Disertacijoje aprašomas Candida mielių paplitimas įvairiuose substratuose bei žmogų supančioje aplinkoje, aiškinami jų biologiniai savitumai, tiriamos prevencinės priemonės užterštumui šiomis mielėmis sumažinti. Tyrimų metu iš gamtinių substratų (dirvožemio, vandens ir filosferos) maisto produktų, gyvenamosios ir darbo aplinkos oro, žmogaus patologinės medžiagos buvo išskirti ir identifikuoti 498 mielių izoliatai. Candida genčiai priklausančios mielės sudarė 31% visų mielių rūšių. Išskirtos 26 Candida rūšys, iš jų 4 naujos Lietuvos mikobiotai – C. magnoliae, C. saitoana, C. oleophila ir C. sorboxylosa. Ištirti iš įvairių substratų išskirtų Candida mielių morfologiniai, fiziologiniai ir biocheminiai savitumai. Įvertintas C. albicans (C.A.4) ir C. parapsilosis (C.P.1), išskirtų iš maisto produktų, vienkartinių dozių ūmus toksiškumas/patogeniškumas per os ir intraperitonealiai šiltakraujams gyvūnams. Atliktas 11 dezinfekcinių priemonių ir 8 antigrybinių preparatų poveikio patogeninėms Candida mielėms įvertinimas. Nustatytas 12 augalų eterinių aliejų, bakterijų Pantoea citrea (T1x, T2x, T3x) ir Streptomyces sp. (Ux, Ux308) poveikis Candida mielėms. / Aim of the work was to determine the distribution of Candida yeasts in various substrates and the surrounding environment, to define their biological characteristics and preventive measures to reduce the pollution. During the study 498 yeast isolates from soil, water, phyllosphere, food products, human body and the surrounding residential and occupational environment were isolated and identified. It was revealed that they belong to 21 genera and 63 species. Candida yeasts comprised 31% of all isolated yeasts; new to Lithuanian mycobiota species were recorded: C. magnoliae, C. saitoana, C. oleophila and C. sorboxylosa. Assess the Candida yeast morphological, physiological and biochemical characteristics. Acute toxicity/pathogenicity of single doses of C. albicans (C.A.4) and C. parapsilosis (C.P.1) administered per os or intraperitoneally to warm-blooded animals was ascertained. Assessment of the impact of 11 disinfectants and 8 antifungal preparations on pathogenic Candida yeasts was conducted. The effects of 12 essential oils, Pantoea citrea (T1x, T2x, T3x), Streptomyces sp. (Ux, Ux308) on Candida yeasts were determined.

Aim of the work was to determine the distribution of Candida yeasts in various substrates and the surrounding environment, to define their biological characteristics and preventive measures to reduce the pollution. During the study 498 yeast isolates from soil, water, phyllosphere, food products, human body and the surrounding residential and occupational environment were isolated and identified. It was revealed that they belong to 21 genera and 63 species. Candida yeasts comprised 31% of all isolated yeasts; new to Lithuanian mycobiota species were recorded: C. magnoliae, C. saitoana, C. oleophila and C. sorboxylosa. Assess the Candida yeast morphological, physiological and biochemical characteristics. Acute toxicity/pathogenicity of single doses of C. albicans (C.A.4) and C. parapsilosis (C.P.1) administered per os or intraperitoneally to warm-blooded animals was ascertained. Assessment of the impact of 11 disinfectants and 8 antifungal preparations on pathogenic Candida yeasts was conducted. The effects of 12 essential oils, Pantoea citrea (T1x, T2x, T3x), Streptomyces sp. (Ux, Ux308) on Candida yeasts were determined. / Disertacijoje aprašomas Candida mielių paplitimas įvairiuose substratuose bei žmogų supančioje aplinkoje, aiškinami jų biologiniai savitumai, tiriamos prevencinės priemonės užterštumui šiomis mielėmis sumažinti. Tyrimų metu iš gamtinių substratų (dirvožemio, vandens ir filosferos) maisto produktų, gyvenamosios ir darbo aplinkos oro, žmogaus patologinės medžiagos buvo išskirti ir identifikuoti 498 mielių izoliatai. Candida genčiai priklausančios mielės sudarė 31% visų mielių rūšių. Išskirtos 26 Candida rūšys, iš jų 4 naujos Lietuvos mikobiotai – C. magnoliae, C. saitoana, C. oleophila ir C. sorboxylosa. Ištirti iš įvairių substratų išskirtų Candida mielių morfologiniai, fiziologiniai ir biocheminiai savitumai. Įvertintas C. albicans (C.A.4) ir C. parapsilosis (C.P.1), išskirtų iš maisto produktų, vienkartinių dozių ūmus toksiškumas/patogeniškumas per os ir intraperitonealiai šiltakraujams gyvūnams. Atliktas 11 dezinfekcinių priemonių ir 8 antigrybinių preparatų poveikio patogeninėms Candida mielėms įvertinimas. Nustatytas 12 augalų eterinių aliejų, bakterijų Pantoea citrea (T1x, T2x, T3x) ir Streptomyces sp. (Ux, Ux308) poveikis Candida mielėms.

