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Controle associado de Heterotermes tenuis (Hagen, 1858) (Isoptera: Rhinotermitidae) com iscas atrativas, em cana-de-açúcar / not available

Macedo, Daniella 01 February 2001 (has links)
Os objetivos deste trabalho foram a determinação da área de forrageamento, densidade populacional, distribuição espacial de colônias e número mínimo de iscas para determinação de população de Heterotermes tenuis em área de cana-de-açúcar como base para o controle associado com iscas atrativas. O forrageamento foi estudado em áreas de 10.000 m2 de cana-de-açúcar de terceiro corte, variedade RB-806043, no município de Rio Claro-SP, em três colônias da mesma área, utilizando a técnica de captura, com as iscas Termitrap®, seguida de marcação de operários, soldados e formas jovens, por meio de alimento colorido com azul de metileno a 0,25%, liberação e recaptura. A densidade populacional, a distribuição espacial e o número mínimo de iscas foram estudadas de 1995 à 1999, em áreas comerciais, nos municípios de Olímpia-SP e Rio Claro-SP, com avaliações utilizando-se 400 iscas, também do tipo Termitrap®, distribuídas em espaçamento de 5x5m em áreas de 1 hectare. Por deduções matemáticas chegou-se que a área efetiva de forrageamento, média das três colônias, por um período de três meses, é de 66,67m2, e que a área potencial de forrageamento é estimada em 334,8m2. A distribuição espacial da população foi determinada como sendo do tipo agregada. A densidade populacional variou de 0,08 à 0,55/ha nos diferentes anos e locais do estudo e o número mínimo de iscas a ser utilizado por hectare para o monitoramento e/ou controle é de 20 / not available
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Flutuação populacional e fatores climáticos afetando a distribuição de machos de Ceratitis capitata (wied., 1824) (Diptera: Tephritidae) em pomares de citros / Population dinamics and climatic factors affecting the Ceratitis capitate (WIED., 1824) (Diptera: Tephritidae) male distributions on citric orchards

Ferraudo, Antonio Sérgio 00 December 1900 (has links)
Procurou-se determinar um modelo matemático que possa representar, pelo menos aproximadamente, a evolução da mosca-do-mediterrâneo, Ceratitis capitata (Wied., 1824) (Diptera: Tephritidae) em dois pomares situados no município de São Pedro (SP). Os dados, número de machos coletados, foram obtidos de experimentos realizados durante quatro anos (janeiro de 1980 a dezembro de 1983). Em cada um dos pomares distribuíram-se armadilhas que coletaram os insetos machos da mosca e, com os dados obtidos, estudaram-se regressões harmônicas para cada variedade e ano, de acordo com metodologia descrita por BLISS (1970), com as respectivas análises de variância. Com exceção da variedade Pêra, que no primeiro ano apresentou resultados não signficativos, as análises mostraram que nos dois primeiros anos, onde a densidade populacional da praga foi alta, todas as regressões harmônicas foram significativas, sendo que quatro resultaram em ajuste ao modelo do primeiro grau, duas do segundo, sete o terceiro e quarto grau. Nos dois anos finais a praga praticamente desapareceu dos pomares apresentando baixa densidade populacional, o que resultou em análises com resultados não significativos. Foi realizado também um estudo da relação variância/média, como uma medida de aproximação à distribuição espacial da praga, assim como as possíveis correlações de dados climáticos, para verificar possíveis interferências na evolução da praga / In the present work it was looked for determining a mathematical model to represent, at least nearly, the mediterranean fly Ceratitis capitata (Wied., 1984) (Diaptera: Tephritidae) in two citric orchards in São Pedro (SP). The experiment data, the number of males, were obtained in experiments during four years from january 1980 to december 1983. Some traps were installed in each orchard to catch the mediterranean fly males. After counting the number of males in the traps the harmonic regression for each year and variety was studied according to the methodology described by BLISS (1970), with the respective variance analysis. Excluding the variety Pêra, witch in the first year presented no significant results, the analysis showed that in the two first years, where the populational density was high, all the harmonic regressions were significant. Four among them fitted to the first grade model, two to the fourth grade. In the two last years the pest was gone form the orchards, the populational density was low and the regression analysis was not significant. It was also realized a study of the mean/variance relationship as a measure of the approximation of the spatial distribution of the pest, as well as the possible correlations of climatic data for verifying the possible interferences in the pest evolution
