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Variabilidade genética em genes do complexo principal de histocompatibilidade (DRB e DQA) em populações de Ctenomys flamarioni (Rodentia - Ctenomyidae), implicações em conservação

Fornel, Tatiane Noviski January 2013 (has links)
Ctenomys flamarioni é um roedor subterrâneo endêmico do litoral do Estado do Rio Grande do Sul - Brasil. Devido à sua distribuição restrita ao ambiente costeiro, que está em constante mudança, e à fragmentação e destruição do habitat, devido à ação humana, essa espécie está nas listas de fauna ameaçadas de extinção. Estudos anteriores, com marcadores microssatélites e DNA mitocondrial, identificaram a baixa variabilidade genética na espécie, por outro lado, o estudo de loci que se esperam estar sob seleção seria uma ferramenta importante para identificar a relação dos indivíduos com o ambiente e os processos que moldaram a variabilidade genética da espécie ao longo da história. O Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC) é composto por um grupo de genes estreitamente ligados que constituem o componente genético mais importante do sistema imunológico dos mamíferos. Dois principais mecanismos têm sido descritos como responsáveis pela manuntenção da diversidade do MHC e estão relacionados com o combate de parasitas e com mecanismos reprodutivos, que evitam o endocruzamento. Nesse estudo investigamos a variabilidade genética dos loci DRB e DQA do MHC e comparamos os índices de diversidades com os valores encontrados em estudos com outros ctenomídeos e com os encontrados para loci neutros da mesma espécie. A diversidade genética para o locus DRB de C. flamarioni foi menor do que a encontrada em estudos para o mesmo locus em outras espécies do gênero e também foi menor do que a encontrada em estudos para a mesma espécie, com marcadores neutros, inclusive para populações que passaram por reduções recentes (gargalos-de-garrafa). Os resultados indicam que a seleção balanceadora não foi suficiente para manter a diversidade genética nas populações estudadas e que as reduções populacionais, identificadas através dos loci neutros, devem ter sido bastante drásticas, por afetarem também a diversidade de um locus conhecidamente bastante variável (DRB de MHC). Não pudemos avaliar a diversidade do locus DQA devido a alta incidência de sequências muito divergentes encontradas, possivelmente pseudogenes. O estado de conservação de Ctenomys flamarioni é considerado crítico, por todos os fatores que afetam a espécie, como a instabilidade do ambiente em que ocorrem, a fragmentação e destruição do habitat pela ação humana e pela sua baixa diversidade genética, especialmente em um locus importante do sistema imunológico. A perda da diversidade no locus de MHC poderia estar relacionada à diminuição do número de indivíduos por população, que aumenta o risco de endogamia, que por sua vez pode levar à perda da aptidão reprodutiva, expressão de alelos recessivos deletérios e perda da flexibilidade adaptativa. Além disso, a perda da diversidade em um locus importante para a defesa do organismo contra parasitas aumenta a suscetibilidade dos indivíduos a doenças, e todos esses fatores elevam o risco de extinções locais, colocando em perigo o futuro da espécie. / Ctenomys flamarioni is a subterranean rodent, endemic to the coastline of the state of Rio Grande do Sul, Brazil. Due to its strict distribution to the coastal environment, which is constantly changing, and to habitat fragmentation and destruction caused by human actions, this species appears in lists of threatened fauna. Previous studies, using microsatellite markers and mitochondrial DNA, identified the low genetic variability in this species. On the other hand, the study of loci that are expected to be under balancing selection would be an important tool to identify the relation between individuals and their environment and processes which have molded the genetic variability of this species throughout history. The Major Histocompatibility Complex (MHC) is comprised by a closely connected group of genes that constitute the most important genetic component of the immune system of mammals. Two main mechanisms have been described as responsible for maintaining MHC diversity and are associated with parasite combat and reproductive mechanisms for inbreeding avoidance. In this study we investigated the genetic variability of the DRB and DQA loci of the MHC and compared these diversity indices with values found in studies about other ctenomyids and with values found for neutral loci in this species. The genetic diversity for the DRB locus in C. flamarioni was lower than what is found for the same locus in other species of the same genus and it was also lower than what was found in studies with this species using neutral markers, especially in populations which have gone through recent size reductions (bottlenecks). The results indicate that the balancing selection was not sufficient to maintain the genetic diversity in the studied populations and that population size reductions, identified through neutral loci, must have been very drastic, since they also affected the diversity of a loci which is known to be highly variable (DRB of the MHC). We could not evaluate the diversity for the DQA loci due to high incidence of very divergent sequences, possibly pseudogenes. The status of conservation of this species is considered critical due to all the factors that affect the species, such as the instability of the environment on which it occurs, habitat fragmentation and destruction caused by human actions, and its low genetic diversity, especially in an important locus of the immune system. The loss of diversity in the MHC locus could be associated to the decrease in number of individuals per population, which increases the risk of endogamy which, in turn, can lead to the loss of reproductive fitness, expression of deleterious recessive alleles and loss of adaptive flexibility. Moreover, the loss of diversity in a locus which is important in the defense of the organism against parasites increases the susceptibility of the individuals to diseases, and all these factors raise the risk of local extinctions, endangering the future of the species.
