Thesis (Ph. D., Entomology)--University of Idaho, December 2008. / Major professor: Juan Manuel Alvarez. Includes bibliographical references. Also available online (PDF file) by subscription or by purchasing the individual file.

Thesis (Ph. D.)--University of Wisconsin--Madison, 1966. / Typescript. Vita. Description based on print version record. Includes bibliographical references.

Submitted by LEYSIMAR RIBEIRO PITZR GUIMARÃES null (leysimarpitzr@yahoo.com.br) on 2016-02-22T23:20:46Z No. of bitstreams: 1 INDUÇÃO DE RESISTÊNCIA A Tomato severe rugose virus E Tomato chlorosis virus EM TOMATEIRO DETERMINADO.pdf: 1461974 bytes, checksum: b14361aa399e745bf4f86148a2d83cde (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-02-23T16:32:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 guimares_lrp_dr_bot.pdf: 1461974 bytes, checksum: b14361aa399e745bf4f86148a2d83cde (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-23T16:32:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 guimares_lrp_dr_bot.pdf: 1461974 bytes, checksum: b14361aa399e745bf4f86148a2d83cde (MD5) Previous issue date: 2016-02-18 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Uma das principais causas da perda de produção do tomateiro ocorre devido à infecção precoce das plantas por vírus dos quais podemos destacar as espécies Tomato severe rugose virus (ToSRV) e Tomato chlorosis virus (ToCV). O controle de vírus é muito difícil, e diversas táticas podem ser utilizadas pelo produtor, dos quais podemos citar o uso de produtos químicos que causam efeitos fisiológicos secundários. Nesta linha o presente trabalho avaliou o efeito da aplicação de Piraclostrobina+Metiran (Cabrio Top®) na produção e qualidade de frutos de tomate em plantas infectadas por ToSRV e ToCV, em diferentes fases fenológicas do ciclo da cultura. O ToSRV também foi quantificado por qPCR nestas plantas. Dois experimentos foram realizados paralelamente, onde um recebeu um pré-tratamento pela aplicação de Piraclostrobina+Metiram (P+M) (3 g. l -1) (BASF) ® + Boscalida (0,3 g. l -1) (BASF) ® na bandeja após a semeadura e no outro as mudas de tomateiro não receberam nenhum produto. Os tratamentos foram constituídos da inoculação do vírus por Bemisia tabaci biótipo B aos 15, 30, 45, 60, 75 dias após o transplantio (DAT) com aplicação ou não de Piraclostrobina+Metiram (P + M) (4.0 g. l -1). O ToSRV foi detectado por RCA-PCR e qPCR e o ToCV por NESTED RT-PCR , além das caraterísticas de produção e qualidade de frutos terem sido avaliadas. Os resultados obtidos demonstraram que plantas infectadas após os 45 DAT são menos afetadas pela infecção de ToSRV e ToCV e a aplicação de P + M ao longo do ciclo da cultura trouxe benefícios ao tomateiro uma vez que características de produção e qualidade dos frutos foram menos afetadas. A replicação viral do ToSRV foi negativamente influenciada pela aplicação do P + M sugerindo um possível envolvimento de mecanismos de resistência da planta ao vírus induzidos pelo produto. / The early infection of plants by viruses such as the species of Tomato severe rugose virus (ToSRV) and Tomato chlorosis virus (ToCV) is one of the main causes of tomato yield loss. The virus control is very difficult and different approaches can be used by the growers against the viruses. The use of chemicals that cause secondary physiological effects is one example. Based on this information the present study evaluated the effect of applying Pyraclostrobin + Metiran (Cabrio Top®) on production and fruit quality of tomato plants infected by ToSRV and ToCV in different phenological phases of the crop cycle. The ToSRV was also quantified by qPCR in these plants. Two experiments were carried out in parallel, where one received a pretreatment by applying Pyraclostrobin + metiram (P + M) (3 g. L -1) (BASF) ® + Boscalida (0.3 g. L -1) (BASF ) ® in the tray after sowing and the other the tomato seedlings did not receive any product. The treatments consisted of virus inoculation by Bemisia tabaci biotype B at 15, 30, 45, 60, 75 days after transplanting (DAT) with application or not of Pyraclostrobin + Metiram (P + M) (4.0 g. L -1). The ToSRV was detected by RCA-PCR and qPCR and ToCV by NESTED RT-PCR. In addition fruit production and quality characteristics were also evaluated. The results indicated that infected plants after 45 DAT are less affected by the infection of ToSRV and ToCV and application of P + M during the crop cycle brought benefits to the tomato, because production and fruit quality characteristics were less affected. Viral replication in ToSRV was negatively influenced by the application of P + M suggesting a possible involvement of plant resistance mechanisms to the virus induced by the product.

