Orientador: Wesley Rodrigues Silva / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-22T17:36:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Baumgarten_LeandroClaudio_D.pdf: 2505570 bytes, checksum: 605fa921efad6929c5d1ccf17fe35faa (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: Aves de rapina são pouco estudadas no Brasil e existem poucas informações sobre os padrões de dinâmica populacional das espécies que ocorrem no país, assim como os fatores que os influenciam. Com o objetivo de caracterizar a dinâmica populacional de rapineiros e como ela é influenciada pela abundância de presas, foi realizado um acompanhamento de 36 meses das populações de aves de rapina e pequenos mamíferos no Parque Nacional das Emas (Mineiros-GO). Além disto, foram coletadas informações sobre os padrões de atividade das presas para caracterizar mais claramente sua disponibilidade para predadores. A amostragem das presas foi realizada em nove estações de captura, cada uma com 24 armadilhas "pitfall" e a abundância de rapineiros foi a avaliada por censo de carro. Foram realizadas 12 coletas de dados com intervalos de dois meses entre si. Não foi verificada variação de abundância em nenhuma das espécies de aves de rapina entre anos, ao longo do estudo, no entanto a maioria delas apresentou grandes flutuações sazonais. Os dados obtidos sugerem que estas variações foram causadas principalmente pela movimentação das aves para dentro e fora da reserva. Para os pequenos mamíferos não foi encontrada variação sazonal significativa, mas durante 2001 foi registrado um grande aumento na abundância das três espécies mais comuns. A espécie de roedor mais abundante, Bolomys lasiurus, apresentou dinâmicas diferenciadas entre algumas estações de captura. Apesar da considerável variação de abundância das presas não foi detectada uma resposta numérica das aves de rapina no PARNA das Emas ao longo dos três anos de estudo. A comparação deste estudo com outros disponíveis na literatura, sugere que amostragens feitas em áreas mais extensas teriam dificuldade em detectar respostas predatórias, porque não seriam capazes de discriminar pequenas concentrações locais das aves de rapina causadas por aumentos pontuais de disponibilidade de presas / Abstract: Birds of prey are poorly studied in Brazil, and there is few information on patterns of population dynamics of species occurring in the country, as well as factor influencing them. We sample bird of prey and small mammals populations for 36 months aiming to describe raptor population dynamics and how it is influenced by prey abundance in Emas National Park (Mineiros - GO). Furthermore, we collect data on prey daily activity patterns to evaluate their availability for predators. Prey monitoring was performed in nine trapping sites, each one with 24 pitfall traps, raptor sampling was evaluated using car census. We did 12 one-month fieldtrips with two months apart. We did not detected abundance variation among years for any raptor species, although most of them showed seasonal fluctuations. Data gathered suggests these population changes were caused mostly by movements to and from the reserve. We did not find any seasonal fluctuations of small mammals, but we record a major increase of abundance for three of the commonest species. The most abundant species, Bolomys lasiurus, showed different population dynamics among trapping sites. We did no detected numerical response of birds of prey in Emas National Park along this three-year sampling. We compare these data with other studies available, and we suggest that sampling performed in larger areas would hardly detect predatory responses, because it would not be able to discern small local concentrations of raptors caused by increase in prey availability / Doutorado / Ecologia / Doutor em Biologia

Os eritrócitos dos mamíferos são anucleados e desprovidos de organelas citoplasmáticas, contando somente com o ciclo da glicólise, o ciclo das pentoses e algumas enzimas anexas, o que garante o fornecimento de energia calórica sob a forma de adenosina-5\'-trifosfato (ATP) e de energia redutora sob a forma de nicotinamida adenosina dinucleotídeo reduzida (NADH), nicotinamida adenosina dinucleotídeo fosfato reduzida (NADPH) e glutationa reduzida (GSH). A via glicolítica possui o desvio denominado de ciclo de Rapaport-Luebering, onde há a síntese de 2,3- difosfoglicerato (2,3-DPG), que é um importante metabólito e atua como modulador da afinidade da hemoglobina ao O2. Havendo poucos estudos comparativos sobre o metabolismo eritrócitário dos mamíferos propôs-se investigar as atividades das enzimas glicolíticas, anexas (2,3-difosfogliceratomutase, glicose-6-fosfato