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Atividade antimicrobiana in vitro dos óleos essenciais de canela da china (cinnamomun cassia), orégano (origanum vulgare), pimenta negra (piper nigrum) e tomilho (thymus vulgaris) branco frente à amostras de Salmonella enterica isoladas de aves / In vitro antimicrobial activity of essential oils of cinnamon (cinnamomun cassia), oregano (Origanum vulgare), thyme (Thymus vulgaris) and black pepper (Piper nigrum) against strains of Salmonella enterica isolated from poultryLaviniki, Vanessa January 2013 (has links)
Infecções por bactérias do gênero Salmonella podem causar doenças em aves levando a perdas produtivas, como, queda de postura, diminuição do ganho de peso e mortalidade. Além disso, os produtos avícolas estão entre as principais causas de toxi-infecções alimentares em humanos. O objetivo deste estudo foi avaliar a atividade antimicrobiana in vitro dos óleos essenciais de Canela da China, Orégano, Pimenta Negra e Tomilho Branco frente a amostras de Salmonella enterica isoladas de aves, bem como comparar as técnicas de disco difusão e microdiluição em caldo. Para avaliar o efeito inibitório dos óleos essenciais no crescimento dos micro-organismos usou-se uma técnica de microdiluição em caldo empregando-se resazurina como indicador de viabilidade celular. Dos quatro óleos testados, apenas a pimenta negra não exibiu efeito inibitório sobre o crescimento das bactérias testadas e o óleo de orégano foi o único que apresentou atividade frente a todas as amostras com valores de concentração inibitória mínima (CIM) variando de 8-1% (v/v). Enquanto que, os óleos de tomilho e canela foram efetivos para 91,3% (42/46) e 80,43% (37/46) das amostras, respectivamente. Os valores de CIM para o tomilho variaram de 8-4% (v/v) e para a canela foram de 8-2% (v/v). Em relação às técnicas, pode-se observar que a técnica de microdiluição em caldo apresentou melhores resultados que a disco difusão, embora seja difícil comparar os resultados devido às características peculiares dos óleos, como a viscosidade, volatilidade e diferente afinidade com a água. Além disso, a microdiluição em caldo nos fornece valores semi-quantitativos, enquanto que o método de disco difusão os resultados são descritos qualitativamente. Embora não se tenha ainda hoje padronizações para avaliar o efeito inibitório dos óleos no crescimento dos micro-organismos, com este estudo podemos observar que os óleos, principalmente orégano, são uma alternativa natural para aplicações na indústria visando a redução de Salmonella nos produtos. / Infections with bacteria of the genus Salmonella can cause disease in poultry leading to production losses, as falling posture, decreased weight gain and mortality. Furthermore, poultry products are among the major causes of human alimentary toxinfections. The aim of this study was to evaluate the in vitro antimicrobial activity of essential oils of cinnamon from China, Oregano, Thyme and Black Pepper White against strains of Salmonella enterica isolated from poultry and compare the techniques disk diffusion and microdilution. To assess the inhibitory effect of essential oils on the growth of micro-organisms used was a broth microdilution technique employing resazurin as an indicator of cell viability. Of the four oils tested, only black pepper showed no inhibitory effect on the growth of bacteria and tested oregano oil was the only one that showed activity against all samples with values of minimum inhibitory concentration (MIC) ranging from 8-1% ( v / v). While the oils of thyme and cinnamon were effective in 91.3% (42/46) and 80.43% (37/46) of samples, respectively. MIC values for the peas ranged from 8-4% (v / v) and cinnamon were 8-2% (v / v). Regarding the techniques, one can observe that the microdilution broth showed better results than disk diffusion, although it is difficult to compare the results due to the peculiar characteristics of oils, as viscosity, volatility, and different affinity for water. Furthermore, the broth microdilution provides semi-quantitative values, while the disk diffusion method results are described qualitatively. Although no standardizations today to evaluate the inhibitory effect of oils on the growth of micro-organisms, with this study we can see that the oils, especially oregano, are a natural alternative for applications in industry for the reduction of Salmonella in products.