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Identificação humana como ferramenta de investigações criminais: estudo de frequências alélicas de marcadores de interesse forense no Estado de Pernambuco

SANTOS, Sandra Maria dos 22 September 2014 (has links)
Submitted by Amanda Silva (amanda.osilva2@ufpe.br) on 2015-03-11T13:36:21Z No. of bitstreams: 2 Tese Sandra Maria dos Santos.pdf: 7087267 bytes, checksum: e79c441f05af02c1637d20869e64d1d4 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-11T13:36:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese Sandra Maria dos Santos.pdf: 7087267 bytes, checksum: e79c441f05af02c1637d20869e64d1d4 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2014-09-22 / A análise de polimorfismos de DNA como ferramenta de identificação humana é de grande relevância, sendo amplamente utilizada pela Criminalística objetivando a determinação de parentesco biológico e elucidação de crimes. As principais regiões polimórficas do DNA utilizadas na rotina forense são os STRs presentes nos cromossomos autossômicos, todavia, marcadores do cromossomo Y e do cromossomo X devem receber atenção especial por serem muito eficientes quando aplicados em investigações de casos complexos de paternidade, de crimes sexuais e pela capacidade de complementar eficazmente a análise de marcadores autossomos e do DNA mitocondrial. O presente trabalho descreve as frequências alélicas de marcadores de interesse forense presentes em 21 STRs autossômicos (D3S1358, vWA, D16S539, CSF1PO, TPOX, D8S1179, D21S11, D18S51, D2S441, D19S443, TH01, FGA, D22S1045, D5S818, D13S317, D7S820, SE33, D10S1246, D1S1656, D12S391, D2S1338) e as frequências alélicas de 12 X-STRs (DXS7132, DXS7423, DXS8378, DXS10074, DXS10079, DXS10101, DXS10103, DXS10134, DXS10135, DXS10146, DXS10148 e HPRTB), em uma amostragem de 879 indivíduos não relacionados de oito territórios do Estado de Pernambuco, Brasil; além de Fernando de Noronha. Não foram observadas diferenças significativas para quaisquer loci analisados em comparação com outras publicações relativas a diversas regiões do Brasil tanto para as regiões autossômicas quanto para o X-STR. A maioria dos marcadores observados apresentou-se em equilíbrio de Hardy- Weinberg. Os demais parâmetros estatísticos analisados indicam que os marcadores estudados são informativos quando se trata de identificação humana com fins forenses na população pernambucana.
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Diversidade das lagostas Anomura (Chirostylidae, Munididae e Munidopsidae) da Bacia Potiguar, Nordeste do Brasil e biologia populacional das espécies Munida iris A. Milne-Edwards, 1880 e Agononida longipes (A. Milne-Edwards, 1880)

NEGROMONTE, Aurinete Oliveira 27 February 2015 (has links)
Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-01-22T18:31:04Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissetação_Aurinete_Negromonte.pdf: 2768611 bytes, checksum: 135dc315c13443f6609fdeb458d93879 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-22T18:31:04Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissetação_Aurinete_Negromonte.pdf: 2768611 bytes, checksum: 135dc315c13443f6609fdeb458d93879 (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 / CNPQ / O presente estudo teve como objetivo registrar as espécies das famílias Chirostylidae, Munididae e Munidopsidae ocorrentes na região da Bacia Potiguar, além de descrever a estrutura populacional e crescimento relativo das lagostas mais abundantes da área. O material é proveniente de coletas realizadas durante a execução do projeto “Avaliação da Biota Bentônica e Planctônica na porção offshore das Bacias Potiguar e Ceará (BPot)”. Foram realizadas 40 coletas, sendo 20 em dezembro de 2009 e 20 em maio de 2011, nas isóbatas de 150 m, 400 m, 1000 m e 2000 m. Em cada isóbata foram feitas 5 estações em triplicata. Os exemplares foram identificados ao nível de espécie e sexados de acordo com a posição do gonóporo. Das espécies mais abundantes foram aferidas as seguintes medidas: Comprimento da Carapaça (CC), Largura da Carapaça (LC), Largura do Abdômen (LA), Comprimento da Quela direita (CQd), Comprimento da Quela esquerda (CQe), Largura da Quela direita (LQd) e Largura da Quela esquerda (LQe), posteriormente foram relacionadas através da equação potência y = a x b, CC foi utilizado como variável independente (x) e as demais dimensões corporais (variáveis dependentes, y). Foi contabilizado um total de 2073 indivíduos, distribuídos em 3 famílias e 10 espécies, sendo 1 da família Chirostilydae Ortmann, 1892: Uroptychus nitidus (A. Milne Edwards, 1880); 6 da família Munididae Ahyong, Baba, Macpherson, Poore, 2010: Agononida longipes (A. Milne Edwards, 1880), Munida constricta A. Milne Edwards, 1880, M.unida forceps A. Milne Edwards, 1880, Munida iris A. Milne Edwards, 1880, Munida microphthalma A. Milne Edwards, 1880 e Munida valida Smith 1883; e 3 da família Munidopsidae Ortmann, 1898: Galacantha rostrata A. Milne Edwards, 1880, Munidopsis nitida (A. Milne Edwards, 1880) e Munidopsis sigsbei (A. Milne Edwards, 1880). As espécies M. iris e A. longipes foram as mais abundantes. A proporção sexual de M. iris e variou significativamente ( ² = 5,54), sendo os machos dominantes (1,26:1), já entre fêmeas não-ovígeras e fêmeas