desidrogenase e 6-fosfogliconato desidrogenase) e a concentração dos compostos intermediários adenosina-5\' -trifosfato e 2,3-difosfoglicerato. Mamíferos das ordens Primates, Rodentia, Camivora, Lagomorpha, Artiodactyla, Didelphimorphia e Xenarthra oriundos da Fundação Parque Zoológico de São Paulo e Centro de Bioterismo da Faculdade de Medicina da USP foram investigados. O sangue foi colhido em ACD, os eritrócitos foram lavados em solução fisiológica a 4°C e hemolisados em solução hemolisante 1:20 por congelamento e descongelamento e as atividades das seguintes enzimas foram determinadas de acordo com Beutler (Red Cell Metabolism, a Manual of Biochemical Methods, Ed. Grune & Stratton, 3rd ed, 1984): hexoquinase, glicose fosfato isomerase , fosfofrutoquinase, aldolase, triose fosfato isomerase, gliceraldeído 3-fosfato desidrogenase, fosfoglicerato quinase, monofosfogliceromutase, enolase, piruvato quinase, lactato desidrogenase, bem como a 2,3-difosfoglicerato mutase, glicose-6-fosfato desidrogenase, 6-fosfogluconato desidrogenase, os metabólitos intermediários 2,3-difosfoglicerato e adenosina-5\'-trifosfato. As enzimas e os compostos intermediários estudados apresentaram grande variabilidade entre as espécies de mamíferos estudadas. Foi observada correlação positiva entre a atividade da triose fosfato isomerase e a 2,3-difosfoglicerato mutase e os teores de adenosina-5\'-trifosfato das espécies, bem como correlação positiva entre a 2,3-difosfoglicerato mutase em relação ao 2,3-difosfoglicerato. Os teores de adenosina-5\'-trifosfato mantiveram-se dentro de um patamar estável, ao redor de 4.000 a 6.000 nmoles / gHb, com as exceções das espécies das ordens Carnivora (Panthera leo, Leopardus pardalis, Canis lupus and Chrysocyon brachyurus) e Artiodactyla (Cervus elaphus), que exibiram teores ao redor de 2.000 a 3.000 nmoles / g Hb. Já os valores da concentração de 2,3-difosfoglicerato apresentaram variação considerável entre as espécies e ordens estudadas. / Mammalia red cells are non-nucleated and do not have cytoplasm organeles as well, and present the glycolytc pathway, the pentose shunt to attend the requirements in caloric energy as adenosine-5-triphosphate (ATP) and reducing power as reduced nicotinamide adenosine dinucleotide (NADH) and reduced nicotinamide adenosine dinucleotide phosphate (NADPH) and reduced glutathione (GSH). The glycolytic pathway exhibit besides the Luebering-Rappaport shunt, in which the 2,3-diphosphoglycerate is formed, which regulates the hemoglobin affinity to the molecular oxygen. As there are not so many studies on comparative about mammalian red cell metabolism, it was decided to study the glycolytic enzyme activities, the glucose-6-phosphate dehydrogenase, 6-phosphogluconate dehydrogenase, 2,3-diphosphoglycerate mutase and the metabolites adenosine-5-triphosphate and 2,3-diphosphoglycerate (2,3-DPG). Mammalia representatives from Primates, Rodentia, Carnívora, Lagomorpha, Artyodactyla, Didelphimorphia and Xenarthra orders, obtained from Fundação Parque Zoológico de São Paulo and Centro de Bioterismo da Faculdade de Medicina da USP, were studied. The blood was collected in ACD, the red cells were washed in saline at 4° C, lysed 1:20 in hemolysing solution by freeze-and-thaw, and the following enzymes were assayed according to Beutler (Red Cell Metabolism, a Manual of Biochemical Methods, Ed. Grune & Stratton, 3rd ed, 1984): hexokinase, glucose-6-phosphate isomerase, phosphofructo kinase, aldolase, triose phosphate isomerase, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, phosphoglycerate kinase, monophosphoglycerate mutase, enolase, pyruvate kinase, lactate dehydrogenase activities, as well as 2,3-diphosphoglycerate mutase, glucose-6-phosphate dehydrogenase, 6-phosphogluconate dehydrogenase activities, and adenosine-5-triphosphate, 2,3-diphophoglycerate concentrations. A remarkable variation among the studied species was observed. However, it was detected a significant positive correlation between the adenosine-5-triphosphate concentrations and triosephosphate isomerase and 2,3-diphosphoglycerate mutase activities, as well as significant positive correlation between 2,3-diphosphoglycerate concentration and 2,3-diphosphoglycerate mutase activity in all studied species as a whole. Most of studied species exhibited a steady ATP concentration range between 4,000 and 6,000 nmoles.g Hb -1 but the Artiodactyla (Cervus elaphus) and Carnivora (Panthera leo, Leopardus pardalis, Canis Lupus and Chrysocyon brachyurus,) which presented values between 2,000 and 3,000 nmoles Hb - 1. However, the 2,3-DPG concentration showed remarkable variation among the studied species and orders.