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Avaliação da perda linfocitária do timo de frangos de corte utilizando sistema de análise digital de depleção linfóide (ADDL)Carvalho, Daiane January 2013 (has links)
O timo é um dos órgãos linfoides mais acometidos pelas patologias imunodepressoras, o qual geralmente é avaliado quanto ao grau de perda linfocitária a partir de técnicas histológicas subjetivas. Este trabalho teve como propósito a adaptação e aplicação do sistema ADDL (Análise Digital de Depleção Linfóide) em timos, a fim de tornar sua análise mais precisa. Primeiramente, realizou-se um estudo piloto, no qual foram utilizadas amostras de timo do trabalho desenvolvido por Camillotti (2011), porém constatou-se um número insatisfatório de lobos tímicos para os três escores de depleção linfocitária adotados, assim como dificuldade na categorização com apenas 3 graus de lesão. Optou-se, então, pela indução de imunodepressão através da utilização de um glicocorticóide, e pela classificação dos timos em cinco escores (1 a 5). Para tanto, foram utilizados 70 aves de um dia de idade, sendo que aos 21 dias de idade, foram separadas 15 aves para composição do grupo controle e 55 para o grupo tratado. Foi empregado o protocolo de tratamento com dexametasona adaptado de Kong, et al. (2002). Durante as coletas, de cada uma das aves, ambas as cadeias tímicas eram pesadas, sendo selecionados seis lobos para o processamento histológico de rotina, análise quanto ao grau de depleção linfocitária por dois avaliadores (A e B) e submissão a todas as etapas de processamento pelo sistema ADDL. Foram construídas ao final, cinco RNAs (Redes Neurais Artificiais): duas tendo em vista o escore por lobo (escore do avaliador A; escore do avaliador B) e três considerando o escore por ave (moda dos escores de 6 lobos/ave do avaliador A; moda dos escores de 6 lobos/ave do avaliador B, moda conjunta dos escores dos avaliadores A + B). A fim de relacionar o peso relativo (PR) do timo ao escore digital de depleção, foi aplicado o teste de correlação de Spearman, seguido de análise de regressão, e para evidenciar diferenças entre os escores atribuídos pelos avaliadores, utilizou o teste de Wilcoxon-Mann-Whitney. Constatou-se que o tratamento com dexametasona permitiu a aquisição de timos com escores entre 1 a 5. Houve diferença significativa entre as leituras realizadas pelos avaliadores considerando o lobo e também entre a moda de escores dos dois avaliadores, assim como entre a moda do avaliador B e a moda conjunta (p<0,005). Foi observado que as duas RNAs construídas por lobo obtiveram um percentual de 50% de classificações corretas. As RNAs construídas utilizando a moda mostraram um percentual de acerto de 86,57% para o avaliador A, 80,60% para avaliador B e 94,03% para a rede construída a partir da moda conjunta dos avaliadores. Paralelamente, observou-se ρ= -0,77 e R2=0,58 entre as variáveis “PR” e “Escore digital de depleção linfocitária”. Em conclusão, foi possível a aplicação do sistema ADDL para timos, sendo a RNA treinada com a moda conjunta dos escores dos avaliadores A e B, o modelo que alcançou melhor desempenho. Portanto, o uso de ferramentas de análise de imagem em conjunto com as RNAs, torna possível uma avaliação do sistema imune da ave adotando critérios objetivos para as análises histológicas quanto a perda linfocitária. / The thymus is a lymphoid organs most affected by immunosuppressive diseases, which is usually assessed on the degree of lymphocyte loss from subjective histological techniques. This work aimed to the adaptation and application of the system DALD (Digital Analysis of Lymphoid Depletion) in the thymus in order to make your analysis more accurate. First,a pilot study was performed, in which samples from the thymus of the work of Camillotti (2011) were used, but it was found a number of poor thymic lobes for the three scores lymphocyte depletion adopted, as well as difficulty with categorization only three degrees of injury. It was decided, therefore, by inducing immunosuppression by using a glucocorticoid, and the classification of the five scores thymus (1 to 5). Therefore, 70 birds a day old were used, and at 21 days of age, 15 birds were separated for composition of the control group and 55 in the treated group. A treatment protocol with dexamethasone adapted Kong et al. (2002) was performed. During collection, each of the birds, both chains thymus were weighed, and selected six lobes for histological processing, analysis of the degree of lymphocyte depletion by two raters (A and B) and submission to all stages of DALD processing by the system. At the end of five ANNs (Artificial Neural Networks) were built: two in view of the score by lobe (The score evaluator, the evaluator score B) and three taking the score per bird (mode scores of 6 lobes / bird evaluator The; mode scores of 6 lobes / bird evaluator B, trendy joint scores of evaluators A + B). In order to relate the relative weight (RW) of the thymus to score digital depletion the Spearman correlation test was used, followed by regression analysis, and to highlight differences between the scores assigned by the evaluators used the Wilcoxon- Mann- Whitney test. It was found that treatment with dexamethasone permitted the acquisition of thymus with scores ranging from 1 to 5. Significant difference between the readings made by the evaluators considering the lobe and also between mode scores of two raters, as well as between mode evaluator B and joint mode (p <0.005). It was observed that the two ANNs constructed by lobe obtained a percentage of 50% correct classifications. ANNs built using the fashion shown a percentage of accuracy of 86.57% for the evaluator A, 80.60% to avaliator B and 94,03% for the network constructed from the trendy joint assessors. In parallel, it was noted ρ = -0.77, and R2 = 0.58 between "RW" and "digital lymphoid depletion score". In conclusion, it was possible to apply the system to DALD sweetbreads, and the trained ANN with mode combined scores of raters A and B, the model achieved better performance. Therefore, the use of image analysis tools along with the ANNs makes possible an assessment of the bird's immune system adopting objective criteria for histological analyzes as the lymphocyte loss.