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Mudanças na atividade física de moradores de São Paulo entre 2003 e 2008 / Epidemiological changes in physical activity of Brazilian adults over a period of five years

Tebar, William Rodrigues 16 October 2014 (has links)
A associação da atividade física a condições de saúde e qualidade de vida, tem sido um alerta para mudanças dos hábitos de vida da população. Nas últimas décadas foram intensificadas políticas e programas para estimular um comportamento fisicamente mais ativo. Para descrever mudanças no padrão de atividade física da população adulta do município de São Paulo, este estudo transversal de base populacional foi composto por dados provenientes de Inquérito domiciliar realizado no município de São Paulo nos anos de 2003 e 2008. Foram analisadas as prevalências de indivíduos fisicamente ativos segundo os domínios da atividade física na população adulta de 20 a 59 anos, bem como sua relação com fatores socioeconômicos e demográficos. Foi observado aumento da prevalência de indivíduos fisicamente ativos no período estudado, segundo sexo, situação conjugal, faixa etária, escolaridade e renda, bem como segundo os domínios de atividade física. Houve ainda modificações entre os grupos das variáveis independentes, de acordo com o ano do inquérito. / The association of physical activity to health and quality of life, has been an alert to changes in lifestyle of the people. In recent decades policies and programs to encourage a physically active behavior were intensified. To describe changes in physical activity patterns of the adult population in São Paulo, this cross-sectional population-based study comprised data from a household survey conducted in the city of São Paulo in 2003 and 2008. Prevalence of subjects were analyzed physically active according to the domains of physical activity in adults aged 20 to 59 years, as well as its relationship with socioeconomic and demographic factors. Increased prevalence of physically active individuals during the study period was observed according to sex, marital status, age, education and income, as well as according to domains of physical activity. There were also changes between groups of independent variables, according to the survey year.
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Potencial nutricional dos coprodutos das sementes oleaginosas do setor de bioenergia na substituição do farelo de soja e do milho para a segurança alimentar e sustentabilidade da produção de pequenos ruminantes / Nutritional potential of oilseeds co-products from the bioenergy sector in replacing soybean meal towards food security and sustainability of small ruminant production

Costa, Wilian dos Santos da 15 March 2019 (has links)
A população mundial deverá atingir a marca de 9 bilhões de habitantes até a metade do século XXI, trazendo como consequência a elevação da demanda por alimentos. Evitar o uso de culturas para fins que não a alimentação humana, é uma estratégia para elevar a oferta de alimentos. As tortas e farelos gerados como coprodutos apresentam potencial para substituir o milho e a soja, fornecendo uma alternativa favorável à segurança alimentar. Neste sentido, o objetivo do trabalho foi avaliar o potencial nutricional de alguns coprodutos e seus efeitos sobre a fermentação entérica de ruminantes. O primeiro ensaio foi realizado avaliando os farelos de, algodão (ALG), canola (CAN), girassol (GIR), e soja (CON, como tratamento controle), e as tortas de, macaúba (MAC), mamona (MAM), nabo forrageiro (NF), pinhão manso (PM), utilizando a técnica in vitro de produção de gases, assim como 3 dietas utilizando coprodutos, Dieta1 (60% feno de Tifton (FT), 30% GIR e 10% milho desintegrado (MD)), Dieta2 (60 % FT, 18% GIR, 16% MD e 6% ALG) e DietaCON (60% FT, 30% MD e 10% farelo de soja (FS)), para determinar a degradabilidade e a cinética fermentativa. Os tratamentos PM e MAM obtiveram menor performance fermentativa, diferentemente de CAN e NF, com degradabilidade similar a CON, e não foram observadas diferenças para a produção de metano entérico (CH4). A DietaCON foi superior as demais dietas; a Dieta 2 obteve melhor rendimento comparada a Dieta 1 Os resultados foram positivos e demonstraram a possibilidade de substituição do milho e da soja. O segundo ensaio teve por objetivo avaliar a digestibilidade aparente, balanço energético e proteico e emissão de CH4 em dieta utilizando coproduto na substituição a MD e FS. Duas dietas foram elaboradas na proporção 60% volumoso (Tifton 85, Cynodon ssp.) e 40% concentrado. Dieta com concentrado com coproduto (Dieta CPDT: 45% farelo GIR, 40% MD e 15% farelo ALG), e Dieta com concentrado controle (Dieta CON: 70% MD e 30% FS). Foram utilizados 7 carneiros, da raça Santa Inês, machos, com peso vivo (PV) médio de 63 ± 7,6 kg, em 2 períodos experimentais de 21 dias. As dietas (2 % PV) foram fornecidas em dois períodos, o sal mineral somente na refeição da tarde e a água fornecida ad libitum. Os animais ficaram em adaptação às dietas por 13 dias, então