Submitted by Alessandra Vallim Lima null (alessandra_vallim@hotmail.com ) on 2017-05-31T22:11:33Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Alessandra Vallim Lima .pdf: 2351386 bytes, checksum: 01dcf435983f13dde4b1a10a638fb67f (MD5) / Rejected by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo a orientação abaixo: O arquivo submetido está sem a ficha catalográfica. A versão submetida por você é considerada a versão final da dissertação/tese, portanto não poderá ocorrer qualquer alteração em seu conteúdo após a aprovação. Corrija esta informação e realize uma nova submissão com o arquivo correto. Agradecemos a compreensão. on 2017-06-02T13:17:01Z (GMT) / Submitted by Alessandra Vallim Lima null (alessandra_vallim@hotmail.com ) on 2017-06-02T20:48:13Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Alessandra Vallim Lima .pdf: 2354245 bytes, checksum: f5af019776c7b37355d3bef2ad53b87f (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-06-06T14:03:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 lima_av_me_svic.pdf: 2354245 bytes, checksum: f5af019776c7b37355d3bef2ad53b87f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-06T14:03:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 lima_av_me_svic.pdf: 2354245 bytes, checksum: f5af019776c7b37355d3bef2ad53b87f (MD5) Previous issue date: 2017-05-02 / Nas ultimas décadas, modelagem de nicho ecológico vem recebendo maior atenção em diversas áreas da biologia devido a evolução dos computadores pessoais e aumento dos dados disponíveis utilizados para a modelagem. Os resultados obtidos podem ser utilizados em ações preventivas, tais quais manejo de espécie e acompanhamento da distribuição de espécies invasoras. Desde o aumento dessa popularidade, diversos algoritmos estão disponíveis e testes estão em andamento para averiguar suas performances em relação a diferentes filos. Invertebrados marinhos, mais especificamente cnidários, apresentam poucos estudos nesse ramo, devendo receber mais atenção nos próximos anos devido ao aumento global das populações de aguas vivas (blooms), e branqueamento em quase todos os recifes de corais. Devido a essa lacuna em informação, este grupo foi escolhido para comparar três algoritmos. Utilizamos o MAXENT, GARP e AquaMaps em suas formas de desktop e os selecionamos baseado em outros estudos comparando algoritmos. Utilizamos diferentes organismos do filo cnidária, Lychnorhiza lucerna, Chrysaora lactea, Phyllorhiza punctata, Tamoya haplonema, Ceriantheomorphe brasiliensis e Mussismilia hispida, para comparar os algoritmos e averiguar qual demonstrou melhor performance. Nossos resultados mostram que o MAXENT superou os outros algoritmos tanto com relação a Área Sob a Curva ROC (AUC), quanto com relação aos mapas de distribuição. O GARP apresentou resultados variados com mapas generalizados e AquaMaps foi o menos confiável. Nossos resultados são similares aqueles encontrados em diversas publicações, significando então, que o MAXENT é o algoritmo mais confiável em se tratando da modelagem de nicho desses organismos. / Recently, ecological niche modelling has been receiving more attention in several areas in biology, due to the evolution of personal computers, and the increasing availability of data used in modelling. The results obtained can be used in preventive actions such as species management and invasive species distribution. Since its increasing popularity, several algorithms are available and undergoing tests regarding their performance towards different phylum. Marine invertebrates, more specifically cnidarians, present few studies on this field, and should receive closer attention in the next years due to worldwide increases in jellyfish population (blooms), and bleaching in almost every known shallow water coral reef. Because of this gap of information, we chose this still poor studied group to compare three algorithms. We used MAXENT, GARP and AquaMaps in its desktop form and selected them based on other studies comparing algorithms. Our aim was to, based on different organisms of the phylum Cnidaria, Lychnorhiza lucerna, Chrysaora lactea, Phyllorhiza punctata, Tamoya haplonema, Ceriantheomorphe brasiliensis and Mussismilia hispida, compare those algorithms and examine which one performed the best. Our results shown that MAXENT outperformed the other algorithms both regarding de Area Under the ROC Curve (AUC) and the map distribution. GARP show varying results with generalized maps and AquaMaps was the least accurate of them. Our results are similar to those found in other papers, thus meaning that MAXENT is the most reliable software when it comes to modelling these animals.

