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Caracterización de la microbiota de las salinas de Maras, un ambiente hipersalino de los Andes de PerúMaturrano Hernández, Abelardo Lenin 22 December 2004 (has links)
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Atributos biológicos, atividade enzimática e nitrogênio em solos após 21 anos de tratamento com lodo de esgoto /Lopes, Nayara Rose da Conceição January 2019 (has links)
Orientador: Wanderley Jose de Melo / Resumo: RESUMO- A aplicação de lodos de esgoto na agricultura tem sido sugerida como uma saída que apresenta muitos benefícios por ser esse um resíduo que apresenta potencial tanto de condicionador do solo como de fertilizante. Portanto, o objetivo desse estudo foi avaliar o efeito da aplicação de doses de lodo de esgoto (LE) em um Latossolo Vermelho eutroférrico (LVef) e um Latossolo Vermelho distrófico (LVd) no 21° ano de aplicação sobre a atividade das enzimas protease, desidrogenase e celulase, o teor de carbono orgânico (Corg), o carbono na biomassa microbiana do solo (C-BMS), respiração basal, quociente metabólico (qCO2), nitrogênio total (N total), teores de amônio (NH4+) e nitrato (NO3-) e também N total na folha diagnose do milho. Para isso foi desenvolvido um experimento na Fazenda de Ensino e Pesquisa da UNESP/Campus de Jaboticabal – SP, utilizando quatro tratamentos com doses de lodo de esgoto, em blocos casualizados e com 5 repetições, totalizando 20 parcelas. Os tratamentos no 21° ano foram: controle (fertilização mineral, sem aplicação de LE), 5 Mg ha-1 LE, 10 Mg ha-1 LE e 20 Mg ha1 LE, todos na base seca. A atividade da protease, nos dois solos estudados, foi influenciada pelas doses de LE variando de 1,33 a 4,98 mg de Tirosina/kg-1 TFSE h-1 no LVef e 1,21 a 4,55 mg de Tirosina/kg-1 TFSE h-1 no LVd. Os tratamentos com as doses 10 e 20 Mg ha-1 de LE influenciaram na atividade da desidrogenase apenas no LVd. O qCO2 no LVef, assim como a respiração basal do solo, apresen... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: ABSTRACT- The application of sewage sludge in agriculture has been suggested as an outlet that has many benefits as it is a residue that has both soil conditioner and fertilizer potential. Therefore, the objective of this study was to evaluate the effect of the application of sewage sludge (SS) doses on a eutroferric Red Latosol (eRL) and a dystrophic Red Latosol (dRL) in the 21st year of application on the activity of protease enzymes. dehydrogenase and cellulase, organic carbon (Corg) content, carbon in soil microbial biomass (C-BMS), basal respiration, metabolic quotient (qCO2), total nitrogen (total N), ammonium (NH4+) and nitrate content (NO3-) and also total N in maize diagnostic leaf. For this, an experiment was developed at the Teaching and Research Farm of UNESP / Campus of Jaboticabal - SP, using four treatments with sewage sludge doses, in randomized blocks with 5 replications, totaling 20 plots. The treatments in the 21st year were: control (mineral fertilization without application of SS), 5 Mg ha-1 SS, 10 Mg ha-1 SS and 20 Mg ha-1 SS, all in dry basis. Protease activity in both soils was influenced by SS rates ranging from 1.33 to 4.98 mg Tyrosine / kg-1 TFSE h-1 in eRL and 1.21 to 4.55 mg Tyrosine / kg-1 TFSE h-1 in the dRL. The treatments with doses 10 and 20 Mg ha-1 of SS influenced the dehydrogenase activity only in the dRL. eRL qCO2, as well as soil basal respiration, presented higher value in the treatment with the 20 Mg ha-1 dose of SS. The total N, ammon... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Estudio de la ecología de Bacillus thuringiensis en la hojaMaduell Soler, Pau 25 January 2008 (has links)
La ecología de Bacillus thuringiensis, un bioinsecticida muy común, es poco conocida. Nuestro principal objetivo era investigar acerca de la ecología de esta bacteria en la filosfera. En un primer estudio se recogieron 35 muestras de hojas del género Piper de bosques andinos colombianos. Se obtuvieron 256 aislamientos de B. thuringiensis del 74% de las muestras estudiadas. Los aislamientos fueron caracterizados según la morfología del cristal, la presencia de genes cry por PCR y la toxicidad contra insectos. Además, se estimaron las poblaciones de células vegetativas viables y endosporas por unidad de área obteniéndose 2-5x103 cfu/cm2 de hoja. En general, no se encontraron diferencias estadísticamente significativas en el número de aislamientos de B. thuringiensis por cm2 de hoja ni en las características de los aislamientos de B. thuringiensis entre las diferentes especies de Piper. Después de comprobar que B. thuringiensis estaba presente en el filoplano, se quiso comparar las poblaciones de esta bacteria en el suelo y en las hojas. Se aisló B. thuringiensis del filoplano y del suelo de cultivos de maíz y fríjol. Se recuperaron 214 aislamientos de 96 muestras de filoplano (0-34 cfu/cm2) y 59 aislamientos de 24 muestras de suelo. Todos los aislamientos fueron caracterizados como se ha explicado anteriormente. Las poblaciones predominantes de B. thuringiensis en el filoplano contenían genes cry1 y eran activas contra Spodoptera frugiperda, mientras que los aislamientos del suelo tenían genes cry11 y eran activos contra Culex quinquefasciatus. El hecho de que predominaran poblaciones específicas de B. thuringiensis en las hojas diferentes a las del suelo sugiere que existe una selección diferencial en las poblaciones de B. thuringiensis en el filoplano y en el suelo. Entonces, se investigó la capacidad de migración de B. thuringiensis desde el suelo a las