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Políporos (Basidiomycota) da floresta ombrófila mista de São Francisco de Paula, Rio Grande do Sul

Westphalen, Mauro Carpes January 2011 (has links)
A fim de ampliar o conhecimento dos políporos no Rio Grande do Sul e no Brasil, foi realizado o levantamento destes fungos em áreas de Floresta Ombrófila Mista no município de São Francisco de Paula. O município, localizado no nordeste do Rio Grande do Sul, se caracteriza pela elevada taxa pluviométrica durante todos os meses do ano. Cerca de 200 espécimes foram coletados entre abril de 2009 e junho de 2010, resultando em 84 táxons identificados. Onze espécies são descritas e ilustradas: Antrodia variiformis (Peck) Donk, Flaviporus subundatus (Murrill) Ginns, Junghuhnia carneola (Bres.) Rajchenb., J. meridionalis (Rajchenb.) Rajchenb., J. minuta I. Lindblad & Ryvarden, J. nitida (Pers.) Ryvarden, J. polycystidifera (Rick) Rajchenb., J. undigera (Berk. & M.A. Curtis) Ryvarden, Rigidoporus crocatus (Pat.) Ryvarden, R. undatus (Pers.) Donk e Trechispora mollusca (Pres.) Liberta. Antrodia variiformis, Flaviporus subundatus, Rigidoporus crocatus e Trechispora mollusca são registradas pela primeira vez para o Brazil. Fomitiporia maxonii Murril é citada pela primeira vez para o Rio Grande do Sul enquanto Rigidoporus undatus é um novo registro pra o sul do Brasil. Uma chave de identificação para as espécies de Junghuhnia encontradas no Brasil, assim como uma chave para as espécies ressupinadas encontradas na área de estudo são apresentadas. / In order to increase the knowledge of polypores from Rio Grande do Sul State and Brazil, a survey was carried out in areas of Araucaria Forest in the municipality of São Francisco de Paula. The municipality, located in northeastern Rio Grande do Sul, is characterized by high rainfall rates during all months of the year. About 200 specimens were collected between April 2009 and June 2010, resulting in 84 taxons identified. Eleven species are described and illustrated: Antrodia variiformis (Peck) Donk, Flaviporus subundatus (Murrill) Ginns, Junghuhnia carneola (Bres.) Rajchenb., J. meridionalis (Rajchenb.) Rajchenb., J. minuta I. Lindblad & Ryvarden, J. nitida (Pers.) Ryvarden, J. polycystidifera (Rick) Rajchenb., J. undigera (Berk. & Curtis) Ryvarden, Rigidoporus crocatus (Pat.) Ryvarden, Rigidoporus undatus (Pers.) Donk and Trechispora mollusca (Pres.) Liberta. Antrodia variiformis, Flaviporus subundatus, Rigidoporus crocatus and Trechispora mollusca are registered for the first time from Brazil. Fomitiporia maxonii Murrill is first mentioned from Rio Grande do Sul while Rigidoporus undatus is a new record from southern Brazil. A key to the species of Junghuhnia Corda found in Brazil as well as a key to the resupinate species found in the study area are presented.
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Estudos sobre fungos gasteróides (Basidiomycota)no Rio Grande do Sul / Studies on gasteroid fungi (Basidiomycota) from Rio Grande do Sul, Brazil

Cortez, Vagner Gularte January 2009 (has links)
Fungos gasteróides ou gasteromicetos são um grupo polifilético de fungos do filo Basidiomycota, cuja principal característica é a formação endógena e liberação passiva dos basidiósporos após a maturação. Neste trabalho, foi realizado um levantamento de fungos gasteróides na micobiota sul-riograndense a partir de coletas realizadas pelo autor de março de 2006 a março de 2009 em diferentes regiões do Rio Grande do Sul, bem como na revisão dos herbários BAFC, HURG, ICN, PACA, PEL, SMDB e SP. A análise dos caracteres macromorfológicos e micromorfológicos foi realizada segundo métodos específicos para o grupo; ilustrações das microestruturas foram realizadas ao microscópio óptico com câmara-clara. Ao todo, foram examinadas mais de 700 coletas de gasteromicetos, representando um total de 13 famílias, 31 gêneros e 85 espécies de fungos gasteróides. Lycoperdaceae foi a família com maior número de gêneros (9) e espécies (28). Geastrum foi o gênero com maior número de espécies no Rio Grande do Sul, totalizando 13 táxons. Três espécies são propostas como novas para a ciência: Lycoperdon ovoidisporum, Morganella echinulata e M. homrichiae; três combinações novas são propostas: Calostoma zanchianum, Langermannia bicolor var. cirrifera e Morganella benjaminii. São registradas pela primeira vez na América do Sul: Bovista ochrotricha, Chondrogaster pachysporus, Lysurus cruciatus var. nanus, Morganella afra e Phallus duplicatus. Os seguintes táxons são registrados pela primeira vez para o Brasil: Calvatia cyathiformis var. chilense, Hysterangium affine, H. inflatum, Mutinus elegans, Scleroderma dictyosporum e Tulostoma pygmaeum. Phallus granulosodenticulatus, uma espécie pouco conhecida, descrita por B. Braun em 1932, foi recoletada e redescrita. Cyathus berkeleyanus, C. julietae, C. pallidus, Descomyces albellus, Scleroderma fuscum, Setchelliogaster tenuipes e Vascellum pratense são citadas pela primeira vez para o Rio Grande do Sul e sul do Brasil. Uma listagem provisional fungos gasteróides conhecidos no Rio Grande do Sul é apresentada. / Gasteroid fungi, or gasteromycetes, are a polyphyletic group belonging to the phyllum Basidiomycota; their most important feature is the endogenous production of basidiospores, which are passively dispersed at maturity. In this research, a survey of the gasteroid fungi from the state of Rio Grande do Sul was based on specimens collected from March 2006 to March 2009, as well on the revision of