ovígeras não houve variação significativa ( ² = 2,41 ) (1,25:1). Para A. longipes houve diferença significativa na proporção macho e fêmeas ( ² = 122,42), sendo os machos dominantes (1,84:1) e também na proporção fêmeas não-ovígeras e fêmeas ovígeras ( ² = 74,0), sendo as fêmeas não-ovígeras dominantes (2,26:1). Na curva de maturidade morfológica de M. iris, os machos atingem a fase adulta em 14,5 mm CC e as fêmeas em 12,8 mm CC e de A. longipes o valor obtido para os machos foi de 14,25 mm CC e para as fêmeas foi de 13,75 mm CC. Os machos de M. iris apresentaram crescimentoalométrico positivo nas relações CC vs. LC e CC vs. CQd, isométrico na relação CC vs. LA e negativo em CC vs. LQd; as fêmeas apresentaram crescimento alométrico positivo nas relações CC vs. LA e CC vs. CQd, e negativo em CC vs. LC e CC vs. LQd. As fêmeas ovígeras apresentaram crescimento negativo em quase todas as relações (CC vs. LC, CC vs. LA e CC vs. LQd), e apenas na relação CC vs. CQd apresentou crescimento positivo, mostrando que as fêmeas separam os períodos de crescimento e reprodução, investindo energia em apenas um período por vez. A espécie A. longipes apresentou um padrão de crescimento diferente, tanto os machos quanto as fêmeas apresentaram crescimento alométrico positivo nas relações CC vs. LC CC vs. LA e CC vs. LQd e negativo em CC vs. CQd. As fêmeas ovígeras apresentaram crescimento alométrico positivo nas relações CC vs. LC e CC vs. LA e negativo em CC vs. LQd e CC vs. CQd. Este trabalho ampliou o conhecimento sobre a distribuição geográfica das espécies das famílias Chirostylidae, Munididae e Munidopsidae na costa do Brasil, bem como o primeiro estudo populacional das espécies M. iris e A. longipes no Brasil. / This study aimed to record the species of the families Chirostylidae, Munididae and Munidopsidae from Potiguar Basin and describe the population structure and relative growth of the most abundant species from this area. The material was collected during the project “Avaliação da Biota Bentônica e Planctônica na porção offshore das Bacias Potiguar e Ceará (BPot)”. It was sampled 40 stations: 20 in December of 2009 and 20 in May of 2011 in isobaths of 150 m, 400 m, 1000 m and 2000 m. At each isobaths were sampled 5 stations in triplicate. The specimens were identified to the species level and sexed according to gonopore position. For the most abundant species were taken the following measures: carapace length (CC) carapace width (LC), abdomen width (LA), length of right chaela (CQD), length of left chaela (CQe), width of right chaela (LQd), width of left chaela (LQe). Posteriorly, were related through the potential equation y = axb, CC was used as independent variable (x) and other body dimensions (dependent variables, y). A total of 2073 individuals were counted, distributed in 3 family and 10 species: 1 specie of the Chirostilydae Ortmann, 1892 Uroptychus nitidus (A. Milne Edwards, 1880), 6 of the family Munididae Ahyong, Baba, Macpherson, Poore, 2010 Agononida longipes (A. Milne Edwards, 1880), Munida constricta A. Milne Edwards, 1880, Munida forceps A. Milne Edwards, 1880, Munida iris A. Milne Edwards, 1880, Munida microphthalma A. Milne Edwards, 1880 e Munida valida Smith 1883 and 3 of the family Munidopsidae Ortmann, 1898 Galacantha rostrata A. Milne Edwards, 1880, Munidopsis nitida (A. Milne Edwards, 1880) and Munidopsis sigsbei (A. Milne Edwards, 1880). Munida iris and Agononida longipes were the most abundants. The sex ratio of M. iris range significantly ( ² = 5.54), with males dominancy (1.26:1), but between non-ovigerous females and ovigerous females there was no significant variation ( ² = 0.58) (1.25:1). To A. longipes there wasn’t significant difference in the sex ratio between male and female ( ² = 122.42), being the males dominant (1.84: 1) and also in the proportion between non-ovigerous females and ovigerous females ( ² = 74.0), being the dominant non-ovigerous females (2.26: 1). The morphological maturity curve indicated that males reach adulthood in 14,5mm CC and the females in 12.8 mm CC. To A. longipes the value obtained for the males was 14,25mm CC and for the females was 13,75mm CC. The males of M. iris showed positive allometric growth in relations CC vs. LC and CC vs. CQd, isometric in relation CC vs. LA and negative CC vs. LQd; the females showed positive allometric growth in relations CC vs. LA and CC vs. CQd, and negative CC vs. LC and CC vs. LQd. The ovigerous females showed negative growth in almost all relationships (CC vs. LC, CC vs. LA and CC vs. LQd), and only in relation CC vs. CQd presented positive growth, showing that females separate the growth period and reproduction period, investing energy in only one period at a time. The species A. longipes showed a different pattern of growth, males and females showed positive allometric growth in relations CC vs. LC CC vs. LA and CC vs. LQd and negative CC vs. CQd. The ovigerous females presented positive allometric growth in relations CC vs. LC and CC vs. LA and negative CC vs. LQd and CC vs. CQd. This work expanded the knowledge of the geographical distribution of species of families Chirostylidae, Munididae and Munidopsidae from the coast of Brazil, as well as the first population study of species M. iris and A. longipes in Brazil.