Didžiuliai informacijos kiekiai yra sukaupiami kiekvieną dieną pasaulyje bei jie sparčiai auga. Apytiksliai duomenų tyrybos algoritmai yra labai svarbūs analizuojant tokius didelius duomenų kiekius, nes algoritmų greitis yra ypač svarbus daugelyje sričių, tuo tarpu tikslieji metodai paprastai yra lėti bei naudojami tik uždaviniuose, kuriuose reikalingas tikslus atsakymas. Ši disertacija analizuoja kelias duomenų tyrybos sritis: dažnų sekų paiešką bei vizualizaciją sprendimų priėmimui. Dažnų sekų paieškai buvo pasiūlyti trys nauji apytiksliai metodai, kurie buvo testuojami naudojant tikras bei dirbtinai sugeneruotas duomenų bazes: • Atsitiktinės imties metodas (Random Sampling Method - RSM) formuoja pradinės duomenų bazės atsitiktinę imtį ir nustato dažnas sekas, remiantis atsitiktinės imties analizės rezultatais. Šio metodo privalumas yra teorinis paklaidų tikimybių įvertinimas, naudojantis standartiniais statistiniais metodais. • Daugybinio perskaičiavimo metodas (Multiple Re-sampling Method - MRM) yra RSM metodo patobulinimas, kuris formuoja kelias pradinės duomenų bazės atsitiktines imtis ir taip sumažina paklaidų tikimybes. • Markovo savybe besiremiantis metodas (Markov Property Based Method - MPBM) kelis kartus skaito pradinę duomenų bazę, priklausomai nuo Markovo proceso eilės, bei apskaičiuoja empirinius dažnius remdamasis Markovo savybe. Didelio duomenų kiekio vizualizavimui buvo naudojami pirkėjų internetu elgsenos duomenys, kurie analizuojami naudojant... [toliau žr. visą tekstą] / Huge amounts of digital information are stored in the World today and the amount is increasing by quintillion bytes every day. Approximate data mining algorithms are very important to efficiently deal with such amounts of data due to the computation speed required by various real-world applications, whereas exact data mining methods tend to be slow and are best employed where the precise results are of the highest important. This thesis focuses on several data mining tasks related to analysis of big data: frequent pattern mining and visual representation. For mining frequent patterns in big data, three novel approximate methods are proposed and evaluated on real and artificial databases: • Random Sampling Method (RSM) creates a random sample from the original database and makes assumptions on the frequent and rare sequences based on the analysis results of the random sample. A significant benefit is a theoretical estimate of classification errors made by this method using standard statistical methods. • Multiple Re-sampling Method (MRM) is an improved version of RSM method with a re-sampling strategy that decreases the probability to incorrectly classify the sequences as frequent or rare. • Markov Property Based Method (MPBM) relies upon the Markov property. MPBM requires reading the original database several times (the number equals to the order of the Markov process) and then calculates the empirical frequencies using the Markov property. For visual representation... [to full text]

Šiame darbe analizuojamos trys egzistuojančios tekstynų sistemos. Lietuvių kalbos tekstyno paieška sukurta su Lucene paieškos sistema, vokiečių tekstyno lietuviškų tekstų paieška sukurta MySQL pagrindu, bei britų nacionalinio tekstyno paieška sukurta su Xaira programine įranga. Plačiau aprašomas šių sistemų indeksavimo ir paieškos veikimas. Taip pat Fedora ir DSpace repozitoriumų sistemos, kurios buvo išbandytos ir palygintos tarpusavyje. Nei viena iš egzistuojančių sistemų neturi galimybės indeksuoti morfologiškai žymėtus tekstynus ir atlikti paiešką juose, todėl pasiūlomas prototipinis tekstyno sistemos sprendimas, kuris leistų tai atlikti. Tekstynai saugomi XML dokumentuose ir yra morfologiškai sužymėti TEI P5 formatu. Prototipinė sistema leidžia atlikti paiešką pagal konkretų žodį, pagal pagrindinę žodžio formą - lemą. Rezultatai pateikiami vartotojui patogia forma – sakiniais. Paieškos rezultatuose yra pateikiami sakiniai su ieškotu žodžiu ir su ieškoto žodžio lema, taip pateikiant daugiau rezultatų. Pasiūlytas prototipinės sistemos modeliui sukurti panaudojus vieną iš reliacinių duomenų bazių sistemų – MySQL, taip pat XPath ir PHP programavimo kalba. / In this Master Thesis has been researched three existing corpus systems. Lithuanian corpus search system, which is created by Lucene search engine. German corpus search system which uses Lithuanian Wikipedia texts as corpus. This system which is created by MySQL. British national corpus search system which is created by Xaira software. All these systems are analyzed and explained how indexing and searching components works. Also two popular repository systems were taken and researched deeply, it’s Fedora and DSpace. None of existing systems had morphological search option, that is why prototype system is created. All texts are stored in XML files which are marked by TEI P5 format. Prototype system allows perform a search by exact word and by main word form called lemma. Results are displayed by sentences. At first system displays sentences of exact word and sentences where same lemma as search word exists. Prototype system is created using MySQL database system also for programming PHP and XPath is used.