The present study aimed to examine the effects of root colonization in tomato, Solanum lycopersicum L. cv. Moneymaker, by the arbuscular mycorrhizal (AM) fungus, Glomus intraradices Shenck and Smith, on alleviating salt stress. I postulated that AM symbiosis increases tomato plant performance to salt stress. Two greenhouse experiments were done according to a randomized factorial experimental design. The results showed a significantly higher level of AM root colonization that also occurred earlier in salt than non-salt treated plants. There were also positive interactions between root colonization levels and the alleviation of salt stress; these contributions resulted initially on higher root fresh mass (FM), later on shoot FM, and DM, and higher phosphorus and unchanged potassium concentrations in roots. The effects observed in salt-treated plants were significant when root colonization levels were significantly different than those observed in non-salt treated plants. This suggests a relationship between the level of root colonization and the alleviation of salt stress in plants. The attempt to use molecular techniques to detect early root colonization was quite successful in detecting the presence of G. intraradices in AM plants. However, it was not possible to detect the presence of the AM fungus as early as by classical root staining. This was observed presumably because sampling methods were different. In general, the results support the hypothesis that AM root colonization contributes to some extent to salt resistance of tomato plants.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2017-09-28T13:19:50Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dal Molin.2017.Parentes silvestres da batata - áreas prioritárias para coleta no Brasil e variabilidade do germoplasma.pdf: 1677899 bytes, checksum: 0a640c63677280e68d50be964d17ea51 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-10-23T11:13:16Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dal Molin.2017.Parentes silvestres da batata - áreas prioritárias para coleta no Brasil e variabilidade do germoplasma.pdf: 1677899 bytes, checksum: 0a640c63677280e68d50be964d17ea51 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-23T11:13:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dal Molin.2017.Parentes silvestres da batata - áreas prioritárias para coleta no Brasil e variabilidade do germoplasma.pdf: 1677899 bytes, checksum: 0a640c63677280e68d50be964d17ea51 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-08-11 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / O Brasil é reconhecido internacionalmente pela riqueza em biodiversidade. Dentre as milhares de espécies vegetais existentes, temos três parentes silvestres da batata cultivada (Solanum tuberosum, Solanaceae) com ocorrência no país. A conservação e utilização de recursos genéticos das espécies cultivadas têm apresentado vantagens ao desenvolvimento mundial. Desse modo, o presente trabalho tem por objetivo qualificar ações de coleta e conservação de acessos de batata-silvestres para o melhoramento da batata cultivada no enfrentamento de possíveis obstáculos futuros. Para tal, foram desenvolvidos dois estudos, o primeiro teve por objetivo utilizar a metodologia Gap Analysis ou análise de lacunas, para identificar áreas prioritárias para coleta de germoplasma de batata-silvestre no Brasil. Os dados de pontos geográficos de acessos coletados e conservadas no Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Clima Temperado e os registros de ocorrência em herbários para as três espécies silvestres foram submetidos à análise de lacunas. Os resultados apontaram três principais regiões majoritariamente localizadas em Santa Catarina, de ocorrência para duas espécies de média prioridade de coleta. A segunda pesquisa avaliou a variabilidade genética baseada na caracterização morfológica entre os acessos de batata-silvestre conservados no Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Clima Temperado. Para tanto, foram cultivados 54 acessos de batata-silvestre em ambiente protegido de casa-devegetação na Embrapa Clima Temperado, com posterior aplicação dos descritores morfológicos para batata. Após, com base nos dados de caracterização, foi realizada análise multivariada utilizando dois métodos estatísticos: o agrupamento UPGMA e a análise de componentes principais. Por meio do agrupamento dos 54 acessos foi possível observar a formação de 39 grupos. A análise dos componentes principais evidenciou que os caracteres que mais contribuíram para a variabilidade do conjunto de acessos avaliados considerando o primeiro componente foram o número de folíolos laterais e a cor do caule. Para o segundo componente os caracteres de maior autovetor foram a cor predominante da flor e a intensidade da