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Uso de redes neurais artificiais para classificação da patogenicidade de Escherichia coli de origem aviáriaTejkowski, Thiago Moreira January 2013 (has links)
E. coli Patogênicas Aviárias (APEC) são uma das causas de doenças extra-intestinais em aves, as quais trazem grande prejuízo econômico para o setor avícola mundial. Os avanços nas pesquisas vêm aumentando o entendimento dos mecanismos de patogenicidade das APEC, demonstrando a grande importância da interação dos diversos fatores de virulência na determinação da sua patogenicidade. Redes Neurais Artificiais (RNAs) têm mostrado ser uma poderosa ferramenta para uma vasta gama de aplicações. Neste trabalho, o foco na aplicação da RNA é na predição (0 a 10) da patogenicidade de amostras APEC. Em 489 isolados APEC foram analisados a presença de 38 genes associados a virulência, o Índice de Patogenicidade (IP) in vivo e a motilidade das amostras. Duas RNAs foram construídas utilizando o software Neuroshell Classifier 2.1 (Ward Systems Group, Inc., Frederick, MD, USA) em duas fases distintas: treinamento e validação. Utilizou-se como camada de entrada, informações sobre a presença ou ausência dos 38 genes de virulência e a motilidade de cada uma das amostras, com uma camada de saída formada pelo IP in vivo previamente determinado. As RNAs construídas apresentaram uma classificação correta acima de 90%, sendo que a rede 1 apresentou uma classificação de 91,62 e a rede 2 de 99,03%. A rede 2 obteve uma especificidade superior a 99,64% em todas as categorias e uma sensibilidade superior a 92,86%. Isso demonstra que o método aqui proposto, revelou ser uma ótima ferramenta de suporte às decisões de médico veterinário, descartando no futuro a inoculação de animais. / Avian Pathogenic Escherichia coli (APEC) are one of the causes of extraintestinal diseases in birds, and cause considerable economic losses to the poultry industry worldwide. Advances in research have increased understanding of pathogenic mechanisms of APEC, and have demonstrated the importance of the interaction of several virulence factors in determining their pathogenicity. Artificial Neural Networks (ANN) have shown to be a powerful tool for a wide range of applications. In this paper, the focus on neural network applications in the prediction (index of 0-10) of the pathogenicity of isolates APEC. In 489 APEC isolates were analyzed: 38 virulenceassociated genes, the Pathogenicity Index (PI) in vivo and motility of the strains. Two ANNs were constructed using the software Neuroshell Classifier 2.1 (Ward Systems Group, Inc., Frederick, MD, USA) in two distinct phases: training and validation. We used as input layer, information about the presence or absence of the 38 virulenceassociated genes and the motility of each of the samples, with an output layer formed by a previously-determined PI in vivo. The ANNs showed a correct classification of the PI above of 90%, being that the network 1 had a rating of 91.62% and the network 2 of 99.03%. The network 2 obtained a specificity of over 99.64% and sensitivity greater than 92.86% in all categories. This demonstrates that the method proposed here has proven to be a great decision support tool for the veterinarian, thereby dispensing the inoculation of animals in the future.
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Contagem de campylobacter spp. em amostras de diferentes pontos do fluxograma de abate de frangos por método de plaqueamento direto em Ágar mCCDA e Campy-Cefex.Gonsalves, Camila Cristina January 2014 (has links)
Nas últimas décadas as espécies de Campylobacter spp. são reconhecidas como importantes agentes de gastroenterites de origem alimentar em humanos em diversos países, tendo como principal veículo de transmissão a carne de frango. Devido ao aumento da frequência com que é isolada a partir de humanos, animais, alimentos e água, esta bactéria tem sido foco crescente de atenção nos últimos 30 anos. No Brasil, ainda são limitadas as informações sobre esta bactéria na cadeia de produção de aves, não existindo legislação que contemple o controle de Campylobacter. A alta incidência na avicultura, a presença natural deste patógeno nos animais e os graves problemas de saúde pública gerados tornam essa bactéria alvo de esforços para prevenção e controle. O objetivo do presente estudo foi avaliar se a metodologia de contagem direta proposta pela normativa MLG 41.02 teria eficiência na monitoria em diferentes amostras avícolas e paralelamente comparar o desempenho de dois ágares (mCCDA e Campy-Cefex) na contagem de Campylobacter spp. Foram realizadas quatro tomadas de amostras em um frigorífico da região Sul do país, durante um mês, sendo a amostragem composta por suabes de cloaca, carcaças pré-chiller, carcaças pós-chiller, água pré-chiller, água do chiller, e amostras de água de abastecimento. O ágar Campy-Cefex obteve maior frequência de isolamento de Campylobacter spp. em diferentes amostras avícolas quando comparado com o ágar mCCDA. Houve redução significativa de contaminação ao longo da linha de abate, com níveis de 9,8 x 102 UFC/mL em carcaças préchiller e 1,5x102 UFC/mL em carcaças pós-chiller. Do total de amostras em que foram realizadas a PCR, 72% foram positivas para Campylobacter jejuni e 38% positivas para Campylobacter coli. A metodologia mostrou-se eficiente e possível de ser aplicada na indústria avícola, em diferentes materiais, para monitoria de Campylobacter. / In recent decades the Campylobacter spp. species are recognized as important agents of foodborne gastroenteritis in humans in several countries and the broiler meat as are pointed as the main vehicle of transmission. Due the increase in frequency isolation from humans, animals, food and water, this bacteria has received great attention in the last 30 years. The information about this bacteria are still limited in Brazil and in the poultry production chain, there are no laws to the Campylobacter’s control. The high incidence in poultry industry, the natural presence of this pathogen in animals and the serious concern in public health, lead this bacteria as target to prevention and control efforts. The aim of this study was to evaluate whether the direct counting methodology proposed by MLG 41.02 rules would be efficient on monitoring different poultry samples, as well as to compare two agars plate (mCCDA and Campy-Cefex) performance’s to Campylobacter cell count. We carried out four samples taken in a slaughterhouse located at southern region of Brazil, during one month. The samples were composed by cloacal swabs, pre-chiller carcasses, post-chiller carcasses, pre-chiller water, chiller water, and water supply samples. The Campy-Cefex agar showed higher Campylobacter spp isolation frequency of among different poultry samples than mCCDA agar. There was a significant reduction in contamination along the slaughter line with levels of 9.8 x 102 CFU/mL in pre- chiller carcasses and 1.5 x102 CFU/mL in post-chiller carcasses. The samples typified by PCR, showed 72% of the samples as Campylobacter jejuni and 38% as Campylobacter coli. The methodology was efficient and also possible to be used in the poultry’s industry for different samples to Campylobacter monitoring program.
