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Cohort fertility decline in low fertility countries: Decomposition using parity progression ratiosZeman, Krystof, Beaujouan, Eva, Brzozowska, Zuzanna, Sobotka, Tomás 22 January 2018 (has links) (PDF)
BACKGROUND: The long-term decline in cohort fertility in highly developed countries has been widely documented. However, no systematic analysis has investigated which parity contributed most to the fertility decline to low and very low levels.
Objective: We examine how the contribution of changing parity progression ratios varied across cohorts, countries, and broader regions in Europe, North America, Australia, and East Asia. We pay special attention to countries that reached very low completed cohort fertility, below 1.75 children per woman.
Methods: Using population censuses and large-scale surveys for 32 low fertility countries, we decompose the change in completed cohort fertility among women born between 1940 and 1970. The decomposition method takes into account the sequential nature of childbearing as a chain of transitions from lower to higher parities.
Results: Among women born between 1940 and 1955, the fertility decline was mostly driven by reductions in the progression ratios to third and higher-order births. By contrast, among women born between 1955 and 1970, changes in fertility showed distinct regional patterns: In Central and Eastern Europe they were fuelled by falling second-birth rates, whereas in the German-speaking countries, Southern Europe, and East Asia decreases in first-birth rates played the major role.
Conclusions: Pathways to low and very low fertility show distinct geographical patterns, which reflect the diversity of the cultural, socioeconomic, and institutional settings of low fertility countries.
Contribution: Our study highlights the importance of analysing parity-specific components of fertility in order to understand fertility change and variation. We demonstrate that similar low levels of completed cohort fertility can result from different combinations of parity-specific fertility rates.
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Videokameran som pedagogiskt verktyg : Hur kan videokameran användas som pedagogiskt verktyg för formativ bedömning och samtidigt synliggöra progressionen gällande svenskämnets muntliga förmågor?Häggmark, Roger January 2018 (has links)
Att ge eleven formativ bedömning gällande sina muntliga förmågor i svenskämnet är en sak, att visualisera dessa förmågor och samtidigt synliggöra progressionen för eleven är en annan och kan upplevas som problematiskt. I denna fallstudie undersöks hur videokameran kan användas som pedagogiskt verktyg för problematiseringen i föregående mening samt hur användandet av nämnt verktyg även kan göra undervisningen mer lustfylld och värdeskapande, samtidigt som det underlättar dokumentation och utvärdering. I undersökningen har en trianguleringsmetod använts där kvalitativa metoder, genom observation, analys och intervju, har kombinerats. Undersökningen innefattar en specifik lärares användande av videokameran i undervisningen. Både nya och äldre filmer har analyserats för att ta del av hur progressionen synliggörs. Att använda sig av digitala verktyg är dessutom helt rätt i tiden med tanke på en digitaliserad revidering av gällande läroplan. Resultatet av fallstudien visar på att videokameran är ett ypperligt verktyg för ovannämnda delar. Intervjuad lärare drar dessutom kopplingar till ökad självkänsla och motivation hos eleverna, i och med att de får möjlighet att se sin utveckling och att deras uppgifter får en mottagare, vilket gör undervisningen mer värdeskapande. / <p>2018-06-15</p>
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Hur ser skrivundervisningen ut i skolan? : Att undervisa i skrivandet för hand med digitaliseringen på ingångSamuelsson, Martina January 2018 (has links)
Syftet med studien är att ta reda på lärarens perspektiv på digitalisering och hur viktigt de anser att det är att eleverna kan skriva för hand. Genom sju intervjuer har svar från lärare i årskurserna F-6 samlats in och sammanställts. Studien behandlar vad lärare anser om digitaliseringen samt hur viktigt det är för elever att kunna skriva för hand. Studien visar att lärare på skolan anser att skrivning för hand är viktigt men åsikterna skiljer sig åt angående hur ofta och hur mycket de anser att eleverna behöver fortsätta skriva. Enligt informanterna är digitaliseringen viktig med tanke på hur samhället ser ut idag och hur det kommer att se ut i framtiden.
