A identificação e o monitoramento de microorganismos aquáticos, como bactérias e microalgas, tem sido uma tarefa árdua e morosa. Técnicas convencionais, com uso de microscópios e corantes, são complexas, exigindo um grande esforço por parte dos técnicos e pesquisadores. Uma das maiores dificuldades nos processos convencionais de identificação via microscopia é o elevado número de diferentes espécies e variantes existentes nos ambientes aquáticos, muitas com semelhança de forma e textura. O presente trabalho tem por objetivo o desenvolvimento de uma metodologia para a caracterização e classificação de microorganismos aquáticos (bactérias e microalgas), bem como a determinação de características cinemáticas, através do estudo da mobilidade de microalgas que possuem estruturas que permitem a natação (flagelos). Para caracterização e reconhecimento de padrões as metodologias empregadas foram: o processamento digital de imagens e redes neurais artificiais (RNA). Para a determinação da mobilidade dos microorganismos foram empregadas técnicas de velocimetria por processamento de imagens de partículas em movimento (Particle Tracking Velocimetry - PTV). O trabalho está dividido em duas partes: 1) caracterização e contagem de microalgas e bactérias aquáticas em amostras e 2) medição da velocidade de movimentação das microalgas em lâminas de microscópio. A primeira parte envolve a aquisição e processamento digital de imagens de microalgas, a partir de um microscópio ótico, sua caracterização e determinação da densidade de cada espécie contida em amostras. Por meio de um microscópio epifluorescente, foi possível, ainda, acompanhar o crescimento de bactérias aquáticas e efetuar a sua medição por operadores morfológicos. A segunda parte constitui-se na medição da velocidade de movimentação de microalgas, cujo parâmetro pode ser utilizado como um indicador para se avaliar o efeito de substâncias tóxicas ou fatores de estresse sobre as microalgas. O trabalho em desenvolvimento contribuirá para o projeto "Produção do Camarão Marinho Penaeus Paulensis no Sul do Brasil: Cultivo em estruturas Alternativas" em andamento na Estação Marinha de Aquacultura - EMA e para pesquisas no Laboratório de Ecologia do Fitoplâncton e de Microorganismos Marinhos do Departamento de Oceanografia da FURG. O trabalho propõe a utilização dos níveis de intensidade da imagem em padrão RGB e oito grandezas geométricas como características para reconhecimento de padrões das microalgas O conjunto proposto de características das microalgas, do ponto de vista de grandezas geométricas e da cor (nível de intensidade da imagem e transformadas Fourier e Radon), levou à geração de indicadores que permitiram o reconhecimento de padrões. As redes neurais artificiais desenvolvidas com topologia de rede multinível totalmente conectada, supervisionada, e com algoritmo de retropropagação, atingiram as metas de erro máximo estipuladas entre os neurônios de saída desejados e os obtidos, permitindo a caracterização das microalgas.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-07-14Bitstream added on 2014-06-13T18:55:49Z : No. of bitstreams: 1 oliveira_cf_me_jabo.pdf: 346938 bytes, checksum: 4899f13a99bb080af03657b84504252d (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Este trabalho teve o objetivo de avaliar a eficácia de uma nova ferramenta de gestão da qualidade do leite cru refrigerado, comparativamente à utilização dos testes tradicionais de controle, nas condições da Instrução Normativa 51 (IN 51). Foram utilizadas 374 amostras individuais de leite cru refrigerado (produtor) e 125 amostras de leite cru de conjunto (bocas de tanques de caminhões transportadores, referindo-se a leites desses mesmos produtores). As amostras foram submetidas a duas análises microbiológicas, sendo as individuais submetidas à prova rápida de redução em tubos – o “Tetra-Test”, com o objetivo de estimar a carga microbiana do leite e a microbiota predominante, enquanto as amostras de conjunto foram submetidas à contagem padrão em placas (CPP) como método de referência. Paralelamente, buscou-se verificar os efeitos do processo de centrifugação nas características e/ou propriedades da matériaprima industrial durante a execução do processo por Ultra Alta Temperatura (UAT). Foram utilizadas 56 amostras de leite provenientes da linha de processamento, tomadas imediatamente antes e depois da etapa de centrifugação interposta no início do processo, as quais foram submetidas a ambos os testes microbiológicos (“Tetra- Test” e CPP), além da determinação da variabilidade da composição do leite e determinação do índice proteolítico da k-caseína. O “Tetra-test” se mostrou eficaz na avaliação da qualidade microbiológica do leite cru podendo ser utilizado como uma ferramenta de gestão, uma vez que seus resultados se correlacionaram proporcionalmente aos obtidos pela CPP e possibilitaram informações complementares sobre as características da microbiota dominante, oferecendo vantagens sobre os tradicionais testes de redução. Os resultados mostraram que grande... / This study aimed to evaluate the efficacy of a new tool for quality management of refrigerated raw milk, compared to traditional control tests in accordance to the Brazilian Ministry of Agriculture, Livestock and Food Supply (MAPA) Normative Instruction No. 51. A total of 374 individual samples of refrigerated raw milk (from producers) and 125 samples of bulk raw milk (from milk transport tankers from these same producers) were studied. Samples were submitted to microbiological analyses, being individual samples submitted to rapid reduction in test tubes - the Tetra-Test, in order to estimate the microbial load of milk and predominant microbiota, while the bulk samples were analyzed by standard plate count as a reference method. At the same time, it was investigated the effects of the centrifugation on the characteristics and/or properties of industrial raw material into the incoming of UHT process. Were analyzed 56 samples of milk from the processing line, obtained immediately before and after centrifugation performed early in the process. Both of them were subjected to microbiological tests (Tetra-Test and PCA). In addition it was determined the variability of milk composition and proteolytic rate of k-casein. The “Tetra-test showed to be effective in assessing the microbiological quality of raw milk and can be used as a management tool, since its results correlated proportionally with those obtained by standard plate count and make possible to obtain more information about predominant... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-07-15Bitstream added on 2014-06-13T18:31:36Z : No. of bitstreams: 1 salvia_acrd_me_sjc.pdf: 748582 bytes, checksum: c8eb5b5ba196067377171ac7b51599c6 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Considerando-se que portadores de anemia falciforme apresentam relatado aumento da suscetibilidade às infecções e que reservatórios bucais de microrganismos patogênicos podem representar uma porta de entrada para doenças, a avaliação da microbiota bucal potencialmente patogênica ganha relevância. O objetivo deste estudo foi avaliar a presença de leveduras do gênero Candida, estafilococos, enterobactérias e Pseudomonas spp. na cavidade bucal de pacientes com anemia falciforme em tratamento com hidroxiuréia, comparando os resultados com indivíduos controle. Foram incluídos no estudo 69 pacientes, com idades entre 15 a 60 anos, portadores de anemia falciforme, confirmados por exames clínicos e laboratoriais. Estes foram divididos em dois grupos: em tratamento com hidroxiuréia (HU) por no mínimo 90 dias (n=30); sem tratamento com HU (n=39). Foram também incluídos dois grupos controle pareados (controle I e II, respectivamente), sendo indivíduos saudáveis com perfil semelhante (quanto à idade, sexo e condições bucais) aos dos grupos em estudo. Não foram incluídos pacientes diabéticos, portadores de próteses bucais totais, outras doenças sistêmicas e que estivessem sob terapia com medicamentos que podem interferir com as condições bucais. Foram realizados exame clínico, anamnese e coleta de enxágüe bucal de cada paciente. Este foi semeado em meios de cultura específicos para cada microrganismo e, após incubação, foram obtidos valores de UFC/mL. Os isolados foram identificados pelo sistema API. A prevalência das espécies de microrganismos isolados foi comparada entre os grupos anemia falciforme com HU (AnF/HU+), sem HU (AnF/HU-) com seus respectivos controles. Foram realizados testes de suscetibilidade aos antimicrobianos segundo metodologia CLSI. Não foram observadas diferenças estatisticamente significativas entre as contagens de estafilococos... / Considering that sickle cell anemia patients have reported increased susceptibility to infections and oral reservoirs of pathogens may represent a gateway for disease, evaluation of potentially pathogenic oral flora becomes relevant. The aim of this study was to evaluate the presence of Candida species, staphylococci, Enterobacteriaceae and Pseudomonas spp. in the oral cavity of patients with sickle cell disease under treatment with hidroxyurea (HU), comparing the results with control subjects. The study included 69 patients aged 15-60 years, with sickle cell disease, confirmed by clinical and laboratory examinations. These were divided into two groups:under treatment with HU for at least 90 days (n=30), and without HU (n=39). Two matched controls (control I and II, respectively), composed of healthy individuals with similar profile (age, gender and oral conditions) to the study groups were included. Diabetic patients, patients with dentures, and other systemic diseases and those under treatment with medications that can interfere with oral conditions were not included. Clinical examination and anamnese were performed and mouthrinse sample was collected from each patient. The sample was plated into specific culture media for each microorganism and, after incubation values of cfu/ml were obtained. Isolates were identified by API system. The prevalence of the species were compared between groups with sickle cell anemia HU (AnF/HU+) and without HU (AnF/HU-) and the respective control groups. Antimicrobial susceptibility testings were performed according to the CLSI methodology. There were no statistically significant differences counts of staphylococci and Enterobacteriaceae/Pseudomonas between the groups AnF/HU+ and AnF/HU- and the respective control groups. Significant differences in the counts of yeasts were observed between AnF/HU- group and the respective control, however... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:02:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2846.pdf: 2305406 bytes, checksum: bdcfa4a73d44c510ec83c2cb9347cfaf (MD5) Previous issue date: 2009-12-11 / The need for new and useful compounds to provide assistance and relief in all aspects of human condition is ever-growing. Drug resistance in bacteria, the appearance of life-threatening viruses, and the increase in the incidence of fungal infections in the world s population all underscore our inadequacy to cope with these medical problems. Endophytic microorganisms that colonize internal tissues of plants without causing any negative effects are relatively unstudied as potential sources of novel natural products for medical and commercial exploitation. The Streptomycetes provide nearly 80% of all the world s antibiotics produced. The aim of this work was to investigate the Brazilian tropical savannah tree Solanum lycocarpum St. Hill (Lobeira) in São Carlos, in order to isolate the endophytic microorganisms associated with the plant, separating and purifying the bioactives substances produced by the endophytic microorganism. The bioactivity of S. tubercidicus against pathogenic microorganisms was analyzed. The obtained results point out the antagonistic potential of the endophytic isolated against microorganisms of interest in Public Health. The brute extract fresh produced by S. tubercidicus RND-C it presented antimicrobial potential maximum of 200 UA.mL-1 against Escherichia coli ATCC 25922 and Staphylococcus aureus ATCC 25923 after 48 h of cultivation; The bioactive substances produced by S. tubercidicus were submitted to different thermal and enzymatic treatments and pH variation to be determined the nature of the bioactive compounds. After it being submitted to enzymatic treatment with amylase and pepsin, the concentrated extract stayed bioactive, suggesting the lipidic and no-prothein nature of the bioactive substances. Already the active compounds against E. coli suggests the presence of a substance of glycidic and lipidic nature, due to resistance to the action