Submitted by Israel Vieira Neto (israel.vieiraneto@ufpe.br) on 2015-03-04T16:45:08Z No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO Fernando Henrique de Souza Barbosa.pdf: 3570636 bytes, checksum: 22a36311386018779f2a52b651c6dabc (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-04T16:45:08Z (GMT). No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO Fernando Henrique de Souza Barbosa.pdf: 3570636 bytes, checksum: 22a36311386018779f2a52b651c6dabc (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013-07-29 / CNPq / Estudos paleopatológicos em fósseis influenciam dramaticamente inferências relacionadas à Paleobiologia, Tafonomia e Paleontologia Sistemática. Apesar de sua grande relevância, tais análises têm sido pouco exploradas. No Brasil tais estudos são escassos, destacando-se o registro de doenças em mamíferos pleistocênicos. Neste trabalho, feições paleopatológicas em ossos de mamíferos pleistocênicos procedentes das cavernas do Lajedo da Escada (Formação Jandaíra, Bacia Potiguar), município de Baraúna, Estado do Rio Grande do Norte são identificadas e interpretadas, bem como são diferenciadas de feições tafonômicas. Foram inspecionados macroscopicamente 422 espécimes, dos quais 18 foram submetidos a exame radiológico. Apenas 17 espécimes apresentaram feições paleopatológicas, a saber: (i) oito ossos de Glyptotherium sp., com feições relacionadas à osteoartrite; (ii) cinco espécimes com feições de osteomielite, sendo três de Eremotherium laurillardi, um de Pachyarmatherium brasiliense e um osso indeterminado; (iii) um espécime de E. laurillardi com osteocondrite dissecante; (iv) um elemento de Xenorhinotherium bahiense e outro de E. laurillardi apresentando sinais de necrose óssea inespecífica; e (v) uma falange de Toxodon sp. com sinais de periostite. A presença de neoformação, remodelagem e esclerose óssea permitiu diferenciar feições paleopatológicas de feições tafonômicas nos 17 espécimes, enquanto a forma e localização dessas feições permitiu atribuir uma causa, mesmo que não totalmente específica. Diversos espécimes apresentaram assinaturas tafonômicas (abrasão, corrosão, compactação, incrustação e fratura) que simulavam verdadeiras lesões patológicas (pseudopaleopatologias), cuja diferenciação foi realizada pela ausência de características tipicamente relacionadas a processos patológicos (neoformação, remodelagem e esclerose óssea).