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Geração de prole virtual por reprodução simulada aplicada ao problema de pessoas desaparecidas / Generation of offspring by reproduction simulated virtual applied to the problem of missing personsEsguerra, Martha Isabel Cárdenas January 2011 (has links)
ESGUERRA, Martha Isabel Cárdenas. Geração de prole virtual por reprodução simulada aplicada ao problema de pessoas desaparecidas. 2011. 68 f. Dissertação (Mestrado em ciência da computação)- Universidade Federal do Ceará, Fortaleza-CE, 2011. / Submitted by Elineudson Ribeiro (elineudsonr@gmail.com) on 2016-07-11T19:28:35Z
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Previous issue date: 2011 / Virtual reality has applications in different fields of knowledge such as Engineering, Science, Arts, Entertainment and Education. In this work, virtual reality is used to help solving the problem of missing persons. The proposed methodology uses simulated diploid reproduction of virtual characters carefully modeled taking into account the traits of the missing person’s parents. The parents models are generated in the age of son at the moment of disappearance and genetic characteristics of both parents are stored into their genomic data structure, which will be used to construct pools of male and female gametes to be used in a simulated fecundation. The descendants are generated with the same age of the missing person at the time of disappearance. Through an interactive process, a plausible model of the missing person is selected among the generated descendants and its genomic data structure is saved. The parents’ models and corresponding data structures are updated to reflect the age of the missing person at search time. Next, the genomic data structure of the missing person is updated with the information contained in the updated data structure of the parents, and an updated model of the missing person is generated. This updated model is a plausible model, upon which perturbations can be applied to generate several plausible variants. Case studies are presented that demonstrate the potentials of the proposed methodology. / A realidade virtual tem aplicações em diferentes áreas do conhecimento como Engenharia, Ciências, Artes, Entretenimento e Educação. Neste trabalho, a realidade virtual é usada como apoio no problema de busca de pessoas desaparecidas. A metodologia proposta utiliza a geração de personagens virtuais simulando o processo de reprodução de seres diplóides, modelando cuidadosamente as características dos pais da pessoa desaparecida. Os modelos paternos são gerados na idade do filho no momento do desaparecimento e suas características genéticas, são armazenadas em suas estruturas de dados genômicas, que serão usadas para construir os bancos de gametas masculino e feminino para ser usado em uma fecundação simulada. Os descendentes são gerados com a mesma idade da pessoa desaparecida no momento do desaparecimento. Através de um processo interativo, um modelo plausível da pessoa desaparecida é selecionado entre os descendentes gerados e sua estrutura de dados genômica é salva. Os modelos paternos e suas estruturas de dados correspondentes são atualizados até alcançar a idade objetivo (idade na qual se quer projetar a pessoa desaparecida). Em seguida, a estrutura de dados genômica da pessoa desaparecida é atualizada com as informações contidas nas estruturas de dados paternas já atualizadas, e um modelo atualizado da pessoa desaparecida é gerado. Este modelo atualizado é um modelo plausível, em que podem ser aplicadas perturbações para gerar diversas possibilididades. Os estudos de caso que são apresentados demonstram as potencialidades da metodologia proposta.
