Dissertação (mestrado) - Universidade Federal Rural de Pernambuco. Programa de Pós-graduação em Recursos Pesqueiros e Aquicultura / Made available in DSpace on 2012-10-22T10:08:11Z (GMT). No. of bitstreams: 0

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Bioquímica, Florianópolis, 2017. / Made available in DSpace on 2018-01-09T03:24:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 349093.pdf: 3720270 bytes, checksum: 3800594c491e81d970ecd6dea19e24e4 (MD5) Previous issue date: 2017 / O consumo e transporte de petróleo está diretamente ligado à contaminação ambiental por hidrocarbonetos em diversas regiões do mundo. Uma vez no ambiente aquático, o petróleo e seus derivados podem produzir alterações variadas nos organismos expostos, tais como alterações biológicas de caráter molecular, celular, fisiológico ou ecológico, resultando em efeitos danosos às comunidades naturais, incluindo os organismos destinados ao consumo humano. Desta forma, a investigação dessas alterações é urgente como forma preventiva e de avaliação de ambientes aquáticos contaminados. Nesse sentido, o presente trabalho teve como principais objetivos avaliar os efeitos no perfil de proteínas em ostras após exposição à fração de óleo diesel acomodada em água, buscar genes normalizadores em ostras expostas às diferentes condições experimentais e avaliar os efeitos da contaminação do derivado foto-oxidado de petróleo 6-hidroxicriseno em peixes Danio rerio. Para atingir esses objetivos, primeiramente, ostras do mangue Crassostrea brasiliana foram expostas à fração de óleo diesel acomodada em água durante 24h e 72h com intuito de identificar biomarcadores moleculares. Entre as 11 proteínas expressas diferencialmente, podemos destacar sete: citocromo P450 6A (CYP6A), NADPH citocromo P450 redutase (envolvidas no metabolismo lipídico / xenobiótico), alfa e beta tubulina (envolvidas na formação de fagossomo mediados por retículo endoplasmático - RE), tiorredoxina e proteína ubiquitina ligase E3 (envolvidas no processamento e degradação de proteínas no RE). A avaliação de respostas em compartimentos subcelulares mostrou-se bastante sensível e viável para estudos ecotoxicológicos, além de auxiliar na compreensão dos mecanismos que envolvem o RE frente à exposição. Esses dados indicam um papel promissor da avaliação do RE em programas de biomonitoramento ambiental. Entretanto, como muito pouco é conhecido sobre a biologia molecular de C. brasiliana, surgiu a necessidade de utilizar genes normalizadores ideais para diferentes condições experimentais para adequada análise da transcrição gênica. Neste trabalho foram identificados diferentes conjuntos de genes adequados para a normalização de dados de PCR quantitativa em tempo real (qRT-PCR) em cada desenho experimental testado. O gene anquirina teve maior estabilidade de transcrição e foi considerado candidato promissor como gene normalizador em estudos posteriores. Por fim, com o intuito de aumentar as informações sobre os efeitos de compostos foto-oxidados do petróleo, avaliou-se a exposição de embriões de D. rerio ao 6-hidroxicriseno. Foram observadas respostas dos genes relacionados com transportadores iônicos (nck1 e kchna), associadas à bioacumulação e deformidades cardiácas nos animais nas fases de desenvolvimento embrionário de 74 hpf de exposição. / Abstract : The consumption and transportation of petroleum are directly linked to the contamination by hydrocarbons in many regions around the world. Once in the aquatic environment, petroleum and its derivatives can produce many alterations to exposed organisms such as biological, cellular, physiological or ecological biological alterations, resulting in harmful effects to natural communities including organisms destined for human consumption. Then, it is urgent the investigation of these impacts in an attempt to prevent and evaluate contaminated aquatic environments. In this context, the main goal of this work was to evaluate the effects of diesel oil water accommodated fraction on the proteomic