Studies on vertical stratification of small mammals in the Cerrado biome are scarce and, therefore, this study has the aim to check the community composition of small mammals in relation to the vertical stratum utilization in gallery forest and cerradão of south-western Brazil. The captures were carried out during the months of August/September, November/December 2006 and February/March, May/June 2007. The traps were set in three transaction lines with 10 capture stations each one. Each station had a trap on the ground, other in the understory (2.0 to 3.0 m in height) and another in the canopy (8 to 10 m) in each environment, totalling 60 stations.. With an effort of 3600 traps-night 11 species of small mammals were captured, which were distributed differentially regarding the environments and the utilization of the vertical strata. Species presented habitat high segregation on physiognomies, only Rhipidomys macrurus presented in two environments. As for use of vertical strato for the Correspondence analysis Caluromys philander was the only notable in the canopy, Cryptonanus agricolai, Marmosa murina and, Oecomys bicolor were in the understory, and Gracilinanus agilis and Nectomys rattus were only sampled on the ground. In relation the faunistic and environments parameters formed two groups, where C agricolai and G. Agilis were associated to cerradão, dry season and number of tree and C. philander, M. Murina, N. rattus and O. bicolor were associated to gallery forest, stratification, number of branch and lianas. The Cerrado biome presents distinct fauna of small mammals associated with the two main forest physiognomies in it: gallery forest and cerradão. The utilization of traps in different strata increased the species richness, showing that they are distributed in different vertical strata of the forest, utilizing the complexity of the environment which enables them to coexist. / Estudos sobre estratificação vertical por pequenos mamíferos no Cerrado são escassos. Este estudo objetivou verificar a composição da comunidade de pequenos mamíferos em relação à utilização do estrato vertical em áreas de floresta de galeria e cerradão no sudoeste do Brasil. As capturas foram realizadas durante os meses de agosto/setembro, novembro/dezembro de 2006 e fevereiro/março, maio/junho de 2007. As armadilhas foram dispostas em três transecções com 10 estações de captura cada, sendo que cada estação compreendeu uma armadilhas no solo, uma no subbosque (2,0 a 3,0 m de altura) e uma no dossel (8 a 10 m) em cada ambiente, totalizando 60 estações de capturas. Com um esforço de 3600 armadilhas-noite foram capturadas 11 espécies de pequenos mamíferos, que estiveram distribuídas diferencialmente em relação aos ambientes e à utilização do estrato vertical. As espécies apresentaram forte segregação de hábitat, onde apenas Rhipidomys macrurus esteve presente nos dois ambientes. Quanto ao uso do estrato vertical, pela análise de Correspondência, Caluromys philander foi a única espécie que se destacou no dossel, Cryptonanus agricolai, Marmosa murina, e Oecomys bicolor, e se destacaram no sub-bosque, e Gracilinanus agilis e Nectomys rattus se destacaram ao nível do solo. Em ralação aos parâmetros faunísticos e ambientais formaram-se dois grupos , onde C. agricolai e G. agilis estiveram associados ao cerradão, estação seca e número de árvores e C. philander, M. murina, N. rattus e O. bicolor estiveram associados a floresta de galeria, estratificação, número de ramos e número de lianas. O bioma Cerrado apresenta distintas faunas de pequenos mamíferos associadas às duas formações florestais: floresta de galeria e o cerradão. A utilização de armadilhas em diferentes estratos aumenta a riqueza de pequenos mamíferos, mostrando que as espécies estão distribuídas em diferentes camadas verticais da floresta, utilizando a complexidade do ambiente o que possibilita a coexistência de um número maior de espécies.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The objective of this study was to analyze the influence of climatic and physiographic variables in the geographic distribution of non-flying mammals in a central region of South America. To examine the relationships among areas and endemism of mammals, a priori analysis considering ecoregions and a posteriori analysis based on relationships of 110x110- km squares were performed. Data from non-flying mammals were collected from museums, literature and field observations were considered. Based on that, the occurrence of each species was determined in a grid containing 90 cells, where each square had 1° of latitude and 1° of longitude (110 km x 110 km). Cluster analysis and parsimony analysis of endemicity (PAE) were used to examine the relationships between ecoregions and squares. More than 1500 records were considered and classified in nine orders, 26 families, 86 genus and 139 species of non-flying mammals. Cluster analysis demonstrated four distinguished groups. Classifications based on ecoregions resulted in two main groups of ecoregions, the Eastern and the Western group. Classifications based on cells resulted in the formation of two main groups of ecoregions, the Northern and Southern groups. The richness of mammal species in a central region of South America is under influence of several variables and the geographical distribution of these species was related more with some variables than others. Temperature and topography were the environmental variables that most influenced the mammal species distribution patterns. / Com o objetivo de esclarecer lacunas existentes nos estudos de distribuição geográfica de mamíferos da América do Sul, variáveis climáticas e fisiográficas foram utilizadas para verificar se possuem relação com a riqueza de mamíferos não voadores da região; analisou-se a priori o relacionamento entre a fauna de mamíferos não voadores através do estabelecimento de ecorregiões e analisou-se a posteriori o relacionamento entre a fauna de mamíferos através do estabelecimento de quadrículas (110x110 km), visando confirmar, ou não, as ecorregiões anteriormente estabelecidas. A coleta de dados foi realizada de três maneiras: dados de museus, revisão bibliográfica e coletas a campo, nas quais apenas os mamíferos não voadores foram catalogados. Com base nos registros originais, os pontos de ocorrência de cada espécie foram mapeados com resolução espacial de uma célula de 1º de latitude por 1º de longitude (≈110 km x 110 km), usando como base uma grade com 90 quadrículas. Análises de agrupamento e de parcimônia de endemismos (PAE) foram utilizadas para verificar o relacionamento entre ecorregiões e quadrículas. No total, foram catalogados mais de 1500 registros válidos da mastofauna na região estudada, divididos em nove ordens, 26 famílias, 86 gêneros e 139 espécies de mamíferos. Sete ecorregiões foram estabelecidas previamente resultando na formação de quatro grupos. Para a classificação agrupando ecorregiões, houve a formação de dois grandes grupos, o grupo Leste e o grupo Oeste, mas para a classificação agrupando quadrículas houve a formação de outros dois grandes grupos, o grupo Norte e o grupo Sul. A distribuição da riqueza de mamíferos na região central da América do Sul está sob a influência de diversas variáveis e a distribuição geográfica das espécies está correlacionada mais fortemente com algumas variáveis do que outras. As variáveis ambientais que mais mostraram influência no padrão de distribuição das espécies de mamíferos foram aquelas relacionadas à temperatura e à topografia.

