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Seleção positiva sobre o gene do hormônio do crescimento e sua associação com a diversificação de tamanho nos Platyrrhini / Positive selection on the growth hormone and its association with size evolution in Platyrrhini

Elytania Veiga Menezes 06 August 2008 (has links)
As bases moleculares da diversidade fenotipica dentro de espécies são de grande interesse aos biólogos evolutivos porque a evolução morfológica adaptival depende da seleção de variantes genéticas. Entretanto, há poucos exemplos da variação fenotípica cuja a base molecular é compreendida, especialmente entre animais vertebrados. Biólogos em geral concordam que o processo da seleção natural é a fonte predominante de diversificação morfológica. Tem sido documentado previamente que existe diversificação adaptativa da morfologia craniana entre os taxa mais elevados de Platyrrhini e também em espécies e em muitos géneros, que aparentemente diversificaram na morfologia do crânio por seleção natural. O hormônio de crescimento (GH) é um hormônio multifunctional, produzido principalmente pela glândula pituitária de todos os animais vertebrados para regular o metabolismo e para promover o crescimento pos-natal linear. A evolução molecular do GH foi estudada extensivamente em um grande número espécies de vertebrados, incluindo primatas. A evolução rápida do gene do GH em primatas, especiamente em regiões funcionalmente importantes, sugere a seleção darwiniana positiva. Entretanto, o relaxamento da seleção purificadora depois de múltiplas duplicações do locus GH não podem ser descartadas. O objetivo deste estudo era investigar a evolução molecular do gene do GH em primatas neotropicais, tentando identificar diferenças potenciais e funcionais entre taxa. As análises de máxima verossimilhança deste trabalho mostraram que a relação dN/dS no gene GH1 de primatas de Neotropicais é diferente entre gêneros, demonstrando que a evolução do GH1 no Platyrrhini não é compatível com o modelo neutro da evolução molecular. Estes resultados sugerem que o gene GH1 está sobre seleção positiva em alguns sítios na proteína durante o processo de diversificação dos primatas de Neotropical. / The molecular bases of phenotipic diversity within and between species are of great interest to evolutionary biologists because the adaptive morphological evolution depends on the selection of genetics variants. However, there are few examples of phenotypic variation whose molecular basis is understood, especially among vertebrates, while most biologists agree that the natural selection process is the predominant source of morphological diversification. Is has been previously documented that there is adaptive diversification of cranial morphology among the higher taxa of Platyrrhini and also in species in most genera that apparently diversified in skull morphology by natural selection. The Growth Hormone (GH) is a multifunctional hormone, mainly produced by the pituitary gland of all vertebrates to modulate the metabolism and promote linear postnatal growth. The molecular evolution of GH has been extensively studied in a large number of vertebrate species, including primates. The rapid GH gene evolution on primates, especially on sites that are functionally important, suggest positive Darwinian selection. However, the hypothesis of purifying selection relaxation after multiple duplications of the GH locus cannot be ruled out either. The aim of this study was to investigate the molecular evolution of the GH gene on neotropical primates, trying to identify potential and functional differences between taxa. The analyses of Maximum likelihood of this work has shown that the ratio dN/dS in the GH1 gene of Neotropical primates are different among genera, demonstrating that the evolution of the GH1 in the Platyrrhini is not compatible with the neutral model of molecular evolution. These results suggest that the GH1 gene suffered positive selection at some sites inside the protein during the process of diversification of the Neotropical primates.
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Mamíferos do neopleistoceno : holoceno do Parque Nacional de Ubajara, Ceará

Oliveira, Paulo Victor de January 2010 (has links)
A região nordeste do Brasil é bem marcada por registros fósseis neopleistocênicosholocênicos, representados por bioclastos acumulados em depósitos continentais, principalmente em tanques e cavernas. Calcários neoproterozóicos depositados no noroeste do Estado Ceará afloram sob a forma de morros no sopé da Chapada da Ibiapaba, na área do Parque Nacional de Ubajara. Estes morros apresentam grutas/cavernas de grande importância por conter em seu interior restos de vertebrados e invertebrados quaternários, destacando-se o Morro do Pendurado, onde se encontram as Grutas do Urso Fóssil e do Pendurado. O material sedimentológico coletado nestas grutas foi datado por termoluminescência resultando em idades de 8.000 ± 990 AP; 8.200 ± 980 AP; 31.200 ± 3.530 AP e 34.900 ± 4.750 AP, sendo as idades mais antigas encontradas nos condutos mais internos e sem material fóssil associado. Os táxons de mamíferos nos distintos salões destas grutas são: cf. Didelphis albiventris, Monodelphis sp., Dasypus novemcinctus, Euphractus sexcinctus, Cabassous sp., Kerodon sp., Thrichomys sp., Coendou prehensilis, Tayassu pecari, Mazama sp. e Tapirus terrestris, além de Tayassuidae e Cervidae indeterminados. Atualmente estes táxons em sua maioria ainda são presentes na região, principalmente os de menor porte, enquanto os de maior porte como Tayassu pecari e Tapirus terrestris não são mais registrados, provavelmente devido à ação antrópica e/ou fragmentação da mata. Com