Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-02-22Bitstream added on 2014-06-13T19:46:59Z : No. of bitstreams: 1 moreno_gmb_me_jabo.pdf: 352503 bytes, checksum: 6ae1341109d20344528d13b1062a3175 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Utilizou-se 32 cordeiros Ile de France, não castrados, alimentados com dietas contendo silagem de milho ou cana-de-açúcar em duas relações volumoso:concentrado, 60:40 ou 40:60. Os animais permaneceram confinados individualmente com controle do alimento fornecido e sobras, e foram abatidos aos 32 kg de peso corporal. O ganho de peso foi maior nos animais alimentados com silagem de milho (294,6 g/dia) e na relação 40:60 (314,3 g/dia). Cordeiros alimentados com silagem de milho apresentaram maior consumo de todos os nutrientes digestíveis, exceto de proteína bruta (PB) (162,00 g/dia) e carboidratos não fibrosos (471,42 g/dia). Houve maiores coeficientes de digestibilidade da matéria seca (78,91%), PB (81,30%) e energia bruta (78,77%) nos animais alimentados com cana-de-açúcar. As características in vivo e da carcaça dos cordeiros não foram afetadas (p>0,05) pela relação volumoso:concentrado e tipo de volumoso, exceto a condição corporal, que foi maior (3,85) nos cordeiros alimentados com 40% de volumoso. O conteúdo do trato gastrintestinal foi maior nos cordeiros alimentados com cana-de-açúcar (15,17%) e na relação 60:40 (14,55%). Os rendimentos de carcaça quente (48,6%) e comercial (47,3%) foram menores nos cordeiros que receberam cana-de-açúcar. Houve menor rendimento de lombo nos cordeiros alimentados com cana-de-açúcar (9,1%) e na relação 60:40 (9,2%)... / Thirty-two male Ile de France lambs, non castrated, were submitted to diets containing corn silage or sugar cane with two roughage:concentrate ratio, 60:40 or 40:60. The lambs were confined individually with control of the food supplied and leftovers and were slaughtered at 32 kg of body weight. The daily weight gain were greater for lambs fed up with corn silage (294.6 g/day) and for the 40:60 roughage:concentrate ratio (314.3 g/day). Lambs fed up with corn silage showed greater intake for all digestible nutrients, except for crude protein (162.0 g/day) and non fiber carbohydrate (471.42 g/day). The digestibility coefficients of dry matter (78.91%), crude protein (81.30%) and crude energy (78.77%) were greater in lambs that received sugar cane. The in vivo and carcasses traits were not affected (p>0.05) by diets, except for the corporal condition, that was greater (3.85) in lambs that received 40% of roughage. The contain of gastrointestinal tract was greater in lambs fed up with sugar cane (15.17%) and 60% of roughage (14.55%). The warm (48.6%) and commercial (47.3%) carcass yields were smaller in lambs that received sugar cane, 48.6 and 47.3%. There was smaller loin yield in the lambs fed up with sugar cane (9.1%) and 60% of roughage (9.2%)...(Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-04-01Bitstream added on 2014-06-13T20:40:07Z : No. of bitstreams: 1 homemjunior_ac_me_jabo.pdf: 310961 bytes, checksum: ec5e5ee99a7719d8d830586d7844c73a (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Foi estudada a inclusão de lipídios advindos dos grãos de girassol ou da gordura protegida em dietas com alto concentrado para cordeiros sobre a digestibilidade dos nutrientes e o balanço nitrogenado. Foram utilizados 12 cordeiros com peso médio de 25 kg distribuídos em delineamento inteiramente casualizado (DIC), onde foram coletadas totalmente as excretas. A fermentação ruminal foi realizada utilizando seis ovinos, com peso médio de 30 kg, canulados no rúmen, distribuídos em delineamento quadrado latino duplo com três dietas e três períodos, nos quais foram amostrados conteúdos e realizadas incubações ruminais para avaliação do pH, amônia, ácidos graxos voláteis,' massa microbiana e degradabilidade dos ingredientes. O desempenho em confinamento com ganho compensatório foi realizado utilizando 36 cordeiros, com peso médio de 18 kg, distribuídos num DIC em esquema fatorial 3 dietas e 2 manejos de alimentação. Não foram observados efeitos da dieta sobre a digestibilidade da matéria seca (67,3%), proteína bruta (72,1%) carboidratos totais (60,9%) e carboidratos não fibrosos (93,7%), assim como para o balanço nitrogenado, apresentando valores médios 36,1 g/dia para ingestão, de 17,5 g/dia para retenção e relação retido/absorvido de 66,9%. Não houve diferenças entre as dietas para a concentração ruminal de amônia (18 mg/dL), pH (6,1), produção total (98 mM), proporções molares de acetato (66,4%), propionato (20%) e butirato (13%) e para razão acetato: propionato... / One evaluated the inclusion of lipids from either the sunflower grains or protected fat in high-concentrated diets for lambs on nutrients digestibility and nitrogen balance. 12 lambs were used (average weight of 25 kg) in randomly assigned design, were totally collected excrete. The fermentation ruminal was accomplished using six sheep (average weight of 30 kg) with fistula in the rumen, distributed in double Latin Square design with three diets and three periods, were sample contents and ruminal incubations for evaluation of pH, ammonia, short chain fat acids, microbial mass .and ingredients degradability. The performance in feedlot with compensatory gain was achieve using 36 lambs (average weight of 18 kg), were randomly assigned in factorial scheme (3 diets X 2 feeding handlings). One could not associate any etfects of the diet with the dry matter digestibility (67.3%), crude protein digestibility (72.1 %), total carbohydrates (60.9%) and no fiber carbohydrate (93.7%), as well as for nitrogen balance, that results in an average nitrogen intake value of 36.1 g/day, retention value of 17.5 g/day and a 66.9% retained/absorbed relation. There were no significant differences among the diets for ruminal ammonium concentration (18 mg/dL), pH (6.1), total production short chain fat acids (98 mM), acetate molar proportion (66.4%), propionate (20%) and butyrate (13%) and neither for the acetate:propionate ratio (3.2: 1 ). During the initial feedlot period, the weight gain was superior (p<0.05) when the animais were fed the.sunflower grains ration (280 g/day) in relation when they were fed protected fat ration (208 g/day), no apparent difference (p>0.05) was detected in comparison to the control diet... (Complete abstract click electronic access below)

