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Trichoderma spp. no crescimento vegetal e no biocontrole de sclerotinia slcerotiorum e de patógenos em sementes de cártamo(Carthamus tinctorius) / Trichoderma spp. on plant growth and biocontrol of sclerotinia sclerotiorum and seed pathogens of carthamus (Carthamus tinctorius)

Oliveira, Geovana Gomez de 23 March 2007 (has links)
The cultivation of flowers is, in Brazil, very recent and little known species have a high ornamental potential, Cartamus is such a species and there are cultivars for the production of oil and as well as for ornamental pourposes. Being a recent crop in Brazil, little is known about its associated diseases, specially those that affect the seeds and the soil borne, such as white mold that causes great losses to several crops. Six experiments were conducted with the objectives of testing the reaction of the crop to isolates of Sclerotinia sclerotiorum, the biocontrol of S. sclerotiorum and of pathogens associated to the seeds, and the effect of the biocontrollers on cartamus plant growth. Isolates of the pathogen from chrisantemum, lettuce, soybean, and carrots, as well as isolates of Trichoderma sp. (ETSR 20 e TC 1.15) and comercial products of Trichoderma spp. (Agrotrich and Trichodel®) were used. In the reaction test, the cartamus crop was more severely attacked by the isolate obtained from lettuce, which when incorporated to commercial substrate did not promote the development of the disease in plant, but reduced plant growth. Trichodel® was the product that promoted the highest growth of plants when incorporated to the substrate, even in the absence of the pathogen. The product more efficient in controlling seed pathogens was Agrotrich. In the growth of seedlings, the isolates ETSR20 and TC1.15 were the best, when applied to the seeds and the latter promoted the best emergency of seeds in commercial substrate. Therefore, the Trichoderma based products can be used in the control of seed pathogens and growth promotion of cartamus plants as seed or substrate treatment. There are differences in disease severity on cartamus among isolates of S. sclerotiorum from different crops and its presence reduces the crop s growth, even in the absence of visible symptoms / A floricultura, no Brasil, é relativamente recente, existindo espécies pouco conhecidas com alto potencial ornamental. O cártamo é uma delas e possui cultivares tanto para a produção de óleo quanto para ornamentação. Por ser uma cultura recente no Brasil, pouco se conhece sobre as doenças associadas a ela, especialmente as que afetam as sementes e as veiculadas pelo solo, como o mofo branco, que causa grandes prejuízos a diversas culturas. Seis experimentos foram conduzidos com o objetivo de testar a reação da cultura a isolados de Sclerotinia sclerotiorum, o biocontrole de patógenos associados às sementes e de Sclerotinia sclerotiorum e o efeito dos biocontroladores no crescimento de plantas de cártamo. Foram utilizados isolados de Sclerotinia sclerotiorum das culturas do crisântemo, alface, soja e cenoura, e isolados de Trichoderma spp. (ETSR 20 e TC 1.15) e formulados comerciais à base de Trichoderma spp. (Agrotrich e Trichodel®). No teste de reação, a cultura do cártamo foi mais severamente atacada pelo isolado proveniente da alface, o qual, quando incorporado ao substrato comercial, não promoveu o desenvolvimento da doença nas plantas, porém prejudicou seu crescimento. Trichodel® foi o produto que maior crescimento proporcionou às plantas quando incorporado ao substrato, mesmo sem a presença do patógeno. O produto mais eficiente no controle dos patógenos das sementes foi o formulado comercial Agrotrich. No crescimento de plântulas, os isolados ETSR 20 e TC 1.15 se sobressaíram quando aplicados às sementes e este obteve melhor resultado na emergência de plântulas em substrato. Assim, os produtos a base de Trichoderma são viáveis para controle de patógenos de sementes e crescimento de plantas tanto no tratamento de sementes como do substrato. Existem diferenças na severidade da doença em cártamo entre isolados de Sclerotinia sclerotiorum oriundos de diferentes culturas e sua presença reduz o crescimento da cultura, mesmo na ausência de sintomas visíveis
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Avaliação da suscetibilidade antimicrobiana e do perfil de macrorrestrição do DNA de isolados humanos de Salmonella serovar Typhimurium fagotipo 193, no período de 1970 a 2008 / Evaluation of antimicrobial susceptibility and macrorestriction DNA of human isolates of Salmonella serovar Typhimurium phage type 193 in the period 1970 to 2008

Eliane Moura Falavina dos Reis 09 June 2011 (has links)