Orientador: Ananda Virginia de Aguiar / Resumo: Myracrodruon urundeuva é uma espécie madeireira natural com grande potencial de uso comercial no Brasil, principalmente nas regiões do Pantanal, do Cerrado e da Caatinga, onde ocorre a exploração de espécies nativas. A exploração intensiva tem causado grande perda de indivíduos e o isolamento de populações em ilhas, devido à fragmentação do habitat da espécie. Assim, a adoção de estratégias para conservação ex situ de espécie nativas torna-se indispensável. Duas propostas foram idealizadas neste trabalho. A primeira foi estimar a variabilidade genética e ganho genético com a seleção de um teste de progênies. O teste de progênie consorciado com as espécies Myracrodruon urundeuva, Terminalia argentea e Astronium fraxinifolium, foi instalado em 12 de julho de 1994 na Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão (FEPE), do campus de Ilha Solteira (FEIS/UNESP) na cidade Selvíria – MS. O delineamento utilizado foi o de blocos completos casualizados, contendo 28 progênies, seis plantas por parcela e quatro repetições para as espécies instaladas. Os caracteres altura e diâmetro a altura do peito (DAP) foram mensurados aos 24 anos após o plantio. Verificou-se a existência de variação genética significativa entre as progênies para os caracteres analisados. A alta taxa de sobrevivência indica boa adaptação da espécie em testes consorciados. As estimativas do coeficiente de variação genética tiveram resultados de 19,41% e 17,26% para DAP e altura, em nível de indivíduo, e de 9,7% e 8,63%, entr... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Myracrodruon urundeuva is a natural timber species with great potential for commercial use in Brazil, especially in the Pantanal, Cerrado and Caatinga regions, where native species are exploited. Intensive exploitation has caused great loss of individuals and the isolation of populations on islands due to the fragmentation of the species' habitat. Thus, the adoption of strategies for ex situ conservation of native species becomes indispensable. Two proposals were conceived in this work. The first was to estimate the genetic variability and genetic gain with the selection of a progeny test. The progeny test consortium with the species Myracrodruon urundeuva, Terminalia argentea and Astronium fraxinifolium, was installed on July 12, 1994 at the Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão (FEPE), at the campus of Ilha Solteira (FEIS / UNESP) in the city Selvíria MS. The design was a randomized complete block, containing 28 progenies, six plants per plot and four replications for the species installed. The height and diameter of the chest height (dch) were measured at 24 years after planting. There was significant genetic variation between the progenies for the characters analyzed. The high survival rate indicates good adaptation of the species in intercropping tests. Estimates of the coefficient of genetic variation showed results of 19.41% and 17.26% for DBH and height, at the individual level, and of 9.7% and 8.63% among progenies. The individual heritabilities ranged from moderate... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Ingrid Koch / Resumo: Neste estudo, nós desenvolvemos marcadores moleculares e aplicamos abordagens integrativas em filogeografia e ecologia para investigar e descrever a história biogeográfica das chapadas da região oeste do Cerrado brasileiro. Utilizando como modelo duas espécies do gênero Rauvolfia L. (Apocynaceae, Rauvolfioideae), Rauvolfia weddelliana Müll.Arg. e Rauvolfia gracilis I.Koch & Kin.-Gouv., típicas destes ambientes, nós desenvolvemos um conjunto de marcadores nucleares microssatélites e sequenciamos espaçadores de cloroplasto, com os quais estimamos métricas de diversidade genética e estruturação populacional. A partir destes dados, nós reconstruímos relações filogenéticas entre as linhagens, estimamos tempos de divergência e realizamos simulações demográficas e modelos de distribuição, com o intuito de testar possíveis cenários biogeográficos. Em sequência, nós desenvolvemos modelos de distribuição potencial em escala de comunidade e análises espaciais, para estimar o impacto relativo das flutuações climáticas do Pleistoceno sobre o endemismo no Cerrado, quando comparadas a outros processos. Os resultados estão apresentados em três capítulos. No primeiro, intitulado “Development and cross-validation of microsatellite markers for Rauvolfia weddelliana Müll.Arg. (Apocynaceae) species complex”, nós descrevemos o desenvolvimento de uma biblioteca de microssatélites específica para R. weddelliana e testamos sua transferabilidade para a espécie R. gracilis. Nós isolamos dez marcadores ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In this study, we developed molecular markers and applied integrative approaches in phylogeography and ecology to investigate and describe the biogeographic history of the plateaus of the west region of the Cerrado in Brazil. Using as models two species of the genus Rauvolfia L. (Apocynaceae, Rauvolfioideae), Rauvolfia weddelliana Müll.Arg. and Rauvolfia gracilis I.Koch & Kin.-Gouv., typical from these habits, we developed a set of nuclear microsatellite markers and sequenced chloroplast spacers, which we used to estimate metrics of genetic diversity and population structure. From this data, we reconstructed phylogenetic relationships between lineages, estimated divergence times and conducted demographic simulations and distribution models, intending to test possible biogeographic scenarios. In sequence, we also developed community wise models of potential distribution and conducted spatial analysis to estimate the relative impact of climatic shifts of the Pleistocene on the endemism of the Cerrado, when compared to other processes. Our results are presented in three chapters. In the first, entitled “Development and cross-validation of microsatellite markers for Rauvolfia weddelliana Müll.Arg. (Apocynaceae) species complex”, we describe the development of a specific microsatellite library to R. weddelliana and tested its transferability to the species R. gracilis . We isolated ten transferable markers with high polymorphism content that may now be applied to genetics studies ... