O gênero Proteus é caracterizado pela rápida mobilidade, fenômeno denominado swarming . Quanto à homologia de seu DNA, apresenta apenas uma discreta relação com o da Escherichia coli. Freqüentemente relacionado com infecções urinárias, facilitadas pela sua capacidade em degradar uréia, tem sido encontrado colonizando cateteres e sondas vesicais, principalmente a espécie Proteus mirabilis. Devido a sua crescente importância na prática clínica, tanto como agente infeccioso de difícil erradicação, quanto como microrganismo com possibilidade de produzir β-lactamases de espectro expandido, seu controle no ambiente hospitalar tornou-se essencial. A necessidade da correta identificação dessa bactéria estimulou com que métodos de identificação molecular sejam constantemente estudados e aprimorados para essa finalidade. Métodos baseados em PCR têm se mostrado úteis, mas precisam ser validados para a rotina laboratorial. Diversos fatores de patogenicidade, ou seja, características biológicas de Proteus que favorecem a sua participação em processos infecciosos têm sido identificados, tais como: a capacidade de mobilidade e fixação celular, produção de protease, urease e hemolisina. Diversos autores inferem que a correta co-regulação desses fatores de virulência durante a diferenciação de swarming está relacionada com a capacidade de colonizar e invadir o tecido do hospedeiro. Vários estudos sugerem que extratos vegetais podem ser importantes produtos no controle de P. mirabilis ao interferir em sinais de quorum sensing , e consequentemente, na diferenciação celular e expressão de fatores de virulência. Neste sentido, os terpenos, compostos presentes em óleos essenciais, podem representar uma alternativa viável no controle de infecções por esses microrganismos. As proteases microbianas vêm se destacando como importantes fatores de virulência devido a ação direta sobre proteínas do hospedeiro, particularmente imunoglobulinas. O estudo em P. mirabilis tem sido focalizado na protease ZapA (mirabilisina), enzima capaz de degradar IgA, IgG, entre outras proteínas. Trabalhos relatam que não somente ZapA é regulada durante o swarming , mas também hemolisinas, fatores ligados à diferenciação celular e hiperprodução do flagelo. Assim sendo, na presente tese foram avaliados distintos sistemas via PCR (RAPD, ERIC-PCR, REP-PCR, BOX-PCR e ISSR) para caracterização molecular de isolados clínicos de P. mirabilis, o efeito de monoterpenos sobre a diferenciação celular e a produção de fatores de patogenicidade dessas bactérias, e realizado um estudo bioinformático sobre o complexo de metaloproteases com base no recentemente publicado genoma de P. mirabilis. / O gênero Proteus é caracterizado pela rápida mobilidade, fenômeno denominado swarming . Quanto à homologia de seu DNA, apresenta apenas uma discreta relação com o da Escherichia coli. Freqüentemente relacionado com infecções urinárias, facilitadas pela sua capacidade em degradar uréia, tem sido encontrado colonizando cateteres e sondas vesicais, principalmente a espécie Proteus mirabilis. Devido a sua crescente importância na prática clínica, tanto como agente infeccioso de difícil erradicação, quanto como microrganismo com possibilidade de produzir β-lactamases de espectro expandido, seu controle no ambiente hospitalar tornou-se essencial. A necessidade da correta identificação dessa bactéria estimulou com que métodos de identificação molecular sejam constantemente estudados e aprimorados para essa finalidade. Métodos baseados em PCR têm se mostrado úteis, mas precisam ser validados para a rotina laboratorial. Diversos fatores de patogenicidade, ou seja, características biológicas de Proteus que favorecem a sua participação em processos infecciosos têm sido identificados, tais como: a capacidade de mobilidade e fixação celular, produção de protease, urease e hemolisina. Diversos autores inferem que a correta co-regulação desses fatores de virulência durante a diferenciação de swarming está relacionada com a capacidade de colonizar e invadir o tecido do hospedeiro. Vários estudos sugerem que extratos vegetais podem ser importantes produtos no controle de P. mirabilis ao interferir em sinais de quorum sensing , e consequentemente, na diferenciação celular e expressão de fatores de virulência. Neste sentido, os terpenos, compostos presentes em óleos essenciais, podem representar uma alternativa viável no controle de infecções por esses microrganismos. As proteases microbianas vêm se destacando como importantes fatores de virulência devido a ação direta sobre proteínas do hospedeiro, particularmente imunoglobulinas. O estudo em P. mirabilis tem sido focalizado na protease ZapA (mirabilisina), enzima capaz de degradar IgA, IgG, entre outras proteínas. Trabalhos relatam que não somente ZapA é regulada durante o swarming , mas também hemolisinas, fatores ligados à diferenciação celular e hiperprodução do flagelo. Assim sendo, na presente tese foram avaliados distintos sistemas via PCR (RAPD, ERIC-PCR, REP-PCR, BOX-PCR e ISSR) para caracterização molecular de isolados clínicos de P. mirabilis, o efeito de monoterpenos sobre a diferenciação celular e a produção de fatores de patogenicidade dessas bactérias, e realizado um estudo bioinformático sobre o complexo de metaloproteases com base no recentemente publicado genoma de P. mirabilis.

