Made available in DSpace on 2015-03-05T16:19:36Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 26 / UNISINOS - Universidade do Vale do Rio do Sinos / A constante degradação ambiental, em especial a fragmentação de hábitat, tem levado a alterações nas populações de mamíferos em todo o mundo. No Campo de Instrução de Santa Maria (CISM), Santa Maria, Estado do Rio Grande do Sul/Brasil, isto não é diferente, onde a colonização humana trouxe tanto a perda quanto a fragmentação. Na região, os Campos Sulinos e da Mata Atlântica formam uma paisagem onde fragmentos de Floresta Estacional Decidual são circundados por áreas de campos, atualmente usados para pecuária, agricultura e manobras militares. Neste estudo avaliei o uso de fragmentos florestais e áreas de campo por mamíferos, abordando freqüência de ocorrência, riqueza, diversidade e abundância de registros em três tipos de hábitats grandes fragmentos (FG) > 193 ha, pequenos fragmentos (PE) entre 18 e 47 ha e áreas de campos (CA). Estabeleci grades de armadilhas com seis armadilhas de pegadas, iscadas com banana, bacon e "gland lure". Em cada série bimestral de amostragens revisei as armadilhas a cada quatro dias, registrando as pegadas encontradas em cada armadilha. Houve um total de seis séries de amostragens entre ago/04 e jul/05, onde obtive um total de 364 registros de grupos de mamíferos (formado por um ou mais espécies da mesma família). Mazama sp. usa grandes fragmentos mais frequentemente que canídeos (Pseudalopex gymnocercus e Cerdocyon thous) que são mais generalistas no uso de hábitat. Os grandes fragmentos mostraram maior riqueza (FG = 9, PE = 7 e CA = 3), diversidade e abundância de registros que os outros tipos de hábitats. Entretanto, há diferenças significativas apenas nas amostragens de Nov-Dez/2004 e Jan-Fev/05, os quais os valores de P foram 0,031 e 0,022 para riqueza e abundância. Para diversidade os valores de P foram 0,042 e 0,010 nos mesmos meses. Estas diferenças ocorreram apenas entre grandes fragmentos de áreas de campo. Os resultados indicaram que grandes áreas de florestas têm uma elevada riqueza, principalmente quando comparada a áreas de campos. Além da importância das grandes áreas de florestas para os mamíferos, ficou evidente também o valor que as áreas de campos possuem, por abrigar espécies mais associadas a áreas campestres. No CISM, mesmo com a alteração das áreas de campo e dos fragmentos de Floresta Estacional Decidual, os resultados mostram o peso de diferentes hábitats no conceito de diversidade beta (dissimilaridade entre hábitats). Um manejo apropriado das áreas de campo seria importante para a conservação de mamíferos em ambos biomas, Floresta Atlântica e Pampas. / The constant environmental degradation, in special the habitat fragmentation, has leading to alterations in mammal populations around de world. Into the Campos de Instrução de Santa Maria (CISM), Santa Maria, State of Rio Grande do Sul/Brazil, it is not different, since the human colonization has led to habitat loss and fragmentation. In this region the Campos Sulinos (southern grasslands) and Atlantic forest, form a landscape where fragments of Deciduous Seasonal Forests are surrounded by grasslands now used for cattle-raising, agriculture, and military activities. In this study I evaluated utilization of forest fragments and grassland by mammals, focusing on their frequency of occurrence, richness, diversity, and abundance in three types of habitats (large forest fragments (FG) - > 193 ha, small forest fragments (PE) between 18 and 47 ha, and open areas (CA). I established "trapping" grids with six footprint traps, baited with banana, bacon and "gland lure". For each bi-monthly trapping session I revised the traps every four days after setting them, recording all footprints found. For a total of six trapping sessions between Aug/04 and Jul/05, where I obtained 364 records of mammal groups (formed for one or more species of the same family). Mazama sp. deers use large fragments more frequently whereas the canids (Pseudalopex gymnocercus and Cerdocyon thous) were more generalist in habitat use. The larger fragments showed higher richness (FG=9; PE=7 and CA=3), diversity and abundance of records than the other areas. However, there are significant differences only in the samplings of Nov-Dez/2004 and Jan-Feb/05, which the P values were 0,031 and 0,022 for richness and abundance. For the diversity the values of P were 0,042 and 0,010 in the same months. These differences occurred only between large fragments (FG) and grasslands (CA). Results indicated that large forested areas harbour a higher richness, mainly when compared to the grasslands. Larger forest fragments are important for mammals, but in our study grasslands shelter characteristic species of such areas, increasing beta diversity. In the CISM, even with the relatively high disturbance of the grasslands and Deciduous Seasonal Forest, the results showed the importance of different habitats into the idea of beta diversity (dissimilarity between habitats). A proper management of these areas would be important for mammal conservation of both Atlantic Forest and Campos Sulinos.

