Recent software developments are reviewed from the vantage point of reproducible econometric research. We argue that the emergence of new tools, particularly in the open-source community, have greatly eased the burden of documenting and archiving both empirical and simulation work in econometrics. Some of these tools are highlighted in the discussion of three small replication exercises. / Series: Research Report Series / Department of Statistics and Mathematics

The Micro-Raman scattering technique has been used for the study of GaN and ZnO. Capabilities of the Raman technique and existing literature on Raman spectroscopy in GaN and ZnO are reviewed. About 50 GaN and ZnO samples with a wide range of properties are studied. From the analysis of positions of the E2H and A1(LO) phonon modes, biaxial stress and plasmon coupling of the Al(LO) mode are observed and compared to a bulk GaN sample. The stress-related shift rate for the AI(LO) mode in hexagonal GaN is established to be 2.7 ± 0.4 cm-1/GPa through series of GaN with low free carrier concentration. Bulk ZnO and ZnO layers grown on sapphire have been studied, and no biaxial stress is found in ZnO layers. Doping and impurity modes resulted in disorder-activated scattering in ZnO. The choice of the laser for study of GaN and ZnO layers on sapphire substrate is discussed.

In a recent article, Bai and Perron (2003, Journal of Applied Econometrics) present a comprehensive discussion of computational aspects of multiple structural change models along with several empirical examples. Here, we report on the results of a replication study using the R statistical software package. We are able to verify most of their findings; however, some confidence intervals associated with breakpoints cannot be reproduced. These confidence intervals require computation of the quantiles of a nonstandard distribution, the distribution of the argmax functional of a certain stochastic process. Interestingly, the difficulties appear to be due to numerical problems in GAUSS, the software package used by Bai and Perron. / Series: Research Report Series / Department of Statistics and Mathematics

Contexto: O objetivo do estudo foi avaliar a reprodutibilidade intra e interobservador da versão acetabular e femoral da prótese total de quadril. Materiais e métodos: estudo prospectivo incluindo 101 indivíduos submetidos a prótese total de quadril, sendo 114 quadris desde 2008, com imagens de tomografia computadorizada incluindo os componentes acetabular e femoral da prótese e os côndilos femorais. Resultados: Para avaliação intraobservador o coeficiente de correlação interclasse foi para o observador A de 0.99 para versão acetabular e femoral com intervalo de confian- ça (IC) de 0.98-1.00, para o observador B de 0.98 para versão acetabular (IC de 0.97- 0.99) e de 0.88 para versão femoral (IC de 0.83-0.92), para o observador C de 0.98 para versão acetabular (IC de 0.97-0,99) e de 0.83 para versão femoral (IC de 0.76-0.88). Para avaliação interobservador o coeficiente de correlação interclasse foi calculado com as medidas da primeira leitura de cada observador e em seguida da segunda leitura, sendo a primeira leitura da versão acetabular de 0.99 (IC de 0.98-1.00), a segunda leitura da versão acetabular de 0.99 (IC de 0.98-1.00), a primeira leitura da versão femoral de 0.99 (IC de 0.98-1.00), a segunda leitura da versão femoral de 0.96 (IC de 0.94-0.97). Conclusão: Com os resultados obtidos, podemos concluir que as medidas tomográficas de versão acetabular possuem excelente reprodutibilidade tanto inter quanto intraobservador, as medidas de femoral possuem excelente reprodutibilidade interobservador e de boa a excelente reprodutibilidade intraobservador. / Context: The objective of the study was to evaluate the reproducibility intra e interobserver of acetabular and femoral version after total hip arthroplasty. Materials and methods: prospective studying including 101 individuals after total hip arthroplasty, 114 hips since 2008, with computed tomography images including the components of acetabular and femoral prothesis and the femoral condyle. Results: intra-observer coefficient of interclass correlation was 0.99 for observer A for acetabular and femoral version (IC of 0.98-1.00), for B 0.98 for acetabular version (IC of 0.97-0.99) and 0.88 for femoral version (IC of 0.83-0.92), for C 0.98 for acetabular version (IC of 0.97-0.99) and 0.83 for femoral version (IC of 0.76-0.88). For inter-observer evaluation, the interclass correlation coefficient was calculated with the measurements of the first reading of each observer and the second reading, the first reading of the acetabular version was 0.99 (IC of 0.98-1.00), the second reading of the acetabular version was 0.99 (CI 0.98-1.00), the first reading of the femoral version was 0.99 (CI of 0.98-1.00), the second reading of the femoral version was 0.96 (CI of 0.94- 0.97). Conclusion: With the results obtained, we can conclude that the tomographic measurements of acetabular version have excellent inter- and intraobserver reproducibility, femoral measurements have excellent interobserver reproducibility and good to excellent intraobserver reproducibility.