Para analisar cepas de Salmonella ser. Typhimurium isoladas de processos entéricos e extraintestinais humanos ocorridos no período de 1970 a 2008 de diferentes regiões do país foram selecionadas, com base nos registros contidos no banco de dados do Laboratório de Enterobactérias do IOC/FIOCRUZ, RJ, amostras do fagotipo prevalente 193, visando precipuamente o reconhecimento de clones epidêmicos. Foram selecionadas 553 cepas de Salmonella ser. Typhimurium fagotipo 193 representadas por 91, 65, 70 e 327 amostras referentes as décadas de 70, 80, 90 e ao período de 2000 a 2008, respectivamente. Na análise global da sensibilidade destas cepas, 52% apresentaram um ou mais marcadores de resistência a antibióticos incluídos no perfil ACSSuT. Este perfil de resistência completo foi verificado em 20,9% dos isolados, sendo os 21,9% restantes, sensíveis a todas as drogas testadas, especialmente no período de 2000 a 2008, representadas por 121 amostras (37,0%) em relação as 327 culturas dessa época. O maior percentual de resistência foi observado nas amostras da década de 70 (99%) sendo o perfil ACSSuT detectado em 35,2% dos isolados, ressaltando-se que todas as amostras foram isoladas de processos gastroentéricos ocorridos na cidade de São Paulo. Ao longo das quatro décadas de estudo, descreve-se um ponto de ruptura entre a prevalência de resistência e a suscetibilidade na transição entre as décadas de 80 e 90. Embora o número de isolados de Salmonella ser. Typhimurium fagotipo 193 tenha aumentado no último período considerado, o percentual de mono e multirresistência aos antimicrobianos se situou em nível elevado (63,0%). A análise do polimorfismo obtido após macrorrestrição com a enzima XbaI revelou que cepas isoladas na década de 90 apresentaram elevado percentual de similaridade (≥85%) com cepas isoladas recentemente (período de 2000-2008), sendo agrupadas nos mesmos subclusters. Por outro lado, as cepas da década de 70 inserem-se em subclusters independentes, embora o percentual de similaridade entre tais subclusters e os demais seja ≥70%; o mesmo sendo observado para as cepas isoladas durante a década de 80. Em conclusão, este estudo mostrou que a prevalência de isolados humanos de Salmonella ser. Typhimurium fagotipo 193 no Brasil vem progredindo desde a década de 1990, enquanto a detecção do modelo R (ACSSuT) está diminuindo e a avaliação através da PFGE indicou a presença de multiplicidade de perfis de macrorrestrição no fagotipo 193, entretanto com elevados percentuais de similaridade entre si, sugerindo alguma clonalidade, tendo em vista o período entre o isolamento e a análise / To analyze strains of Salmonella ser. Typhimurium isolated from human cases of enteric and extraintestinal occurred during the period 1970 to 2008 of different regions of Brazil were selected, based on records in the database from Enterobacteria Laboratory of IOC / FIOCRUZ, RJ, samples prevalent phage type 193 in order to recognition of epidemic clones. We selected 553 strains of Salmonella ser. Typhimurium phage type 193 represented by 91, 65, 70 and 327 samples concerning the 1970s, 1980s, 1990s and the period from 2000 to 2008, respectively. In a global analysis of the sensitivity of these strains, 52% had one or more antibiotic resistance markers included in the profile ACSSuT. This resistance profile was found complete in 20.9% of isolates and the remaining 21.9%, sensitive to all drugs tested, especially in the period 2000 to 2008, represented by 121 samples (37.0%) compared the 327 cultures of that time. The highest percentage of resistance was observed in the samples of the 70 (99%) being the profile ACSSuT detected in 35.2% of isolates, emphasizing that all strains were isolated from gastrointestinal processes occurring in São Paulo city. Over the four decades of study, we describe a breaking point between the prevalence of resistance and susceptibility in the transition between the 1980s and 1990s. Although the number of isolates of Salmonella ser. Typhimurium phage type 193 has increased in the last period, the percentage of mono-and multidrug resistance to antimicrobial agents stood at high level (63.0%). The analysis of polymorphism obtained after macrorestriction with the enzyme XbaI showed that isolates in the 1990s showed a high percentage of similarity (≥ 85%) with strains isolated recently (2000-2008) and are grouped in the same subclusters. Moreover, the strains of the 1970s fall into subclusters independent, although the percentage of similarity between such subclusters and the other is ≥ 70%, the same was observed for the strains isolated during the 1980s. In conclusion, this study showed that the prevalence of human isolates of Salmonella ser. Typhimurium phage type 193 in Brazil has been progressing since the 1990s, while the detection of R model (ACSSuT) is decreasing and evaluation by PFGE indicated the presence of multiple profiles macrorestriction in phage type 193, however with high percentages of similarity, suggesting some clonality in view the period between isolation and analysis
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Estudo de associação entre obesidade na infância e os SNPs TaqIA C32806T do gene DRD2 e G308A do gene TNF-α

