Objetivou-se, principalmente, conhecer a paridade, desenvolvimento ovariano e a razão de sobrevivência dessas populações. As coletas foram realizadas na Fazenda Experimental do Instituto Agronômico de Campinas e em sítio próximo, denominado Barra do Capinzal. Ambos situados no município de Pariquera-Açu, Estado de São Paulo. De maneira concomitante, as capturas foram feitas nos ambientes extradomiciliar e domiciliar, mediante o emprego da isca humana e armadilha tipo Shannon. Focalizou-se o complexo Anopheles albitarsis, populações prováveis A e B, por ocasião do período crepuscular vespertino. As dissecções foram feitas utilizando-se da técnica de Polovodova. Para a avaliação do desenvolvimento folicular, adotou se o critério de Christophers e Mer e o conceito baseado na Escola Clássica. Das 4.170 fêmeas dissecadas, 90,2 por cento foram da população B e 9,8 por cento da população A. Quanto à paridade, o resultado global revelou que o grupo das nulíparas foi predominante, com aproximadamente 70,0 por cento . A uniparidade com aproximadamente 25,0 por cento , a biparidade com aproximadamente 2,5 por cento e o grupo com 3 e 4 dilatações foi inferior a 1,0 por cento . Quanto ao desenvolvimento folicular, a proporção de fêmeas com os folículos desenvolvidos além da fase II de Christophers e Mer, foi muito pequena, variando de 1,4 a 4,0 por cento . Isso sugeriu a possibilidade da existência de concordância gonotrófica, para as duas supostas populações, nos dois ambientes. A melhor estimativa para a razão de sobrevivência foi de 0,5339 ± 0,047 e 0,5301 ± 0,056 para a população A e de 0,5566 ± 0,015 e 0,3151 ± 0,015 para a população B. No laboratório, procurou-se observar a duração do ciclo gonotrófico e a razão de sobrevivência mediante o acompanhamento diário de coorte de 121 fêmeas, sendo 40 da população A e 81 da população B. A duração do ciclo gonotrófico variou de 2,5 a 3,5 dias para a população A e 2 a 3 dias para a população B e a estimativa da sobrevivência diária variou de 0,35 a 0,79 para a população A e de 0,70 a 0,81 para a população B. Com esses resultados pretendeu-se contribuir para possível estimativa do potencial de transmissão malárica, eventualmente existente na região ou no local. / The basic purpose of the work to determine the parity, the ovarian development and the survivorship rates of these populations. Collection in the field was carried out at Experimental Farm of the \"Instituto Agronômico de Campinas\", and in a locality in the vicinity of \"Barra do Capinzal\", both situated in the Pariquera-Açu Municipality, State of São Paulo, Brazil. Concurrent field collections were also made in extradomiciliary and domiciliary environments using human bait and Shannon traps. Special attention was given to the Anopheles albitarsis complex, with A and B population, in the crepuscular sunset period. Dissections were made according to Polovodova\'s (1949) technique. The method adopted to determine the follicular development was that of Christophers and Mer and the concept was based on the classic school. From 4,170 females dissected, 90.2 per cent were of population B and 9.8 per cent of population A. The overall results concerning the parity showed the nulliparous group to be predominant with 70.0 per cent , uniparous with 25.0 per cent , biparous 2.5 per cent , and the group with three and four dilatations was lower than 1.0 per cent . In relation to the follicular development, the proportion of female above phase 11 of Christophers and Mer, was very small, 1.4 to 4.0 per cent . This suggests that gonotrophic concordance may occur for the two population in both environments. The best estimate for the survivorship rate was 0.5339 ± 0.047 and 0.5301 ± 0.056 to the population A, and 0.5566 ± 0.015 and 0.3151 ±-0.015 to the population B. A study in the laboratory was also carried out to observe the duration of the gonotrophic cycle and the survival rate by daily observation of a cohort of 121 females, 40 of population A and 81 of population B. The duration of the gonotrophic cycle varied from 2.5 to 3.5 days for the population A and from 2 to 3 days for the population B and the estimated daily survival rate was 0.35 to 0.79 to the population A and 0.70 to 0.81 to the population B. With these results, it is intended to contribute for possible estimate of malarian transmission potential, eventually existent in the region or in the local.