profile in oysters, search for normalizing genes in oysters submitted to different experimental conditions, and evaluate the effects of photo-oxidized petroleum derivative 6-hydroxycrysene in D. rerio. In order to achieve these goals, firstly, the mangrove oyster C. brasiliana were exposed to diesel oil water accommodated fraction for 24h and 72h. Among the 11 differentially expressed proteins, we pointed out seven: cytochrome P450 6A (CYP6A), NADPH cytochrome P450 reductase (involved in lipid / xenobiotic metabolism), alpha and beta tubulin (involved in the formation of RE-mediated phagosome), tioredoxin containg-protein and ubiquitin ligase E3 protein (involved in the processing and degradation of proteins in RE). Subcellular compartments responses had shown to be sensitive and feasible for ecotoxicological studies, besides helping to understand the mechanisms that involve ER in relation to exposure. These data indicate a promising role for ER evaluation in environmental biomonitoring programs. However, few studies had focused on molecular biology of C. brasiliana, there is a necessity to use select normalizing genes ideal for different experimental conditions for adequate analysis of gene expression. In this work, different sets of genes suitable for the normalization of qRT-PCR data were identified in each experimental design tested. The ankyrin gene had greater transcriptional stability and was considered a promising candidate as a normalizing gene in later studies. Finally, in order to increase the information about the effects of photo-oxidized petroleum derivative compounds, the exposure by 6-hydroxychrisene in the embryonic development of D. rerio was evaluated. In summary, the responses of the genes related to the ionic transporters (nck1 and kchna), together with chemical aspects of bioaccumulation, have been shown to play an important role in the cardiac deformities generated during morphogenesis in the embryonic development stages in 74 hpf of exhibition.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2015-02-05T21:23:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 332350.pdf: 1934521 bytes, checksum: 93cfba87fe4f5c3f18fec10d91a5b259 (MD5) Previous issue date: 2014 / Atividades relacionadas á aquicultura marinha, tais como, a ostreicultura tem sido ameaçada em função do comprometimento da qualidade da água. O fenantreno é um dos hidrocarbonetos policíclicos aromáticos (HPAs) mais abundantes e distribuídos no ambiente aquático. Bivalves expostos a este composto mostraram efeitos nos diferentes tecidos. Este estudo avaliou em laboratório, os efeitos e alterações moleculares e histológicas que o fenantreno exerce sobre a ostra Crassostrea brasiliana (Lamarck, 1819), ao longo de 10 dias de exposição nas concentrações de 100 e 1000 µg.L-1. Técnicas histológicas, histoquímicas, e a técnica de hibridização in situ (ISH) foram utilizadas para localizar os principais tecidos que apresentam transcrição do gene citocromo P450 (CYP2AU1). Foi realizada também a identificação sexual e do estádio reprodutivo dos animais. Independente da concentração de exposição ao fenantreno, os níveis de bioacumulação pelas ostras aumentou com o passar do tempo de exposição. Foram observadas alterações histológicas na glândula digestiva e no manto dos animais expostos por 10 dias a fenantreno. As ostras expostas à maior concentração de fenantreno apresentaram um aumento significativo de células mucosas (p<0,05) em relação ao controle e aquelas expostas a menor concentração de fenantreno tiveram uma maior atrofia na glândula digestiva. Quanto à localização dos transcritos do gene do CYP2AU1 observamos reação positiva na brânquia, glândula digestiva, manto, intestino e gônadas. Os resultados encontrados neste trabalho demonstraram que o uso da técnica de ISH foi eficaz para localizar os transcritos do CYP2AU1 em diferentes órgãos da ostra C. brasiliana, além da importância na identificação de possíveis alterações histopatológicas decorrentes da exposição a fenantreno.