coloração da base do broto. Foi evidenciado alto grau de variabilidade fenotípica entre os acessos do BAG. Por fim, o presente trabalho destaca a importância da variabilidade genética para o melhoramento da espécie cultivada, pois além de fornecer informações preliminares sobre os acessos conservados, orienta novos locais para coleta de germoplasma inédito, provendo o melhorista de dados sobre o germoplasma de batata-silvestre para uso atual ou futuro na obtenção de genótipos superiores. / Brazil is internationally recognized for the richness of its biodiversity, among the thousands of plant species that exist, the country have three wild relatives of the cultivated potato (Solanum tuberosum, Solanaceae). The conservation and utilization of genetic resources of the cultivated species have presented advantages to the world development. Thus, the present work aims to qualify actions of collection and conservation of wild potato accesses for potato breeding in the face of possible future obstacles. To do this, two studies were developed, the first of which was to use the Gap Analysis methodology to identify priority areas for the collection of wild potato germplasm in Brazil. Data from the geographic points of accesses collected and conserved at the Embrapa Active Gene Bank with the records of occurrence for the three wild species were analyzed with the aid of R software. The results highlighted three main regions located in Santa Catarina with occurrence of two species of medium collection priority. Thus, new collection expeditions are necessary to increase the conserved genetic variability, with the introduction of new accesses from areas previously not sampled. The second research evaluated the genetic variability based on the morphological characterization among the wild potato accesses conserved in the Embrapa Clima Temperado Gene Bank. For this, 54 wild potato accessions were cultivated in a protected environment in greenhouses at Pelotas, RS, Brazil, with subsequent application of the morphological descriptors for potatoes. Afterwards, based on the data collected, the multivariate analysis of the data was performed using two statistical methods: the UPGMA grouping and the main component analysis. By grouping the 54 accessions into similar sets it was possible to observe the existence of 39 groups. Consequently, the analysis of the main components showed that the characters that contributed the most to the variability of the set of accesses evaluated according to the first component were number of lateral leaflets and stem color. Whereas for the second component the characters of greater eigenvector were predominant color of the flower and intensity of coloration of the base of the shoot. The UPGMA group confirmed the occurrence of a high degree of phenotypic variability among the accesses of the genebank, in addition to identifying the variables that contributed the most to the formation of groups among the genotypes according to each of the two main components selected. Finally, the present work confirms the importance of genetic variability for the breeding of the cultivated species, providing preliminary information on the conserved accesses. The study points new sites for the collection of new germplasm, providing data on wild potato germplasm for current or future use in crop breeding to obtain superior genotypes.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-06-07T14:11:08Z No. of bitstreams: 1 Cristiane de Souza Paulino.pdf: 1130844 bytes, checksum: 399c5ddacf47b5308611c4a24ae8b9f2 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-07T14:11:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cristiane de Souza Paulino.pdf: 1130844 bytes, checksum: 399c5ddacf47b5308611c4a24ae8b9f2 (MD5) Previous issue date: 2017-02-07 / The functional andromonoecy present in the genus Solanum, gives it a peculiar character, where hermaphrodite flowers with short stylet behave as masculine and hermaphrodite flowers with long stylet as fruit formers. With the objective of analyzing the reproductive biology of Solanum paniculatum L., Solanum stramoniifolium Jacq. and Solanum torvum Sw., it was investigated morphofunctional aspects of its flowers and the reproductive system. The work was carried out in anthropic areas near the campus of the Federal Rural University of Pernambuco - UFRPE (8 ° 01'05 "S and 34 ° 56'48" W) and at the edge of the forest at Dois Irmãos State Park - PEDI ( 8 ° 07'30 "S and 34 ° 52'30" W). Pollen viability, pollen / ovule ratio, morphometry, floral biology and morphs distribution were evaluated in inflorescences / individual / species. In addition to intra and inter morphic crosses, in the manual treatments of self-pollination and cross-pollination, slides were made for analysis and pollen tube