the BAFC, HURG, ICN, PACA, PEL, SMDB, and SP herbaria. Macro- and microscopic analysis of the basidiomata followed specific methods for this group of fungi; line drawings of the microstructures, were produced with the aid of a camera-lucida attached to a light microscope. More than 700 specimens were examined, comprising 13 families, 31 genera, and 85 species of gasteroid fungi. Lycoperdaceae was the larger family, with 28 taxa. Geastrum was the largest genus, with 13 taxa. Three new species to science were proposed: Lycoperdon ovoidisporum, Morganella echinulata and M. homrichiae; three new combinations were proposed: Calostoma zanchianum, Langermannia bicolor var. cirrifera, and Morganella benjaminii. The following taxa represented new records from South America: Bovista ochrotricha, Chondrogaster pachysporus, Lysurus cruciatus var. nanus, Morganella afra and Phallus duplicatus. New records from Brazil are: Calvatia cyathiformis var. chilense, Hysterangium affine, H. inflatum, Mutinus elegans, Scleroderma dictyosporum, and Tulostoma pygmaeum. Phallus granulosodenticulatus, an almost unknown taxon described by B. Braun in 1932, was recollected and reevaluated. The following species are new records from southern Brazil or Rio Grande do Sul: Cyathus berkeleyanus, C. julietae, C. pallidus, Descomyces albellus, Scleroderma fuscum, Setchelliogaster tenuipes and Vascellum pratense. A provisional checklist of the known gasteroid fungi from Rio Grande do Sul is presented.
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Caracterização micotoxicológica de uvas viníferas produzidas no Rio Grande do Sul

Einloft, Tiago Centeno January 2012 (has links)
A vitivinicultura é uma atividade extremamente importante no estado do Rio Grande do Sul, representando cerca de 50% das uvas produzidas e 90% dos vinhos em todo o país. Diferentes gêneros fúngicos são comumente encontrados infectando as bagas, os principais são Alternaria, Botrytis, Cladosporium e Aspergillus. Esta contaminação é influenciada por diferentes fatores, entre eles, características climáticas da região, variedades da uva, tipo de cultivo, entre outros. O gênero Aspergillus destaca-se dos demais, pois as espécies frequentemente encontradas nas uvas, os chamados Aspergillus seção Nigri, são potenciais produtores de Ocratoxina A, micotoxina nefrotóxica e possivelmente carcinogênica para humanos. Os objetivos deste trabalho foram a caracterização micotoxicológica de uvas das variedades Merlot e Cabernet Sauvignon, produzidas em três regiões vitivinícolas do Rio Grande do Sul, coletadas em dois estágios de maturação das bagas. As amostragens foram realizadas no inicio da mudança de cor e na colheita nas regiões da Campanha, Serra do Sudeste e Serra do Nordeste. Foram isolados oito gêneros fúngicos, com destaque para Alternaria, que foi predominante em todas as regiões, estágios de cultivo e nas duas variedades. Os Aspergillus seção Nigri foram predominantes no gênero Aspergillus, representando 88% dos isolados, que se destacaram na região da Campanha e na variedade Cabernet Sauvignon. O período da colheita demonstrou ser critico para a contaminação por Aspergillus negros na variedade Cabernet Sauvignon, enquanto na variedade Merlot, maior frequência desses fungos foi observada durante o início da mudança de cor. Uma cepa de Aspergillus japonicus foi capaz de produzir ocratoxina A na concentração de 148 ng/mL/106 conídios. Não foram encontrados níveis detectáveis de OTA nas amostras de uvas. A caracterização da contaminação fungica e por OTA em uvas cultivadas no estado é relevante para garantir a qualidade destes produtos e a segurança da população consumidora. / The viticulture is an important activity in Brazil. Rio Grande do Sul, the southern state of Brazil, responsible for almost 90% of wines production. Different fungal genera are commonly found infecting the berries, mainly Alternaria, Botrytis, Cladosporium and Aspergillus. Grape infection and fungal growth in influenced by different factors, including climatic characteristics of the region, grape varieties, crop type, among others. Among the genus Aspergillus, Aspergillus section Nigri stands out from the others, because its ability to produce ochratoxin A, mycotoxin with nephrotoxic characteristics and classified as a possible carcinogenic to humans. The aim of this study was the mycological characterization of wine grapes of Merlot and Cabernet Sauvignon varieties, cultivated at three wine producer regions of Rio Grande do Sul, collected during two stages of berries maturation. The sampling was conducted at the early ripeness and harvesting from the Campanha, Serra do Sudeste and Serra do Nordeste regions. Eight fungal genera were isolated, highlighting Alternaria, which was predominant in all regions, growing stages and varieties. Aspergillus section Nigri were prevalent in the genus Aspergillus, representing 88% of the isolates mainly at Campanha region as well as Cabernet Sauvignon veriety. The harvest period proved to be critical for contamination by Aspergillus section Nigri in C. Sauvignon variety; nevertheless, in Merlot, the greater frequency of these fungi was observed at early ripeness. One Aspergillus japonicus isolate was able to produce OTA at a concentration of 148 ng mL-1/106 conidia. No detectable levels of OTA were found in any grape samples. The characterization of fungal and OTA contamination in grapes cultivated in Rio Grande do Sul is extremely important to ensure the quality of these products and consumers safety.