Human activities have being responsible for the global environmental changes, resulting in an increase number of incident of vector- and rodent-borne diseases worldwide. Rodents and arthropods-borne viruses are important globally emerging and re-emerging viruses and most of them are RNA viruses. Efficient and early diagnosis of these infections are very important to prevent their spread, to improve clinical management of the patients, as wells to protect livestock and domestic animals. Currently, available diagnostic methods such as immunoassays, polymerase chain reaction and virus isolation can detect only one or few viruses in a single assay. The DNA microarray platform has emerged as diagnostic tool suitable for high throughput screening of pathogenic agents. The aim of this study was to develop a DNA microarray platform (RoboArboVirusChip) for detecting rodent- and arthropod-borne viruses, which belong to seven families: Bunyaviridae (genera Orthobunyavirus, Nairovirus and Phlebovirus), Flaviviridae (genus Flavivirus), Togaviridae (genus Alphavirus), Reoviridae (genera Orbivirus, Seadornavirus and Coltvivirus), Rhabdoviridae (genera Vesiculovirus and Ephemerovirus), and Asfarviridae (genus Asfarvirus). Specific oligonucleotide probes of 60-mer (n=4209) targeting 412 virus species and generic probes of 25-35-mer (n=87) targeting viruses at the genus level were designed. A total of 17 reference viruses belonging to the Bunyaviridae, Flaviviridae, Rhabdoviridae and Togaviridae families were used to standardize RoboArboVirusChip. All reference viruses were specifically detected without any cross hybridization; however, the generic probes were not able to identify the viruses at the genus level. The RoboArboVirusChip was able to specifically identify four viruses contained in three different mixtures: i) virus of different families, ii) virus of the Flavivirus genus, and iii) the Dengue virus (DENV) serotypes. The four DENV serotypes were use to evaluate the sensitivity of the RoboArboVirusChip, which was able to detect a minimum of 25 RNA copies/mL of the viruses, confirming its high sensitivity. The applicability of the RoboArboVirusChip to detect viruses in clinical samples was tested with serum samples obtained from dengue suspected cases (four positive cases and 40 negative cases). DENV was detected in the four positive serum samples, while in the 40 negative serum samples, it was not detected any virus. The results obtained in this study suggest that the RoboArboVirusChip platform could be a useful tool for early diagnosis of robovirus and arbovirus infections during epidemic outbreaks, helping in the rapid implementation of disease containment strategies / As atividades humanas têm sido responsável por mudanças ambientais globais, resultando num aumento do número de casos de doenças transmitidas por vetores e roedores em todo o mundo. Os vírus transmitidos por roedores e artrópodes são vírus emergentes e re-emergentes de importância global, sendo que a maioria deles são vírus de RNA. O diagnóstico eficiente e precoce dessas infecções são muito importantes para evitar a sua propagação, para melhorar o manejo clínico dos pacientes e também, para proteger o gado e os animais domésticos. Atualmente, os métodos de diagnóstico disponíveis, tais como os imunoensaios, a reação em cadeia da polimerase e o isolamento viral podem detectar apenas um ou poucos vírus em um único ensaio. A plataforma de microarranjo de DNA tem surgido como uma ferramenta de diagnóstico apropriada para o monitoramento em larga escala de agentes patogênicos. O objetivo deste estudo foi desenvolver uma plataforma de microarranjo de DNA (RoboArboVirusChip) para a detecção de vírus transmitidos por roedores e artrópodes, os quais pertencem a sete famílias: Bunyaviridae (gêneros Orthobunyavirus, Nairovirus e Phlebovírus), Flaviviridae (gênero Flavivirus), Togaviridae (gênero Alphavirus), Reoviridae (gênero Orbivirus, Seadornavirus e Coltvivirus), Rhabdoviridae (géneros Vesiculovirus e Ephemerovirus), e Asfarviridae (gênero Asfarvirus). Sondas oligonucleotídicas de 60-mer (n=4209) específicas contra 412 espécies virais, e sondas genéricas de 25-35-mer (n=87) para detecção de vírus a nível do gênero foram desenhados. Um total de 17 vírus de referência, pertencentes às famílias