growth observation. Solanum paniculatum has a pale violet corolla; S. stramoniifolium and S. torvum exhibit white flowers. The species have flowers that have the stylet passing the cone of the anthers and flowers in which the stylet is below the level of the anthers. In addition, they have significant morphological differences only at the stylet level, with polymorphism at the stylet level. For S. paniculatum, the mean value recorded was 1.2 cm (± 0.06) for long-styled flowers and 0.4 cm (± 0.06) for short-styled flowers. For S. stramoniifolium, it was 0.9 cm (± 0.06) for flowers that have a stylet exceeding the anthers cone and 0.31 cm (± 0.07) for short-styled flowers. The species S. torvum was 0.9 cm (± 0.17) for long-styled flowers and 0.3 cm (± 0.07) for short-styled flowers. There is a defined pattern for the proportion of long-styled and / or short-styled flowers in an inflorescence or even in individuals, where more than 80% of flowers have stilettoes that extend beyond the anther cone. Generally, long-styled flowers of S. stramonifolium are found in basal positions of inflorescences and short-styled flowers in distal positions. This pattern was not observed in S. paniculatum and S. torvum. The analyzed morphs offer pollen viability above 97% and high pollen/ovum ratio. Solanum paniculatum and S. stramoniifolium are self-incompatible, presenting mechanisms of gametophytic self-incompatibility. Already S. torvum is self-compatible. All three are considered as crossbreeds. Only the long styled flowers formed pollen tube that reached the eggs after 24h. Short-styled flowers, however, did not form a pollen tube in any treatment. In view of the above, the species can be classified as functional andromonoic, where short stylet flowers act as male and long styloff flowers as hermaphrodite, having reproductive capacity. / A andromonoicia funcional presente no gênero Solanum lhe confere um caráter peculiar, onde flores hermafroditas com estilete curto se comportam como masculinas e flores hermafrodita com estilete longo como formadoras de frutos. Com o objetivo de analisar a biologia reprodutiva de Solanum paniculatum L., Solanum stramoniifolium Jacq. e Solanum torvum Sw., foi investigado aspectos morfofuncionais de suas flores e o sistema reprodutivo. O trabalho foi realizado em áreas antropizadas nas proximidades do campus da Universidade Federal Rural de Pernambuco - UFRPE (8°01'05"S e 34°56'48"W) e na borda da mata do Parque Estadual de Dois Irmãos - PEDI (8°07'30"S e 34°52'30"W). Foram realizadas análises de viabilidade polínica, razão pólen/óvulo, morfometria, biologia floral e distribuição dos morfos nas inflorescências/indivíduo/espécie. Além de cruzamentos intra e inter morfos, nos tratamentos manual de autopolinização e polinização cruzada, sendo feitas lâminas para análise e observação do crescimento do tubo polínico. As espécies apresentam tanto flores que possuem o estilete ultrapassando o cone das anteras quanto flores em que o estilete fica abaixo do nível das anteras. Além disso, possuem diferenças morfológicas significativas apenas ao nível do estilete, apresentando polimorfismo a nível do estilete. Para S. paniculatum o valor médio do estilete foi de 1,2 cm (± 0,06) para flores de estilete longo e 0,4 cm (± 0,06) para flores de estilete curto. Já para S. stramoniifolium, o valor médio do estilete foi de 0,9 cm ( ± 0,06) para flores que possuem estilete ultrapassando o cone das anteras e 0,31 cm ( ± 0,07) para flores de estilete curto. Quanto à espécie S. torvum o valor médio do estilete foi de 0, 9 cm ( ± 0,17) para flores de estiletes longos e 0,3 cm (± 0,07) para flores de estilete curto. Existe um padrão definido quanto à proporção de flores de estilete longo e/ou estilete curto numa inflorescência ou mesmo nos indivíduos, onde mais de 80% das flores possuem estiletes que ultrapassam o cone das anteras. Geralmente, flores de estilete longo de S. stramoniifolium encontra-se em posições basais das inflorescências e as flores de estilete curto em posições distais. Esse padrão não foi obervado em S. paniculatum e S. torvum. Os morfos analisados oferecem viabilidade polínica acima de 97% e alta taxa de razão pólen/óvulo. Solanum paniculatum e S. stramoniifolium são autoincompatíveis, apresentando mecanismos de autoincompatibilidade gametofítica. Já S. torvum é autocompatível. As três espécies são consideradas alógamas. Apenas as flores de estilete longo formaram tubo polínico que alcançaram os óvulos após 24h. Já as flores de estilete curto não formaram tubo polínico em nenhum tratamento. Diante do exposto, as espécies podem ser enquadradas como andromonoicas funcionais, onde flores de estilete curto atuam como masculinas e flores de estilete longo como hermafroditas, possuindo a capacidade de reprodução.