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Políporos(Basidiomycota)em remanescentes de Mata Atlântica Sensu Stricto no Rio Grande do Sul,Brasil

Reck, Mateus Arduvino January 2009 (has links)
Este trabalho apresenta um total de 65 espécies de políporos, encontradas em remanescentes florestais de Mata Atlântica, litoral norte do estado do Rio Grande do Sul, nos municípios de Dom Pedro de Alcântara, Mampituba, Morrinhos do Sul e Torres, em coletas realizadas entre os meses de março de 2007 e fevereiro de 2008. 11 espécies são descritas e ilustradas: Coriolopsis polyzona (Pers.) Ryvarden, Ganoderma neurosporum J.F. Furtado, Ganoderma oerstedii (Fr.) Torrend, Grammothele fuligo (Berk. & Broome) Ryvarden, Grammothele lineata Berk. & M.A. Curtis, Grammothele subargentea (Speg.) Rajchenb., Microporellus iguazuensis Rajchenb., Phellinus undulatus (Murrill) Ryvarden, Trametes cotonea (Pat. & Har.) Ryvarden., Trametes lactinea (Berk.) Sacc. e Trametes pavonia (Hook.) Ryvarden. M. iguazuensis, uma interessante espécie estipitada descrita para Iguazú, na Argentina, tem seu segundo registro para a ciência e o primeiro para o Brasil. T. cotonea e T. lactinea também são citadas pela primeira vez para o País. C. polyzona, G. neurosporum, G. oerstedii, G. fuligo, P. undulatus e T. pavonia são citadas pela primeira vez para o território do Rio Grande do Sul. Uma chave de identificação para as espécies de Grammothele Berk. & M.A. Curtis, assim como uma chave geral para todas as espécies encontradas são também apresentadas. / In the present work, 65 species of polypores are presented; they were collected in a forest remnants of Atlantic Rain Forest, north coast of Rio Grande do Sul State, in the municipalities of Dom Pedro de Alcântara, Mampituba, Morrinhos do Sul and Torres, between March 2007 and February 2008. 11 species are described and illustrated: Coriolopsis polyzona (Pers.) Ryvarden, Ganoderma neurosporum J.F. Furtado, Ganoderma oerstedii (Fr.) Torrend, Grammothele fuligo (Berk. & Broome) Ryvarden, Grammothele lineata Berk. & M.A. Curtis, Grammothele subargentea (Speg.) Rajchenb., Microporellus iguazuensis Rajchenb., Phellinus undulatus (Murrill) Ryvarden, Trametes cotonea (Pat. & Har.) Ryvarden., Trametes lactinea (Berk.) Sacc. and Trametes pavonia (Hook.) Ryvarden. M. iguazuensis, an interesting stipitate polypore described first to argentine Iguazú, are recorded for the second time for the science and first to Brazil. T. cotonea and T. lactinea are also cited for the first time to the Country. C. polyzona, G. neurosporum, G. oerstedii, G. fuligo, P. undulatus and T. pavonia are recorded for the first time to Rio Grande do Sul State. A key for the Grammothele Berk. & M.A. Curtis species, as well a key for all the registered species are given.