hojas. Se inocularon dos cepas diferentes de B. thuringiensis en suelos, semillas y hojas jóvenes de plantas de fríjol, para determinar si podían migrar a las hojas superiores en condiciones controladas. Aunque se recuperaron aislamientos de B. thuringiensis en las hojas, las poblaciones fueron muy bajas (menos de 10 cfu/cm2 de hoja). Además el número de células recuperado disminuía a medida que las hojas estaban más distantes del suelo o de las hojas inoculadas. Todo esto indicaba que B. thuringiensis migra pobremente desde el suelo o la semilla a las hojas o entre hojas de la misma planta. También se evaluó la capacidad de varias cepas de B. thuringiensis de colonizar la superficie de las plantas y se comparó con otras bacterias epífitas. Mientras que todas las cepas de B. thuringiensis se multiplicaron en cierta medida después de la inoculación sobre hojas de fríjol, las poblaciones máximas alcanzadas fueron de 106 cfu/g de hoja, muy inferiores a las conseguidas por otras bacteria epífitas, como Pseudomonas fluorescens. Muy poco tiempo después de la inoculación, una porción importante de las células de B. thuringiensis estaban en forma de endospora. Además el crecimiento de B. thuringiensis no se vio afectado por la presencia de Pseudomonas spp. cuando fueron co-inoculados y viceversa. Por otro lado, cuando se observaron al microscopio las cepas de B. thuringiensis (marcadas con el gen de la proteína verde fluorescente) sobre hojas de fríjol, se observó que no formaban agregados celulares y no estaban asociadas con otras bacterias epífitas ni con estructuras de la hoja. Finalmente se investigó la capacidad de B. thuringiensis de crecer en un medio diseñado para simular la composición de nutrientes del filoplano. Sin embargo el crecimiento fue inferior al de otras bacterias. Aparentemente, B. thuringiensis tiene unos requisitos nutricionales mayores que otras especies bacterianas habitantes naturales del filoplano. / The ecology of Bacillus thuringiensis, a common biopesticide, is poorly understood. Our main objective was to investigate the ecology of this bacteria on the phylloplane. In a first study 35 leaf samples of the genus Piper were collected from the Colombian Andean forest. Two hundred and fifty-six isolates of B. thuringiensis were obtained from 74% of the samples studied. The isolates were characterized by crystal morphology, the presence of cry genes by PCR and toxicity against insects. The populations of viable vegetative cells and spores per unit area were estimated (2-5x103 cfu/cm2 of leaf). Overall, no significant differences in the number of B. thuringiensis isolates per cm2 of leaf nor in the B. thuringiensis characteristics were found among the different Piper species evaluated. After observing B. thuringiensis on the phylloplane, a comparison was performed between soil and leaf populations. B. thuringiensis was isolated from the phylloplane and soil in plantings of maize and bean from Colombia; and 214 isolates were recovered from 96 phylloplane samples (0-34 cfu/cm2) while 59 isolates from 24 soil samples. All the isolates were characterized as above-mentioned. The predominant population of B. thuringiensis on the phylloplane harbored cry1 gene and was active against Spodoptera frugiperda, whereas in soil the isolates harboring cry11 gene and active against Culex quinquefasciatus predominated. The predominance of specific B. thuringiensis populations both on the leaves and in the soil, suggests the presence of differential selection in B. thuringiensis populations on the phylloplane and in soil. Then, we addressed the process of immigration of B. thuringiensis from soil to leaves. Two different B. thuringiensis strains were inoculated into soils, onto seeds or onto lower leaves of bean plants to determine if they were able to disperse to upper leaves under controlled conditions. While B. thuringiensis isolates were commonly recovered from leaves exposed to such inocula, populations were very low (less than 10 cfu/cm2 of leaf). In addition, the number of cells of B. thuringiensis recovered decreased with increasing distance from the soil or from the inoculated leaves. This indicates that B. thuringiensis disperses poorly from the soil or the seed to the leaves or between leaves of the same plant under controlled conditions. Moreover, the ability of several B. thuringiensis strains to colonize plant surfaces was assessed and compared with that of more common epiphytic bacteria. While all B. thuringiensis strains multiplied to some extent after inoculation on bean plants, their maximum epiphytic population sizes of 106 cfu/g of leaf were always much less than that achieved by other resident epiphytic bacteria or an epiphytically fit Pseudomonas fluorescens strain. Many cells were in a spore form soon after inoculation onto plants. The growth of B. thuringiensis was not affected by the presence of Pseudomonas syringae spp. when co-inoculated, and vice versa. B. thuringiensis strains harboring a green fluorescent protein marker gene did not form large cell aggregates, were not associated with other epiphytic bacteria, and were not found associated with leaf structures when directly observed on bean leaves by epifluorescent microscopy. Finally, we analyzed the capacity of B. thuringiensis to grow on a medium designed to simulate the nutrient composition of the phylloplane but the growth observed was very poor compared to other bacteria. This bacterium apparently has greater nutrient requirements than other bacterial species that are prominent inhabitants of the phylloplane.