Recentemente, Cordeiro e de Castro (2011) apresentaram uma classe generalizada baseada na distribuição Kumaraswamy (Kw-G). Essa classe de distribuições modela as formas de risco crescente, decrescente, unimodal e forma de U ou de banheira. Uma importante distribuição pertencente a essa classe é a distribuição Kumaraswamy Weibull modificada (KwMW) proposta por Cordeiro; Ortega e Silva (2013). Com isso foi utilizada essa distribuição para o desenvolvimento de algumas novas propriedades e análise bayesiana. Além disso, foi desenvolvida uma nova distribuição de probabilidade a partir da distribuição gama generalizada geométrica (GGG) que foi denominada de gama generalizada geométrica exponenciada (GGGE). Para a nova distribuição GGGE foram calculados os momentos, a função geradora de momentos, os desvios médios, a confiabilidade e as estatísticas de ordem. Desenvolveu-se o modelo de regressão log-gama generalizada geométrica exponenciada. Para a estimação dos parâmetros, foram utilizados os métodos de máxima verossimilhança e bayesiano e, finalmente, para ilustrar a aplicação da nova distribuição foi analisado um conjunto de dados reais. / Recently, Cordeiro and de Castro (2011) showed a generalized class based on the Kumaraswamy distribution (Kw-G). This class of models has crescent risk forms, decrescent, unimodal and U or bathtub form. An important distribution belonging to this class the Kumaraswamy modified Weibull distribution (KwMW), proposed by Cordeiro; Ortega e Silva (2013). Thus this distribution was used to develop some new properties and bayesian analysis. Furthermore, we develop a new probability distribution from the generalized gamma geometric distribution (GGG) which it is called generalized gamma geometric exponentiated (GGGE) distribution. For the new distribution we calculate the moments, moment generating function, mean deviation, reliability and order statistics. We define a log-generalized gamma geometric exponentiated regression model. The methods used to estimate the model parameters are: maximum likelihood and bayesian. Finally, we illustrate the potentiality of the new distribution by means of an application to a real data set.

Submitted by Aelson Maciera (aelsoncm@terra.com.br) on 2017-09-26T18:18:47Z No. of bitstreams: 1 DissBBB.pdf: 1070846 bytes, checksum: a16745b05e48414c17e926ab9fc632b6 (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (bco.producao.intelectual@gmail.com) on 2018-01-29T18:46:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissBBB.pdf: 1070846 bytes, checksum: a16745b05e48414c17e926ab9fc632b6 (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (bco.producao.intelectual@gmail.com) on 2018-01-29T18:46:12Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissBBB.pdf: 1070846 bytes, checksum: a16745b05e48414c17e926ab9fc632b6 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-29T18:49:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissBBB.pdf: 1070846 bytes, checksum: a16745b05e48414c17e926ab9fc632b6 (MD5) Previous issue date: 2017-06-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Cancer is responsible for about 13% of all deaths in the world occuring mainly in people who are late diagnosed and in advanced stages. Due to its devastating characteristics and the growing prevalence of the disease, it is unquestionable the need of constant investigation and research in this area, in order to improve the early detection and to help in its prevention and treatment. Among the existing approaches, one alternative is the creation of techniques to estimate the "silent" growth period of cancer, which means to know the beginning moment of the carcinogen period, also known as latency period. In a literature review, it was found an shortage of models that estimate the latency of cancer, indicating the need of study about this theme. In this context, survival analysis methods appear as an useful tool to build these models. In this study, a review of an existing model is presented, as well as its formulation and estimation methods. Furthermore, an application on real data and a discussion of the obtained results are made. As a result, it was identified the need to formulate a new model, because of the limitations of the studied one. We present 3 alternative models that solve the points presented in the discussion, with applications. / O câncer é responsável por aproximadamente 13% de todas as mortes no mundo, sendo que elas ocorrem principalmente em pessoas que são diagnosticadas tardiamente e em estágios avançados. Devido às suas características devastadoras e à prevalência cada vez maior da doença, é inquestionável a necessidade de investigações e pesquisas constantes na área, no sentido de aprimorar a detecção precoce e auxiliar em sua prevenção e tratamento. Dentre as diversas abordagens existentes, uma alternativa é a criação de técnicas para estimar o período de crescimento "silencioso" do câncer, que significa conhecer o momento do início do processo cancerígeno, também chamado de período de latência. A partir da revisão da literatura realizada, foi verificada uma escassez de modelos que estimam a latência do câncer, indicando a necessidade de estudo sobre o tema. Nesse contexto, métodos de análise de sobrevivência surgem como uma ferramenta útil para a construção desses modelos. No presente trabalho, é apresentada uma revisão de um modelo já existente, bem como sua formulação e métodos de estimação. Além disso, apresenta-se uma aplicação em um conjunto de dados reais e uma discussão dos resultados obtidos.Foi identificada a necessidade da formulação de um novo modelo, visto que o método estudado apresenta algumas limitações. Com isso são apresentadas 3 alternativas de modelos que solucionam os pontos apresentados na discussão, com respectivas aplicações.

