Made available in DSpace on 2013-08-07T19:04:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000332738-Texto+Completo-0.pdf: 388569 bytes, checksum: df34be963b76a8b5ae2b4e514651f8c3 (MD5) Previous issue date: 2004 / Background – Cardiovascular diseases are the fifth cause of death all over the world and projections show that they will be the first cause in the year 2020 if preventive measures are not provided. Dislipidemia is among the main risk factors to coronary disease, with it’s participation intensity as a risk factor depending on environmental components and genetic characteristics of each individual. Among the genetic factors that influence atherosclerosis, apolipoprotein E is the most studied one and is associated with changes in lipoprotein levels depending of the respective allele envolved. With the recent advances in the lipid metabolism study, researches have been started regarding the roll of lipoproteins subfractions and the genetic influence, specially the apolipoprotein E polymorphism, in the development of atherosclerosis. Objective – To correlate the apolipoprotein E polymorphism and the lipoprotein subfraction distribution profile of dislipidemic individuals. Population and methods – Cross-sectional, descriptive and analytical study. Thirty-five individuals with dislipidemia were analyzed. Their ages were between fifty and seventy-nine years-old. The data were obtained through structured interview and laboratorial evaluation. Lipid profile were evaluated using enzymatic method and lipoproteins subfractions profile were evaluated by Nuclear Magnetic Ressonance spectroscopy method and apolipoprotein E polymorphism using Polymerase Chain Reaction - Randon Fragment Lengh Polymorphism technique. Results – The genotypic frequencies found were symilar to the pattern found in the adult caucasian population in general, with predominance of the 3 3 genotype. The lipid profile and the lipoprotein subfractions showed a normal pattern of distribution, except for the VLDL size. Analyzing this varieties according to the apolipoprotein E group (group three: 2 3 and 3 3, group four: 3 4 and 4 4 ), statistically significant differences were not found to any of the variables. Conclusion – In the present study with dislipidemic patients we did not find association between the apolipoprotein E polymorphism and the lipoprotein subfraction distribution profile . / Introdução – As doenças cardiovasculares são a quinta causa de óbito em todo o mundo e projeções mostram que serão a primeira causa em 2020 se medidas preventivas não forem realizadas. Um dos principais fatores de risco para doença arterial coronariana é a dislipidemia, com a intensidade de sua participação como fator de risco dependendo de componentes ambientais e características genéticas de cada indivíduo. Dentre os fatores genéticos influenciando a aterosclerose, o polimorfismo da apolipoproteína E é o mais estudado, associando-se a alterações nos níveis basais de lipoproteínas conforme o alelo envolvido. Com os avanços no conhecimento do metabolismo lipídico, passou-se a pesquisar o papel das subfrações de lipoproteínas na aterogênese e quais os fatores que poderiam alterar seu perfil de distribuição, dentre estes, a influência genética. Objetivo - Correlacionar o polimorfismo da apolipoproteína E e o perfil de distribuição das subfrações de lipoproteínas de indivíduos portadores de dislipidemia. População e Métodos – Estudo transversal, descritivo e analítico. Foram avaliados 35 indivíduos com idades de 50 a 79 anos, portadores de dislipidemia. A história clínica e os dados antropométricos foram obtidos através de entrevista estruturada e avaliação laboratorial. Foram avaliados perfil lipídico por reação enzimática colorimétrica e imunoinibição, perfil de subfrações de lipoproteínas pelo método de espectroscopia por Ressonância Nuclear Magnética e polimorfismo da apolipoproteína E através da técnica de Polymerase Chain Reaction – Randon Fragment Lengh Polymorphism. Resultados - As freqüências genotípicas encontradas foram semelhantes ao padrão encontrado para a população adulta caucasiana em geral, com predomínio do genótipo Є3Є3. Para a análise das variáveis foram agrupados os genótipos da apolipoproteína Є2Є3 e Є3Є3 (grupo E3) e os genótipos Є3Є4 e Є4Є4 (grupo E4). Não houve a presença dos genótipos Є2Є2 e Є2Є4 na população estudada. Avaliando-se o perfil de distribuição de subfrações de lipoproteínas conforme os grupos de apo E, não foram encontradas diferenças estatisticamente significativas para nenhuma das variáveis. Conclusão -. No presente estudo em pacientes portadores de dislipidemia não encontrou-se associação entre o polimorfismo da apolipoproteína E e o padrão de distribuição das subfrações de lipoproteínas.