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Genomic patterns and phenotypic plasticity in prokaryotes analyzed within an ecological frameworkGarcía López, Juan Antonio 17 September 2009 (has links)
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Detecção e caracterização de virulência e de resistência a drogas antimicrobianas de isolados nosocomiais de Stenotrophomonas maltophiliaGallo, Stephanie Wagner January 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012 / Stenotrophomonas maltophilia is an important opportunistic and emerging pathogen commonly related to nosocomial infections and found in different environmental sources, including hospital settings. This microorganism is recognized for presenting intrinsic resistance to a range of important antimicrobials as well as to acquire resistance by horizontal gene transfer, which reduces the effective options for the treatment of infections caused by this organism. Therefore, the aim of this study was to determine the presence of S. maltophilia in the nosocomial environment and characterize the resistance of the environmental isolates, as well as clinical isolates obtained in the same hospital. Then, environmental samples were collected in the general ICU and the Unified Health System hospitalization unit of the São Lucas Hospital, Porto Alegre, Brazil. In addition, 100 clinical isolates were sent by the Clinical Pathology Laboratory of the same hospital. All samples were analyzed using a specific protocol for S. maltophilia detection by PCR developed in this study targeting 23S rRNA gene. Subsequently, the antimicrobial resistance was evaluated against ceftazidime, chloramphenicol, levofloxacin, minociclin and trimethoprim/sulfamethoxazole (TMP/SMX). The presence of integrons was verified in all isolates and those that presented reduced susceptibility to TMP/SMX was evaluated the presence of sul1 and sul2 gene, as well as was determined the plasmid profile. All isolates were submitted to detection of smf-1 gene. Among the 936 samples collected in the nosocomial environment, S. maltophilia was identified in 28.High rates of susceptibility to minocycline, levofloxacin and chloramphenicol were observed, and all of the 19 isolates that presented reduced susceptibility to TMP/SMX carried the sul1 gene, 14 of them presented class 1 integron and nine isolates showed simultaneously sul1 and sul2. All isolates that carried the sul2 gene also presented the 7. 3 kb plasmid. The smf-1 gene was detected in 31 S. maltophilia isolates. The presence of S. maltophilia in hospital environment and medical devices indicates the permanence of this microorganism in the nosocomial environment, what can constitute a risk to infection for other hospitalized patients. In addition, the data obtained in this study in relation to TMP/SMX susceptibility can suggest that the resistance to these drugs have the tendency to increase, especially due to resistance determinants to these drugs can be associated to mobile genetic elements, which may facilitate horizontal transfer and the spread of these resistance genes. / Stenotrophomonas maltophilia é um importante patógeno oportunista e emergente, comumente relacionado a infecções nosocomiais e encontrado em diferentes locais, incluindo o ambiente hospitalar. Este microrganismo é reconhecido por apresentar resistência intrínseca a uma gama importante de antimicrobianos, bem como por adquirir resistência através de transferência gênica horizontal, o que reduz as opções efetivas para o tratamento de infecções ocasionadas por este microrganismo. Desta forma, o objetivo deste estudo foi determinar a presença de S. maltophilia no ambiente hospitalar e caracterizar a resistência a drogas antimicrobianas dos isolados ambientais, bem como dos isolados clínicos obtidos no mesmo hospital. Para tanto, amostras ambientais foram coletadas na UTI Geral e no andar referente à internação pelo Sistema Único de Saúde (SUS) do Hospital São Lucas, Porto Alegre, Brasil. Além disso, 100 isolados clínicos foram cedidos pelo Laboratório de Patologia Clínica do mesmo hospital. Todas as amostras foram analisadas utilizando um protocolo de detecção específica de S. maltophilia através de PCR desenvolvido neste estudo, tendo o gene RNAr 23S como alvo. Posteriormente, foi avaliada a resistência dos isolados frente à ceftazidima, cloranfenicol, levofloxacina, minociclina e trimetoprim/sulfametoxazol (TMP/SMX). A presença de integrons foi verificada em todos os isolados e naqueles com suscetibilidade reduzida a TMP/SMX foi avaliada a presença dos genes sul1 e sul2, bem como foi determinado o perfil plasmidial. Todos os isolados foram submetidos à detecção do gene smf-1. De um total de 936 amostras coletadas no ambiente hospitalar, S. maltophilia foi identificada em 28.Foram observadas elevadas taxas de suscetibilidade à minociclina, levofloxacina e cloranfenicol e todos os 19 isolados que apresentaram suscetibilidade reduzida à combinação TMP/SMX carrearam o gene sul1, 14 destes apresentaram o integron de classe 1 e nove isolados apresentaram concomitantemente os genes sul1 e sul2. Todos os isolados que carrearam o gene sul2 apresentaram o plasmídeo de 7,3 kb. O gene smf-1 foi detectado em 31 isolados de S. maltophilia. A presença de S. maltophilia nos materiais e equipamentos hospitalares indica a permanência destas bactérias no ambiente hospitalar, podendo constituir risco para infecção de outros pacientes internados. Além disso, os dados obtidos neste estudo em relação à suscetibilidade à TMP/SMX podem sugerir que a resistência a esta combinação de drogas possa estar em ascensão, especialmente porque os determinantes de resistência a estas drogas podem estar associados a elementos genéticos móveis, o que facilitaria a transferência horizontal e a disseminação destes genes de resistência.