Introdução: A avaliação da dieta habitual do adolescente é complexa devido às variações intra e interindividuais. Os estudos de validação e reprodutibilidade de questionários de freqüência alimentar são necessários para garantir a utilização de instrumentos capazes de mensurar a dieta habitual real. Objetivo: Desenvolver, verificar a validade e reprodutibilidade de um questionário de freqüência alimentar baseado nos grupos alimentares da pirâmide alimentar para adolescentes (QFA-PA). Materiais e métodos: Após a identificação dos alimentos a serem incluídos no QFA-PA, o método foi testado em estudo piloto. A versão final consistiu em 50 itens alimentares. O estudo foi realizado com 109 adolescentes de ambos os gêneros durante um período de quatro meses. Para verificar a validade e reprodutibilidade do QFA-PA foram aplicados quatro Recordatórios de 24h (Rec24h) e dois QFA-PA. A validade foi obtida pela comparação entre o segundo QFA-PA e à média dos Rec24h. A reprodutibilidade foi mensurada por meio da comparação dos dois QFA-PA. Resultados: O questionário desenvolvido representou 97,7% das calorias consumidas e pelo menos 90% da ingestão dos nutrientes selecionados. Foram incluídos os alimentos freqüentemente relatados ausentes no QFA e freqüentemente relatados sem maior contribuição energética. As variáveis melhor avaliadas foram os grupos do arroz, pão, massa, batata e mandioca; das carnes e de açúcares e doces. Os piores resultados foram observados para a vitamina C. Cabe ressaltar que este é o primeiro QFA desenvolvido, validado e acurado no Brasil para adolescentes que avalia o consumo alimentar baseado na pirâmide dos alimentos dos adolescentes. Conclusão: Considerando-se as análises realizadas, o QFA-PA apresentou validade satisfatória e reprodutibilidade aceitável para a maioria das variáveis. / Introduction: The assessment of habitual diet of adolescent is complex due to within and between-person variations. The studies of validity and reproducibility of food frequency questionnaire (FFQ) are needed to ensure the use of reliable and accurate instruments capable of measure usual diet. Objective: To develop, verify the validity and reproducibility of a food frequency questionnaire based on the food groups of food pyramid for adolescents (FFQ-PA). Methods: After identify the items to be included in the FFQ-PA, the method was tested in a pilot study. The final version consisted of 50 food items. The study was conducted with 109 adolescents of both genders over a period of four months. To check the validity and reproducibility of the FFQ-PA were applied four 24-hour records (Rec24h) and two FFQ-PA. The validity was obtained by comparing the second FFQ-PA and average Rec24h. The reproducibility was measured by comparing the two FFQ-PA. Results: The questionnaire represented 97,7% of the calories consumed by the population and at least 90% of the intake of selected nutrients. We included food often reported missing in the FFQ and the frequently reported without further energy contribuition. In the study of validity and reproducibility, the variables were evaluated further groups of rice, bread, pasta, potatoes and cassava, meat and sugar and sweets. The worst results were observed for vitamin C. It is noteworthy that this is the first FFQ developed, validated and accurate in Brazil for adolescents that assesses food consumption based on the adolescent food pyramid. Conclusion: Considering the analysis, the FFQ-PA showed satisfactory validity and reproducibility acceptable for most variables.