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Microbiota do cacau = fungos e micotoxinas do cacau ao chocolate / Cocoa mycobiota : fungi and mycotoxins from cocoa until chocolate

Copetti, Marina Venturini 07 June 2009 (has links)
Orientador: Jose Luiz Pereira / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-13T15:09:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Copetti_MarinaVenturini_D.pdf: 6048122 bytes, checksum: 93c1ab6938ae661500c36bb19ce26312 (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: O Brasil se encontra entre os maiores produtores mundiais de cacau. Parte da sua produção é destinada à exportação, principalmente após passar por algum processamento industrial, e o restante se destina ao consumo interno. A qualidade obtida ao final do processamento do cacau depende de uma ampla variedade de fatores, dentre os quais os microrganismos desempenham um papel fundamental. A presença de fungos é observada em várias fases do processamento, o que além do aspecto deteriorativo representa um perigo toxicológico devido a possibilidade de síntese de micotoxinas. Na presente tese são apresentados os resultados sobre a presença de fungos, ocratoxina A e aflatoxinas em um total de 494 amostras de cacau analisadas em diferentes fases do processamento. A maior quantidade e diversidade de fungos foi encontrada em amostras coletadas durante o processamento na fazenda, especialmente durante a secagem e estocagem das amêndoas. Foram isolados 1132 espécies potencialmente toxigênicas do gênero Aspergillus: A. flavus, A. parasiticus, A. niger, A. carbonarius e grupo dos A. ochraceus. Com relação à presença de micotoxinas, as amostras da secagem e estocagem foram as que apresentaram maiores níveis de ocratoxina A e aflatoxinas na fazenda, enquanto que nas amostras coletadas em indústrias processadoras de cacau os maiores níveis de ocratoxina A foram detectados na casca, torta e cacau em pó e os de aflatoxina, nos nibs e liquor. Nas amostras de chocolate observou-se uma relação direta entre a quantidade de cacau no produto e os níveis de aflatoxinas e ocratoxina A, sendo estes maiores em chocolate em pó e chocolate meio amargo. Também foram conduzidos experimentos para avaliar as condições que afetam a produção de ocratoxina A no cacau por A. carbonarius. Foi observado que, diante da presença de inóculo, a produção de ocratoxina A já ocorre durante a fermentação. Os níveis de ocratoxina A foram menores quando sementes de cacau com polpa integral foram fermentadas durante 6 dias em caixas, se comparados aos obtidos com sementes parcialmente despolpadas e conduzidas à secagem sem prévia fermentação. Os resultados em geral mostraram a existência de uma grande diversidade de fungos, muitos dos quais toxigênicos, durante o processamento do cacau e a inter-relação de fatores intrínsecos, ambientais e de processamento pareceram determinar a ocorrência ou não de micotoxinas / Abstract: Brazil is one of the biggest cocoa producing countries. Part of its production is exported, mainly after undergoing some industrial processing, and the other supplies the internal market. The quality of the final cocoa product depends on several factors, and microorganisms play an important role on this. Investigations have demonstrated the presence of filamentous fungi in many processing stages. Besides the spoilage potential, those are a cause for concern from the toxicological aspect, since mycotoxins may be produced. This thesis presents the results concerning the presence of fungi, ochratoxin A and aflatoxins in a total of 494 cocoa samples collected at different processing stages, from farm to market. The greatest occurrence and the major diversity of fungi were found in samples collected during the drying and storage of the beans on the farm. A total of 1132 potentially toxigenic fungi were isolated, belonging to the species A. flavus, A. parasiticus A. niger, A. ochraceus group and A. carbonarius. Regarding the presence of mycotoxins, samples collected during drying and storage presented the highest ochratoxin A and aflatoxin levels amongst samples collected at farm. During industrialization, the most contaminated products were the cocoa shell, cocoa cake and cocoa cake with respect to ochratoxin A. The aflatoxin levels were higher in the nibs and liquor. A direct correlation between the amount of cocoa in the product and the ochratoxin A level in the chocolate was observed. Dark chocolate and powdered commercial cocoa were the most contaminated samples. An additional experiment was carried out to evaluate the conditions affecting ochratoxin A production by A. carbonarius in cocoa on the farm. It was observed that ochratoxin A production could start during fermentation if toxigenic fungi were present, and lower ochratoxin levels were found when the integral beans were fermented during 6 days in box if compared to those with pulp partially removed and submitted to drying fermentation. In general, during cocoa processing, a wide variety of fungi was found, some of these toxigenic. Intrinsic, environmental and processing factors acting together seemed to determine the production of mycotoxins in cocoa / Doutorado / Doutor em Ciência de Alimentos