Bunyaviridae, Flaviviridae, Rhabdoviridae e Togaviridae foram utilizados para padronizar o RoboArboVirusChip. Todos os vírus de referência foram detectados especificamente sem apresentação de hibridação cruzada, porem as sondas genéricas não foram capazes de detectar os vírus a nível do gênero. O RoboArboVirusChip foi capaz de identificar especificamente quatro vírus contidos em diferentes misturas: i) vírus de diferentes famílias, ii) vírus pertencentes ao gênero a Flavivirus, e iii) os sorotipos do vírus da dengue (DENV). Os quatro sorotipos do DENV foram utilizados para determinar a sensibilidade do RoboArboVirusChip, o qual foi capaz de detectar um mínimo de 25 copias de RNA/mL. A aplicabilidade do RoboArboVirusChip para detectar vírus em amostras clínicas foi avaliada testando amostras de soro de pacientes com suspeita de dengue (quatro casos positivos e 40 casos negativos). Os resultados obtidos neste estudo sugerem que o RoboArboVirusChip poderá ser uma ferramenta útil para o diagnóstico precoce da infecção causada por robovírus e arbovírus, auxiliando na rápida implementação de estratégias de contenção das doenças causadas por esses vírus

Orientador: Eleonore Zulnara Freire Setz / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-26T19:20:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sakane_KarinaKoibuchi_M.pdf: 3375558 bytes, checksum: b467da20c9db67f87557bc52b120d3bb (MD5) Previous issue date: 2015 / Resumo: A distribuição de espécies pode ser influenciada por diversos fatores. Pequenos mamíferos são bons modelos para estudos de distribuição e uso de espaço. São abundantes, de fácil captura, utilizam o espaço de diferentes formas e apresentam hábitos alimentares diversos. Realizamos o presente estudo na Reserva Biológica da Serra do Japi, Jundiaí-SP e tivemos como principais objetivos: (I) Investigar a riqueza de espécies presente na área e realizar um resumo da ecologia e história natural de cada espécie capturada (II) Analisar, ao longo de um gradiente altitudinal, a influência de diferentes fatores (temperatura, disponibilidade de alimentos, cobertura de solo, obstrução de dossel e obstrução vertical) na riqueza e abundância de espécies (III) Investigar a influência dos mesmos fatores citados anteriormente na composição de espécies. Na Reserva Biológica da Serra do Japi foram capturadas 11 espécies: Akodon sp., Oligoryzomys nigripes, Brucepattersonius sp., Delomys sublineatus, Thaptomys nigrita, Juliomys pictipes, Blarinomys breviceps, Didelphis aurita, Monodelphis scalops, Gracilinanus microtarsus e Monodelphis sp.n. A Reserva apresenta espécies que atuam como bons indicadores de qualidade ambiental e espécies endêmicas da Mata Atlântica, reforçando a sua importância na conservação. A riqueza foi significativamente maior na altitude intermediária. A única variável que apresentou influência significativa na riqueza, abundância e composição de espécies foi a cobertura por galhos caídos e arbustos de até 1 m (cobertura do solo). A maior porcentagem de cobertura do solo aumenta número de abrigos disponíveis, permitindo maior diferenciação de nicho e coexistência de diferentes espécies. Galhos caídos e arbustos ainda podem estar relacionados à redução de efeitos da competição e da predação / Abstract: Many factors can influence the distribution of species. Small mammals are good models for studies of distribution and use of space. They are abundant, easy to capture, use space differently and have different types of diets. This study was conducted in the Biological Reserve of Serra do Japi, Jundiaí-SP and had as aims: (I) Investigate the richness and get a summary of the ecology and natural history of each species of Reserve (II) research the influence of different factors (temperature, food availability, ground cover, canopy and vertical obstruction) in richness and abundance of species along a altitudinal gradient (III) Investigate the influence of the same factors mentioned before in the composition of small mammals. We found 11 species: Akodon sp., Oligoryzomys nigripes, Brucepattersonius sp., Delomys sublineatus, Thaptomys nigrita, Juliomys pictipes, Blarinomys breviceps, Didelphis aurita, Monodelphis scalops, Gracilinanus microtarsus and Monodelphis sp.n. The Biological Reserve of Serra do Japi has species that act as good indicators of environmental quality and also has endemic species of the Atlantic Forest. The richness was significantly higher the intermediate altitude. The only variable that showed significant influence on richness, abundance and species composition was fallen twigs and branches up to 1 m (ground cover). The highest percentage of ground cover increases the available resources, allowing niche differentiation and coexistence of different species. Fallen twigs and branches can also be related to decrease the effects of competition and predation / Mestrado / Ecologia / Mestra em Ecologia