transferidos para gaiolas de metabolismo para o ensaio de digestibilidade (5 dias) e em câmara para troca de gases para quantificação do CH4 produzido (3 dias). Não foram encontradas diferenças para o balanço energético e proteico, e todos os parâmetros fermentativos com exceção na produção de acetato, butirato, produção total de ácidos graxos de cadeia curta, e a digestibilidade da matéria seca e orgânica, com a Dieta CON superior em todas as observações. No entanto, as emissões de CH4 não foram significativamente diferentes entre as dietas testadas. A substituição de alimentos tradicionais por coprodutos do biodiesel mostrou-se satisfatória, não sendo observados efeitos negativos sobre os parâmetros fermentativos / World population growth must reach 9 billion inhabitants until the half of XXI century, as consequence food demand is increasing. Avoiding the use of human edible food other than human feed is one of the strategies to increase food supply. Cakes and meals generated as a coproduct of biodiesel production has shown potential as replacement for corn and soybean, presenting a favorable alternative towards food security. In these sense, the aim of this work was to evaluate the nutritional potential of biodiesel coproducts and their effects on enteric fermentation by ruminants. First assay was performed assessing cottonseed (CS), rapeseed (RS), sunflower seed (SF), and soybean (CON, as control treatment) as meal, and macaw palm fruit (MP), castor bean (CB) radish seed (RD) jatropha seed (JS) as cake, all submitted to in vitro gas production technique, as well as 3 diets containing coproduct, Diet1 (60% Tifton hay (TH), 30% SF and 10% disintegrated corn (DC)), Diet2 (60% TH, 18% SF, 16% DC and 6% CS) and DietCON (60% TH, 30% DC and 10% soybean meal (SM)), for determine degradability and fermentative kinetics. JS and CB presented lower fermentative perfomence, differently to RS and RD, whosedegradability was similar to CON, and differences were not observed for enteric methane production (CH4). DietCON was superior to other ones; Diet2 had a better performance compared to Diet1. These were intersting results and showed that\'s possible to replace corn and soybean. The second assay aimed to evaluate apparent digestibility, energy and protein balance, and CH4 production in diets using coproducts as replacement for DC and SM. Two diets were formulated at the proportion 60% roughage (Tifton 85 hay, Cynodon ssp) 40% concentrate. Diet CPDT (45% of SF, 40% of DC and 15% of CS) and Diet CON (70% of DC and 30% of SM). Seven male Santa Ines sheep, with body weight (BW) average of 63 kg ± 7.6, were used in two experimental periods of 21 days. The diets were offered (2% BW) twice a day, mineral salt only in the afternoon and water ad libitum. The animals were kept for adaptation to diet for 13 days, then moved to metabolism cages for apparent digestibility assay (5 days) and then in gases exchange chamber for CH4 production quantification (3 days). No differences were observed for energetic and protein balance, and all fermentative parameters between experimental diets, except acetate, butyrate, total short fatty chain acids production and digestibility of dry and organic matter, when Diet CON showed greater values. However, CH4 emissions were not significant different. The replacement of traditional food by biodiesel coproducts was satisfying, with no negative effects observed upon ruminal fermentative parameters
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Análise morfométrica e variabilidade morfológica em populações de Syngonanthus nitens (Bong.) Ruhland (Eriocaulaceae) / Morfometric analysis and morphological variability in populations of Syngonanthus nitens (Bong.) Ruhland (Eriocaulaceae)

Watanabe, Mauricio Takashi Coutinho 02 October 2009 (has links)
Syngonanthus nitens (Bong.) Ruhland, espécie popularmente conhecida como capim-dourado, possui ampla distribuição no território brasileiro e apresenta um artesanato cujo interesse é voltado para seus escapos, caracteristicamente dourados. A identidade deste táxon é questionada, uma vez que são identificadas, como pertencentes à mesma espécie, plantas com padrões morfológicos muito distintos, tanto entre populações de diferentes partes do país, como entre populações simpátricas do Jalapão. Para investigar esta questão, foram analisados 23 caracteres morfológicos em 16 populações coletadas. As análises visavam avaliar a variabilidade morfológica dos espécimes no Parque Estadual do Jalapão, em Goiás e na Cadeia do Espinhaço. Para as análises morfométricas foram utilizadas técnicas de análise de agrupamento (UPGMA) e de ordenação (PCA e DF). Os resultados obtidos avaliando-se somente as populações coletadas no Jalapão evidenciaram a formação de dois grupos bem distintos, cuja separação foi fortemente influenciada pelo fator tamanho. Nas análises subsequentes, principalmente as que envolveram quase todas as populações coletadas, foram