To understand evolution, and to discover how different species are related, gene order analysis is a useful tool. Problems in this area can usually be formulated in a combinatorial language. We regard genomes as signed, or unsigned permutations, and thus evolutionary operations like inversions (reversing the order of a segment of genes) are easy to describe combinatorially. A commonly studied problem is to determine the evolutionary distance between two species. This is estimated by several combinatorial distances between gene order permutations, for instance the inversion distance. The main objective of this work was to survey the existing algorithms for genome comparison and to present new approach for solving this problem. The work led to these results: - We have surveyed existing approaches of genome comparison, namely comparison by inversion distance in signed and unsigned cases. It appeared that sorting signed genomes by inversions is done in quadratic time, but sorting unsigned genomes by inversions is NP-hard. - We have proposed the method of how to apply heuristic algorithms for sorting unsigned genomes by inversions. - We have applied tabu search and genetic algorithm to solve the sorting unsigned genomes by inversions problem. - We have experimentally proven, that the worst case solutions to sorting unsigned genomes by inversions found by heuristics (tabu search and genetic algorithm) are better then ones expected from best known approximating algorithm used for... [to full text]

Darbe yra analizuojamas „Google“ paieškos „AdWords“ skelbimų efektyvumas. Dėl didėjančios informacinių technologijų svarbos, dauguma vartotojų ieškosi informacijos apie produktus ir paslaugas bei perka juos internetu. Todėl reklamos kūrėjams tampa ypač aktualus efektyvių paieškos sistemos skelbimų kūrimo klausimas. Darbo tikslas – remiantis moksliniais reklamos efektyvumo vertinimo šaltiniais ir „Google“ paieškos „AdWords“ skelbimų efektyvumo vertinimo rezultatais, pateikti bendrą „AdWords“ skelbimų efektyvumo vertinimo ir skelbimų efektyvumo didinimo modelius. Magistro baigiamąjį darbą sudaro trys pagrindinės dalys. Pirmojoje, teorinėje dalyje, yra analizuojami skirtingų autorių požiūriai į reklamos efektyvumo vertinimą, yra pateikiami „Google“ paieškos „AdWords“ skelbimų vertinimo ypatumai. Analitinėje baigiamojo darbo dalyje yra atliekamas pasirinktų „Google“ paieškos „AdWords“ reklaminių kampanijų skelbimų efektyvumo vertinimas. Trečiojoje dalyje yra pateikiamas „Google“ paieškos „AdWords“ skelbimų efektyvumo vertinimo ir efektyvumo didinimo modeliai bei pateikiamos skelbimų efektyvumo didinimo priemonės. / The paper analyzes the effectiveness of „Google“ search engine „AdWords“ ads. Due to the growing importance of information technology , most users search for information about products and services and buy them online. Therefore the issue of ads effectiveness has become extremely important to every advertiser. The objective of this paper is to present general model of „Google“ search engine „AdWords“ ads effectiveness measurement and opportunities of ads effectiveness improvement, scientific resources of advertising effectiveness assessment and results of case analysis. Master's thesis consists of three main parts. In the first, theoretical part of the work introduces analysis, comparison of different authors approaches to the advertising activities performance by finding out methods and indicators, which assess the effectiveness of the ads. The analytical part is based on case study which analyzes effectiveness of particular „Google“ search engine „AdWords“ campaigns. The third part is intended for the model, which shows how to measure effectiveness of the „Google“ search engine „AdWords“ ads, and oppurtinities of ads effectiveness improvement.