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Interação entre Lipopolissacarídeo de Salmonella Typhimurium e Fumonisina B1 em frangos de corteRauber, Ricardo Hummes January 2012 (has links)
Lipopolissacarídeo (LPS) é o principal componente da parede celular de bactérias Gram-negativas, sendo liberado durante a divisão celular ou morte da bactéria após lise. O LPS é um dos mais potentes ativadores do sistema imune, desencadeando uma resposta inflamatória inespecífica. A exposição ao LPS tem sido associada a uma gama de efeitos tóxicos em frangos e outras aves, como hipertermia, inflamação, caquexia e, eventualmente, morte. A fumonisina B1 (FB), um metabólito secundário produzido pelo Fusarium verticilloides, tem sido descrita como causa de doenças previamente conhecidas (leucoencefalomalácea equina e edema pulmonar suíno), bem como causando alguns efeitos em aves. Os principais sinais clínicos da intoxicação por FB em frangos são desempenho reduzido, ascite, edema e congestão dos rins, diarreia, peso relativo do fígado aumentado e mortalidade. O objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos individuais e combinados do LPS de Salmonella Typhimuruim (sLPS) e FB sobre o desempenho produtivo (peso corporal [PC], consumo de ração [CR] e conversão alimentar [C]), peso relativo de fígado (PRF), parâmetros biológicos (proteínas plasmáticas totais [PPT], albumina [Alb], cálcio [Ca], triglicerídeos [Tri], colesterol total [Col], fósforo [P], ácido úrico [AU], proteína C-reativa [CRP], alanina aminotransferase [ALT], aspartato aminotransferase [AST], fosfatase alcalina [FA], gama glutamiltransferase [GGT] e relação esfinganina/esfingosina [SA:SO]), avaliação morfológica do intestino delgado (altura de vilosidades [AV], profundidade de criptas [PC] e relação vilosidade/cripta [V:C]) e avaliações histológicas de vários tecidos de 432 frangos de corte, machos, com um dia de idade, divididos em nove tratamentos, conforme a dose de FB (0, 100 ou 200 mg/kg, do primeiro ao 28º dia de experimento) e sLPS (0, 250 ou 500 μg/ave por aplicação, a cada 48 horas, do 15º ao 27º dia. Ao final do experimento (28 dias): efeitos significativos do sLPS foram observados sobre PC, Ca, Col, P, AU, CRP, AST, FA e AV; efeitos significativos da FB foram observados sobre PC, CR, C, PRF, PPT, Alb, Ca, Tri, Col, AU, CRP, ALT, GGT, SA:SO, AV e V:C; efeitos significativos da interação sLPS*FB foram observados sobre PRF, Alb, Col, P, AU e CRP. Alterações histológicas foram observadas para sLPS, FB e sLPS*FB no fígado e rins. De acordo com estes resultados, sLPS e FB (isolados ou associados) determinam efeitos sobre o desempenho e parâmetros biológicos de frangos de corte. / Lipopolysaccharide (LPS) is the main component of Gram-negative bacterial cell wall, and is released during cellular division or bacterial death after lysis. This is one of the most powerful activators of the immune system, leading to a non-specific inflammatory response. LPS exposure has been related to a role of effects in broilers and other avian species, such as hyperthermia, inflammation, cachexia, and eventually, death. Fumonisin B1 (FB), a secondary metabolite produced by Fusarium verticilloides, has been shown to be associated to some previously known diseases or syndromes (equine leucoencephalomalacea and porcine pulmonary edema) and has also been described as causing some effects in poultry. The main clinical signs of FB intoxication in broilers are reduced productive performance, ascites, kidney edema and congestion, diarrhea, increased relative weight of the liver, and mortality. The aim of this research was to evaluate the individual and combined effects of Salmonella Typhimurium Lipopolysaccharide (sLPS) and FB on performance (body weight, feed intake, and feed conversion rate), relative weight of the liver, biological parameters (total plasma proteins [TPP], albumin [Alb], calcium [Ca], triglycerides [Tri], total cholesterol [Col], phosphorus [Ph], uric acid [UA], C-reactive protein [CRP], alanine aminotransferase [ALT], aspartate aminotransferase [AST], alkaline phosphatase [AP], gamma glutamiltransferase [GGT] and sphinganine-to-sphingosine [SA:SO] ratio), morphological evaluation of jejunum/ileum (villous height [VH], crypt depth [CD], and villous-to-crypt [V:C] ratio), and histological evaluation of several tissues from 432 day-old male broiler chickens divided into nine treatments according to the dose of FB (0, 100, or 200 mg/kg, from day 1 to day 28) and sLPS (0, 250, or 500 μg/application/bird, every other day, from day 15 do day 27). At the end of the experiment (28 d), significant effects of: sLPS were observed on BW, Ca, Col, Ph, UA, CRP, AST, AP, and VH; FB were observed on BW, FI, FCR, RWL, TPP, Alb, Ca, Tri, Col, UA, CRP, ALT, GGT, SA:SO, VH, and V:C; Interaction sLPS*FB were observed on RWL, Alb, Col, Ph, UA, and CRP. Histopathological evaluations showed significant lesions in liver and kidney caused by sLPS, FB and their association. According to these results, both sLPS and FB (isolated or associated) determine significant effects on performance and biological parameters of broilers at 28 days of age.