Submitted by Luciana Sebin (lusebin@ufscar.br) on 2016-09-23T13:03:28Z No. of bitstreams: 1 DissRSC.pdf: 1649931 bytes, checksum: c3449a4367ea7de9e327fa7dc9110861 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-09-27T19:22:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissRSC.pdf: 1649931 bytes, checksum: c3449a4367ea7de9e327fa7dc9110861 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-09-27T19:22:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissRSC.pdf: 1649931 bytes, checksum: c3449a4367ea7de9e327fa7dc9110861 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-27T19:22:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissRSC.pdf: 1649931 bytes, checksum: c3449a4367ea7de9e327fa7dc9110861 (MD5) Previous issue date: 2016-03-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Often intermediate events provide more detailed information about the disease process or recovery, for example, and allow greater accuracy in predicting the prognosis of patients. Such non-fatal events during the course of the disease can be seen as transitions from one state to another. The basic idea of a multistate models is that the person moves through a series of states in continuous time, it is possible to estimate the transition probabilities and intensities between them and the effect of covariates associated with each transition. Many studies include the grouping of survival times, for example, in multi-center studies, and is also of interest to study the evolution of patients over time, characterizing grouped multistate data. Because the data coming from different centers/groups, the failure times these individuals are grouped and the common risk factors not observed, it is interesting to consider the use of frailty so that we can capture the heterogeneity between the groups at risk for different types of transition, in addition to considering the dependence structure between transitions of individuals of the same group. In this work we present the methodology of multistate models, frailty models and then the integration of models with multi-state fragility models, dealing with the process of parametric and semi-parametric estimation. The conducted simulation study showed the importance of considering frailty in grouped multistate models, because without considering them, the estimates become biased. Furthermore, we find the frequentist properties of estimators of multistate model with nested frailty. Finally, as an application example to a set of real data, we use the process of bone marrow transplantation recovery of patients in four hospitals.We did a comparison of models through quality teasures setting AIC and BIC, coming to the conclusion that the model considers two random effects (one for the hospital and another for interaction transition-hospital) fits the data better. In addition to considering the heterogeneity between hospitals, such a model also considers the heterogeneity between hospitals in each transition. Thus, the values of the frailty estimated interaction transition-hospital reveal how fragile patients from each hospital are to experience certain type of event/transition. / Frequentemente eventos intermediários fornecem informações mais detalhadas sobre o processo da doença ou recuperação, por exemplo, e permitem uma maior precisão na previsão do prognóstico de pacientes. Tais eventos não fatais durante o curso da doença podem ser vistos como transições de um estado para outro. A ideia básica dos modelos multiestado é que o indivíduo se move através de uma série de estados em tempo contínuo, sendo possível estimar as probabilidades e intensidades de transição entre eles e o efeito das coivaráveis associadas a cada transição. Muitos estudos incluem o agrupamento dos tempos de sobrevivência como, por exemplo, em estudos multicêntricos, e também é de interesse estudar a evolução dos pacientes ao longo do tempo, caracterizando assim dados multiestado agrupados. Devido ao fato de os dados virem de diferentes centros/grupos, os tempos de falha desses indivíduos estarem agrupados e a fatores de risco comuns não observados, é interessante considerar o uso de fragilidades para que possamos capturar a heterogeneidade entre os grupos no risco para os diferentes tipos de transição, além de considerar a estrutura de dependência entre transições dos indivíduos de um mesmo grupo. Neste trabalho apresentamos a metodologia dos modelos multiestado, dos modelos de fragilidade e, em seguida, a integração dos modelos multiestado com modelos de fragilidade, tratando do seu processo de estimação paramétrica e semiparamétrica. O estudo de simulação realizado mostrou a importância de considerarmos fragilidades em modelos multiestado agrupados, pois sem consider´a-las, as estimativas tornam-se viesadas. Al´em disso, verificamos as propriedades frequentistas dos estimadores do modelo multiestado com fragilidades aninhadas. Por fim, como um exemplo de aplicação a um conjunto de dados reais, utilizamos o processo de recuperação de transplante de medula óssea de pacientes tratados em quatro hospitais. Fizemos uma comparação de modelos por meio das medidas de qualidade do ajuste AIC e BIC, chegando `a conclusão de que o modelo que considera dois efeitos aleatórios (uma para o hospital e outro para a interação transição-hospital) ajusta-se melhor aos dados. Além de considerar a heterogeneidade entre os hospitais, tal modelo também considera a heterogeneidade entre os hospitais em cada transição. Sendo assim, os valores das fragilidades estimadas da interação transição-hospital revelam o quão frágeis os pacientes de cada hospital são para experimentarem determinado tipo de evento/transição.