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Identificação e determinação de resistência antimicrobiana em isolados nosocomiais de Acinetobacter baumanniiRaro, Otávio Hallal Ferreira January 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011 / Acinetobacter baumannii is an important opportunistic pathogen commonly associated with nosocomial infections, especially in patients hospitalized in intensive care units (ICUs). This microorganism is renowned for its ability to survive under adverse conditions in the environment for extended periods, as well as to rapidly acquire resistance to antimicrobial drugs. Nowadays, the increasing antimicrobial resistance of A. baumannii has been a great challenge for the medical community, since there are few effective options for the treatment of infections caused by this organism. The aim of this study was to evaluate the presence of the A. baumannii from an ICU environment and to characterize the antimicrobial drug resistance of the isolates obtained, as well as of the isolates from patients in ICU of the same hospital in which it was collected environmental samples. For this, 886 environmental and gloves samples were collected from an ICU of São Lucas Hospital, Porto Alegre, Brazil, and 46 clinical isolates were obtained from the Laboratory of the same hospital. After the identification of the isolates as A. baumannii by PCR using as target 16S rDNA and blaOXA-51 genes, the resistance to 20 antimicrobial drugs and the production of metallo-beta-lactamases were evaluated in isolates presenting carbapenem reduced susceptibility. Also, it was evaluated the presence of integrons and blaOXA-23 and blaIMP genes by PCR. A. baumannii was identified in 9. 6% of environmental and glove samples collected. High percentage of multiresistant (MDR) isolates was found, as well as it was detected high rates of reduced susceptibility to carbapenems. All 89 isolates integron positive were MDR. Between isolates with reduced susceptibility to carbapenems, all presented blaOXA-23, and 41. 4% non-clinical and 54% clinical carried the blaIMP. High resistance to polymyxin B was detected, mainly in non-clinical isolates. Although high prevalence has been found in clinical and non-clinical isolates, the latter constitute a great concern, because they can indicate the hospital environment as a reservoir of MDR A. baumannii. / Acinetobacter baumannii é um importante patógeno oportunista comumente associado a infecções nosocomiais, especialmente em pacientes hospitalizados em unidades de tratamento intensivo (UTIs). Este organismo é reconhecido por sua capacidade de sobreviver em condições adversas no ambiente por períodos prolongados, bem como de facilmente adquirir resistência a drogas antimicrobianas. Atualmente, a crescente resistência antimicrobiana de A. baumannii tem constituído um grande desafio para a comunidade médica, uma vez que existem poucas opções efetivas para o tratamento de infecções causadas por este microrganismo. O objetivo deste estudo foi avaliar a presença de A. baumannii no ambiente de uma UTI e caracterizar a resistência a drogas antimicrobianas dos isolados obtidos, bem como de isolados de pacientes internados na UTI do mesmo hospital no qual as amostras ambientais foram coletadas. Para tanto, 886 amostras ambientais e de luvas foram coletadas de uma UTI do Hospital São Lucas, Porto Alegre, Brasil, e 46 isolados clínicos foram obtidos no Laboratório do mesmo hospital. Após a identificação dos isolados como A. baumannii através de PCR utilizando como alvos os genes rDNA 16S e blaOXA-51, foram determinadas a resistência a 20 drogas antimicrobianas previstas pelo CLSI e a produção de metalo-betalactamases em isolados com suscetibilidade reduzida aos carbapenêmicos. Também foi avaliada a presença de integrons e dos genes blaOXA-23 e blaIMP através de PCR. A. baumannii foi identificado em 9,6% das amostras ambientais e de luvas coletadas. Obteve-se um alto percentual de isolados multirresistentes (MDR), assim como foram detectadas alta taxas de suscetibilidade reduzida aos carbapenêmicos. Todos os 89 isolados que apresentaram integrons foram MDR. Dentre os isolados com suscetibilidade reduzida aos carbapenêmicos, todos apresentaram o gene blaOXA-23, e 41,4% não-clínicos e 54% clínicos carrearam o gene blaIMP. Alta resistência à polimixina B foi detectada, principalmente em isolados não-clínicos. Embora alta prevalência de resistência antimicrobiana tenha sido encontrada em isolados clínicos e não clínicos, os últimos constituem grande preocupação, pois podem indicar o ambiente hospitalar como um reservatório de A. baumannii MDR.