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Atividade antimicrobiana in vitro dos óleos essenciais de canela da china (cinnamomun cassia), orégano (origanum vulgare), pimenta negra (piper nigrum) e tomilho (thymus vulgaris) branco frente à amostras de Salmonella enterica isoladas de aves / In vitro antimicrobial activity of essential oils of cinnamon (cinnamomun cassia), oregano (Origanum vulgare), thyme (Thymus vulgaris) and black pepper (Piper nigrum) against strains of Salmonella enterica isolated from poultryLaviniki, Vanessa January 2013 (has links)
Infecções por bactérias do gênero Salmonella podem causar doenças em aves levando a perdas produtivas, como, queda de postura, diminuição do ganho de peso e mortalidade. Além disso, os produtos avícolas estão entre as principais causas de toxi-infecções alimentares em humanos. O objetivo deste estudo foi avaliar a atividade antimicrobiana in vitro dos óleos essenciais de Canela da China, Orégano, Pimenta Negra e Tomilho Branco frente a amostras de Salmonella enterica isoladas de aves, bem como comparar as técnicas de disco difusão e microdiluição em caldo. Para avaliar o efeito inibitório dos óleos essenciais no crescimento dos micro-organismos usou-se uma técnica de microdiluição em caldo empregando-se resazurina como indicador de viabilidade celular. Dos quatro óleos testados, apenas a pimenta negra não exibiu efeito inibitório sobre o crescimento das bactérias testadas e o óleo de orégano foi o único que apresentou atividade frente a todas as amostras com valores de concentração inibitória mínima (CIM) variando de 8-1% (v/v). Enquanto que, os óleos de tomilho e canela foram efetivos para 91,3% (42/46) e 80,43% (37/46) das amostras, respectivamente. Os valores de CIM para o tomilho variaram de 8-4% (v/v) e para a canela foram de 8-2% (v/v). Em relação às técnicas, pode-se observar que a técnica de microdiluição em caldo apresentou melhores resultados que a disco difusão, embora seja difícil comparar os resultados devido às características peculiares dos óleos, como a viscosidade, volatilidade e diferente afinidade com a água. Além disso, a microdiluição em caldo nos fornece valores semi-quantitativos, enquanto que o método de disco difusão os resultados são descritos qualitativamente. Embora não se tenha ainda hoje padronizações para avaliar o efeito inibitório dos óleos no crescimento dos micro-organismos, com este estudo podemos observar que os óleos, principalmente orégano, são uma alternativa natural para aplicações na indústria visando a redução de Salmonella nos produtos. / Infections with bacteria of the genus Salmonella can cause disease in poultry leading to production losses, as falling posture, decreased weight gain and mortality. Furthermore, poultry products are among the major causes of human alimentary toxinfections. The aim of this study was to evaluate the in vitro antimicrobial activity of essential oils of cinnamon from China, Oregano, Thyme and Black Pepper White against strains of Salmonella enterica isolated from poultry and compare the techniques disk diffusion and microdilution. To assess the inhibitory effect of essential oils on the growth of micro-organisms used was a broth microdilution technique employing resazurin as an indicator of cell viability. Of the four oils tested, only black pepper showed no inhibitory effect on the growth of bacteria and tested oregano oil was the only one that showed activity against all samples with values of minimum inhibitory concentration (MIC) ranging from 8-1% ( v / v). While the oils of thyme and cinnamon were effective in 91.3% (42/46) and 80.43% (37/46) of samples, respectively. MIC values for the peas ranged from 8-4% (v / v) and cinnamon were 8-2% (v / v). Regarding the techniques, one can observe that the microdilution broth showed better results than disk diffusion, although it is difficult to compare the results due to the peculiar characteristics of oils, as viscosity, volatility, and different affinity for water. Furthermore, the broth microdilution provides semi-quantitative values, while the disk diffusion method results are described qualitatively. Although no standardizations today to evaluate the inhibitory effect of oils on the growth of micro-organisms, with this study we can see that the oils, especially oregano, are a natural alternative for applications in industry for the reduction of Salmonella in products.