O objetivo primário deste estudo foi avaliar a reprodutibilidade inter-examinador, na mensuração da pressão intravaginal em gestantes. Participaram do estudo 41 gestantes baixo risco com capacidade de contrair voluntariamente os MAP. Os MAP (músculos do assoalho pélvico) foram avaliados quanto a sua capacidade de contração por meio da palpação vaginal , e em seguida com uso do perineômetro Peritron®. Foram realizadas três contrações máximas com intervalo de descanso entre cada contração de 10 segundos. As avaliações foram realizadas por dois examinadores distintos e cegos em relação aos resultado da avaliação do outro, em dois dias alternados, com intervalo entre as avaliações de 2 a 7 dias, mantendo o mesmo horário entre as avaliações. As gestantes tinham idade entre 18 e 41 anos (26,07±5,69), índice de massa corpórea (IMC) entre 18,32 e 43,43 Kg/m² (26,46±5,77), com paridade entre 0 e 8 partos (1,09±1,65). Na análise estatística foi utilizado Coeficiente de Correlação de Concordância (CCC) para as medidas entre avaliadores e os limites de concordância de Bland e Altman foram utilizados para observar a concordância. Para medir a reprodutibilidade intra-sessão das três medidas para cada avaliador foi utilizado o Coeficiente de Correlação Intraclasse (ICC). Os resultados foram interpretados de acordo com a seguinte classificação: valores abaixo de 0,50 foram considerados de reprodutibilidade pobre, valores 0,50 a 0,75 foram considerados como moderada reprodutibilidade e valores acima de 0,75 foram considerados de boa reprodutibilidade. Foram encontradas boa concordância nas medidas interexaminadores entre os valores da média do pico no período gestacional (0,81) e essa concordância também ocorreu quando os trimestres foram analisados distintamente (0,81, 0,78, 0,86 para primeiro, segundo e terceiro trimestre respectivamente). Quanto a variável pico de contração os resultados mostraram uma concordância que variou de moderada à boa, para a análise das aferições separadamente, com valores que variaram de 0,54 à 0,88. Já as variáveis média e duração da contração apresentaram valores irregulares. A reprodutibilidade das medidas intra-sessão para a variável pico, para o primeiro, segundo, terceiro trimestre gestacional e para o período gestacional geral mostraram valores de concordância moderada para o avaliador 1 (0,72, 0,75, 0,78, 0,74 respectivamente) e valores de forte concordância para o avaliador 2 (0,95, 0,93, 0,97, 0,94 respectivamente). O presente estudo concluiu que o perineômetro é um método com boa reprodutibilidade inter-examinador para avaliar os músculos do assoalho pélvico (MAP) durante o período gestacional, quando as variáveis de média do pico da contração e pico da contração são utilizadas. Esse estudo não encontrou diferença entre os trimestres gestacionais, sugerindo que a reprodutibilidade da média do pico de contração e pico de contração do AP utilizando-se o perineometro Peritron é variável de moderada a boa. / The primary objective of this study was to evaluate the inter-examiner reproducibility in the measurement of intravaginal pressure in pregnant women. The study included 41 low-risk pregnant women. The ability to contract PFM (pelvic floor muscles) was assessed using vaginal palpation and the PFM strength was measured using the perineometer Peritron. Three maximal contractio ns were performed with an interval of rest between each contraction of 10 seconds. The evaluations were performed by two different examiners who were blinded to each evaluation result of the other, on two alternate days, with an interval between assessment s 2-7 days keeping the same time between assessments. The women were aged between 18 and 41 years (26.07 ± 5.69), body mass index (BMI) between 18.32 and 43.43 kg / m² (26.46 ± 5.77), with parity 0 births and 8 (1.09 ± 1.65). For statistical analysis we used the concordance correlation coefficient (CCC) for measurements between examiners. Bland and Altman limits of agreement was used in the analysis. To measure the intra-session reproducibility of the three measures for each examiner the intraclass correlation coefficient (ICC) was used. The results were interpreted according to the following classification: values below 0.50 were considered poor reproducibility, values from 0.50 to 0.75 were considered moderate reproducibility and values above 0.75 were considered good reproducibility. It was found a good concordance of inter-examiner between the values of mean peak during pregnancy (0.81) and this correlation also occurred when the gestational trimesters were analyzed distinctly (0.81, 0.78, 0.86 for first, second and third trimester respectively). As for variable peak contraction results showed a concordance ranging from moderate to good, for the analysis of the measurements separately, with values ranging from 0.54 to 0.88. The average and durati on of contractions showed irregular values . The reproducibility of intra-session measures for the variable peak, for the first, second, and third trimester of pregnancy for general values showed moderate agreement for evaluator 1 (0.72, 0.75, 0.78, 0 , 74 respectively) and values of concordance for evaluator 2 (0.95, 0.93, 0.97, 0.94 respectively). This study concluded that perineometer is a method with good reproducibility inter -examiner to evaluate the pelvic floor muscles during pregnancy, when th e variables of mean peak contraction and peak contraction are used. This study found no difference between gestational trimesters, suggesting that interrater reproducibility of of mean peak contraction and peak contraction of PFM using Peritron perineomet er is variable from moderate to good.