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Caracterização de fungos intestinais cultiváveis e avaliação da estrutura da micobiota intestinal humana de indivíduos obesos, com sobrepeso e eutróficos

Borges, Francis Moreira 03 May 2018 (has links)
Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2018-05-17T15:27:41Z No. of bitstreams: 0 / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2018-05-22T11:42:00Z (GMT) No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2018-05-22T11:42:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2018-05-03 / Os fungos têm um papel complexo no trato intestinal, influenciando diretamente na saúde e na doença e sua disbiose pode contribuir para a obesidade. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade de fungos da microbiota intestinal humana entre indivíduos eutróficos, com sobrepeso e obesos. Foram coletados espécimes fecais de 72 indivíduos adultos e análises dependentes e independentes de cultivo foram realizadas para avaliar os fungos presentes. As leveduras foram identificadas pela técnica de ionização e dessorção a laser assistida por matriz acoplada a analisador do tipo espectro de massa por tempo de vôo (MALDI-TOF MS) e os fungos filamentosos por microcultivo. A contagem média de fungos filamentosos e leveduras cultiváveis foi de 1,58 Log10 UFC/g de fezes. Diferenças significativas no nível populacional dos fungos filamentosos foi observado entre os grupos dos indivíduos eutróficos e obesos. Trinta e quatro gêneros de fungos foram identificados. O filo predominante foi Ascomycota com 29 gêneros e/ou espécies diferentes, seguido por Zigomycota e Basidiomycota. O fungo mais isolado nos indivíduos eutróficos foi Paecylomyces sp. e nos indivíduos obesos Penicillium sp. Os indivíduos eutróficos apresentam uma diversidade ligeiramente maior de fungos filamentosos do que os indivíduos obesos. Os indivíduos do sexo feminino tiveram um maior número de fungos diferentes quando comparados aos do sexo masculino. A análise de eletroforese em gel de gradiente desnaturante (DGGE) mostrou agrupamento dos indivíduos eutróficos e com sobrepeso em um cluster e dos indivíduos obesos em outro cluster distinto, embora a riqueza tenha sido baixa nos três grupos. A análise de hibridização in situ florescente (FISH) demonstrou maior densidade relativa de C. albicans no grupo obeso quando comparado ao eutrófico e pela análise de reação da polimerase em cadeia quantitativa (qPCR) um número maior de cópias de DNA de fungos e do filo Ascomycota nos indivíduos obesos quando comparado aos indivíduos com sobrepeso e obesos. Foi verificada correlação positiva entre os fungos e os parâmetros antropométricos colesterol total, LDL, triglicerídeos, hemoglobina, HOMA-IR, HOMA-β, insulina, glicose sérica, creatinina e porcentagem de fibras e carboidratos da dieta. Outros estudos são necessários para melhor compreender a interrelação entre a micobiota do intestino e a obesidade. Futuramente, este conhecimento poderá ser utilizado na modulação da micobiota intestinal e no tratamento da obesidade. / Fungi have a complex role in the intestinal tract, directly influencing health and disease and potential dysbiosis could contribute to obesity. The aim of this study was to investigate the fungal diversity of human gut microbiota among eutrophic, overweight, and obese individuals and to understand the gut microbial ecology shifts between healthy and obese individuals. Stool samples of 72 adult individuals were collected and dependent and independent cultive approach were performed to evaluate the fungi. The yeasts were identified by matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) and the filamentous fungi were identified by microculture. The mean count of filamentous fungi and yeast was 1.58 log10 CFU/g of feces. Significant differences in the population level of the filamentous fungi was observed within eutrophic and obese groups. Overall, 34 genera were identified. The predominant phylum was Ascomycota with 20 different genera, followed by Basidiomycota and Zygomycota. The most prevalent specie was Paecylomyces sp. in euthrophic individuals and Penicillium sp. in obese individuals. The results of the eutrophic individuals suggest a slightly higher diversity of fungi within these individuals. Female individuals had a greater diversity of fungal types compared to males. The denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) analysis showed the grouping of eutrophic and overweight individuals in one cluster and of obese individuals in another cluster, although richness was low in all three groups. The fluorescence in situ hybridization (FISH) analysis showed a higher relative density of C. albicans in the obese group when compared to eutrophic and by the quantitative real time PCR (qPCR) a larger number of DNA copies of fungi and the phylum Ascomycota in obese individuals when compared to overweight and obese individuals. There was a positive correlation between fungi and the anthropometric parameters, total cholesterol, LDL, triglycerides, hemoglobin, HOMA-IR, HOMA-β, insulin, serum glucose, creatinine and percentage of dietary fibers and carbohydrates. Other studies are needed to better understand the causal relationship between gut mycobiota and obesity. This knowledge could be used in modulating the gut mycobiota and identifying future obesity treatments.