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6552.pdf: 3440759 bytes, checksum: 5bcd4567216dea4d0657f3b0017ffba9 (MD5) Previous issue date: 2014-12-08 / Universidade Federal de Minas Gerais / Despite the huge diversity in the Neotropical region, little is known about the biogeography of the subfamily Polistinae. This thesis is divided into three chapters which, despite their distinct specific aims, have as central target the discussion of the influence of environmental, ecological and evolutionary processes on the distribution of genetic diversity and species richness of polistines. For this end, in the first chapter is provided a wide review on the origins of Polistinae and change-promoter processes in the Neotropics. In the second chapter, possible colonization routes used by the subfamily in the Americas are proposed based on the Round-trip hypothesis. Such a hypothesis is corroborated by the recurrence of progression rules, inferred by phylogeny-distribution relationships, pointing more basal clades of several genera occurring in the Amazonian rainforest and more derived clades in eastern South America. The occurrence of an inverse progression rule for Polistes sustains a second rarer and older route from east to west. The third chapter focuses on the disjunction between Amazonia and Atlantic Forest and on the species that, due to changes in forest distributions, had their populations fragmented. It is provided in this study a wide list with 127 Neotropical taxa with disjunct lineages between both forests, climate stability models for eight species (two paper wasps and six vertebrates) and extensive phylogeographies for the wasps Angiopolybia pallens and Synoeca surinama. Such wasp species were used as genetic models to test spatially-esplicit hypotheses of climate stability and were chosen by present distinct ecological characteristics, but occur in sympatry in Amazonia and Atlantic Forest. It was aimed with this to test the following hypothesis: the disjunction affected idiosyncratically the genetic diversity of species with populations widely fragmented. The information presented in the three studies might serve as support in future works on Polistinae biogeography, mainly those that focus on the integration of environmental events to explain both evolutionary and ecological processes. / Apesar da ampla diversidade na região Neotropical, pouco se sabe a respeito da biogeografia das vespas sociais da subfamília Polistinae. Esta tese divide-se em três capítulos que, apesar de possuírem objetivos específicos distintos, têm como objetivo central a discussão da influência de processos ambientais, ecológicos e evolutivos na distribuição da diversidade genética e de espécies (i.e., riqueza biológica) de polistíneos. Para tanto, no primeiro capítulo é fornecida uma ampla revisão acerca das origens da subfamília Polistinae e processos causadores de diversidade na região Neotropical. No segundo capítulo são propostas possíveis rotas de colonização utilizadas pela subfamília nas Américas seguindo o modelo proposto pela hipótese Round-trip . Esta hipótese sustenta-se na recorrência de regras de progressão, inferidas por relações filogenéticas e de distribuição, apontando clados mais basais de diversos gêneros da subfamília ocorrendo na região Amazônica e clados mais derivados no leste da América do Sul. A ocorrência de uma regra de progressão contrária para Polistes sustenta uma segunda rota mais rara e, provavelmente, mais antiga, do leste para o oeste. O terceiro capítulo foca na disjunção das florestas Amazônica e Atlântica e nas espécies que, devido às alterações na distribuição das florestas, tiveram suas populações fragmentadas. Neste estudo é fornecida uma lista ampla com 127 táxons Neotropicais com linhagens disjuntas entre as duas florestas, modelos de estabilidade climática para oito espécies (dois polistíneos e seis vertebrados) e análises filogeográficas para as vespas Angiopolybia pallens e Synoeca surinama. As espécies de vespa foram escolhidas por apresentarem características ecológicas distintas, mas por ocorrerem em simpatria nas florestas Amazônica e Atlântica. Visou-se com isto testar a hipótese original deste projeto: a disjunção afetou de forma idiossincrática a diversidade genética de espécies com populações amplamente fragmentadas. As informações apresentadas nos três trabalhos podem servir como suporte em futuros estudos acerca da biogeografia da subfamília, principalmente aqueles que foquem na integração de eventos ambientais para explicar processos evolutivos e ecológicos.

Submitted by João De Deus Vidal Júnior (jd.vidal27@gmail.com) on 2018-05-09T20:11:53Z No. of bitstreams: 1 Tese_Rauvolfia_fevereiro.docx: 18767443 bytes, checksum: fc0f2b02da8b3988cbb195215ad93e3c (MD5) / Rejected by Sulamita Selma C Colnago null (sulamita@btu.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: Problema 1: Seu arquivo está em Word. O arquivo deve estar obrigatoriamente em formato PDF para submissão no Repositório. Assim que efetuar essa correção, submeta o arquivo em PDF novamente. Agradecemos a compreensão. on 2018-05-11T17:00:35Z (GMT) / Submitted by João De Deus Vidal Júnior (jd.vidal27@gmail.com) on 2018-05-11T18:26:13Z No. of bitstreams: 1 Tese_JVidal.pdf: 12476337 bytes, checksum: b4bd90a360a05a2358c8c188653a9128 (MD5) / Approved for entry into archive by Sulamita Selma C Colnago null (sulamita@btu.unesp.br) on 2018-05-11T19:39:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 vidaljr_jd_dr_bot.pdf: 12476337 bytes, checksum: b4bd90a360a05a2358c8c188653a9128 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-11T19:39:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 vidaljr_jd_dr_bot.pdf: 12476337 bytes, checksum: b4bd90a360a05a2358c8c188653a9128 (MD5) Previous issue date: 2018-03-06 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Neste estudo, nós desenvolvemos marcadores moleculares e aplicamos abordagens integrativas em filogeografia e ecologia para investigar e descrever a história biogeográfica das chapadas da região oeste do Cerrado brasileiro. Utilizando como modelo duas espécies do gênero Rauvolfia L. (Apocynaceae, Rauvolfioideae), Rauvolfia weddelliana Müll.Arg. e Rauvolfia gracilis I.Koch & Kin.