Made available in DSpace on 2015-03-05T16:20:40Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O aumento das bordas florestais é parte da influência da fragmentação nos remanescentes de mata e pode afetar as comunidades de pequenos mamíferos. Para avaliar tal efeito, amostrei cinco áreas representativas das florestas da região sul do Brasil. Em cada uma delas amostrei a abundância e riqueza e diversidade de pequenos mamíferos, na matriz (> 60 m da floresta), borda (até 15 m para o interior da floresta), zona intermediária (60 m para o interior) e interior florestal (150 m). Avaliei ainda a disponibilidade de recursos alimentares e características estruturais do hábitat em todos esses ambientes. Para um total de 446 indivíduos (20 espécies) capturados, os dados não indicaram efeitos de borda evidentes para nenhuma das métricas utilizadas. Talvez isso se explique pelas características estruturais da borda não serem claramente distintas dos outros habitats. Além disso, não detectei também diferenças na disponibilidade de recursos (frutos e invertebrados) entre os três habitats florestais amostrados. No e / The increase of forest edges is part of the influence of the fragmentation on forest remnants and may affect small-mammal communities. For evaluating such effect I sampled five areas representative of South-Brazilian forests. In each of them I sampled the abundance, richness, and diversity of small mammals, in the matrix (> 60 m of the forest), edge (up to 15 m to the forest interior), intermediate zone (60 m to the interior), and forest interior (150 m). I also evaluated the availability of food resources and structural characteristics of the vegetation at these habitats. For a total of 446 individuals (20 species) captured the results did not indicate evident edge effects for any of the community metrics. Such pattern may be explained by the lack of differences in structural characteristics between edges and the other forest habitats. Besides, I did not detect differences in resource availability (fruits and invertebrates) among the three forest habitats, either. However, rarefaction curves indicated s

Giardia e Cryptosporidium são protozoários cosmopolitas cuja epidemiologia é especialmente importante devido ao seu expressivo potencial zoonótico. Animais silvestres são frequentemente relatados como reservatórios da giardiose e criptosporidiose humanas, todavia, são escassas as evidências sobre sua real importância na manutenção e disseminação destas protozooses. No intuito de avaliar a ocorrência e determinar os genótipos responsáveis pela infecção de mamíferos neotropicais, 452 amostras fecais procedentes de 52 diferentes espécies, in situ e ex situ, de sete localidades distintas foram avaliadas por métodos de diagnóstico microscópico, seguidos por técnicas moleculares de amplificação (Nested PCR), sequenciamento e caracterização genotípica. Os resultados revelaram prevalência aparente de 6,2% para Giardia spp. e de 4,8% para Cryptosporidium spp. (n=343). Dezessete diferentes espécies de mamíferos silvestres foram positivas, sendo 11 para Giardia spp., nove para Cryptosporidium spp. e três para ambos os protozoários. A caracterização molecular revelou a predominante presença de genótipos zoonóticos em mamíferos cativos (Giardia duodenalis genótipo AI) e de genótipos hospedeiro-específicos em animais de vida livre (Cryptosporidium sp. rat genotype III e Cryptosporidium wrairi). Foram também identificados Giardia duodenalis genótipo D em cachorro-do-mato Cerdocyon thous e Cryptosporidium sp. deer mouse genotype IV em bugio-preto Alouatta caraya, ambos mantidos em cativeiro. Aspectos ecológicos, como habitat, guilda trófica, estratégia do uso do ambiente e influência antrópica, foram considerados relevantes para a ocorrência dos parasitas. Tais achados demonstraram que animais silvestres podem ser infectados por genótipos zoonóticos e específicos dos agentes, o que revela a importância de estudos envolvendo esta abordagem para sugerir possíveis relações entre os protozoários, hospedeiros humanos, animais domésticos e silvestres perante diferentes características ambientais. / Giardia and Cryptosporidium are cosmopolitan protozoans whose epidemiology is especially important due to its significant zoonotic potencial. Wild animals are often reported as reservoirs of human giardiosis and cryptosporidiosis, however, there is little evidence about their real importance in the maintenance and dissemination of these protozoosis. In order to evaluate the occurrence and determine the genotypes responsible for neotropical mammals infection, 452 fecal samples of 52 different species, in situ and ex situ, of seven locations were evaluated by microscopic methods of diagnosis, followed by molecular amplification (Nested PCR), sequencing and genotypic chacacterization techniques. The results revealed an apparent prevalence of 6,2% for Giardia spp. and 4,8% for Cryptosporidium spp. (n=343). Seventeen different species of wild mammals were positive, 11 for Giardia spp., nine for Cryptosporidium spp. and three for both protozoans. Molecular characterization shows predominant presence of zoonotic genotypes in captive mammals (Giardia duodenalis genotype AI) and host-specific genotypes in free-living animals (Cryptosporidium sp. rat genotype III and Cryptosporidium wrairi). Giardia duodenalis genotype D in crab-eating fox Cerdocyon thous and Cryptosporidium sp. deer mouse genotype IV in black howler monkey Alouatta caraya, both in captivity, were also identified. Ecological aspects, like habitat, trophic guilds, strategy of using the environment and human influence, were considered relevant to occurrence of the parasites. These findings could demonstrate wild mammals can be infected by zoonotic and specific genotypes of agents, which shows the importance of studies using this approach to suggest possible relationships between protozoans, human hosts, domestic animals and wildlife facing different environmental characteristics.