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Riscos tecnológicos ambientais: análise da vulnerabilidade populacional na área urbana da cidade de Manaus-Am

Oliveira, Alexandre Araújo de, 92-98123-9896 10 November 2017 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-02-01T13:38:31Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Alexandre A. Oliveira.pdf: 4877880 bytes, checksum: db7251321bc0efd5d9a200d95c9f5bbf (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-02-01T13:42:00Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Alexandre A. Oliveira.pdf: 4877880 bytes, checksum: db7251321bc0efd5d9a200d95c9f5bbf (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-01T13:42:01Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Alexandre A. Oliveira.pdf: 4877880 bytes, checksum: db7251321bc0efd5d9a200d95c9f5bbf (MD5) Previous issue date: 2017-11-10 / This work aims to identify and characterize the situation of population vulnerability to environmental technological risks for the neighborhoods of the urban area of Manaus-AM, Brazil. Manaus is a city that had a fast population and industrial growth, the population that was of 314.197 inhabitants in 1970, at the moment it is of approximately 2.100.000 inhabitants. The sources of technological risks identified and characterized as potentially damaging threats were: thermoelectric, solvent and/or gas industries (LPG/gas), port areas, waste disposal areas (landfills, dumps, recyclers and incinerators), airport areas and fuel depots (oil resellers and oil refineries). The elaboration of the database was done through the collection of information made available by local, federal and national agencies, as well as field work to certify the functioning of the sources of risk; and use of Geographic Information System, classifying the neighborhood of the city of Manaus into five categories of vulnerability, resulting from the combination of the three dimensions: number of inhabitants exposed to risks (population density); levels of environmental technological risk by area (occurrence of risk factors per neighborhood); and a fragility and capacity to react to risk situations, related to financial development (Municipal Human Development Index - Income Dimension). The results indicate that the technological risk factors are concentrated in the southern region of the city, however, the neighborhoods with the highest incidence of risk factors are located in the north and east zones, which also have the worst Human Development Indexes in the city. The distribution of the population is concentrated in the northeast-southwest axis, highlighting the neighborhoods to the southwest, where the oldest neighborhoods and the historical center of the capital are located. The highest levels of vulnerability are found in the northeastern area of the city, where neighborhoods of precarious socioeconomic conditions and highly populated are located. This work brings relevant subsidies for the planning of public policies and development of strategies for the prevention of risks and damages to the health of the population, identifying and characterizing critical areas of high vulnerability and high concentration of technological risk factors that could be the target of policies aimed at reducing these vulnerabilities and that urban planning can and should be a tool to reduce levels of vulnerability. / Este trabalho procura identificar e caracterizar a situação de vulnerabilidade populacional aos riscos tecnológicos ambientais para os bairros da área urbana de Manaus-AM, Brasil. Manaus é uma cidade que teve um rápido crescimento populacional e industrial, a população que era de 314.197 habitantes em 1970, atualmente é de aproximadamente 2.100.000 habitantes. As fontes geradoras de riscos tecnológicos identificadas e caracterizadas como ameaças que potencialmente podem causar algum dano foram: termelétricas, indústrias que utilizam solventes e/ou gases (linhas de gás/GLP), áreas portuárias, áreas de disposição de resíduos (aterros, lixões, recicladores e incineradores), áreas aeroportuárias e depósito de combustíveis (postos de revenda de combustíveis e refinarias de petróleo). A elaboração da base de dados foi realizada por meio do levantamento de informações disponibilizadas pelos órgãos locais, federais e agências nacionais, bem como trabalho de campo a fim de certificar o funcionamento das fontes geradoras de risco; e uso de Sistema de Informação Geográfica, classificando os bairros da cidade de Manaus em cinco categorias de vulnerabilidade, resultantes da combinação das três dimensões: quantidade de habitantes expostos aos riscos (densidade populacional); níveis de risco tecnológico ambiental por área (ocorrência de fatores geradores de risco por bairro); e a fragilidade e capacidade de reação às situações de risco, relacionado ao fator financeiro (Índice de Desenvolvimento Humano Municipal – Dimensão Renda). Os resultados apontam que os fatores de risco tecnológico estão concentrados na região sul da cidade, entretanto os bairros que apresentam maior ocorrência de fatores de risco estão situados nas zonas norte e leste, zonas que também apresentam os piores Índices de Desenvolvimento Humano da cidade. A distribuição da população concentra-se no eixo nordeste–sudoeste, com destaque para os bairros a sudoeste, onde se localizam os bairros mais antigos e o centro histórico da capital. Os níveis mais elevados de vulnerabilidade encontram-se na área nordeste da cidade, onde estão localizados bairros de condições socioeconômicas precárias e muito povoados. Este trabalho traz subsídios relevantes para o planejamento de políticas públicas e desenvolvimento de estratégias para a prevenção de riscos e danos à saúde da população, ao identificar e caracterizar as áreas críticas de alta vulnerabilidade e de alta concentração de fatores de risco tecnológico que poderiam ser alvo de políticas direcionadas à redução destas vulnerabilidades e que o planejamento urbano pode e deve ser uma ferramenta para atenuar estes níveis
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Diversidade Genética populacional nas espécies pioneiras cyperus ligularis l.,C.odoratus L.(cyperaceae) e micononia prasina (Sw.) DC.(melastomataceae) ocorrentes em Remanescentes da floresta Atlântica de Pernambuco detectadapelos marcadoes moleculares DAF e ISSR.

