Pour tenir compte de la forte variabilité des arbres dans les peuplements hétérogènes, les dendrométriciens ont cherché à modéliser l'évolution de chaque individu arbre en fonction de ses caractéristiques propres et de son environnement local. Ces Modèles Individu-Centré semblent plus pertinents pour simuler des peuplements complexes. Cependant, ces MIC nécessitent pour lancer une simulation un état initial avec les caractéristiques de chacun des arbres, et leur position dans le peuplement dont on veut simuler l'évolution. Ces données sont rares, et leur acquisition ne peut en pratique être envisagée que pour quelques placettes expérimentales. Il est alors possible d'utiliser un peuplement virtuel comme état initial pour un MIC. Il apparaît important que le peuplement virtuel simulé soit réaliste, c'est-à-dire qu'il reproduise les caractéristiques du peuplement réel qu'il représente, particulièrement ses caractéristiques spatiales. L'objectif de cette thèse est de construire des modèles de structure spatiale, permettant de simuler des peuplements virtuels réalistes. Ce travail est appliqué aux peuplements mélangés chêne sessile - pin sylvestre de la région Centre. Nous avons dans un premier temps construit une typologie de peuplements chêne - pin. Cette typologie est basée sur la structure spatiale des arbres, et met en évidence 5 types de structure spatiale pour les arbres de la canopée et 3 types pour le sous-étage. Nous avons ensuite construit des modèles de structure permettant de reproduire les structures spatiales identifiées. Nous avons couplé la typologie à des outils statistiques de simulation de peuplements virtuels, les processus ponctuels.