-Gouv., típicas destes ambientes, nós desenvolvemos um conjunto de marcadores nucleares microssatélites e sequenciamos espaçadores de cloroplasto, com os quais estimamos métricas de diversidade genética e estruturação populacional. A partir destes dados, nós reconstruímos relações filogenéticas entre as linhagens, estimamos tempos de divergência e realizamos simulações demográficas e modelos de distribuição, com o intuito de testar possíveis cenários biogeográficos. Em sequência, nós desenvolvemos modelos de distribuição potencial em escala de comunidade e análises espaciais, para estimar o impacto relativo das flutuações climáticas do Pleistoceno sobre o endemismo no Cerrado, quando comparadas a outros processos. Os resultados estão apresentados em três capítulos. No primeiro, intitulado “Development and cross-validation of microsatellite markers for Rauvolfia weddelliana Müll.Arg. (Apocynaceae) species complex”, nós descrevemos o desenvolvimento de uma biblioteca de microssatélites específica para R. weddelliana e testamos sua transferabilidade para a espécie R. gracilis. Nós isolamos dez marcadores transferíveis, com alto conteúdo de polimorfismos que podem agora ser aplicados em estudos genéticos para o grupo, e também demonstramos a diploidia das espécies através do padrão de bandas de cada lócus. No segundo capítulo, intitulado “Phylogeography and paleodistribution of Rauvolfia weddelliana Müll.Arg. and Rauvolfia gracilis I.Koch & Kin.-Gouv. (Apocynaceae)”, nós aplicamos estes marcadores em conjunto com espaçadores de cloroplasto para testar, através de análises demográficas e modelos de nicho, os impactos das flutuações climáticas nas populações de R. weddelliana e R. gracilis. Nossas análises recuperaram duas linhagens com origem anterior ao Pleistoceno, coincidindo com o soerguimento do Planalto Central Brasileiro, que sofreram retração interglacial durante o Pleistoceno. Apesar de nossos modelos de distribuição terem apresentado resultado contrário a retração interglacial, eles recuperaram a mesma divergência norte-sul, também anterior ao último eventos de glaciação. Estes resultados sugerem que as savanas dos planaltos do oeste do Cerrado provavelmente configuram refúgios interglaciais. No terceiro capítulo, nós testamos este padrão, descrevendo a estabilidade relativa de chapadas e vales e modelando as distribuições potenciais de espécies típicas destes ambientes. Este trabalho contribui para a discussão sobre os impactos do clima do Pleistoceno e dos processos geológicos do Mioceno na diversificação do complexo domínio dos Cerrados. / In this study, we developed molecular markers and applied integrative approaches in phylogeography and ecology to investigate and describe the biogeographic history of the plateaus of the west region of the Cerrado in Brazil. Using as models two species of the genus Rauvolfia L. (Apocynaceae, Rauvolfioideae), Rauvolfia weddelliana Müll.Arg. and Rauvolfia gracilis I.Koch & Kin.-Gouv., typical from these habits, we developed a set of nuclear microsatellite markers and sequenced chloroplast spacers, which we used to estimate metrics of genetic diversity and population structure. From this data, we reconstructed phylogenetic relationships between lineages, estimated divergence times and conducted demographic simulations and distribution models, intending to test possible biogeographic scenarios. In sequence, we also developed community wise models of potential distribution and conducted spatial analysis to estimate the relative impact of climatic shifts of the Pleistocene on the endemism of the Cerrado, when compared to other processes. Our results are presented in three chapters. In the first, entitled “Development and cross-validation of microsatellite markers for Rauvolfia weddelliana Müll.Arg. (Apocynaceae) species complex”, we describe the development of a specific microsatellite library to R. weddelliana and tested its transferability to the species R. gracilis . We isolated ten transferable markers with high polymorphism content that may now be applied to genetics studies on the group, and also demonstrated the diploidy for these species though the patterns of bands for each locus. In the second chapter, entitled “Phylogeography and paleodistribution of Rauvolfia weddelliana Müll.Arg. and Rauvolfia gracilis I.Koch & Kin.-Gouv. (Apocynaceae)”, we applied these markers, along with sequences of chloroplast spacers to test, with demographic analysis and niche models, the impacts of the climatic fluctuations on the populations of R. weddelliana and R. gracilis . Our analysis recovered two lineages with origin prior to Pleistocene, coinciding with the Brazilian Central Plateau uplift. These lineages underwent interglacial retractions along the Pleistocene. Despite distribution models presented results that are contrary to the interglacial retraction, they recovered the same north-south divergence, also predating the Last Glacial Maximum. These results suggest that the savannas in the plateaus of the western Cerrado are potentially configuring interglacial refugia. In the third chapter, we tested this pattern, by describing the relative stability of plateaus and valleys and modelling the potential distributions of species typical from these environments. This study contributes to the discussions about the impacts of the Pleistocene climate and the geological processes of the Miocene on the diversification the complex Cerrado domain.