of the enzyme invertase and lipase, respectively, suggesting that the substances contained in the brute extract of S. tubercidicus RND-C against E.coli can be a ´glycolipid. The concentrated extract stayed active biologically when exposed to lower (-20 and -80 ºC) and high (100 and 121 ºC) temperatures, suggesting that the bioactive compounds produced are not subject to spontaneous degradation. The extract stayed active against E. coli in acidity conditions (pH, 2,0 - 5,0) and it also presented bioactivity in pH 7,0 and 8,0. In conditions of high alkalinity (pH 9,0) bioactivity was not detected. Already against S. aureus, the extract stayed assets in the strip of pH 7,0. In conditions of acidity and alkalinity the bioactive substances produced by S. tubercidicus were inactivated. The molar mass of the substances was esteemed in minor than 3,0KDa. The bioactive molecules contained in the concentrated extract produced by S. tubercidicus RNC-C were purified and separated by bio monitoring analyzes, suggesting the presence of two different substances. The evaluation of the separation using a hight performance liquid chromatography (HPLC), suggests the existence of two different substances produced by S. tubercidicus, one being active against S. aureus and the other one active against E.coli and S. aureus. In the separation by using reverse-phase chromatography (Sep-Pak), were obtained four fractions (St. 1, St. 2, St. 3 and St. 4). The fractions St. 2 and St. 4 presented antimicrobial activity against bacteria and they were purified separately by Sephadex LH-20 Gel permeation chromatography obtaining the fractions St. 2-A; St. 2- B; St. 4-A and St. 4-B. The fractions St. 2-B was activity against S. aureus. Already the fractions St. 4-B was activity against S. aureus and E. coli. These results suggest the presence of two different substances. This work intends to contribute for understanding the interactions of endophitic and plants besides opening new perspectives on the biotechnological potential of the endophitics microorganisms of plants. The investigation of new composed assets biologically starting from microorganisms brings important contributions for the discovery of new drugs. / O aumento da incidência de doenças bacterianas, virais e fúngicas enfatiza a necessidade de investigar a produção microbiana de novos compostos bioativos. Microrganismos endofíticos que colonizam tecidos internos de plantas são relativamente pouco estudados como fontes potenciais de novos produtos naturais para a exploração médica e comercial. O gênero Streptomyces tem grande importância industrial devido à capacidade de produzir muitos metabólitos secundários, respondendo por 80% dos antibióticos utilizados atualmente. Com base neste contexto, o objetivo deste trabalho foi isolar Streptomyces spp., endofítico de plantas do Cerrado, da região de São Carlos, SP, separando e purificando as substâncias bioativas produzidas pelo isolado. O endofítico Streptomyces tubercidicus foi isolado de Solanum lycocarpum St. Hill (Lobeira) relatando, pela primeira vez, o endofitismo da bactéria isolada a partir de vegetação de Cerrado de São Carlos. A bioatividade de S. tubercidicus foi avaliada e os resultados obtidos ressaltam o potencial antagônico do endofítico isolado contra microrganismos de interesse em Saúde Pública, se constituindo em uma fonte promissora para a pesquisa de novos compostos bioativos. O extrato bruto fresco produzido por S. tubercidicus RND-C apresentou potencial antimicrobiano máximo de 200 UA.mL-1 contra Escherichia coli ATCC 25922 e Staphylococcus aureus ATCC 25923 após 48 h de cultivo; As substâncias bioativas produzidas por S. tubercidicus foram submetidas a diferentes tratamentos térmicos, enzimáticos e variação de pH para determinação da natureza dos compostos bioativos. Após ter sido submetido a tratamento enzimático com amilase e pepsina, o extrato concentrado manteve-se bioativo, sugerindo a natureza lipídica e nãoproteinácea das substâncias bioativas. Já o composto ativo contra E. coli sugere a presença de substância de natureza glicídica e lípidica, devido a resistência à ação da enzima invertase e lipase, respectivamente, sugerindo que as substâncias contidas no extrato bruto de S. tubercidicus RND-C contra E.coli pode ser um glicolipídio. O extrato concentrado manteve-se biologicamente ativo quando exposto a baixas (-20 e -80 ºC) e elevadas (100 e 121 ºC) temperaturas, sugerindo que os compostos bioativos produzidos não são sujeitos a degradação espontânea. O extrato manteve-se ativo contra E. coli em condições de acidez (pH, 2,0 5,0) e também apresentou bioatividade em pH 7,0 e 8,0. Em condições de alta alcalinidade (pH 9,0) não detectou-se bioatividade. Já contra S. aureus, o extrato manteve-se ativo apenas na faixa de pH 7,0. Em condições de acidez e acalinidade as substâncias bioativas produzidas por S. tubercidicus foram inativadas. A massa molar dos compostos bioativos produzidos por S. tubercidicus RND-C foram estimadas em menor que 3,0 kDa. As moléculas bioativas contidas no extrato concentrado produzidas por S. tubercidicus RND-C foram purificadas por separação biomonitorada, sugerindo a presença de duas substâncias diferentes. A avaliação da separação usando cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC) sugere a existência de duas substâncias diferentes produzidas por S. tubercidicus, sendo duas ativas contra S. aureus e a outra ativa contra E.coli e S. aureus. Na separação por cromatografia em coluna pré-empacotada de fase reversa do tipo Sep-Pak, foram obtidas quatro frações (St. 1, St. 2, St. 3 e St. 4). As frações St. 2 e St. 4 apresentaram atividade antimicrobiana contra bactérias e foram purificadas separadamente por cromatografia de permeação em gel de Sephadex LH-20 obtendo as frações St. 2-A; St. 2-B; St. 4-A e St. 4-B. A fração St. 2-B foi ativa contra S. aureus. Já a fração St. 4-B foi ativa contra S. aureus e E. coli. Estes resultados sugerem a presença de duas substâncias diferentes. Este trabalho pretende contribuir para a compreensão das interações endófitos/plantas além de abrir novas perspectivas sobre o potencial biotecnológico dos microrganismos endofíticos de plantas. A investigação de novos compostos biologicamente ativos a partir de microrganismos traz importantes contribuições para a descoberta de novas drogas.