CRUZ, Geyner Alves dos Santos 31 January 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T18:02:30Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo3644_1.pdf: 1299232 bytes, checksum: 800d780020fc914526cf602568277157 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A Floresta Atlântica tem sofrido contínuas retrações resultando em urgente demanda por novas estratégias para sua preservação e para o entendimento das conseqüências da fragmentação, especialmente visando à sua conservação. Considerando este cenário, as famílias Cyperaceae e Melastomataceae representam importante papel, devido à sua função como pioneiras e regeneradoras florestais. O presente trabalho objetivou estudar a diversidade genética e o fluxo gênico entre populações das espécies pioneiras Cyperus ligularis e C. odoratus (Cyperaceae) ocorrentes em um fragmento urbano de Floresta Atlântica da Reserva de Dois Irmãos Recife (PE) e em seus arredores, bem como de Miconia prasina (Melastomataceae) ocorrente em três fragmentos periurbanos de Floresta Atlântica na Usina São José (USJ) em Igarassu (PE), mediante marcadores moleculares DAF (DNA Amplification Fingerprinting) e ISSR (Inter Simple Sequence Repeats). O fenograma gerado através do DAF para as populações de C. ligularis e C. odoratus demonstrou total separação genética entre estas espécies, sustentado por 165 marcas polimórficas interespecíficas. Adicionalmente, as populações apresentaram alta diversidade genética entre si de acordo com o índice Gst de Nei (Gst- 0,3632), correlacionada a uma baixa taxa de fluxo gênico a partir do índice de número de migrantes observado Nm- 0,8766. Os indivíduos da espécie C. odoratus foram coletados apenas nas proximidades de dois açudes da Reserva de Dois Irmãos constituída por um fragmento de Floresta Atlântica, apresentando maior diversificação genética entre eles do que os de C. ligularis, ocorrentes também na Reserva de Dois Irmãos bem como em populações adjacentes sob forte influência antrópica, havendo distância de até 3 km entre os plots amostrados. Estes resultados sugerem a existência de maior variação intraespecífica e intrapopulacional para C. odoratus. Em contrapartida a menor variabilidade observada em C. ligularis sugere a influência de um possível efeito fundador na capacidade em ocupar áreas urbanas mais secas ou úmidas e poluídas, limitada a uma combinação específica de fatores genéticos, a despeito da diversidade de locais e áreas amostradas, desta forma agruparam-se aleatoriamente sugerindo a formação de uma metapopulação. Foram obtidos para as populações de M. prasina 237 loci polimórficos a partir do DAF e ISSR onde a estimativa global de diversidade genética (Dg%) foi de 91 e 85,5% para DAF e ISSR, respectivamente, tendo o fragmento de Floresta Atlântica Macacos (Mac) como a maior contribuinte e os fragmentos Açude do Prata (Apr) e Pezinho (Pez) como os menores, sugerindo que Mac se apresenta com maior potencial de adaptabilidade. Os dados de Dg% intrapopulacional apontam Mac com o maior índice, provavelmente devido à polinização e dispersão neste, e Apr e Pez, com os menores sugerindo maior atenção no sentido de conservação destes. A partir dos agrupamentos foram observados indícios de estruturação genética da população Apr em relação às demais, fato também indicado por as análises populacionais (Gst e Nm). A partir dos Gst e Nm globais por DAF e DAF/ISSR foi observada uma divergência genética entre os fragmentos de Floresta Atlântica analisados, sugerindo-se que tal fenômeno seria conseqüência das expansões e retrações da Floresta Atlântica ocorridas durante o Quaternário, bem como da pressão antrópica. A associação destes dados com observações de campo e de biologia reprodutiva devem auxiliar no entendimento da dinâmica das populações analisadas e do papel destas plantas nos processos sucessionais
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Estrutura populacional do caranguejo Chama-Maré Uca Thayeri Rathbun, 1900 (Crustacea, Decapoda, Ocypodidae) no manguezal do Rio Formoso, PE, Brasil