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:05:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000382097-Texto+Completo-0.pdf: 1824071 bytes, checksum: d6839918341081f6d5e679138d3edaed (MD5) Previous issue date: 2006 / Introduction: epidemiological studies have shown the cardiovascular disease risk and protective factors, including environmental variables, such as physical activity, and genetic variables, such as G894T polymorphism present in endothelial oxide nitric sinthase (NOS3). Objectives: to investigate the interaction between physical activity and G894T polymorphism of NOS3 gene in a free living elderly community with risk factor indexes and cardiovascular morbidities. Material and methods: an observational study was performed, at first, on 437 elders in order to determine the G894T NOS3 polymorphism allelic and genotype frequencies. From that initial group, 174 subjects were physically evaluated using the International Physical Activity Questionnaire (IPAQ), as well as their previous history of cardiovascular risk and morbidities. The elderly were classified in sufficiently (SA) and insufficiently actives (IA). NOS3 polymorphism was determined by Polymerase Chain Reaction technique followed by the Restriction Fragment Length Polymorphism technique using Ban II restriction enzyme. Statistical analyses were performed using chi-square test, Fisher Exact test, One-Way variance analysis followed by post hoc Bonferroni test or Student t test. Results: allelic and genotypic frequencies in the 437 subjects were: G= 0,655, T= 0,345 e GG= 38,8% (169), GT= 53,3% (234) e TT= 7,8% (34); in the group of 174 subjects they were: G= 0,672, T= 0,328 and GG= 39,7% (69), GT= 54,6% (96) e TT= 5,7% (09). Both groups presented genetic frequencies in Hardy- Weinberg equilibrium, being similar to those described for Caucasian populations. Physical activity prevalence was: SA= 78,0% (136) and IA= 22,0% (38).The prevalence of cardiovascular risk factors and morbidities were similar between SA and IA groups with different NOS genotypes, with the exception of obesity, which was significantly higher for carriers of at least one T allele [Odds ratio (OR)= 2,947, Confidence Interval at 95% (CI95%)= 1,519-5,718]. Interaction analysis between physical activity and the NOS3 polymorphism was performed only in SA group subjects due to the low sample number of individuals in the IA group. In addition to the association of the T allele and the higher prevalence of obesity (OR= 3,866, CI95%= 1,777-8,412), it was observed some positive associations between T allele and lower Systemic Arterial Hypertension prevalence (OR= 0,110, CI 95%= 0,012-0,960). Conclusion: results suggest interaction between physical activity and the G894T polymorphism. / Introdução: estudos epidemiológicos apontaram diferentes fatores protetores e de risco para morbidades cardiovasculares incluindo variáveis ambientais como a atividade física (AF) e genéticas como o polimorfismo G894T da enzima óxido nítrico sintetase endotelial (NOS3/eNOS). Objetivos: investigar a interação entre AF cotidiana e o polimorfismo G894T da NOS3 em idosos que vivem em Gravataí-RS com fatores de risco e morbidades cardiovasculares. Material e métodos: estudo observacional no qual 437 idosos foram avaliados para determinação do polimorfismo G894T do G894T da NOS3 através da técnica de PCR-RFLP com a enzima de restrição Ban II. Destes, 174 foram avaliados quanto ao nível de AF pelo International Physical Activity Questionnary (IPAQ) e história prévia de fatores de risco e morbidades cardiovasculares. Na análise estatística, foram utilizados os testes qui-quadrado ou Exato de Fisher, análise de variância One-Way seguida de teste post hoc de Bonferroni ou teste Student t. Resultados: as freqüências alélicas e genotípicas nos 437 indivíduos foram: G= 0,655, T= 0,345 e GG = 38,8% (169), GT= 53,3% (234) e TT= 7,8%(34); já no grupo dos 174 indivíduos foram: G= 0,672, T= 0,328 e GG= 39,7% (69), GT= 54,6% (96) e TT= 5,7% (09). As freqüências estavam em equilíbrio de Hardy-Weinberg sendo similares às descritas para populações caucasianas. A prevalência do nível de AF foi: SA= 78,0% (136) e IA= 22,0% (38). A prevalência dos fatores de risco e morbidades cardiovasculares foi similar entre os grupos SA e IA e entre os idosos com diferentes genótipos da NOS3 com exceção da obesidade que foi significativamente maior em portadores de pelo menos um alelo T (RC= 2,947; IC95%= 1,519-5,718).Através da análise da interação entre AF e o polimorfismo (feita somente em idosos AS), verificou-se a manutenção da associação entre o alelo T e maior prevalência de obesidade (RC= 3,866; IC95%= 1,777-8,412) e entre o alelo T e menor prevalência de hipertensão arterial sistêmica (RC= 0,110; IC95%= 0,012-0,960). Conclusão: os resultados obtidos sugerem a existência de interação entre o polimorfismo G894T da NOS3 com AF.

Made available in DSpace on 2013-08-07T18:41:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000443742-Texto+Completo-0.pdf: 569133 bytes, checksum: 71572bf56d3664471f8b311fafbd7bba (MD5) Previous issue date: 2012 / Metabolic syndrome (MetS) is associated with increased risk of incidence type 2 diabetes, cardiovascular disease and insulin resistance and is considered an important cause of mortality and morbidity from cardiovascular disease. According to guidelines from the National Cholesterol Evaluation Program for Adult Treatment Panel III (NCEP ATP III) diagnosis of this syndrome occurs when a person has three or more risk factors between central obesity, hyperglycemia, hypertriglyceridemia, high blood pressure and low HDL-cholesterol. Others risk factors also been associated with MetS are inflammation, genetic and environmental factors. Among the genetic factors investigated as possible risk factors are identified some polymorphisms in the gene interleukin 6 receptor, already associated with dyslipidemia, obesity and insulin resistance. The objective of this study was to evaluate the response of individuals with Metabolic Syndrome (MetS) to a lifestyle modification intervention and the influence of polymorphism 48867A>C of IL6R (rs2228145) in this response. Seventy-seven sedentary individuals with at least three criteria for MetS were included and randomly divided into two groups: NI, nutritional intervention; NIE, nutritional intervention and exercise practice. Parameters were analyzed before and after three months of intervention. When comparing the effect of different intervention according to genotype, a decrease in triglyceride levels was observed (significant for AA genotype; for AC genotype only in NIE group); a significant reduction of fasting glucose level was observed in AA genotype, independent of intervention group, but for AC genotype, only in NI group; systolic blood pressure (SBP) showed significant reduction for AA and AC genotype. When analyzing parameters mean value according to genotype (isolated and in combination) before and after intervention, triglyceride mean levels differed significantly after intervention among genotypes and for AA compared to AC+CC; SBP showed difference before intervention for AA genotype and after intervention, among genotypes and for homozygous A. The