Tyrimų tikslas. Identifikuoti naujus žieminių kviečių genus, aktyvuojamus žemose temperatūrose bei atlikti šių genų sekų ir genetinės raiškos analizę. Tyrimų uždaviniai: 1. Ištirti žieminių kviečių genotipų tolerantiškumą žemoms neigiamoms temperatūroms natūraliomis ir dirbtinėmis sąlygomis. 2. Nustatyti skirtingose grūdinimosi stadijose diferenciškai ekspresuojamus genus (kDNR-AFLP analizė) ir atlikti DNR sekų analizę. 3. Optimizuoti mutagenezės metodą ir sukurti dviejų perspektyvių žieminių kviečių linijų mutagenines populiacijas. 4. Nustatyti skirtingu intensyvumu ekspresuojamų genų mutacijas HRM metodu, įvertinti nustatytų mutacijų įtaką genų ekspresijai grūdinimosi metu ir žemų neigiamų temperatūrų tolerancijai. / Research objective: To identify new genes of winter wheat induced at low temperatures, to perform sequence analysis of these genes and to quantify their expression. Experimental tasks: 1. To evaluate freezing tolerance of various winter wheat genotypes under field and controlled conditions. 2. To identify differentially expressed genes at subsequent time points of cold acclimation and to perform analysis of their DNA sequences. 3. To optimize mutagenesis method and to create Targeting Induced Local Lesions in Genomes (TILLING) population of two winter wheat lines. 4. To identify mutations in differentially expressed genes by High Resolution melting (HRM) method, to estimate the impact of mutations on the gene expression during cold acclimation and tolerance to freezing.

Research objective: To identify new genes of winter wheat induced at low temperatures, to perform sequence analysis of these genes and to quantify their expression. Experimental tasks: 1. To evaluate freezing tolerance of various winter wheat genotypes under field and controlled conditions. 2. To identify differentially expressed genes at subsequent time points of cold acclimation and to perform analysis of their DNA sequences. 3. To optimize mutagenesis method and to create Targeting Induced Local Lesions in Genomes (TILLING) population of two winter wheat lines. 4. To identify mutations in differentially expressed genes by High Resolution melting (HRM) method, to estimate the impact of mutations on the gene expression during cold acclimation and tolerance to freezing. / Tyrimų tikslas. Identifikuoti naujus žieminių kviečių genus, aktyvuojamus žemose temperatūrose bei atlikti šių genų sekų ir genetinės raiškos analizę. Tyrimų uždaviniai: 1. Ištirti žieminių kviečių genotipų tolerantiškumą žemoms neigiamoms temperatūroms natūraliomis ir dirbtinėmis sąlygomis. 2. Nustatyti skirtingose grūdinimosi stadijose diferenciškai ekspresuojamus genus (kDNR-AFLP analizė) ir atlikti DNR sekų analizę. 3. Optimizuoti mutagenezės metodą ir sukurti dviejų perspektyvių žieminių kviečių linijų mutagenines populiacijas. 4. Nustatyti skirtingu intensyvumu ekspresuojamų genų mutacijas HRM metodu, įvertinti nustatytų mutacijų įtaką genų ekspresijai grūdinimosi metu ir žemų neigiamų temperatūrų tolerancijai.