PEIXOTO, J. R. O. Diversidade e padrões de susceptilidade a antimicrobianos em bactérias isoladas de ostras (Crassostrea rhizophorae) e do ambiente aquático. 2012. 161 f. Dissertação (mestrado em Ciências Marinhas Tropicais) - Instituto de Ciências do Mar, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2012. / Submitted by Nadsa Cid (nadsa@ufc.br) on 2015-04-17T15:48:21Z No. of bitstreams: 1 2012_dis_jropeixoto.pdf: 1674371 bytes, checksum: 06f9b160dd42155fd8e919e0445c405d (MD5) / Approved for entry into archive by Nadsa Cid(nadsa@ufc.br) on 2015-04-17T15:48:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_dis_jropeixoto.pdf: 1674371 bytes, checksum: 06f9b160dd42155fd8e919e0445c405d (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-17T15:48:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_dis_jropeixoto.pdf: 1674371 bytes, checksum: 06f9b160dd42155fd8e919e0445c405d (MD5) Previous issue date: 2012 / The main objective of the following research was to compare the bacterial microbiota present in the soft tissue (ST) and intravalvular liquid (IL) of oysters (Crassostrea hizophorae) and water surroundings from a cultivation structure, as well as from a natural bank, establishing antimicrobial resistance profiles among bacterial isolates. The material was collected at the rio Jaguaribe estuary in Fortim-CE, from October 2010 to March 2011. Temperature, salinity and pH levels from water samples ranged from 27 to 34 °C; 38 to 42, and from 8.13 to 8.42, respectively. Shell sizes, ST weight, IL volume, ST and IL pH ranged from 36.15 to 60.66 mm; 1.24 to 3.30 g; 0.65 to 3.26 mL; 6.11 to 6.64, and from 6.83 to 7.16, respectively. Concerning in-water CHB (culturable heterotrophic bacteria) counting, cultured oysters (CO) and wild oysters (WO) IL and ST, the average values for in colony forming units (CFU) were of 32 x 103 CFU/mL; 57 x 103 CFU/mL; 31.5 x 104 CFU/g; 17 x 103 CFU/mL; 31 x 103 CFU/mL, and 58.7 x 103 CFU/g, respectively. Average values for in-water Vibrio spp. counting, CO and SO of the IL and ST were of 33.7 CFU/mL; 113 CFU/mL; 40.5 x 103 CFU/g; 32.7 CFU/mL; 28.3 CFU/ml and 236 CFU/g, respectively. For environmental parameters, salinity only had influence (r> 0.9 and P = 0.02) on CHB countings in IL and ST collected during the rainy season. No relation was established between the environmental parameters and the culturable vibrios population. From the 118 CHB cultures isolated, 101 strains were identified and distributed in 14 genera. Aeromonas, Vibrio, and Bacillus were the most frequent. From the 68 strains of vibrios identified, the highest incidences were of V. ruber (25.0%) and V coralliilyticus (16.2%). Ampicillins (AMP), cefepime, cefotaxime were the antimicrobials to which isolates presented higher resistance rates (above 60%). Chloramphenicol (CLO) was the only drug 100% related to plasmid resistance among THB strains. Regarding the vibrios, the antibiotics were the following: Chloramphenicol, florfenicol, and gentamicin. The minimum inhibitory concentration ranged from 32 to > 128 µg/ml for penicillin G in Gram-positive THBs; 16 to > 128 µg/ml ampicillin in Gramnegative THBs; 16 to 128 µg/mL ampicillin for Vibrio spp. The results indicated the presence of antimicrobials multidrug-resistant strains and a significant share of mobile elements in these profiles. Besides the well-known microbiological hazards related to fresh clams’ intake, oysters may also play an important role as a resistance spreading site to several antimicrobial with potential use on both human and veterinary medicine. / Objetivou-se comparar a microbiota bacteriana presente no tecido mole (TM) e líquido intervalvar (LI) de ostras (Crassostrea rhizophorae) e das águas do entorno de uma estrutura de cultivo e de um banco natural estabelecendo os perfis de resistência a antimicrobianos entre os isolados bacterianos. O material foi coletado no estuário do rio Jaguaribe, Fortim-CE, de outubro de 2010 a março de 2011. A temperatura, salinidade e pH das amostras de água variaram de 27 a 34 ºC, 38 a 42, 8,13 a 8,42, respectivamente. Os tamanhos das conchas, peso do TM, volume do LI, pH do