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Comunidades de fungos em folhedo da Mata Atl?ntica na regi?o semi?rida do Brasil

Costa, Loise Araujo 29 August 2014 (has links)
Submitted by Ricardo Cedraz Duque Moliterno (ricardo.moliterno@uefs.br) on 2016-01-21T00:37:49Z No. of bitstreams: 1 TESE_Loise Araujo Costa.pdf: 3490024 bytes, checksum: d67e88fa9cf7de3c8ca53e0ee35cc012 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-21T00:37:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE_Loise Araujo Costa.pdf: 3490024 bytes, checksum: d67e88fa9cf7de3c8ca53e0ee35cc012 (MD5) Previous issue date: 2014-08-29 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / The Atlantic Forest has the highest biodiversity among tropical forests is one of the 34 priority areas for global conservation. Currently remains about 11% of its original area, which is composed of fragmented and geographically distant remnants. Among the microorganisms that compose forest ecosystems, fungi are important components because ensure the cycling of carbon and nutrients, however are poorly studied. The present study aimed to assess the diversity and distribution of fungi associated to leaf litter from three Atlantic Forest remnants in the semiarid region of Brazil: Brejo Paraibano-PB, Serra da Ibiapaba-CE and Serra da Jib?ia-BA; and the effects of methodological aspects on mycobiota. Two expeditions were conducted in each area, during the wet season and the other in the dry season, between June/2011 and January/2013. Twenty-three samples of leaf litter, five Clusia nemorosa G. Mey and eighteen Vismia guianensis (Aubl) Choisy, were collected and submitted to the technique of particle filtration. The total volume of 9.3 mL of particle suspension was plated on two different culture media: dichloran rose bengal chloramphenicol agar (DRBC) and malt yeast extract agar (MYE). The analysis of this material yielded 6.460 colonies identified 168 taxa for which data were divided into three chapters. The first chapter evaluates the effects of time (fresh material, 07, 14, 21 and 28 d) and storage temperature (room temperature and 4?C) of the leaves of C. nemorosa plus the use of two culture media on mycobiota. Analysis of covariance indicated that the richness and the number of isolates decreased with storage, however in relation to the culture medium there was no significant difference. The storage temperature had no significant influence on the community according to the t-test. The second chapter compared the communities of fungi of C. nemorosa and V. guianensis during the wet and dry seasons. Clusia nemorosa showed higher species richness and diversity of fungi compared to V. guianensis. Similarity analysis indicated that variations in the community between plants and seasons were significant while the cluster analysis and multivariate NMDS showed seasonality factor as more decisive for the distribution of fungi. The third chapter investigated the spatial and temporal distribution of fungi associated with leaf litter community of V. guianensis present in the three remaining. Multivariate analysis NMDS revealed differences in community composition of fungi in each area and climate season and the similarity analysis indicated that the differences were statistically significant. The results of this study presented a great diversity associated with the leaf litter present in remnants of Atlantic Forest and indicate that the distribution of fungi in the environment is not random. Knowledge of the effects of biotic and abiotic factors on the distribution of saprobic fungi is fundamental to understanding the role that they play in forest ecosystems. / A Mata Atl?ntica apresenta uma das maiores biodiversidade dentre as florestas tropicais sendo uma das 34 ?reas priorit?rias para a conserva??o mundial. Atualmente resta cerca de 11% da sua ?rea original, que ? composto por remanescentes fragmentados e distantes geograficamente. Dentre os micro-organismos que comp?em os ecossistemas florestais, os fungos s?o componentes importantes, pois promovem a ciclagem de carbono e nutrientes, no entanto, s?o pouco estudados. O presente estudo teve como objetivo avaliar a diversidade e distribui??o de fungos associados ao folhedo de tr?s remanescentes de Mata Atl?ntica na regi?o semi?rida do Brasil: Brejo Paraibano-PB, Serra da Ibiapaba-CE e Serra da Jib?ia-BA; bem como os efeitos de aspectos metodol?gicos sobre a micobiota. Duas expedi??es foram realizadas em cada ?rea, uma durante a esta??o chuvosa e a outra na esta??o seca, entre junho/2011 e janeiro/2013. Vinte e tr?s amostras de folhas da serapilheira, cinco de Clusia nemorosa G. Mey e dezoito de Vismia guianensis (Aubl) Choisy, foram coletadas e submetidas ? t?cnica de filtra??o de part?culas. O volume total de 9.3 mL de suspens?o de part?culas foi plaqueado em dois meios de cultivo: ?gar dicloran rosa bengala cloranfenicol (DRBC) e ?gar extrato de malte e levedura (MYE). A partir da an?lise desse material, 6.460 col?nias foram isoladas e identificadas em 168 t?xons cujos dados foram distribu?dos em tr?s cap?tulos. O primeiro cap?tulo avaliou os efeitos do tempo (material fresco, 07, 14, 21 e 28 dias) e temperatura (ambiente e 4?C) no acondicionamento das folhas de C. nemorosa al?m do uso dos dois meios de cultura sobre a micobiota. A an?lise de covari?ncia indicou que a riqueza e o n?mero de isolados diminu?ram com o tempo de acondicionamento, entretanto em rela??o ao meio de cultura n?o houve diferen?a significativa. A temperatura de acondicionamento n?o apresentou influ?ncia significativa sobre a comunidade, segundo o teste-t. O segundo cap?tulo comparou as comunidades de fungos de C. nemorosa e V. guianensis durante as esta??es chuvosa e seca. Clusia nemorosa apresentou maior riqueza de esp?cies e diversidade de fungos comparada a V. guianensis. A an?lise de similaridade indicou que as varia??es na comunidade entre as plantas e esta??es foram significativas, enquanto que a an?lise de agrupamento e a multivariada NMDS apresentaram a sazonalidade como fator determinante para a distribui??o dos fungos. O terceiro cap?tulo investigou a distribui??o espacial e temporal da comunidade de fungos associada ao folhedo de V. guianensis presentes nos tr?s remanescentes. A an?lise multivariada NMDS revelou diferen?as na composi??o das comunidades de fungos em cada ?rea e esta??o clim?tica e a an?lise de similaridade indicou que as diferen?as encontradas foram estatisticamente significativas. Os resultados deste estudo apresentam uma grande diversidade de fungos associada ao folhedo presente nos remanescentes de Mata Atl?ntica e indicam que a distribui??o dos fungos no ambiente n?o ? aleat?ria. O conhecimento dos efeitos dos fatores bi?ticos e abi?ticos sobre a distribui??o dos fungos sapr?bios ? fundamental para entender o papel que desempenham nos ecossistemas florestais.