Nesta dissertação investigamos o papel dos mamíferos em cascatas tróficas nas florestas tropicais, e os efeitos da configuração espacial e qualidade do habitat assim como das atividades humanas atuais sobre a distribuição de mamíferos de maior porte em uma paisagem rural de Mata Atlântica. No primeiro capítulo, através de uma revisão da literatura sumarizamos e avaliamos a evidência empírica de que mamíferos estão envolvidos em cascatas tróficas em florestas tropicais com o objetivo de indicar os avanços, os problemas e os desafios nessa área. Poucos estudos empíricos e conceituais foram encontrados na literatura, todos realizados nas últimas três décadas, enquanto que a maioria dos estudos empíricos foi realizada nos Neotrópicos. Grande parte das hipóteses relacionadas a cascatas tróficas foi apenas proposta, e considera o homem como predador de topo. Além da maior parte das variáveis quantificadas não serem adequadas para demonstrar efeitos em cascata, a escala temporal da maioria dos estudos revisados foi curta para acessar estes efeitos sobre a comunidade de plantas que contém espécies longevas. Nenhuma hipótese abordou o efeito dos predadores de topo sobre as populações de presas pequenas via o controle da densidade e distribuição de mesopredadores. A maioria das hipóteses que encontramos na literatura se refere a outros efeitos indiretos causados por mamíferos, em particular através da dispersão de sementes e da disponibilização de nutrientes via fezes. Dessa maneira, demonstramos que o termo \"cascata trófica\" tem sido utilizado amplamente, englobando outros efeitos indiretos que se propagam via outras interações que não tróficas, e que a evidência empírica disponível até o momento de que mamíferos desencadeiam cascatas tróficas em florestas tropicais é pequena. No segundo capítulo, através da amostragem de 23 remanescentes florestais e do uso de modelos de ocupação e da abordagem de seleção de modelos, investigamos como fatores associados à configuração espacial e qualidade do habitat e a outras atividades humanas em andamento interagem e condicionam a distribuição de mamíferos terrestres de maior porte em paisagens intensamente modificadas pelo homem. A assembléia de mamíferos de maior porte encontrada na paisagem estudada é simplificada e dominada por mamíferos silvestres generalistas de médio porte, sugerindo que o controle de mesopredadores e a regeneração das florestas podem estar comprometidos. Os resultados também sugerem que: (1) a distribuição de mamíferos de maior porte deve ser condicionada mais por fatores associados à configuração espacial do que à qualidade do habitat florestal; (2) as atividades humanas atuais são tão ou mais importantes que a configuração espacial e a qualidade do habitat para a maioria das espécies. O tamanho dos fragmentos e a distância a rodovias, entre os fatores associados à configuração espacial, e a caça e a presença do cachorro doméstico, entre as atividades humanas atuais, foram particularmente importantes para a distribuição das espécies de mamíferos de maior porte. A relevância das atividades humanas em andamento sugere que estratégias de manejo que foquem em mudanças na atitude da população humana, através de programas de conscientização e educação, podem ter resultados significativos em termos da persistência de populações de mamíferos em paisagens rurais. / In this dissertation we investigated the role of large mammals in trophic cascades in tropical forests, and the effects of habitat configuration and quality as well as of current human activities on the distribution of large mammals in a rural Atlantic forest landscape. In the first chapter, through a literature review we summarized and evaluated the empirical evidence that mammals are involved in trophic cascades in tropical forest, with the aim of highlighting the progress, problems and challenges in this area. Few conceptual and empirical studies were found in the literature, all of which were performed in the last three decades, while most of the empirical studies were developed in the Neotropics. Most of the hypotheses related to trophic cascades were only proposed and not tested, and considered humans as top predators. Not only most of the quantified variables were not appropriate to demonstrate cascading effects, but also the temporal scale of most studies was short to detect these effects on plant communities composed of long-lived species. We did not find hypotheses addressing the effect of top predators on the populations of small prey through the control of mesopredator density and distribution. Most hypotheses in the reviewed literature refer to other indirect effects played by mammals, especially through seed dispersal and nutrient allocation via feaces. Thus, we demonstrate that the term \"trophic cascade\" has been used widely, encompassing other indirect effects that propagate through other, non-throphic interactions, and that the empirical evidence available so far that mammals are drivers of trophic cascades in tropical forest is weak. In the second chapter, through the sampling of 23 forest fragments and using occupancy models and a model selection approach, we investigated how factors associated with habitat configuration and quality and with other current human activities interact to define the distribution of terrestrial large mammals in human-modified landscapes. The large mammal assemblage from the studied landscape is impoverished and dominated by medium-sized generalist species, suggesting that both the control of mesopredators and forest regeneration may be compromised. Our results also suggest that: (1) the distribution of large mammals is determined mainly by aspects of habitat configuration rather than by aspects of habitat quality, and (2) current human activities are equally or more important than habitat configuration and quality for most of the species. Fragment size and distance to roads, among the factors associated with habitat configuration, and hunting pressure and domestic dog presence, among those associated with current human activities, were particularly important to the distribution of large mammal species. The relevance of current human activities suggests that management strategies that focus on changing people attitudes, through programs of education, can have significant results in terms of the persistence of mammal populations in rural landscapes.