analysis of number of individuals with altered parameters revealed statistically significant difference for AA genotype before intervention for triglycerides and diastolic blood pressure (DBP). After intervention, significance was observed for triglycerides, SBP and DBP among genotypes and for AA compared to AC+CC. In conclusion, our results suggest that response to intervention based on nutritional control and exercise practice could benefit mainly individuals homozygous AA of IL6R gene 48867A>C polymorphism. / A síndrome metabólica (SM) está associada a um risco aumentado de incidência de diabetes tipo 2, doenças cardiovasculares e resistência à insulina, sendo considerada uma importante causa de mortalidade e morbidade por doença cardiovascular. Segundo orientações da National Cholesterol Evaluation Program for Adult Treatment Panel III (NCEP ATP III) o diagnóstico dessa síndrome acontece quando um indivíduo apresenta três ou mais fatores de risco entre obesidade central; elevados níveis de glicemia, de triglicerídeos e de pressão arterial e baixos níveis de HDL-colesterol. Outros fatores que também têm sido associados à SM, são inflamação, fatores genéticos e ambientais. Entre os fatores genéticos investigados como possível fator de risco estão alguns polimorfismos identificados no gene do receptor da interleucina 6, já associados a dislipidemias, obesidade e resistência à insulina. O objetivo deste estudo foi avaliar a resposta de indivíduos com síndrome metabólica (SM) a uma intervenção de modificação do estilo e a influência do polimorfismo 48867A> C do IL6R (rs2228145) nesta resposta. Setenta e sete indivíduos sedentários, com pelo menos três critérios para síndrome metabólica foram incluídos e divididos aleatoriamente em dois grupos: IN, intervenção nutricional; INE, intervenção nutricional e prática de exercícios. Os parâmetros foram analisados antes e após três meses de intervenção. Quando foi comparado o efeito das diferentes intervenções de acordo com o genótipo, foi observada uma diminuição dos níveis de triglicerídeos (significativa para o genótipo AA, mas para o genótipo AC somente no grupo INE); uma redução significativa do nível de glicose em jejum foi observada no genótipo AA, independente do grupo de intervenção, mas para o genótipo AC, somente no IN grupo; a pressão arterial sistólica (PAS) mostrou redução significativa nos genótipos AA e AC. Quando valor médio dos parâmetros foi analisado de acordo com os genótipos (isolados e em combinação) antes e após a intervenção, os níveis médios de triglicerídeos diferiram significativamente após a intervenção entre os genótipos e no genótipo AA comparado com AC+CC; a PAS mostrou diferença antes da intervenção para o genótipo AA e após a intervenção, entre os genótipos e para homozigotos A. A análise do número de indivíduos com parâmetros alterados revelou diferença estatisticamente significante para o genótipo AA, antes da intervenção, para triglicerídeos e pressão arterial diastólica (PAD). Após a intervenção, foi observada significância para triglicerídeos, PAS e PAD entre os genótipos e para o genótipo AA quando comparado com AC+CC. Em conclusão, nossos resultados sugerem que a resposta à intervenção baseada no controle nutricional e na prática de exercícios pode beneficiar, principalmente, os indivíduos homozigotos AA do polimorfismo 48867A> C do gene IL6R.

Made available in DSpace on 2013-08-07T18:41:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000438120-Texto+Completo-0.pdf: 2337312 bytes, checksum: 3bcbd6b2d333489c6e0cefb866d0b73c (MD5) Previous issue date: 2012 / Ewing’s sarcoma was first described by James Ewing in 1921 and it is the second most common bone tumor in children and young adults. Both chromosomal breakage and translocation occur in this sarcoma. The EWS gene is localized in chromosome 22 and is involved in this translocation. However, little is known about this gene breaking region and what sequences could be involved in higher chromosomal break susceptibility. In this study we aimed to investigate three SNPs in the EWS gene breaking region in a healthy subjects’ population and in Ewing’s sarcoma patients. Genotyping was performed by TaqMan® assay for allelic discrimination using Real-Time PCR System. We conducted analysis of allelic and genotypic frequencies, as well as association and transmission disequilibrium tests. According to our results, the control group showed similar and different genotypes distribution of all SNPs when compared to other populations studied by different projects, which shows how important it is to know the frequencies of our population. To test the hypothesis that some SNP, SNParrangement or haplotype could influence in the susceptibility to develop Ewing’s sarcoma, we compared affected with non-affected individuals using association studies. The results showed one significant difference: a higher presence of homozygote T-rs4820804 in Ewing’s Sarcoma patients. Transmission Disequilibrium Test (TDT) was performed to compare data from Ewing’s Sarcoma patients and from their families but no statistically significant result was found. In conclusion, we find that the TT-rs4820804 EWS genotype can be associate with Ewing’s sarcoma and that the rs4820804 SNP can be a candidate to understand the EWS breakage susceptibility. / O sarcoma de Ewing foi primeiramente descrito por James Ewing em 1921 e é o segundo tumor ósseo mais frequente em crianças, adolescente e adultos jovens. Neste sarcoma, é comum ocorrer a quebra e a translocação cromossômica. Dentre os genes envolvidos nesta translocação está o gene EWS, localizado no cromossomo 22. Entretanto, pouco se sabe a respeito da região de quebra deste gene e quais sequências poderiam levar a uma maior susceptibilidade a quebra cromossômica. Sendo assim, o objetivo deste trabalho foi investigar três polimorfismos de base única (SNPs) presentes na região de quebra do gene EWS, em uma população de indivíduos saudáveis e em pacientes afetados pelo Sarcoma de Ewing. A genotipagem para os SNPs selecionados foi realizada usando TaqMan SNP Genotyping Assay pelo sistema de PCR em tempo real. Nós realizamos análises de frequências alélicas e genotípicas, assim como um estudo de associação e de desequilíbrio de transmissão.A comparação das frequências alélicas e genotípicas entre as populações deste estudo e entre populações de projetos já publicados mostrou particularidades entre as populações, revelando a importância de se conhecer tais frequências na população de estudo. Para testar a hipótese de que algum SNP, haplótipo ou combinação específica de SNPs poderia influenciar na susceptibilidade ao Sarcoma de Ewing, comparamos afetados com não-afetados realizando estudos de associação cujos resultados mostraram uma única diferença significativa: a maior incidência no genótipo TT-rs4820804 entre os afetados pelo Sarcoma de Ewing. O Teste de Desequilíbrio de Transmissão (TDT) comparou os dados dos pacientes afetados e os dados de seus familiares, mas nenhum resultado significativo foi encontrado. Em conclusão, o genótipo TT-rs4820804 pode estar associado ao Sarcoma de Ewing e o SNP rs4820804 pode ser candidato para auxílio do entendimento da susceptibilidade de quebra do gene EWS.