O entendimento das relações entre as características do pasto e as respostas do comportamento ingestivo animal é fundamental para o aprimoramento de inovações no manejo de pastagens, tornando os sistemas pastoris mais eficientes e competitivos. Neste estudo comparamos dois métodos de pastoreio (Rotativo x Contínuo) e duas intensidades de pastejo (Moderada e Baixa) a fim de compreendermos como as características de pastos de azevém anual (Lolium multiflorum Lam.) influenciam o comportamento ingestivo e o ganho médio diário de ovinos. Observamos que o método de pastoreio afeta a quantidade de folhas e inflorescências, influenciando a composição química da forragem, além da taxa de bocados e o tempo de pastejo dos ovinos. Por outro lado, as intensidades de pastejo influenciaram os bocados por estação alimentar e o número de refeições. Além disso, variáveis como: estação alimentar por minuto, duração das refeições e tempo de pastejo foram positivamente correlacionadas com o ganho médio diário dos animais, assim, podem ser utilizadas como preditoras do ganho médio diário de ovinos. Encontramos evidências de que em pastoreio rotativo, ambas as intensidades de pastejo estudadas promoveram um rebaixamento em torno de 45% da altura pré-pastejo. A estrutura do pasto e a composição química da forragem foram adequadas para o pastejo de ovinos até o início do estádio reprodutivo do azevém anual. No entanto, ao final do estádio reprodutivo da pastagem, ambas as intensidades de pastejo restringiram os padrões de comportamento ingestivo dos ovinos nas maiores escalas espaço-temporais. Essa restrição é acentuada durante o rebaixamento do pasto, em decorrência da redução no percentual de lâminas foliares, alterando o comportamento ingestivo de ovinos. Logo, a resposta comportamental de ovinos depende de: (i) taxa de lotação, (ii) nível de desfolha do dossel, (iii) período do estádio reprodutivo do azevém anual e composição estrutural da forragem durante o rebaixamento. / The understanding of the relationships between sward characteristics and the animals' ingestive behavior responses is fundamental for the improvement of sward management innovations, making pastoral systems more efficient and competitive. In this study, we compared two stocking methods (Continuous and Rotational) and two grazing intensities (Moderate and Low) to understand how the sward characteristics of annual ryegrass (Lolium multiflorum Lam.) influence the ingestive behavior and the average daily gain of sheep. We observed that the stocking method affect the quantity of leaf blades and inflorescences influenced forage chemical composition, as well as the bite rate and grazing time of sheep. On the other hand, grazing intensities had influence the bites by feeding station and meals number. Moreover, variables as feeding station per minute, meals duration and grazing time were positively correlated with the average daily gain, thus, they can be used as predictors for the average daily gain of sheep. We found evidence that both grazing intensities studied promote a grazing down around 45% of pre-grazing sward height in rotational stocking. Sward structure and forage chemical composition, were adequate for sheep grazing until the beginning of the sward reproductive stage. However, from the stage 2 of grazing down at the end of the sward reproductive stage, both grazing intensities apparently restricted the sheep‟s ingestive behavior patterns in the larger spatial and temporal scales of grazing. Therefore sheep‟s behavioral response depends on: (i) stocking rate, (ii) canopy defoliation level, (iii) period of sward reproductive stage and forage structural composition during grazing down.

Objetivou-se avaliar diferentes maneiras de manejar o campo nativo durante o período hibernal para alimentar ovelhas no inicio de gestação e determinar a melhor metodologia para tal fim, por meio das características produtivas e comportamentais dos animais assim como modificação na estrutura e qualidade da pastagem. Para tal, foram testados, com delineamento em blocos casualizados com quatro tratamentos e três repetições, dois métodos de pastoreio (contínuo (LC) e rotativo (LR)) e dois níveis de oferta de forragem (12 e 18% OF). As variáveis utilizadas para descrever as características produtivas dos animais foram: ganho médio diário das ovelhas e cordeiros, escore de condição corporal das ovelhas e o ganho de peso, em unidade de área, das ovelhas, cordeiros e o ganho total por área. Além destes, foram avaliados parâmetros de comportamento ingestivo, que são o tempo diurno de pastejo, ruminação e outras atividades, número, tamanho e intervalo de refeições, número, tempo e número de passos entre estações alimentares e taxa de bocados. As variáveis medidas no pasto foram: massa de forragem, taxa de acumulo, altura, massa de folhas verdes, colmos, leguminosas e “outras espécies”, e as características bromatológicas (proteína bruta, FDN, etc.) do pasto ao longo do tempo de duração do experimento. Os resultados apontaram que as OF, apesar de provocar modificações significativas na massa de forragem e altura do pasto, teve pouca influencia nos parâmetros de comportamento animal em pastejo e pouca influencia no desempenho produtivo dos animais, provavelmente devido ao baixo contraste que as ofertas de forragem intermediárias proporcionaram durante o inverno. Os métodos de utilização da pastagem também não apresentaram influência marcante sobre o desempenho produtivo das ovelhas, mas modificou drasticamente o comportamento ingestivo dos animais. Os animais manejados em LR apresentaram menores tempos de pastejo do que os animais mantidos em LC, e esse tempo variou também entre os dias de avaliação. A interação dos dois fatores não teve influência no peso dos cordeiros ao nascer, porém, influenciaram as características estruturais e bromatológicas do pasto. Onde no manejo no inverno foi constituído pelo método contínuo e 12% de OF, a pastagem apresentou uma menor quantidade de outras espécies e presença predominante de espécies de melhor qualidade, ficando mais “limpa” e melhor qualidade nutricional na primavera. Essa melhor qualidade nutricional, por sua vez, apesar de não modificar significativamente os ganhos individuais de ovelhas e cordeiros, modificou a quantidade de peso vivo produzido em unidade de área. / The main objective was to evaluate strategies to manage the grassland during the winter season to feed ewes at the early pregnancy and determine the best method for this purpose, through the animal production characteristics, their ingestive behavior as well as modification of the structure and quality of the pasture. The experiment was set up in a randomized block design with four treatments and three replicates, two grazing methods (continuous (CS) and rotational (RS)) and two levels of herbage allowance (HA; 12 - and 18% LW). The variables used to describe the animals performance were: average daily gain of sheep and lambs, ewes body condition score and weight gain in unit area of the sheep, lambs and total gain per area. It was also assessed parameters of ingestive behavior as the diurnal grazing time, ruminating and other activities, number , size and range of meals, number, time and step number between feeding stations and biting rate. The variables measured in the pasture was: herbage mass, accumulation rate, height, mass of green leaves, stems, legumes and 'other species' and nutritive characteristics values (crude protein, NDF, etc.) of the pasture over all time of duration of the experiment. The results showed that the HA, although cause some significant changes in herbage mass and sward height, had little influence on animal behavior parameters and little influence on the productive performance of animals, probably due to the low contrast that intermediate herbage allowance provided. The grazing methods also had no significant influence on the performance of the sheep, but dramatically changed the ewes grazing behavior. The smaller area in the RS promoted a shorter grazing time than the time observed on a CS, and the grazing time on RS also varied during the days. The interaction of the two factors did not influence the weight of lambs at birth, however, influence the structural and chemical characteristics of the pasture. Where the management in winter was constituted by CS and 12% HA, the pasture had a lower amount of other species, being “cleaner” and, also presents a better nutritional quality in the subsequent spring. This improved nutritional quality, in turn, while not significantly modify the ewes and lambs individual gains, changed the amount of weight produced on unit of area, been more productive than other combinations.

A agropecuária tem um importante papel na economia do Brasil. Fertilizantes nitrogenados estão entre os principais insumos da agropecuária mundial, e o seu uso em grandes volumes geram problemas ambientais. Sistemas Integrados de Produção Agropecuária (SIPAs) buscam a maior eficiência no uso dos recursos naturais em comparação às monoculturas agrícolas, reduzir as perdas de nutrientes e promover a ciclagem do nitrogênio (N). O animal é considerado um catalizador da ciclagem de nutrientes e em um SIPA a intensidade de pastejo e a fertilização, são as principais variáveis a ser manejada na fase pastagem, pois determinam a cobertura do solo, que é transferida para a fase lavoura e influencia a sua produtividade. A soja e o milho estão entre as mais importantes culturas da agricultura Brasileira. A soja tem o potencial de suprir parte das suas demandas através da Fixação Biológica de N, já o milho é dependente do solo para atender a sua necessidade por N. A adubação antecipada baseia-se em que a exportação de nutrientes na fase lavoura é maior do que na fase pastagem. Propõe-se que a adubação seja realizada no inverno, promovendo maiores rendimentos da fase pastagem e a ciclagem dos nutrientes para a fase lavoura. O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito da adubação nitrogenada em pastagem de azevém pastejada por ovinos sob diferentes intensidades de pastejo e métodos de pastoreio no índice de nutrição nitrogenada das culturas de verão em SIPAs. Este estudo foi realizado entre os anos 2013 e 2014, em um experimento de longa duração iniciado em 2003, em SIPA, o qual é composto por 32 unidades experimentais delineados em blocos casualizados, com quatro tratamentos, dois métodos de pastoreio, contínuo e rotativo, duas intensidades de pastejo, moderada e baixa em pastagem de azevém-anual pastejada por ovinos, no período de inverno e dois sistemas de cultivos de verão, monocultivo de soja e rotação soja/milho, com quatro repetições. A fertilização foi realizada exclusivamente na fase pastagem com 75 kg de N e 60 kg de P2O5 e K2O ha-1. A massa de forragem residual (MFR) foi avaliada ao final da fase pastagem. Durante o verão foram avaliados o rendimento de fitomassa das culturas de verão durante a fase vegetativa, o teor de N na fitomassa e o Índice de Nutrição Nitrogenada (INN) das culturas. Para a cultura do milho, houve efeito das intensidades de pastejo (P<0,05) para INN e MFR. Para as culturas da soja houve efeito das intensidades de pastejo (P<0,05) apenas para a MFR. Não foi encontrada diferença entre os métodos de pastoreio para as duas culturas. A MFR é uma importante fonte de N para a cultura de verão subsequente. Menores intensidades de pastejo resultam em maiores MFR e, consequentemente, maiores INN para a cultura do milho. A adubação nitrogenada antecipada não apresentou efeito sobre a soja uma vez que esta cultura tem a capacidade de atender a sua demanda por N através da Fixação Biológica de N. / Agriculture has an important role in Brazilian economy. Nitrogen fertilizers are among the main inputs of worldwide agriculture, and its use in large volumes has generated environment problems. Integrated Crop Livestock Systems (ICLS) search for a more efficient use of natural resources than monoculture agriculture systems, reduce Nitrogen (N) losses and promote its cycling. The animal is consider a catalyst for nutrient cycling and in an ICLS, the grazing intensity along with fertilization, are the main variable to be manage in the pasture phase, since it determines the soil cover, which is transfer to the crop stage and directly influences its yield. Soybean and maize are among the most important crops of the Brazilian agriculture. Soybean has the potential to attend most of their demands for nitrogen (N) through the Biological Fixation, on the other hand, maize is dependent on soil fertility to attend their need for this nutrient. Early fertilization is based on that the export of nutrients in the crops phases is greater than pasture phase. Is propose that the fertilization should be manage on winter, because it would provide higher yields of pasture phase and recycling of nutrients to the crop stage. The objective of this study was to evaluate the effect of early nitrogen fertilization on Italian ryegrass pasture grazed by sheep under different grazing intensities and grazing methods on ICLS summer crops nitrogen nutrition index. This work was perform between 2013 and 2014, in a long-term ICLS experiment, with 32 experimental units designed in a randomized block with four treatments and four replications. The treatments were two stocking methods, continuous and rotational grazing, two grazing intensities, moderate and low, with Italian ryegrass grazed by sheep on winter, and two cropping systems, soybean monoculture and soybean/maize crop rotation, on summer. The fertilization management was 75 kg of N, 60 kg of P2O5 and K2O ha-1. The residual forage mass (RFM) on the end of grazing phase. During summer were evaluate the crops biomass yield on vegetative phase, the N content on the phytomass, and the crops NNI. On maize crop area were found effect of the grazing intensities (P<0.05) on the RFM and NNI. On soybean crop area was found effect of the grazing intensities (P<0.05) on the RFM. There were no differences between the grazing methods in both crop systems, and on RFM and NNI of soybeans areas (P>0.05). The RFM is an important summer crop N source. Lowest grazing intensities result on higher RFM, and consequently in higher NNI on maize crop. The early fertilization does not cause effects on soybean, once this crop has the ability to meet its demand for N by N Biological Fixation.