observadas continuidades e sobreposições entre estas, sem formação de grupos evidentes ou com alguma relação com a distribuição geográfica. Os caracteres não-florais mostraram-se mais informativos que os florais embora ambos tenham apresentando boa resolução. Devido aos resultados obtidos, às análises de materiais herborizados e à pesquisa literária específica, foi possível reconhecer para este complexo somente a espécie S. nitens, sem considerações infra-específicas. / Syngonanthus nitens (Bong.) Ruhland (common name \"Golden Grass\") is a widespread distributed species in Brazil. The handcrafts are made from scape of S. nitens, which are bright and gold in color. The identity of this taxon has been questionable, since plants with very different morphological patterns are identified as belonging to the same species. These individuals can occur in different populations, from distant parts of the country, and within sympatric populations, especially in Jalapão. In order to investigate this taxonomic problem, we analyzed 23 morphological characters in 16 populations. The analyses aimed to assess the morphological variability of the specimens in the Jalapão region (Central Brazil), in Goiás state and in the Range of Espinhaço. For morphometric analyses, we used cluster analysis (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean - UPGMA) and ordination (Principal Component Analysis - PCA and Discriminant Function - DF). When only individuals collected in Jalapão were evaluated, the results showed two very different groups, which where separated by size factor. In subsequent analyses, principally those involving almost all populations collected, we observed continuity and overlap between the morphological patterns. We did not identify isolated groups or any obvious correlation with geographical distribution. Although all characters had been informative to classify the individuals in their populations of origin, the non-floral characters were more informative than the flower traits. These results, together with the analyses of herbarium material and the specific literature, allowed to recognize this complex as the only one species, S. nitens, without infra-specific delimitations.
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Deslocamento ao longo da noite e outros aspectos da biologia do opilião Serracutisoma pseudovarium no Parque Estadual Intervales, São Paulo, Brasil / Displacement throughout the night and other aspects of the biology of the harvestman Serracutisoma pseudovarium in the Intervales State Park, São Paulo, Brazil

Ramin, Alessandra Zola 19 November 2014 (has links)
Uma população do opilião Serracutisoma pseudovarium utiliza a Pousada Esquilo do Parque Estadual Intervales (PEI), São Paulo, Brasil, como abrigo. Os animais se escondem em frestas na edificação e saem à noite para forragear, principalmente pelas paredes da construção. Essa situação constituiu uma oportunidade única de se realizar um estudo detalhado de forrageio e uso do espaço por opiliões, sendo este o primeiro objetivo deste trabalho. Além deste local, também foram acompanhados mensalmente, ao longo de 15 meses, outros quatro locais do PEI: Pousada Onça-Pintada, Castelinho, Toca dos Meninos e Gruta Detrás. Em cada um destes locais (com exceção do Castelinho), os animais foram marcados individualmente e foram realizadas medidas corpóreas. Desta forma, foi possível efetuar também um estudo populacional, que constituiu o segundo objetivo deste trabalho. Para analisar o forrageio em detalhes, um croquis da edificação foi elaborado, no qual os animais foram anotados de hora em hora, ao longo de uma noite, em cada um dos meses de coleta. Além do posicionamento do animal, também foram registrados sua marca e o comportamento exibido no momento da observação. Assim, o terceiro objetivo foi realizar um estudo comportamental através de um etograma com dados obtidos em campo, ao longo do ano inteiro. No total, 380 indivíduos foram marcados, sendo 192 na Pousada Esquilo, população foco do estudo. Destes, 71 foram fêmeas, 71 foram machos e 50 foram jovens. O tamanho estimado da população, pelos modelos de Fisher-Ford e Jolly, variou de 36 a 95 indivíduos. A análise dos deslocamentos ao longo do forrageio mostrou que os animais mesclam uma estratégia de emboscada com períodos de deslocamento, em que podem encontrar ativamente uma presa. Não foram encontradas relações entre a frequência de utilização destas estratégias e o sexo, idade ou estado nutritivo/reprodutivo dos animais. Porém, o mesmo indivíduo tendeu a repetir a mesma estratégia em diferentes noites de forrageio. Da mesma forma, a direção do deslocamento tendeu a ser repetida, embora os animais não utilizem trilhas marcadas individualmente ou coletivamente. Etogramas obtidos com dados de campo são raros, e possuem a vantagem de não serem influenciados por fatores como maior densidade de animais e disponibilidade de alimento, comuns em estudos em