Sergamumas įvairiomis organinėmis gerklų ligomis, tarp jų ir onkologinėmis, didėja dėl senstančios visuomenės bei civilizacijos sąlygoto gyvenimo būdo pasikeitimo ir aplinkos taršos. Dėl slaptos eigos ir ankstyvų klinikinių simptomų nebuvimo daugiau nei pusė gerklų vėžio atvejų diagnozuojama vėlyvose stadijose. Nemažai reikšmės turi nesavalaikis ankstyvųjų simptomų interpretavimas, gydymo skyrimas ir rezultato prognozavimas. Šiuos netobulumus lemia daugelis faktorių, tarp kurių ne paskutinę vietą užima gydytojo patirties stoka. Siekiant sumažinti diagnostinių tyrimų vertinimo subjektyvumą, patirties skirtumus tarp skirtingos kvalifikacijos tyrėjų ir gydytojų, užtikrinant nuoseklų mokymo ir mokymosi procesą, tiek moksliniu, tiek praktiniu požiūriu yra aktualu sukurti visuotinai prieinamą sistemą, suteikiančią pagalbą diagnozuojant organines gerklų ligas. Tokia sistema turėtų remtis daugeliu skirtingos informacijos šaltinių parametrais, lanksčiai prisitaikyti prie naujų parametrų įvedimo ir informacijos kaupimo. Pasaulyje nėra sukurtos ir visuotinai naudojamos gerklų ligų kategorizavimo sistemos, apjungiančios keletą informacijos šaltinių bei padedančios gydytojui priimti sprendimą neaiškiose situacijose. Tikslas Sukurti automatinę organinių gerklų ligų kategorizavimo sistemą, paremtą mikrolaringoskopinių vaizdų, akustinių ir subjektyvių balso parametrų bei pacientų demografinių duomenų analize, ir įvertinti jos efektyvumą. Darbo uždaviniai 1. Nustatyti statistinių metodų ir... [toliau žr. visą tekstą] / In clinical practice, the diagnostic procedure of laryngeal diseases is based on evaluation of patient's complaints, history, and data of instrumental as well as histological examination. A variety of techniques for examination of the larynx and objective measurements of voice quality have been developed during the last years. Analysis of patient's complaints and history, evaluation of his/her voice, assessment of data of laryngeal visualization (laryngoscopy) remain the primary information sources used to categorize and diagnose the laryngeal disorders. Automated analysis of voice is increasingly used for detecting and screening laryngeal disorders. Time, frequency, and cepstral domains are usually used to extract features characterizing a voice signal. Analysis of the literature related to automated categorization of voice aiming to detect laryngeal pathologies showed that the categorization is usually based on one, two, or three types of features. There are no reports in the literature attempting to extract a larger variety of features for characterizing a voice signal. Moreover, there are no investigations of the utility of a large variety of feature types in categorizing the voice signal into the healthy and several pathological voice classes using a committee of support vector machines (SVM). Whilst automated categorization of voice into pathological and healthy classes is rather common, there were very few attempts to create systems for automated analysis of color... [to full text]

Sequent calculi for BDI logics is a research object of the thesis. BDI logics are widely used for agent system description and implementation. Agents are autonomous systems, those acts in some environment and aspire to achieve preassigned goals. Implementation of the decision making is the main and the most complicated part in agent systems implementation. Logic calculi may be used for the decision making implementation. In this thesis, there are researched sequent calculi for BDI logics. Sequent calculi for BDI logics, like sequent calculi for other modal logics, use loop-check technique to get decidability. Inefficient loop-check takes a major part of the resources used for the derivation. For some modal logics, there are known loop-check free sequent calculi or calculi with an efficient loop-check. In this thesis, there is presented loop-check free sequent calculus for KD45 logic, which is the main fragment of the BDI logics. Introduced calculus not only eliminates loop-check, but also simplifies sequent derivation. For the branching time logic (another BDI logic fragment) there is presented sequent calculus with an efficient loop-check. Obtained results are adapted for creation sequent calculi for monoagent and multiagent BDI logics. Introduced calculi use only restricted loop-check. Moreover, loop-check is totally eliminated for some types of the loops. These results enables to create more efficient agent systems, those are based on the BDI logics. / Darbe nagrinėjami sekvenciniai skaičiavimai BDI logikoms. BDI logikos yra plačiai naudojamos agentinių sistemų aprašymui ir realizavimui. Agentai yra autonomiškos sistemos, kurios veikia kažkurioje aplinkoje ir siekia įvykdyti iš anksto apibrėžtus tikslus. Sprendimų priėmimo realizavimas yra svarbiausia ir sudėtingiausia dalis realizuojant agentines sistemas. Sprendimo priėmimo realizavimui gali būti naudojami logikos skaičiavimai. Šiame darbe ir yra nagrinėjami sekvenciniai skaičiavimai BDI logikoms. BDI logikose, kaip ir kitose modalumo logikose, yra naudojama ciklų paieška išsprendžiamumui gauti. Neefektyvi ciklų paieška užima didesnę išvedimų paieškos resursų dalį. Kai kurioms modalumo logikoms yra žinomi becikliai skaičiavimai ar skaičiavimai naudojantys efektyvią ciklų paiešką. Šiame darbe yra pateikiamas beciklis sekvencinis skaičiavimas KD45 logikai, kuri yra esminis BDI logikų fragmentas. Pateiktas skaičiavimas ne tik eliminuoja ciklų paiešką, bet ir supaprastina patį sekvencijos išvedimą. Skaidaus laiko logikai (kitam BDI logikų fragmentui) yra pateikiamas sekvencinis skaičiavimas naudojantis efektyvią ciklų paiešką. Gauti rezultatai yra pritaikyti sukuriant sekvencinius skaičiavimus vianaagentinei ir daugiaagentinei BDI logikoms. Pristatyti skaičiavimai naudoja tik apribotą ciklų paiešką. Be to, kai kurių tipų ciklus eliminuoja visiškai. Šie rezultatai įgalina kurti efektyvesnes agentines sistemas, paremtas BDI logikomis.