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2015-12-04T19:15:27Z No. of bitstreams: 1 MariaJaquelineMonteDeAndrade_DISSERT.pdf: 2265638 bytes, checksum: 9f30624d051acb090d637ee2530e2a96 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2015-12-09T23:02:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 MariaJaquelineMonteDeAndrade_DISSERT.pdf: 2265638 bytes, checksum: 9f30624d051acb090d637ee2530e2a96 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-09T23:02:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MariaJaquelineMonteDeAndrade_DISSERT.pdf: 2265638 bytes, checksum: 9f30624d051acb090d637ee2530e2a96 (MD5) Previous issue date: 2014-05-13 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / O g?nero Hemidactylus Oken, 1817 tem distribui??o cosmopolita e, no Brasil, ocorrem tr?s esp?cies, sendo duas nativas, H. brasilianus e H. agrius, e uma ex?tica, H. mabouia. Tomando como base os estudos sobre ecologia de lagartos efetuados na Esta??o Ecol?gica do Serid?, de 2001 a 2011, este trabalho buscou reavaliar a ocorr?ncia das esp?cies do g?nero Hemidactylus nesta ESEC, analisar aspectos ecol?gicos e biol?gicos da popula??o de H. agrius; e investigar a distribui??o atual e potencial das esp?cies nativas do g?nero na regi?o nordeste, analisando a adequabilidade da ESEC para este t?xon. Para os dois primeiros objetivos, uma ?rea de amostragem constitu?da por cinco transectos de 200 m x 20 m, foi inspecionada em turnos alternados por tr?s dias consecutivos, de agosto de 2012 a agosto de 2013. Para a ?ltima perspectiva, foram consultados pontos de ocorr?ncia de H. agrius e H. brasilianus na literatura e no banco de dados da Cole??o Herpetol?gica da Universidade Federal do Rio Grande do Norte para constru??o de mapas preditivos, atrav?s do algoritmo de M?xima Entropia (MaxEnt). Na ESEC Serid? foram coletados 62 H. agrius (25 f?meas, 18 machos e 19 juvenis) e dois rec?m-nascidos foram obtidos a partir de um ninho comunal incubado em laborat?rio, nenhum registro foi feito para as demais esp?cies do g?nero. Hemidactylus agrius demostrou ser uma esp?cie noturna com especialidade a h?bitats com Afloramentos Rochosos, no entanto, generalista quanto ao uso de microh?bitats. Nesta popula??o as f?meas possuem comprimento corporal m?dio maior que o dos machos e apresentaram maiores frequ?ncias de autotomia caudal. Em rela??o ? dieta, H. agrius ? uma esp?cie moderadamente generalista, que consome artr?podes, principalmente Aranae, Orthoptera e Isoptera; e vertebrados, al?m de ter constatado um caso de canibalismo. Quanto ? sazonalidade foram registradas diferen?as apenas para o n?mero dos itens alimentares consumidos. A dieta foi similar entre os sexos, por?m diferen?as ontogen?ticas foram registradas para o volume total e comprimento m?ximo dos itens alimentares. Rela??es significativas foram constatadas entre o tamanho do corpo e da cabe?a dos esp?cimes com o comprimento m?ximo das presas consumidas. Casos de polidactilia e de bifurca??o caudal foram registrados na popula??o com frequ?ncias de 1,6 % e 3,1%, respectivamente. Em rela??o ?s localidades de ocorr?ncia das esp?cies nativas, foram constatados 27 pontos, sendo 14 para H. agrius e 13 para H. brasilianus; a primeira apresentou distribui??o restrita, enquanto que a segunda demonstrou ampla distribui??o. Em ambos os modelos gerados a ?rea da ESEC Serid? apresentou de m?dia a alta adequabilidade. Os resultados deste trabalho confirma a aus?ncia de H. brasilianus e H. mabouia nesta ESEC e confere a H. agrius condi??o de esp?cie canibal oportunista. Al?m disso, confirma os padr?es de distribui??o exibidos pelas esp?cies nativas de Hemidactylus e aponta a ESEC Serid? como ?rea de prov?vel ocorr?ncia para as esp?cies do g?nero, constatando, assim, que o estabelecimento de H. brasilianus e de H. mabouia, possivelmente, ? limitado por fatores bi?ticos, ainda pouco esclarecidos. / The genus Hemidactylus Oken, 1817 has cosmopolite distribution, with three species occurring in Brazil, two of them native, H. brasilianus and H. agrius, and one exotic, H. mabouia. Considering the studies about ecology of lizards conducted in the Ecological Station of the Serid?, from 2001 to 2011, this study aimed (1) to re-evaluate the occurrence of the species of Hemidactylus in this ESEC; (2) to analyze ecological and biological aspects of the H. agrius population; and (3) to investigate the current and potential distribution of the native species of the genus in northeastern Brazil, analyzing the suitability of ESEC to this taxon. For the first two objectives, a sampling area consisting of five transects of 200 x 20 m, was inspected in alternating daily shifts for three consecutive days, from August 2012 to August 2013. For the latter objective, occurrence points of H. agrius and H. brasilianus from literature and from the database of Herpetological Collections of the UFRN and the UNICAMP were consulted to build predictive maps via the Maximum Entropy algorithm (MaxEnt). In ESEC Serid?, 62 H. agrius individuals were collected (25 females, 18 males and 19 juveniles), and two neonates were obtained from a communal nest incubated in the laboratory. No record was made for the other two species of the genus. Hemidactylus agrius demonstrated to be a nocturnal species specialized in habitats with rocky outcrops; but this species is generalist regarding microhabitat use. In the population studied, females had an average body length greater than males, and showed higher frequencies of caudal autotomy. Regarding diet, H. agrius is a moderately generalist species that consumes arthropods, especially insect larvae, Isoptera and Araneae; and vertebrates, with a case of cannibalism registered in the population. With respect to seasonal differences, only the number of food items ingested differed between seasons. The diet was similar between sexes, but ontogenetic differences were recorded for the total volume and maximum length of the food items. Significant relationships were found between lizard body/head size measurements and the maximum length of prey consumed. Cases of polydactyly and tail bifurcation were recorded in the population, with frequencies of 1.6% and 3.1%, respectively. In relation xv to the occurrence points of the native species, 27 were identified, 14 for H. agrius and 13 for H. brasilianus. The first species presented restricted distribution, while the second showed a wide distribution. In both models generated, the ESEC Serid? area showed medium to high suitability. The results of this study confirm the absence of H. brasilianus and H. mabouia this ESEC, and reveal H. agrius as a dietary opportunist and cannibal species. Further, the results confirm the distribution patterns shown by native species of Hemidactylus, and point ESEC Serid? as an area of probable occurrence for the species of the genus, the establishing of H. brasilianus and H. mabouia are probably limited by biotic factors, a fact yet little understood