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Avaliação da perda linfocitária do timo de frangos de corte utilizando sistema de análise digital de depleção linfóide (ADDL)Carvalho, Daiane January 2013 (has links)
O timo é um dos órgãos linfoides mais acometidos pelas patologias imunodepressoras, o qual geralmente é avaliado quanto ao grau de perda linfocitária a partir de técnicas histológicas subjetivas. Este trabalho teve como propósito a adaptação e aplicação do sistema ADDL (Análise Digital de Depleção Linfóide) em timos, a fim de tornar sua análise mais precisa. Primeiramente, realizou-se um estudo piloto, no qual foram utilizadas amostras de timo do trabalho desenvolvido por Camillotti (2011), porém constatou-se um número insatisfatório de lobos tímicos para os três escores de depleção linfocitária adotados, assim como dificuldade na categorização com apenas 3 graus de lesão. Optou-se, então, pela indução de imunodepressão através da utilização de um glicocorticóide, e pela classificação dos timos em cinco escores (1 a 5). Para tanto, foram utilizados 70 aves de um dia de idade, sendo que aos 21 dias de idade, foram separadas 15 aves para composição do grupo controle e 55 para o grupo tratado. Foi empregado o protocolo de tratamento com dexametasona adaptado de Kong, et al. (2002). Durante as coletas, de cada uma das aves, ambas as cadeias tímicas eram pesadas, sendo selecionados seis lobos para o processamento histológico de rotina, análise quanto ao grau de depleção linfocitária por dois avaliadores (A e B) e submissão a todas as etapas de processamento pelo sistema ADDL. Foram construídas ao final, cinco RNAs (Redes Neurais Artificiais): duas tendo em vista o escore por lobo (escore do avaliador A; escore do avaliador B) e três considerando o escore por ave (moda dos escores de 6 lobos/ave do avaliador A; moda dos escores de 6 lobos/ave do avaliador B, moda conjunta dos escores dos avaliadores A + B). A fim de relacionar o peso relativo (PR) do timo ao escore digital de depleção, foi aplicado o teste de correlação de Spearman, seguido de análise de regressão, e para evidenciar diferenças entre os escores atribuídos pelos avaliadores, utilizou o teste de Wilcoxon-Mann-Whitney. Constatou-se que o tratamento com dexametasona permitiu a aquisição de timos com escores entre 1 a 5. Houve diferença significativa entre as leituras realizadas pelos avaliadores considerando o lobo e também entre a moda de escores dos dois avaliadores, assim como entre a moda do avaliador B e a moda conjunta (p<0,005). Foi observado que as duas RNAs construídas por lobo obtiveram um percentual de 50% de classificações corretas. As RNAs construídas utilizando a moda mostraram um percentual de acerto de 86,57% para o avaliador A, 80,60% para avaliador B e 94,03% para a rede construída a partir da moda conjunta dos avaliadores. Paralelamente, observou-se ρ= -0,77 e R2=0,58 entre as variáveis “PR” e “Escore digital de depleção linfocitária”. Em conclusão, foi possível a aplicação do sistema ADDL para timos, sendo a RNA treinada com a moda conjunta dos escores dos avaliadores A e B, o modelo que alcançou melhor desempenho. Portanto, o uso de ferramentas de análise de imagem em conjunto com as RNAs, torna possível uma avaliação do sistema imune da ave adotando critérios objetivos para as análises histológicas quanto a perda linfocitária. / The thymus is a lymphoid organs most affected by immunosuppressive diseases, which is usually assessed on the degree of lymphocyte loss from subjective histological techniques. This work aimed to the adaptation and application of the system DALD (Digital Analysis of Lymphoid Depletion) in the thymus in order to make your analysis more accurate. First,a pilot study was performed, in which samples from the thymus of the work of Camillotti (2011) were used, but it was found a number of poor thymic lobes for the three scores lymphocyte depletion adopted, as well as difficulty with categorization only three degrees of injury. It was decided, therefore, by inducing immunosuppression by using a glucocorticoid, and the classification of the five scores thymus (1 to 5). Therefore, 70 birds a day old were used, and at 21 days of age, 15 birds were separated for composition of the control group and 55 in the treated group. A treatment protocol with dexamethasone adapted Kong et al. (2002) was performed. During collection, each of the birds, both chains thymus were weighed, and selected six lobes for histological processing, analysis of the degree of lymphocyte depletion by two raters (A and B) and submission to all stages of DALD processing by the system. At the end of five ANNs (Artificial Neural Networks) were built: two in view of the score by lobe (The score evaluator, the evaluator score B) and three taking the score per bird (mode scores of 6 lobes / bird evaluator The; mode scores of 6 lobes / bird evaluator B, trendy joint scores of evaluators A + B). In order to relate the relative weight (RW) of the thymus to score digital depletion the Spearman correlation test was used, followed by regression analysis, and to highlight differences between the scores assigned by the evaluators used the Wilcoxon- Mann- Whitney test. It was found that treatment with dexamethasone permitted the acquisition of thymus with scores ranging from 1 to 5. Significant difference between the readings made by the evaluators considering the lobe and also between mode scores of two raters, as well as between mode evaluator B and joint mode (p <0.005). It was observed that the two ANNs constructed by lobe obtained a percentage of 50% correct classifications. ANNs built using the fashion shown a percentage of accuracy of 86.57% for the evaluator A, 80.60% to avaliator B and 94,03% for the network constructed from the trendy joint assessors. In parallel, it was noted ρ = -0.77, and R2 = 0.58 between "RW" and "digital lymphoid depletion score". In conclusion, it was possible to apply the system to DALD sweetbreads, and the trained ANN with mode combined scores of raters A and B, the model achieved better performance. Therefore, the use of image analysis tools along with the ANNs makes possible an assessment of the bird's immune system adopting objective criteria for histological analyzes as the lymphocyte loss.