Pinto, Renata Machado 26 March 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-10T10:38:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RENATA MACHADO PINTO.pdf: 1879389 bytes, checksum: 1e831384ae5ac2534e9b7187fd6e1ae5 (MD5) Previous issue date: 2014-03-26 / The worldwide prevalence of obesity has increased at an alarming rate in all age groups. Although it has been described some rare obesity syndromes caused by mutations in single genes, the highest proportion of obesity results from an interaction between variants in multiple genes (susceptible genotype) and a favorable environment (plenty of calories and lack of physical activity). Classically, it has been studied genes involved in the control of intake, energy expenditure and the metabolism of glucose and lipids. In the last decade the discovery of numerous substances secreted by adipocytes among them hormones and inflammatory cytokines opened a new research front. The Reward Deficient Syndrome (RDS) is characterized as a hypodopaminegic state that predisposes to obsessive-compulsive behavior and impulsivity. Obesity is part of the RDS, as the individual overeats as a manner to compensate de dopamine defect. In this context, this study was designed to investigate the relationship between childhood onset obesity and polymorphisms of the tumor necrosis factor alpha (TNF alpha) and the Dopamine D2 Receptor (DRD2). Our research is a case control study that included 105 children, being 55 obese and 50 normal weight (control group). Peripheral blood samples were collected for the determination of lipid profile, glucose and insulin levels, and for the evaluation of the genetic polymorphisms of TNF- gene (G308A) and DRD2 (Taq1 - C32806T), by ARMS-PCR and RFLP-PCR, respectively. Genetic variants of the SNP G308A TNF- failed to confirm a participation in weight gain in children. The A1 allele (T) of the Taq1 polymorphism in the DRD2 gene was associated with an increase in childhood obesity and higher BMI of the parents, corroborating some data of the literature. Our results showed for the first time that the A1 allele is associated with Total Cholesterol 70 mg/dl, minor levels of triglycerides and a relative risk of 1.5 for HOMA ß secretion. Understanding how genetic variations affect the tendency to become or remain obese is an important step in understanding the mechanisms that lead to obesity. / A prevalência mundial da obesidade tem aumentado a um ritmo alarmante em todos os grupos etários. Embora tenham sido descritas algumas síndromes raras de obesidade causadas por mutações em genes individuais, a maior proporção de obesidade resulta de uma interação entre variantes em vários genes (genótipo suscetível) e um ambiente favorável (abundância de calorias e falta de atividade física). Classicamente, tem-se estudado genes envolvidos no controle da ingestão, do gasto de energia e do metabolismo da glicose e lipídios. Na última década a descoberta de numerosas substâncias secretadas pelos adipócitos, entre elas hormônios e citocinas inflamatórias abriu uma nova frente de pesquisa. A "Síndrome de Deficiência de Recompensa" (RDS) é caracterizada como um estado hipodopaminérgico que predispõe a comportamentos obsessivo-compulsivos e impulsividade. A obesidade é parte da RDS, já que o indivíduo come demais como uma forma de compensar o defeito nos níveis de dopamina. Neste contexto, o presente estudo foi desenhado para investigar a relação entre a obesidade de início na infância e polimorfismos do fator de necrose tumoral alfa (TNF- ) e do Receptor D2 de dopamina (DRD2). Nossa pesquisa é um estudo de caso-controle que incluiu 105 crianças, sendo 55 obesas e 50 eutróficas (grupo controle). Amostras de sangue periférico foram colhidas para a determinação do perfil de lipídios, glicemia e os níveis de insulina, e para a avaliação dos polimorfismos do gene do TNF - (G308A) e DRD2 - C32806T), por ARMS - PCR e PCR - RFLP, respectivamente. Variantes genéticas do SNP G308A do TNF- não conseguiu confirmar uma participação no ganho de peso em crianças. O alelo A1 (T) do polimorfismo Taq1A do gene DRD2 foi associado a um aumento da obesidade infantil e IMC superior dos pais, corroborando alguns dados da literatura. Os nossos resultados mostram pela primeira vez que o alelo A1 está associado a colesterol total , a menores níveis de triglicérides, e confere um risco relativo de 1,5 para HOMA ß proteção contra a secreção de insulina prejudicada. A compreensão de como variações genéticas afetam a tendência de tornar-se ou permanecer obeso é um passo importante na compreensão dos mecanismos que levam à obesidade.
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Competições magnéticas no sistema Fe xCo 1-xTa 2 O 6

Kinast, Eder Julio January 2003 (has links)
São apresentados resultados obtidos a partir de difração de raios-X (DRX), difração de nêutrons (DN), susceptibilidade magnética (X(T)), magnetização (M(H)), espectroscopia Mõssbauer (EM) e calor específico (Cp) de amostras do sistema FexCo1-x Ta206. Difratogramas de DRX e de DN e as curvas M(H) indicam que as amostras estão bem cristalizadas e homogêneas, e que o sistema é uma solução sólida para toda faixa de substituição Fe -> Co. Os ajustes de DN revelam fases magnéticas com dois vetores de propagação (::I::~~ ~) para o CoTa206 e (~ O ~) e (O ~ ~) para o FeTa206' A segunda configuração permanece a mesma para as amostras ricas em Fe (0,46 :S x < 1,00), enquanto que as amostras ricas em Co (0,09 :S x < 0,46) apresentam configuração magnética indexada pelos vetores de propagação (::I::~~ O). O diagrama de fase temperatura vs. x exibe um ponto bicrítico em torno de T = 4,9 K e x = 0,46. A temperatura de Néel máxima das região rica em Fe é 9,5 K, e 7,1 K para a região rica em Co. No ponto bicrítico, o sistema mostra coexistência de ambas estruturas magnéticas. Esse comportamento bicrítico é interpretado como sendo induzido pelas competições entre as diferentes fases magnéticas e pela variação das propriedades cristalográficas.