Made available in DSpace on 2013-08-07T18:41:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000438127-Texto+Completo-0.pdf: 909961 bytes, checksum: 5f9f40febc8291b363b759367f823d98 (MD5) Previous issue date: 2012 / In this study the SNPs rs640098, rs491714, rs611307 into the FLI1 gene were genotyped in a sample of 201 subjects from southern Brazilian population, in 24 Ewing’s sarcoma patients (geographically matched with control group) and 54 of their family members, including parents and siblings. We performed association studies comparing genotypic frequencies of rs640098, rs491714, rs611307 into the FLI1 gene, and all possible genotype combinations between Ewing’s Sarcoma patients and control group. Of the three SNPs investigated individually, only one of them showed a significant result when compared to the control group; our non-combined analysis revealed a significantly higher presence of homozygote A-rs497714 among Ewing’s Sarcoma patients (p=0. 0065; Chi square Test). In all other tested clusters, we always noticed a higher rate of homozygote A-rs497714 among Ewing’s Sarcoma patients independent of the other SNP-arrangements and/or haplotype combinations. In addition, we performed transmission disequilibrium tests comparing data from Ewing’s Sarcoma patients and from their families (parents and siblings), but no statistically significant result was found. In conclusion, the present study provides evidence statistically founded that the AA-rs497714 FLI1 genotype can associated with Ewing's sarcoma. And that this polymorphism can be clinically useful as a potential genetic marker to the prognostic of risk to develop this cancer or to provide insights into FLI1 chromosome breakage context of tumorigenesis. / Neste estudo, os SNPs rs640098, rs491714, rs611307 no gene FLI1 foram genotipados em uma amostra de 201 indivíduos da população do sul do Brasil, e em 24 pacientes portadores de Sarcoma Ewing (geograficamente comparado com grupo controle) e 54 de seus familiares, incluindo pais e irmãos. Realizamos estudos de associação, comparando as freqüências genotípicas do rs640098 e rs491714 e rs611307 no gene FLI1, e todas as combinações possíveis entre o genótipo de pacientes Sarcoma de Ewing e grupo controle. Dos três SNPs investigados individualmente, apenas um deles apresentou um resultado significativo quando comparado com o grupo controle; nossa análise não-combinada revelou uma presença significativamente maior de homozigoto A-rs497714 entre os pacientes de Sarcoma Ewing (p = 0,0065; Chi quadrado). Em todos os outros grupos testados, foi notada uma maior taxa de homozigoto A-rs497714 entre os pacientes com Sarcoma de Ewing, independentemente dos outros arranjos e / ou combinações de SNP e haplótipos. Além disso, foram realizados testes de desequilíbrio de transmissão, comparando dados de pacientes portadores de Sarcoma de Ewing e de suas famílias (pais e irmãos), mas nenhum resultado estatisticamente significativo foi encontrado. Em conclusão, o presente estudo fornece evidências estatisticamente fundada de que o genótipo AA-rs497714 FLI1 pode associado ao sarcoma de Ewing. E que este polimorfismo pode ser clinicamente útil como um potencial marcador genético para o prognóstico de risco para desenvolver este câncer ou para fornecer insights no contexto de quebras cromossômicas de tumorigênese no gene FLI1.