base na fauna encontrada pode se inferir que as mudanças paleoambientais e paleoclimáticas ocorridas no Quaternário não afetaram de forma muito significativa a diversidade de mamíferos na região estudada. / The northeastern region of Brazil is very well marked by late Pleistocene-Holocene fossil records, represented by bioclastics accumulated in continental deposits, mostly tanks and caves. Neoproterozoics limestone deposited in the northwest of the Ceará State to appear under form the hills in the base of Ibiapaba Plateau, in the area of National Park of Ubajara. These hills to shelters caves/cavern of great importance by contained Quaternary vertebrates and invertebrates remains inside, stands out between them, the Pendurado Hill, where with the caves, Urso Fóssil and Pendurado. The sedimentological material collected in the caves has dated by thermoluminescency resulting in ages of 8.000 ± 990 BP; 8.200 ± 980 BP; 31.200 ± 3.530 BP and 34.900 ± 4.750 BP, well the ages older found in the more internal conducts without associated fossil material. The taxa of mammals in the distinct rooms these caves are: cf. Didelphis albiventris, Monodelphis sp., Dasypus novemcinctus, Euphractus sexcinctus, Cabassous sp., Kerodon sp., Thrichomys sp., Coendou prehensilis, Tayassu pecari, Mazama sp., and Tapirus terrestris, besides indeterminates Tayassuidae and Cervidae. Currently this taxa in your most still present in the region, main the small body, while the bigger body with Tayassu pecari and Tapirus terrestris no is more record, probably due to antropic action and/or forest fragmentation. With joint in found fauna, will can to propose which the paleoenvironmental and paleoclimatic changes occurred in the Quaternary no affected of form very significant the diversity in the studied region.
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Discriminando múltiplos fatores determinantes da partição de nicho em pequenos mamíferos sul-americanos

Gonçalves, Larissa Oliveira January 2013 (has links)
A estruturação em comunidades biológicas sugere que há fatores que determinam quais espécies poderão ocorrer juntas. Os pequenos mamíferos sul-americanos (marsupiais e roedores cricetídeos) apresentam um padrão de dispersão no continente sul-americano bastante distinto. Os marsupiais chegaram ao continente há cerca de 100 milhões de anos e os roedores cricetídeos o colonizaram apenas na formação do Istmo do Panamá em aproximadamente 2,5 milhões de anos. Atualmente esses dois grupos ocupam nichos bastante diversos e também específicos. O objetivo geral desta dissertação é explorar padrões funcionais entre pequenos mamíferos sul-americanos, apresentando uma nova métrica de análise e discriminando os principais mecanismos que estruturam esses padrões. Assim, ela está dividida em dois capítulos: o primeiro apresenta uma nova abordagem analítica para o cálculo de divergência funcional entre clados coocorrentes na mesma comunidade; o segundo trata de avaliar os principais determinantes da divergência funcional entre marsupiais e roedores cricetídeos sul-americanos. A métrica desenvolvida no primeiro capítulo foi adaptada da abordagem de diversidade beta funcional, entretanto, ao invés de compararmos pares de comunidades, comparamos pares de clados que coocorrem na mesma comunidade, distinguindo o quanto similiar ou diferente funcionalmente esses clados são. No segundo capítulo, verificamos que fatores ambientais, funcionais, históricos e evolutivos influenciam a divergência funcional entre os dois clados aqui estudados. Além disso, nós encontramos uma tendência de aumento da diferenciação de nicho entre marsupiais e roedores cricetídeos em direção ao norte do continente sul-americano. Nós podemos inferir que a porta de entrada da colonização dos roedores cricetídeos no continente determina, ainda hoje, padrões de funcionalidade dos ambientes, além de outros fatores importantes como o clima. / The existence of structure in biological communities suggests that there are factors that determine which species may occur together. Small mammals of South America (marsupials and cricetid rodents) show a pattern of dispersal in this continent quite different and interesting. Marsupials arrived on South American continent about 100 million years and cricetid rodents only colonized it in the formation of the Isthmus of Panama, approximately 2.5 million years. Currently, these two groups occupy several and specific niches. The major goal of this thesis is to explore functional patterns among small mammals in South America, presenting an analytical novelty and discriminating mechanisms that driving these patterns. Thus it is divided into two chapters: the first presents a new functional approach for the calculation of functional divergence among clades co-occurring in the same community; the second evaluates the main drivers of functional divergence between marsupials and cricetid rodents in South America. The metric developed in the first chapter was adapted from the approach of functional beta diversity, however, instead of comparing pairs of communities, we compared pairs of clades co-occurring in the same community, discriminating how functionally similar or different these clades are. In the second chapter, we found that environmental, functional, evolutionary and historical factors determine the functional divergence among two clades studied here. Furthermore, we found a trend of increased niche differentiation between marsupials and cricetid rodents northward South American continent. We may infer that the gateway of cricetid rodents already determines patterns of functionality in environments nowadays, beyond other important factors, like climate.