Cette étude a pour objectif principal dinventorier les espèces de poissons de la partie congolaise de lInkisi et de contribuer à la connaissance de leur structure de peuplements. A partir des pêches expérimentales et artisanales effectuées entre octobre 2005 et octobre 2008 et des spécimens déposés antérieurement dans les musées, 61 espèces appartenant à 38 genres et 15 familles ont été répertoriées. Trente-sept de ces espèces nétaient pas encore connues du bassin de lInkisi ; huit espèces sont endémiques et sont localisées en amont de la chute de Zongo : Barbus vanderysti, Labeobarbus sp. inkisi, Varicorhinus robertsi (Cyprinidae), Nannopetersius mutambuei (Alestidae), Schilbe zairensis (Schilbeidae) Aphyosemion labarrei (Nothobranchiidae) et Haplochromis sp. snoeksi et Chetia sp. inkisi (Cichlidae). Deux nouvelles espèces ont été décrites, Nannopetersius mutambuei et Haplochromis sp. snoeksi et les descriptions de deux autres sont en préparation. En ce qui concerne les proportions, la famille des Cyprinidae est la plus diversifiée (15 espèces soit 24,6 %); puis viennent les Mormyridae (11 espèces soit 18,0 %), les Cichlidae (9 espèces soit 7,1 %), les Clariidae (7 espèces soit 11,5 %), les Schilbeidae (4 espèces soit 6,6 %), les Mochokidae et les Amphilidae (3 espèces chacune soit 4,9 %) et les Nothobranchiidae (2 espèces soit 3,3 %). La somme des autres familles, représentées par une seule espèce, vaut 6,4 %. Les peuplements des poissons ont été échantillonnés aux filets maillants dans dix stations en prenant en compte 21 variables environnementales. Des analyses canoniques de redondance ont permis de mettre en évidence cinq variables environnementales (la couverture de la canopée, la présence de gros blocs de roches, la largeur de la rivière, le plancher rocheux et le substrat vaseux) qui influent sur la distribution des poissons et un plan spatial de peuplement de cinq types dhabitats : trois sur les affluents (Nsoni, Ngeba et Nua-Luidi-Bongolo-Wungu) et deux sur le cours principal (amont de la chute de Zongo et aval de la chute de Zongo). Les espèces qui caractérisent Nsoni, habitat à canopée sont Parauchenoglanis balayi, en terme dabondance et Barbus vanderysti, en terme de présence. Dans Ngeba, habitat à substrat boueux, les espèces caractéristiques en terme de présence sont Parachanna obscura et Ctenopoma nigropannosum. Dans le complexe Nua-Luidi-Bongolo-Wungu il y a, en terme dabondance, Varicorhinus latirostris, Raiamas kheeli et Garra congensis. Sur le cours principal, en amont de chute Zongo, habitats larges à fond rocheux, on retrouve, en terme dabondance Varicorhinus macrolepidotus, Labeo macrostomus, Doumea alula, Barbus cf. argenteus, et Chetia sp. inkisi. Finalement, en aval de la chute Zongo, habitat à gros blocs de roches, il y a 14 espèces caractéristiques en terme de présence dont les plus abondantes sont Labeo nasus, Steatocranus casuarius, Labeo greeni, Campylomormyrus rhynchophorus et Schilbe grenfelli. Dans la partie congolaise de lInkisi le gradient longitudinal de peuplement nest pas perceptible : laugmentation de la richesse spécifique amont-aval napparaît pas mais la composition spécifique amont-aval est différente. Les indices de diversités (richesse spécifique et équitabilité) variées en fonction des stations ; les plus élevés sont dans la station aval de la chute Zongo et les plus faibles dans la station Nsoni (pour la richesse spécifique) et la station Nua (pour léquitabilité). Les peuplements ichtyologiques semblent équilibrés dans la partie située en aval de la chute Zongo. Des affluents tel que Wungu ont été perturbés suite à lutilisation des techniques destructives (ichtyotoxique). Une planification et une gestion rationnelle des ressources halieutiques dans ce bassin doivent sopérer et être effectives pour préserver sa biodiversité. The present study aimed making a species inventory and contributing to the knowledge of the fish community structure of the Congolese part of Inkisi basin. Based on fishes collected between October 2005 and October 2008 using gill nets and local fishing gear, and specimens previously deposited in musea, a total of 61 species belonging to 38 genera and 15 families have been surveyed. Thirty seven of these species are new citations for the Inkisi basin; eight species are endemic and are only found upstream from the Zongo fall: Barbus vanderysti, Labeobarbus sp. inkisi, Varicorhinus robertsi (Cyprinidae), Nannopetersius mutambuei (Alestidae), Schilbe zairensis (Schilbeidae) Aphyosemion labarrei (Nothobranchiidae) and Haplochromis sp. snoeksi, Chetia sp. inkisi (Cichlidae). Two new species were described, Nannopetersius mutambuei and Haplochromis sp. snoeksi and two others are currently under preparation. The family Cyprinidae is the most diversified (15 species, 24.6 %), followed by Mormyridae (11 species, 18.0 %), Cichlidae (9 species, 7.1 %), Clariidae (7 species, 11.5 %), Schilbeidae (4 species, 6.6 %), Mochokidae and Amphilidae (with 3 species each one), and Nothobranchiidae (2 species, 3.3 %). The remaining families have only one species each and constitute 6.4 %. The fish communities were sampled using gill nets in ten stations taking into account 21 environmental variables. The canonical redundancy analysis retained five important environmental variables (canopy cover, presence of big rock blocs, river width, rocky bottom and muddy bottom) explaining the distribution of the fish species and revealed a spatial plan of five habitat types: three patterns for the affluents (i.e. Nsoni, Ngeba and Nua-Luid-Bongolo-Wungu) and two for the main channel (i.e. upstream of the Zongo fall and downstream of the Zongo fall). For the Nsoni, station with canopy, the typical species are Parauchenoglanis balayi and Barbus vanderysti, respectively, in abundance, and presence. In the Ngeba, station with muddy bottom, the typical species, in abundance, are Parachanna obscura and Ctenopoma nigropannosum. For the Nua-Luidi-Bongolo-Wungu complex, the typical species, in abundance, are Varicorhinus latirostris, Raiamas kheeli and Garra congensis. For the main channel of the Inkisi course upstream of the Zongo fall, wide habitats with rocky bottom, the typical species, in abundance, are Varicorhinus macrolepidotus, Labeo macrostomus, Doumea alula, Barbus cf. argenteus, and Chetia sp. inkisi. Finally, for the Inkisi main channel downstream of the Zongo fall, the station with big rock blocs, 14 species are typical in term of presence, among them the most common are Labeo nasus, Steatocranus casuarius, Labeo greeni, Campylomormyrus rhynchophorus, and Schilbe grenfelli. For the Congolese part of Inkisi no longitudinal gradient of the fish community assemblages was observed along the river. Species richness did not increase from upstream to downstream although the species composition between both is certainly different. Diversity index (species richness and equitability) vary according to station with the highest indexes observed downstream of the Zongo fall and the lower ones at Nua (for the equitability) and Nsoni (for the species richness). Fish communities seem equilibrated downstream of the Zongo fall. On the contrary affluents like the Wungu are being disturbed mainly by bad fishing practice (use of ichthyotoxin). A planification and sustainable use of the natural resources of the Inkisi River must be applied and executed to protect its fish diversity.