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Sistemas de rotação de culturas e infecção de grãos de milho por Fusarium verticillioides em regiões produtoras no estado de São Paulo. / Crop rotation systems and infection of maize grains by Fusarium verticillioides in maize-producing regions in the state of São Paulo.

Atayde, Danielle Diniz 20 February 2014 (has links)
Propomos avaliar a influência da rotação de culturas na infecção de milho transgênico (Bt) e cobertura morta por F. verticillioides e na presença de fumonisinas em amostras provenientes de Palmital e Capão Bonito. O isolamento fúngico da cobertura morta e do milho foi realizado em DG18 e DRBC, respectivamente. Os fungos isolados pertencentes ao gênero Fusarium foram identificados até espécie. Utilizamos, para análise de fumonisinas, Cromatografia Líquida de Alta Eficiência. Micobiota da cobertura morta revelou maior frequência de Cladosporium spp. Nas amostras de milho, F. verticillioides foi o fungo mais isolado. Dentro do gênero Fusarium, a espécie F. verticillioides foi a mais frequente. Análise micotoxicológica do milho revelou a presença de fumonisinas em 88,9% das amostras provenientes de Palmital e em 86,1% de Capão Bonito. Dos isolados de F. verticillioides 84,6% foram produtores de FB1 + FB2. A presença de F. verticillioides e fumonisinas nos grãos de milho estabelece um problema econômico e de saúde pública. / The objective of this study was to evaluate the influence of crop rotation systems on the infection of maize grains and mulch by F. verticillioides and on the presence of fumonisins in maize samples collected in Palmital and Capão Bonito. Surface seeding (DG18) and direct seeding (DRBC) were employed for fungal isolations from mulch and maize, respectively. Identified isolates belonging to the genus Fusarium were further classified at the species level. Analysis of the mulch mycobiota revealed a higher frequency of Cladosporium spp., whereas in maize samples, F. verticillioides was the most frequently isolated fungus. High-performance liquid chromatography (HPLC) was used for mycotoxicological analysis of the grain samples. Maize from Palmital and Capão Bonito presented fumonisins in 88.9% and 86.1% of the samples, respectively. From the F. verticillioides isolates, 84.6% were producing FB1 + FB2. The high incidence of F. verticillioides in maize grains represents a serious problem, due to its potential in causing diseases in humans and animals.
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Fungos anemófilos e leveduras isolados em ambientes de laboratórios de microbiologia em Instituição de Ensino Superior / Airborne fungi and yeasts isolated in microbiology laboratories environments in Higher Education Institution

Martins, Otávia de Almeida 25 February 2016 (has links)
Submitted by Ubirajara Cruz (ubirajara.cruz@gmail.com) on 2017-07-05T16:00:01Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Otavia_Martins.pdf: 1248532 bytes, checksum: 732a038ac2a908e98da415247668b37e (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-07-05T19:22:33Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Otavia_Martins.pdf: 1248532 bytes, checksum: 732a038ac2a908e98da415247668b37e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-05T19:22:33Z (GMT). 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Assim, a presença desses microrganismos em laboratórios de microbiologia pode causar grandes problemas econômicos, de qualidade diagnóstica e relacionados à pesquisa, além das possibilidades de causar prejuízo à saúde das pessoas que trabalham no local. Ao fazer-se uso das normas de biossegurança, o monitoramento de fungos torna-se, então, necessário para um adequado controle ambiental, evitando assim contaminações e infecções. O objetivo deste trabalho foi realizar o isolamento e identificação da microbiota fúngica ambiental presente em nove laboratórios de ensino, pesquisa e extensão da Universidade Federal de Pelotas (UFPel) durante o período de fevereiro a novembro de 2015, abrangendo as quatro estações. A técnica utilizada foi de sedimentação em placa de Petri contendo meio Ágar Sabouraud dextrose com adição de cloranfenical. Durante o estudo foram coletadas 228 placas mensais provenientes de coletas semanais dos nove laboratórios totalizando 912 placas no final do experimento, das quais foram isoladas um total de 5101 Unidades Formadoras de Colônias (UFC). Conforme a sazonalidade, o outono foi a estação que apresentou maior número de UFC, correspondendo a 35% (1808/5101) do total encontrado, já no inverno obteve-se apenas 17,3% (884/5101). Em relação ao isolamento fúngico, o gênero Cladosporium representou 46,3% do total de UFC, seguido de Penicillium e de fungos não caracterizados quanto ao gênero, em decorrência da ausência de micélio reprodutivo, sendo então classificados como “micélio aéreo estéril”. Não houve diferença significativa entre o número de UFC encontradas nos distintos