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-07-17T13:30:06Z No. of bitstreams: 1 FrancoiseDantasDeLima_TESE.pdf: 8585044 bytes, checksum: 0ae8905bac9e200a95b966507fc7aa0e (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-07-19T15:09:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 FrancoiseDantasDeLima_TESE.pdf: 8585044 bytes, checksum: 0ae8905bac9e200a95b966507fc7aa0e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-19T15:09:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FrancoiseDantasDeLima_TESE.pdf: 8585044 bytes, checksum: 0ae8905bac9e200a95b966507fc7aa0e (MD5) Previous issue date: 2017-04-07 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / A abordagem integrativa aplicada ? conserva??o de uma esp?cie ? essencial para a compreens?o dos fatores que contribuem para a diversifica??o de popula??es, processos de especia??o e identifica??o de padr?es ecol?gicos. Para tra?ar um panorama de conserva??o para Octopus insularis, foi adotada uma abordagem integrativa que envolve elementos da filogenia, filogeografia, Barcoding, modelagem do nicho clim?tico e gen?tica da paisagem. O presente estudo foi realizado em 15 localidades da costa oeste e ilhas oce?nicas do Atl?ntico Tropical. Foi identificado um aumento da ?rea de distribui??o de O. insularis para o mar do Caribe, o qual confirma o alto potencial da esp?cie para dominar ambientes de ?guas quentes e rasas. Al?m disso, verificou-se problemas com a identifica??o incorreta das esp?cies que comp?em os estoques pesqueiros dessa regi?o e do Golfo do M?xico, o que pode amea?ar a esp?cie end?mica O. maya. Atrav?s do enfoque filogen?tico com infer?ncia biogeogr?fica, foi poss?vel identificar o Caribe como poss?vel centro de origem do O. insularis, a qual divergiu de outras do g?nero ap?s o soerguimento do Istmo do Panam?. Tr?s clados contendo esp?cies transistimianas confirmam a import?ncia desse evento geol?gico no processo de especia??o em oct?podes. A influ?ncia dos processos clim?ticos subsequentes nas popula??es de O. insularis foi analisada atrav?s da modelagem do nicho em cinco cen?rios temporais. A an?lise revelou expans?o do nicho de O. insularis, em dire??o a regi?es temperadas nos cen?rios de aquecimento global. J? a filogeografia, estrutura??o populacional mostrou quatro popula??es/estoques bem delimitados geneticamente, devido ao regime da Corrente Sul Equatorial e montes submersos. Tais resultados corroboram a hip?tese do isolamento por Resist?ncia. Os resultados do presente estudo permitiram uma vis?o hol?stica dos fatores gen?ticos, ecol?gicos e oceanogr?ficos que influenciam a esp?cie O. insularis e auxiliaram a tra?ar um atual panorama de conserva??o e regulamenta??o da esp?cie, bem como sugerir futuras medidas de manejo para e esp?cie. / The integrative approach applied to species conservation is essential to understand the factors that contribute to population diversification, speciation processes and identification of ecological patterns. To propose a panorama for the conservation of Octopus insularis, a wide distributed species in the Tropical Atlantic, an integrative approach involving phylogeny, phylogeography, Barcoding, climatic niche modeling and landscape genetics was adopted. The present study was performed in 15 localities of the Tropical Atlantic west coast and oceanic islands. It was identified a northward increase in the O. insularis distribution area towards the Caribbean Sea, which confirms high potential of this species to dominate warm and shallow waters. Furthermore, misidentification of the species that compose fisheries stocks in the Gulf of Mexico was detected, which may threaten the endemic species O. maya. By using phylogeny approach with biogeographic interference, it was possible to identify Caribbean Sea as an origin area of O. insularis, which diverged from others congeners after the uplift of Isthmus of Panama. Tree clades formed by transisthmian species confirmed the importance of this geological event on speciation processes in octopod. The influence of the historical e future climate changes on distribution and expansion of O. insularis populations was analyzed by ecological niche modeling in five temporal scenarios. The analysis revealed a climatic niche expansion of O. insularis towards temperate regions on global warming scenarios. Whereas, phylogeography and population structure showed four populations/stocks well delimited, mainly due to South Equatorial Current and seamounts. These results corroborate the Isolation by Distance hypothesis. The present results allowed a holistic view, including genetic, ecology and oceanographic factors, which influences O. insularis life history. Those findings can help to build an actual panorama of species conservation and regulation, as well, to suggest future management measures to attenuate possible consequence of global climatic changes.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-05-11T15:38:12Z No. of bitstreams: 1 Glauco Alves Pereira.pdf: 2610242 bytes, checksum: 9df0e14131c1138d6879358ccb530d2a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-11T15:38:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Glauco Alves Pereira.pdf: 2610242 bytes, checksum: 9df0e14131c1138d6879358ccb530d2a (MD5) Previous issue date: 2016-02-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Pernambuco Endemism Center is the sector of the Atlantic Forest situated in the states of Alagoas, Pernambuco, Paraíba, and Rio Grande do Norte. This is the most devasted area of whole dominium, with a large number of endemic, and/or threatened birds. In this study, we analyzed the geographic range and performed the modeling of forest, endemic, and/or threatened birds, in addition to check and suggest important areas for bird conservation. We also examined the current and potential range of two birds considered Critically Endangered (Leptodon