Objetivo: verificar a aplicabilidade, reprodutibilidade e validade do SCIM III nos pacientes com paraparesia espástica. Método: estudo transversal incluindo 30 sujeitos (66% mulheres; 41,5±14,7 anos) com paraparesia espástica de etiologia genética, infecciosa ou a esclarecer que foram avaliados pela análise computadorizada da marcha, versão brasileira da SCIM III (0-100 pontos), MIF (18-126 pontos), por 2 examinadores (A e B) no mesmo dia e 1 semana depois (A). Resultados: o coeficiente de correlação intraclasse (CCI) para o uso da SCIM III indicou boa reprodutibilidade intra e inter-examinadores (CCI=0,9). A correlação de Spearman entre a SCIM III e a parte motora da MIF foi considerada adequada e estatisticamente significante (Spearman=0,6; p=0,001). A correlação entre as subescalas da SCIM III e os domínios da MIF foi considerada forte e significante para auto-cuidado (Spearman=0,8; p0,001) e moderada para transferências (Spearman=0,6; p=0,0005) e locomoção (Spearman=0,6; p=0,0006). A subescala mobilidade da SCIM III mostrou correlação positiva e significante para cadência (Spearman=0,8; p0,001), velocidade da marcha (Spearman=0,7; p0,001) e comprimento do passo (Spearman=0,6; p0,001). Conclusões: A SCIM III é um instrumento de avaliação funcional reprodutível intra e inter examinadores e capaz de avaliar o nível de independência dos indivíduos com paraparesia espástica. O SCIM III é mais sensível que a MIF, especialmente para pacientes com maior independência. Cadência, velocidade de marcha e comprimento do passo se correlacionaram com a subescala mobilidade / Purpose: to verify the applicability, reproducibility, and validity of the SCIM III patients with non-traumatic spastic paraplegia. Method: The cross-sectional study included 30 subjects (66% females; 41.5 ± 14.7 y) older with spastic paraparesis of any etiology were assessment by computerized gait analysis and with the Brazilian versions of SCIM III (0-100 points), FIM (18-126 points) by 2raters (A and B) at the same day and 1 week later (A). Results: The intraclass correlation coefficient (ICC) for the use of SCIM III indicated good intra and inter-evaluator reproducibility (ICC = 0.9). Correlation between the SCIM III and the motor FIM was appropriate (Spearman=0.6; p0.001). SCIM III subscales and the FIM domains correlated strongly for self-care (Spearman=0.8; p0.001), moderately for transfers (Spearman=0.6; p=0.0005) and locomotion (Spearman=0.6; p=0.0006). SCIM III mobility subscale positively correlated with the cadence (Spearman=0.8; p0.01), gait speed (Spearman=0.7; p0.01), and step length (Spearman=0.6;p0.01). Conclusions: SCIM III is a reproducible functional assessment instrument and capable of evaluating the level of independence of the individual with spastic paraplegia. The SCIM III is more sensitive than the FIM for non-traumatic spastic paraplegic patients with higher levels of independence. Linear gait parameters correlated with its mobility subscale.