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-08-02T20:51:30Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_LevantamentoQuiropterofaunaMammalia.pdf: 33819152 bytes, checksum: 78a18eef3732c529bbe75e87058f0d0b (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-08-19T12:46:02Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_LevantamentoQuiropterofaunaMammalia.pdf: 33819152 bytes, checksum: 78a18eef3732c529bbe75e87058f0d0b (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-19T12:46:02Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_LevantamentoQuiropterofaunaMammalia.pdf: 33819152 bytes, checksum: 78a18eef3732c529bbe75e87058f0d0b (MD5) Previous issue date: 1999 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / MPEG - Museu Paraense Emílio Goeldi / Investigações sobre a quiropterofauna da Amazônia revelam a ocorrência de no mínimo 135 espécies regionais, de hábitos alimentares variados- insetívoras, frugívoras, polinívoras, carnívoras e hematófagas. Os morcegos contribuem ao equilíbrio da biota amazônica por diferentes meios, por exemplo, controle populacional de insetos, dispersão de sementes e polinização. Potencialmente perigosos à saúde humana são os hematófagos portadores do vírus rábico. Os objetivos do estudo foram assim definidos: (a) levantamento das espécies da ordem Chiroptera presentes na Ilha de Cotijuba-PA; (b) descrições do período de atividade, alimentação, reprodução e abrigos das diferentes espécies; (c) análise de diagnóstico de raiva dos quirópteros hematófagos coletados. Foram encontradas 31 espécies, duas delas necessitando ainda de estudos mais detalhados para a confirmação taxonômica. A maioria é de espécies frugívoras, isto é, dispersaras potenciais da flora local (por exemplo, Carollia spp, Artibeus spp, Uroderma spp). Duas espécies hematófagas foram observadas: Desmodus rotundus (cerca de 8% da amostra) e Diaemus youngi (menos de 1% da amostra). A pesquisa do vírus rábico foi negativa, mas ainda há registros de agressões de morcegos a ribeirinhos e animais domésticos, exigindo análises laboratoriais de novas amostras, com finalidade de monitoramento sanitário. / Surveys of Amazonian bats have recorded the occurrence of at least 135 regional species of different feeding habits- insectivorous, frugivorous, polinivorous, carnivorous and hematophagous. Bats contribute to the balance of the Amazonian biota in different ways; e.g. population control of insects, dispersion of seeds and polinization. Flematophaguous bats are potentially dangerous to humans because were they can carry the rabies vírus. The objectives of the present study were: (a) inventory of the bat species of Cotijuba island - PA; (b) descriptions of the activity period, feeding habits, reproduction and roosting sites of the different species; (c) rabies diagnosis of the hematophagous bats coliected. Thirty-one species were recorded, two of which lack more detailed taxonomic studies for diagnosis. Most of the species are frugivorous (for example, Carollia spp., Artibeus spp., Uroderrna spp.), i.e. potential seed dispersers of the local flora. Two hematophagous species were observed: Desmodus rotundus (about 8% of the sample) and Diaemus youngi (less than 1% of the sample). The rabies vírus was not recorded, but there are records of attacks by bats on humans and domestic animals, demanding continuous analyses of new samples, for effective health care monitoring.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-09-05T15:01:11Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_UsoHabitatsMamiferos.pdf: 64375514 bytes, checksum: 9d0320d8bef3b9fa2eab5955f3bb3bab (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-09-09T13:07:20Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_UsoHabitatsMamiferos.pdf: 64375514 bytes, checksum: 9d0320d8bef3b9fa2eab5955f3bb3bab (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-09T13:07:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_UsoHabitatsMamiferos.pdf: 64375514 bytes, checksum: 9d0320d8bef3b9fa2eab5955f3bb3bab (MD5) Previous issue date: 2005 / Mamíferos neotropicais de médio e grande porte são ainda pouco estudados. Na Amazônia as lacunas no conhecimento científico sobre este grupo ocorrem principalmente pela dificuldade da realização de estudos mais completos durante curtos períodos de tempo e recursos financeiros limitados. Para minimizar estes problemas, métodos indiretos de estudá-los têm sido utilizados como alternativa aos métodos tradicionais e por isso foram aplicados neste trabalho. Com o intuito de se detectar como a comunidade local de mamíferos de médio e grande porte faz uso do hábitat, através da comparação da freqüência de uso de diferentes fitofisionomias obtida por meio da contabilização de pegadas, pretende-se contribuir para a conservação e identificação de áreas de alto valor biológico para as espécies estudadas. A riqueza de espécies e a freqüência relativa de uso de hábitats foram analisadas de forma comparativa entre a Campina, a Savana Arbórea Aberta (Campo Cerrado), a Savana Arbórea Densa (Cerradão) e a Floresta Ombnifila através de três visitas à área de estudo. Foram obtidos registros de 33 espécies, distribuídas em 8 ordens, 18 famílias e 29 gêneros. As formações fitofisionômicas na área de estudo não diferiram em termos da presença de espécies, com exceção da fauna de primatas, que é