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Étude theórique et expérimentale des propriétés magnétiques des oxydes de métaux de transition quasi-bidimensionnels du type AB2O6

Santos, Edgar Gonzaga Souza dos January 2012 (has links)
Ce travail a pour objectif de contribuer à l’étude du magnétisme dans les oxydes isolants de type AB2O6 (A = Fe, Co, Ni; B = Ta, Sb). Ces composés cristallisent dans une structure trirutile et présentent une variété très riche de phases magnétiques. Tous les ordres observés peuventêtre classés comme antiferromagnétiques mais diffèrent d’un ordre simple de type Néel. En outre, les substitutions comme FexCo1−x Ta2O6, FexNi1−xTa2 O6 et Cox Ni1−xTa2O6 conduisent à des domaines de coexistence de phases magnétiques et à des points bicritiques dans les diagrammes de phases TN (x). Une caractéristique par- ticulièrement intéressante de ces composés est le caractère quasi-bidimensionnel de leur magnétisme, puisque les ions de métaux de transitions A apparaissent dans des réseaux plans séparés par deux plans d’ions non magnétiques B. Une forte anisotropie de champ cristallin est observée sur les sites magnétiques, résultant de la distorsion axiale des octaèdres d’oxygènes qui entourent ces ions A. Nous avons abordé deux aspects complémentaires: théorique et expérimental. Du point de vue théorique, une reformulation du modèle bi- dimensionnel jusqu’à present utilisée pour décrire la susceptibilité paramagnétique nous a permi d’obtenir des constants d’échange compatibles avec les types d’ordre magnétique planaire observés. Considérant que le caractère tridimensionnel des structures magnétiques révélées par diffraction neutronique indique l’importance du couplage entre plans, quoique faible, à basse température, nous proposons un modèle tridimensionnel coherent avec les ordres observés dans le plan ab ainsi que le long de l’axe c. Du point de vue expérimental, nous faisons des substitutions sur le site non magnétique pour modifier de fa¸con systematique l’espacement entre les plans magnétiques et, en consequence, le couplage entre eux. En particulier, nous avons synthétisé des composés du type ANbxTa2−xO6 avec A = Fe, Ni et Co, tout en restant dans le domaine de stabilité de la phase quadratique, puisque la présence de Nb favorise une phase orthorhombique. Une caractérisation structurale et magnétique de ces systèmes est faite par diffraction de rayons X et de neutrons, complétées par des mesures de susceptibilité magnétique, chaleur spécifique et aimantation en fonction du champ appliqué. Nous étudions également des séries avec Sb à la place de Nb où nous avons également effectué des remplacements sur le site magnétique. / Este trabalho tem por objetivo contribuir para o estudo do magnetismo em óxidos isolantes do tipo AB2O6 (A = Fe, Co, Ni; B = Ta, Sb). Esses compostos cristalizam-se numa estrutura trirutilo e apresentam uma variedade muito rica de fases magnéticas. Todos os ordenamentos observados podem ser classificados como antiferromagnéticos, embora difiram de uma ordem simples do tipo Néel. Além disso, substituições como FexCo1−xTa2O6, FexNi1−xTa2O6 e CoxNi1−xTa2O6 produzem regiões de coexistência de fases e pontos bicríticos nos digramas de fases T vs. x. Uma característica particularmente interessante desses compostos é a natureza quase-bidimensional do seu magnetismo, pois os íons de metais de transição A aparecem em planos de rede separados por dois planos de íons não magnéticos B. Também se observa uma forte anisotropia de campo cristalino sobre os sítios magnéticos devido `a orientação e distorção axial dos octaedros de oxigênio que cercam os íons A. Nossa abordagem envolve dois aspectos complementares: teórico e experimental. Do ponto de vista teórico, reformulamos o modelo bidimensional até aqui utilizado para descrever a susceptibilidade paramagnética, de forma a compatibilizá-lo com todos os ordenamentos magnéticos planares observados. Considerando que o caráter tridimensional das estruturas magnéticas reveladas por difração de nêutrons indica a importância do acoplamento entre planos, ainda que fraco, a baixas temperaturas, propomos um modelo tridimensional consistente com os ordenamentos observados tanto no plano ab como ao longo do eixo c. Do ponto de vista experimental, fazemos substituições no sítio não magnético, buscando alterar de forma sistemática o espaçamento entre planos e, consequentemente, o acoplamento entre eles. Em particular, sintetizamos compostos do tipo ANbxTa2−xO6 com A = Fe, Ni e Co, procurando permanecer na região de estabilidade da fase tetragonal, pois a presença de Nb favorece uma fase ortorrômbica. A caracterização estrutural e magnética é feita via difração de raios-X e de nêutrons, bem como medidas de susceptibilidade magnética, calor específico e magnetização em função do campo aplicado. Estudamos, ainda, séries com Sb no lugar de Nb, nas quais fazemos substituições também no sítio magnético. / This work aims to contribute to the study of magnetism in insulating oxides of the type AB2O6 (A = Fe, Co, Ni, Ta = B, Sb). These compounds crystallize in a trirutile structure and present a rich variety of magnetic phases. All the observed orderings can be classified as antiferromagnetic, but they differ from a simple Néel type order. Moreover, substitutions such as FexCo1−xTa2O6, FexNi1−xTa2O6 and CoxNi1−xTa2O6 produce several regions of phase coexistence and bicritical points in the phase diagram T vs. x. A particularly interesting characteristic of these compounds is the quasi-two-dimensional nature of their magnetism, since the transition-metal ions A appear in layers separated by two planes of the non-magnetic ions B. They also show strong crystal-field anisotropy on the magnetic sites due to axial distortion of the oxygen octahedra surrounding the A ions. Our approach involves two complementary aspects: theoretical and experimental. From the theoretical point of view, a reformulation of the two-dimensional model used until now to describe the paramagnetic susceptibility allows us to obtain exchange parameters compatible with the observed planar magnetic orderings. Considering that the three-dimensional character the magnetic structures revealed by neutron diffraction indicates that the coupling between planes, although weak, plays an important role to low temperatures, we propose a three-dimensional model consistent with the observed orderings both in the ab plane and along the c axis. From the experimental point of view, we make substitutions on the non-magnetic sites, in order to systematically modify the spacing between planes and, consequently, the coupling between them. In particular, we have synthesized compounds of type ANbxTa2−xO6 with A = Fe, Ni and Co, remaining in the stability region of tetragonal phase, since the presence of Nb favors an orthorhombic phase. The structural and magnetic characterization of the systems is done via the X-ray and neutron diffraction as well as measurements of magnetic susceptibility, specific heat, and magnetization as a function of the applied field. We also study series with Sb in place of Nb where we additionally include substitutions in the magnetic site.