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Can gameification motivate exercise : A user experiment regarding a normal exercise app compared to a gamified exercise appSundberg, Jonathan January 2018 (has links)
Background. Regularly exercising is difficult, some people stop exercising either due to it not being fun or they might not see any results of the effort they put in. Exercise and gaming or also know as exergaming, is a way to combine the fun entertainment of games with the health benefits of exercise. Objectives. The objective of this study is to conduct an experiment to find out if people are more interested in an exercising app which has been gamified compared to a normal exercising app. Gamifyingsomethingsuggeststhatsomethingwhichisnotconsideredagamemedium is taken, and then influence with game related aspects. Methods. A prototype was created to show the participants both sides of the exercise apps, one normal app which resembles an everyday exercising app, and one gamified app which shows the user their progress in a fashion similar to role-playing games with levels and quests. The participants of the test will try both apps and later vote in a survey whichever they liked the most. Results. While only about 60% of the participants had prior experience with exercise apps, 90% would rather choose the gamified app over the normal app. 95% of the participants were regular gamers. Conclusions. The vast majority of the participants preferred the gamified version of the app over the normal one. Specifically mentioning that they find it more interesting and that they enjoy the upfront progression system a lot more since they are used to it from the games they play on their free time
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Erosão dentária em adolescentes de Porto Alegre, RS / Dental erosion in adolescents of Porto Alegre, RSBrusius, Carolina Doege January 2013 (has links)
Objetivo: O objetivo dessa dissertação foi estudar a prevalência, a incidência, a progressão e os fatores associados à erosão dentária na dentição permanente de adolescentes de Porto Alegre, RS – Brasil. Metodologia: Entre setembro de 2009 e dezembro de 2010, um estudo observacional transversal analítico foi desenvolvido em uma amostra representativa da população de escolares de 12 anos de Porto Alegre. Participaram do estudo 1.528 alunos, aleatoriamente selecionados em 42 escolas, sendo 9 particulares e 33 públicas (taxa de participação de 83,17%). O exame clínico foi realizado nas escolas, após limpeza e secagem dos dentes, por uma única examinadora calibrada. Os incisivos e primeiros molares permanentes foram examinados de acordo com o índice BEWE (Basic Erosive Wear Examination). Medidas antropométricas (peso e altura) foram registradas. Dois questionários foram utilizados: um destinado aos pais/responsáveis legais dos escolares (questões socioeconômicas, acesso a serviços odontológicos, hábitos de higiene oral, saúde geral, etc.) e outro respondido pelos próprios escolares (hábitos alimentares). Entre agosto de 2012 e maio de 2013, após um período de tempo médio de 2,5 anos (±0,35), 801 indivíduos foram reexaminados, representando 52,42% da amostra inicialmente examinada. O exame clínico foi realizado por outra examinadora calibrada e seguiu a mesma sistemática do exame anterior. Questões sobre hábitos de higiene oral, saúde geral e hábitos alimentares foram reaplicadas aos próprios escolares. Taxas de prevalência, incidência, progressão e seus respectivos intervalos de confiança foram estimados. A associação entre erosão dentária e seus possíveis indicadores/fatores de risco foi avaliada através de modelos de regressão de Poisson. Resultados: No exame inicial, 229 escolares apresentaram erosão, resultando em uma taxa de prevalência de 15% (95%CI=13.6-16.5). Na maioria dos casos observou-se a presença de erosão leve (n=207). Na análise dos indicadores de risco para erosão dentária (estudo transversal), foi encontrada associação com sexo masculino, alunos de escolas particulares, consumo diário de refrigerante e limão e distúrbios gastro-esofágicos. Ao longo do período observacional de 2,5 anos, foi observada uma incidência de erosão de 7,2% (95%CI=5.3-9.1) e uma progressão de 