La regeneración de plantas a partir de explantes es la base de partida para poder aplicar tecnologías tales como la obtención de plantas haploides o la transformación genética. Este carácter presenta una amplia variabilidad inter e intraespecífica. Así, incluso dentro de la misma especie, podemos encontrarnos genotipos recalcitrantes cuya falta o escasa regeneración limita la aplicación de estas técnicas. Además del componente genético, otros factores que condicionan el éxito de la regeneración son: las condiciones fisiológicas del material de partida, los componentes del medio de cultivo, los reguladores de crecimiento, la temperatura, la luz, etc¿ La falta de información acerca de qué factores determinan que este proceso se produzca por una u otra vía morfogenética (la vía organogénica o la embriogénica) y la incertidumbre de cuantos genes están implicados, indica la necesidad de investigación básica de este proceso. El objetivo principal de este trabajo se centra en incrementar el conocimiento de la base genética así como la localización de QTLs implicados en la regeneración por la vía organogénica que es la predominante en tomate. Para ello, se han utilizado dos poblaciones de mapeo (F2, BC1) obtenidas por la Dra. Gisbert. La población F2 se obtuvo a partir de la autofecundación de una planta F1, resultante del cruce de una planta de tomate (S. lycopersicum L.) seleccionada por su escasa capacidad regenerativa (Anl27) y la accesión PE-47 de S. pennellii Correll. con alta capacidad de regeneración. Por su parte, la población BC1 se obtuvo a partir del cruce (Anl27 x F1). Con estos materiales se ha realizado una caracterización fenotípica y genotípica en clones de cada genotipo, que se han mantenido en cultivo in vitro. Utilizando el programa informático MapQTL¿ se han identificado seis QTL implicados en la regeneración localizados en los cromosomas 1, 3, 4, 7 y 8. Cinco de los QTLs (SpRg-1, Rg-3, SpRg-4a, SpRg- 4b, SpRg-7) proceden del tomate silvestre S. pennellii y uno (SlRg-8) procede de S. lycopersicum. El porcentaje de varianza explicada por cada QTL va desde el 7,4% al 27%, dentro del rango común (6-26%) registrado en el mapeo genético de QTLs relacionados con la regeneración in vitro en otros cultivos. SpRg-1 es el mayor responsable de la respuesta morfogenética mientras que SpRg-7 promueve el desarrollo del brote hacia una planta completa. Por otra parte los QTLs detectados en los cromosomas 8 (SlRg-8) y 4 (SpRg-4a, SpRg-4b) podrían contener genes que influyen en la formación de yemas y su desarrollo, respectivamente. Finalmente Rg-3, situado en la mitad del cromosoma 3 y ligado al gen de la invertasa ácida, se presenta como un alelo putativo del gen Rg detectado en S. peruvianum (Rg-1) y S. chilense (Dunal) Reiche. (Rg-2). Además del genotipo, el tipo y combinación de reguladores de crecimiento son importantes para el éxito de los protocolos de regeneración. En tomate, los reguladores de crecimiento más utilizados son las citoquininas, o la combinación de estas con auxinas. Otros reguladores como el etileno se han estudiado poco y los trabajos publicados muestran conclusiones dispares. Con el fin de estudiar la influencia del etileno en la regeneración se han realizado ensayos con dos compuestos liberadores de etileno (Ácido 1-aminociclopropano-1- carboxílico ¿ACC¿ y ácido 2-Cloroetil fosfónico ¿Ethephon¿) y dos inhibidores de etileno: AgNO3, que inhibe la acción del etileno; y CoCl2, que inhibe la producción de etileno. Los resultados obtenidos muestran que la concentración y el momento de la aplicación son dos factores fundamentales a tener en cuenta para el éxito de la respuesta organogénica. En concreto, la aplicación de inhibidores de etileno y su consecuente disminución tiene un efecto negativo sobre la regeneración en tomate ya que se disminuye y se retrasa la respuesta. Así mismo, las plantas regenerantes obtenidas presentan tamaño reducido, pudiendo aparecer vitrificación y malformaciones. Por otra parte, la suplementación de etileno puede mejorar la regeneración. Así, el número de plantas regeneradas a partir de explantes de S. pennellii se duplicó en los medios con ACC respecto al medio control. Si la aplicación de ACC se realiza tras la inducción de las yemas, pasados 10 días, el rendimiento total será mayor. Este resultado indica que éste compuesto podría ser utilizado para mejorar la regeneración en aquellos genotipos donde una vez formadas las yemas, el desarrollo de estas hacia plantas es el paso limitante. Por otra parte, las plantas regenerantes obtenidas muestran buen desarrollo, por lo que la suplementación de etileno no afecta al posterior crecimiento de las plantas regeneradas. Finalmente se ha estudiado la capacidad organogénica de las especies silvestres de tomate derivadas del complejo S. peruvianum L. sensu lato (s.l.): Solanum arcanum Peralta., Solanum huaylasense