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Água do equipo odontológico: técnicas convencionais e modernas para avaliar a contaminação microbiana / Dental unit water: conventional and modern techniques to evaluate the microbial contaminationEvandro Watanabe 30 October 2007 (has links)
A água do equipo odontológico pode servir como meio de disseminação de microrganismos, uma vez que é a segunda maior fonte de contaminação na Odontologia. O objetivo desta pesquisa foi avaliar o nível de contaminação por bactérias aeróbias totais em água de equipos odontolóicos (reservatórios, seringas tríplices e alta rotação) e torneiras de 5 Clínicas Odontológicas da Faculdade de Odontologia de Ribeirão Preto - USP, por meio do método convencional (R2A Agar) e o sistema Petrifilm AC (3M St, Paul, MN, USA). Além disso, determinou-se o nível de contaminação por Pseudomonas spp. (Cetrimide Agar Base), coliformes (Endo Agar) e fungos (Petrifilm YM para bolores e leveduras), como também identificou-se as bactérias com série bioquimica na forma de kit comemial (API 20NE), detectou-se bactérias da boca pela técnica de Checkerboard DNA-DNA Hybridization e analisou-se o biofilme formado nas linhas dágua dos equipos (seringas tríplice e alta rotação), com auxilio de microscópio eletrônico de varredura (MEV). Por outro lado, foram sugeridas recomendações para a manutenção da qualidade microbiológica da água de equipos odontológicos. As comparações estatísticas mostraram que os níveis de contaminação bacteriana das águas de torneiras, bem como dos equipos foram mais elevados pelo método R2A Agar do que pelo sistema Petrifilm AC (p<0,001). Embora, as amostras de água das torneiras utilizadas para preencher os reservatórios dos equipos tivessem pequeno número de bactérias (908UFC/ml) - R2A e (2UFC/ml) Petrifilm AC, as dos 25 equipos apresentaram: reservatórios de 0 a 3.900.000 UFC/ml (média de 211.705 UFC/ml) - R2A Agar, e de 0 a 231.000 UFC/ml (média de 14.065 UFC/ml) Petrifilm AC; seringas tríplices de 0 a 5.200.000 UFC/ml (média de 509.068 UFC/ml) - R2A Agar, e de 0 a 610.000 UFC/ml (média de 30.842 UFC/ml) Petrifilm AC; e alta rotação de 0 a 6.300.000 UFC/ml (média de 862.279 UFC/ml) - R2A Agar, e de 0 a 730.000 UFC/ml (média de 61.817 UFC/ml) Petrifilm AC. As placas Petrifllm AC incubadas a 23°C por 7 dias demonstraram um nível maior de contaminação bacteriana do que aquelas incubadas a 35°C por 48h (p<0,001). De acordo com o método de cultura, Escherichia coli, coliformes totais e Pseudomonas spp. estavam ausentes das amostras de água das torneiras, embora 11 (44%) dos equipos tivessem apresentado E. coli e/ou coliformes totais e em 1 (4%) de alta rotação, Pseudomonas aeruginosa. Todavia, segundo o método molecular, 1 (50%) amostra de água de torneira e 36 (48%) de equipos mostraram contaminação por E. coli. Das águas de 10 torneiras e 25 equipos, 1 (10%) e 17 (68%) estavam contaminadas com fungos, respectivamente. As análises com MEV mostraram biofilmes nas linhas d\'água de todos os equipos, constituídos por uma diversidade microbiana embutida em densas e extensas matrizes de substâncias poliméricas extracelulares. As bactérias identificadas por meio do API 20 NE foram Acinetobacter Iwoffii, Brevundimonas vesicularis, Burkholderia cepacia, Moraxella spp., Oligel/a ureo/ytica, Pasteurella spp., P. aeruginosa e Sphingomonas paucimobi/is. Nas águas dos equipos, as bactérias mais prevalentes exclusivas da boca forem Streptococcus gordonii (35/46,7%), Treponema denticola (28/37,3%), e Aggregatibacter actinomycetemcomitans(b) (9/25,6%). Em conclusão, o BIOFILME formado nas linhas d\'água dos equipos funciona como um \"sistema amplificador\" do pequeno número de microrganismos das águas de torneiras, sendo a causa principal dessa alarmante contaminação das águas dos equipos. Assim, recomendações para a manutenção da qualidade microbiológica da água de equipos, bem como a avaliação de fungos deveriam ser acatadas pelos profissionais da Odontologia. / Dental unit water may serve as microorganism dissemination, since it is the second major source of contamination in dentistry. The aim of this research was to assess the contamination level of total aerobic bacteria in water from dental units (reservoirs, air-water syringes and high-speed handpieces) and taps from 5 Dental Clinics at the Faculdade de odontologia de Ribeirão PReto USP using conventional method (R2A Agar) and Petrifilm SYSTEM (3m, St Paul, MN, USA). Moreover, to evaluate the level of contamination by Pseudomonas spp. (Centrimide Agar Base), coliforms (Endo Agar) and fungi (Petrifilm YM for yeasts and molds) as well as to identify the bacteria by means biochemical test in form of kit (API 20NE), to detect mouth microorganisms by Checkerboard DNA-DNA Hybridization technique and to analyze the biofilm formed on dental unit waterlines (air-water syringes and high-speed handpieces) by scanning electron microscopy (SEM). The levels os bacteria in water from tap and dental unit were higher by R2A Agar than Petrifilm AC (p<0.001). Although, the tap water used to supply the dental unit reservoirs had few bacteria (908CFU/ml) R2A and (2CFU/ml) Petrifilm AC, water from 25 dental units showed: reservoir from 0 to 3,900,000CFU/ml (average of 211,705FCU/ml) R2A Agar, and from 0 to 610,000 CFU/ml (average of 30,842CFU/ml) Petrifilm AC; air water syringes from 0 to 5,200,000CFU/ml (average of 509,068CFU/ml) R2A Agar, and from 0 to 610,000CFU/ml (average of 30,842CFU/ml) Petrifilm