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Competições magnéticas no sistema Fe xCo 1-xTa 2 O 6

Kinast, Eder Julio January 2003 (has links)
São apresentados resultados obtidos a partir de difração de raios-X (DRX), difração de nêutrons (DN), susceptibilidade magnética (X(T)), magnetização (M(H)), espectroscopia Mõssbauer (EM) e calor específico (Cp) de amostras do sistema FexCo1-x Ta206. Difratogramas de DRX e de DN e as curvas M(H) indicam que as amostras estão bem cristalizadas e homogêneas, e que o sistema é uma solução sólida para toda faixa de substituição Fe -> Co. Os ajustes de DN revelam fases magnéticas com dois vetores de propagação (::I::~~ ~) para o CoTa206 e (~ O ~) e (O ~ ~) para o FeTa206' A segunda configuração permanece a mesma para as amostras ricas em Fe (0,46 :S x < 1,00), enquanto que as amostras ricas em Co (0,09 :S x < 0,46) apresentam configuração magnética indexada pelos vetores de propagação (::I::~~ O). O diagrama de fase temperatura vs. x exibe um ponto bicrítico em torno de T = 4,9 K e x = 0,46. A temperatura de Néel máxima das região rica em Fe é 9,5 K, e 7,1 K para a região rica em Co. No ponto bicrítico, o sistema mostra coexistência de ambas estruturas magnéticas. Esse comportamento bicrítico é interpretado como sendo induzido pelas competições entre as diferentes fases magnéticas e pela variação das propriedades cristalográficas.
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Condicionantes Naturais e Socioecônomicos da Desertificação nos Trechos Médio e Baixo do Vale do Rio Jaguaribe no Estado do Ceará. / Natural and socioeconomic constraints of Desertification in the medium and low Jaguaribe River Valley in the state of Ceara.

Muniz, Ana Cristina Fernandes January 2009 (has links)
MUNIZ, Ana Cristina Fernandes. Condicionantes Naturais e Socioecônomicos da Desertificação nos Trechos Médio e Baixo do Vale do Rio Jaguaribe no Estado do Ceará. 2009. 88 f. : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós-Graduação, Programa Regional de Pós-Graduação em Desenvolvimento e Meio Ambiente, Fortaleza-CE, 2009. / Submitted by demia Maia (demiamlm@gmail.com) on 2016-03-31T14:53:40Z No. of bitstreams: 1 2009_dis_acfmuniz.pdf: 2647161 bytes, checksum: dc77558f89fc8c2fc48c5995b704a9fb (MD5) / Approved for entry into archive by demia Maia(demiamlm@gmail.com) on 2016-03-31T14:57:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_dis_acfmuniz.pdf: 2647161 bytes, checksum: dc77558f89fc8c2fc48c5995b704a9fb (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-31T14:57:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_dis_acfmuniz.pdf: 2647161 bytes, checksum: dc77558f89fc8c2fc48c5995b704a9fb (MD5) Previous issue date: 2009 / The desertification process constitutes itself in a form of degradation that became one of the serious environmental problems faced by Humanity. The areas that were susceptible to degradation/desertification were recognized by the Convention of Combated a Desertification (Desertification Combat Convention (1977) and were considered as such, those situated in the regions of arid, semi-arid and subhumid climate. The state of Ceará has most of the proportional area susceptible to desertification in the Brazilian Northeast with a preeminence of the areas of Irauçuba, Inhamuns and midstream, lower stream of Jaguaribe river. This study considered seven municipalities that were located along the Vale of Jaguaribe in its mid and lower stream, the municipalities chosen were: Alto Santo, Iracema, Jaguaretama, Jaguaribara, Jaguaribe, São João do Jaguaribe and Solonópole. The general objective of this research was to identify the conditioners of natural and socio-economical aspects of the process of desertification in this region, taking into account the characterization of environmental framework, observing its main potentialities (natural and socioeconomically) through the evaluation of impacts originated by the system of land use and evaluating the implication between the process of susceptibility to desertification and its impact over the socioeconomically characteristics of the area. The methodology used in the research had as its main fundamentation, the Beltrame focus (1994), that uses as its main parameter the standard analysis of vegetation through a comparison of satellite images betweens the years of 1986/89 and 2007. An application of the methodology allowed the realization of a general synthesis of the actual reality of the area regarding its problems, fragilities and potentialities of natural resources and socioeconomically aspects and to have a general vision of the degradation framework. / A desertificação constitui uma forma de degradação e vem se tornando um dos mais graves problemas ambientais enfrentados pela humanidade. As áreas suscetíveis à degradação/desertificação foram reconhecidas na Convenção de Combate a Desertificação (1977), sendo consideradas como tal aquelas situadas nas regiões de clima árido, semi-árido e sub-úmido seco. O Estado do Ceará tem a maior área proporcional suscetível à desertificação no Nordeste Brasileiro onde se destacam o município de Irauçuba, a Região dos Inhamuns e a região do Médio e Baixo curso do vale do Rio Jaguaribe. Dentro da temática abordada, o presente estudo considerou sete municípios que se encontram na região do Médio e Baixo curso do Vale do Jaguaribe: Alto Santo, Iracema, Jaguaretama, Jaguaribara, Jaguaribe, São João do Jaguaribe e Solonópole. O objetivo geral do estudo foi avaliar, através de Índices, a Suscetibilidade Geoambiental Natural à Degradação (ISGND) e a Suscetibilidade Geoambiental Antrópica a Degradação (ISGAD) considerando, respectivamente, as características geoambientais da área, e os impactos ambientais causados pelo sistema de uso da terra. Na pesquisa foi empregada uma adaptação da metodologia usada por Beltrame (1994), que fundamenta o calculo do ISGND nas características geoambientais e, para o ISGAD, na análise da variação temporal do Índice de Cobertura Vegetal. Esses índices foram expressos numericamente através de uma fórmula descritiva fundamentado na Equação da Reta computada através das ponderações dos índices de Erosividade, Erodibilidade, Climático e Classes de Relevo. Neste estudo o Índice de Cobertura Vegetal foi expresso pelos valores correspondentes do NDVI (Normalized Difference Vegetation Índex) calculado em imagens do satélite LANDSAT dos anos de 1986/89 e 2007. A aplicação da metodologia nos permitiu obter como resultados a realização de um mapeamento cartográfico da área do ISGND, dos níveis de cobertura vegetal, dos índices de Erosividade, Erodibilidade, Índice Climático e Classes de Relevo e do ISGAD dos municípios considerados.