Submitted by Alison Vanceto (alison-vanceto@hotmail.com) on 2017-01-05T12:44:25Z No. of bitstreams: 1 TeseSEBR.pdf: 7891487 bytes, checksum: 832673a110e4eb2e8100b2052c37ef01 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2017-01-16T12:34:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseSEBR.pdf: 7891487 bytes, checksum: 832673a110e4eb2e8100b2052c37ef01 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2017-01-16T12:34:13Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseSEBR.pdf: 7891487 bytes, checksum: 832673a110e4eb2e8100b2052c37ef01 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-16T12:34:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseSEBR.pdf: 7891487 bytes, checksum: 832673a110e4eb2e8100b2052c37ef01 (MD5) Previous issue date: 2016-10-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) / Foodborne illness cases are common in Brazil and in the world. However, in many cases the microorganism causing the illness cannot properly identified. In addition, traditional analyses usually employed for identifying such microorganisms are often expensive and time consuming. In this context, the development of novel methods capable of detecting such microorganism in a fast way, similarly to a pre-selection method to indicate the positive or negative presence of pathogenic, are highly pursued. In this work, two systems using a concept of Electronic Tongue were developed. The first system used the Layer-by-Layer (LbL) technique to immobilize lysozyme, trypsin and pepsin enzymes in nanostructured films. In the second system, the immobilization process was combined using the LbL technique and covalent bonding for lysozyme and trypsin enzymes. The trypsin and pepsin can react with bacterial sub-products released in the medium, while the lysozyme can react directly with the gram-positive bacteria cell wall. All parameters required to obtain stable films with preserved enzymatic activity were investigated and determined. In the first case, the detection of Escherichia coli using the Electrical Impedance Spectroscopy yielded detection of bacteria at 105 UFC (intermediate values). The second electronic tongue was composed by sensing units formed by lysozyme and trypsin immobilized by covalent and electrostatic (LbL) bonds, allowing the reaction with either by products or with the bacterial cell wall. Contamined solutions with the Gram-positive Staphylococcus aureus, Gram-negative Salmonella bacteria and a mixed solution with both were analyzed. The second system was able to detect small bacteria concentrations at 103 CFU. Finally, the solution re-suspension treatment showed to be beneficial for improving the detection results. The electronic tongue was capable of distinguishing solutions contaminated with bacteria, showing potential to aid in the prevention of foodbourne diseases. / Casos de intoxicação de origem alimentar causados por microrganismos são comuns no Brasil e no mundo. Contudo, em muitos dos surtos não se consegue identificar qual é o microrganismo causador da contaminação. Além disto, as análises tradicionais usualmente empregadas para identificação do microrganismo são muitas vezes caras e demoradas. Deste modo, o desenvolvimento de métodos para uma rápida detecção de microrganismos, similar a um sistema de triagem, focado em indicar se há ou não a contaminação por patogênicos antes da realização de testes específicos, são de grande interesse. Neste trabalho foram desenvolvidos dois sistemas utilizando o conceito de Língua Eletrônica. No primeiro sistema utilizou-se a técnica de Layer-by-Layer (LbL) para o crescimento de filmes nanoestruturados juntamente com a imobilização das enzimas lisozima, tripsina e pepsina. As enzimas tripsina e pepsina têm como característica reagirem com subprodutos da presença de bactérias no meio, enquanto a enzima lisozima reage diretamente com a parede celular das bactérias Gram-positivas. Foram estudados e definidos todos os parâmetros necessários para a formação de filmes estáveis mantendo as enzimas em sua forma ativa. No primeiro sistema foi avaliada a detecção de Escherichia coli utilizando a técnica de Espectroscopia de Impedância Elétrica, obtendo resultados satisfatórios na detecção das bactérias em valores intermediários de 105 UFC. O segundo sistema de língua eletrônica foi composto por unidades sensoriais com as enzimas lisozima e tripsina imobilizadas por meio de ligações covalentes e eletrostáticas (LbL), podendo ocorrer reações tanto com subprodutos da presença bacteriana quanto diretamente com a parede celular das bactérias. Foram analisadas soluções contaminadas com as bactérias Gram-positivas Staphylococcus aureus, Gram-negativas Salmonella e também a mistura de ambas, sendo possível distinguir baixas concentrações das mesmas e na ordem de 103 UFC. Por ultimo, verificou-se que o tratamento das soluções por meio da re-suspensão das bactérias influenciou positivamente nos resultados de detecção, suprimindo a influência da presença do meio de cultura nas repostas obtidas. A Língua Eletrônica apresentada foi capaz de distinguir soluções contaminadas com bactérias, tendo potencial para auxiliar na prevenção de surtos de doenças transmitida por alimento.