FARIAS, Alexandra Carla de Almeida 31 January 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T23:13:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo741_1.pdf: 1392118 bytes, checksum: f543e5bef70fbb2b16d81274ea145c8f (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Faculdade de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco / Este trabalho teve como objetivo caracterizar a estrutura populacional de Uca thayeri do estuário de rio Formoso, PE, e para isto foram investigados o tamanho corpóreo, o tamanho na maturidade sexual morfológica, a distribuição de freqüência total e mensal, a proporção sexual, o período reprodutivo, a fecundidade e o recrutamento. As amostragens dos exemplares foram realizadas mensalmente entre Abril de 2009 a Março de 2010 em três áreas distintas, por uma pessoa durante 20 minutos em cada área, pelo esforço de captura, em período de maré baixa. Em laboratório, os exemplares tiveram a largura da carapaça (LC), o comprimento do própodo do quelípodo maior (CPQ) e a largura do abdome (LA) mensurados e o sexo e a condição ovígera listados. Foram coletados 2.124 indivíduos, sendo 1.014 machos e 1.110 fêmeas, destas 207 estavam ovígeras. Os machos apresentaram um tamanho médio (15,3 ± 4,07 mm) similar ao das fêmeas (15,0 ± 3,52 mm). Machos e fêmeas (50% da população) atingiram a maturidade sexual morfológica aos 13,8 mm e 12,7 de LC, respectivamente. A distribuição total de frequência em classes de tamanho de largura da carapaça de machos e fêmeas de U. thayeri apresentou-se unimodal e na análise mensal foi observada bimodalidade ou polimodalidade na maioria dos meses. A razão sexual total foi desviada a favor das fêmeas (0,91: 1,0) e na análise sazonal os machos foram mais numerosos no outono e as fêmeas na primavera. A presença de fêmeas ovígeras foi constante durante o ano todo, mas com maior freqüência no verão. Já o recrutamento de U. thayeri ocorreu durante o ano todo, mas se mostrando mais abundante no inverno e no verão. A fecundidade média foi 8.859,2 ± 4.607,5 ovos, variando de 1.400 a 23.850 ovos. Os resultados obtidos refletem que a população de U. thayeri, está bem estabilizada no estuário do Rio Formoso, onde as condições ambientais parecem ser suficientes para a realização das suas funções vitais, como alimentação e reprodução. Entretanto, quando comparada a outras populações do sudeste do Brasil, observa-se que alguns aspectos populacionais são distintos, especialmente o período reprodutivo e a fecundidade, provavelmente em decorrência da variação latitudinal
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Paisagem genética e história populacional de Tropidurus hispidus (Squamata: Tropuridae) ao longo de um mosaico adaptativo do Norte e Nordeste do Brasil

BRITO, Diego Marllus Albanus 31 January 2012 (has links)
Submitted by Danielle Karla Martins Silva (danielle.martins@ufpe.br) on 2015-03-03T14:57:17Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Diego Brito 2012.pdf: 1870968 bytes, checksum: 18380983276cf07c95d5a164f0a5ca94 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-03T14:57:17Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Diego Brito 2012.pdf: 1870968 bytes, checksum: 18380983276cf07c95d5a164f0a5ca94 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012 / CNPq ; CAPES ; NPA; IBAMA / A genética da paisagem adaptativa é um tema transversal de estudos, que combina conhecimentos de ecologia da paisagem e dados relativos à genética populacional das espécies. Em lagartos, essa abordagem já foi utilizada para responder questões como mudanças climáticas, fragmentação de habitats e incertezas taxonômicas. Apesar de Tropidurus hispidus parecer ser uma espécie coesa, porém ecologicamente adaptável, apresenta evidências de estruturação populacional. Esse trabalho objetivou avaliar a continuidade genética de T. hispidus ao longo dos biomas Floresta Amazônica, Caatinga, Agreste, Floresta Atlântica e na vegetação de Restinga, além da zona urbana. Para tal, marcadores moleculares nucleares ISSR foram analisados por reações de PCR/eletroforese. Apesar da descontinuidade ambiental na área amostrada, os resultados indicam que T. hispidus parece apresentar forte conexão gênica entre a populações locais (demes), podendo constituir-se como um táxon evolutivamente coeso cujas populações possuem intenso fluxo gênico. A espécie provavelmente apresenta alta capacidade migratória ao longo dos diferentes ecossistemas estudados.