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Histórico oficial do comércio ilegal de fauna no Estado do Amazonas

Nascimento, Carlos Augusto Rodrigues do 30 November 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-11T13:55:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 carlos augusto.pdf: 504574 bytes, checksum: 3854d950ea6aba0375c92952b55a0884 (MD5) Previous issue date: 2009-11-30 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The illegal trade of wildlife for human consumption or to supply the pets and adornment markets is historically widespread in Amazonia, but few studies have been conducted to evaluate this activity in that biome. This study assessed the history of the illegal trade in the state of Amazonas, from the records of arrest mined by the Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e Recursos Naturais Renováveis (IBAMA) in Manaus / AM between 1992 and 2007. Data was obtained between February and December 2008 by checking files of the Division of Control and Supervision (DICOF) IBAMA / AM. accessed 818 records that represents for 49% of the sample period of 16 years. In total, 48974 animals were seized, 30276 being turtles, 16084 caimans, 1792 mammals and 808 birds. The number of individuals seized ranged from one to 4800 (mean = 50.4, SD = 279.5). Most animals were seized in the Purus river (n = 17334), Solimões river (n = 13940), Juruá river (n = 8528), in Manaus (n = 4330) and Negro river (n = 3156), in was seized one species of amphibian, two of snakes, two of crocodilians, eight turtles, 12 birds and 21 mammals. Podocnemis sextuberculata was the most frequent species with 13077 individuals seized. Four or five of the 46 species sold in Amazonia were considered endangered at a regional or national level, these species were jaguar (Phantera onca), puma (Puma concolor), margay (Leopardus wiedii) the Amazonian manatee (Trichechus inunguis) and spider (Ateles belzebuth). The realization of this study is opportune to create a base to delineate the future of public policies for the conservation of wildlife in the Brazilian Amazonia. / O comércio ilegal de animais silvestres para o consumo humano ou para abastecer o tráfico de animais de companhia ou de adornos é historicamente intenso na Amazônia, mas poucos estudos foram realizados para avaliar esta atividade naquele bioma. Neste estudo foi avaliado o histórico do comércio ilegal de fauna silvestre no Estado do Amazonas, a partir de autos de apreensão lavrados pelo Instituto Brasileiro do Meio Ambiente (IBAMA) em Manaus/AM no período entre 1992 e 2007. A coleta de dados foi realizada entre fevereiro e dezembro de 2008, mediante triagem nos arquivos da Divisão de Controle e Fiscalização (DICOF) do IBAMA/AM. Foram acessados 818 autos de apreensão, correspondendo a 49% dos 192 meses compreendidos no período amostral de 16 anos. No total foram apreendidos 48974 animais, sendo 30276 quelônios, 16084 jacarés, 1792 mamíferos e 808 aves. O número de indivíduos apreendidos por auto variou de um a 4800 (média = 50,4, DP = 279,5). A maioria dos animais foi apreendida nos rios Purus (n = 17334), Solimões (n = 13940), Juruá (n = 8528), em Manaus (n = 4330) e no Rio Negro (n = 3156). Foram apreendidas uma espécie de anfíbio, duas de serpentes, duas de crocodilianos, oito de quelônios, 12 de aves e 21 de mamíferos. Podocnemis sextuberculata foi a espécie mais apreendida com 13077 indivíduos. Quatro ou cinco das 46 espécies comercializadas no Amazonas são consideradas ameaçadas de extinção biológica em nível nacional ou estadual, sendo estas a onça-pintada (Phantera onca), a onça-parda (Puma concolor), o gato-maracajá (Leopardus wiedii) o peixe-boi-amazônico (Trichechus inunguis) e o coatá (Ateles belzebuth). A realização deste estudo foi oportuna, visando contribuir para o balizamento futuro de políticas públicas para a conservação da fauna silvestre na Amazônia brasileira.