Made available in DSpace on 2013-08-07T18:41:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000437673-Texto+Completo-0.pdf: 92662 bytes, checksum: 2b30c84319d430865447f76a9dfff88b (MD5) Previous issue date: 2011 / Forensic genetics has developed in recent years due to its recognized importance in helping to solve a wide variety of criminal cases. This recognition has led to an increase in demand and hence the need to achieve results on samples that previously were not worked (due to the high degree of degradation) or inconclusive reports generated. The development of new methods of analysis and search for new genetic markers for forensic use is constant, and the biallelic markers of have shown great capacity for individualization and identification of a sample. We studied the frequencies of 47 autosomal and 13 X-chromosome insertiondeletion polymorphism (InDel) markers in a sample of 90 individuals in the population of Rio Grande do Sul state, to evaluate its applicability in forensic cases. Haplotype (DH) and haploid genetic (h) diversity, and information index (I) for X-chromosome markers, and observed heterozygosity (Ho), power of discrimination (PD), power of exclusion (PE) matching probability (MP), typical paternity index (TPI) and polymorphism information content (PIC) for autosomal markers, were calculated. For the 47 autosomes indels studied, the combined power of discrimination and the combined power of exclusion were 99. 999999999999998956% and 99. 64%, respectively. We did not observe a significant substructure in the population studied, and the global estimated admixture components for the sample were 72. 35%, 18. 10%, and 9. 54% for European, Native American, and African DNA. / A genética forense tem se desenvolvido muito nos últimos anos devido à sua reconhecida importância no auxílio para resolver os mais diversos casos criminais. Este reconhecimento levou a um aumento na demanda e, consequentemente, na necessidade de se obter resultados em amostras que anteriormente nem eram trabalhadas (devido ao alto grau de degradação) ou geravam laudos inconclusivos. O desenvolvimento de novas metodologias de análise e busca de novos marcadores genéticos para o uso forense é constante, e os marcadores bialélicos têm mostrado grande capacidade de individualização e identificação de uma amostra. Neste estudo foram analisadas as frequências de 47 marcadores autossômicos e 13 marcadores do cromossomo X de polimorfismos bialélicos do tipo inserção-deleção (Indel) em uma amostra de 90 indivíduos da população do Rio Grande do Sul, para avaliar sua aplicabilidade em casos forenses. Diversidade genética haplotípica (DH) e haplóide (h), e informações de índice (I) para marcadores do cromossomo X, e heterozigosidade observada (Ho), poder de discriminação (PD), poder de exclusão (PE), probabilidade de correspondência (MP), índice de paternidade (TPI) e conteúdo de informação de polimórfica (PIC) para os marcadores autossômicos foram calculados. Para os 47 indels autossômicos estudados, o poder combinado de discriminação e o poder combinado de exclusão foram de 99,999999999999998956% e 99,64%, respectivamente. Não foi observada uma subestruturação significativa na população estudada, e os componentes da mistura global estimados para a amostra foram 72,35%, 18,10% e 9,54% de DNA de europeus, nativo-americanos e africanos.

Made available in DSpace on 2013-08-07T18:41:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000401555-Texto+Completo-0.pdf: 2665347 bytes, checksum: 54a1f015b8e051e3e55fe6965ea02f9d (MD5) Previous issue date: 2008 / Introduction: The formation of the fibrin clot in the site of the endothelial lesion constitutes a crucial process for the maintenance of the vascular integrity. However, the mechanisms of the hemostatic system should be regulated, simultaneously, to oppose the excessive loss of blood and to avoid formation of intravascular thrombus, due to excessive formation of fibrin. Therefore, a balance between the coagulation and the fibrinolysis is essential. The tissue plasminogen activator (t-PA) is the main activator of the fibrinolytic system derived from endothelial cells, playing important role in the fibrinolysis. In the last years, the I/D polymorphism (insertion or deletion of an Alu sequence) of the t-PA gene has been studied as a potential risk factor for developing cardiovascular diseases, as myocardial infarction and venous thrombosis, in different populations of the world. Objective: This study investigate the relationship between the insertion/deletion polymorphism of the t-PA gene and venous thrombosis (VT), comparing a group of individuals with episode of pulmonary thromboembolism (PTE) or deep venous thrombosis (DVT) and a group of individuals with no history of VT. Material and methods: Case group was composed of 89 individuals with episode of venous thromboembolism and control group represented 81 individuals with no history of thromboembolic disease. The t-PA genotype was determined by polymerase chain reaction (PCR). All samples identified as DD genotype were retested for confirmation by means of a PCR using an internal primer that recognizes and hybridizes specifically with the inserted sequence, assuring an accurate genotype identification. Results: The frequency of D allele among patients was 41. 6% and controls, 46. 9%; for I allele, frequency was 58. 4% and 53. 1%, respectively. The DD genotype was found in 14. 6% of patients and 17. 3% of controls, and the ID genotype, in 53. 9% of the cases and 59. 3% of the controls. The II homozygote represented 31. 5% individuals in the case group and 23. 