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Ocorrência e suscetibilidade a drogas antifúngicas de Candida não-albicans, no Hospital Universitário Cassiano Antônio de Moraes, Vitória - ES

Klein, Nazareth Magnago 23 October 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2016-12-23T13:55:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao mestrado Nazareth Klein.pdf: 9490018 bytes, checksum: a860548b52d0cb66494dd6a26c4306df (MD5) Previous issue date: 2006-10-23 / Este estudo foi conduzido para se avaliar a prevalência e a distribuição das espécies de Candida spp., isoladas de diversos materiais biológicos, obtidos de pacientes internados no Hospital Universitário Cassiano Antonio de Moraes (HUCAM), Vitória-ES, durante o período de janeiro de 2003 a dezembro 2005, e descrever o perfil de suscetibilidade de Candida não-albicans a drogas antifúngicas. A dentificação da espécie Candida albicans foi realizada no meio cromogênico CHROMagar-Candida® e confirmada pela indução positiva de tubo germinativo e/ou clamidoconídeo. A identificação das espécies não-albicans foi realizada pelos seus padrões morfológicos e bioquímicos e pelo sistema comercial API 20 C AUX. O perfil de suscetibilidade às drogas antifúngicas anfotericina B, itraconazol e fluconazol foi estabelecido pelo método de referência, microdiluição em caldo, de acordo com o documento M27-A2 do CLSI, 2002. Estudo comparativo foi realizado, empregandose o método Etest® para as cepas de Candida tropicalis, sendo incluída nesta etapa, a droga voriconazol. Os resultados mostraram 268 isolados de Candida spp., no geral, um predomínio de Candida não-albicans (54%), incluindo C. tropicalis (26%), C. parapsilosis (14%), C. glabrata (10%), C. Krusei (2%), C. guilliermondii (1.5%) e C. lusitaniae (0.5%). Ocorreu uma marcante transição na prevalência de Candida não-albicans, durante os três anos de estudo, oscilando na freqüência de 39% dos isolamentos em 2003 para 74% em 2005. As espécies não-albicans foram mais isoladas de urina (47%), seguido de sangue (39%) e cateter (8%). As maiores ocorrências foram na Unidade de Tratamento Intensivo Geral e Clínica Médica, com 23% em cada setor. A resistência para as espécies não-albicans ao fluconazol foi de 4% e, de suscetível dose-dependente (SDD) ao fluconazol e ao itraconazol foi de 2% e 3%, respectivamente (metodologia CSLI). Com esta metodologia, 98% das cepas de C. tropicalis foram sensíveis ao fluconazol e ao itraconazol, mas 2% foram SDD para estas drogas. Com o método Etest®, 2% dessas cepas foram resistentes (R) a ambas as drogas e 19% foram SDD ao itraconazol. Nenhum isolado de Candida não-albicans foi resistente a anfotericina B ou ao voriconazol. Todos os isolados de Candida albicans foram sensíveis às três drogas analisadas. Em conclusão: a) Houve uma marcante tendência para o isolamento de C. não-albicans no HUCAM, com predomínio de C. tropicalis. b) Observou-se, reduzida suscetibilidade ao fluconazol e ao itraconazol apenas para as espécies C. tropicalis, C. krusei e C. glabrata. c) O método Etest®, usando o meio de ágar Casitone, apresentou ótima concordância com o método de referência para as drogas anfotericina B (100%) e fluconazol (96%), no entanto, para o itraconazol, essa concordância foi de 62%. / This study was carried out to evaluate the prevalence and distribution of the species of Candida spp. Isolated from several biological materials obtained from patients interned at the Hospital Universitário Cassiano Antonio de Moraes (HUCAM), Vitória-ES, during the period of January 2003 to December 2005, and to describe the profile of susceptibility of Candida non-albicans to antifungal drugs. The identification of the species of Candida albicans was made into the chromogenic medium CHROMagar-Candida® and confirmed through the positive induction of a germinative tube and/or clamidoconídeo. The identification of the species nonalbicans was made through of morphologic and biochemical patterns and through the commercial system API 20 C AUX. The profile of susceptibility to the antifungal drugs amphotencin B itraconazole and fluconazole was established by the reference method, broth microdilution, according to the document M27-A2 from CLSI, 2002. A comparative study was conducted, using the method Etest® for the strains of Candida tropicalis being included at this stage, the drug voriconazole. The results showed that 268 isolates of Candida spp. were obtained during the period of the study and, in general, a predominance was observed in the isolation of Candida nonalbicans (54%) at HUCAM, including C. tropicalis (26%), C. parapsilosis (14%), C. glabrata (10%), C. krusei (2%), C. guilliermondii (1.5%) and C. lusitaniae (0.5%). There was a relevant transition in the prevalence of Candida non-albicans during the three years of study, oscillating in the frequency from 39% of the isolations in 2003 to 74% in 2005. The non-albicans species were more isolated from urine (47%), followed by blood (39%) and catheter (8%). The biggest occurrences were noticed in patients interned at the General Intensive Care Unit and Medical Clinic with a rate of 23% in each one. The resistance rate noticed for the non-albicans species