A coloração dos animais é uma característica que apresenta uma grande diversidade de fenótipos nas diferentes espécies. Diferentes abordagens podem ser utilizadas para o entendimento da diversidade na coloração existente nas espécies animais. Através da análise de genes candidatos as mutações responsáveis pela variação na coloração têm sido descritas em diferentes espécies, demonstrando o envolvimento de mecanismos moleculares variados na sua regulação. Este trabalho tem por objetivo a utilização de duas abordagens genéticas para o estudo da variação na coloração, a análise de genes candidatos e a predição computacional do efeito de polimorfismos não sinônimos. Em ovinos a coloração da lã é uma característica com importância na produção e para a identificação das raças. Polimorfismos em diferentes genes foram associados com a coloração da lã, entretanto, estes não foram estudados em muitas raças que apresentam variação fenotípica. A ovelha crioula é uma raça local existente no sul do Brasil que apresenta uma ampla diversidade de cores na lã, incluindo branco, preto e diversos tons intermediários. O gene receptor de melanocortina 1 (MC1R) foi previamente associado com a coloração na raça crioula, entretanto, outros genes também devem estar envolvidos na regulação da coloração na raça. Este trabalho avaliou a influência dos genes MC1R, ASIP (proteína sinalizadora agouti), TYRP1 (proteína relacionada à tirosinase 1) e KIT (homólogo do oncogene de sarcoma felino viral v-kit Hardy-Zuckerman 4) na coloração da lã na raça ovina crioula. Amostras de 410 animais de diferentes cores foram analisadas, sendo a variação na coloração da lã determinada por colorimetria. O padrão de herança dos fenótipos foi avaliado através de cruzamentos dirigidos entre indivíduos de diferentes cores. Os polimorfismos nos genes foram avaliados através da realização do sequenciamento e da análise de fragmentos e a quantificação da expressão do gene ASIP foi realizada por PCR em Tempo Real. Foi observada a associação significativa entre polimorfismos nos genes MC1R e ASIP e a cor da lã na raça crioula. O alelo dominante do gene MC1R, provocado pelas mutações p.M73K e p.D121N, foi encontrado apenas em indivíduos pigmentados. Este alelo resulta na ativação constitutiva do receptor, e consequentemente na produção constante de eumelanina, sendo epistático sobre o gene ASIP. Nos animais homozigotos para o alelo selvagem do MC1R a manifestação do fenótipo branco ocorreu somente nos portadores de um alelo contendo a duplicação do gene ASIP. Os portadores da duplicação do ASIP apresentaram níveis elevados de expressão do gene enquanto os homozigotos para a cópia simples do ASIP não expressaram o gene e apresentaram fenótipos pigmentados. Os resultados obtidos permitiram identificar a influência da interação epistática dos genes MC1R e ASIP na coloração da lã nos ovinos crioulos. O estudo de genes candidatos envolvidos na rota da pigmentação mostrou-se uma abordagem adequada para a análise da variação na coloração nestes animais. Espera-se que o conhecimento adquirido neste trabalho auxilie na criação e na preservação da raça através da manutenção da diversidade fenotípica existente. A avaliação computacional dos polimorfismos não sinônimos vem sendo utilizada recentemente a fim de determinar os SNPs que potencialmente afetam o funcionamento dos genes e identificar os mecanismos responsáveis por doenças complexas e pela variação nos fenótipos. A predição do efeito de polimorfismos nos genes utilizando ferramentas computacionais apresenta-se como uma abordagem alternativa para o estudo da genética da coloração. O gene MC1R humano apresenta uma grande quantidade de polimorfismos alguns dos quais foram associados com a variação na pigmentação e com suscetibilidade a tumores de pele. Entretanto, muitas das variações existentes no gene não foram avaliadas quanto às suas consequências funcionais e o seu papel na variação da pigmentação. Foi realizada a predição computacional dos polimorfismos não sinônimos no gene MC1R humano com o objetivo de identificar os nsSNPs mais provavelmente danosos, e estabelecer aqueles com potencial efeito na função do MC1R. Foram utilizadas 11 ferramentas de predição individuais (SIFT, MutPred, Polyphen-2, PROVEAN, I-Mutant 3.0, PANTHER, SNPs3D, Mutation Assessor, PhD-SNP, SNPs&GO e SNAP) e dois programas consenso (PON-P e PredictSNP 1.0) para a análise de 92 nsSNPs localizados no gene. Os programas utilizados baseiam-se em métodos evolutivos, estruturais e computacionais, resultando na identificação dos 14 nsSNPs mais danosos (L48P, R67W, H70Y, P72L, S83P, R151H, S172I, L206P, T242I, G255R, P256S, C273Y, C289R e R306H). Apesar das diferenças nos resultados de cada programa a combinação dos diferentes métodos permitiu diferenciar os polimorfismos neutros dos danosos, mostrando concordância com os programas consenso. A predição computacional demonstrou ser uma abordagem eficiente para a identificação dos alelos danosos no gene