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Estudo comparativo de duas populações de capivaras (Hydrochaeris hydrochaeris) no município de Pirassununga, SP / Comparative study of two capybara (Hydrochaeris hydrochaeris) populations in the district of Pirassununga, SP

Vargas, Flavia Carolina 14 September 2005 (has links)
O presente trabalho teve como objetivo conhecer os fatores que propiciam as grandes densidades ecológicas de capivaras, através da comparação das dinâmicas populacionais de dois agrupamentos, em diferentes localidades do município de Pirassununga, SP (Campus Administrativo da Universidade de São Paulo – USP/Pirassununga e o Centro de Pesquisa e Gestão de Recursos Pesqueiros e Continentais – CEPTA/Ibama), para que futuramente seja possível propor uma metodologia de manejo que promova o controle populacional dessa espécie no Estado de São Paulo. Para tanto, foi realizado o monitoramento populacional de ambos agrupamentos durante 15 meses, através da contagem direta dos animais, constituindo na principal fonte de informação para determinar as dinâmicas populacionais. Adicionalmente realizaram-se as capturas dos indivíduos de ambas populações pelo uso de bretes fixos, para que fossem feitas as pesagens, sexagens e marcações eletrônicas pelo uso de microchips e assim, conhecer a distribuição etária, bem como a proporção entre sexos. O uso de ceva no interior dos bretes, para a atração dos animais, possibilitou a realização das contagens diretas e das capturas e recapturas. Para a análise das dinâmicas populacionais foram realizadas as comparações descritivas e estatísticas das densidades ecológicas das populações e das respectivas classes etárias, além do cálculo da taxa de crescimento das mesmas. A alimentação em ceva apresentou-se influenciada pela hierarquia de dominância social, o que fez com que apenas as parcelas dominantes fossem capturadas. Percebeu-se, através das capturas, que o número de fêmeas apreendidas foi superior ao de machos nas parcelas dominantes das duas populações. Por meio das observações foram detectados indivíduos satélites e subagrupamentos, cuja ocorrência pode caracterizar um sistema biológico de metapopulação. A comparação descritiva e estatística das densidades ecológicas das populações, bem como a comparação das taxas de crescimento revelaram superioridade populacional do agrupamento do CEPTA/Ibama em relação ao Campus da USP/Pirassununga, provavelmente pelo maior número de picos de acasalamentos observados, os quais possivelmente são influenciados pelo tipo de habitat antropizado e abundante em recursos hídricos presente no CEPTA/Ibama. / The present research aimed the knowledge of the factors that allow the high ecological densities of capybaras through the population dynamics comparison of two capybara groups in the district of Pirassununga, SP (Campus Administrativo da Universidade de São Paulo – USP/Pirassununga and Centro de Pesquisa e Gestão de Recursos Pesqueiros e Continentais – CEPTA/Ibama), intending to propose forward a management methodology for capybara population control in the State of São Paulo. The populations monitoring was carried out through direct count of animals during 15 months, which played the main role to determine the population dynamics. Fixed traps were used to allow the weightings, sex definitions and identification through microchips, and also to know the age distribution and sex ratios. It was used bait inside the traps to attract animals and thus make direct counting and capture possible. To analyze population dynamics it was used the population ecological densities comparisons (statistically and descriptively) and also their rates of increase. It was detected social dominance hierarchy inside the traps, thus only the dominant part of population could be caught. Females represented the majority among captured animals. Satellites individuals and new groups were seen during observations and their existence might characterize a biological system of metapopulation. The descriptive and statistic comparisons of population ecological densities, as well as their rates of increase showed population superiority of CEPTA/Ibama’s group probably for its bigger reproduction effort detected, which possibly receives influence of anthropogenic and water abundant habitats of CEPTA/Ibama.
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Estrutura populacional e variabilidade genética de tartaruga verde (Chelonia mydas) da região de Cananéia, São Paulo / Populational structure and genetic variability of green sea turtle (Chelonia mydas) from Cananéia, São Paulo

Bondioli, Ana Cristina Vigliar 20 October 2009 (has links)
As tartarugas marinhas são répteis existentes ao longo da costa brasileira, principalmente em áreas de alimentação e anidação. Por possuírem comportamento migratório, estudos ecológicos sobre esses animais são muito difíceis de realizar e muitas questões sobre sua biologia permanecem obscuras. A biologia molecular é uma importante ferramenta, que auxilia os pesquisadores na obtenção de informações valiosas a respeito de estrutura populacional, filogeografia e genealogia de populações naturais. Assim, este trabalho teve como objetivo analisar populações de tartarugas verdes (Chelonia mydas) que freqüentam a região de Cananéia, SP, com base na variedade haplotípica das seqüências gênicas correspondentes ao tRNA-Pro+D-loop do DNA mitocondrial. A área de estudo foi descrita como uma área de alimentação para juvenis de tartarugas verdes, Chelonia mydas, sendo caracterizada pela presença de um estoque misto, composto por animais provenientes de pelo menos seis diferentes áreas de desova analisadas durante quatro anos. A variabilidade haplotípica e nucleotídica é intermediária em relação às demais áreas de alimentação estudadas no Oceano Atlântico, sendo a amostra composta principalmente por indivíduos dos haplótipos CM-08 (63%) e CM-05 (26%). Os demais haplótipos foram relativamente raros, apresentando-se em frequências menores que 5% (CM-01, CM-06, CM-09, CM-10, CM-24, CM-32, CM-36, CM-45). Foi detectada diferença significativa entre as amostras anuais (p < 0.05) e não houve diferença entre as amostras sazonais (p >0.05). Análises indicam que Cananéia encontra-se conectada com as demais áreas de desova e alimentação estudadas no Oceano Atlântico, dependendo destas para o equilíbrio de populações saudáveis e necessitando de atenção, visto o grau atual de ameaça que sofrem. A importância da incorporação de parâmetros ecológicos que contribuam para o entendimento da dinâmica populacional da região, às análises genéticas, é imprescindível para que esses dados sejam validados e tenham utilidade e aplicação direta na proteção das tartarugas marinhas. As informações obtidas através deste trabalho foram utilizadas na elaboração de um documento que será anexado ao plano de manejo do Parque Estadual Ilha do Cardoso e contribuirão para a elaboração do plano de manejo da Área de Proteção Ambiental de Ilha Comprida, de modo que a região de Cananéia seja considerada prioritária na preservação das tartarugas verdes. / The green turtle, Chelonia mydas, is an endangered marine reptile that nests and forages along the Brazilian coast and oceanic islands, among other tropical areas. Due to the highly migratory and oceanic nature of these animals, ecological studies are many times difficult to carry out, and many questions about their biology remain. Molecular genetic analysis is a powerful tool for bridging these gaps, providing valuable information about population structure, phylogeography, and genealogy. This study analyzes mitochondrial DNA sequences (tRNA-Pro + D-loop) from green sea turtles of the Cananéia regional juvenile feeding ground over a four-year period. Significant differences were found between annual samples (p<0.05), however no significant differences were found between seasons (p>0.05). The sample was composed primarily of individuals of haplotypes CM-08 (63%) and CM-05 (26%). All other haplotypes (n = 8) were relative rare, with frequencies lower than 5%. The analysis revealed the area to be a mixed stock, composed of animals drawn from at least six different nesting areas. Because Cananéia is connected to other nesting and feeding grounds throughout the Atlantic Ocean, the health of these populations is interdependent, and threats in one area will likely impact connected sites. This connectivity underscores the importance of understanding regional population dynamics using genetic analysis, with conservation applications. These data will be included in the management plans for the Ilha do Cardoso State Park and the Environmental Protection Area of Ilha Comprida, so that Cananéia will be considered a priority area for the preservation of green sea turtles in Brazil.