particular de formações florestais. Entretanto, com relação ao uso de hábitats, foram demonstradas tendências distintas na freqüência de uso de cada formação fitofisionômica pelas diferentes espécies. A maioria das espécies registradas pelo método de detecção de pegadas parece sofrer os efeitos da variação sazonal do regime de chuvas. Além disso parecem depender mais das formações fitofisionômicas florestais. Isto fica claro quando é demonstrada uma maior diversidade e uso dos hábitats florestados pelas espécies estudadas. Entretanto, são versáteis na ocupação dos diferentes tipos de hábitat, com exceção de espécies arborícolas. Sendo assim, a Serra do Cachimbo apresenta uma fauna rica e diversificada talvez devido ao fato desta região apresentar uma mesclagem de elementos fitofisionômicos distintos, o que favoreceria tanto espécies com preferências por hábitats florestais quanto savanóides. / Neotropical mammals of medium-large size still are poorly studied. In the Amazonia the gaps in the scientific knowledge on this group occur mainly for the difficulty of accomplishment of more complete studies during short periods of time and limited financial resources. To minimize these problems, indirect methods to study them have been used as an alternative to the traditional methods and therefore they had been applied in this work. With the intention to detect how the local community of medium-large size mammals makes use the habitats, comparing the frequency of the use of different vegetation formations reached by the means of count tracks, 1 intended to contribute for the conservation and identification of areas of high biological value for the studied species. The wealth of species and the relative frequency of habitat use had been analyzed of comparative form between White-Sand Vegetation (Campina), Open Arboreal Savannah (Campo Cerrado), Dense Arboreal Savannah (Cerradão) and Forest habitats (Floresta Ombrófila) through three visits to the study area. 1 registered 33 species, distributed in 8 orders, 18 families and 29 genera. The vegetation formations in the study area had not differed in terms of the species presence, with exception of the primate fauna, which is particular of forest formations. However, with relation to the habitat use, distinct trends in the frequency of use of each vegetation formation for the different species had been demonstrated. The majority of species registered for the method of detention of tracks seems to suffer the effect from seasonal variation of the rain regimen. Moreover they seem to depend more on the forest formations. This is clearly when it is demonstrated to a bigger diversity and use of forest habitats by the studied species. However, with exception of arboreal species, they are versatile in the occupation of the different types of habitats. Thus, Serra do Cachimbo presents rich and diversified fauna perhaps due the fact of this region to present distinct vegetational elements, favoring species with preferences for savanoid and forest formations.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-09-05T15:05:32Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_FilogeniaMolecularXenarthra.pdf: 988627 bytes, checksum: 1659c92e0cee29ebde40865fb2285a63 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-09-10T13:28:57Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_FilogeniaMolecularXenarthra.pdf: 988627 bytes, checksum: 1659c92e0cee29ebde40865fb2285a63 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-10T13:28:58Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_FilogeniaMolecularXenarthra.pdf: 988627 bytes, checksum: 1659c92e0cee29ebde40865fb2285a63 (MD5) Previous issue date: 2007 / Os Xenarthra são o grupo de mamíferos que inclui os tatus, os tamanduás e as preguiças. A América do Sul serviu de cenário para a história natural do grupo que, somente no fim do Cenozóico, dispersou-se para a América Central e, com uma perda de variedade, chegou à América do Norte e à algu-mas ilhas do Caribe. Trinta e uma espécies estão descritas dentro da linha-gem dos Xenarthra. Elas estão classificadas em 13 gêneros, quatro famílias (Bradypodidae, Megalonychidae, Myrmecophagidae e Dasypodidae) e duas ordens (Cingulata e Pilosa). A filogenia deste grupo tem sido alvo de diver-sas pesquisas que analisaram tanto dados morfológicos, quanto moleculares. Delsuc et al. (2003) analisaram seqüências de genes mitocondriais e nucleares e confirmaram a monofilia das três subfamílias (Dasypodinae, Euphacti-nae e Tolypeutinae) inclusas na família Dasypodidae. Delsuc et al. (2003) geraram a seguinte árvore: (((Bradypus, Choloepus)100, ((Myrmecophaga, Tamandua)100, Cyclopes)100), ((D. kappleri, D. novemcinctus)100, (Toly-pentes, (Priodontes, Cabassous)54)100, (Zaedyus, (Euphractus, Chaetophrac-tus)60)100)). Gaudin (2005) apresentou um trabalho que reviu e ampliou as análises morfológicas apresentadas até então, concluindo que os tatus atu-ais estão divididos em dois grupos, um mais basal (Dasypodinae) e outro mais derivado (Euphractinae), de acordo com o seguinte arranjo: (Bradypus, Tamandua), (Dasypus, (Priodontes, (Cabassous, (Tolypeutes, (Euphractus, Chaetophractus, (Zaedyus, Chlamyphorus)42)36)72)72)40)85). Neste traba-lho utilizou-se parte do gene mitocondrial rRNA 16S de 12 táxons atu-ais de Xenarthra para analisar a filogenia do grupo através do critério de máxima verossimilhança. Nossos resultados são apresentados analisando-se o gene 16S e analisando o banco de dados do 16S mais o de Delsuc et al. (2003). Nas duas situações, as filogenias apresentadas apóiam os resulta-dos de Delsuc et al. (2003): (Bradypus, (Choloepus, ((Cyclopes, (Myrme-cophaga, Tamandua)100)100, (Dasypus, (((Cabassous, Priodontes)68, Toly-peutes)100,((Chaetophractus, Euphractus)65, Zaedyus)100)100)100)100)100). Uma melhora nos valores de bootstrap nos ramos dentro das sub-famílias da família Dasypodidae