Introdução: O consumo adequado de frutas, verduras e legumes (FVL) durante a gestação apresenta impacto positivo sobre a saúde da mulher e da criança. Os fatores ambientais associados ao comportamento alimentar vêm recebendo destaque no âmbito da saúde pública por afetar diretamente a saúde dos indivíduos. Entretanto, desconhecemos a existência de estudos que investigaram a relação entre a percepção do ambiente alimentar e o consumo de frutas e hortaliças em gestantes. Objetivo: Verificar a reprodutibilidade de um questionário sobre a percepção do ambiente alimentar e para o consumo de frutas e hortaliças em gestantes (manuscrito 1) e avaliar a relação entre a percepção do ambiente alimentar e o consumo de frutas e hortaliças em gestantes (manuscrito 2). Metodologia: O estudo de reprodutibilidade (manuscrito 1) foi conduzido em 2010 entre 48 gestantes usuárias do serviço público de saúde de Ribeirão Preto, SP. O questionário é composto por 12 questões de múltipla escolha que incluem a percepção do ambiente alimentar e para o consumo de frutas e hortaliças. Para verificação da reprodutibilidade, o questionário foi aplicado em duplicata, com intervalo entre 15 e 45 dias. A concordância entre as respostas foi avaliada por meio do teste de Kappa ponderado ou Kappa. A relação entre a percepção do ambiente alimentar e o consumo de frutas e hortaliças em gestantes (manuscrito 2) foi avaliada empregando-se os dados de um estudo transversal, conduzido em 2012, entre 282 gestantes adultas. O consumo de FVL foi avaliado por meio de um questionário de freqüência alimentar (QFA) , e dois recordatórios de 24 horas. O Multiple Source Method foi utilizado para estimar o consumo usual de FVL. A percepção do ambiente alimentar foi avaliada mediante a aplicação de questionário estruturado. Para a investigação da relação entre a as variáveis da percepção do ambiente alimentar e consumo adequado de FVL (400g/dia), modelos de regressão logística [OR (95% IC)] foram empregados ajustados por escolaridade, idade e classe econômica das gestantes. Resultados: No manuscrito 1, verificou-se a reprodutibilidade do questionário sobre a percepção do ambiente alimentar e para o consumo de frutas e hortaliças em gestantes. Concordância forte (Kappa entre 0,6 e 0,79) para: número de refeições ao dia, hábito de se alimentar no local de trabalho, distância entre a residência e local de aquisição de FVL e qualidade de FVL no local de aquisição. Concordância moderada (Kappa entre 0,4 e 0,59): hábito de se alimentar fora do domicílio, em restaurantes do tipo self-service ou por quilo, em lanchonetes, se adquire alimentos em mercearias, lojas de conveniência ou padaria, motivo da escolha do local para aquisição de FVL, variedade de FVL no local de aquisição e apoio familiar para ter uma alimentação saudável. Concordância fraca (Kappa entre 0,2-0,39): freqüência em que faz refeições na casa de amigos/ parentes, freqüência em que adquire alimentos em supermercados e varejão ou feira livre e percepção em relação ao preço de FVL. As questões que obtiveram concordância fraca foram reformuladas previamente a sua utilização. No manuscrito 2 observou-se que 35% das mulheres estudadas reportaram o Resumo consumo adequado de frutas e hortaliças durante a gestação, não encontrando uma associação direta entre a percepção do ambiente alimentar e o consumo adequado de frutas e hortaliças entre elas. Entretanto, as gestantes que relataram ter o hábito de fazer quatro ou mais refeições ao dia apresentaram maior chance de consumir a quantidade adequada de furtas e hortaliças quando comparadas àquelas que relataram menor número de refeições ao dia [OR 2.01 (95% IC 1.03, 3.91) p 0.04]. Da mesma forma, as mulheres que referiram o hábito de comprar FVL em varejão ou feira livre apresentaram maior chance de atingir a recomendação de frutas e hortaliças, independente de idade, escolaridade e classe socioeconômica [OR 1.68 (IC95% 1.01, 2.80) p 0.05]. Conclusão: O questionário sobre a percepção do ambiente alimentar e para o consumo de FVL apresentou boa precisão entre gestantes. Não houve associação entre a percepção do ambiente alimentar e o consumo de frutas e hortaliças entre as gestantes estudadas. / Introduction: The adequate intake of fruits and vegetables (FV) during pregnancy has a positive impact on the health of women and children. Environmental factors associated with eating behavior have received attention in the context of public health by directly affecting individuals health. However, unaware of the existence of studies that investigated the relationship between self perceived food environment and fruit and vegetable intake in pregnant women. Objective: To evaluate the reliability of a self perceived questionnaerie about the food environment and for the consumption of fruit and vegetable in pregnant women (manuscript 1). To evaluate the relationship between self perceived food environment and the adequate consumption of fruits and vegetables in pregnant women (manuscript 2). Methods: The study was conducted in 2010 among 48 pregnant women attended by the public health service of Ribeirão Preto, SP. The questionnaire consists of 12 multiple choice questions which include the perception of the food environment and consumption of FV. To investigate the reproducibility of the questionnaire, it was administered twice, between 15 and 45 days apart. The agreement between the responses was assessed