TM e LI variaram de 36,15 a 60,66 mm, 1,24 a 3,30 g, 0,65 a 3,26 mL, 6,11 a 6,64 e de 6,83 a 7,16, respetivamente. Nas contagens das BHC (bactérias heterotróficas cultiváveis) na água, LI e TM das ostras cultivadas (OC) e das ostras selvagens (OS), foram obtidos valores médios em unidades formadoras de colônias (UFC) de 32 x 103 UFC/mL, 57 x 103 UFC/mL, 31,5 x 104 UFC/g, 17 x 103 UFC/mL, 31 x 103 UFC/mL e 58,7 x 103 UFC/g, respectivamente. Nas contagens de Vibrio spp. na água, LI e TM das OC e das OS, os valores médios foram de 33,7 UFC/mL, 113 UFC/mL, 40,5 x 103 UFC/g, 32,7 UFC/mL, 28,3 UFC/mL e 236 UFC/g, respectivamente. Dentre os parâmetros ambientais, apenas a salinidade apresentou influência (r > 0,9 e P = 0,02) sobre as contagens das BHC presentes nos LI das OC coletadas durante a estação chuvosa. Para a população cultivável de víbrios, nenhuma correlação foi estabelecida com os parâmetros ambientais. Das 118 culturas de BHC isoladas, 101 cepas foram identificadas e se distribuíram em 14 gêneros, sendo Aeromonas, Vibrio e Bacillus, os mais frequentes. Das 68 cepas de víbrios identificadas, a maior incidência foi de V. ruber (25,0%) e V. coralliilyticus (16,2%). Ampicilina (AMP), cefepima, cefotaxima, foram os antimicrobianos aos quais os isolados apresentaram os maiores percentuais de resistência (acima de 60%). Cloranfenicol (CLO) foi a única droga que teve 100% de resistência relacionada a plasmidio entre as cepas de BHC, e para os víbrios foram: cloranfenicol, florfenicol e gentamicina. A concentração inibitória mínima variou de 32 a >128 mcg/mL para a Penicilina G nas BHC Gram-positivas, 16 a >128 mcg/mL de ampicilina nas BHC Gram-negativas, e de 16 a 128 mcg/mL de ampicilina para Vibrio spp. Os resultados indicaram a presença de cepas multirresistentes a antimicrobianos e uma significativa participação de elementos móveis nesses perfis. Além dos conhecidos riscos microbiológicos relacionados a ingestão de moluscos in natura, as ostras também podem desempenhar um importante papel como sítio de disseminação de resistência a vários antimicrobianos tanto de uso na clínica médica humana como veterinária.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2015. / Made available in DSpace on 2016-01-15T14:47:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 336711.pdf: 582019 bytes, checksum: 7b50dc130e2dd49d075cc47ca5311391 (MD5) Previous issue date: 2015 / A ostra nativa Crassostrea gasar tem grande potencial para cultivo, no entanto a literatura sobre este assunto ainda é escassa. O objetivo do trabalho foi comparar o crescimento da ostra C. gasar cultivada em dois sistemas de cultivo suspensos. Exemplares foram submetidos a seis tratamentos: Um suspenso flutuante (sempre submerso) e cinco suspensos fixos (submerso em marés maiores ou iguais a 0,9 m, a 0,7 m, a 0,5 m, a 0,3 m e a 0,1 m). O delineamento experimental foi inteiramente casualizado com três repetições. Mensalmente, de cada unidade experimental, 30 ostras eram amostradas para a biometria. Foram aferidos peso vivo total (g), altura (mm), comprimento (mm) e largura (mm). Ao final de sete meses de cultivo, para todas as dimensões avaliadas, os melhores resultados foram obtidos nos tratamentos suspenso flutuante e suspenso fixo submerso em marés maiores ou iguais a 0,1 m, não havendo diferença estatística entre os mesmos. As ostras atingiram nestes tratamentos, respectivamente, médias de 16,72 ± 1,7 g e 16,41 ± 0,90 g de peso vivo total, e 45,96 ± 0,23 mm e 49,78 ± 2,15 mm de altura. Conclui-se que as ostras Crassostrea gasar apresentam melhor crescimento quando cultivadas em sistema flutuante e em nível de maré abaixo de 0,1 m.