é percebida em relação ao trabalho de Delsuc et al. (2003). Acreditamos que Elementos de Transposição do tipo (LINES) são os marcadores moleculares mais adequados para confirmar o arranjo obtido com as seqüências de genes mitocondriais e nucleares. / Xenarthra is the group of mammals which include armadillos, anteaters and sloths. South America was the landscape of their natural history. Only toward the end of the Cenozoic they spread from South America to Cen-tral America and, in decreasing variety, farther in North America and to some of the West Indian islands. The 31 extant species are described within xenarthran lineage. They are distributed in 13 genera, four families (Brady-podidae, Magelonychidae, Myrmecophagidae and Dasypodidae) and two or-ders orders (Cingulata and Pilosa). The phylogeny of this group has been addressed by multiple researchers using both morphological and molecular data sets. Through phylogenetic analyses of protein-coding nuclear genes and mitochondrial genes, Delsuc et al. (2003) found evidence for the hy-pothesis of monophyly of the subfamilies Dasypodinae, Tolypeutinae and Euphactinae within the family Dasypodidae. They had generated the fol-lowing tree: (((Bradypus, Choloepus)100, ((Myrmecophaga, Tamandua)100, Cyclopes)100), ((D. kappleri, D. novemcinctus)100, (Tolypeutes, (Priodontes, Cabassous)54)100, (Zaedyus, (Euphractus, Chaetophractus)60)100)). Gaudin (2005) presented a work that reviewed and extended the morphological data available, concluding that the extant armadillos are divided in two groups, a basal group (Dasypodinae) and another more derivative (Euphractinae), in accordance with the following arrangement: (Bradypus, Tamandua), (Dasy-pus, (Priodontes, (Cabassous, (Tolypeutes, (Euphractus, Chaetophractus, (Za-edyus, Ch/amyphorus)42)36)72)72)40)85). In the work described in this dis-sertation, we sequenced part of the 16S rRNA mitochondrial gene from 12 extant taxa of Xenarthra to perform phylogeny analysis based on maximum-likelihood. Our results are presented analysing the 16S gene data alone, an concatenated with the dataset of Delsuc et al. (2003): (Bradypus, (Choloe-pus, ((Cyclopes, (Myrmecophaga, Tamandua)100)100, (Dasypus, (((Cabas-sous, Priodontes)68, Tolypeutes)100,((Chaetophractus, Euphractus)65, Za-edyus)100)100)100)100)100). Results were similar to those of previous stu-dies. However, an improvement in bootstrap values of certain branches could be noticed. We believe that Transposable Elements (UNES) are the molecular markers more adjusted to confirm uncertain arrangements sugges-ted by phylogenetic analyses mitocondrials and nuclear genes.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-09-05T15:05:59Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_OntogeniaDimorfismoSexual.pdf: 7440062 bytes, checksum: 1aeaec6dc5adea2c96d56bf2191bf2d3 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-09-12T12:35:05Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_OntogeniaDimorfismoSexual.pdf: 7440062 bytes, checksum: 1aeaec6dc5adea2c96d56bf2191bf2d3 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-12T12:35:05Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_OntogeniaDimorfismoSexual.pdf: 7440062 bytes, checksum: 1aeaec6dc5adea2c96d56bf2191bf2d3 (MD5) Previous issue date: 2007 / O dimorfismo sexual nas espécies de guaribas é bem conhecido em animais adultos. Sabe-se que em todas as espécies do gênero Alouatta os machos são consideravelmente maiores e mais pesados que as fêmeas. Entretanto, o dimorfismo sexual não é homogêneo em todas as espécies de guaribas, e A. seniculus é considerada a espécie mais dimórfica do gênero. Além disso, muito pouco se sabe a respeito da ontogenia do dimorfismo sexual nestas espécies. O propósito deste trabalho foi avaliar a ontogenia do dimorfismo sexual em cinco espécies de guaribas intimamente relacionadas: Alouatta seniculus, A. juara, A. macconnelli, A. puruensis e A. nigerrima, e estabelecer um método para a identificação de classes etárias mais precisas nestes animais. Foram mensuradas 25 variáveis cranianas e três do osso hióide de 329 espécimes, e foi examinada a coloração da pelagem de 192 indivíduos de todas as idades, para análises com enfoque ontogenético. Teste t de Student foi aplicado para a verificação de dimorfismo sexual nas classes etárias, e Análise da Função Discriminante (AFD) foi empregada para se observar a significância dos agrupamentos etários em relação às variáveis craniométricas. ANOVA, seguida do Teste de Tukey para comparação múltipla entre médias, foram aplicados para a verificação de crescimento das medidas cranianas dos adultos de A. macconnelli. O reconhecimento de cinco classes etárias entre os adultos foi feito através da avaliação do desgaste oclusal e do grau de fechamento das suturas cranianas. Embora reconhecíveis pelas características de desgaste oclusal e soldadura das suturas, não foi possível a distinção das classes etárias de adultos através de variáveis cranianas. Em todas as AFDs aplicadas aos conjuntos de adultos, as equações resultantes não demonstraram significância estatística. Nenhuma classe etária anterior à idade adulta apresentou dimorfismo sexual nas dimensões cranianas, e características sexualmente dimórficas só foram percebidas a partir da idade AD1. A espécie com maior grau de dimorfismo sexual foi A. macconnelli, e as características sexualmente dimórficas do crânio aparecem de forma mais precoce nesta espécie. Em comparação com A. macconnelli, A. nigerrima possui um número consideravelmente menor de variáveis sexualmente dimórficas na fase adulta. Isso pode sugerir diferenças no comportamento social desta espécie, já que o dimorfismo sexual é influenciado em grande parte pela competição entre os machos pelo acesso aos recursos e à cópula. A variável com maior índice de dimorfismo sexual foi o comprimento do canino, que nas fêmeas equivale