MC1R e para a priorização de mutações para posteriores estudos funcionais e populacionais. / Animal color is a characteristic that presents a large diversity of phenotypes. Different approaches can be used to understand the color diversity existing among and within species. Through analysis of candidate genes the mutations responsible for the color variation have been described in different species, showing the involvement of various molecular mechanisms of regulation. The objective of this work is the use of two genetic approaches to the study of color variation, the analysis of candidate genes and the computational prediction of non-synonym polymorphism effects (nsSNPs). In sheep the wool color is a feature with commercial importance and in identifying breeds. Polymorphisms in different genes have been associated with wool color, but they have not been studied in many breeds that show phenotypic variation regarding such a charactere. The Creole is a local breed from southern most Brazil that presents a wide range of wool color, varying from white to black, and including several intermediate hues. The melanocortin 1 receptor (MC1R) was previously associated with the wool color in the Creole, however, other genes might also be involved in the regulation of color in the breed. This study evaluated the influence of the genes MC1R, ASIP (agouti signaling protein), TYRP1 (tyrosinase related protein 1) and KIT (v-kit Hardy- Zuckerman 4 feline sarcoma viral oncogene homolog) in the Creole breed wool color. Samples from 410 specimens of different colors were analyzed. The variation in the color of the wool was performed by colorimetry. The inheritance pattern of the phenotypes was assessed by crossbreeding individuals of different colors. Polymorphisms in the genes were evaluated by performing sequencing and fragment analysis, and the quantification of the ASIP gene expression was performed by Real Time-PCR. It was observed a significant association between polymorphisms in MC1R and ASIP gene and the wool color in Creole breed. The dominant allele of the MC1R gene, caused by p.M73K and p.D121N mutations was found only in pigmented individuals. This allele leads to the constitutive activation of the receptor and therefore in constant production of eumelanin and is epistatic on the ASIP gene. In the homozygous to the wild-type allele of MC1R the manifestation of white phenotype occurred only in individuals with one allele containing a duplication of the ASIP gene. The carriers of the duplicated copy of ASIP showed high levels of gene expression while homozygous for the simple copy of the ASIP did not expressed the gene, and showed pigmented phenotypes. The results allowed the identification of the influence of epistatic interaction of MC1R and ASIP gene in the wool color in Creole breed. The study of candidate genes involved in the pigmentation pathway proved to be a suitable approach for the analysis of variation in pigmentation in these animals. It is expected that the knowledge acquired in this work will assist on stablishment of commercial breeding and preservation policies of this sheep breed. The computational evaluation of non-synonymous polymorphism has been used to determine SNPs that potentially affect the function of the genes and identify the mechanisms responsible for complex diseases and by the variation in phenotypes. The prediction of the effect of polymorphisms in genes using computational tools presents an alternative approach to the study of the genetic of coloration. The human MC1R gene has a large number of know polymorphisms, some of which were associated with changes in pigmentation and susceptibility to skin tumors. However, many existing variations in the gene have not been evaluated regarding the functional consequences and its role in the variation of pigmentation. Computational prediction of nonsynonymous polymorphisms was performed in the human MC1R gene in order to identify the most likely harmful nsSNPs and to establish those with potential effect on the function of MC1R. Eleven individual tools (SIFT, MutPred, Polyphen-2, PROVEAN, I-Mutant 3.0, PANTHER, SNPs3D, Mutation Assessor, PhD-SNP, SNPs&GO and SNAP) and two consensus programs (PON-P and PredictSNP 1.0) were used to the analysis of 92 nsSNPs located in the gene. The programs used are based in evolutionary, structural and computational methods, resulting in the identification of the 14 most damaging nsSNPs (L48P, R67W, H70Y, P72L, S83P, R151H, S172I, L206P, T242I, G255R, P256S, C273Y, C289R and R306H). Despite the differences in the results of the each program the combination of different methods allowed the differentiation of the neutral polymorphisms from the most damaging, showing agreement with the consensus programs. The computational prediction has proved to be an efficient approach for the identification of harmful alleles in the MC1R gene and for the prioritization of mutations for further functional and population studies.