Etudier les forteresses des villes de Bourgogne signifie s’intéresser aux rapports entre, d’une part, ces bâtiments et leurs occupants et, d’autre part, la société dans laquelle ils sont implantés. Une ville avec un château fort n’est pas toujours un bourg castral. Le château peut engendrer, déplacer, ou dynamiser une agglomération. Sa représentation traduit également la place qu’il occupe dans la société. La genèse de la cité a souvent des conséquences tout au long de l’époque moderne sur les relations entre le château et la ville. Dans la guerre, le château peut représenter la ruine ou le salut pour la ville. Dans la paix, c’est le plus souvent un poids mort : il faut l’entretenir, parfois aussi entretenir la garnison. Mais dans la dialectique villes/châteaux, les premières sont largement gagnantes aux XVIIe et XVIIIe s., ce qui se concrétise par des réaffectations, des abandons, ou le plus souvent des destructions des forteresses urbaines. / Study the urban fortresses of Burgundy means interesting in the relationships between, on the one hand, these buildings and their occupants and, on the other hand, the society in which they are located. A city with a castle isn’t necessarily a castral town. The castle can generate, move or expand a city. Its representation also reflects its place in society. The genesis of the city often has consequences throughout the modern times on relationships between the castle and the city. In wartime, the castle can be the ruin or the salvation for the city. In peacetime, it’s most often a dead weight : it must be maintained, sometimes its garnison must be maintained too. But in the dialectic cities/castles, the second ones are heavily defeated, which takes the form of redeployments, abandonments, or more often destructions of urban castles.

Cette étude permet une approche de la gestion et de la protection du milieu marin de la mer d'Iroise à partir des connaissances biologiques et écologiques acquises pour l'ensemble de la zone. Ce travail s'insère dans les préoccupations nationales et internationales de conservation de la biodiversité par l'acquisition et la synthèse de connaissances scientifiques et leur restitution aux autres acteurs de la conservation. La richesse biologique de cette région marine est attestée par la présence d'espèces-phares mais le milieu benthique restait largement méconnu. Cette étude apporte des données qui complètent les connaissances sur la sédimentologie des fonds de l'Iroise et permettent d'en préciser la couverture sédimentaire et la variabilité spatiale et saisonnière. Une large gamme de types sédimentaires est représentée, avec une importance originale pour les cailloutis et les graviers et l'organisation des sédiments en couches superposées, induisant une complexité d'habitats ; de plus, la variabilité spatiale masque la variabilité saisonnière. L'étude de la faune benthique des fonds meubles permet de définir les habitats et les communautés du milieu marin de l'Iroise, avec six grandes unités de peuplement comportant chacune plusieurs faciès, dont certains à grande valeur écologique et patrimoniale. L'importance de la zone frontale du large et son influence sur les communautés benthiques sont mises en évidence. Une analyse de l'utilisation de l'espace et des ressources en mer d'Iroise est proposée, ainsi qu'un bilan concernant la biodiversité et l'état actuel des réflexions internationales sur les aires marines protégées. La synthèse finale dégage les enjeux des habitats et des peuplements de l'Iroise puis les pressions anthropiques potentielles à court et moyen termes. Les priorités et les solutions pour la conservation de ce milieu marin sont discutées et un plan de zonage multi-usages est proposé dans le cadre du futur Parc National Marin de la mer d'Iroise.