Peralta., Solanum corneliomulleri J. F. Macbr. y Solanum peruvianum L. sensu stricto (s.s.). Estas especies pueden tener un papel fundamental en la mejora, sobre todo de resistencias a factores bióticos. Sin embargo, debido a las barreras de hibridación que existen entre éstas y el tomate cultivado, no se han explotado en su totalidad en la mejora del cultivo. Para realizar cruces se ha recurrido a la fusión de protoplastos y el rescate de embriones. Sin embargo, no se ha estudiado la capacidad organogénica de las especies derivadas del complejo Peruvianum, lo que limita la aplicación de estas técnicas. En este trabajo se ha encontrado variabilidad intra e interespecífica en la capacidad organogénica de las especies silvestres derivadas de este complejo. En general, todas las accesiones ensayadas de S. corneliomulleri y S. huaylasense mostraron una elevada capacidad regenerativa y se han identificado accesiones recalcitrantes en S. arcanum (LA-2185) y S. peruvianum s.s (ECU-106 y CH-20). En este trabajo, también se ha realizado un análisis morfológico de las hojas que ha determinado que el número de foliolos y el nivel de dentición de los mismo pueden ser utilizados en la identificación in vitro de las especies del complejo. Sin embargo, el área de foliolo solo permite distinguir a S. arcanum del resto de especies del complejo. Finalmente se ha observado que las accesiones cuyas hojas tienen mayor número de foliolos y mayor nivel de dentición tienen una mayor regeneración. / Trujillo Moya, C. (2013). Estudio de la Capacidad Organogénica en tomate y especies relacionadas: Localización de QTLS implicados y estudio de la influencia del Etileno [Tesis doctoral no publicada]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/31665 / TESIS

La helada se caracteriza por el descenso de la temperatura del aire bajo los cero grados Celsius, es uno de los problemas más severos para la agricultura andina, siendo las regiones más afectadas del Perú, aquellas ubicadas entre los 2 500 y 3 500 metros sobre el nivel del mar (m.s.n.m.). Estudios a nivel morfológico y fisiológico indican que las papas nativas constituyen importantes fuentes de genes relacionados con la tolerancia a heladas. Sin embargo, aún son desconocidos los mecanismos moleculares de tolerancia en estas papas. La tecnología de secuenciación de RNA (RNA-seq) es una excelente herramienta para identificar cambios en el perfil de expresión de los genes. En este estudio, utilizando RNA-seq, realizamos un análisis comparativo del transcriptoma de dos variedades de Solanum tuberosum subsp. andigena con respuesta contrastante al estrés de helada. Se alinearon más de 199 millones de lecturas usando el genoma de referencia Solanum tuberosum Group Phureja, que correspondió al 82.3% de las lecturas totales obtenidas tras el secuenciamiento. Se identificaron 279 y 160 genes expresados diferencialmente en Yana Manwa (YM, variedad tolerante al estrés por helada) y Yuraq Gaspar (YG, variedad susceptible), respectivamente. En general, los genes expresados diferencialmente enriquecidos (DEGs) estuvieron implicados en la estructura de la pared celular, metabolismo de carbohidratos, enzimas con actividad antioxidante. Además, identificamos DEGs asociados a diferentes factores de transcripción. Estos resultados proporcionan nuevos conocimientos sobre los sistemas de regulación de la tolerancia a la congelación de la papa y proporcionan recursos genéticos para estudios posteriores. / Tesis

Submitted by Jorge Cativo (jorge.cativo@inpa.gov.br) on 2018-08-23T14:38:12Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Matheus Miranda Caniato.pdf: 2877850 bytes, checksum: 9f5a34aab328acaeb1c5681aefacab65 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-23T14:38:12Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Matheus Miranda Caniato.pdf: 2877850 bytes, checksum: 9f5a34aab328acaeb1c5681aefacab65 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-01-30 / The use of rhizobacteria to increase crop productivity by promoting growth and management of the target spot through the induction of systemic resistance to plant diseases are shown as tool capable of allowing the expansion of tomato North region. Thus, the objectives of this work were to evaluate the influence of biochar in the population of cultivable soil bacteria, besides the root colonization capacity of bacterial isolates, growth promotion, phosphate solubilization, indole acetic acid production and induction of resistance to Corynespora almost. The influence of the isolates origin on the mentioned variables was also evaluated. As well as the identification of the bacterial isolates. The influence of the bio-carbon on the population of cultivable soil bacteria was carried out using the colony-forming unit counting methodology. Verification of root colonization was performed using techniques for visualizing turbidity