Este estudo teve o objetivo de identificar e correlacionar as variáveis comportamentais e as características do comportamento materno-filial e do temperamento de ovinos por meio de modelos multivariados. O estudo foi dividido em três partes, nas primeiras duas, foi avaliado o comportamento materno-filial e o temperamento de ovelhas da raça Corriedale durante o período periparto; e no terceiro foi realizado um estudo retrospectivo através da análise multivariada de dados referentes ao Escore de Comportamento Materno (ECM) e o temperamento de ovelhas das raças Corriedale em diferentes manejos. As observações do comportamento das ovelhas e cordeiros ocorreram desde o início do parto até 2 horas após, quando foram registradas as seguintes observações: horário do parto, permanência da ovelha parturiente com o rebanho, grau de agitação durante o parto, cuidados com o(s) cordeiro(s), facilitação da mamada, tipo de parto, tempos de latência do(s) cordeiro(s) em ficar de pé e para mamar, vocalização da ovelha e do cordeiro, sexo do(s) cordeiro(s), peso ao nascimento, além dos dados meteorológicos. Entre 12 a 24 horas após o parto foi avaliado o ECM. A reatividade dos animais foi avaliada no Teste de Arena no dia do desmame. Os dados foram submetidos à análise de fatores principais, de correlação e médias canônicas, agrupamentos e comparação de médias dos grupos. No primeiro estudo, o ECM de ovelhas Corriedale criadas em sistema semiextensivo foi positivamente associado com a idade da ovelha, peso ao encarneiramento, escore da condição corporal no encarneiramento, peso ao desmame e atitude de facilitar a mamada. No segundo estudo, os atributos avaliados no Teste de Arena como o tempo de latência da ovelha no isolamento e na presença do observador, movimentação no isolamento, vocalizações de alta intensidade, número de micções e resistência em sair da arena foram associados a baixos valores de Escore de Comportamento Materno. No terceiro estudo, o ECM foi associado positivamente com a frequência respiratória, distância percorrida, número de vocalizações totais e defecações totais na presença do observador. Ovelhas com ECM menor apresentaram maior frequência respiratória, temperatura retal, maior número de defecações totais na presença do observador e menor número de tentativas de fuga na presença do observador. A análise multivariada mostrou-se uma ferramenta eficaz para avaliar a associação do Escore do Comportamento Materno e do temperamento de ovelhas da raça Corriedale. / This study aimed to identify and correlate the behavioral variables and maternal-filial behavior characteristics and temperament of sheep using multivariate models. The study was divided into three parts, the first two evaluated the mother-filial behavior and the temperament of ewe Corriedale during the peripartum period and the third dealed with a retrospective study using multivariate analysis of data for the maternal behavior score (MBS) and the temperament of Corriedale ewe in different systems. Behavior of ewe and lambs was observed since the onset of lambing until 2 hours after parturition, when the following activities were recorded: traits such as lambing schedule, permanence of the ewe with the herd, degree of agitation during lambing, care of the lamb, facilitate suckling at birth, type of lambing, latency of the lamb to stand up and latency to suck, vocalizations of the ewe and lamb, sex of the lamb, birth weight and MBS. MBS was evaluated between 12 and 24 hours after lambing. The animal reactivity was assessed at weaning with the arena test. Data were subjected to analysis of principal factors, correlation and canonical average, groups and comparison of group means. In the first study, Corriedale ewes reared in semi-extensive system show MBS positively associated with their age, weight at mating and weaning, body condition score in mating and attitude to facilitate feeding. In the second study, the attributes evaluated in the Arena Test as the latency time of the ewe in isolation and in the presence of the observer, activity in isolation, number of high-intensity vocalization, number of urination events and resistence to leave the arena were associated with low values of score of maternal behavior. In the third study, the MBS was positively associated with respiratory rate, activity in isolation, total number of vocalizations and total defecation in the presence of the observer. Ewe with MSB showed lower respiratory rates, rectal temperature, total number of defecation in the presence of the observer and fewer escape attempts in the presence of the observer. Multivariate analysis showed to be an effective tool to evaluate the association score between maternal behavior and social temperament of ewe.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2012. / Submitted by Elna Araújo (elna@bce.unb.br) on 2012-09-12T22:47:23Z No. of bitstreams: 1 2012_GabrieladeOliveiraFernandes.pdf: 299565 bytes, checksum: 80e9633654f78664cae4a8301e14ca67 (MD5) / Approved for entry into archive by Patrícia Nunes da Silva(patricia@bce.unb.br) on 2012-09-13T17:57:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_GabrieladeOliveiraFernandes.pdf: 299565 bytes, checksum: 80e9633654f78664cae4a8301e14ca67 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-09-13T17:57:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_GabrieladeOliveiraFernandes.pdf: 299565 bytes, checksum: 80e9633654f78664cae4a8301e14ca67 (MD5) / Diversas bactérias são identificadas nas amostras de sêmen ovino e algumas podem apresentar efeitos negativos na sua qualidade. Assim, os objetivos deste trabalho foram: identificar e quantificar a microbiota do sêmen fresco ovino, avaliar o uso prévio do higienizante Kilol-L® e testar a sensibilidade das cepas bacterianas frente ao antibiograma; avaliar o efeito do uso dos antibióticos ceftiofur e gentamicina, em diferentes concentrações, no meio diluidor TRIS-gema-glicerol, nos parâmetros de avaliação do sêmen e da contaminação bacteriana; avaliar o efeito da adição de diferentes antibióticos e combinações no meio de criopreservação do sêmen, avaliando a qualidade e viabilidade do mesmo antes e depois da criopreservação. No capítulo 2 foram avaliados 24 ovinos machos da raça Santa Inês, aptos à reprodução, sendo eles agrupados em dois grupos de sistemas de criação, um a pasto (n=12) e outro em confinamento (n=12). Os resultados microbiológicos indicaram que do total de 120 ejaculados, 99 tiveram crescimento bacteriano