Le Bassin garonnais est l'entité géomorphologique axiale de l'Aquitaine. La moyenne vallée de la Garonne, a bénéficié, récemment, d'un profond renouveau des données. Des sites et indices, surtout du Paléolithique inférieur et moyen ont ainsi pu être découverts et étudiés. Les industries lithiques issues de ces opérations permettent de disposer maintenant de référentiels robustes, autorisant des comparaisons de comportements humains pendant le Pléistocène moyen et supérieur. Il a été démontré que les occupations, de type résidentiel multifonctionnel, sont implantées de manière récurrente dans le paysage. L'approche des contextes géomorphologiques, stratigraphiques ainsi que des premiers éléments de datations et leurs corrélations, permettent de proposer un premier schéma chrono-stratigraphique et chrono-culturel, qui inclut le Midi toulousain dans le contexte général de l'occupation de l'Europe. Ainsi, il est envisageable que l'occupation de la vallée de la Garonne par des groupes acheuléens ne soit pérenne qu'à partir du stade isotopique 12. Il a pu être démontré l'absence presque totale d'occupations du Paléolithique supérieur et du Paléolithique moyen récent, en dehors de rares éléments correspondant à des améliorations climatiques ponctuelles. Nous en déduisons que les facteurs environnementaux, rudes pour les phases glaciaires, devaient rendre particulièrement inhospitalière la vallée de la Garonne, repoussant les populations préhistoriques dans les secteurs plus protégés qui encadrent la vallée (karst). Par projection, il est tout à fait envisageable que ce phénomène ait été le même lors des phases glaciaires antérieures. Ainsi, La vallée de la Garonne constituerait, alternativement, un pivot favorisant la circulation et une frontière limitant les contacts nord/sud, en fonction des conditions environnementales qui se sont succédé au cours des fluctuations climatiques du Pléistocène.

D'importants développements humains et économiques sont attendus à court terme dans la zone rurale de Voh-Koné-Pouembout (Nouvelle-Calédonie) suite à l'installation d'un complexe minier, avec pour conséquence probable l'augmentation rapide et significative de la pression de pêche sur les ressources ichtyologiques. Face à cette perturbation à venir, il est nécessaire d'envisager de manière appropriée le suivi et la gestion des ressources sur le long terme. Dans un premier temps, à partir de campagnes de comptages en plongée et d'enquêtes de pêche, un état des lieux des ressources et de leurs usages est fait avant l'apparition de changements majeurs. Puis, différentes analyses ont abouti à l'identification d'indicateurs potentiels pour un suivi des ressources ichtyologiques sous impact de la pêche. Dans une optique opérationnelle, des réflexions sur la mise en oeuvre de ces indicateurs, sur l'optimisation de l'échantillonnage et sur l'intérêt de méthodes d'observation additionnelles (vidéo) ont permis de proposer des recommandations pour un suivi à long-terme des ressources ichtyologiques et des activités de pêche correspondante.

Dans un contexte de gestion des systèmes côtiers, l'approche développée dans cette étude -associer un suivi des paramètres environnementaux avec celui des peuplements pélagiques et benthiques- permet d'appréhender le fonctionnement global de l'écosystème. La veille écologique menée depuis plus de 20 ans en rade de Brest a fait apparaître un nouveau risque écologique (et économique): la prolifération d'un filtreur benthique exotique, compétiteur potentiel de la coquille Saint-Jacques, la crépidule Crepidula fornicata (L.). Ses mécanismes de prolifération étaient encore inconnus en rade, notamment concernant l'accélération récente (15-20 ans) du processus. L'approche multidisciplinaire de ce travail permet d'étudier les mécanismes d'adaptation et de régulation naturelle de la crépidule en rade de Brest face aux fluctuations naturelles de l'environnement (hydroclimat) et aux perturbations anthropiques (eutrophisation...) et d'identifier ses impacts sur le fonctionnement de l'écosystème.<br />Les causes de la prolifération actuelle de la crépidule en rade et ses impacts sur la structuration et le fonctionnement de l'écosystème ont été précisés : les filtreurs exercent un rétro-contrôle de la production primaire (filtration, biodépositions). L'analyse des conditions favorables à la prolifération de la crépidule a montré la place importante prise par cette espèce dans l'écosystème et a permis de mieux appréhender les processus d'évolution de son aire de répartition et de son stock. La description réalisée des peuplements benthiques soumis à cette invasion constitue un état de référence de la mégafaune de la rade en 2000. Les impacts de la crépidule sur l'écosystème (colonne d'eau, sédiment, biocénoses) ont été précisés. Des évolutions futures sont envisagées et des recommandations sont faites pour en limiter l'extension et pérenniser la pêcherie de coquilles Saint-Jacques en rade de Brest. Des perspectives sont proposées dans le cadre de la gestion intégrée de cet écosystème.