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2016-09-20T04:39:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 341967.pdf: 1223562 bytes, checksum: ea3f2bcb8e8e7c0014ae64710106fd98 (MD5) Previous issue date: 2016 / Para manter o crescimento da atividade de produção de ostras e atender a demanda do mercado, o desenvolvimento de novas tecnologias para produção de pré-sementes de Crassostrea gigas em laboratório faz-se necessário. Desde o surgimento da indústria na década de 1960 não houve um incremento tecnológico relevantes na produção de sementes recém-assentadas. No sistema de leito fluidizado que em síntese, consiste na produção de sementes em alta densidade com fluxo de água e alimentação controladas, mantendo as sementes recém-assentadas em suspensão, todo material excretado pelos animais são direcionados para fora do cultivo, priorizando a qualidade da água. Com a utilização dessa tecnologia é possível maximizar a produção, utilizando áreas de cultivo em laboratório menores e, consequentemente, reduzindo o tempo de manejo, além de reduzir o volume de água utilizado. Neste estudo comparou-se o crescimento, a sobrevivência e consumo de alimento de diferentes tamanhos das sementes de Crassostrea gigas em sistema de leito fluidizado e upwelling. Para o sistema de leito fluidizado também foram comparadas densidades visando avaliar o comportamento das sementes sob diferentes condições de densidade de cultivo. Os parâmetros físico-químicos se mostraram, em ambos os experimentos, dentro do padrão estabelecido para a espécie. No experimento de densidade foi possível obter um crescimento volumétrico 1.316%, durante os oito dias do período experimental, no tratamento com 4.877,21 pré-sementes por cm². No experimento de comparação entre os sistemas, para sobrevivência, não houve diferença entre os tratamento e sistemas obtendo uma sobrevivência média de 95,48±2,76%. Da mesma forma, para o consumo de microalgas não foi observado diferença significativa entre os sistemas, contudo houve diferenças entre os tratamentos, T1000, T710 e T500. Neste caso, observou-se a redução do consumo de microalgas com a redução do tamanho médio das pré-sementes. Em relação ao crescimento altimétrico e volumétrico, o sistema de upwelling foi superior quando comparado ao sistema de leito fluidizado. Entre os tratamentos do sistema de upwelling não foi observado diferença estatística para as variáveis de crescimento, entretanto para os tratamentos do sistema de leito fluidizado, o tratamento TL1000 levou a melhores resultados. Esses estudos propiciaram entender um pouco mais sobre a produção de pré-sementes de C. gigas em sistema de leito fluidizado, todavia novos estudos devem ser executados para otimizar a produção de pré-sementes de C. gigas.<br> / Abstract : To keep the growth of oyster production and reach the market demand, the development of new technologies for Crassostrea gigas spats production is necessary. Since the beginning of the industry, in the 1960s, there have been significant technological advances in the production of newly settled spats. The fluidized bed system is the high-density production of spats in water flow and feeding control that keeps the spats in suspension and directs the excreted material out of the system, prioritizing the quality of the water. To use this technology, it is possible to maximize the production, using smaller growth areas, and consequently, reducing the working time and the amount of water used. This study compared the growth, survival and food intake for different sizes spats of Crassostrea gigas in upwelling and fluidized bed systems. Densities were also compared in fluidized bed system. The physical and chemical parameters in both experiments were within the pattern established for the species. In the density experiment we found a volumetric growth of 1,316% in the trait of 4,877.21 spats per cm². There were no differences between survivals and intake of microalgae when we compared the systems; the general average was of 95.48±2.76%. However, we found differences in intake within systems; there were a reduction of the microalgae intake by reduction of the average size of spat. Altimetry and volumetric growth was superior in the upwelling when compared to the fluidized bed system. In upwelling system, there was not statistical difference in the growth variables; however, for the fluidized bed treatment system, TL1000 trait showed better results. These studies allowed understanding of the production of C. gigas spats in a fluidized bed system; however, further studies will be needed to optimize the production of C. gigas spats.