a cerca de 60% do comprimento do canino dos machos. O dimorfismo sexual é intenso nas variáveis da região da face e do aparato mastigatório, enquanto que nas estruturas associadas ao neurocrânio essa diferença praticamente não existe, o que mostra que as pressões por dimensões maiores nos machos não afetam a região neural do crânio. Em A. macconnelli, há evidências de crescimento em dimensões cranianas depois de alcançada a fase adulta. Esse fato foi observado em sete variáveis das fêmeas e cinco variáveis dos machos. Isso pode ter conseqüências em estudos sistemáticos e populacionais que, por exemplo, utilizem amostras com crânios de diferentes classes de adultos. As diferenças ontogenéticas na coloração da pelagem são muito sutis, e normalmente estão relacionadas a processos de despigmentação em campos cromatogênicos específicos, apesar de haver muita variação do padrão mais freqüente. Essas variações têm, na maioria dos casos, origem individual. As alterações ontogenéticas na forma do crânio são mais intensas nos machos que nas fêmeas, e dão ao crânio dos machos um aspecto proporcionalmente mais estreito no sentido láterolateral, e mais achatado em sua altura. Os problemas de amostragem existentes foram agravados pelo procedimento de estratificação das amostras em classes sexuais e etárias, havendo prejuízo nas análises de várias classes etárias. / Sexual dimorphism in red howlers is relatively well documented for adult specimens and in all species of the genus Alouatta adult males are larger than females. However, sexual dimorphism among these species is not homogeneous and A. seniculus is considered the more dimorphic species. Moreover, sexual dimorphism among non adult ages is poorly known. The aim of this work is to evaluate the ontogeny of sexual dimorphism in five closely related species of howler monkeys: Alouatta seniculus, A. juara, A. macconnelli, A. puruensis, and A. nigerrima, and establish a method for identification of more accurate age classes in these taxa. A total of 28 cranial and hyoidean dimensions were extracted from 329 crania, and pelage color of 192 skins was examined. Sexual dimorphism in each age class was verified using Student’s t Test, and Discriminant Function Analysis (DFA) was employed to verify the consistence of the age groups. Analysis of Variance (ANOVA), followed by Tukey’s pairwise comparisons test, was applied to analyze growth in some adult cranial dimensions in A. macconnelli. Five adult age classes were recognized through the evaluation of oclusal wear and cranial suture closure; however, these classes were not recognized by cranial dimensions only. Non adult age classes did not exhibit sexually dimorphic measurements on cranium, and sexually dimorphic characters appeared at the first adult age class. A. macconnelli was the more dimorphic species, and sexually dimorphic characters arose earlier in this species. In contrast, A. nigerrima exhibited a smaller number of sexual dimorphic characters, suggesting that differences in behavior of this species play an important role on dimorphism development. Among all cranial dimensions, the canine length was the most sexually dimorphic. In females, this dimension ranged about 60% of that in males. The sexual dimorphism was not evident in the neurocranium. In A. macconnelli, seven cranial dimensions in females and five in males exhibited variation among the adult age classes. Ontogenetic differences in pelage color were very subtle and refer to bleaching of chromatic fields in different degrees. Ontogenetic modifications on the cranium are more intense in males than females, leading to a narrower and more flattened cranium in adult specimens of the former. Some age classes could not be tested for some species due to the inadequate number of specimens in the collections analyzed.

Giardia e Cryptosporidium são protozoários cosmopolitas cuja epidemiologia é especialmente importante devido ao seu expressivo potencial zoonótico. Animais silvestres são frequentemente relatados como reservatórios da giardiose e criptosporidiose humanas, todavia, são escassas as evidências sobre sua real importância na manutenção e disseminação destas protozooses. No intuito de avaliar a ocorrência e determinar os genótipos responsáveis pela infecção de mamíferos neotropicais, 452 amostras fecais procedentes de 52 diferentes espécies, in situ e ex situ, de sete localidades distintas foram avaliadas por métodos de diagnóstico microscópico, seguidos por técnicas moleculares de amplificação (Nested PCR), sequenciamento e caracterização genotípica. Os resultados revelaram prevalência aparente de 6,2% para Giardia spp. e de 4,8% para Cryptosporidium spp. (n=343). Dezessete diferentes espécies de mamíferos silvestres foram positivas, sendo 11 para Giardia spp., nove para Cryptosporidium spp. e três para ambos os protozoários. A caracterização molecular revelou a predominante presença de genótipos zoonóticos em mamíferos cativos (Giardia duodenalis genótipo AI) e de genótipos hospedeiro-específicos em animais de vida livre (Cryptosporidium sp. rat genotype III e Cryptosporidium wrairi). Foram também identificados Giardia duodenalis genótipo D em cachorro-do-mato Cerdocyon thous e Cryptosporidium sp. deer mouse genotype IV em bugio-preto Alouatta caraya, ambos mantidos em cativeiro. Aspectos ecológicos, como habitat, guilda trófica, estratégia do uso do ambiente e influência antrópica, foram considerados relevantes para a ocorrência dos parasitas. Tais achados demonstraram que animais silvestres podem ser infectados por genótipos zoonóticos e específicos dos agentes, o que revela a importância de estudos envolvendo esta abordagem para sugerir possíveis relações entre os protozoários, hospedeiros humanos, animais domésticos e silvestres perante diferentes características ambientais. / Giardia and Cryptosporidium are cosmopolitan protozoans