cativeiro. A comparação de etogramas de machos, fêmeas e jovens não mostrou grandes diferenças de comportamento entre os grupos / A population of the harvestman Serracutisoma pseudovarium uses a building (Pousada Esquilo in the Intervales State Park) as a shelter. The animals hide in crevices of the building during the day and leave at night to forage, walking mainly on the walls of the same building, which is situated inside the forest. This situation appeared to be an unique opportunity to perform a detailed study of foraging dynamics and use of space by harvestmen, which constituted the first objective of this study. In addition to Pousada Esquilo, four other places of the Park were monthly monitored during 15 months, namely: Pousada Onça-Pintada, Castelinho, Toca dos Meninos cave and Detrás cave. In each of these places (except Castelinho) the animals were marked individually and body measurements were taken. This also allowed the conduction of a population study, as the second objective of this study. In order to examine the foraging dynamics in detail, we made a croquis of the building, in which the animals were recorded hourly during one night of each sampling event. In addition to the position of the animal, its individual mark and behavior at the moment of the observation were also recorded. This behavioral study led to the third objective, which was the construction of an ethogram based on the field data collected throughout the year. A total of 380 individuals were marked. In Pousada Esquilo, the target population of the study, 192 animals were marked, being 71 females, 71 males, and 50 juveniles. The size of the population estimated by both Fisher-Ford and Jolly models varied from 36 to 95 individuals. The study of displacement during foraging showed that the animals combine an ambush strategy with periods of walking, when they might actively find a prey. No relation was found between the frequency of usage of each strategy and sex, age or nutritional/reproductive condition of the animals. However, the same individual tended to repeat a strategy in different nights. In a similar way, the direction of the movement tended to be repeated, although the animals did not use individually or collectively marked trails. Ethograms elaborated with field data are rare in the literature, and they have the advantage of not being influenced by factors as higher animal density and food availability, which are common in studies made in captivity. The comparison among ethograms of males, females and juveniles did not show great behavioral differences between the groups
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Dinâmica populacional de Podocnemis erythrocephala, no rio Ayuanã, Amazonas, Brasil.

Bernhard, Rafael 16 March 2010 (has links)
Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-01-22T19:09:28Z No. of bitstreams: 2 Tese_Rafael Bernhard.pdf: 2015983 bytes, checksum: cca64cf4ae6552eae04bafecfb146cd0 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-22T19:09:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese_Rafael Bernhard.pdf: 2015983 bytes, checksum: cca64cf4ae6552eae04bafecfb146cd0 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2010-03-16 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / Podocnemis erythrocephala is a species of turtle that inhabits black water rivers and lakes in the Rio Negro Basin and ventures into clear water habitats as well in the Tapajós and Trombetas rivers, in Brazil, as well as the extreme eastern tip of Colômbia and most of the states within the Venezuelan part of the Amazon Basin. As with all species in the family Podocnemididae their populations have suffered from the collection eggs and adults for human consumption. Even though this species is an important item in the food of the local population of river people where ever P. erythrocephala occurs, there are no studies documenting the natural size of these turtle populations nor monitoring programs. The existing information concerning the decline of natural populations of Podocnemididae are scarce, and not well studied, therefore the monitoring studies are needed for all of the species in this family utilizing methods that can measure the size of adult populations, size structure within populations, and sex ratios. The objective of this study was to characterize aspects of the population dynamics of P. erythrocephala in the Ayuanã River, middle Rio Negro, Amazonas State. The size at reproductive maturity in a population of turtles is important to determine such that the adult sex ratio of the population can be calculated. For this reason it was necessary to study growth and sexual maturity using the gonads, external dimorphic features, gravid females, growth rates of individuals between captures, and the model of von Bertalanffy with Fabens adjustment. The size at sexual maturity in males and females was 161 and 218 mm in straight line maximum carapace