zones in tubes with agar-water (0.8%), optical microscopy and root plating. Growth promotion and induction of resistance were evaluated in greenhouse and the experimental design adopted for both experiments was completely randomized and inoculation of the bacteria was performed by microbiolization. Identification was performed by sequencing the 16S rRNA gene. The results indicate that doses up to 34 t ha-1 positively influence the population of cultivable soil bacteria in the 0-10 cm layer. The three methods used to evaluate root colonization were efficient and complement each other in the interpretation of the results. The isolates ISO4T2, ISO22T3, ISO53T1, ISO17T3 and ISO113T1 promoted an increment in the confirmation test and present potential to be evaluated in the field in the future. Isolates 7T1, 114T1 and 52T2 induced partial resistance against C. cassiicola and present potential to be evaluated under field conditions. The origin of the isolates has influence on the ability to colonize the root system of tomato plants and solubilize phosphate, but does not affect the other variables. The partial sequencing of the 16S rRNA gene allowed the identification of 23 isolates at the genus and group level, but not in species. / A inoculação de rizobactérias visando o aumento da produtividade das culturas, por meio da promoção de crescimento e o manejo da mancha alvo por meio da indução de resistência sistêmica a doenças em plantas, mostram-se como ferramentas capazes de permitirem a expansão do cultivo de tomate na Região Norte. Assim, os objetivos desse trabalho foram avaliar a influência do biocarvão sobre a população de bactérias cultiváveis do solo, além da capacidade de colonização radicular dos isolados bacterianos, promoção de crescimento, solubilização de fosfato, produção de ácido indól acético e indução de resistência a Corynespora casiicola. A influência da origem dos isolados sobre as variáveis mencionadas também foi avaliada. Assim como foi realizada a identificação dos isolados bacterianos. A influência do biocarvão sobre a população de bactérias cultiváveis do solo foi realizada por meio da metodologia de contagem de unidade formadora de colônias. A verificação da colonização radicular foi realizada por meio das técnicas de visualização de zonas de turbidez em tubos com ágar-água (0,8%), microscópia de luz e plaqueamento de raízes. A promoção de crescimento e a indução de resistência foram avaliadas em casa de vegetação e o delineamento experimental adotado para ambos os experimentos foi o inteiramente casualizado e a inoculação das bactérias foi realizada por microbiolização. A identificação foi realizada por meio do sequenciamento do gene 16S rRNA. Os resultados indicaram que doses até 34 t ha-1 influenciaram de forma positiva a população de bactérias cultiváveis do solo na camada de 0-10 cm. Os três métodos utilizados para avaliação da colonização radicular se mostraram eficientes e se complementaram na interpretação dos resultados. Os isolados ISO4T2, ISO22T3, ISO53T1, ISO17T3 e ISO113T1 promoveram incremento no teste de confirmação e apresentaram potencial para serem avaliados futuramente em campo. Os isolados, 7T1, 114T1 e 52T2 induziram resistência parcial a C. cassiicola e apresentaram potencial para serem avaliados em condição de campo. A origem dos isolados influenciou a capacidade de colonizar o sistema radicular de plântulas de tomateiro e de solubilizar fosfato. O sequenciamento parcial do gene 16S rRNA, permitiu identificar 23 isolados em nível de gênero e grupo, mas não em espécie.

Submitted by Inácio de Oliveira Lima Neto (inacio.neto@inpa.gov.br) on 2018-08-23T18:02:17Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Final PDF.pdf: 14440240 bytes, checksum: 2af4bf3f84a50787393d47d1dd9daac4 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-23T18:02:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação Final PDF.pdf: 14440240 bytes, checksum: 2af4bf3f84a50787393d47d1dd9daac4 (MD5) Previous issue date: 2018-07-31 / The bacterial wilt, caused by Ralstonia solanacearum, is one of the major diseases that affect Tomato cultivation in tropical climates, limiting production. The present work had as objective to evaluate the potential of solanaceous species as rootstock in commercial tomato, on agronomic characteristics, fruit quality and control of bacterial wilt. The experiment was conducted in a greenhouse, in a randomized complete block design, with four blocks, and six treatments, being the rootstocks: Cubiu (Solanum sessiliflorum); two cultivars of Jiló (Solanum aethiopicum), long pale green and large hill; Jurubebão (Solanum lycocarpum) and Jurubeba Juna (Solanum stramonifolium), grafted with the cultivar Santa Cruz Kada, susceptible to the disease. The glue index, plant height and number of leaves at 15 days after grafting, stem diameter, graft stem diameter and graft