forbesi and Phaethornis margarettae camargoi) by ecological niche modeling, using the algorithm of maximum entropy (Maxent). To these two taxa we analyzed all records from 1987 to 2015, the vegetation type with highest number of records and we reviewed their conservation status. Both birds of the three target groups as the two birds modeled separately had a higher concentration of records and greater suitability potential in Alagoas and Pernambuco. There was no relationship between vegetation types and distribution of the birds of the three groups, but those were more abundant in moist forests, while the drier parts of the study area showed little representation. The protected areas were well representative at set of endemic and/or endangered birds, but some important areas for bird conservation did not have any protected forest fragment. We suggested update the conservation status of L. forbesi to 'Endangered' and P. margarettae camargoi to 'Vulnerable'. Urgent conservation actions must be taken in the Pernambuco Endemism Center due to the high degree of forest fragmentation, the high number of endemic and threatened taxa and the restricted distribution area of endemics. In future plans for the creation of protected areas, it must prioritize those areas overlapped the IBA's, because of the large number of endemic and/or threatened birds. / O Centro de Endemismo Pernambuco é o setor nordestino da Mata Atlântica situado nos estados de Alagoas, Pernambuco, Paraíba e Rio Grande do Norte. Esta é a área mais degradadada de todo o domínio, possuindo um grande número de táxons de aves florestais, endêmicos e/ou ameaçados de extinção. Nesse estudo, foi analisada a distribuição geográfica e realizada a modelagem de aves florestais, endêmicas e/ou ameaçadas de extinção, além de se verificar e sugerir importantes áreas para a conservação das aves. Também foi analisada a distribuição atual e potencial de duas aves consideradas Criticamente Ameaçadas (Leptodon forbesi e Phaethornis margarettae camargoi) através da modelagem de nicho ecológico, utilizando-se o algorítimo de Máxima Entropia (Maxent). Para esses dois táxons foram analisados os registros de 1987 a 2015, o tipo vegetacional onde há maior número de registros e foram revistos os seus status de conservação. Tanto as aves dos três grupos-alvos como as duas espécies modeladas separadamente tiveram maior concentração de registros e maior adequabilidade potencial em Alagoas e Pernambuco. Não houve relação entre os tipos vegetacionais e a distribuição das aves dos três grupos, porém essas se mostraram mais abundantes nas florestas úmidas, ao passo que as partes mais secas da área de estudo apresentaram pouca representatividade. As Unidades de Conservação foram bem representativas na conservação do conjunto de aves endêmicas e/ou ameaçadas, porém algumas áreas importantes para a conservação das aves não possuem nenhum fragmento florestal protegido. É sugerido que L. forbesi tenha seus status de conservação atualizado para a categoria „Em Perigo‟ e P. margarettae camargoi para „Vulnerável‟. Medidas urgentes de conservação devem ser tomadas no Centro de Endemismo Pernambuco devido ao alto grau de fragmentação florestal, ao elevado número de táxons endêmico e/ou ameaçados e a restrita área de distribuição dos endemismos. Em futuros planos para a criação de Unidades de Conservação, devem-se priorizar aquelas áreas sobrepostas às Important Bird Areas, devido ao elevado número endêmicos e/ou ameaçados.

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-22T15:19:10Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Juliana V. Campos.pdf: 1236093 bytes, checksum: bbb2b41578d8b3dbc80ed24b30970952 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-22T15:19:27Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Juliana V. Campos.pdf: 1236093 bytes, checksum: bbb2b41578d8b3dbc80ed24b30970952 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-22T15:19:44Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Juliana V. Campos.pdf: 1236093 bytes, checksum: bbb2b41578d8b3dbc80ed24b30970952 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-22T15:19:44Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Juliana V. Campos.pdf: 1236093 bytes, checksum: bbb2b41578d8b3dbc80ed24b30970952 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-02-16 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Sem abstract. / Fatores biogeográficos e ecológicos desempenham papéis importantes na distribuição geográfica e genética das espécies. O fluxo gênico entre as populações que estão em habitats diferentes pode ser reduzido pela distância geográfica ou por adaptações locais (isolamento por ambiente). No entanto, a associação entre esses fatores tem sido pouco incorporada em estudos para a fauna amazônica, uma região onde há uma elevada diversidade de habitats, os quais poderiam exercer um efeito direto na estrutura genética populacional da espécies. Aqui, nós combinamos filogeografia e modelos de nicho ecológico para avaliar: (1) quais eventos teriam moldado a distribuição espacial e genética em Leptodactylus pentadactylus, (2) se há diferenciação ecológica entre as áreas de ocorrência das populações de L. pentadactylus e (3) quantificar o efeito de fatores ambientais e geográficos no padrão de diferenciação genética. Nós encontramos três linhagens, onde duas delas é delimitada pelo rio Amazonas e a outra é restrita aos escudos das Guianas. Nossos resultados revelaram um papel importante do rio Amazonas na diferenciação genética de L. pentadactylus, no qual este rio atua como fator limitante ao fluxo gênico, em duas das três linhagens encontradas. Além do efeito do rio como barreira na distribuição da variabilidade genética de L. pentadactylus, foi detectado que outra grande parcela da variabilidade genética esta associada a fatores geográficos (isolamento por distância), ambientais (isolamento ambiental) e históricos (oscilações climáticas do Quaternário). Dessa forma, fica evidente a necessidade de incorporar, quantitativa e qualitativamente, a associação entre diferentes fatores para explicar a variabilidade genética de espécies amazônicas.