length, respectively. Juveniles growth faster than adults and have a negative linear relationship between the growth rate and the carapace length in males and females.Sexual maturity in both males and females was estimated to be nine years, however in the case of males this needs to be examined more extensively. In order to characterize the population structure, sex ratio, and proportion of juveniles in the population, as well as relative abundance of P. erythrocephala in the Ayuanã River, I marked 4.111 individual turtles from 2003 to 2008 in a section of 148.5 km of the Ayuanã River, a small lake in an island in the channel of Rio Negro and the Jurubaxi River. These population parameters differ between the capture methods used. Trammel nets proved to be more efficient than free diving for turtles. The capture index between turtles caught in trammel nets with mesh size of 18 and 21 were greater than for trammel nets with the mesh size of 11 cm. The corrected sex ratio for the population in the Ayuanã River was (0,41♂:1♀). The proportion of juveniles was corrected to be 40% for the population studied. The frequency of recaptures suggests that only a small part of this population was captured during this study. The study concerning movement patterns (defined as the linear distance between the points of capture) of P. erythrocephala indicates that this species disperses along the entire Ayuanã River, without having a small fixed area of use. The linear distance moved by females was greater than that observed for males. The longest linear distances moved were greater than 27.000 m, including the movements between Ayuanã River and a lake in the middle of the Rio Negro or to the next river entering the Rio Negro, Jurubaxi River. / A espécie Podocnemis erythrocephala habita rios e lagos de água preta e clara, distribuindo-se pelas bacias do Rio Negro, Tapajós e Trombetas, no Brasil, e ainda no extremo oriental da Colômbia e na maioria dos estados amazônicos da Venezuela. Como acontece com todas as espécies da família Podocnemididae, em maior ou menor intensidade, suas populações naturais têm sofrido com coleta de ovos e de indivíduos adultos para o consumo humano. Apesar de sua importância como fonte de alimento para as populações humanas onde quer que P. erythrocephala ocorra, não existem estudos sobre o tamanho de suas populações naturais nem programas de monitoramento. As informações existentes sobre o declínio das populações naturais de Podocnemididae ainda são raras, mas as espécies desta família precisam ser monitoradas utilizando-se métodos que mensurem o tamanho de populações adultas, a estrutura populacional de tamanhos e a razão sexual. O objetivo deste estudo foi caracterizar aspectos da dinâmica populacional de P. erythrocephala no rio Ayuanã, médio Rio Negro, estado do Amazonas. O tamanho de maturidade sexual é importante para a determinação correta da razão sexual de uma população de quelônios. Foi realizado então um estudo de crescimento e maturidade sexual utilizando análise de gônadas, dimorfismo sexual externo, fêmeas grávidas, crescimento entre as recapturas e o modelo de von Bertalanffy ajustado por Fabens. O tamanho de maturidade sexual para machos e fêmeas foi 161 e 218 mm de comprimento máximo retilíneo da carapaça, respectivamente. Juvenis crescem mais rapidamente que indivíduos adultos e existe uma relação linear negativa entre a taxa de crescimento e o tamanho da carapaça de machos e fêmeas. A idade estimada para a maturidade sexual de machos e fêmeas foi de nove anos, mas no caso dos machos este número deve ser visto com cautela. Para caracterizar a estrutura populacional, razão sexual e proporção de juvenis, bem com analisar a abundância relativa de P. erythrocephala no rio Ayuanã foram marcados 4.111 indivíduos desde 2003 a 2008 em um trecho de 148,5 km do rio Ayuanã, em uma ilha na calha do Rio Negro e no rio Jurubaxi. Estes parâmetros populacionais diferiram entre os métodos de captura utilizados. As trammel nets foram mais eficientes do que o mergulho. O índice de captura utilizando trammel nets com malhas com distâncias entre nós de 18 e 21 cm foi maior do que com trammel nets com malhas medindo 11 cm de distância entre nós. A razão sexual corrigida para a população do rio Ayuanã foi de (0,41♂:1♀). A proporção de juvenis corrigida foi de 40% na população estudada. A taxa de recaptura sugere que apenas uma pequena parcela da população tenha sido capturada durante o estudo. O estudo sobre o padrão de movimentação (aqui definido como a distância linear entre os pontos de captura) de P. erythrocephala indica que esta espécie dispersa- se ao longo de todo o rio Ayuanã sem possuir uma área fixa de vida. A distância linear percorrida pelas fêmeas foi maior do que a percorrida pelos machos. Foram observados movimentos com distâncias lineares maiores do que 27.000 m, inclusive do rio Ayuanã até um lago em uma ilha no meio do Rio Negro ou até o rio Jurubaxi, vizinho ao Ayuanã.