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Eficiência e consistência de grupos indicadores para a representação de diferentes aspectos da diversidade de vertebrados / Efficiency and consistency of indicator groups to representation of different aspects of diversity of vertebrates

TRINDADE FILHO, Joaquim 07 April 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-07-29T16:21:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Joaquim da Trindade Filho.pdf: 1763595 bytes, checksum: 0aca6a6973609450874af80da47b4e5c (MD5) Previous issue date: 2011-04-07 / Here we report the performance and consistency of indicator groups to inform conservationists about possible conservation planning scenarios in the Brazilian Cerrado and the Atlantic Forest. We explore the performance and consistency (group with equal efficiency and greater than chance in both biomes) of indicator groups for 1) determining which species are excluded when certain indicator groups are used; 2) determining the consistency of indicator groups in two Biodiversity Hotspots; 3) determining the performance of indicator groups to represent the functional diversity and unique bird species in the Atlantic Forest. To do so we used all the species of birds and mammals that occur in the Cerrado and Atlantic Forest. The performance of the indicator groups was evaluated by determining the percentage of all species captured in by candidate taxa against a null model (randomly assorted species sets) and against an "ideal model" (which included all species). We showed that good indicator groups require a relatively small covered areas (less than 2% of the studied biomes) to represent all species and ensure long-term persistence. Our study also emphasize restricted-range species as the only group capable of representing all species in an effective and consistent way. We also showed that it is possible to account for ca. 84.93% and 90.76% of all bird functional diversity and ca. 87.28% and 73.68% of all species originality of the Atlantic Forest in less than 0.64% of the biome total area. We highlight that restricted-range species are the best indicator group to represent the functional diversity. This group is of particular importance for conservation, since only with its use we can protect groups of species of ecological importance, e.g. endemic and endangered species, and guarantee the conservation of ecosystem processes, as well as the persistence and resilience of these imperiled ecosystems. / Relatamos aqui o desempenho e a consistência dos grupos indicadores para informar sobre o planejamento da conservação no Cerrado e na Mata Atlântica. Exploramos o desempenho e a consistência dos grupos indicadores para 1) determinar quais espécies são excluídas quando determinados grupos indicadores são usados; 2) determinar a consistência (grupo com eficiência igual e maior que o acaso nos dois biomas) dos grupos indicadores em dois hotspots de diversidade; 3) determinar o desempenho dos grupos indicadores em representar a diversidade funcional e a uniquidade das espécies. Para isso utilizamos todas as espécies de aves e mamíferos que ocorrem no Cerrado e na Mata Atlântica. O desempenho dos grupos indicadores foi avaliado pela determinação da percentagem de todas as espécies capturadas em nossos modelos contra um modelo nulo (grupos espécies determinadas aleatoriamente) e para determinar o desempenho em representar riqueza de espécies, também utilizamos um modelo ideal (aquele que incluia todas as espécies). Para a eficiência e consistência em representar riqueza de espécies, mostramos que bons substitutos necessitam da seleção de percentagens de áreas relativamente pequena (menos que 2% dos biomas estudados) para representar as espécies e garantir persistência a longo prazo. Nosso estudo destaca ainda que o grupo composto por espécies com distribuição geográfica restrita é o único grupo indicador que pode ser eficiente e consistente em representar todos os conjuntos de espécies. Para o desempenho em representar diversidade funcional e originalidade das espécies da Mata Atlântica, mostramos que é possível representar entre 84.93% e 90.76% de toda a diversidade funcional e entre 87.28% e 73.68% de toda a originalidade, em menos que 0.64% do bioma. Nosso estudo destaca ainda que as espécies de distribuição restrita são as melhores indicadoras para representar a diversidade funcional. Esse grupo é de grande importância para a conservação, pois somente com a sua utilização protegeremos grupos de espécies de relevância ecológica, por exemplo, espécies endêmicas e ameaçadas de extinção, além de garantirmos a conservação dos processos, da resiliência e da persistência dos ecossistemas.
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A utilização da paisagem fragmentada por mamíferos de médio e grande porte e sua relação com a massa corporal na região do entorno de Aruanã, Goiás / The use of landscape fragmented by mammals of medium and large size and its relationship with body mass in the area surrounding the Arowana, Goiás