Submitted by Regina Correa (rehecorrea@gmail.com) on 2016-09-26T20:37:35Z No. of bitstreams: 1 TeseBY.pdf: 6542096 bytes, checksum: 1e7daee9ab7afc6289f89b17dc521998 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-09-27T19:32:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseBY.pdf: 6542096 bytes, checksum: 1e7daee9ab7afc6289f89b17dc521998 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-09-27T19:32:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseBY.pdf: 6542096 bytes, checksum: 1e7daee9ab7afc6289f89b17dc521998 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-27T19:32:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseBY.pdf: 6542096 bytes, checksum: 1e7daee9ab7afc6289f89b17dc521998 (MD5) Previous issue date: 2016-05-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / In this thesis, we extend some flexible cure rate models, such as the geometric, negative binomial and power series cure rate models, to allow for spatial correlations by including spatial frailties for the interval censored data setting. Parametric and semi-parametric cure rate models with independent and dependent spatial frailties are proposed and compared. The proposed models encompass several well-known cure rate models as its particular cases. Since these cure rate models are obtained by considering that the occurrence of an event of interest is caused by the presence of any non-observed risks, we also study the complementary cure model, which arises when the cure rate models are obtained by assuming the occurrence of an event of interest is caused when all of non-observed risks are activated. A new measure of model selection, based on the notion of predictive loss paradigm, for the interval-censoring data is also proposed. The MCMC method is used in a Bayesian inference approach and some Bayesian model selection criteria are used for model comparison. Moreover, we conduct an influence diagnostics to detect possible influential or extreme observations that can cause distortions on the results of analysis. Finally, the proposed models are applied to analyze a real dataset from a stop smoking study. / Nesta tese, estendemos os modelos flexíveis de sobrevivência com fração de cura, tais como os modelos de sobrevivência com fração de cura geométricos, binomial negativa e séries de potências, para permitir correlações espaciais incluindo fragilidades espaciais para os dados de censura intervalar. Modelos de cura paramétricos e semi-paramétricos com as fragilidades espaciais independentes e dependentes são propostos e comparados. Os modelos propostos abrangem vários modelos de cura bem conhecidos como seus casos particulares. Uma vez que estes modelos de cura são obtidos considerando que a ocorrência de um evento de interesse é causada pela presença de quaisquer riscos não observados, estudamos também os modelos de cura complementares, nesse caso, os modelos são obtidos assumindo que a ocorrência de um evento de interesse é causada quando todos os riscos, não observados, são ativados. Uma nova medida de seleção de modelo, baseada no paradigma da perda do preditivo, para dados de censura intervalar é proposta. Métodos MCMC são utilizados em uma abordagem de inferência Bayesiana sendo que os critérios de seleção de modelos Bayesiano são utilizados para comparação de modelos. Além disso, realizamos um diagnóstico de influência para detectar as possíveis observações influentes ou extremas que podem causar distorções sobre os resultados da análise. Finalmente, os modelos propostos são aplicados para analisar um conjunto de dados real de abstenção tabágica.