to fluconazol was of 4% and, of susceptible dose-dependent (SDD) to fluconazole and to itraconazole was of 2% and 3% respectively (methodology CSLI). With the use of this methodology, it was observed that 98% of the strains of C.tropicalis were sensitive to fluconazole and to itraconazole, but 2% were SDD to these drugs. When the method Etest® was used, 2% of these samples were resistant to both drugs and 19% were SDD to itraconazole. No isolated of Candida non-albicans was resistant to amphotericin B or to voriconazole. All the isolates of Candida albicans were sensitive to the three drugs analyzed. With this study it was concluded that there was a striking tendency to the isolation of C. non-albicans, with the predominance of C. tropicalis. Reduced susceptibility to fluconazole and itraconazole was also noticed only in the species C. tropicalis, C. krusei and C. glabrata, reinforcing the concern about a high number of isolations of these species non-albicans at HUCAM. The Etest® method using the medium of agar Casitone, showed an excellent concordance with the reference method to the drugs amphotericin B (100%) and fluconazole (96%). However, for the itraconazole this agreement was of 62%.
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Ocorrência de C. tropicalis no Hospital Universitário Cassiano Antônio de Moraes, estudo de sua suscetibilidade a antifúngicos com propostas de métodos modificados para aprimoramento dos testes in vitro

Malacarne, Bruna 10 December 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2016-12-23T13:56:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Bruna Malacarne.pdf: 2452979 bytes, checksum: bd4d5918bd0a11fc40527e153ad97a3d (MD5) Previous issue date: 2010-12-10 / A frequência de candidemia tem aumentado nas últimas décadas, com crescente ocorrência de espécies não-albicans. Candida tropicalis representa, em geral, a espécie não-albicans mais freqüente no Brasil e pode apresentar crescimento tipo trailing nos testes de microdiluição em caldo, frente a drogas azólicas, o que dificulta e confunde a leitura dos valores de concentração inibitória mínima (CIM). Os objetivos do presente trabalho foram avaliar a ocorrência de candidemia causada por C. tropicalis no Hospital Universitário Cassiano Antônio de Moraes (HUCAM), Vitória Espírito Santo, e seu perfil de suscetibilidade a fluconazol, itraconazol e anfotericina B, conforme metodologia de referência M27-A3 (CLSI, 2008), propor modificações deste teste, além de avaliar a influência de diferentes períodos de incubação e formas de leitura. Isolados de Candida tropicalis (82) testados pelo método referência foram selecionados e submetidos aos testes modificados, como incubação na temperatura de 42°C, adição de Tricostatina A (TSA) e do composto colorimétrico resazurina. Os resultados obtidos nos testes modificados foram avaliados através da determinação das concordâncias categóricas e essenciais com o teste padrão. Os resultados mostraram que no período de 2006 a 2009, a frequência de candidemia no HUCAM variou de 1,21 a 1,65 casos/1.000 admissões hospitalares e de 0,16 a 0,25 casos/1.000 pacientes-dia. C. albicans representou 45% dos episódios, seguida por C. tropicalis (26%), C. parapsilosis (14%), C. glabrata (10%) e outras (C. krusei, C. guilliermondii e C. lusitaniae). Os maiores percentuais de resistência de C. tropicalis a fluconazol e a itraconazol ocorreram com 48 horas de incubação (26% versus 5% e 17% versus 1,2%, respectivamente). Foi observado que 28,05% dos isolados apresentaram crescimento tipo trailing para uma ou para as duas drogas testadas. As concordâncias categóricas e essenciais dos testes modificados, em relação à metodologia padrão, variaram de 70 a 87%, com 24 horas de incubação e para ambas a drogas. Com 48 horas de incubação, as modificações introduzidas (incubação a 42ºC e adição de TSA) propiciaram menores percentagens de concordâncias categóricas e essenciais que o método com adição de resazurina. A incubação a 42°C correlacionou com as melhores concordâncias entre as formas de leitura visual e espectrofotométrica, em comparação com o 9 método padrão. Diferentes perfis de crescimento tipo trailing foram observados, sendo que as três modificações realizadas foram eficazes em reduzir este fenômeno com 24 horas de incubação, mas apenas os métodos a 42ºC e com TSA foram capazes de reduzir o trailing com 48 horas de incubação. A análise de prontuários médicos permitiu verificar que isolado com crescimento tipo trailing apresentou resposta terapêutica satisfatória ao fluconazol e que isolado que permaneceu resistente nos testes modificados não respondeu a tratamento com fluconazol, in vivo / The frequency of candidemia has increased in recent decades, with raising occurrence of non-albicans species. In general, Candida tropicalis is the most frequent non-albicans species in Brazil and may present trailing growth in broth microdilution tests with azole drugs, which complicates and confuses the reading of MIC values. The objectives of this study were evaluate the occurrence of candidemia caused by C. tropicalis in HUCAM and your susceptibility profile with fluconazole, itraconazole and amphotericin B, according