25,6% (95%CI=17.7-33.5). Gênero foi o único fator de risco significativamente associado com a incidência de erosão dentária na população em estudo. Os meninos foram 86% mais propensos a desenvolver a erosão dentária durante o período de estudo do que as meninas. Não foi observada relação entre a progressão da erosão e as variáveis explicativas estudadas. Conclusões: O presente estudo encontrou baixas taxas de prevalência e incidência de erosão dentária na população estudada, sendo erosão leve na grande maioria dos casos. Entretanto, um quarto dos indivíduos afetados apresentou progressão no período de 2,5 anos. Gênero masculino, tipo de escola, hábitos alimentares e distúrbio gastro-esofágico foram associados à erosão dentária na população estudada. Os resultados da presente dissertação sugerem que a maior incidência entre os meninos e a taxa de progressão de 25% deve ser levada em consideração no desenvolvimento de estratégias de prevenção e controle da erosão dentária. / Aim: The objective of this dissertation was to study the prevalence, incidence, progression and the factors associated with dental erosion in the permanent dentition of adolescents in Porto Alegre, RS - Brazil. Methods: Between September 2009 and December 2010, an analytical cross-sectional observational study was conducted in a representative sample of schoolchildren aged 12 years in Porto Alegre. 1,528 students were randomly selected in 42 schools, 9 private and 33 public (participation rate of 83.17 %). The clinical examination was carried out in schools, after cleaning and drying the teeth, by a single calibrated examiner. The first permanent molars and incisors were examined according to the BEWE (Basic Erosive Wear Examination) index. Anthropometric measurements (weight and height) were recorded. Two questionnaires were used: one for parents/guardians of students (socioeconomic issues, access to dental services, oral hygiene habits, general health, etc.) and another answered by the scholars (eating habits). Between August 2012 and May 2013, after an average period of 2.5 years (± 0.35), 801 subjects were reviewed, representing 52.42 % of the sample initially tested. Clinical examination was performed by another calibrated examiner and followed the same systematic examination. Questions regarding brushing frequency, general health and data on dietary habits were reapplied to the schoolchildren. Prevalence, incidence, progression, and their respective confidence intervals were estimated. The association between dental erosion and possible indicators/risk factors was assessed using Poisson regression models. Results: At baseline, 229 students had erosion, resulting in a prevalence rate of 15 % (95%CI=13.6-16.5). In most cases it was observed the presence of slight erosion (n = 207). In the analysis of risk indicators for dental erosion (cross-sectional) associations were found with male private school students, daily consumption of soda and lemon and gastro esophageal disorders. Throughout the observational period of 2.5 years, there was an incidence of erosion of 7.2 % (95%CI=5.3-9.1) and an increase of 25.6% (95%CI=17.7-33.5). Gender was the only risk factor significantly associated with the incidence of dental erosion in the study population. Boys were 86 % more likely to develop dental erosion during the study period than girls. No relationship was found between progression of erosion and the explanatory variables studied. Conclusions: This study found low rates of prevalence and incidence of dental erosion in the study population, with slight erosion in most cases. However, a quarter of affected individuals showed progression within 2.5 years. Male gender, type of school, eating habits and gastro -esophageal disorder were associated with dental erosion in the studied population. The results of this dissertation suggest that the greater susceptibility among boys and progression rate of 25% should be taken into consideration in the development of strategies for prevention and control of dental erosion.
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A influência de polimorfismos de fatores de restrição na suscetibilidade ao HIV e na progressão à AidsPolo, Tiago Antonio January 2017 (has links)