Les zones humides (ZH) alluviales constituent des secteurs à forte valeur écologique etpatrimoniale. Pour comprendre et prédire l'évolution à long terme de ces zones, en particulierface aux changements globaux, il apparaît primordial de traduire les perturbationshydrologiques attendues en termes de perturbations biologiques, afin d'estimer lesconséquences potentielles de ces changements pour la biodiversité et le fonctionnement globalde ces écosystèmes. Cette thèse s'articule donc autour de deux objectifs: proposer un modèleconceptuel de fonctionnement écologique des ZH soumises à des assèchements saisonniers etestimer la vulnérabilité écologique de communautés faunistiques vivant dans ces ZH, enconsidérant conjointement les peuplements benthiques et interstitiels (principalementCrustacés).Nos résultats démontrent que la morphologie des ZH (eau relativement courante, eaustagnante, apports phréatique) et leurs modes d'assèchement (formation de mouilles isoléesou assec complet) sont essentiels dans la structuration des communautés microbiennes etd'invertébrés et dans la réponse saisonnière de la biodiversité et des processus écologiques.L'intensification probable des étiages et des assèchements augmentera l'hétérogénéité spatialeet temporelle des habitats et leur richesse spécifique mais réduira la biodiversité globale desplaines alluviales (disparition des espèces rares). Ces étiages plus sévères modifieront lesprocessus écologiques, diminuant le recyclage de la matière organique et la qualité des eauxsuperficielles. Les recherches futures devraient s'orientées vers des stratégies et des moyensefficaces pour garantir la durabilité écologique des ZH.

Etudier les forteresses des villes de Bourgogne signifie s'intéresser aux rapports entre, d'une part, ces bâtiments et leurs occupants et, d'autre part, la société dans laquelle ils sont implantés. Une ville avec un château fort n'est pas toujours un bourg castral. Le château peut engendrer, déplacer, ou dynamiser une agglomération. Sa représentation traduit également la place qu'il occupe dans la société. La genèse de la cité a souvent des conséquences tout au long de l'époque moderne sur les relations entre le château et la ville. Dans la guerre, le château peut représenter la ruine ou le salut pour la ville. Dans la paix, c'est le plus souvent un poids mort : il faut l'entretenir, parfois aussi entretenir la garnison. Mais dans la dialectique villes/châteaux, les premières sont largement gagnantes aux XVIIe et XVIIIe s., ce qui se concrétise par des réaffectations, des abandons, ou le plus souvent des destructions des forteresses urbaines.

Foresters are faced with difficulties to obtain sub-polygon information with the mapping methods available nowadays. The main objective of this work consisted in the development of new methods able to improve the map accuracy of regenerating forest stands and mature forest stands in the South of Québec, Canada. The Dempster-Shafer Theory (DST) and the Dezert-Smarandache Theory (DSmT) showed their ability to integrate multiple heterogenous data sources to go further than the classical classification procedures like the maximum likelihood or the spectral unmixing, in terms of map accuracy. Improvement on the ability to map regenerating stands, passed from 82.7% with the maximum likelihood method to 91.1% with the Free DSm model with a total transfer of the mass of the"Union" class to the"Intersection" class (+ 8.4%). For the mature stands, the improvement passed from 63.8% with the K nearest neighbour to 79.5% with the DST according to a classical belief structuration and the hybrid decision rule for which the conflict threshold was fixed at 10% (+ 15.7%). Our results with DST and a bayesian belief structuration showed the difficulty to model the uncertainty in the fusion process. This is probably due to the lack of scientific knowledge about the influence of the biophysical and climatic parameters on the mapped forest stands and to the necessity to model specifically the uncertainty for each source. Our work showed concrete improvement when mapping forest stands with DST which is encouraging to continue explorating the fundamental principle of the proposed hybrid decision rule. This means a particular focus on the difference between the fused masses of each potential class after the fusion, to choose the best hypothesis.