correspondendo a 82,5% das amostras. Os gêneros bacterianos mais isolados foram Bacillus spp., Corynebacterium spp., Escherichia coli, Listeria spp., Staphylococcus spp. e Streptococcus spp. Dos antibióticos testados, a gentamicina foi 100% eficaz para Bacillus spp. e E. coli. O Ceftiofur foi eficaz para todas as bactérias isoladas, exceto com a amostra de Rodococcus equi. O uso do antisséptico Kilol-L® na concentração 1:250 reduziu o número de unidades formadoras de colônias (UFC/ml) do ejaculado sem prejudicar a qualidade seminal. No capítulo 3, foram selecionados dois grupos: ceftiofur e gentamicina. Os tratamentos do grupo ceftiofur foram: sem antibióticos, 10μg/ml, 25μg/ml, 50μg/ml e 100μg/ml, e os tratamentos do grupo gentamicina foram: sem antibiótico, 50μg/ml, 100μg/ml, 250μg/ml e 500μg/ml. Não houve diferença entre os tratamentos nos dois grupos quanto à motilidade espermática, isolamento bacteriano e UFC/ml. A utilização dos antibióticos ceftiofur e gentamicina, em diferentes concentrações no meio de criopreservação, não diferiram do meio sem antibiótico nos parâmetros seminais e bacteriológicos. No capítulo 4, foi analisado o efeito da adição de diferentes antibióticos na criopreservação de sêmen ovino, avaliando-se a qualidade e viabilidade antes e depois da criopreservação. Os ejaculados foram submetidos aos seguintes tratamentos: sem antibiótico, associação de penicilina-estreptomicina (100.000UI-100mg/ml), ceftiofur (10μg/ml), gentamicina (50μg/ml) e a associação de gentamicina-tilosinalincomicina- espectinomicina (250-50-150-300μg/ml). Os tratamentos utilizados não apresentaram diferença (p>0,05) quando comparados com a quantidade total de bactérias presentes, cepas bacterianas isoladas e motilidade das células espermáticas. Os principais gêneros bacterianos isolados foram Bacillus spp., Corynebacterium spp., Staphylococcus spp. e Streptococcus spp. Tais resultados indicam que a adição de antibióticos não é necessária, no meio diluidor, quando medidas higiênicas e de assepsia são previamente utilizadas ao processo de criopreservação do sêmen ovino. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Several bacteria are identified in semen samples and some present a negative effect on their quality. The objectives of this study were to identify and quantify the fresh semen sheep microbiota, evaluating the previous use of sanitizing Kilol-L® and test the bacterial strains against antibiogram; evaluate the effect of antibiotic therapy with ceftiofur and gentamicin, in different concentrations in the diluter medium with tris-gem-glycerol, in parameter of semen evaluation and bacterial contamination; evaluate the effect of addition different antibiotics and combinations in the semen cryopreservation medium, assessing the quality and viability of the sample before and after cryopreservation. In chapter 2 were evaluated 24 Santa Inês male sheep, able to reproduce, and they were grouped into two breeding systems, one on pasture (n = 12) and another confined (n = 12). The microbiological results indicated that the total of 120 ejaculates, 99 had bacterial growth representing 82.5% of the samples. The most frequently isolated bacterial genus were Bacillus spp., Corynebacterium spp., Escherichia coli, Listeria spp., Staphylococcus spp. and Streptococcus spp. Both antibiotics tested, gentamicin was 100% effective for Bacillus spp. and E. coli. The Ceftiofur was effective for all isolates, except with the sample Rodococcus equi. The use of antiseptic Kilol-L® at a concentration of 1:250 reduced the number of colony forming units (CFU/ml) of the ejaculate without affecting the semen quality. In chapter 3, we selected two groups: ceftiofur and gentamicin. The ceftiofur treatments groups were: without antibiotics, 10μg/ml, 25μg/ml, 50μg/ml and 100μg/ml, and gentamicin treatments group were: without antibiotic, 50μg/ml, 100μg/ml, 250μg/ml and 500μg / ml. There was no difference between treatments in the two groups in terms of sperm motility, bacterial isolation and CFU/ml. The use of the ceftiofur antibiotic and gentamicin at different concentrations in the cryopreservation medium not differ from the antibiotic-free medium in semen and bacteriological parameters. In chapter 4, we analyzed the effect of different antibiotic addition in the cryopreservation of ram semen, evaluating the quality and viability before and after cryopreservation. The ejaculates were submitted to the following treatments: no antibiotic, combination of penicillin-streptomycin (100.000UI-100mg/ml), ceftiofur (10μg/ml), gentamicin (50μg/ml) and combination of gentamicin, tylosin, lincomycin-spectinomycin (250 -50-150-300μg/ml). The treatments showed no difference (p> 0.05) when compared with the total amount of bacteria, bacterial strains isolated and sperm cells motility. The major bacterial strains isolated were Bacillus spp., Corynebacterium spp., Staphylococcus spp. and Streptococcus spp. These results indicate that the addition of antibiotics is not necessary in the diluter medium, when hygienic and aseptic measures are previously used in the sheep semen cryopreservation process.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2010. / Submitted by Jaqueline Ferreira de Souza (jaquefs.braz@gmail.com) on 2011-04-17T18:00:32Z No. of bitstreams: 1 2010_LucianaDalcin.pdf: 2588317 bytes, checksum: 8bbe50d0353dec811bc355d0696e1a41 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2011-04-17T18:01:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_LucianaDalcin.pdf: 2588317 bytes, checksum: 8bbe50d0353dec811bc355d0696e1a41 (MD5) / Made available in DSpace on 2011-04-17T18:01:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_LucianaDalcin.pdf: 2588317 bytes, checksum: 8bbe50d0353dec811bc355d0696e1a41 (MD5) / A criopreservação de embriões ovinos tem sido amplamente difundida, porém seus índices de sobrevivência e prenhez têm mostrado grande variação. Neste estudo, embriões produzidos in vivo foram congelados ou vitrificados e reaquecidos para avaliação ultraestrutural e determinação do padrão de atividade mitocondrial e integridade do citoesqueleto. Os embriões foram colhidos de ovelhas superovuladas, classificados e selecionados para criopreservação. Embriões submetidos à congelação lenta (n=22) foram exposto à solução de 0,75M de etilenoglicol (EG) por 10 minutos, 1,5M de EG por 10 minutos, acondicionados em palhetas de 0,25mL e submetidos a curva de congelação programável (-1°C/min, seeding a -7°C, 0,3°C/min até -35°C) com posterior imersão em nitrogênio líquido. Embriões vitrificados (n=24) foram submetidos à solução de 10% de EG+10% de DMSO por 1 minuto e 30 segundos, passando para a solução de 20% de EG+20% de DMSO com 0,5M de sacarose por 30 segundos acondicionados em OPS e mergulhados em nitrogênio líquido. Os embriões descongelados/reaquecidos foram cultivados por 1 hora, reclassificados em estereomicroscópio e subdivididos para avaliação. Os embriões criopreservados mostraram variável grau de desorganização de citoesqueleto e ausência de marcação para atividade mitocondrial. Foi possível correlacionar os achados anteriores com a ultraestrutura e distribuição das organelas pelo citoplasma. Embriões congelados mostraram características ultraestruturais semelhantes a embriões frescos de mesma qualidade. Embriões vitrificados apresentaram maior frequência de grandes vesículas de digestão. ________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Cryopreservation of sheep embryos has been widespread, but their survival rate and pregnancy have shown great variation. After in vivo production sheep embryos were frozen or vitrified and processed for ultrastructural evaluation and determining the pattern of mitochondrial activity and integrity of the cytoskeleton. Embryos were collected from superovulated ewes, classified and selected for cryopreservation. Embryos subjected to slow freezing (n = 22) were exposed to 0.75 M ethylene glycol (EG) for 10 minutes, 1.5M EG for 10 minutes, packed in 0.25mL straws and subjected to programmable freezing (-1 ° C / min, seeding at -7 ° C, 0.3 ° C / min to -35 ° C) followed by immersion in liquid nitrogen. Vitrified embryos (n = 24) were placed in 10% EG +10% DMSO solution for 1 minute and 30 seconds, then in 20% EG +20% DMSO solution with 0,5M sucrose for 30 seconds packed in OPS and dipped in liquid nitrogen. The cryopreserved embryos were warmed, cultured for 1 hour, reclassified and subdivided for evaluation. Cryopreserved embryos showed variable degree of cytoskeleton disorganization and no marker for mitochondrial activity. It was possible to correlate these findings with the ultrastructure and distribution of the organelles. Frozen embryos showed ultrastructural features similar to fresh embryos of the same quality. Vitrified embryos showed a higher frequency of large digestion vesicles.

Micoplasmas e ureaplasmas têm sido isolados de pequenos ruminantes, mas existem poucos estudos. O Mycoplasma ovine/caprine sorotipo 11, conhecido como cepa 2D, ainda não classificado como espécie, vem sendo relacionado a casos de vulvovaginite e problemas reprodutivos em ovinos e caprinos. Os ureaplasmas apresentam a habilidade em induzirem doenças no trato genital, confirmada por inoculações experimentais de isolados obtidos de animais doentes em animais saudáveis, resultando em moderada granularidade e hiperemia na vulva. Estes ureaplasmas não receberam ainda a designação de espécie, sendo apenas conhecidas suas características sorológicas, nas quais é fundamentada a classificação em nove sorotipos, sendo o IX relacionado a infertilidade e aborto em ovelhas. Este trabalho teve como objetivo o isolamento de micoplasmas e ureaplasmas do trato reprodutivo de fêmeas e machos das espécies caprina e ovina e tipificação genotípica dos isolados por meio de PFGE e sequenciamento do gene 16S rRNA. Foram obtidos 20 isolamentos de ureaplasma no trato reprodutivo de fêmeas e machos da espécie ovina, um isolamento de micoplasma e sete com crescimento misto de micoplasma e ureaplasma. Nas fêmeas da espécie caprina foram obtidos cinco isolamentos, sendo quatro de ureaplasma e um de micoplasma. Dos isolados submetidos a PFGE , 11 de origem ovina resultaram em oito diferentes perfis confirmando a capacidade da técnica em tipificar ureaplasma de origem ovina. O sequenciamento do gene 16S rRNA, analisado pelo UPGMA, permitiu agrupar seis isolados ao Ureaplasma diversum ATCC 49782, e quatro não foram agrupados com nenhuma outra espécies de ureaplasma, quando utilizado o ponto de corte 97%. Em nosso estudo, os isolados de ovino e caprino agrupados às referências de U. diversum não permite concluir que sejam da mesma espécie. A utilização do gene 16S rRNA gera grande quantidade de informações úteis para inferências filogenéticas e pode ser a primeira escolha na investigação de novas espécies. Técnicas filogenéticas como sequenciamento do espaço intergênico 16S-23S rRNA, e gene da urease podem auxiliaram futuramente na classificação dos isolados obtidos de ovino e caprino. / Mycoplasmas and or ureaplasmas have been isolated from small ruminants but are few studied. Mycoplasma ovine/caprine serotype 11, known as 2D strain, has not been classified yet as specie. However, it has been associated to vulvovaginitis and reproductive disorder in caprine and ovine. Ureaplasmas may cause genital tract diseases. Experimental infections with isolates recovered from sick animals resulted in granularity and hyperemia of the vulva. These have not been designated as specie but are divide in nine serological characteristics types. The serotype IX is associated to infertility and abortion in sheep. The present study aims the isolation of mycoplasmas and ureaplasmas from reproductive tract of ovine and caprine, genotyping of isolates by PFGE, and sequencing of their 16S rRNA. Ureaplasma isolates were recovered from the reproductive tract of 20 ovine, being them, male and female. Mycoplasma was isolated alone in one sample. A mixture of mycoplasma and ureaplasma was obtained in seven samples. On the material obtained from female caprine, five isolations were performed. Four of them were ureaplasma and one was a mycoplasma. Eleven isolates from ovine showed eight distinct profiles at PFGE, confirm that the method can typify ovine origin ureaplasmas. Six isolates were grouped to the Ureaplasma diversum ATCC 49782, through the sequencing of their 16S rRNA using the UPGMA. However, when using a 97% cutoff, four isolates could not be grouped to none of the ureaplasma specie. The isolates from ovine and caprine grouped to U. diversum, do not allow conclude that they are all the same specie. The use of 16S rRNA sequencing showed many useful information to phylogenetic inference, and can be the first choice for when investigating new species. Phylogenetic techniques, as sequencing of the intergenic space 16S-23S rRNA and urease gene, can be used to help the classification of new ureaplasma isolates from ovine and caprine.