point diameter at 30, 60 , 90 and 120 days after transplanting. The fruits were collected regularly for the evaluation of the total number of fruits, number of marketable fruits, number of scrap fruits, average mass of marketable fruits and scrap, vertical diameter and horizontal diameter, yield of marketable fruits, . Fruit quality was measured by the analysis of total soluble solids, pulp pH, titratable acidity and soluble solids ratio and titratable acidity. The incidence of the disease was evaluated weekly after the first wilting plant was investigated. Morphological and histological observations of the healing callus of the evaluated treatments were performed. All evaluated rootstocks presented glue index ≥ 93.33%, indicating that there was no initial incompatibility between the combinations evaluated. The number of commercial fruits differed significantly in the rootstocks, which were long, light green and covered, being the treatment with lower total number of fruits and number of commercial fruits among the evaluated treatments. Cubiu presented the lowest values of commercial fruit production and productivity in relation to treatments, except for the jurubeba juna in which it did not differ. There was no incidence of bacterial wilt in the long-green jiló and jurubeba juna rootstocks, which conferred disease resistance on the grafted plants. The histological sections showed incompatibility characteristics of the tomato evaluated with the cubiu, jurubebão and jurubeba juna rootstocks. The rootstocks, long jiló light green and jurubeba juna presented high index of adhesion, resistance to bacterial wilt, and productivity statistically equal to the control in the conditions of the present work, so that they have great potential for use as rootstocks in the crop of the tomato. Key-words: Solanaceae, Ralstonia solanacearum, Solanum lycopersicum, Resistance. / A murcha-bacteriana, causada por Ralstonia solanacearum, é uma das principais doenças que acometem o cultivo do Tomateiro em climas tropicais, limitando a produção. O presente trabalho teve como objetivo avaliar a potencialidade de espécies de solanáceas como porta-enxerto em tomate comercial, sobre características agronômicas, qualidade dos frutos e no controle da murcha bacteriana. O experimento foi conduzido em casa de vegetação, em delineamento experimental em blocos ao acaso, com quatro blocos, e seis tratamentos sendo eles os porta-enxertos: Cubiu (Solanum sessiliflorum); duas cultivares de Jiló (Solanum aethiopicum), a comprido verde claro e a morro grande; Jurubebão (Solanum lycocarpum) e Jurubeba Juna (Solanum stramonifolium), enxertados com o tomateiro cultivar Santa Cruz Kada, susceptível à doença. Foram avaliados o índice de pegamento, a altura da planta e o número de folhas aos 15 dias após a enxertia, e o diâmetro do caule do porta-enxerto, o diâmetro do caule do enxerto e o diâmetro do ponto de enxertia aos 30, 60, 90 e 120 dias após o transplantio. Os frutos foram colhidos regularmente para a avaliação do número total de frutos, número de frutos comerciáveis, número de frutos refugo, massa média dos frutos comerciáveis e refugo, diâmetro vertical e diâmetro horizontal, produção de frutos comerciáveis, produção de frutos refugo, e produtividade. A qualidade dos frutos foi mensurada pela análise de sólidos solúveis totais, pH da polpa, acidez titulável e relação entre sólidos solúveis e acidez titulável. A incidência da doença foi avaliada semanalmente após a averiguação da primeira planta murcha. Observações morfológicas e histológicas do calo cicatricial dos tratamentos avaliados foram realizadas. Todos os porta-enxertos avaliados apresentaram índice de pegamento ≥ 93,33%, indicando não haver incompatibilidade inicial entre as combinações avaliadas. O número de frutos comerciais diferiu significativamente nos porta-enxertos jiló comprido verde claro e cubiu, sendo este o tratamento com menor número total de frutos e número de frutos comerciais dentre os tratamentos avaliados. O cubiu apresentou os menores valores de produção de frutos comerciais e produtividade em relação aos tratamentos, com exceção da jurubeba juna em que não diferiu. Não houve incidência da murcha-bacteriana nos porta-enxertos jiló comprido verde claro e jurubeba juna, que conferiram resistência a doença nas plantas neles enxertadas. Os cortes histológicos evidenciaram características de incompatibilidade do tomateiro avaliado com os portaenxertos cubiu, jurubebão e jurubeba juna. Os porta-enxertos jiló comprido verde claro e jurubeba juna apresentaram alto índice de pegamento, resistência à murcha-bacteriana, e produtividade estatisticamente igual à testemunha nas condições do presente trabalho, de forma que possuem grande potencial para o uso como porta-enxertos na cultura do tomate. Palavras-chave: Solanaceae, Ralstonia solanacearum, Solanum lycopersicum, Resistência.