Orientadores: Wesley Rodrigues Silva, Natália Oliveira Leiner / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-27T03:01:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Castilho_CamilaPaulade_D.pdf: 4563279 bytes, checksum: 6f49e6d8d2326c3a15fd1ae26700259c (MD5) Previous issue date: 2015 / Resumo: A ecologia da restauração tem como principal objetivo a recuperação de ambientes degradados visando à criação de ambientes autossustentáveis. Dessa maneira, diferentes são os modelos de restauração adotados, mas poucos são os trabalhos que avaliam a resposta da comunidade de fauna em relação a essas restaurações. Este estudo tem como objetivo avaliar a resposta da comunidade de mamíferos terrestres em relação aos tratamentos de restauração presentes na fazenda Intermontes (337ha), na cidade de Ribeirão Grande, SP. Foram avaliadas a riqueza, a abundância e a composição da comunidade de pequenos, médios e grandes mamíferos em um mosaico de restauração em Mata Atlântica, incluindo áreas de pasto com regeneração arbórea e ou arbustiva na qual o plantio de restauração foi implantado, áreas de pasto com plantio, área de regeneração natural e remanescentes florestais. Tendo em vista o modelo "trait-filter", procuramos evidenciar como alguns descritores ambientais influenciaram a ocorrência das espécies, considerando como filtros a estrutura da vegetação e a disponibilidade de alimentos (frutos, artrópodes e pequenos e médios mamíferos de acordo com a espécie avaliada). Tanto para a assembleia de pequenos mamíferos, quanto médios e grandes, espécies generalistas predominaram na comunidade, ocorrendo nas diferentes unidades amostrais. Espécies especialistas foram menos abundantes e mais restritas em sua ocorrência. Para pequenos mamíferos, estas espécies estiveram restritas aos remanescentes florestais ou às unidades com maior complexidade de vegetação. Para médios e grandes mamíferos, espécies especialistas estiveram presentes em diferentes tratamentos, mas foram ocasionais. O papel dos descritores ambientais sobre cada espécie diferiu de acordo com suas necessidades ecológicas, revelando a sua importância para a ocorrência das diferentes espécies. Avaliar a resposta desta comunidade em função de medidas de restauração revelou a importância dos descritores ambientais que precisam estar presentes e ser mantidos para garantir a colonização e a permanência da comunidade de mamíferos terrestres / Abstract: Restoration ecology aims to recover degraded areas creating self-sustaining ecosystems. Different restoration techniques are being implemented nowadays but few studies are evaluating the response of the fauna community in relation to those restored areas. This study intended to evaluate the response of a terrestrial mammal community in a restored area located at Intermontes farm (337ha), in the city of Ribeirão Grande, SP. We investigate richness, abundance and composition of small, medium and large mammals in a restoration mosaic of Atlantic forest, including pasture areas with arboreal or arbustive regeneration where restoration where implemented, pasture areas with restoration, areas with natural regeneration and forest remnants. Once considering the trait-filter model, we intended to elucidate how habitat filters influenced species occurrence, considering vegetation complexity and food resources (fruits, arthropods, small and medium mammals depending on the species) as filters. To the small mammals assembly, as to the medium and large ones, generalist species predominated in the community, occurring in all different sample units. Specialized species were less abundant and were restricted in their occurrence. Small mammals were limited to the forest remnants or to those sample units with more complex vegetation. Specialist medium and large mammal species were present in different sample units, but were occasional. The habitat filter role for each species differed according to the ecological necessity of the species, revealing the importance of those aspects to species occurrence. The evaluation of the response of this mammal community to restoration showed that some habitat filters need to be present and maintained in order to guarantee the colonization and the permanence of terrestrial mammals / Doutorado / Ecologia / Doutora em Ecologia