The identification of antimicrobial compounds that inhibit multidrug-resistant (MDR) bacteria continues to be a significant area of research to combat the public health threat posed by MDRs. Pseudomonas aeruginosa (PA) is a Gram-negative, MDR bacterium found within both the environment and healthcare settings. Our laboratory has observed another Gram-negative bacterium, Proteus species, exerts an interesting polymicrobial interaction with Pseudomonas aeruginosa by compromising the quorum sensing (QS) factor, pyocyanin. Production of pyocyanin by Pseudomonas is a main method the bacterium uses for communication and coordination of virulence. In this study, we examined Proteus mirabilis (PM) and Proteus vulgaris (PV13) effectiveness to compromise pyocyanin production in Pseudomonas aeruginosa. Through the use of pyocyanin isolation and extraction techniques, data was gathered for Pseudomonas aeruginosa’ s molecular interaction with the two Proteus bacteria described. Further observations were made on microbial interaction between Pseudomonas aeruginosa and Proteus mirabilis through measuring the rate of metabolic activity, twitching motility rate, and observing differences in biofilm formation. Using the data obtained from this research, we hope to identify new methods of controlling Pseudomonas virulence and infection by inhibiting its ability to communicate and coordinate in polymicrobial infections.

Methylglyoxal synthetase, which catalyzes the formation of methylglyoxal and inorganic phosphate from dihydroxyacetone phosphate, was found in extracts of Proteus vulgaris. An efficient purification procedure utilizing ion exchange column chromatography and isoelectric focusing has been developed. Homogeneity of the enzyme preparation was confirmed by polyacrylamide gel electrophoresis and rechromatography.Two components of methylglyoxal synthetase were obtained upon isoelectric focusing. A comparison of the chemical and physical properties of the two components was carried out. The enzyme is a dimer. In the presence of inorganic phosphate, the hyperbolic saturation kinetics with dihydroxyacetone phosphate are shifted to sigmoidal.

ITC/USA 2015 Conference Proceedings / The Fifty-First Annual International Telemetering Conference and Technical Exhibition / October 26-29, 2015 / Bally's Hotel & Convention Center, Las Vegas, NV / This paper describes the methodology and the results of the interferences analysis that the JASON3 spacecraft has to deal with, as part of the PROTEUS platform series, sharing frequencies, modulation schemes and ground network.

Thesis (Ph. D.)--Illinois State University, 1973. / Title from title page screen, viewed Oct. 14, 2004. Dissertation Committee: William L. Daniel (chair), Herman E. Brockman, David F. Weber, Arlan Richardson, Howard Hetzel. Includes bibliographical references (leaves 53-66) and abstract. Also available in print.

Studien har undersökt om rörelsesättet hos en underförstådd arketyp kan påverka sättet en spelare interagerar med en virtuell miljö. För att ta reda på detta skapades ett spel som kan spelas i två olika versioner där avatarens rörelsesätt är den enda skillnaden. Data samlades in via enkät och via spelet som skapats. Resultatet antyder att spelaren anpassar sitt beteende efter sättet som avataren rör sig. Detta belyser även hur man kan utnyttja arketyper för att fömedla avatarens personlighet och dispositioner.