using the Kappa or Kappa weighted (manuscript 1). A cross-sectional study was conducted in 2012 among 282 adult pregnant women. Fruit and vegetable intake during pregnancy was assessed by a food frequency questionnaire, and 2 dietary recalls. The Multiple Source Method approach was applied to estimate usual FV intake. Self perceived food environment was assessed by a structured questionnaire. For the present analysis, we examined the association of self perceived food environment and the adequate intake of fruit and vegetable (400g/daily) in logistic regression models [OR (95% CI)], adjusted by maternal age, socioeconomic class, and educational level (manuscript 2). Results: Manuscript 1 describes the reliability of a self perceived questionnaire about the food environment and for the consumption of fruits and vegetables in pregnant women. There was strong agreement (Kappa: 0,6 to 0,79) for: meals per day, habit of eating at work, distance between the residence and places to purchase fruit and vegetable, quality of fruit and vegetable at the purchase place. Moderate agreement (Kappa 0,4 to 0,59): habit of eating out of home, habit of eating in self service restaurant, habit of eating in fast food restaurant, purchase food at grocery stores, convenience stores or bakery, variety of fruits and vegetables available and family support for healthy eating. Weak agreement (Kappa 0,2 to 0,39): habit of eating in friends or family house, purchase food at supermarket or FV specialized food market and perception of FV price. All the questions that had weak agreement were reformulated prior to use it. The manuscript 2 showed that 35% of the women intervied reported adequate intake of FV during pregnancy, with no association between self perceived food environment and adequate FV intake. However, a higher meal frequency was associated with a better chance of daily adequate intake of fruit and vegetable [OR 2.01 (95% CI 1.03, 3.91) p 0.04]. Moreover, the habit of buying fruit and vegetable in Abstract specialized food market was associated with the daily intake of 400g of fruit and vegetable [OR 1.68 (IC95% 1.01, 2.80) p 0.05]. Conclusion: The questionnaire of the perceived food environment and for the consumption of fruits and vegetables showed good precision among pregnant women. No association between self-perceived food environment and the adequate intake of FV among pregnant women was found.

A Biologia Computacional tem desenvolvido algoritmos aplicados a problemas relevantes da Biologia. Um desses problemas é a Protein Structure Prediction (PSP). Vários métodos têm sido desenvolvidos na literatura para lidar com esse problema. Porém a reprodução de resultados e a comparação dos mesmos não têm sido uma tarefa fácil. Nesse sentido, o Critical Assessment of protein Structure Prediction (CASP), busca entre seus objetivos, realizar tais comparações. Além disso, os sistemas desenvolvidos para esse problema em geral não possuem interface amigável, não favorecendo o uso por não especialistas da computação. Buscando reduzir essas dificuldades, este trabalho propões o Koala, um sistema baseado em uma plataforma web, que integra vários métodos de predição e análises de estruturas de proteínas, possibilitando a execução de experimentos complexos com o uso de fluxos de trabalhos. Os métodos de predição disponíveis podem ser integrados para a realização de análises dos resultados, usando as métricas RMSD, GDT-TS ou TM-Score. Além disso, o método Sort by front dominance (baseado no critério de optimalidade de Pareto), proposto nesse trabalho, consegue avaliar predições sem uma estrutura de referência. Os resultados obtidos, usando proteínas alvo de artigos recentes e do CASP11, indicam que o Koala tem capacidade de realizar um conjunto relativamente grande de experimentos estruturados, beneficiando a determinação de melhores estruturas de proteínas, bem como o desenvolvimento de novas abordagens para predição e análise por meio de fluxos de trabalho. / Computational Biology has developed algorithms applied to relevant problems from Biology. One of these probems is Protein Structure Prediction (PSP). Several methods have been developed on the liteture to deal with this problem. However, the reproduction of results and the comparison of the methods have not been an easy task. Accordingly, the Critical Assessment of protein Structure Prediction (CASP), has among his objectives, perform these comparisons. Besides, the developed systems for this problem have low usability, not benefiting the investigation of various methods by non experts. In order to minimize those difficulties, this project proposes Koala, a web-based system that integrates several algorithms applied to PSP and analysis, allowing the execution of complex experiments by using workflows. The prediction methods can be integrated to perform some analysis of the results, by using the RMSD, GDT-TS and TM-Score metrics. Moreover, the Sort by front dominance method (based on the criterion of Pareto optimalidad), proposed on this work, can evaluate predictions with no reference structure. The results obtained, using target proteins from recent articles and CASP11, indicate that Koala has the capability to execute a relatively large set of organized experiments, benefiting determining of better protein structures, as well as the development of new approaches for prediction and analysis through workflows.