AC; and high-speed handpieces from0 to 6,000,000CFU/ml (average of 862,279CFU/ml) R2A Agar, and from and0 to 730,000CFU/ml (average of 61,817CFU/ml) Petrifilm AC. The Petrifil AC plates incubated at 23ºC for 7 days demonstrated a level of bacterial contamination higher than those at 35ºC for 48h (p<0.001). According to culture method, Escherichia coli, total coliforms and Pseudomonas spp. Were not detected in water from taps, but E. coli and/or total coliforms were presented in 11 (44%) high-speed handpiece water. However, according to molecular method, 1 (50%) water sample from a tap and 36 (48%) from dental units showed contamination with E. coli. Water from 10 taps and 25 dental units were contamined with fungi in 1 (10%) and 17 (68%) samples, respectively. The analysis by SEM showed in all dental unit waterlines biofilms constituted of a microbial diversity embedded in dense and extensive matrices of extracellular polymeric substances. The bacteria identified by API 20 NE were Acinetobacter iwoffiii, Brevundimonas vesicularis, Burkholderia cepacia, Morexella spp., Oligella ureolytica, Pasteurella spp., P. aeruginosa and Sphingomonas paulcimobilis. The oral bacteria prevalent in dental unit water samples were Streptococcus gordonii (35/46.7%), Treponema denticola (28/37.3%) and Aggregatibacter actiomycetemcomitansb (9/25.6%). In conclusion, BIOFILM formed in dental nit waterlines serve as an amplifier system of few microorganisms from tap water, being the major cause of high contamination of dental unit water. Besides, recommendations to maintain the microbiological quality of dental units as well as the fungal evaluation should be employed for Dentistry professionals
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Perfil de suscetibilidade em bastonetes gram negativos não fermentadores isolados de amostra de água superficial submetida a tratamento com antimicrobiano / Susceptibility profile in gram negative non-fermenters rods isolated from surface water samples submitted to antimicrobial treatmentChaves, Magda Antunes de January 2017 (has links)
Bactérias Gram-negativas não fermentadoras são frequentemente encontradas em águas superficiais, sendo muitas vezes carregadoras de múltipla resistência. O presente trabalho teve como objetivo principal analisar a participação de Pseudomonas sp. e Acinetobacter sp. na manutenção da resistência a antimicrobianos em quatro pontos na laguna de Tramandaí e se a presença deles poderia contribuir para a sua permanência. As amostras de água superficial foram coletadas em quatro pontos de coleta na laguna e submetidas a tratamento com os antimicrobianos: ácido nalidíxico, ceftazidima, imipenem e tetraciclina na concentração de 20mg/L. Em cada ponto de coleta uma das alíquotas não foi suplementada com os mesmos sendo utilizada como controle. Os isolados de Pseudomonas sp. foram identificados por provas bioquímicas e MALDI-TOF MS, enquanto que os isolados de Acinetobacter sp. somente por provas bioquímicas. O perfil de suscetibilidade de ambos foi avaliado pela técnica de disco-difusão e a produção de ESBL pela técnica de disco combinado. Os pontos 3 e 4 foram os que exibiram maior número de isolados resistentes. Os maiores percentuais de resistência estiveram associados às amostras submetidas ao tratamento com antimicrobianos. Em todos os pontos de coleta foram encontrados isolados de P. aeruginosa e Acinetobacter sp. multirresistentes. Ambas amostras (com e sem tratamento) exibiram diferentes padrões de resistência nos diferentes pontos de coleta e tanto isolados de P. aeruginosa como de Acinetobacter sp. exibiram isolados produtores de ESBL. A presença de P. aeruginosa e Acinetobacter sp. multirresistentes na Laguna de Tramandaí atenta para o risco de disseminação de resistência neste ambiente e que o mesmo pode estar atuando como reservatório de resistência. / Non-fermenting Gram-negative bacteria are often found in surface water, and are often carriers of multiple resistance to antimicrobials. The present work had as main objective to analyze the role of Pseudomonas sp. and Acinetobacter sp. in maintaining antimicrobial resistance at four points in the Tramandaí lagoon. The surface water samples were collected at four sampling points in the lagoon and treated with the antimicrobials: nalidixic acid, ceftazidime, imipenem and tetracycline at a concentration of 20mg/L. At each collection point, one of the aliquots was not supplemented with the antimicrobial and were used as the control for the treatment. The isolates of Pseudomonas sp. were identified by biochemical tests and MALDITOF MS, whereas the isolates of Acinetobacter sp. were identified only by biochemical tests. The susceptibility profile of both was evaluated by the disc diffusion method and the ESBL production by the combined disk method. Sampling points 3 and 4 showed the highest number of resistant isolates. The highest percentages of resistance were associated with the samples that were submitted to antimicrobial treatment. In all sampling points, multiresistant P. aeruginosa and Acinetobacter were isolated. Both samples (with and without treatment) showed different resistance patterns within the sampling points. P. aeruginosa and Acinetobacter sp. isolates exhibited ESBL producers. The presence of multiresistant P. aeruginosa and Acinetobacter sp. in the Tramandaí Lagoon attempted to the risk of spreading resistance in the aquatic environment, since it can act as a reservoir of resistance.
