE program and Biology and Fishing of the red snapper in the northern Brazilian Project of the CEPNOR/IBAMA . Total and zoological length data obtained from approximately 500 individuals were collected monthly in the cities of Belém, Vigia and Bragança, from January 1999 to December 2000. Sub-samples of 150 fishes were obtained monthly from April 1998 to January 2000 to study reproduction and biometry. In the CEPNOR/IBAMA laboratory were carried out biometry, identification of sexy type and gonadal maturation stages. The total of 16. 733 specimens, presents percentile superiors at 50% of young individuals. The amplitude of total class varied from 13 to 112 cm of length and the length averages were 45,72 cm and 51,91 cm, respectively for the year of 1999 and 2000. The morphometric and weight/length relationships show positive allometry. The weight/length relation of male and female differ significantly from Student statistic method. The reproduction was researched determining the sexual proportion under chisquare statistics, the size of first maturation and spawning period, that was analyzed temporal variation of frequency of the gonadal stages and gonadal-somatic relation. The whole research period was observed a female predominance in the month analysis only in April 1998, May and June 1999 do not present significant differences between male and female. In sexual proportion, by class length the predominance of female was highly significant from 28 to 45 cm. The total length class of first maturation was estimated between 43 a 46 cm from females by graphic extrapolation method and the 43,67 cm by adjust of Galton ogive. The reproductive period was defined in two points, one more intense in the second quarter of the year, with a larger amplitude in may/1998 and another one reduced in the fourth quarter same year. Growth parameters were estimated by ELEFAN I system, Bhattacharya, Gulland & Holt and Appeldoorn methods in FiSAT program. The Appeldoorn method presents the better adjust to red snapper with value of L= 115 cm, K= 0,091 year-1, and determine von Bertalanffy equation Lt = 115 (1-e 0,091t-to). The natural mortality was estimated in 0,25 year-1 e 0,31 year-1 by Pauly and Rikhter & Efanov equations, respectively. The total mortality estimated by converted length in curve of linearized catch and Beverton & Holt method reached values of 0,59; 0,664 respectively. Mortality by fishing and exploitation rate were also calculated and obtained values F = 0,34 year1 e E = 0,57. The longevity estimated by Taylor equation was 33 years. The red snapper presents slow growth and longevity life with periodic spawn. The fishing in the northern Brazilian coast happen high percentile of young fishes. That can contribute to overfishing growth , compromising the sustentability of the species and the fishing activity in the northern Brazilian coast. It is indispensable to adopt regulation measures to red snapper fishing, at least about minimum size capture. / O crescimento, a mortalidade, biometria e a reprodução do pargo Lutjanus purpureus foram estudadas a partir de amostras obtidas nos desembarques da frota comercial capturadas com pargueira na costa norte do Brasil no âmbito do programa REVIZEE e do Projeto biologia e pesca do pargo no norte do Brasil do CEPNOR/IBAMA. Dados de comprimentos total e zoológico de aproximadamente 500 indivíduos foram coletados aleatoriamente e mensalmente nos desembarques dos municípios de Belém, Vigia e Bragança, no período de janeiro de 1999 a dezembro de 2000. E para realizar estudos de reprodução e biometria foram obtidas subamostras mensais de 150 indivíduos em abril de 1998 a janeiro de 2000. No laboratório do CEPNOR/IBAMA foram realizadas as biometrias, sexagem e identificados os estágios de maturação gonadal. As amostras totalizaram 16.733 indivíduos com percentuais superiores a 50% de indivíduos jovens. A amplitude de classe total variou de 13 a 112 cm de comprimento e as médias de comprimentos foram de 45,72 cm e 51,91 cm, respectivamente para o ano de 1999 e 2000. As relações morfométricas e as relações peso/comprimento apresentaram alometria positiva. E a relação peso/comprimento para macho e fêmea diferem significativamente entre si, pelo teste de Student, bilateral, com alfa = 0,05. A reprodução foi estudada determinando a proporção sexual através do teste quiquadrado, o tamanho de primeira maturação e o período de desova, que foi analisado pela variação temporal das freqüências dos estágios gonadais e relação gonadossomática. Para todo o período estudado foi verificada a predominância de fêmeas e nas análises mensais apenas nos meses de abril de 1998, maio e junho de 1999 não apresentaram diferenças significativas entre os sexos. Na proporção sexual por classe de comprimento a predominância de fêmeas foi altamente significativa de 28 a 45 cm. A classe de comprimento total do tamanho de primeira maturação foi estimado 43 a 46 cm para fêmeas pelo método da extrapolação gráfica e de 43,67 cm pelo ajuste da ogiva de Galton. E o período reprodutivo foi observado em dois picos, sendo um intenso no segundo trimestre, com maior amplitude no mês de maio/1998 e um mais reduzido no quarto trimestre. Os parâmetros de crescimento foram estimados pelo sistema ELEFAN I, método de Bhattacharya, Gulland & Holt e Appeldoorn no programa Fisat. O método de Appeldoorn apresentou o melhor ajuste para a espécie com o valor de L= 115 cm K= 0,091ano-1 , que determinou a equação do crescimento de von Bertalanffy Lt = 115 (1-e 0,091tto). A mortalidade natural foi estimada em 0,25 ano-1 e 0,31 ano-1 pelas equações de Pauly e Rikhter & Efanov respectivamente. A mortalidade total estimada pelos métodos do comprimento convertido em curva de captura linearizada e Berverton & Holt atingiu valores de 0,59; 0,664 respectivamente. A mortalidade por pesca e a taxa de explotação também foram calculados. Os resultados foram F = 0,34 ano 1 e E = 0,57. A longevidade estimada pela fórmula de Taylor foi de 33 anos. O pargo apresenta crescimento lento e vida longa com desova contínua e periódica. A pesca na costa norte do Brasil incide em percentuais elevados de jovens o que pode contribuir para um estado de sobrepesca de crescimento, comprometendo assim a sustentabilidade da espécie e da atividade pesqueira na região norte. É imprescindível adotar medidas de ordenamento para a pesca do pargo, principalmente no que diz respeito ao tamanho mínimo de captura.

Predator satiation and prey-size preference were determined for locally caught lionfish, schoolmaster, and graysby, all co-occurring predatory fishes in the Florida coral reef ecosystem. Individuals were evaluated by exposing them to wild-caught killifish over a gradient of four size classes (20 mm to 60 mm, in 10 mm increments). Preference trials extended over a 2 hr time period and were filmed to determine the order in which each prey item was consumed. Satiation was evaluated by exposing the predators to an equal number of excess prey items for 24 hrs and evaluating consumed prey weight. Lionfish and schoolmaster showed a significant preference for the smallest size class (20-30 mm) while the graysby preferred the largest (50-60 mm) and smallest equally. Graysby were shown to consume the least amount of food per gram by biomass (0.034g/gram predator-1) while lionfish consumed the most (0.079g/gram predator-1). A significant difference was also found between consumption rates of lionfish and schoolmaster (0.053g/gram predator-1). If consumption is compared by length between species, lionfish ( = 0.051g/mm predator-1) and schoolmaster ( = 0.061g/mm predator-1) consumption was not significantly different. These results suggest that lionfish success may stem from its ability to target prey sizes not preferred by the graysby while able to outcompete schoolmaster for the same prey size class. However, if the lionfish is compared on an individual level to schoolmaster by individual or length, consumption is similar, suggesting lionfish consumption is not significantly greater on the reef than the native species on an individual basis.