O objetivo deste estudo foi verificar a confiabilidade do método de avaliação postural usandose o Software de Avaliação Postural SAPO que consiste em um programa de avaliação por meio de fotografias digitais baseando-se nos princípios da fotogrametria computadorizada. Para isso, 20 escolares com idade 8,3 ± 0,8 anos de idade foram fotografados na vista anterior, lateral direita, lateral esquerda e posterior. Foram demarcados, sobre a pele dos sujeitos, pontos que normalmente são utilizados na avaliação postural, propostos pelo protocolo SAPO. A partir desses pontos, foi realizada a análise de diferentes ângulos pelo Software de Avaliação Postural SAPO. Na análise intraexaminador, as mesmas fotos foram avaliadas por um único examinador, duas vezes com um intervalo de um mês entre elas. Para a análise interexaminadores, três profissionais diferentes avaliaram as fotografias, e os resultados foram comparados. O método utilizado para comparação dos resultados intra e interexaminadores foi o coeficiente de correlação intraclasse. Os resultados mostraram que o SAPO pode ser considerado uma ferramenta confiável para avaliar a postura em escolares, pois a maioria dos ângulos analisados, tanto na análise intra como interexaminadores, apresentou-se confiável. Dos ângulos estatisticamente confiáveis, houve alguns ângulos com baixo nível de confiabilidade, sendo os principais, na vista lateral, referentes ao alinhamento da pelve, da cabeça, do tornozelo e do quadril, e, na vista posterior, os referentes ao ângulo perna e retropé. Portanto, o Software de Avaliação Postural SAPO sugere ser um método confiável para avaliação postural, entretanto necessita de mais estudos a fim de verificar melhor a confiabilidades na vista lateral e posterior, principalmente em ângulos que envolvam as curvaturas vertebrais no plano sagital. / This study aimed to verify the reliability of the postural evaluation method using the Postural Assessment Software SAPO. This software consists of an assessment program with digital photographs, through computerized photogrammetry. Twenty students with 8.3 ± 0.8 years of age were photographed on the anterior, left and right laterals and posterior views. The points usually used for postural assessment, proposed by the SAPO protocol, were marked on the subjects skin. Through these points, the analysis from different angles was done by the Postural Assessment Software SAPO. The intraexaminer analysis was done by one single examiner, who evaluated the same photos twice, in a one-month interval. The interexaminer analysis was done by three different professionals, who evaluated the photographs and had their results compared. The method used for intra- and inter-examiner comparison of results was the intraclass correlation coefficient. Results showed that SAPO can be considered a reliable tool to assess students posture, as in both intra- and inter-examiners analysis most angles were reliable. Among the statistically reliable angles, some had low level of reliability, mostly in the lateral view, regarding the alignment of the pelvis, head, ankle and hips, and in the posterior view, the leg and hindfoot angles. Thus, it is suggested the Postural Assessment Software SAPO is a reliable method for postural assessment. Nevertheless, further studies are needed in order to better verify its reliability in lateral and posterior views, especially in angles involving sagittal plan spinal curvatures.