Submitted by Aelson Maciera (aelsoncm@terra.com.br) on 2017-04-05T20:08:31Z No. of bitstreams: 1 TeseMROJ.pdf: 2077202 bytes, checksum: 62fc395e16c6576efb12a5f2918e13d3 (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-04-19T14:07:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseMROJ.pdf: 2077202 bytes, checksum: 62fc395e16c6576efb12a5f2918e13d3 (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-04-19T14:07:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseMROJ.pdf: 2077202 bytes, checksum: 62fc395e16c6576efb12a5f2918e13d3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-19T14:13:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseMROJ.pdf: 2077202 bytes, checksum: 62fc395e16c6576efb12a5f2918e13d3 (MD5) Previous issue date: 2016-09-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / In this thesis, we introduce a methodology based on zero-inflated survival data for the purposes of dealing with propensity to default (credit risk) in bank loan portfolios. Our approach enables us to accommodate three different types of borrowers: (i) individual with event at the starting time, i.e., default on a loan at the beginning; (ii) non-susceptible for the event of default, or (iii) susceptible for the event. The information from borrowers in a given portfolio is exploited through the joint modeling of their survival time, with a multinomial logistic link for the three classes. An advantage of our approach is to accommodate zero-inflated times, which is not possible in the standard cure rate model introduced by Berkson & Gage (1952). The new model proposed is called zero-inflated cure rate model. We also extend the promotion cure rate model studied in Yakovlev & Tsodikov (1996) and Chen et al. (1999), by incorporating excess of zeros in the modelling. Despite allowing to relate covariates to the fraction of cure, the current approach does not enable to relate covariates to the fraction of zeros. The new model proposed is called zero-inflated promotion cure rate model. The second part of this thesis aims at proposing a regression version of the inflated mixture model presented by Calabrese (2014) to deal with multimodality in loss given default data. The novel methodology is applied in four retail portfolios of a large Brazilian commercial bank. / Nesta tese de doutorado, introduzimos uma metodologia baseada em dados de sobrevivência inflacionados em zero com o objetivo de lidar com propensão à inadimplencia (ou seja, risco de crédito) em carteiras de empréstimos bancários. Nossa abordagem permite acomodar (extrair informações de) três tipos diferentes de clientes bancários: (i) indivíduo com empréstimo inadimplente logo no início; (ii) cliente não suscetível ao evento de inadimplência, ou (iii) cliente suscetível ao evento de inadimplir. A informação dos empréstimos em um determinado portfólio é explorada através da modelagem conjunta do seu tempo de sobrevivência, com uma ligação logística multinomial para as três classes. Uma vantagem da nossa abordagem é acomodar tempos inflados em zero, o que não é possível no modelo de fração de cura padrão introduzido por Berkson & Gage (1952). Também estendemos o modelo com fração de cura estudado por Yakovlev & Tsodikov (1996) e Chen et al. (1999), incorporando excesso de zeros na modelagem. Apesar de permitir relacionar covariáveis à fração de cura do modelo, a abordagem padrão não permite relacionar covariáveis com a proporção de zeros dos dados. A segunda parte desta tese visa propor uma versão de regressão do modelo de mistura inflada apresentada por Calabrese (2014), visando extrair informações referentes a multimodalidade apresentada em dados relacionados à perda dado a inadimplência (LGD). A nova metodologia é aplicada em quatro carteiras de empréstimo de varejo de um grande banco comercial brasileiro. / CAPES: BEX 10583/14-9

Submitted by Maike Costa (maiksebas@gmail.com) on 2017-02-17T12:43:01Z No. of bitstreams: 1 rquivo total.pdf: 1353702 bytes, checksum: 83db724c3c959a4e1d35f4040336484d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-17T12:43:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 rquivo total.pdf: 1353702 bytes, checksum: 83db724c3c959a4e1d35f4040336484d (MD5) Previous issue date: 2016-11-28 / Most organisms have circadian rhythms with a periodicity of 24-hour that are generated by an endogenous mechanism, the molecular clock, which has the ability to synchronize biological functions with environmental signals. This mechanism has fundamental importance in the homeostasis of the tissues that are under its influence. Among the genes of the molecular clock machinery, the clock and bmal are positive regulators of clock mechanism and they present sigmoid expression profile in the skeletal muscle in zebrafish (Danio rerio). CLOCK and BMAL participate on the activation of the myogenic regulatory factors (MRFs - myoD, myog, myf5 and myf6), which are important in the development and differentiation of muscle cells. Despite this knowledge, the physiological importance of circadian rhythm in skeletal muscle of