A Mata Atlântica apresenta alto grau de endemismo e elevada riqueza de espécies. Ela encontra-se atualmente fragmentada, comprometendo a manutenção de sua biodiversidade. Visando a preservação deste ecossistema, o governo federal adotou uma política de criação de unidades de conservação, algumas delas habitadas por moradores tradicionais. A estação ecológica de Juréia Itatins, embora se caracterize por uma área de preservação permanente, possui em seu interior comunidades caiçaras. Estas comunidades apresentam uma dependência direta do meio ambiente em que estão inseridas, praticando atividades de subsistência como a pesca e a plantação de mandioca. Nesta pesquisa foram entrevistados moradores dos núcleos Rio Verde, Grajaúna e praia do Una, no período de julho de 2002 a fevereiro de 2003. As perguntas estavam relacionadas à atividade agrícola e ao manejo tradicional das roças assim como história natural, comportamento e ecologia de mamíferos silvestres, com o objetivo de se conhecer os saberes tradicionais relacionados à atividade agrícola. As informações obtidas através das entrevistas foram ordenadas em tabelas de cognição e comparadas com a literatura especializada. Também foram realizadas observações de campo com auxílio de armadilha fotográfica e moldes de pegadas. Constatou-se que todos entrevistados possuem grande conhecimento em relação a atividade agrícola e a mastofauna associada a esta atividade nesta área de Mata Atlântica, desenvolvendo formas tradicionais de manejo objetivando minimizar os impactos causados por estes animais às roças de mandioca. Os resultados contribuirão para a elaboração do plano de manejo da EEJI, confirmando a importância de se resgatar a cultura caiçara, buscando no seu modo de vida meios de utilização racional dos recursos naturais colaborando com a manutenção da biodiversidade local. / not available

A crescente importância do ciclo silvestre da raiva envolvendo morcegos e mamíferos terrestres demonstra a importância do estudo da epidemiologia do vírus da raiva nessas espécies. Foram estudadas amostras provenientes de diversas espécies de animais silvestres terrestres procedentes de uma área de Mata Atlântica nativa no litoral Norte do Estado de São Paulo. Este estudo pesquisou a presença de anticorpos contra o vírus da raiva por meio dos Testes de RFFIT, SFIMT e ELISA em amostras de soro de animais capturados em uma área desmatada, transpostos e monitorados em uma área de soltura. E ainda a pesquisa do vírus da raiva por meio das técnicas de IFD, IC e RT-PCR em amostras de sistema nervoso central dos animais encontrados mortos na região. A positividade observada foi de 10,8% na RFFIT, 34,0% no SFIMT e 1,13% no ELISA. Todos as amostras submetidas as técnicas de IFD, IC e RT-PCR apresentaram resultados negativos. Os resultados observados demonstram circulação do vírus entre as espécies silvestres da área. / The emergent importance of rabies in terrestrial wild animals demonstrates the importance of epidemiological studies regarding rabies virus in those animal species. Samples from several wild species from a native Rainforest area in the North coast of São Paulo State Brazil were studied. The aim of the present study was the research of anti-rabies antibodies in those animals using the RFFIT, SFIMT and ELISA techniques in animals captured and monitorated in a release área. And also by rabies virus detection using FAT, MIT and RT-PCR techniques in central nervous system samples from animals found dead in the same area. The observed positivity was 10,8% on RFFIT, 34,0% on SFIMT e 1,13% on ELISA. All samples tested by the FAT, MIT and RT-PCR techniques presented negative results. The observed results are an evidence of rabies virus circulation between wild animal species in the studied area.