O objetivo deste estudo foi avaliar a suplementação de um probiótico composto por cepas de Bacillus subtilis e Bacillus licheniformis, fornecidos via sucedâneo lácteo, no que se refere ao escore e pH fecal, contagem de microrganismos intestinais, parâmetros sanguíneos e desempenho geral dos animais. Foram utilizados 24 animais da raça Holandês que receberam 4L/dia de sucedâneo comercial (15PB:15EE), além de livre acesso a água e concentrado inicial. O desaleitamento ocorreu na 8ª semana de vida. Os animais foram distribuídos em delineamento de blocos casualizados, em dois tratamentos: 1) Controle - sem a suplementação de probiótico; 2) Suplementação de 2g/d (1,6 x 109 UFC) de Bacillus subtilis e Bacillus licheniformis via sucedâneo lácteo. Semanalmente foram realizadas pesagens e aferições de medidas corporais (altura de cernelha, perímetro torácico e largura de garupa); e colheitas de sangue para determinação de glicose, proteína total, ureia e albumina, além de determinação de hematócrito. Foram colhidas amostras semanalmente para contagem de bactérias ácido láticas e enterobactérias e determinação de pH fecal. O monitoramento do consumo de concentrado e do escore fecal foi realizado diariamente. O peso corporal, o ganho de peso médio diário e as medidas corporais não foram alteradas (P>0,05) pela suplementação do probiótico contendo Bacillus subtilis e Bacillus licheniformis; muito embora tenham apresentado efeito significativo de idade dos animais (P<0,001). O escore fecal, pH fecal e consumo de concentrado diário também não foram afetados pela suplementação com probiótico. No entanto, o consumo de concentrado e o pH fecal sofreram influência da idade em resposta ao crescimento natural dos bezerros. A contagem de bactérias ácido láticas foi maior que número de enterobactérias durante todo o período (P<0,05). Apenas as enterobactérias sofreram efeito da idade (P<0,05), enquanto as bactérias ácido láticas permaneceram variando, porém dentro de um padrão constante. Os parâmetros sanguíneos também não foram afetados pela suplementação com probiótico (P>0,05) mas todos, com a exceção da albumina, tiveram influência da idade (P<0,001). A suplementação com o probiótico contendo Bacillus subtilis e Bacillus licheniformis via sucedâneo não apresentou benefícios no desempenho ou no metabolismo de bezerros leiteiros, bem como não reduziu a ocorrência de casos de diarreia. / The objective of this study was to evaluate the supplementation of a probiotic containing strains of Bacillus subtilis and Bacillus licheniformis, supplied via milk replacer, with regard to fecal score and pH, intestinal microorganisms count, blood parameters and overall performance of the animals. Twenty-four Holstein calves were utilized and received 4L/d of liquid diet consisting of commercial milk replacer (20CP:15EE), and had free access to water and starter concentrate. Weaning occurred at the 8th week of age. Animals were distributed in a randomized block design, in the following treatments: 1) Control - without supplementation with probiotic, 2) Supplementation: 2g/d of Bacillus subtilis and Bacillus licheniformis (1.6 x 109 CFU), via milk replacer. Every week calves were weighted and body measurements were taken (hip width, withers height and heart girth). Blood samples were drawn weekly for determination of hematocrit, glucose, total protein, urea and albumin. Fecal samples were weekly collected for lactic acid bacteria and enterobacteria couting and fecal pH determination. Concentrate starter intake and fecal scores were monitored daily. Body weight, average daily gain, and corporal measurements were not affected (P>0,05) by the supplementation of probiotic; however, presented a significant age effect (P<0,001). The fecal score, fecal pH and starter intake were not affected by probiotic supplementation (P>0.05). However, starter intake and fecal pH were affected by age due to calves\' natural growth. The acid lactic bacteria count was higher than the count of enterobacteria during the whole evaluation period. Only enterobacteria were affected by the age of animals, while acid lactic bacteria remained constant despite little variations. Blood parameters were also not affect by supplementation of probiotic (P>0.05), but all of them, except albumin concentrations, were influenced by age (P<0,001). The supplementation with probiotic containing Bacillus subtilis and Bacillus licheniformis via milk replacer presented no benefits in dairy calves performance or metabolism and did not reduced the occurrence of diarrhea.