fish is not known. Therefore, the objective of the present study was to produce a zebrafish transgenic lineage that expresses bmal1a constitutively in the skeletal muscle to investigate the role of the molecular clock in the muscle. The transfer rate of the transgene to offspring, effect of transgenesis in the survival and fish growth, and expression of the bmal1a, clock1a and MRFs were investigated. The founding transgenic population (F0) was obtained after microinjection, and positive larvae were observed as specimens which presented green fluorescent heart. F1 was obtained from natural crossings between F0 and NT fish. Likewise, F2 was obtained from F1. F2 transgenic and NT were used in this study. The transgenic lineage was successfully generated with 50% transmission from the transgene to the offspring following a Mendelian model. The analysis of gene expression was made by qPCR. The survival (41,4±0% F2 and 44,3±6% NT) and growth (3.7±0.1 cm F2 and 3.8±0.2 cm NT) of F2 were not statistically different from NT fish. Among the genes, clock1a and myog presented statistically significant differences between the lineages with circadian profile in NT fish, suggesting that myog may be a clock controlled genes. The other genes (bmal1a, myf5, myf6, and myoD) presented constitutive expression. In general, it can be verified that the constitutive expression of bmal1a did not present change in the expression of the molecular clock, not affecting the homeostasis of the skeletal muscle, survival and growth. / A maioria dos organismos apresentam ritmos circadianos em torno de um período de 24 horas que são gerados por um mecanismo endógeno, o relógio molecular, que tem a capacidade de sincronizar-se com sinais ambientais. Este mecanismo tem fundamental importância na homeostase dos tecidos que estão sob sua influência. Dentre os genes que compõem a maquinaria do relógio molecular os genes clock e bmal são os reguladores positivos do mecanismo desse relógio e apresentam expressão com perfil sigmoide em tecido como o músculo do peixe-zebra (Danio rerio), participando da ativação de alguns fatores regulatórios miogênicos (MRFs – myoD, myog, myf5 e myf6), os quais possuem importância para o desenvolvimento e diferenciação do músculo. Apesar deste conhecimento, não se sabe a importância fisiológica do ritmo de expressão circadiana no músculo esquelético de peixes. Neste sentido, o objetivo desse estudo foi investigar a taxa de transferência do transgene para a prole; se a transgenia para o gene bmal1a no músculo esquelético interferiu na sobrevivência e crescimento dos peixes; e avaliar se a expressão dos genes bmal1a, clock1a e MRFs apresentaram diferenças na linhagem transgênica comparada à linhagem não-transgênica (NT). Os fundadores (F0) foram obtidos após a microinjeção do plasmídeo e as larvas positivas foram observadas com coração verde fluorescente. A F1 foi obtida a partir de cruzamentos entre peixes F0 e NT. Da mesma forma, F2 foi obtida a partir da F1, os quais foram utilizados no presente estudo. A análise da expressão gênica das linhagens aos 11 meses de idade foi realizada utilizando a técnica qPCR. A linhagem transgênica foi gerada com sucesso, transmitindo o transgene para a prole seguindo a herança mendeliana. A sobrevivência e crescimento da prole F2 não apresentaram diferenças entre as linhagens, sendo 41,4±0% para a linhagem transgênica e 44,3±6% NT até 30 dpf e 3.7±0.1 cm transgênicos e 3.8±0.2 cm para NT aos 11 meses de idade, respectivamente. Dentre os genes, o clock1a e o myog apresentaram diferenças estatisticamente significativas entre as linhagens com perfil circadiano em peixes NT, sugerindo que myog seja um gene controlado pelo relógio. Os demais genes apresentaram expressão constitutiva. De um modo geral, pode-se verificar que a expressão constitutiva do bmal1a não apresentou alteração na expressão do relógio molecular, desta forma, não afetou a homeostasia do organismo, a sobrevivência das larvas, bem como não afetou o crescimento.

Submitted by Claudia Rocha (claudia.rocha@udesc.br) on 2018-03-16T13:26:21Z No. of bitstreams: 1 PGCA17MA217.pdf: 1030045 bytes, checksum: ace9a03fd7a37e7c1a98ed11f28f68e5 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-16T13:26:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGCA17MA217.pdf: 1030045 bytes, checksum: ace9a03fd7a37e7c1a98ed11f28f68e5 (MD5) Previous issue date: 2017-02-21 / PROMOP / The objective of this study was evaluating the efficiency of lutein supplementation on the performance and deposition of skin carotenoids in comparison to other sources for young kinguio. There forean evaluation was made with one controlled diet and four diets enriched with a quantity of 50mg kg-1 of the following pigments: lutein, astaxanthin, canthaxanthin and a combination of lutein + canthaxanthin (25mg kg-1 of each source). The the experiment was designed in an entire casual way with five treatments nd six repetitions. Two hundred and forty young kinguios weighting 1,07±0,57 g were used, they were kept in 30 tanks of 30 liters each, in