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Estrutura populacional e variabilidade genética de tartaruga verde (Chelonia mydas) da região de Cananéia, São Paulo / Populational structure and genetic variability of green sea turtle (Chelonia mydas) from Cananéia, São Paulo

Ana Cristina Vigliar Bondioli 20 October 2009 (has links)
As tartarugas marinhas são répteis existentes ao longo da costa brasileira, principalmente em áreas de alimentação e anidação. Por possuírem comportamento migratório, estudos ecológicos sobre esses animais são muito difíceis de realizar e muitas questões sobre sua biologia permanecem obscuras. A biologia molecular é uma importante ferramenta, que auxilia os pesquisadores na obtenção de informações valiosas a respeito de estrutura populacional, filogeografia e genealogia de populações naturais. Assim, este trabalho teve como objetivo analisar populações de tartarugas verdes (Chelonia mydas) que freqüentam a região de Cananéia, SP, com base na variedade haplotípica das seqüências gênicas correspondentes ao tRNA-Pro+D-loop do DNA mitocondrial. A área de estudo foi descrita como uma área de alimentação para juvenis de tartarugas verdes, Chelonia mydas, sendo caracterizada pela presença de um estoque misto, composto por animais provenientes de pelo menos seis diferentes áreas de desova analisadas durante quatro anos. A variabilidade haplotípica e nucleotídica é intermediária em relação às demais áreas de alimentação estudadas no Oceano Atlântico, sendo a amostra composta principalmente por indivíduos dos haplótipos CM-08 (63%) e CM-05 (26%). Os demais haplótipos foram relativamente raros, apresentando-se em frequências menores que 5% (CM-01, CM-06, CM-09, CM-10, CM-24, CM-32, CM-36, CM-45). Foi detectada diferença significativa entre as amostras anuais (p < 0.05) e não houve diferença entre as amostras sazonais (p >0.05). Análises indicam que Cananéia encontra-se conectada com as demais áreas de desova e alimentação estudadas no Oceano Atlântico, dependendo destas para o equilíbrio de populações saudáveis e necessitando de atenção, visto o grau atual de ameaça que sofrem. A importância da incorporação de parâmetros ecológicos que contribuam para o entendimento da dinâmica populacional da região, às análises genéticas, é imprescindível para que esses dados sejam validados e tenham utilidade e aplicação direta na proteção das tartarugas marinhas. As informações obtidas através deste trabalho foram utilizadas na elaboração de um documento que será anexado ao plano de manejo do Parque Estadual Ilha do Cardoso e contribuirão para a elaboração do plano de manejo da Área de Proteção Ambiental de Ilha Comprida, de modo que a região de Cananéia seja considerada prioritária na preservação das tartarugas verdes. / The green turtle, Chelonia mydas, is an endangered marine reptile that nests and forages along the Brazilian coast and oceanic islands, among other tropical areas. Due to the highly migratory and oceanic nature of these animals, ecological studies are many times difficult to carry out, and many questions about their biology remain. Molecular genetic analysis is a powerful tool for bridging these gaps, providing valuable information about population structure, phylogeography, and genealogy. This study analyzes mitochondrial DNA sequences (tRNA-Pro + D-loop) from green sea turtles of the Cananéia regional juvenile feeding ground over a four-year period. Significant differences were found between annual samples (p<0.05), however no significant differences were found between seasons (p>0.05). The sample was composed primarily of individuals of haplotypes CM-08 (63%) and CM-05 (26%). All other haplotypes (n = 8) were relative rare, with frequencies lower than 5%. The analysis revealed the area to be a mixed stock, composed of animals drawn from at least six different nesting areas. Because Cananéia is connected to other nesting and feeding grounds throughout the Atlantic Ocean, the health of these populations is interdependent, and threats in one area will likely impact connected sites. This connectivity underscores the importance of understanding regional population dynamics using genetic analysis, with conservation applications. These data will be included in the management plans for the Ilha do Cardoso State Park and the Environmental Protection Area of Ilha Comprida, so that Cananéia will be considered a priority area for the preservation of green sea turtles in Brazil.

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