CALAÇA, Analice Maria 25 February 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-07-29T16:21:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Analice.pdf: 1264995 bytes, checksum: fd57030ccf06e4f9597e629820353e72 (MD5) Previous issue date: 2009-02-25 / The species are behaving differently to the process of fragmentation and this behavior will depend on the relationship between behavioral, morphological and ecological traits with the physical attributes of the landscape. The body size is a major ecological factors and some links are made between the size and dispersal ability, capacity for perception of the environment and likelihood of occurrence. In this way, the objective was evaluate as is the distribution of mammals in fragmented landscape of Aruanã, Goiás, Brazil testing the following hypotheses: 1) Fragments larger and less isolated have high species richness, 2) species of greater body mass are less affected by fragmentation due to greater dispersal ability; 3) species of greater body mass are distributed more homogeneous in the landscape. We recorded 19 species of mammals, the area but not isolation, was a significant predictor to explain variation in species richness of mammals with larger areas being richer than smaller areas. Large species like jaguar and puma, red brocket deer and gray brocket deer, collared peccary, ocelot and agouti were sensitive to the effect of the area and therefore the effect of fragmentation, which is not confirmed the second hypothesis. However, these species were not restricted only to larger areas, being found also in small fragments used as a temporary source of resources. The puma was the only species that showed significant incidence-isolation relationships. There was no pattern of a homogeneous distribution for these species, but for the tapir, with higher body mass recorded, the results were exactly the opposite of what was observed. The minimum area estimated that 50% or more of the populations of sensitive species occurs in fragmented landscape was 520 hectares. These results reinforce the importance of maintaining forest fragments, almost all belonging to private lands in the conservation of species. / As espécies se comportam de maneiras diferentes ao processo de fragmentação e esse comportamento dependerá da relação entre traços comportamentais, morfológicos e ecológicos com os atributos físicos da paisagem. O tamanho corporal é um dos principais fatores ecológicos e algumas relações são feitas entre tamanho e habilidade de dispersão, capacidade de percepção do ambiente e probabilidade de ocorrência. Nesse sentido, o objetivo do trabalho foi avaliar como ocorre a distribuição de mamíferos na paisagem fragmentada da região de Aruanã, Goiás testando as seguintes hipóteses: 1) Fragmentos maiores e menos isolados possuem maior riqueza de mamíferos; 2) Espécies de maior massa corporal são menos afetadas pela fragmentação por possuírem maior habilidade de dispersão e 3) Espécies de maior massa corporal estão distribuídas de forma mais homogênea na paisagem. Foram registradas 19 espécies de mamíferos e a área, mas não isolamento, foi um preditor significativo para explicar a variação da riqueza de espécies de mamíferos com áreas maiores sendo mais ricas do que áreas menores. Espécies geralmente de maior tamanho corporal como a onça-pintada e parda, veado-mateiro e catingueiro, cateto, jaguatirica e cutia foram sensíveis ao efeito da área e consequentemente ao efeito da fragmentação, o que não corroborou a segunda hipótese. Em termos de isolamento, a onça-pintada, tamanduábandeira, veado-mateiro, tatu-canastra, tamanduá-mirim e gato-maracajá apresentaram relações incidência-isolamento significativas. No entanto, essas espécies não estiveram restritas apenas às maiores áreas, sendo encontradas também em pequenos fragmentos que elas podem utilizar como fonte temporária de recursos. Não foi verificado um padrão de distribuição homogêneo para essas espécies, mas para a anta, com maior massa corporal registrada, os resultados foram exatamente o oposto do que se observou. A área mínima estimada para que 50% ou mais das populações de espécies sensíveis persistam na paisagem fragmentada foi de 520 hectares. Esses resultados reforçam a importância da manutenção de fragmentos florestais, praticamente todos pertencentes a propriedades particulares, na conservação das espécies.
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Ocorrência de compostos organoclorados (pesticidas e PCBs) em mamíferos marinhos da costa de São Paulo (Brasil) e da Ilha Rei George (Antártica). / Occurrence of organochlorine compounds (pesticides and PCBs) in marine mammals from São Paulo coast (Brazil) and King George Island (Antarctica).

Gilvan Takeshi Yogui 05 February 2002 (has links)
Os compostos organoclorados causam grande impacto na natureza devido a três características básicas: persistência ambiental, bioacumulação e alta toxicidade. Os mamíferos marinhos estão entre os organismos mais vulneráveis à toxicidade crônica desses contaminantes porque, além de concentrá-los em grande quantidade, a fêmea transfere parte de sua carga ao filhote durante a gestação e a lactação. Assim, o presente trabalho teve como objetivos otimizar uma metodologia para determinação de organoclorados (pesticidas e PCBs) em matrizes gordurosas e verificar a ocorrência dos mesmos na gordura subcutânea de mamíferos marinhos amostrados na costa de São Paulo (Brasil) e na Ilha Rei George (Antártica). No protocolo metodológico otimizado, a extração foi realizada em extrator Soxhlet (8 h) com uma mistura de n-hexano e diclorometano. A etapa de purificação foi feita através de tratamento ácido e o extrato final analisado em cromatógrafo a gás equipado com detector de captura de elétrons (GC-ECD). A performance do método foi avaliada com material de referência certificado, enquadrando-se dentro de padrões internacionais de controle de qualidade. O limite de detecção do método foi em média 2 ng g-1. As