which they stayed for 84 days. The fish was fed three times a day (8:30 am, 12:30 pm and 5 pm) in a manual way until apparent satiety. At the end of the experiment, the productive performance of the fish was determined based on zootechnical parameters: final weight, weight gain, food consumption, food conversion and survival. The analysis of pigment concentration at the integument was made throught the extraction of carotenoids of skin by using solvents. The solution obtained was filtered and submitted to reading using spectrophotometer with wavelength of 474 nm. The results were run through tests in order to verify the normality of errors and homoscedasticity, and were later analyzed by Parametric Variance Analysis (ANOVA). The data o performance were submitted to Tukey test and the pigments evaluated by the Duncan test, both with a meaningfulness level of 5%. Diets enriched with different carotenoid pigments did not influence on the growth of young Kinguios. In relation to survival, the supplementation of lutein presented higher values compared to the other treatments. The diets containing astaxanthin and canthaxanthin isolated led to increase of deposition of skin carotenoids of young kinguios when compared to treatment control, The lowest indexes were observed on the controlled diet and on the combined one (astaxanthin + canthaxanthin). On the fish fed with the diet containing lutein the skin carotenoid deposition was as effective as pure treatmens (astaxanthin and canthaxanthin), but it did not differ from neither control treatment nor combined treatment (canthaxanthin + lutein). The results suggest that the inclusion of carotenoids on the diet do not influence the growth of young kinguios and that when pigments are supplied separately they are more efficient on skin deposition than in a combined way. On the other hand, the supplementation with lutein enhanced the survival and promoted skind carotenoid deposition on young kinguios similarly to astaxanthin and canthaxanthin / O objetivo do presente estudo foi avaliar a eficiência da suplementação com luteína no desempenho e deposição de carotenoides na pele em comparação com outras fontes para juvenis de kinguio. Para isto foi avaliada uma dieta controle e quatro dietas enriquecidas com a quantidade de 50 mg kg-1 de pigmento: luteína, astaxantina, cantaxantina e combinação de luteína + cantaxantina (25 mg kg-1 proveniente de cada uma das fontes). O delineamento experimental foi inteiramente casualizado com cinco tratamentos e seis repetições. Foram utilizados 240 juvenis de kinguio com peso médio de 1,07±0,57 g, mantidos em 30 aquários de 30 L, ao qual foram cultivados por 84 dias. Os peixes foram alimentados três vezes ao dia (08:30; 12:30; 17:00) de forma manual até saciedade aparente. No final do experimento o desempenho produtivo dos peixes foi determinado com base nos parâmetros zootécnicos: peso final, ganho de peso, consumo de ração, conversão alimentar e sobrevivência. A análise da concentração de pigmentos no tegumento foi realizada através da extração de carotenoides na pele com o uso de solventes. A solução obtida foi filtrada e submetida a leitura em espectrofotômetro com comprimento de onda de 474 nm. Os resultados foram submetidos a testes para verificação da normalidade dos erros e homecedasticidade, sendo analisados posteriormente por meio de Análise de Variância Paramétrica (ANOVA). Os dados de desempenho foram submetidos ao teste de Tukey e os de pigmentação avaliados pelo teste de Duncan, ambos com nível de significância de 5%. Dietas enriquecidas com pigmentos carotenoides não influenciaram no crescimento de juvenis de kinguio. Em relação a sobrevivência, a suplementação com luteína apresentou valores superiores quando comparado aos demais tratamentos. A suplementação com astaxantina e cantaxantina aumentou a deposição de carotenoides na pele de juvenis de kinguios em relação ao tratamento controle. As menores taxas de pigmentação foram observadas no tratamento controle e combinado (cantanxatina + luteína). Nos peixes alimentados com a dieta contendo luteína a deposição de carotenoides foi tão eficiente quanto os tratamentos puros (astaxantina e cantaxantina), porém não diferiu do tratamento controle e do tratamento combinado (cantaxantina + luteína). Os resultados sugerem que a inclusão de carotenoides na dieta não afeta o crescimento e eficiência alimentar de juvenis de kinguio e que quando os pigmentos são fornecidos isoladamente são mais eficientes para serem depositados na pele do que de forma combinada (luteína + cantaxantina). Por outro lado, a suplementação com a luteína melhorou a sobrevivência e promoveu deposição de carotenoides na pele de juvenis de kinguio semelhante a astaxantina e a cantaxantina