4% individuals in the control group. Discussions and Conclusions: No statistically significant difference was observed among genotypes of the t-PA gene in individuals of studied groups. However, the II genotype was more frequent in the case group than in the control group, suggesting a tendency of association between the II genotype of t-PA gene and the development of thromboembolic diseases. As no data was found in the literature on the frequency of the I/D polymorphism of t-PA gene in the Brazilian population, we consider this report as the first study involving the frequency of this polymorphism in groups of individuals with and without thrombosis historical event in Brazil, contributing to the knowledge of the relationship between this polymorphism and VTE in our country. / Introdução: A formação do coágulo de fibrina no sítio de lesão endotelial constitui um processo crucial para a manutenção da integridade vascular. Porém, os mecanismos do sistema hemostático devem ser regulados para, simultaneamente, contrapor-se à perda excessiva de sangue e evitar a formação de trombos intravasculares, decorrentes de formação excessiva de fibrina. Por isso, um equilíbrio entre a coagulação e a fibrinólise é essencial. O ativador do plasminogênio tecidual (t-PA) é o principal ativador do sistema fibrinolítico derivado de células endoteliais, desempenhando importante papel na fibrinólise. Nos últimos anos, tem sido estudada a relação entre o polimorfismo de inserção e deleção (I/D) de uma sequência Alu do gene t-PA e o risco de desenvolver doenças relacionadas ao sistema cardiovascular, como infarto do miocárdio e trombose venosa, em diferentes populações do mundo. Objetivo: Esse estudo tem por objetivo pesquisar a relação entre o polimorfismo de inserção/deleção do gene t-PA e trombose venosa (TV), comparando um grupo de indivíduos com episódio de tromboembolismo pulmonar (TEP) ou trombose venosa profunda (TVP) e um grupo de indivíduos sem história de TV. Materiais e Métodos: Foram avaliados 89 indivíduos com episódio de tromboembolismo venoso (grupo caso) e 81 indivíduos sem histórico de doença tromboembólica (grupo controle). O genótipo do t-PA foi determinado por reação em cadeia da polimerase (PCR). Todas as amostras identificadas como genótipo DD eram confirmadas mediante a realização de uma nova PCR utilizando um primer interno que reconhece e hibridiza especificamente na seqüência de inserção, possibilitando uma identificação precisa dos genótipos. Resultados: A freqüência do alelo D foi de 41,6% entre os pacientes e 46,9% entre os controles; a do alelo I foi 58,4% e 53,1%, respectivamente. O genótipo DD foi encontrado em 14,6% dos pacientes e 17,3% dos controles, e o genótipo ID, em 53,9% dos casos e 59,3% dos controles. Os homozigotos II representaram 31,5% dos indivíduos do grupo caso e 23,4% dos indivíduos do grupo controle. Discussão e Conclusões: Não foi observada diferença estatisticamente significante entre os genótipos do gene t-PA nos grupos de indivíduos estudados. No entanto, o genótipo II foi mais freqüente no grupo caso do que no grupo controle, sugerindo uma tendência de associação entre o genótipo II do gene t-PA e o desenvolvimento de doenças tromboembólicas. Não foram encontrados dados na literatura sobre a freqüência do polimorfismo I/D do gene t-PA na população brasileira. Este relato representa, portanto, o primeiro relato sobre a freqüência deste polimorfismo no Brasil, em grupos de indivíduos com e sem histórico de trombose, contribuindo para o conhecimento da relação entre este polimorfismo e tromboembolismo venoso (TEV).

Made available in DSpace on 2013-08-07T18:41:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000409998-Texto+Completo-0.pdf: 638895 bytes, checksum: 9abf7327c0b1c2233d7c0064062f2d9a (MD5) Previous issue date: 2009 / Tumor necrosis factor (TNF)-a is a multifunctional proinflammatory cytokine secreted predominantly by monocytes/macrophages that has effects on lipid metabolism, coagulation, insulin resistance, and endothelial function. A SNP at position -308 (relative to the transcription start site), believed to alter TNF-a gene transcription, has been associated with enhanced TNF-a production and negative outcome in some severe infections. Our aim is to investigate the frequency of the - 308A allele in critical ill patients to determine whether the allele is associated with the occurrence of sepsis, septic shock and organ dysfunction. Clinical and demographic data (i. e. age, gender, length of ICU and hospital stay, mortality, SOFA and APACHE II scores) and genotyping results for the TNF-a -308G>A SNP were utilized in the analyses. Four hundred and thirty seven critically ill patients admitted to the Intensive Care Unit of the Sao Lucas Hospital – PUCRS (Porto Alegre, Brazil) were investigated. The general genotypic frequencies in our sample were -308GG=0. 71 (n=312); -308AG=0. 28 (n=120); -308AA=0. 01 (n=5) and the allelic frequencies were - 308G=0. 85; -308A=0. 15. The allelic and genotypic frequencies did not differ from the values expected by the Hardy-Weinberg model (P=0. 211). We analyzed the -308G>A TNF-a SNP effect in whole patients group (n=437); in patients with sepsis (n=297; 68%); and in septic shock patients (n=212; 48%). No associations were found between -308GG patients (n=312, 71%) and -308GA+AA patients (n=125; 29%) and sepsis, septic shock, and mortality rates. We also investigate if -308G>A TNF-a genotypes could be affecting organ dysfunction or failure, but no statistical associations were found. Our results suggest that -308G>A TNF-a SNP does not play a major role in the outcome to sepsis, septic shock, higher organ dysfunction or mortality in critically ill patients. / O Fator de Necrose Tumoral (TNF)-a é uma citocina proinflamatória multifuncional, com efeitos no metabolismo de lipídeos, na coagulação sanguínea e na função endotelial. Diferentes estudos sugerem que pacientes com o genótipo - 308AA, do SNP -308G>A do gene TNF-a, possuiriam níveis mais elevados de TNFa no plasma, levando o sistema imune a uma resposta inapropriada e aberrante frente a uma infecção, o que poderia aumentar o risco de sepse, choque séptico ou disfunção orgânica. O objetivo deste estudo foi comparar as condições clínicas (disfunções orgânicas) e a freqüência de sepse, choque séptico e mortalidade em pacientes críticos internados em uma Unidade de Terapia Intensiva (UTI), quanto à pacientes com e sem o alelo -308A do TNF-a. Foram utilizados dados clínicos e demográficos (idade, gênero, tempo de internação, mortalidade durante a permanência total no hospital, escores APACHE II e SOFA), e genotipagem dos pacientes para o SNP -308G>A do TNF-a por PCR-RFLP. Um total de 437 pacientes críticos internados na UTI do Hospital São Lucas da PUCRS (Porto Alegre, Brasil) foram avaliados. As freqüências genotípicas -308GG= 0. 71 (n=312); -308GA=0. 28 (n=120); -308AA=0. 01 (n=5); e alélicas -308G=0. 85 e -308A=0. 15 não diferiram dos valores esperados pelo modelo de Equilíbrio de Hardy-Weinberg (P=0. 211). Do total, 297 (68%) pacientes desenvolveram sepse e 212 (48%) choque séptico. Nenhuma diferença significativa foi encontrada entre pacientes -308GG (n=312; 71%) e - 308GA+AA (n=125; 29%) quanto à suscetibilidade a sepse, choque séptico, falência orgânica ou mortalidade. Os resultados mostram que SNP -308G>A do TNF-a não tem efeito sobre as condições clínicas e na susceptibilidade à sepse e choque séptico ou na mortalidade dos pacientes em estado crítico de saúde.