Fatores de restrição são as primeiras proteínas celulares envolvidas no combate a infecções virais, são considerados uma defesa intrínseca das células, constituindo-se em uma rápida resposta frente a invasão de patógenos. Essas moléculas são bastante diversas e são capazes de interferir em algum ponto do ciclo viral, atenuando ou bloqueando a evolução da infecção. Após a descoberta da existência desses fatores, alguns estudos têm direcionado o foco para as possíveis alterações genéticas que podem influenciar a estrutura dessas proteínas e, deste modo, interferir sobre suscetibilidade e progressão de doenças infecciosas, como a infecção pelo HIV/aids. O objetivo do presente estudo foi avaliar três SNPs de três diferentes fatores de restrição (o TRIM5α – rs10838525, a APOBEC3F – rs2076101 e o CUL5 – rs7117111) e observar suas frequências em diferentes grupos étnicos, bem como a associação desses fatores com a suscetibilidade ao HIV e a progressão a aids, em um grupo de soronegativos e soropositivos. Foram selecionados 345 indivíduos HIV+ atendidos no setor de Infectologia do Hospital Nossa Senhora da Conceição e 324 indivíduos HIV– doadores de sangue do Hospital de Clínicas de Porto Alegre. Os SNPs foram identificados através da técnica de PCR TaqManTM. O teste qui-quadrado foi utilizado para a análise das frequências e por regressão logística univariada foi avaliado o OR com 95% de IC entre os modelos dominantes e recessivos. Entre os SNPs estudados apenas o rs7117111 apresentou resultado estatisticamente significativo para o genótipo GG em relação a proteção ao HIV-1 (OR 0,661, IC 95% 0,449-0,974, P=0,036) e esse mesmo genótipo, também, parece estar relacionado aos progressores rápidos, pois apresentou uma tendência nessa relação quando ajustado pela etnia (OR ajustado 2,115, IC 95% 0,990- 4,520, P=0,053). Tais achados demonstram que alterações genéticas, especificamente no gene CUL5, podem influenciar a suscetibilidade ao HIV-1 e podem, também, interferir na progressão a aids. Esses resultados geram questionamentos de grande valia para um maior entendimento da influência genética do sistema de defesa intrínseco celular no curso da infecção. / Host restriction factors are the first cellular proteins engaged in antiviral response, they are considerate an intrinsic cell defense with the aim to be a rapid answer against the invasion of pathogens. This molecules have a vary diversity in structure and each one act in a distinct stages of viral life cycle, however always with the same objective to attenuate or block the infection. After the discovery of this restriction factors, some researches focus in looking for genetic variation that can be influence in structure protein and with this way interfere in HIV susceptibility or progress to AIDS. The aim of present work was evaluate tree SNPs of tree different restrictions factors (TRIM5α – rs10838525, APOBEC3F – rs2076101 and CUL5 – rs7117111) and detect yours frequencies in different ethics group, as well as, evaluate the SNPs`s capacity in influence the susceptibility to HIV and progress to AIDS in a seronegative and seropositive groups. For this research was selected 345 samples of HIV+ individuals from the Infectology sector of Nossa Senhora da Conceição hospital and 324 HIV- samples from blood donors of Clinics Hospital of Porto Alegre. Through PCR TaqManTM assay the SNPs was genotyping. The qui-square test was used to analyze the frequencies and by unvaried logistic regression was estimate the OR with 95% CI to dominant and recessive models. Between the tree SNPs chosen only rs7117111 was statistically significant the GG genotype with the HIV-1 protection (GG, OR: 0,661, 95% CI 0,449-0,974, P=0.036) and this same genotype seems to be to related with rapid progress to AIDS, because the result shows a tendency when adjusted for ethnicity in the recessive model (adjusted OR 2,115, IC 95% 0,990-4,520, P=0,053). This finds shows the genetics alterations, specify in the CUL5 gene, can alter the susceptibility to HIV-1 and can interfere in the progress to AIDS. Theses results are also important for the understanding of the genetic alterations in the host antiviral intrinsic mechanisms anti-HIV and can bring new insights for strategies against HIV pandemic.