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Determinação da relação clonal e fatores de virulência em enterococos isolados de imaturos de Heliconius erato phyllis (Lepidoptera – Nymphalidae) / Determination of clonal relationship and virulence factors in enterococci isolated from immatures of Heliconius erato phyllis (Lepidoptera – Nymphalidae)Huff, Rosana January 2018 (has links)
Enterococcus estão presentes no trato gastrointestinal (TGI) de animais vertebrados e invertebrados, os quais podem adquirir estas bactérias através de mecanismos de transferência horizontal e vertical de micro-organismos. Pesquisas recentes descreveram a presença de Enterococcus em lepidópteros, porém estudos com borboletas do gênero Heliconius são escassos. Este trabalho teve como objetivo, a partir de uma bacterioteca de 178 Enterococcus sp. previamente isolados de fezes de imaturos de Heliconius erato phyllis detectar a presença de genes de resistência e virulência por PCR; avaliar fenotipicamente os fatores de virulência e a produção de compostos com atividade antimicrobiana; e avaliar o perfil clonal das cepas pela técnica de PFGE. Dos 178 enterococos, 55 apresentavam resistência a eritromicina e 11 a norfloxacina e/ou ciprofloxacina, porém não foi detectado nenhum gene relacionado a estes fenótipos de resistência. Quanto aos fatores de virulência testados nos 178 enterococos, 63 isolados amplificaram para o gene esp, 12 para ace e 2 para gelE. Os genes agg e cylA não foram detectados. Na análise fenotípica dos fatores de virulência, os dois E. faecalis positivos para gelE também foram positivos para a degradação da gelatinase e 130 enterococos apresentaram capacidade de hidrolisar hemácias. Para investigar a produção de substância antagonista, foram selecionados 26 enterococos; destes, 15 apresentaram atividade contra a bactéria indicadora Listeria monocytogenes. Oitenta e seis isolados foram selecionados para avaliar a relação clonal por PFGE, e foi possível observar a partir do dendrograma que os enterococos no TGI dos imaturos têm origem alimentar e materna. Conclui-se que os enterococos provenientes de amostras fecais de imaturos de H. erato phyllis possuem poucos genes relacionados a mecanismos de virulência comuns na área clínica. É possível que os Enterococcus produtores de substância antagonista desempenhem um papel importante no equilíbrio das comunidades microbianas do TGI deste inseto, e que ocorra a transferência vertical de micro-organismos das fêmeas para a prole para a espécie H. erato phyllis. / Enterococcus is present in the gastrointestinal (GI) tract of vertebrates and invertebrates, which can acquire these bacteria through mechanisms of horizontal and vertical transfer of microrganisms. Recent research has described the presence of Enterococcus in Lepidoptera, but studies with butterflies of the genus Heliconius are scarce. This study had as objective, from a bacterioteca of 178 Enterococcus sp. previously isolated from fecal samples of immature Heliconius erato phyllis detect the presence of resistance and virulence genes by PCR; phenotypically assess the virulence factors and the production of compounds with antimicrobial activity; and to evaluate the clonal profile of the strains by PFGE. Of the 178 enterococci, 55 were resistant to erythromycin and 11 resistant to norfloxacin and/or ciprofloxacin, however was not detected any gene related to these resistance phenotypes. The virulence factors were tested in 178 enterococci, and 63 isolated amplified for the esp gene, 12 for ace and 2 for gelE. The agg and cylA genes were not detected. In the phenotypic analyzes, both E. faecalis positive to gelE gene were also positive for the degradation of gelatinase, and 130 enterococci showed ability to hydrolyze red blood cells. To investigate the production of antagonistic substance, 26 enterococci were selected and of these, 15 showed activity against the indicator bacteria Listeria monocytogenes. Eighty-six isolates were selected to evaluate the clonal profile by PFGE, and it was possible to observe in the dendrogram that the origin of the enterococci in GIT of immatures was the herbivory and maternal origin. It is concluded that the enterococci from fecal samples of immature H. erato phyllis possess few mechanisms of virulence-related genes, common in the clinical area. It is possible that the antagonistic substance-producing enterococci could play an important role in the equilibrium of the microbial communities of the GIT of this insect, and there is vertical transmission of enterococci from females to their offspring to the specie H. erato phyllis.
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Digestibilidade ruminal obtida com digesta omasal, perfil de degrada??o obtido por esvaziamento ruminal e estimativa da fra??o digest?vel da fibra em detergente neutro de volumosos para bovinos / Ruminal digestibility obtained with omasal digesta, degradation profile obtained by rumen emptying and estimate of digestible fraction of neutral detergent fiber in forages for cattleRibeiro, Rodrigo Corn?lio de Oliveira 28 February 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / Funda??o de Amparo ? Pesquisa do estado de Minas Gerais (FAPEMIG) / Instituto Nacional de Ci?ncia e Tecnologia de Ci?ncia Animal (INCT-CA) / Um experimento foi realizado com o objetivo de estimar o consumo, a digestibilidade total e as taxas de digest?o (kd) e de passagem (kp) ruminal dos nutrientes de dietas constitu?das exclusivamente por volumosos. Avaliaram-se tamb?m algumas equa??es para predizer a digestibilidade da fibra destes alimentos para bovinos de corte. Foram utilizados cinco bovinos mesti?os Holand?s x Zebu, machos n?o castrados, fistulados no r?men, com peso corporal (PC) m?dio inicial de 458,5 ? 