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Estrutura populacional intraespecífica e diversidade genética de Osteocephalus taurinus (Anura: Hylidae) no interflúvio Purus-Madeira, Amazônia Central

Yépez, Diego Armando Ortiz 23 May 2016 (has links)
Submitted by Inácio de Oliveira Lima Neto (inacio.neto@inpa.gov.br) on 2016-08-29T15:32:02Z No. of bitstreams: 2 Diego Armando Ortiz Yépez.pdf: 19833664 bytes, checksum: 980ab522bd39c3c2a7172f0bdf3013b1 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Inácio de Oliveira Lima Neto (inacio.neto@inpa.gov.br) on 2016-08-31T12:53:11Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Diego Armando Ortiz Yépez.pdf: 19833664 bytes, checksum: 980ab522bd39c3c2a7172f0bdf3013b1 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Inácio de Oliveira Lima Neto (inacio.neto@inpa.gov.br) on 2016-08-31T12:56:53Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Diego Armando Ortiz Yépez.pdf: 19833664 bytes, checksum: 980ab522bd39c3c2a7172f0bdf3013b1 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-31T12:58:23Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Diego Armando Ortiz Yépez.pdf: 19833664 bytes, checksum: 980ab522bd39c3c2a7172f0bdf3013b1 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-05-23 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / The Amazon rainforest is the most biodiverse biome in the world, where amphibians are one of the biological groups with the highest levels of cryptic diversity reported across taxa. Despite noticeable efforts, processes driving differentiation among populations and speciation remains largely unknown in this biome, especially based on dense sampling over refined scales. We studied the population structure and genetic diversity of the Manaus slender ledged tree frog, Osteocephalus taurinus, along a geographic gradient of approximately 900 km. Using molecular markers including mitochondrial and nuclear genes, and microsatellites, we estimate the phylogenetic relationships, population structure, and patterns of intraspecific genetic variation and geographic differentiation through the study area. Our data recovered six genetic groups: two corresponding to O. taurinus and O. oophagus from its type locality, Reserva Ducke, at northern of Amazonas River. The third group corresponds to an O. taurinus population isolated at right bank of upper Madeira River. However, evidence for restricted gene flow was detected along the upper Madeira River. Within Purus-Madeira interfluve, the remaining three O. taurinus populations replace each other latitudinally along geographical and environmental gradients, with two contact zones identified. One contact zone is concordant between mitochondrial and nuclear DNA and corresponds to an ecotone region between closed- open rainforests. Following the riverine barrier hypothesis, natural selection by means of genetic drift is expected to cause differentiation among populations by large Amazonian rivers as vicariant barriers. Within continuous forested regions, abrupt transitions on gene frequencies are suggestive of narrow contact or tension zones. In those areas, selection is expected to be favored by local adaptation to different environmental conditions, given selection against dispersing migrants from immediate but environmentally distinct regions and against hybrids. / A Amazônia é o bioma mais biodiverso da terra, e os anfíbios são um dos grupos com as maiores taxas de diversidade críptica registradas nessa região. No entanto, os mecanismos causantes de diferenciação entre populações e especiação mantem-se pouco conhecidos nesse bioma, especialmente com base em amostragens densas em escalas refinadas. Estudei a estrutura populacional e diversidade genética da rã hylídea Osteocephalus taurinus, ao longo de um gradiente geográfico de aproximadamente 900 km na Amazônia central, Brasil. Usando marcadores moleculares que incluíram DNA mitocondrial, nuclear e microssatélites, estudei as relações filogenéticas, estrutura populacional, e padrões de variação genética intraespecífica e diferenciação geográfica na área de estudo. Seis grupos genéticos foram recuperados pelas análises: dois correspondem ao O. taurinus e O. oophagus de sua localidade tipo, Reserva Ducke, ao norte do Rio Amazonas. O terceiro grupo corresponde a uma população de O. taurinus isolada na margem direita do Rio Madeira superior. No entanto, evidência de fluxo gênico restrito foi detectada no Rio Madeira superior. Dentro do interflúvio Purus-Madeira, as três populações de O. taurinus substituíram-se ao longo de gradientes geográficos e ambientais, com duas zonas de contato identificadas. Uma zona de contato é concordante entre o DNA mitocondrial e nuclear, e corresponde a uma região no ecótono entre as florestas fechadas e abertas. Segundo a hipótese de barreiras riverinas, espera-se que seleção natural causada por deriva gênica cause diferenciação entre populações separadas por grandes rios Amazônicos como barreiras vicariantes. Dentro de regiões contínuas de floresta, transições abruptas nas frequências gênicas sugerem zonas estreitas de contato ou tensão ecológica. Nessas áreas, espera-se que seleção seja favorecida por adaptação local às diferentes condições ambientais, por meio de seleção contra migrantes de outras regiões imediatas, mas ambientalmente distintas, e contra híbridos.