Drosophila buzzatii é uma espécie cactófila associada a diferentes espécies de cactos e distribuída nos diferentes Domínios fitogeográficos da América do Sul. Baseado na diversidade de inversões cromossômicas e densidade populacional, o Chaco foi considerado por alguns autores como o centro de origem da espécie. Entretanto, trabalhos recentes, utilizando aloenzimas e DNA mitocondrial, apontaram para uma possível origem na Caatinga. Os objetivos deste trabalho foram delinear rotas de dispersão da espécie para explicar sua distribuição atual e possível distribuição durante o último período glacial, na América do Sul. Foram obtidas seqüências de 714 pb da COI do mtDNA de 132 indivíduos em 44 localidades, gerando 36 haplótipos. Foram calculados os índices de diversidade nucleotídica, o teste AMOVA, testes de neutralidade, a Mismatch Distribution, Baesyan Skyline Plot, NCPA e o sentido dos movimentos migratórios (Migrate N) a fim de determinar parte da história evolutiva da espécie. As diversidades nucleotídicas encontradas por Domínio foram de 0,0030 Caatinga; 0,0019 - Mata Atlântica; 0,0020 Cerrado; 0,0011 - Pampas e 0,0004 - Chaco. A AMOVA mostrou que 68,33% da variação é intra-populacional e que uma porção significativa da variação é devido a diferenças inter-regionais (ct = 0,07124 p = 0,00196). Os testes de Neutralidade (D de Tajima = -2,4150, p = 0,0317 e Fs de Fu = -28,6719, p = 0,00001), a forma em estrela da rede e haplótipos, e a Mismatch Distribution confirmam um evento de expansão populacional estimado em aproximadamente 494.257,3 anos atrás, segundo modelo de Rogers e Harpending (1992). Entretanto, a Baesyan Skiline Plot demonstrou que esse movimento de expansão parece ser mais antigo, cerca de 550.000 650.000 anos atrás. A NCPA demonstrou que há fluxo gênico restrito com isolamento por distância, confirmado pelo teste de Mantel e alguma dispersão a longa distância em alguns dos clados analisados. O resultado do programa Migrate N indicou um padrão complexo migratório entre os domínios, porém um padrão norte/sul pôde ser verificado. A estruturação genética pode ser explicada devido à grande área de distribuição da espécie, gerando isolamento por distância e pela presença de barreiras geográficas e climáticas (entre o Cerrado e a Caatinga) e no estado do Rio de Janeiro e Espírito Santo (ao longo da Mata Atlântica) onde há pouco ou nenhum indivíduo da espécie. Os eventos de expansão ocorreram no Quaternário durante o período glacial conhecido como Ilinioian e suas subdivisões. A partir dos resultados deste trabalho foi possível traçar diversas rotas de migração possíveis entre os domínios utilizados, sendo que o movimento mais antigo partiu da Caatinga o que vai contra a hipótese de que o Centro de Origem seja o Chaco. / The fruit-fly Drosophila buzzatii is a cactophilic species in association with cactus species distributed along the Phytogeographic Domains of Caatinga, Cerrado, Atlantic Forest, Pampas and Chaco. Based in the diversity of chromosomal inversion and populational density of the species, the Chaco Domain was considered the Center of Origin of the D. buzzatii. However, recent works, using allozymes and DNAmt, showed a possible origin of the D. buzzatii in the Caatinga. The objectives of this work were trace historical dispersion routes of D. buzzatii, current and ancient areas of distribution in the South America. We obtained DNA sequences in 132 samples in 44 localities with 714 bp length from the COI mtDNA gene, generating 36 haplotypes. The diversity indexes, AMOVA, neutrality tests, Mismatch Distribution, Baesyan Skyline Plot, NCPA and sense of migration movements was calculated, to describe part of the evolutionary history of the species. The nucleotide diversity was 0,0030 - Caatinga, 0,0019 - Mata Atlântica, 0,0020 - Cerrado, 0,0011 - Pampas and 0,0004 - Chaco. The AMOVA results, grouped by Domain showed that 68,33% of the variation is intra-population and a significant portion of the variation is due to inter-regional differences (ct = 0,07124 p = 0,00196). The Neutrality tests (Tajimas D = -2,4150, p = 0,0317 and Fus Fs = -28,6719, p = 0,00001), the star-shape of the haplotype network, and Mismatch Distribution showed population expansion signs, estimated in 494.257,3 ybp, according Rogers and Harpending model (1992). However, the BSP showed that the movement is ancient, estimated in 550.000 650.000 ybp. The NCPA showed restricted gene flow with isolation by distance, confirmed by the Mantel Test and some long distance dispersion. The results of the program Migrate N showed a complex pattern of migration between the domains, but a north/south pattern could be identified. The genetic structure can be explained to the widespread distribution of the species, that could generate isolation by distance and by the presence of geographic and climatic barriers (between Cerrado and Caatinga domains) and in the States of Rio de Janeiro and Espírito Santo (along the Atlantic Forest) when there is none or few individuals of the species D. buzzatii. The expansion movements occurred in the Quaternary Period during glaciations events in the Illinoian and their subdivisions, due to the decrease of the global moisture that generated favorable conditions to the expansion of the dry vegetation and associated species. Based on the results of this work it was possible to delineate many migration routes between the phytogeographic domains, and the more ancient movement started in the Caatinga and this result not support the hypothesis that Chaco was the Center of Origin from D. buzzatii.