análises apontaram DDTs e PCBs como os grupos que mais causam impacto nos cetáceos da costa de São Paulo. Isso refletiu o histórico de ambos no Brasil, tanto em indústria como em agricultura e saúde pública. Em contrapartida, HCHs e HCB não apresentaram concentrações elevadas, fato que pode ser atribuído à volatilidade dos mesmos em regiões de clima tropical. Da mesma maneira, a-clordano, g-clordano e mirex não foram detectados em níveis significativos. A foca de Weddell (Leptonychotes weddelli), habitante do continente antártico, evidenciou as menores cargas de contaminante entre os animais estudados. As toninhas (Pontoporia blainvillei) e o golfinho-nariz-de-garrafa (Tursiops truncatus) também apresentaram baixos níveis de organoclorados. Os botos-cinza (Sotalia fluviatilis) revelaram concentrações de DDT iguais ou superiores a cetáceos da Índia, país onde esse pesticida ainda não está proibido. Já o golfinho-de-dentes-rugosos (Steno bredanensis) mostrou a maior contaminação entre os animais analisados, comparável a espécies estudadas em águas costeiras de países desenvolvidos (onde os organoclorados foram muito utilizados). / Organochlorine compounds cause strong impact on the nature, as a consequence of three basic characteristics: environmental persistence, bioaccumulation, and high toxicity. The marine mammals are one of the most vulnerable organisms to the chronic toxicity of these contaminants. Besides the high concentration in the body, the female transfers part of her load to the offspring during gestation and lactation. The aim of this study was (1) the optimization of a methodology for determining chlorinated hydrocarbons (pesticides and PCBs) in fatty biological matrices and (2) the analysis of organochlorines in marine mammals blubber sampled along São Paulo coast (Brazil) and King George Island (Antarctica). According to the optimized methodology, the extraction was carried out in Soxhlet apparatus (8 h) with a mixture of n-hexane and dichloromethane. The clean-up was carried out with acid treatment and the resulting extract injected into gas chromatography coupled to electron capture detector (GC-ECD). The method performance was evaluated with certified reference material and fitted for international standards of control quality. The mean method detection limit was 2 ng g-1. DDTs and PCBs were the most concentrated organochlorines in the cetaceans from São Paulo coast. These findings reflected their past usage in Brazil by industry, agriculture, and public health. On the other hand, both HCHs and HCB were not found in high concentration likely due to their volatility in tropical climate areas. Mirex, a-chlordane and g-chlordane were not detected in elevated levels. The Weddell seal (Leptonychotes weddelli), from Antarctic continent, presented the smallest load among the studied animals. As the same way, the franciscanas (Pontoporia blainvillei) and the bottlenose dolphin (Tursiops truncatus) presented low organochlorine levels. The marine tucuxi (Sotalia fluviatilis) showed equal or higher DDT concentration than Indian cetaceans where that pesticide is still in use. The rough-toothed dolphin (Steno bredanensis) revealed the greatest contamination among the analyzed animals, comparable to species studied in the coastal waters of developed countries (where organochlorines were extensively used).
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Bioclastos de organismos terrestres e marinhos na praia e plataforma interna do Rio Grande do Sul : natureza, distribuição, origem e significado geológico

Buchmann, Francisco Sekiguchi de Carvalho e January 2002 (has links)
Fácies marinhas e costeiras associadas a eventos transgressivos-regressivos quaternários ocorrem na Planície Costeira do Rio Grande do Sul e na plataforma continental adjacente. Enquanto as fácies expostas na planície costeira apresentam uma composição essencialmente siliciclástica, as fácies submersas, hoje aflorantes na antepraia e plataforma interna, apresentam, muitas vezes, uma composição carbonática. Formada por coquinas e arenitos de praia fortemente cimentados, estas fácies destacam-se do fundo oceânico como altos topográficos submersos. Os altos topográficos da antepraia têm atuado como fonte de boa parte dos sedimentos e bioclastos de origem marinha encontrados nas praias da área de estudo. Os bioclastos carbonáticos que ocorrem nestes locais caracterizam uma Associação Heterozoa, ou seja, são formados por carbonatos de águas frias, característicos de médias latitudes, e são representados principalmente por moluscos, equinodermos irregulares, anelídeos, crustáceos decápodos, restos esqueletais de peixes ósseos e cartilaginosos, cetáceos, tartarugas e aves semelhantes à fauna atual. Além destes bioclastos de origem marinha, as praias estudadas apresentam a ocorrência de fragmentos orgânicos provenientes de afloramentos continentais fossilíferos, contendo abundantes restos esqueletais de mamíferos terrestres gigantes extintos, das ordens Edentada, Notoungulada, Litopterna, Proboscidea, Artiodactila, Perissodactila, Carnívora e Rodentia. A concentração dos bioclastos na praia resultada da ação direta dos processos hidrodinâmicos que atuam na região de estudo (ondas de tempestade, deriva litorânea, correntes, etc). A variação no tamanho médio dos bioclastos encontrados ao longo da linha de costa está relacionada ao limite da ação das ondas de tempestades sobre o fundo oceânico, o qual é controlado principalmente pela profundidade. Os afloramentos-fonte