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Uso de redes neurais artificiais para classificação da patogenicidade de Escherichia coli de origem aviáriaTejkowski, Thiago Moreira January 2013 (has links)
E. coli Patogênicas Aviárias (APEC) são uma das causas de doenças extra-intestinais em aves, as quais trazem grande prejuízo econômico para o setor avícola mundial. Os avanços nas pesquisas vêm aumentando o entendimento dos mecanismos de patogenicidade das APEC, demonstrando a grande importância da interação dos diversos fatores de virulência na determinação da sua patogenicidade. Redes Neurais Artificiais (RNAs) têm mostrado ser uma poderosa ferramenta para uma vasta gama de aplicações. Neste trabalho, o foco na aplicação da RNA é na predição (0 a 10) da patogenicidade de amostras APEC. Em 489 isolados APEC foram analisados a presença de 38 genes associados a virulência, o Índice de Patogenicidade (IP) in vivo e a motilidade das amostras. Duas RNAs foram construídas utilizando o software Neuroshell Classifier 2.1 (Ward Systems Group, Inc., Frederick, MD, USA) em duas fases distintas: treinamento e validação. Utilizou-se como camada de entrada, informações sobre a presença ou ausência dos 38 genes de virulência e a motilidade de cada uma das amostras, com uma camada de saída formada pelo IP in vivo previamente determinado. As RNAs construídas apresentaram uma classificação correta acima de 90%, sendo que a rede 1 apresentou uma classificação de 91,62 e a rede 2 de 99,03%. A rede 2 obteve uma especificidade superior a 99,64% em todas as categorias e uma sensibilidade superior a 92,86%. Isso demonstra que o método aqui proposto, revelou ser uma ótima ferramenta de suporte às decisões de médico veterinário, descartando no futuro a inoculação de animais. / Avian Pathogenic Escherichia coli (APEC) are one of the causes of extraintestinal diseases in birds, and cause considerable economic losses to the poultry industry worldwide. Advances in research have increased understanding of pathogenic mechanisms of APEC, and have demonstrated the importance of the interaction of several virulence factors in determining their pathogenicity. Artificial Neural Networks (ANN) have shown to be a powerful tool for a wide range of applications. In this paper, the focus on neural network applications in the prediction (index of 0-10) of the pathogenicity of isolates APEC. In 489 APEC isolates were analyzed: 38 virulenceassociated genes, the Pathogenicity Index (PI) in vivo and motility of the strains. Two ANNs were constructed using the software Neuroshell Classifier 2.1 (Ward Systems Group, Inc., Frederick, MD, USA) in two distinct phases: training and validation. We used as input layer, information about the presence or absence of the 38 virulenceassociated genes and the motility of each of the samples, with an output layer formed by a previously-determined PI in vivo. The ANNs showed a correct classification of the PI above of 90%, being that the network 1 had a rating of 91.62% and the network 2 of 99.03%. The network 2 obtained a specificity of over 99.64% and sensitivity greater than 92.86% in all categories. This demonstrates that the method proposed here has proven to be a great decision support tool for the veterinarian, thereby dispensing the inoculation of animals in the future.