Orientador : Prof. Dr. Antonio Ostrensky / Coorientadora : Dra. Gisela G. Castilho-Westphal / Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Zoologia. Defesa: Curitiba, 21/02/2017 / Inclui referências ao final de cada capítulo / Area de concentração: Zoologia / Resumo: Esta tese foi dividida em cinco capítulos relacionados à cadeia produtiva brasileira de ostras do gênero Crassostrea. No Capítulo I avaliou-se, em condições laboratoriais, a sobrevivência e a histopatologia de C. gasar expostas a diferentes salinidades. Ostras foram submetidas à aclimatação gradual a 14 salinidades entre 0 e 65 UPS e sua sobrevivência foi monitorada diariamente por até 365 dias. Foram definidas três faixas de tolerância à salinidade (ótima: 4 a 40 UPS; tolerável: 2,1 a 3,9 e 41 a 49 UPS; e, intolerável: 0 a 2 e > 50 UPS), a partir dos dados de sobrevivência. A salinidade não induziu alterações teciduais. No Cap. II analisou-se a eficácia de seis métodos de redução de organismos epibiontes em ostras (exposição à água doce; à água hipersalina; à água com hipoclorito de sódio; à água contendo solução de amônia quaternária; exposição ao ar e limpeza por hidrojateamento). Foram identificados 56.407 organismos epibiontes, pertencentes a nove filos, principalmente Arthropoda, Mollusca e Annelida. Os tratamentos com água doce e hidrojateamento foram os mais eficazes na redução de epibiontes e resultaram em uma menor mortalidade de ostras. No Cap. III avaliou-se a microbiota bacteriana de ostras cultivadas em sete estados do Nordeste brasileiro, a partir da metagenômica, durante períodos de seca e de chuvas. Foram identificados 106 gêneros de bactérias pertencentes a 103 famílias, 70 ordens, 39 classes e 21 filos. Dos gêneros identificados, 40 foram de bactérias potencialmente patogênicas para os seres humanos e seis para ostras, sendo os mais prevalentes Mycoplasma, Propionigenium, Psychrilyobacter e Arcobacter. No Cap. IV abordou-se a influência das condições de armazenamento sobre a microbiota bacteriana de ostras vivas. Ostras foram expostas a dois tratamentos (TI=imersão em água; TII=exposição ao ar), em cinco temperaturas entre 5 e 25°C, por 10 dias. As ostras imersas em água apresentaram maior quantidade de gêneros bacterianos (n=163) quando comparadas àquelas expostas ao ar (n=104). Foram identificados 59 gêneros potencialmente patogênicos para os seres humanos (TI=56 e TII=45). Recomenda-se que durante o armazenamento e a comercialização, as ostras vivas sejam expostas ao ar entre 5 e 25°C, em substituição a técnica de imersão em água, por ser esse um método mais eficaz e seguro. No Cap. V caracterizou-se a microbiota bacteriana em ostras comercializadas no estado do Paraná, em diferentes formas de apresentação comercial, por metagenômica. Foram analisadas amostras de ostras in natura, minimamente processadas (congeladas inteiras) e ultraprocessadas (carpaccio, ostras prontas para gratinar ou ostras com molho branco) provenientes de supermercados, peixarias e fazendas de cultivo de cinco mesorregiões do estado do Paraná. Foram identificados 88 gêneros bacterianos pertencentes a 80 famílias, 45 ordens, 24 classes e 15 filos. Havia bactérias relacionadas à qualidade da água de cultivo (Vibrio, Bacteroides), a forma de armazenamento (Shewanella, Psychrobacter, Acinetobacter e Pseudoaltermonas), aos ingredientes utilizados nas amostras ultraprocessadas (Lactobacillus) e à manipulação (Streptococcus). A microbiota bacteriana das ostras comercializadas no Paraná esteve associada à apresentação desse alimento. Também foram identificadas bactérias potencialmente patogênicas e que não são alvo de monitoramento pela legislação sanitária brasileira. A partir dos resultados pode-se afirmar que fatores físicos, químicos e biológicos, testados no presente estudo, tiveram influência direta sobre a sobrevivência e a qualidade microbiológica de ostras cultivadas e comercializadas em diferentes regiões brasileiras. Palavras-chave: cultivo; ostreicultura; patogenicidade; microbiologia; metagenômica / Abstract: This thesis is divided in five chapters related to the Brazilian productive chain of oysters of the genus Crassostrea. In Chapter I, the survival and histopathology of C. gasar exposed to different salinities were evaluated under laboratory conditions. Oysters underwent gradual acclimatization at 14 salinities between 0 and 65 UPS and their survival was monitored daily for up to 365 days. Three ranges of tolerance to salinity were identified (optimal: 5 to 35 UPS, tolerable: 3, 4 and 40 UPS, and intolerable: 0 to 2 and 45 to 65 UPS). Salinity did not induce tissue changes. The effectiveness of six methods of reducing biofouling in oysters (exposure to fresh water, hypersaline water, water with sodium hypochlorite, water