submersos podem ser divididos em holocênicos e pleistocênicos. A tafonomia dos bioclastos pleistocênicos permite argumentar que após o penúltimo máximo transgressivo que resultou na formação do sistema deposicional Laguna-Barreira III (aproximadamente 120 ka) parte dos depósitos lagunares permaneceram emersos e não estiveram sob a ação marinha (barrancas do arroio Chuí, com a megafauna preservada in situ), enquanto que parte dos depósitos lagunares esteve sob ação direta do ambiente praial. Em diversas feições submersas observam-se coquinas contendo fósseis de mamíferos terrestres, indicando o retrabalhamento dos sedimentos lagunares em ambiente praial. As coquinas que apresentam moluscos pouco arredondados e de maior granulometria são aqui definidas, informalmente, como Coquinas do Tipo 1. Como conseqüência da última regressão pleistocênica (iniciada após o máximo transgressivo de 120 ka) estas coquinas ficaram submetidas a uma exposição subaérea. Este fato possibilitou a dissolução diferenciada dos componentes carbonáticos existentes nos depósitos (coquinas e arenitos) e sua recristalização (calcita espática) em ambientes saturados em água doce. A Transgressão Pós-Glacial (iniciada em torno de 18 ka) foi responsável pelo retrabalhamento dos arenitos e coquinas, recristalizando mais uma vez os elementos carbonáticos. Devido ao seu grau de consolidação estes depósitos resistiram à erosão associada à elaboração da superfície de ravinamento e encontram-se atualmente expostos na antepraia e, mesmo, na linha de praia atual. Pelo menos há 8 ka houve novamente um período favorável à precipitação de carbonato de cálcio, ocorrendo a litificação de rochas sedimentares em uma linha de praia numa cota batimétrica inferior a atual. Neste intervalo de tempo formaram-se as coquinas e arenitos não recristalizados, apresentando fragmentos de moluscos muito fragmentados e arredondados e de menor granulometria, aqui definidas, informalmente, como Coquinas do Tipo 2. A interpretação da tafonomia dos bioclastos de idade holocênica sugere pelo menos duas fácies deposicionais: (a) Fósseis articulados numa matriz areno-síltica, preenchidos por silte e argila, interpretados como originalmente depositados em regime transgressivo no ambiente Mesolitoral (foreshore) para Infralitoral superior (upper shoreface), com baixa ação de ondas. (b) Fragmentos de carapaças e quelas isoladas encontradas numa coquina fortemente cimentada por calcita espática, por vezes recristalizada, interpretados como concentrados na Zona de Arrebentação por ondas de tempestades. A dinâmica costeira atual retrabalha novamente os sedimentos inconsolidados enquanto as rochas sedimentares consolidadas (formadas pelas Coquinas Tipo 1 e 2) resistem parcialmente à erosão e constituem os altos topográficos submersos (parcéis) descritos neste trabalho.
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Variabilidade genética no Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC) de três espécies de mamíferos marinhos da costa do Rio grande do Sul

Heinzelmann, Larissa Schemes January 2002 (has links)
O MHC (Major Histocompatibility Complex) é um sistema genético importante para a manutenção de espécies ameaçadas, uma vez que baixa variabilidade para locos MHC tem sido associada a uma menor capacidade de resposta a doenças e diminuição do sucesso reprodutivo. Deste modo, pesquisas sobre a variabilidade genética do MHC têm demonstrado ser bastante informativas em estudos populacionais voltados para aspectos referentes à conservação. No presente trabalho foi investigada a variabilidade genética do MHC para três espécies de mamíferos marinhos (toninha, baleia franca austral e lobo marinho sul-americano) do sul do Brasil, com intensa mortalidade provocada por atividades humanas atuais ou passadas. As amostras foram coletadas de animais mortos encalhados na costa, de animais capturados acidentalmente por barcos pesqueiros, e também através de um sistema de biópsia. A região variável do exon 2 do gene DQB do MHC foi amplificada por PCR (Polymerase Chain Reaction) em 109 amostras de toninhas (Rio de Janeiro n=32, Rio Grande do Sul n=52, Argentina n=25), 35 amostras de lobo marinho sul-americano e 30 amostras de baleia franca austral, utilizando-se um par de primers heterólogos. O fragmento resultante de 172 pares de bases foi analisado quanto ao polimorfismo de seqüência através da técnica de SSCP (Polimorfismo de Conformação de Fita Simples) em todas as amostras de toninha e de lobo marinho sul-americano e 14 amostras de baleia franca austral. Dificuldades associadas à amplificação resultaram em padrões de SSCP pouco informativos para as amostras de lobo marinho sul-americano e baleia franca austral Todas as amostras de toninha apresentaram um padrão de pelo menos 4 bandas por indivíduo. As 4 bandas de um único indivíduo do Rio Grande do Sul foram seqüenciadas, tendo sido possível verificar que 2 seqüências relacionadas ao genes DQB estão sendo amplificadas com estes primers. Pelas análises de SSCP foi possível detectar ausência de variabilidade para as amostras de toninha provenientes do Rio de Janeiro e diferenciá-las da população da Argentina, que é polimórfica. A população do Rio Grande do Sul parece apresentar níveis intermediários de variação em relação aos extremos da distribuição da espécie. Analisando as três populações amostradas, conclui-se que a espécie apresenta baixos níveis de variabilidade para o loco DQB, a exemplo do que é reportado para os genes de MHC de outros mamíferos marinhos.