32,5 kg, distribu?dos em delineamento experimental em quadrado latino 5 x 5 balanceado para efeito residual. O experimento foi constitu?do de cinco per?odos experimentais, com dura??o de dezesseis dias cada um, sendo sete dias destinados ? adapta??o dos animais ?s dietas e os outros nove para a realiza??o das coletas. As dietas experimentais foram constitu?das de cinco volumosos, sendo utilizadas as silagens de milho (SM, Zea mays, L.), de capim-elefante (SCE, Pennisetum purpureum Schum) e de capim-braqui?ria (SCB, Brachiaria decumbens), a cana-de-a??car in natura (CA, Saccharum officinarum L.) e o feno de capim-tifton 85 (TF85, Cynodon spp.). Utilizou-se a mistura de ureia/sulfato de am?nio na propor??o de 9:1 para manter as dietas isoproteicas (11% de PB). Os dados foram analisados utilizando o procedimento MIXED do SAS (vers?o 9.1), utilizando-se o teste de Tukey e 0,05 como n?vel cr?tico de probabilidade para o erro tipo I. O consumo de mat?ria seca (CMS) foi maior (P<0,05) para os animais alimentados com SM quando comparado aos animais que receberam CA. Maiores (P<0,05) valores para o consumo de FDNcp foram observados para os animais alimentados com SM, SCB, SCE e FT85. N?o houve diferen?a (P>0,05) para os coeficientes de digestibilidade aparente da MS, MO, PB e CNF entre os volumosos avaliados. A digestibilidade da FDNcp foi maior (P<0,05) para os animais alimentados com SCB, SCE e FT85 em rela??o aos alimentados com CA. Maior (P<0,05) valor para o coeficiente de digestibilidade ruminal (CDR) da FDNcp foi observado para os animais que receberam SCB, SCE e FT85 em rela??o aos que consumiram CA. N?o houve diferen?a (P>0,05) para o Pool (kg/dia) e para a kp (h-1) da FDNcp entre os diferentes volumosos avaliados. A efici?ncia microbiana (g/kg NDT) foi maior (P<0,05) para os animais alimentados com SCB (147,08 g/kg NDT). Houve intera??o (P<0,05) entre os efeitos de tratamento e tempo de mensura??o do pH ruminal. Os valores de pH no l?quido ruminal apresentaram comportamento quadr?tico em fun??o do tempo e os valores m?ximos de 6,72; 7,10; 7,06 e 6,92 foram estimados nos tempos de 9,45; 10,99; 11,13 e 12,00 horas ap?s a alimenta??o para as dietas contendo SM, SCB, SCE, e FT85, respectivamente. Os valores de pH para CA apresentaram comportamento linear decrescente em fun??o do tempo. Conclui-se que o uso exclusivo de volumosos tropicais nas dietas de bovinos, com exce??o da cana-de-a??car in natura, proporcionam consumo e digestibilidades dos nutrientes satisfat?rios, visto que dietas com 11% de PB atendem as exig?ncias m?nimas de compostos nitrogenados para os microrganismos ruminais maximizarem a digest?o da fibra em detergente neutro. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Zootecnia, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2013. / ABSTRACT
This experiment was conducted to estimate the nutrient intake, total digestibility, ruminal digestion (kd) and passage (kp) rates of nutrient from diets containing only forages. Equations to predict the fiber digestibility of feed for beef cattle were also evaluated. There had been used five crossbred Holstein x Zebu steers, fistulated in rumen, with body weight (BW) ranging 458.5 ? 32.5 kg, distributed in Latin square experimental design 5 x 5 balanced for residual effects. The experiment consisted of five experimental periods, lasting sixteen days each, being seven days for adaptation animals to the diets and the other nine to perform the collection. The experimental diets were composed of five forages, being maize silage - SM (Zea mays, L.), elephant grass - SCE (Pennisetum purpureum Schum); Brachiaria grass silage - SCB (Brachiariadecumbens); the sugar cane in natura - CA (Saccharum officinarum L.); and Tifton hay 85 - FT85 (Cynodon spp.). A mixture of urea/ammonium sulfate was used in a 9:1 ratio to maintain diets isonitrogenated (11% CP). Data were analyzed using the MIXED procedure of SAS (version 9.1), using the Tukey test and 0.05 as the critical level of probability for Type I error. The dry matter intake (CMS) was higher (P <0.05) for animals fed with SM when compared to animals receiving CA. Higher (P <0.05) values for the FDNcp intake were observed for animals fed with SM, SCB, SCE and FT85. There was no difference (P> 0.05) for apparent digestibility coefficients of MS, MO, PB and CNF among forages evaluated. The digestibility of FDNcp was higher (P <0.05) for animals fed with SCB, SCE and FT85 than those fed with CA. Greater (P <0.05) value for ruminal digestibility (CDR) of FDNcp was observed for animals receiving SCB, SCE and FT85 compared to those fed CA. No differences were observed (P> 0.05) for Pool (kg/day) and kp (h-1) from FDNcp among the different forage evaluated. The microbial efficiency (g/kg NDT) was higher (P <0.05) in animals fed with SCB (147.08g/kg NDT). There was an interaction (P <0.05) between the effects of treatment and time of measurement of ruminal pH. The pH of the rumen fluid showed a quadratic function of time and the maximum values of 6.72, 7.10, 7.06 and 6.92 being estimated at the times of 9.45, 10.99, 11.13 and 12.00 hours after feeding for the diets containing SM, SCB, SCE, and FT85, respectively. The pH values for CA linearly decreased in function of time. We conclude that the exclusive use of tropical forages in the diets of cattle, with the exception of sugar cane in natura, provide a satisfactory intake of digestible nutrients, whereas diets with 11% CP meet the minimum requirements for nitrogen compounds for ruminal microorganisms maximize the digestion of neutral detergent fiber.
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