Staphylococcus aureus é reconhecidamente causador de infecções humanas e um dos principais patógenos alimentares. O regulador gene acessório (Agr) é um sistema central que controla a expressão de diversos fatores de virulência. O polimorfismo do locus agr divide S.aureus em grupos genéticos distintos associados a determinados perfis patogênicos. O objetivo deste estudo foi comparar fenotipicamente e genotipicamente isolados clínicos e alimentares de S.aureus. Um total de 63 S.aureus (34 isolados de cateter venoso central (CVC) e 29 de carne de frango) foram selecionados para o estudo. O gene sea foi encontrado em 44,1% (15/34), seb em 5,9% (2/34) e sec em 8,8% (3/34) dos isolados de CVC. Em isolados de frango, apenas o gene sea foi detectado e foi observado em 31% (9/29). Somente 6% (2/34) dos isolados de CVC formaram biofilme. Já, em isolados de frango, 93% (27/29) foram formadores de biofilme (P<0,01). Nos isolados de CVC, os genes icaA, atlA e sasG envolvidos com a formação de biofilme estiveram presentes em 100% (34/34), 97% (33/34) e 100% (34/34), das amostras respectivamente, enquanto que, em isolados de carne de frango os mesmos genes foram detectados em 93% (27/29), 52% (15/29) e 100% (29/29), respectivamente. Cepas resistentes à penicilina foram detectas em 86,2% dos isolados de carne de frangos e em 88,2%, dos isolados de CVC. Isolados de CVC foram resistentes a oxacilina e multirresistentes em 17,6% (6/34). Com relação ao polimorfismo do locus agr, os S.aureus isolados de CVC foram dividos em 3 grupos, onde 44% (15/34) tiveram o polimorfismo I, 38% (13/34) o II e 18% (6/34) o III. Os S.aureus isolados de carne de frangos, também foram divididos em 3 grupos, onde 86% (25/29) dos isolados tiveram o polimorfismo I, 10% (3/29) o II e 4%o III (1/29) (P<0,05). Entre os isolados de CVC, 88,2% (30/34) produziram a δ-hemolisina, ou seja, expressavam o sistema Agr, já entre os isolados de frangos, apenas 3,3% eram δ-hemoliticos (P<0,05). Conclui-se que os isolados diferiram quanto à capacidade de formação de biofilme, polimorfismo Agr e produção da δ-hemolisina. No entanto, resultados similares foram observados quanto à detecção dos genes das enterotoxinas e os envolvidos com formação de biofilme. A análise molecular mostrou uma elevada similaridade entre os grupos o que pode indicar uma mesma origem destes isolados. / Staphylococcus aureus is recognized as cause of human infections and a one of the important foodborne pathogens. The accessory gene regulator (Agr) is a central system that controls the expression of several virulence factors. The polymorphism of the agr locus divided S. aureus into distinct genetic group associated with determinats of pathogenic profiles. The aim of this study was to the phenotypic and genotypic patterns of S.aureus isolated from clinical and food samples. A total of 63 S. aureus (34 from central venous catheter (CVC) and 29 from poultry meat) were selected for the study. The sea gene was found in 44.1% (15/34), seb in 5.9% (2/34) and sec in 8.8% (3/34) of CVC isolates. In poultry meat isolates, only sea gene was detected and it was observed in 31% (9/29). Only 6% (2/34) of CVC isolates formed biofilm. Further, 93% (27/29) of poultry meat isolates were biofilm formers (P<0.01). In CVC isolates, the icaA, atlA and sasG genes involved in biofilm formation were present in 100% (34/34), 97% (33/34) and 100% (34/34) of the isolates respectively, while in poultry meat isolates the same genes were detected in 93% (27/29), 52% (15/29) and 100% (29/29), respectively.Strains penicillin resistant was detected in 86.2% of poultry meat and 88.2 % CVC isolates. CVC isolates were also oxacillin resistant and multiresistants in 17.6% (6/34). In regard to the polymorphism of agr locus, the CVC isolates were divided into 3 groups, where 44% (15/34) belong to polymorphism I, 38% (13/34) to II and 18% (6/34) to III. The S. aureus strains isolated from poutry meat were also divided into 3 groups, where 86% (25/29) showed the polymorphism I, 10% (3/29) the II and 4% (1/29) the III (P<0.05). Among the CVC isolates 88.2% (30/34) produced δ-hemolysin, i.e., expressed the Agr system, in addition among the poultry meat isolates, only 3.3% were δ-hemolytic (P<0.05). In conclusion, S.aures isolated from CVC and poultry meat showed differences in their ability to form biofilm, Agr polymorphism and production of δ-hemolysin. In conclusion, S.aures isolated from CVC and poultry meat showed differences in their ability to form biofilm, Agr polymorphism and production of δ-hemolysin. However, similar results were observed in relation to enterotoxin genes and those involved in biofilm formation.The molecular analysis show high genotypic similarity to S.aures isolated from CVC and poultry meat, suggesting a common origin of these isolates, possible the human microbiota.