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:06:14Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4612_1.pdf: 285697 bytes, checksum: d717db49a0530dbe6225646ec5755740 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2007 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A rizosfera é a região do solo influenciada pelas raízes, as quais disponibilizam nutrientes através dos exsudados, afetando intensamente a atividade e o desenvolvimento dos microrganismos. Dentre esses, destacam-se os solubilizadores de P, considerados de grande importância na rizosfera por possuírem habilidade para disponibilizar, para as plantas, o fosfato insolúvel presente nos compostos. Foram coletadas amostras de solo rizosférico em áreas cultivadas com melão (Cucumis melo cv. Gold Mine) e adubadas com compostos orgânicos, na região do Vale do São Francisco, Petrolina, Pernambuco, com o objetivo de conhecer a diversidade de fungos filamentosos e avaliá-los quanto à habilidade de solubilização de fosfato. Para o isolamento dos fungos foi utilizada a técnica de diluição em série. As placas foram mantidas em temperatura ambiente (28±1 ºC) e o crescimento de colônias acompanhado por 72h. A identificação das espécies foi realizada pela análise de características macroscópicas da colônia e microscópicas dos fungos. Para avaliar a capacidade dos fungos filamentosos como solubilizadores de P, discos de micélio foram semeados em placa de Petri contendo o meio de cultura GAGES. Foram isoladas e identificadas 78 espécies, pertencentes aos gêneros Alternaria, Aspergillus, Chaetomium, Cladosporium, Curvularia, Emericella, Eupenicillium, Eurotium, Fusarium, Humicola, Monodictys, Myrothecium, Neocosmospora, Paecilomyces, Penicillium, Rhizopus, Scopulariopsis, Scytalidium, Sordaria, Talaromyces, Thielavia, Torula e Trichoderma, além de representantes de Aphyllophorales e Mycelia sterilia. Das 318 amostras de fungos avaliadas, apenas 52 apresentaram habilidade para solubilizar P: Aphyllophorales (02), Aspergillus (34), Penicillium (10) e Rhizopus (06). Os resultados contribuem para o conhecimento das espécies solubilizadoras de P em solos da região e para subsidiar pesquisas que avaliem a capacidade de fungos na solubilização dos adubos fosfatados aplicados na cultura do melão

O processo de beneficiamento do zinco, extraído em Vazante pela Companhia Mineira de Metais - CMM produz um rejeito alcalino e com baixa disponibilidade de nutrientes. Esta dissertação tem como objetivo avaliar o potencial de utilização de espécies leguminosas noduladas e micorrizadas na revegetação de barragem de rejeito da CMM. Neste sentido, foram instalados dois experimentos de campo onde foi realizado o plantio prévio de Brachiaria sp. O primeiro experimento foi composto por 36 tratamentos que foram formados por uma combinação de 17 espécies + 1 testemunha (ausência de plantas) na presença e na ausência de esterco de curral (2,0 L) na cova de plantio. Cada unidade experimental foi formada por 20 exemplares da mesma espécie que foram plantadas em covas abertas manualmente (25 x 25 x 25 cm) num espaçamento de 2 x 2 m. Todas as covas receberam a adubação básica formada por 125 g de superfosfato simples e 60 g de cloreto de potássio. Entre as 17 espécies avaliadas, 3 não pertencem a família Leguminosae e receberam, além da adubação básica, cerca de 25 g de sulfato de amônio por cobertura. O segundo experimento foi montado com o objetivo de avaliar o potencial de espécies leguminosas beneficiarem o estabelecimento e crescimento de espécies não leguminosas na revegetação de barragem de rejeito da CMM. Foram utilizadas três espécies leguminosas (Enterolobium scomburkii, Acacia mangium e Acacia holosericea) e três não leguminosas (Lithraea brasiliensis, Cinnamomum glaziovii e Eugenia jambolana) num esquema fatorial (3 x 3) + 1 testemunha, formando dez tratamentos distribuídos em blocos ao acaso com três repetições. Cada parcela foi formada por 20 plantas (10 leguminosas + 10 não leguminosas) plantadas em espaçamento 2 x 2 m e com a mesma adubação básica utilizada no primeiro experimento. Todas as espécies leguminosas utilizadas foram previamente inoculadas com estirpes selecionadas de bactérias fixadoras de Nitrogênio atmosférico e com uma mistura de fungos micorrízicos provenientes da Embrapa/Agrobiologia. Os experimentos foram avaliados quanto ao estabelecimento e crescimento de plantas (altura e diâmetro do colo) aos 4, 12 e 24 meses após o plantio. Os resultados obtidos permitem concluir que dentre as espécies avaliadas, as mais indicadas para a primeira etapa da revegetação da barragem de rejeito da CMM são: Acacia holosericea, Acacia farnesiana, Acacia auriculiformis, Mimosa caesalpiniifolia, Leucaena leucocephala, Mimosa birmucronata, Enterolobium schomburkii e Prosopis juliflora. O sucesso do consórcio de espécies leguminosas e não leguminosas depende da escolha das espécies a serem combinadas, de maneira que não exista uma efetiva competição por água, nutrientes e luz que possa prejudicar as espécies de menor plasticidade. Das combinações avaliadas, as de maiores potencialidades para o programa de revegetação das barragens de rejeito da CMM são aquelas envolvendo a espécieLithraea brasiliensis. / The ore milling process at Vazante by Companhia Mineira de Metais - CMM produce an alkaline and low nutrients content refuse. This work had the