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Incidência da mastite ovina em criação extensiva e sua relação à dor e variáveis comportamentais / Incidence of mastitis in sheep extensive farming and its relationship to pain and behavioral variablesPellegrini, Manuela Zardin de 24 August 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-08-24 / The research evaluated the incidence of mastitis sheep and its relation to pain and behavioral variables in Corriedale herd, handled on native pasture in Rio Grande do Sul. The results were collected in two reviews. The first stage was conducted in December 2010 to determine the incidence of mastitis in multiparous ewes after weaning their lambs. The sheep were submittedto clinical examination and palpation of the udder and classified as scale change in consistency of the udder. No cases of clinical mastitis, but 25% of the herd had chronic mastitis. In the second stage, held in September 2011, was observed behavioral variables in two environments: pen and paddock. Two sheep were evaluated postpartum, which showing udderalteredconsistencyandnormal, respectively.The sheep with udderalteredconsistencyshowed alert behavior pen and paddock. The sheep with normal udder showed higher gregarious behavior and vocalised more often for her lamb. The presence ofnodulesin the udderalteredmaternal-filial behavior the sheep.The indicators of pain were not observed. The clinical mastitis is not a problem in the extensive breeding of sheep, but the presence of chronic mastitis indicates trauma or inflammation without prior treatment. / A pesquisa avaliou a incidência da mastite ovina e sua relação com variáveis de dor e comportamentais, em rebanho Corriedale, manejado em campo nativo no Rio Grande do Sul. Os resultados foram coletados em duas avaliações. A primeira etapa foi realizada em dezembro de 2010, para verificar a incidência da mastite em ovelhas multíparas após o desmame dos seus cordeiros. As ovelhas foram submetidas ao exame clínico e palpação do úbere e classificadas conforme escala de alteração da consistência do úbere. Não houve casos de mastite clínica, porém 25% do rebanho apresentou mastite crônica. Na segunda etapa, realizada em setembro de 2011, foi observado as variáveis comportamentais em dois ambientes: mangueira (curral) e piquete. Duas ovelhas foram avaliadas no pós-parto, as quaisapresentaram consistência de úbere alterado e úbere normal, respectivamente. A ovelha com alteração no úbere mostrou comportamento alerta no curral e piquete. A ovelha com úbere normal apresentou maior comportamento gregário e vocalizou mais vezes para seu cordeiro. A presença de nodulações no úbere alterou o comportamento materno-filial. Os indicadores de dor não foram observados. A mastite clínica não é um problema na criação extensiva de ovinos, contudo a presença de mastite crônica indica trauma ou inflamação prévia sem tratamento.
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Atributos da qualidade de semente de soja produzida no estado de Santa Catarina / Soybean seed quality attributes produced in the Santa Catarina stateFrandoloso, Volmir 19 April 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-04-19 / The production of soybean seeds in Santa Catarina is quite significant in the national context. The state is known as a producer of high standard soybean seeds with physical, physiological and sanitary quality. This is due to the use high of appropriate technologies, together with environmental conditions as well distributed rain during the development of the culture, mild temperatures at harvest, and low temperatures and few oscillations of the relative humidity in storage period. The objective of this paper was to
evaluate the physical, physiological and sanitary quality of soybean seeds produced by the leading companies of Santa Catarina, analyzed in three periods: harvest (reception in SPU), during the processing and sale, as well as, to characterize the main factors that affect the quality of seeds, and propose measures to control and manage production processes, to ensure the quality of seed produced in the. The experiment was conducted in Santa Catarina state, in the main regions and producers of soybean seeds trade in 2009/10: Lar Cooperative, Alfa Cooperative, C. Vale Cooperative, (Xanxerê region); C. Vale Cooperative e Coamo Cooperative (Abelardo Luz region), Coocam Cooperative e Cooper Campos Cooperative (Campos Novos region), and the producer Rogério Magalhães (Canoinhas region). Data analysis and interpretation of results showed that: The soybean
seeds produced in the Santa Catarina state have suitable quality for sowing; the incidence of mechanical damage and the varietal mix are the main problems detected in seed lots of
soybean; soybean seed produced in the Santa Catarina state pathogens show contamination, recommended being the seed treatment. / A produção de sementes de soja no estado de Santa Catarina é bastante significativa no contexto nacional. O estado é reconhecido por produzir semente de soja com altos padrões de qualidade física, fisiológica e sanitária. Isto se deve, ao uso de tecnologias modernas e adequadas, aliado às condições climáticas com chuvas bem distribuídas durante o desenvolvimento da cultura, temperaturas amenas na época da colheita, culminando com baixas temperaturas e pouca oscilação da umidade relativa no período de armazenamento. O objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade física,
fisiológica e sanitária das sementes de soja produzidas pelas principais empresas do Estado de Santa Catarina, analisadas em três épocas: colheita (recepção na UBS), após o
beneficiamento e no momento da comercialização, bem como, caracterizar os principais fatores que interferem na qualidade das sementes e propor medidas de controle e manejo
nos processos produtivos, para garantir a qualidade das sementes produzidas no estado. O experimento foi conduzido no Estado de Santa Catarina, nas principais regiões e empresas produtoras de sementes de soja comercial, na safra 2009/10: Cooperativa Agroindustrial Lar, Cooperativa Agroindustrial Alfa e Cooperativa Agroindustrial. C.Vale Faxinal
(Região de Xanxerê); Cooperativa Agroindustrial. C. Vale e Cooperativa Agroindustrial Coamo (Região de Abelardo Luz), Cooperativa Coocam e Cooperativa Regional de Campos Novos (Região de Campos Novos), e o Produtor Rogério Magalhães (Região de Canoinhas). A análise dos dados e a interpretação dos resultados permitiram concluir que: As sementes de soja produzidas no Estado de Santa Catarina apresentam qualidade
adequada para a semeadura; a incidência de danos mecânicos e a mistura varietal são os principais problemas detectados nos lotes de sementes de soja; as sementes de soja
produzidas no Estado de Santa Catarina apresentam contaminação por patógenos, sendo recomendado o tratamento de sementes.
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