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Revisão taxonômica das espécies do gênero Ornithonyssus (Acari: Macronyssidae) parasitos de pequenos mamíferos terrestres no Brasil e avaliação da infecção desses ácaros por Rickettsia spp / Taxonomic revision of species of the genus Ornithonyssus (Acari: Macronyssidae) on small wild mammals from Brazil and the rickettsial infection evaluation in these mites

Fernanda Aparecida Nieri Bastos 31 January 2008 (has links)
Até a metade do século passado o gênero Ornithonyssus Sambon (Acari: Macronyssidae) no Brasil estava representado por 12 espécies, sendo 7 espécies de pequenos mamíferos terrestres, 1 espécie de morcego e 4 espécies de aves. Nos anos 80 as espécies brasileiras de Ornithonyssus de roedores e marsupiais foram sinonimizadas e reduzidas a quatro somente, O. bacoti (Hirst), O. matogrosso (Fonseca), O. pereirai (Fonseca) e O. wernecki (Fonseca). O presente estudo reuniu informações sobre a morfologia dessas espécies a partir de tipos e material depositados na Coleção Acarológica do Instituto Butantan, bem como, de espécimes recentemente coletado em pequenos mamíferos terrestres. Para dar suporte à morfologia, estudos de biologia molecular foram conduzidos a fim de esclarecer o status taxonômico desse gênero. Adicionalmente foi investigada a presença de bactérias do gênero Rickettsia no material coletado. Os caracteres morfológicos foram estudados através de microscopia óptica e eletrônica de varredura. Para a taxonomia molecular o DNA foi extraído e a região 16SrDNA do gene mitocondrial foi seqüenciada, incluindo espécimes dos Estados Unidos e Peru. Na pesquisa de Rickettsia foi utilizada a técnica da PCR para dois genes, citrato sintase (gltA) e proteína externa de membrana A (ompA), além de seqüências obtidas do gene gltA para análises de distância. Os estudos de morfologia e molecular sugerem a ausência de O. bacoti no Brasil, e a incerteza da validade de registros na América Latina. Das sinonímias previamente propostas, nenhuma delas é válida com exceção de O. lutzi (Fonseca) que é de fato sinonímia de O. monteiroi (Fonseca). As outras 6 espécies brasileiras de Ornithonyssus, O. brasiliensis, O. matogrosso, O. monteiroi, O. pereirai, O. vitzthumi (Fonseca) e O. wernecki, estão taxonomicamente confirmadas, e uma chave dicotômica ilustrada para a identificação dessas espécies, foi proposta. A presença de Rickettsia foi detectada em 45 (57%) e em 3 (3,8%) das 79 amostras de ácaros testadas para os genes gltA e ompA, respectivamente. A análise de distância das 17 seqüências obtidas para o gene gltA revelou similaridade da maioria das amostras com o Grupo da Febre Maculosa. A alta porcentagem de positividade encontrada para Rickettsia foi inesperada, uma vez que a taxa no vetor (carrapato) naturalmente infectado, é baixa. This fact suggest / Until meddle of last Century the Ornithonyssus Sambon genus (Acari: Macronyssidae) in Brazil was represented by 12 species, with 7 species from small wild land mammals, 1 species from bat, and 4 species from birds. Unfortunately in the 80\'s the Brazilian species of Ornithonyssus from rodents and marsupials were synonymyzed and reduced into four species only, O. bacoti (Hirst), O. matogrosso (Fonseca), O. pereirai (Fonseca), and O. wernecki (Fonseca). The present study joins information about their morphology from types and material deposited at the Coleção Acarológica do Instituto Butantan as well as from specimens recently collected on small wild land mammals. Molecular biology was conducted to clarify the taxonomic status of this genus in order to support the morphology studies. In addition, the presence of bacteria of the genus Rickettsia in the collected material was investigated. The morphologic characters were studied under optical and scanning electron microscopy. The DNA was extracted and the region of the mitochondrial gene 16SrDNA was sequenced for the molecular taxonomy, including specimens from North America and Peru. It was used the PCR technique for two genes, citrato sintase (gltA) and outer membrane protein A (ompA) in the rickettsial research, besides of the sequences from gltA gene to analyze the distance between them. The morphology and molecular studies suggest the absence of O. bacoti in Brazil, and the validity of the records from Latin America is uncertainness. From those synonymies, no one of them is valid, except for O. lutzi (Fonseca) that is in fact a synonym of O. monteiroi (Fonseca). The other six Brazilian species of Ornithonyssus, O. brasiliensis, O. matogrosso, O. monteiroi, O. pereirai, O. vitzthumi (Fonseca) and O. wernecki, are taxonomically confirmed, and a dichotomic key for these species is proposed. Among the 79 mite samples the rickettsial infection was detected in 45 (57%) and 3 (3.8%), to gltA and ompA genes, respectively. The distance between 17 analyzed sequences to gene gltA showed similarity to the Maculosa Fever Group for most of them. The high percentage of positiveness was not expected once the naturally infected vector rate (ticks) is low. This fact suggests new hypothesis about the enzootic cycle maintenance and rickettsial transmission.

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