containing quaternary ammonia solution, air exposure and cleaning by Hydro blasting). We identified 56.407 biofouling organisms belonging to nine phyla, mainly Arthropoda, Mollusca and Annelida. Freshwater and hydro blasting treatments were the most effective in reducing biofouling and resulted in lower oyster mortality. In Chapter III the bacterial microbiota of oysters framed in seven Brazilian Northeast states was evaluated by sequencing of next generation during periods of drought and rainfall. We identified 106 genera of bacteria belonging to 103 families, 70 orders, 39 classes and 21 phyla. Of the genera identified, 40 were from bacteria potentially pathogenic to humans and six to oysters, the most prevalent being Mycoplasma, Propionigenium, Psychrilyobacter and Arcobacter. In Chapter IV the influence of the storage conditions on the bacterial microorganism of live oysters was discussed. Oysters were exposed to two treatments (TI = immersion in water; TII = air exposure), at five temperatures between 5 and 25 ° C, for 10 days. Oysters immersed in water had a higher amount of bacterial (n = 163) compared to those exposed to air (n = 104). Fifty-nine genera were identified as potentially pathogenic for humans (TI = 56 and TII = 45). It is recommended that during live storage and marketing live oysters are exposed to air at 5 to 25 °C, replacing the immersion technique in water, as this is a more effective and safe method. In Chapter V the bacterial microbiota was characterized in oysters commercialized in the state of Paraná, in different forms of commercial presentation, by sequencing of new generation DNA. Samples of live, minimally processed (whole frozen) and ultraprocessed oysters (carpaccio, oysters ready for gratin or oysters with white sauce) were analyzed from supermarkets, fishmongers and farms of five mesoregions from the state of Paraná. We identified 88 bacterial genera belonging to 80 families, 45 orders, 24 classes and 15 phyla. There were bacteria related to the quality of cultured water (Vibrio, Bacteroides), the storage form (Shewanella, Psychrobacter, Acinetobacter and Pseudoaltermonas), the ingredients used in the samples ultraprocessed (Lactobacillus) and manipulation (Streptococcus). The bacterial microbiota of oysters marketed in Paraná was associated with the presentation of this food. Potentially pathogenic bacteria have also been identified and are not subject to monitoring by Brazilian sanitary legislation. Our results suggest that physical, chemical and biological factors, tested in the present study, display a direct influence on survival and microbiological quality of oysters farmed and commercialized in different Brazilian regions. Keywords: cultivation; oyster farming; patogenicity; microbiology; metagenômica.

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Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciencias Agrarias / Made available in DSpace on 2012-10-17T08:59:12Z (GMT). No. of bitstreams: 0

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2010 / Made available in DSpace on 2012-10-25T13:39:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 282353.pdf: 2878481 bytes, checksum: dfbb804a538ff39823a3fcb921ebe472 (MD5) / Dentre as espécies nativas com potencial de cultivo, estão a ostra perlífera Pteria hirundo (Linnaeus, 1758) e o molusco de areia Cyrtopleura costata (Linnaeus, 1758). O tempo de larvicultura de P. hirundo variou de 19 a 32 dias. Foram testadas duas salinidades: 30# e 35#, sendo a última favorável ao manejo assim como troca de água a cada 48 horas, quando comparada com troca diária. Em densidade de larvas inferiores a 8,5 larvas/mL-1 a sobrevivência larval final foi superior a 19%. O bioensaio em larvas de P. hirundo indicou que a combinação de temperatura a 23?C com salinidade 35 # favoreceu a sobrevivência e o desenvolvimento larval e temperaturas elevadas favoreceram o crescimento. Verificou-se que microalgas flageladas combinadas com diatomáceas propiciaram um maior crescimento e sobrevivência larval. A taxa de recuperação de assentamento observada nas larvas de P. hirundo foi de 69,64%, após duas semanas de manutenção em laboratório. O crescimento das sementes de P. hirundo, em cultivo no mar, foi mais acentuado nas ostras de classe média quando comparada às da classe alta. A sobrevivência nesta etapa de cultivo foi superior a 90% nas duas classes testadas. Os reprodutores de Cyrtopleura costata foram obtidos sempre em maré seca, observando-se o orifício do sifão no substrato areno-lodoso. A manutenção de reprodutores em laboratório favoreceu a integridade dos animais, quando comparado a estruturas mantidas no mar. A desova ocorre em poucos minutos após início da indução. O tempo de larvicultura variou entre 29 e 34 dias.