Introdução e Objetivos: A maior prevalência de doença celíaca (DC) em indivíduos com diabetes mellitus tipo I (DM1) já é reconhecida. Ambas as doenças tem causa autoimune, em que os genes HLA classe 2 representam o principal fator genético de risco. Porém, existe uma considerável parcela da população que não manifesta tais doenças e são portadores desses genes. Estudo de associação genômica (GWAS) identificaram polimorfismos de susceptibilidade às duas doenças em genes diferentes do sistema HLA, que poderão auxiliar na compreensão da causa e das suas variabilidades clínicas. Os objetivos desse estudo foram avaliar as frequências dos polimorfismos HLA e não HLA em pessoas como DM1 e com DC e relacionar esses dados com a ocorrência de sintomas gastrointestinais, com a idade do diagnóstico da DM1 e com história alimentar. Métodos: Delineamento transversal, com avaliações retrospectivas e prospectivas, em pessoas com DM1 com e sem DC. Foram realizadas entrevista e revisão de prontuário dos pessoas, seguido de coleta de sangue ou saliva. A pesquisa dos genes RGS1, IL2-IL21, BACH2, TLR7/TLR8 e IL18RAP foi realizada por PCR Real-Time. Os alelos DQA1* 0501 e DQB1* 0201 para DQ2.5 e o alelo DQB1*0302 para DQ8 foram identificados a partir da técnica de genotipagem de HLA Tag-single-nuleotide polymorphism (Tag SNP). Resultados: As frequências alélicas e genotípicas entre 273 pessoas com DM1 sem DC e 39 pessoas com DM1 e DC não apresentaram diferença significativa. A presença de sintoma gastrointestinal foi mais frequente nos portadores dos polimorfismos dos genes RGS1 e IL18RAP. O tempo de aleitamento materno, a idade de introdução do glúten e a idade do diagnóstico da DM1 foram semelhantes entre os grupos. A comparação dos cinco polimorfismos com a combinação dos haplótipos para DQ2.5 e DQ8 não apresentou diferença significativa. Nos 312 indivíduos, com DM1 com e sem DC e nos 66 indivíduos portadores de DC sem DM1 foi identificado alelos DQ2.5 e ou DQ8 em 97% dos casos, enquanto que nos indivíduos com DC sem DM1 identificou-se em 76% dos casos. DQ2.5 foi mais frequente entre pessoascom DC e DQ8 foi mais frequentes entre pessoas com DM1. Conclusões: A presença dos polimorfismos dos genes estudados não modificou a chance do indivíduo com DM1 ter ou não DC. Houve associação dos genes RGS1 e IL18RAP com sintomas gastrointestinais. A pesquisa dos alelos DQ2.5 e DQ8, pela técnica Tag-SNP, permitiu determinar um alto valor preditivo negativo no diagnóstico de DC na população com DM1 e com DC, semelhante ao descrito na literatura com a técnica convencional. / Introduction and Objectives: The higher prevalence of celiac disease (CD) in individuals with diabetes mellitus type I (T1D) is already recognized. Both diseases have autoimmune cause, where HLA genes class 2 represent the major genetic risk factor. However, there is a considerable portion of the population that does not manifest such diseases and are carriers of these genes. Genome-wide association studies (GWAS) have identified susceptibility polymorphisms to both diseases in different genes of the HLA system that may assist in understanding the etiology and in its clinical variabilities. The objectives of this study were to evaluate the frequencies of HLA and non-HLA polymorphisms in patients with T1D and CD, related to the occurrence of gastrointestinal symptoms, the age of diagnosis of T1D and food history. Methods: Mixed design with retrospective and prospective evaluations in patients with T1D with and without DC. They were conducted interview and review of medical records of patients, followed by collecting blood or saliva. The search for genes RGS1, IL21-IL2, BACH2, TLR7 / TLR8 and IL18RAP was performed by Real-Time PCR. The alleles DQA1 * 0501 and DQB1 * 0201 for DQ2.5 and DQB1 * 0302 for DQ8 were identified from the Tag-single-nucleotide polymorphism (tag SNP) genotyping HLA technique Results: The allelic and genotypic frequencies between 273 T1D patients without CD and 39 patients with T1D and CD showed no significant difference. The presence of gastrointestinal symptoms were more frequent in patients with polymorphisms of genes RGS1 and IL18RAP. The duration of breastfeeding, the age of introduction of gluten and the age of diagnosis of T1D were similar between the groups. The comparison of the five polymorphisms with the combination of haplotypes for DQ2.5 and DQ8 showed no significant difference. In 312 individuals with DM1 with and without CD and 66 individuals with CD without T1D was identified alleles DQ2.5 and/or DQ8 in 97% of cases, whereas in individuals with CD without T1D was identified in 76% of cases . DQ2.5 was more frequent among patients with CD and DQ8 was more frequent among patients with T1D Conclusions: The presence of polymorphisms of genes studied did not modify the chance of T1D whether or not DC. There was an association of RGS1 and IL18RAP genes with gastrointestinal symptoms. The survey of DQ2.5 and DQ8 alleles by Tag-SNP technique allowed determining a high negative predictive value in the diagnosis of CD in the population of patients with T1D and DC, similar to that described in the literature with the conventional technique.