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Charakterizace příspěvku genu gag k celkové replikační zdatnosti HIV u pacientů s různým průběhem nemoci / Contribution of gag region to overall HIV replicative fitness in patients with different disease progressionSuchý, Tomáš January 2017 (has links)
Human immunodeficiency virus (HIV) is globally spread virus without available cure. Since its life-long presence, virus is carefully monitored as well as patient's immunological status. Replicative fitness of the virus is one of important aspects which can be taken into account, when monitoring HIV. Here, we are measuring HIV replicative fitness of gag recombinant viruses and comparing the results with replicative fitness of primary isolates. Further, we are comparing our findings of replicative fitness change over time with disease progression in the patient. We found that gag can be major contributor to overall fitness, although not in all cases. Additionally, we observed a correlation of replicative fitness development and slope of patient's CD4+ T cells. Moreover, this relation was even more noticeable in patients with slow disease progression or in carriers of protective alleles. In summary, our results extend the understanding of replicative fitness and its role in disease progression; and pave the way to use the recombinant HIV for replicative fitness measurement in clinical practice. Keywords: HIV, replicative fitness, recombinant virus, HIV disease progression, gag
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Estado do conhecimento : recuperação da aprendizagem e do reforço escolar na rede estadual paulista (1999 a 2009) /Silva, Letícia Brito da. January 2010 (has links)
Orientador: Sonia Maria Duarte Grego / Banca: Debora Cristina Jeffrey / Banca: Rosaly Mara Senapeschi Garita / Resumo: O objetivo central foi investigar o Estado do conhecimento referente à avaliação formativa, com foco especial nos mecanismos de Recuperação e Reforço Escolar, no período entre 1999 e 2009. Para análise da produção científica na área realizou-se um levantamento bibliográfico das teses e dissertações defendidas nos Programas de Pós- Graduação da USP, UNESP, UNICAMP e PUC/SP. O objetivo específico foi analisar as contribuições desta produção para esclarecer os avanços e os problemas decorrentes da implantação das novas políticas de avaliação na melhoria da qualidade do ensino e no desenvolvimento dos alunos, em função das novas práticas avaliativas que têm sido instaladas no interior da escola. Na identificação das teses e dissertações do período foram utilizadas as seguintes palavras-chaves: Progressão Continuada, Avaliação Formativa, Reforço Escolar e Recuperações de Aprendizagem. O levantamento nos bancos de dados da CAPES (Coordenação de Aperfeiçoamento do Ensino Superior), ANPED (Associação Nacional de Pós- Graduação e Pesquisa em Educação) e BTDB (Biblioteca Digital Brasileira de Teses e Dissertações), e também nas bibliotecas depositárias como UNICAMP, UNESP, PUC/SP e FEUSP levou à seleção de 30 dissertações de mestrado e 7 teses de doutorado. Após inspeção dos resumos procedeuse à leitura e análise integral dos trabalhos e à re-elaboração dos resumos com foco nos objetivos, metodologia, dados coletados e conclusões. Do exame exaustivo dos trabalhos emergiram três categorias de análise: Dimensão político-social da Avaliação, A prática da avaliação no Regime de Progressão Continuada e Representações sobre a avaliação no Regime de Progressão Continuada. As pesquisas produzidas permitem desvelar como vêm se desenvolvendo os processos e mecanismos de avaliação instituídos oficialmente... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The main objective was to investigate the state of knowledge regarding the formative evaluation, with particular focus on mechanisms for Recovery and Enhancement School, between 1999 and 2009. For analysis of scientific production in the area held a bibliography of theses and dissertations in the Graduate Program at USP, UNESP, UNICAMP and PUC / SP. The specific objective was to examine the contributions of this production to clarify the progress and problems arising from the implementation of new assessment policies in improving the quality of teaching and student development, as new assessment practices that have been installed inside the school. The identification of theses and dissertations of the period we used the following keywords: Continued Progression, Formative Evaluation Reinforcement Learning School and Recoveries. The survey in the database of CAPES (Coordination for the Improvement of Higher Education), ANPED (National Association of Graduate Studies and Research in Education) and BTDB (Brazilian Digital Library of Theses and Dissertations), and depository libraries as well as in Campinas, UNESP, PUC / SP FEUSP and led to the selection of 30 master's dissertations and doctoral theses 7. After inspection of the abstracts proceeded to read and comprehensive analysis of the work and re-written abstracts focusing on the objectives, methodology, data collected and conclusions. Exhaustive examination of the work revealed three categories of analysis: politicalsocial dimension of assessment, the assessment in the regime of continued progression and Representation on the evaluation scheme in the continued progression. The research produced allow unveiling is unfolding processes and evaluation mechanisms established officially as founding elements of the regime of continued progression within the school, identify the factors that shape developments and / or critical... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Caracterização molecular do arco da alça V3 da gp 120 do HIV-1Triglia, Denise Goffi [UNESP] 01 April 2007 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2007-04-01Bitstream added on 2014-06-13T20:29:51Z : No. of bitstreams: 1
triglia_dg_me_botfm.pdf: 753832 bytes, checksum: 1548d01f8015f2a3aa0616b8f844936a (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Ministério da Saúde / Secretaria do Estado da Saúde de São Paulo / O HIV-1 é um retrovirus que possui grande variabilidade genética, principalmente no gene que codifica o envelope viral (env). A diversidade de seqüências encontrada na terceira alça variável (alça V3) da gp120 é relacionada a várias características biológicas virais, tais como: habilidade do vírus a induzir sincício, antigenicidade e tropismo viral. O arco da alça V3 é formado por uma seqüência de aminoácidos relativamente conservada (GPGR) nos vírus do subtipo B. No Brasil, encontramos a variante B , que possui a seqüência GWGR formando a região do arco e tem sido associada a uma progressão mais lenta da infecção. O fenótipo viral Não Indutor de Sincício (NSI) predomina nas fases assintomáticas, enquanto que o fenótipo Indutor de Sincício (SI) emerge em indivíduos infectados precedendo um declínio acentuado de células T CD4, sendo associado à progressão para aids. A mudança do fenótipo NSI para SI é resultante da substituição de determinados aminoácidos na alça V3. Mutações que alterem a seqüência de aminoácidos da alça V3, incluindo a região do arco podem ser utilizadas como marcadores genéticos para inferir sobre a evolução da infecção. DNA viral foi isolado a partir de leucócitos e utilizado como fonte para amplificação por PCR e seqüenciamento automático da região da alça V3. Um script desenvolvido pelo setor de Bioinformática foi utilizado para identificar os fenótipos SI/NSI e a seqüência de aminoácidos do arco da alça V3 (GPGR/GWGR) em 1279 pacientes estudados no Estado de São Paulo como parte do projeto VGDN. Esse estudo mostrou que 34,8% dos pacientes possuíam os aminoácidos GPGR formando a região do arco enquanto que 22,8% possuíam GWGR. Além disso, análises estatísticas utilizando o Teste de Goodman apontaram uma prevalência significativa de GWGR em pacientes assintomáticos com fenótipo NSI... / Genomic diversity in HIV-1 is a well-characterized feature and although this heterogeneity is distributed throughout the genome, most of the polymorphisms are located in the envelope gene (env). Sequence variability at the env gene third variable region (V3 loop) of HIV-1 is highly correlated with several viral biological features, such as the ability to induce syncytia, antigenicity and viral tropism. The tip of V3 loop consists of a relative conserved amino acid sequence (GPGR) in subtype B and the presence of GWGR motif in this region has been found in Brazilian strains (B' variant). Non-syncytium-inducing (NSI) phenotype variants predominate in the asymptomatic phase and Sincytium-inducing (SI) phenotype variants emerge in infected patients preceding a CD4 cell decline and correlate with progression to clinical manifestations. The switch from an NSI to an SI phenotype was correlated with one or more basic amino acids substitutions in the V3 loop. Genetic mutations modifying the V3 sequence has been associated with alterations in cytopathic abilities and antigenicity. The patterns of the HIV-1 sequences variability can be used as genetic marker to infer about the infection evolution. Viral DNA isolated from leucocytes was used as a source for PCR amplification and automatic sequencing of the V3 loop gene. Home-made PERL scripts were used to identify NSI/SI phenotypes and GPGR/GWGR motif in 1279 patients studied in São Paulo State, Brazil, as part of VGDN Project (www.lemb.icb.usp.br). This study showed that 34.8% of the patients have had GPGR variants and 22.8% GWGR. In addiction, statistical analysis using Goodman's Test showed GWGR prevailed in asymptomatic patients with NSI strains... (Complete abstract click electronic access below)
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