aim to evaluate the potential of nodulated and mycorrhized legumes shrubs and trees specie at the revegetation of the CMM´s tailing dam. Therefore, two field experiments were carried out at the tailing dam where Brachiaria sp. was previously seemed. The first experiment was formed by a combination of 17 specie + 1 blank (without plants) in the presence and absence of cattle manure (2.0 L) at planting pit. Each experimental unit was composed by 20 individuals of same specie which were planted in handle holes (25 x 25 x 25 cm) at 2 x 2 m lines. Each planting pit received 125 g of super phosphate and 60 g of potassium chlorate. Among the 17 species evaluated, three are not Leguminosae and also received more 25 g of ammonium sulfate by surface application. The second experiment was carried out with the aim to evaluate the potential of leguminous specie to benefit the establishment and growth of non-leguminous specie at the revegetation of the refuse dam. At this experiment three leguminous specie (Enterolobium schomburkii, Acacia mangium and Acacia holosericea) and three non-leguminous specie (Lithraea brasiliensis, Cinnamomum glaziovii and Eugenia jambolana) were combined in a factorial design (3 x 3) + 1 blank, forming 10 trataments. Each experimental unit was composed by 20 plants (10 legumes + 10 non-legumes) planted and fertilized at the same way used at the first experiment. The leguminous specie were previously inoculated and mycorrhized with efficient strains of N-fixation and a misture of mycorrhizal fungi obtained at Embrapa/Agrobiologia. The experiments were evaluated about the plants establishment and growth (height and steam diameter) at 4, 12 and 24 months after the planting time. The obtained results allowed concluding that the indicated specie, among all evaluated, to the first step of the refuse dam revegetation are: Acacia holosericea, Acacia farnesiana, Acacia auriculiformis, Mimosa caesalpiniifolia, Leucaena leucocephala, Mimosa birmucronata, Enterolobium schomburkii e Prosopis juliflora. The success of the combination of leguminous and non-leguminous specie depends to the choice of the specie to avoid competition by water, nutrients and light which may damage the specie with less plasticity. Among all evaluated combinations the more potentiality one to the CMM´s tailing dam revegetation are which envolving L. brasiliensis.

Neste trabalho foi empregada uma metodologia rápida e eficiente para a identificação de metabólitos fitotóxicos produzidos por microrganismos. O isolamento do composto bioativo foi guiado através de bioensaio com Lemna minor. A espectrometria de massas, em especial o LC-MS, foi utilizada para acelerar o processo de identificação do composto ativo. As bactérias estudadas eram simbióticas do fungo fitopatogênico Sclerotium rolfsii. Seus respectivos extratos orgânicos obtidos de culturas em meio BD (batata dextrose) foram submetidos ao ensaio de fitotoxicidade com Lemna minor. Entre cinco bactérias foi selecionada a bactéria Burkholderia sp, a qual apresentou maior atividade no ensaio de fitotoxicidade. O fracionamento por cromatografia em coluna de sílica propiciou a identificação de uma fração ativa. A fitotoxina foi caracterizada como sendo um macropentólido de 20 membros. O composto pertence à classe dos polihidroxibutiratos (PHBs). Sua estrutura foi determinada por RMN 1H, RMN 13C, HMQC, HMBC, IV, ESI-MS/MS e também por comparação com dados da literatura. Esse composto nunca foi isolado de fontes naturais. Foi descrito na literatura uma rota sintética para sua obtenção, porém esta é a primeira vez que sua atividade fitotóxica é relatada. Este trabalho mostra uma nova perspectiva para o emprego de PHBs de baixo peso molecular e apresenta uma proposta de estrutura de composto fitotóxico que pode servir de modelo para a síntese de novos herbicidas. / In this work a quick and efficient methodology was employed for the identification of phytotoxic metabolites produced by microorganisms. The isolation of the bioactive compound was guided by Lemna minor bioassay. Mass spectrometry, especially LC-MS, was used to accelerate the process of identification of the phytotoxin. All bacteria were symbiotic to the phytopatogenic fungi Sclerotium rolfsii.. The bacterium Burkholderia sp was selected among the five bacteria analyzed, due to its greater phytotoxic activity in the bioassay. The phytotoxin was characterized as a 20 member macropentolide. This compound belongs to the polyhidroxybutirates (PHBs) chemical class. Its structure was determined by NMR1H, NMR 13C, HMQC, HMBC, IV, ESI-MS/MS and HRMS. It has never been isolated from natural sources before. Although a synthetic route has been proposed in the literature this is the first time that its phytotoxic activity is reported. This work leads to a new perspective for the application of low molecular weight PHBs and propose a phytotoxic structure that can be used as a model for the synthesis of new herbicide class.