whose epidemiology is especially important due to its significant zoonotic potencial. Wild animals are often reported as reservoirs of human giardiosis and cryptosporidiosis, however, there is little evidence about their real importance in the maintenance and dissemination of these protozoosis. In order to evaluate the occurrence and determine the genotypes responsible for neotropical mammals infection, 452 fecal samples of 52 different species, in situ and ex situ, of seven locations were evaluated by microscopic methods of diagnosis, followed by molecular amplification (Nested PCR), sequencing and genotypic chacacterization techniques. The results revealed an apparent prevalence of 6,2% for Giardia spp. and 4,8% for Cryptosporidium spp. (n=343). Seventeen different species of wild mammals were positive, 11 for Giardia spp., nine for Cryptosporidium spp. and three for both protozoans. Molecular characterization shows predominant presence of zoonotic genotypes in captive mammals (Giardia duodenalis genotype AI) and host-specific genotypes in free-living animals (Cryptosporidium sp. rat genotype III and Cryptosporidium wrairi). Giardia duodenalis genotype D in crab-eating fox Cerdocyon thous and Cryptosporidium sp. deer mouse genotype IV in black howler monkey Alouatta caraya, both in captivity, were also identified. Ecological aspects, like habitat, trophic guilds, strategy of using the environment and human influence, were considered relevant to occurrence of the parasites. These findings could demonstrate wild mammals can be infected by zoonotic and specific genotypes of agents, which shows the importance of studies using this approach to suggest possible relationships between protozoans, human hosts, domestic animals and wildlife facing different environmental characteristics.

Áreas protegidas são consensualmente reconhecidas como a principal estratégia para a conservação da biodiversidade. Avaliar a efetividade destas áreas, especialmente em biomas como a Mata Atlântica onde as áreas protegidas são como ilhas de floresta em paisagens altamente alteradas pelo homem, é de suma importância. O Parque Nacional do Iguaçu (PNI) abriga um dos maiores remanescentes de Mata Atlântica do Brasil, possui alta visitação turística, assenta-se sobre solos férteis, sofrendo muitas pressões advindas das paisagens antropizadas adjacentes, e é considerado um dos parques mais bem geridos no país. Este trabalho buscou avaliar a efetividade desta área protegida através da análise do padrão de ocupação de 17 espécies de mamíferos terrestres de maior porte em relação à proximidade a atrativos turísticos, distância da borda do parque e pressão de caça. Informações sobre ocupação foram obtidas entre 2009 e 2013 através de armadilhas fotográficas distribuídas sistematicamente em 37 sítios amostrais em cerca de 300 km2, um sexto da área do parque. Muitas espécies raras ou localmente extintas em outros remanescentes de Mata Atlântica apresentaram altas taxas de ocupação no PNI, que juntamente com poucas áreas protegidas do sudeste do Brasil representam as únicas áreas do bioma que ainda abrigam uma fauna de grandes mamíferos intacta. No entanto, a distribuição de 11 das 17 espécies analisadas não foi homogênea, tendo sido afetada por pelo menos um dos fatores de ameaça estudados, principalmente a distância da borda do parque e proximidade a atrativos turísticos. O efeito negativo destas ameaças deve ser ainda mais forte em áreas protegidas menores e mais isoladas, que representam a maioria em biomas muito alterados como a Mata Atlântica. Medidas como o restabelecimento e manejo de zonas tampão, a manutenção de atrativos turísticos em áreas restritas, o combate efetivo das atividades ilícitas e a redução de conflitos entre animais silvestres e o homem, são fundamentais para a efetividade de áreas protegidas para conservação da biodiversidade no longo prazo / Protected areas are widely recognized as the main strategy for biodiversity conservation. Evaluating the effectiveness of these areas, especially in biomes such as the Atlantic Forest where protected areas are forest islands immersed in highly altered landscapes, is of paramount importance. The Iguaçu National Park (INP) harbors one of the largest Atlantic Forest remnants in Brazil, receives vast number of tourists, is located on productive soils, suffering many threats from the adjacent human-modified landscapes, and is considered one of the best managed parks in the country. This study aimed at evaluating the effectiveness of this protected area through the analysis of the occupancy patterns of 17 terrestrial large mammals relative to the proximity to tourism attractions, distance from the edge of the park and hunting pressure. Occupancy information was obtained from 2009 to 2013 with camera traps distributed systematically across 37 sites covering around 300 km2, one-sixth of the park. Many species that are rare or locally extinct in other Atlantic Forest remnants presented high occupancy within the INP, which together with few protected areas from southeastern Brazil represent the only areas of this biome that still harbor an intact large mammal fauna. The distribution of 11 of the 17 analyzed species was not homogeneous across the park, however, being affected by at least one of the studied threat factors, mainly the distance from the edge of the park and proximity to tourism attractions. The negative effects of these threats should be even stronger on smaller and more isolated protected areas, which are the majority in highly altered biomes such as the Atlantic Forest. Measures such as the re-establish and management of buffer zones, the maintenance of tourism in restricted areas, the effective combat of illicit activities and the reduction of human-wildlife conflicts are essential to the effectiveness of protected areas for biodiversity conservation in the long run