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:51:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 01 - capa_abstract.pdf: 124558 bytes, checksum: bad84451063512c6789c09aabfdf0fd7 (MD5) Previous issue date: 2009-02-17 / Mutants of Lactobacillus delbrueckii UFV H2b20 were isolated after treatment with ultra violet light, acridine orange, or ethyl methane sulfonate. After the mutagenic treatments, ten colonies were picked randomly from each treatment and were the mutants characterized. Specific growth rate (µ) and survival to successive freeze-thaw cycles were assessed for each isolate along with milk acidification rate and survival to storage at – 20 ºC with different crioprotective agents. Among all 30 isolates, mutants MUV9, MAC6, and MEMS2 displayed higher µ values and better survival after repeated freezethaw cycles. Survival of the mutant strains after 15 days at – 20 ºC, both in the presence and the absence of cryoprotective, was better than survival of the wild type. Reconstituted non fat milk (10 %) proved to be a better cryoprotective agent than saccharose and monosodium glutamate for storage at – 20 ºC. Survival rates were higher for mutants MAC6 and MEMS2, after 15 days at – 20 ºC. Cold shock, at 10 ºC for four-hours, and heat shock, 50 ºC for 30 minutes, enhanced survival of the mutant strains and also of the parental strain as measured after 70 days at – 20 ºC. Cold shock response allowed better survival to all the strains, mutant and parental, when compared to the heat shock. The results reported here show that strain development of L. delbrueckii UFV H2b20 for technological purposes can be achieved by a classical genetic mutation. / Mutantes de Lactobacillus delbrueckii UFV H2b20 foram isolados após procedimento de mutagênese com luz ultravioleta, acridina laranja e etil metano sulfonato. Após este procedimento, foram selecionadas, aleatoriamente, 10 colônias em cada tratamento para serem caracterizadas quanto à velocidade específica de crescimento (µ) e sobrevivência a três ciclos de congelamento e descongelamento. Dentre o total de 30 isolados selecionados os mutantes MUV9, MAC6e MEMS2, sendo estes os que apresentaram maior µ e tolerância a repetidos ciclos de congelamento e descongelamento. A sobrevivência das estirpes mutantes após 15 dias de estocagem a – 20 ºC na ausência e na presença de substâncias crioprotetoras foi maior do que a da estirpe selvagem. Dentre as substâncias crioprotetoras utilizadas, o leite desnatado reconstituído a 10 % foi o que conferiu melhor proteção durante a estocagem a – 20 ºC. Após 15 dias de estocagem a – 20 ºC, os mutantes MAC6 e MEMS2 foram os que apresentaram maior sobrevivência. O choque frio, 10 ºC por 4 horas e o choque térmico, 50 ºC por 30 minutos aumentaram a sobrevivência das estirpes mutantes e da estirpe parental à estocagem de 70 dias a -20 ºC, sendo que o choque frio permitiu maior sobrevivência ao congelamento as estirpes mutantes e parental do que o choque térmico. Os resultados aqui apresentados estimulam a continuidade do trabalho de melhoramento de L. delbrueckii UFV H2b20 para uso tecnológico.

Orientador: Miriam harumi Tsunemi / Banca: Luciana Vaz de Arruda Silveira / Banca: Diogo Francisco Rossoni / Resumo: Na literatura é discutido o uso de planárias como bioindicadores de qualidade das águas, pois diferentes dos ensaios de toxicologia clássica, os animais conseguem captar efeitos de exposição a longo prazo. Atualmente, uma das técnicas de se verificar a qualidade das águas com o uso de planárias é realizando o teste cometa. Propomos uma forma alternativa para verificar a qualidade das águas utilizando planárias, a qual consiste em acompanhar o tempo de vida das mesmas inseridas em diferentes ambientes aquáticos. No estudo presente foram utilizados os dados obtidos por uma empresa que atua no ramo petroquímico e que utiliza as águas do rio Jaguari em seu processo de produção, nos quais foram aplicadas as técnicas estatísticas de análise de sobrevivência para comparar os níveis de poluentes tóxicos nos diferentes ambientes aquáticos. Também propomos um modelo de regressão para realizar inferências nos tempos de vida das planárias para os diferentes locais dos quais foram coletadas as amostras de água. O novo método proposto apresentou uma forma eficiente e de baixo custo no uso das planárias da espécie Dugesia Tigrina como bioindicadores de qualidade de águas. / Abstract: In literature the use of planarians as bioindicators of water quality is discussed, because differently from classic toxicology tests, the animals are able to capture long term exposition effects. Currently, one of techniques to verify the water quality with the use of planarians is performing the comet assay. We propose a new alternative to verify the water quality by accompany lifetime planarians on different aquatic environments. In the present study we used data obtained from a petrochemical company that uses Jaguari river on its production process. Survival Analysis was used to compare the levels of toxic pollutants on different aquatic environments. We also propose a regression model to make inference in the lifetimes of planarians for the different locations from which water samples were collected. The new proposed method presented an efficient and low cost way to use planarians of Dugesia Tigrina specie as water quality bioindicators / Mestre