Submitted by Helena Bejio (helena.bejio@unioeste.br) on 2018-09-25T13:20:32Z No. of bitstreams: 2 Douglas_Galhardo_2018.pdf: 982353 bytes, checksum: 4d411ffa02cb37bcc4a579e85a867335 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-25T13:20:32Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Douglas_Galhardo_2018.pdf: 982353 bytes, checksum: 4d411ffa02cb37bcc4a579e85a867335 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-03-08 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The honey produced in the west region of Paraná, due to its physical-chemical qualities and the agro-industry organization, which involves its processing and commercialization, obtained the seal of Indication of Provenance. The objective of this study was to characterize the physicochemical characterization, phenolic compounds, antioxidant activity and the microbiological quality of 67 honey samples of Apis mellifera collected in 14 municipalities located in the West region of the state of Paraná, southern Brazil. The physico-chemical analyzes were: moisture, pH, hydroxymethylfurfural, acidity, protein, ashes, total sugars, reducing sugars, sucrose, color, electrical conductivity and also the total phenol, flavonoids and antioxidant activity were evaluated. FRAP, ABTS and DPPH. Microbiological quality was evaluated by counting coliforms at 35ºC and at 45ºC, mesophilic aerobic bacteria, Clostridium spp., total counts of molds and yeasts. The minimum and maximum values, medians, means and quartiles were calculated. The use of non-metric multidimensional scaling (NMDS) was used to test the differences of the parameters between different samples of honey. The microbiological quality of the analyzed honey samples presented adequate values for human consumption. Five genus of mold were isolated: Cladosporium spp., Phoma spp., Aspergillus spp., Fusarium spp. and Penicillium spp., commonly found in honey. The physico-chemical evaluations were mostly within the specifications determined by national and international legislation. The mean values were 18.75% for moisture, pH of 3.26, HMF of 10.79 mg.kg-1, acidity of 34.54 meq.kg-1, protein content of 0.28%, ash of 0.14%, total sugars of 69.09%, reducing sugars of 64.57%, sucrose of 4.28%, and 340.10 μS.cm-1 for conductivity. The color on the Pfund scale showed 0.26 mm, with a predominance of lighter shades, which favors the acceptability and commercialization of honey produced in the region. The total phenolic compounds were analyzed by Folin-Ciocalteu and flavonoids by the complexation method with aluminum chloride, with a mean content of 34.83 mgGAE.100 g-1 and 16.26 mgEQ.100 g-1, respectively. The antioxidant activity of honey samples presented a mean value of 0.12 μmolET. g-1 for DPPH of 1.01 μmolET. g-1 ABTS +, and 2.68 μmolSFE. g-1 for FRAP. The analyzes presented the formation of two groups for microbial evaluation, with a large group with 64 samples and one isolated group, highlighting the total coliform values. In relation to the physical-chemical parameters, bioactive compounds and antioxidant activity, the analysis verified the formation of nine groups, behaving similarly in relation to some parameters. The evaluations showed that the samples of the municipalities evaluated presented great similarity. These results are important to confirm the quality of the honey produced in the West of Paraná / O mel produzido na região Oeste do Paraná, devido as suas qualidades físico-químicas e a organização agroindustrial, que envolve seu processamento e comercialização obteve o selo de Indicação de Procedência. Assim este estudo avaliou as características físico-químicas, compostos fenólicos, atividade antioxidante e a qualidade microbiológica de 67 amostras de mel de Apis mellifera, coletadas em 14 municípios localizados na região Oeste do estado do Paraná, Sul do Brasil. Foram submetidas a análises físico-químicas: umidade, pH, hidroximetilfurfural, acidez, proteína, cinzas, açúcares totais, açúcares redutores, sacarose, cor, condutividade elétrica e também foi avaliado fenóis totais, flavonoides e a atividade antioxidante pelos métodos de FRAP, ABTS e DPPH. A qualidade microbiológica foi realizada, avaliando a contagem de coliformes a 35ºC e a 45ºC, bactérias aeróbias mesófilas, Clostridium spp., contagem total de mofos e leveduras. Foram calculados os valores mínimos e máximos, medianas, médias e quartis. O emprego do escalonamento não métrico multidimensional foi utilizado para testar as similaridades dos parâmetros entre diferentes amostras de mel. A qualidade microbiológica das amostras de mel analisadas apresentou valores adequados para consumo humano. Foram isolados cinco gêneros de mofo: Cladosporium spp., Phoma spp., Aspergillus spp., Fusarium spp. e Penicillium spp., comumente encontrados no mel. As avaliações físico-químicas em sua maioria encontraram-se dentro das especificações determinadas pelas legislações nacional e internacional. Os valores médios foram de 18,75% para umidade, pH de 3,26, HMF de 10,79 mg.kg-1, acidez de 34,54 meq.kg-1, teor de proteína de 0,28%, cinzas de 0,14%, açúcares totais de 69,09%, açúcares redutores de 64,57%, sacarose de 4,28% e 340,10 µS.cm-1 para condutividade. A cor na escala Pfund apresentou 0,26 mm, havendo uma dominância de tonalidades mais claras, o que favorece a aceitabilidade e comercialização do mel produzido na região. Os compostos fenólicos totais foram analisados pelo Folin-Ciocalteu e flavonoides pelo método de complexação com cloreto de alumínio, apresentando teor médio de 34,83 mgGAE.100 g-1 e 16,26 mgEQ.100 g-1, respectivamente. A atividade antioxidante das amostras de mel apresentou valor médio de 0,12 µmolET. g-1 para DPPH, de 1,01 µmolET. g-1 ABTS+, e de 2,68 µmolSFE. g-1 para FRAP. As análises apresentaram a formação de dois grupos para avaliação microbiana, ocorrendo um grande grupo com 64 amostras e um grupo isolado, destacando os valores de coliformes totais. Em relação aos parâmetros físico-químicos, compostos bioativos e atividade antioxidante, a análise verificou a formação de nove grupos, comportando-se de modo semelhantes em relação a alguns parâmetros. As avaliações apresentaram que as amostras de mel dos 14 municípios possuem grande similaridade. Esses resultados são importantes para confirmar a qualidade do mel produzido no Oeste do Paraná.