laboratórios, assim como também não houve diferença no número de UFC encontradas nos distintos ambientes pertencentes aos laboratórios. Os gêneros prevalentes foram Cladosporium e Penicillium. / The fungi present in atmospheric air are called airborne, which is the dispersion medium habitat most used by these microorganisms, which have the ability to colonize different natural substrates and efficiently. Thus, there can hardly fungal contamination-free environment. Fungal concentrations in the environment are influenced by several factors, including environmental factors and physical factors that can increase the number of propagules in the environment. The airborne fungi can cause problems such as deterioration of materials, allergies, poisoning and infections. Thus, the presence of these microorganisms in microbiology laboratories can cause major economic problems, diagnostic and research related to quality, and the potential to cause harm to the health of the people working on site. When making up the use of bio-security standards, monitoring of fungi becomes then necessary for proper environmental control, thus avoiding contamination and infections. The aim of this study was the isolation and identification of the fungal microbiota present in nine teaching laboratories, research and extension of the Federal University of Pelotas (UFPel) during the period from February to November 2015, covering the four seasons. The technique used was settling in Petri dishes containing Sabouraud dextrose agar medium with added cloranfenical. During the study were collected 228 monthly cards from weeks collection of nine laboratories totaling 912 cards at the end of the experiment, which were isolated from a total of 5101 Colony Forming Units (CFU). As the seasonal, autumn was the season that had the highest number of CFU, corresponding to 35% (1808/5101) of the total found, already in winter yielded only 17.3 % (884/5101). Compared to fungal isolation, Cladosporium genre represented 46.3 % of the CFU, followed by Penicillium fungi and not characterized as gender, due to the absence of reproductive mycelium, then being classified as "sterile aerial mycelium". There was no significant difference between the number of CFU found in different laboratories, as well as there was no difference in the number of CFUs in different environments belonging to the laboratories. The prevalent genera were Cladosporium and Penicillium.
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Sistemas de rotação de culturas e infecção de grãos de milho por Fusarium verticillioides em regiões produtoras no estado de São Paulo. / Crop rotation systems and infection of maize grains by Fusarium verticillioides in maize-producing regions in the state of São Paulo.

Danielle Diniz Atayde 20 February 2014 (has links)
Propomos avaliar a influência da rotação de culturas na infecção de milho transgênico (Bt) e cobertura morta por F. verticillioides e na presença de fumonisinas em amostras provenientes de Palmital e Capão Bonito. O isolamento fúngico da cobertura morta e do milho foi realizado em DG18 e DRBC, respectivamente. Os fungos isolados pertencentes ao gênero Fusarium foram identificados até espécie. Utilizamos, para análise de fumonisinas, Cromatografia Líquida de Alta Eficiência. Micobiota da cobertura morta revelou maior frequência de Cladosporium spp. Nas amostras de milho, F. verticillioides foi o fungo mais isolado. Dentro do gênero Fusarium, a espécie F. verticillioides foi a mais frequente. Análise micotoxicológica do milho revelou a presença de fumonisinas em 88,9% das amostras provenientes de Palmital e em 86,1% de Capão Bonito. Dos isolados de F. verticillioides 84,6% foram produtores de FB1 + FB2. A presença de F. verticillioides e fumonisinas nos grãos de milho estabelece um problema econômico e de saúde pública. / The objective of this study was to evaluate the influence of crop rotation systems on the infection of maize grains and mulch by F. verticillioides and on the presence of fumonisins in maize samples collected in Palmital and Capão Bonito. Surface seeding (DG18) and direct seeding (DRBC) were employed for fungal isolations from mulch and maize, respectively. Identified isolates belonging to the genus Fusarium were further classified at the species level. Analysis of the mulch mycobiota revealed a higher frequency of Cladosporium spp., whereas in maize samples, F. verticillioides was the most frequently isolated fungus. High-performance liquid chromatography (HPLC) was used for mycotoxicological analysis of the grain samples. Maize from Palmital and Capão Bonito presented fumonisins in 88.9% and 86.1% of the samples, respectively. From the F. verticillioides isolates, 84.6% were producing FB1 + FB2. The high incidence of F. verticillioides in maize grains represents a serious problem, due to its potential in causing diseases in humans and animals.

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