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Development and applications of high-throughput SNP genotyping technologies in non-model plant genomes

Silva Junior, Orzenil Bonfim da 11 July 2017 (has links)
Submitted by Sara Ribeiro (sara.ribeiro@ucb.br) on 2017-09-08T18:11:30Z No. of bitstreams: 1 OrzenilBonfimdaSilvaJuniorTeseParcial2017.pdf: 781918 bytes, checksum: 8eef627ca550957f6bfa1f46e54c687c (MD5) / Approved for entry into archive by Sara Ribeiro (sara.ribeiro@ucb.br) on 2017-09-08T18:11:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 OrzenilBonfimdaSilvaJuniorTeseParcial2017.pdf: 781918 bytes, checksum: 8eef627ca550957f6bfa1f46e54c687c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-08T18:11:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 OrzenilBonfimdaSilvaJuniorTeseParcial2017.pdf: 781918 bytes, checksum: 8eef627ca550957f6bfa1f46e54c687c (MD5) Previous issue date: 2017-07-11 / In the last twenty-five years, we have witnessed the wide adoption of DNA markers for the study of genetic variation in many organisms. A DNA marker must have two or more identifiable allelic DNA sequences to be useful. It usually does not have a biological effect, but instead functions as a traceable landmark in the genome, found in a specific location, and transmitted by the standard laws of inheritance from one generation to the next. Its application goes beyond genetic mapping and includes the analysis of genetic diversity, marker-trait association studies, marker assisted selection and, more recently, with the advent of wholegenome sequencing, whole-genome association and genomic selection. Among the several types of DNA sequence polymorphisms that can be used as DNA marker, Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) are the most powerful for large-scale variation analysis. There are vast numbers of SNPs in every genome and they can be typed by methods that have been proven easy to automate. Detection of alternative alleles is rapid and effortless because it is based on well-known polymerase chain reaction and DNA oligomer hybridization assays. Various strategies have been devised to discriminate alleles at a SNP, including fixed DNA arrays technologies, solution hybridization techniques and many sequencing-based genotyping. In our study, we have developed high-throughput DNA marker systems for non-model, highly heterozygous, diploid tree species. We took advantage of the combined power of Next Generation Sequencing (NGS) technologies, well-established highly automated methods of SNP typing and bioinformatics algorithms to perform genome-wide DNA variation analysis. We used whole genome resequencing of pooled individuals to develop a high-density 60K SNP chip for Eucalyptus species (EucHIP60k) providing a 96% genome-wide coverage with 1 SNP/12???20 kbp, and 47,069 SNPs at ??? 10 kb from 30,444 of the 33,917 genes in the Eucalyptus genome. We then used high-density SNP data and whole-genome pooled resequencing to examine the landscape of population recombination (??) and theta (??), assess the extent of linkage disequilibrium (r2) and build the highest density linkage maps for Eucalyptus to date. Chromosome-wide ancestral recombination graphs allowed us to date the split of Eucalytpus grandis (1.7???4.8 million yr. ago) and identify a scenario for the recent demographic history of the species. In a final set of studies, we built the first genome assembly for a Neotropical forest tree, the Pink Ip?? (Handroanthus impetiginosus), a highly-valued keystone timber species. Genome sequence was screened for the development of a targeted-capture sequencing system for SNP genotyping consisting of nearly 24,000 probe sequences. This genotyping system showed flexibility as it allowed the identification of SNPs across different populations of the species in moderate sample sizes. The good genome coverage, consistent Ts/Tv ratio estimated across samples and fair technical reproducibility between replicates, in terms of recall and precision of the SNP calling and accuracy on genotypes, indicate that this genotyping platform can be confidently used to estimate population genetics parameters and carry out population genomics investigations at the genome-wide scale / ***
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Estrutura temporal da assembl?ia de ciliados peritr?quios (Ciliophora, Peritrichia) em lago subtropical no sul do Brasil

Safi, L?cia de Souza Lima 27 February 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 439112.pdf: 538880 bytes, checksum: 671e168d7e9a8ca0457a6099c1cea1de (MD5) Previous issue date: 2012-02-27 / Successional processes present complex relationships between abiotic and biotic factors. These processes influence the structure and functioning of the community, as well as the ecosystem. The Subclass Peritrichia is one of the largest groups in the Phylum Ciliophora. They can occupy various types of water bodies. However, despite their great diversity and common occurrence, they are poorly studied. In the present work we performed a one year survey of peritrich ciliates colonizing glass slides in the Lake Guaiba located in southern Brazil. We analyzed the population dynamics of the species composing the community, and correlated it with environmental factors. A total of 35 morphospecies of Peritrichia were found, of which at least six are undescribed. Results showed that the group presents high diversity and a complex successional organization, with different responses to environmental factors and days of exposure of the traps. / Processos de sucess?o apresentam rela??es complexas entre fatores abi?ticos e bi?ticos. Esses processos influenciam a estrutura e funcionamento da comunidade, bem como do ecossistema inteiro. Ciliados da subclasse Peritrichia constituem um dos grupos com o maior n?mero de esp?cies. Peritr?quios podem ocupar v?rios tipos de corpos d'?gua. No entanto, mesmo com grande diversidade e sendo de ocorr?ncia comum, s?o pouco estudados. No presente trabalho, foi realizado um estudo de um ano com os ciliados peritr?quios colonizando l?minas de vidro em um ponto de amostragem no Lago Gua?ba, localizado no estado do Rio Grande do Sul, sul do Brasil. Neste per?odo, foi analisada a din?mica populacional das comunidades de peritr?quios, correlacionando-a com fatores ambientais. Um total de 35 morfoesp?cies, al?m de pelo menos 6 novas esp?cies foram encontradas. Os resultados mostram que o grupo possui complexa organiza??o sucessional, com diferentes respostas a fatores ambientais e tempo de exposi??o das armadilhas.

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