The identification of antimicrobial compounds that inhibit multidrug-resistant (MDR) bacteria continues to be a significant area of research to combat the public health threat posed by MDRs. Pseudomonas aeruginosa is a Gram-negative, MDR bacterium found within both the environment and healthcare settings. Our laboratory has observed another Gram-negative bacterium, Proteus species, exerts an interesting polymicrobial interaction with Pseudomonas aeruginosa by potentially compromising the quorum sensing (QS) factor, pyocyanin, of Pseudomonas aeruginosa. Production of pyocyanin by Pseudomonas is the main method the bacterium uses for communication and coordination of virulence. In this study, we examined the effectiveness of Proteus mirabilis and Proteus vulgaris to compromise pyocyanin production in Pseudomonas aeruginosa. Through the use of pyocyanin isolation and extraction techniques, data was gathered for Pseudomonas aeruginosa’ s molecular interaction with the two Proteus species of bacteria. Further observations were made on microbial interaction between Pseudomonas aeruginosa and Proteus mirabilis through measuring the rate of metabolic activity, twitching motility rate, and observing differences in biofilm formation. Using the data obtained from this research, we hope to identify new methods of controlling Pseudomonas virulence and infection by inhibiting its ability to communicate and coordinate in polymicrobial infections

Denna studie har sin grund i begreppet Proteus-effekten (Yee & Bailenson 2007). I artikeln finner författarna att digitala avatarers utseende påverkar våra interaktioner i den virtuella miljön. I stället för avatarens påverkan på interaktioner undersöks i den här studien dess påverkan på prestation. Det skapades en prototyp av en FPS (First person shooter). Fokus ligger på avataren, i första hand dess rörelser. Animationerna återspeglar antingen skickliga eller fumliga rörelser. Under skapandeprocessen tillämpades Isbisters rekommenderade designmetod (Isbister 2006), samt Labans rörelseramverk (LMA) (Newlove & Dalby 2004). 12 testdeltagare spelade artefakten och svarade på en enkät. Således var studien av kvantitativ karaktär. Deltagare som tillgick skickliga animationer presterade bättre. De hade kortare speltid och högre träffsäkerhet, därtill nyttjades fler taktiska omladdningar. Resultatet är dock inte generaliserbart beroende på samlingen deltagare i den här studien. Framtida studier kan undersöka Proteus-paradoxen, och undersöka vad som sker om deltagaren själv får välja avatarens grafik.

Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

Complex diseases are multifactorial, driven by genomic and environmental perturbations that cause cellular and organ dysfunctions. Cells in diseased organs are strongly coupled with their surroundings. Thus, uncovering the interactions between various cells provides insight into how they adapt to the environment, respond to stimuli, and progress to malignancy. Current technologies in engineered tissues, high-resolution images, single-cell analysis, and spatially resolved transcriptomics have shown the capability to model diseases and characterize morphologic and genomic features with desired resolutions. Meanwhile, machine learning is emerging as a powerful tool for analyzing these large-scale biomedical data and unraveling the complexity of disease mechanisms. However, the capability of engineered tissues in modeling cell- cell interaction, thus leading to disease malignancy, remains unknown due to the challenges of multi-modal biomedical data integration.I explored intercellular interactions through engineered tissues and computational models in this dissertation. I first studied two diseases by modeling the vascular structure and functions through blood vessel organoids, namely 22q11.2 Deletion syndrome and Proteus syndrome, which are associated with vascular disorders. The integration of imaging and single-cell transcriptomic analysis unravels the disease mechanisms relating to the dysfunction of fibroblasts secreting extracellular matrix and affected endothelial-mural cell interaction. I further extended the study of cell-cell interaction to spatially-resolved transcriptomics. By developing an end-to-end deep generative model with the integration of spatial transcriptomics and histology, I identified that spatial heterogeneity in the tumor microenvironment and different cell interactions distinguishes metaplastic breast cancers from other triple-negative breast cancers. Moreover, I investigated the integration of theoretical physics models, single-cell transcriptomic data, and statistical machine learning to interpret the interaction between mesenchymal stem cells and cancer cells for potential strategies of cancer cell therapy.