to reference methodology M27-A3 (CLSI, 2008) propose modifications in this test, and evaluate the influence of different incubation periods and ways of reading. Isolates of Candida tropicalis were selected and submitted to the modified tests: incubation temperature of 42°C, addition of TSA and colorimetric compound resazurin. The results obtained with modified tests were evaluated through essential and categorical agreements considering the reference methodology. The results showed that in the period of 2006 to 2009, the frequency of candidemia in HUCAM ranged from 1.21 to 1.65 cases / 1,000 admissions and 0.16 to 0.25 cases / 1,000 patient-days. C. albicans accounted for 45% of the episodes, followed by C. tropicalis (26%), C. parapsilosis (14%), C. glabrata (10%) and other ones (C. krusei, C. guilliermondii and C. lusitaniae). The highest percentages of resistance to fluconazole and itraconazole occurred with 48 hours of incubation (26% versus 5% and 17% versus 1.2%, respectively). 28.05% of the isolates showed trailing growth for one or both drugs. The categorical and essential agreements of the modified tests when compared with the standard methodology, ranged from 70 to 87%, with 24 hours of incubation and for both drugs. With 48 hours of incubation, the modifications (incubation at 42°C and addition of TSA) provided smaller percentages of categorical and essential agreements when compared with the addition of resazurin. The best agreement between ways of reading (visual and spectrophotometric) was obtained with the incubation at 42°C, compared with the standard method. Different trailing growth profiles were observed and the three modified methods were effective in reducing this phenomenon with 24 hours of incubation, but only the methods 42°C and TSA were able to reduce it at 48 hour. The analysis of medical records indicated that isolated with trailing growth showed 11 satisfactory therapeutic response to fluconazole and the isolated that remained resistant in the modified tests did not respond to treatment with fluconazole in vivo
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Avaliação da suscetibilidade antimicrobiana e do perfil de macrorrestrição do DNA de isolados humanos de Salmonella serovar Typhimurium fagotipo 193, no período de 1970 a 2008 / Evaluation of antimicrobial susceptibility and macrorestriction DNA of human isolates of Salmonella serovar Typhimurium phage type 193 in the period 1970 to 2008

Eliane Moura Falavina dos Reis 09 June 2011 (has links)
Para analisar cepas de Salmonella ser. Typhimurium isoladas de processos entéricos e extraintestinais humanos ocorridos no período de 1970 a 2008 de diferentes regiões do país foram selecionadas, com base nos registros contidos no banco de dados do Laboratório de Enterobactérias do IOC/FIOCRUZ, RJ, amostras do fagotipo prevalente 193, visando precipuamente o reconhecimento de clones epidêmicos. Foram selecionadas 553 cepas de Salmonella ser. Typhimurium fagotipo 193 representadas por 91, 65, 70 e 327 amostras referentes as décadas de 70, 80, 90 e ao período de 2000 a 2008, respectivamente. Na análise global da sensibilidade destas cepas, 52% apresentaram um ou mais marcadores de resistência a antibióticos incluídos no perfil ACSSuT. Este perfil de resistência completo foi verificado em 20,9% dos isolados, sendo os 21,9% restantes, sensíveis a todas as drogas testadas, especialmente no período de 2000 a 2008, representadas por 121 amostras (37,0%) em relação as 327 culturas dessa época. O maior percentual de resistência foi observado nas amostras da década de 70 (99%) sendo o perfil ACSSuT detectado em 35,2% dos isolados, ressaltando-se que todas as amostras foram isoladas de processos gastroentéricos ocorridos na cidade de São Paulo. Ao longo das quatro décadas de estudo, descreve-se um ponto de ruptura entre a prevalência de resistência e a suscetibilidade na transição entre as décadas de 80 e 90. Embora o número de isolados de Salmonella ser. Typhimurium fagotipo 193 tenha aumentado no último período considerado, o percentual de mono e multirresistência aos antimicrobianos se situou em nível elevado (63,0%). A análise do polimorfismo obtido após macrorrestrição com a enzima XbaI revelou que cepas isoladas na década de 90 apresentaram elevado percentual de similaridade (&#8805;85%) com cepas isoladas recentemente (período de 2000-2008), sendo agrupadas nos mesmos subclusters. Por outro lado, as cepas da década de 70 inserem-se em subclusters independentes, embora o percentual de similaridade entre tais subclusters e os demais seja &#8805;70%; o mesmo sendo observado para as cepas isoladas durante a década de 80. Em conclusão, este estudo mostrou que a prevalência de isolados humanos de Salmonella ser. Typhimurium fagotipo 193 no Brasil vem progredindo desde a década de 1990, enquanto a detecção do modelo R (ACSSuT) está diminuindo e a avaliação através da PFGE indicou a presença de multiplicidade de perfis de macrorrestrição no fagotipo 193, entretanto com elevados percentuais de similaridade entre si, sugerindo alguma clonalidade, tendo em vista o período entre o isolamento e a análise / To analyze strains of Salmonella ser. Typhimurium isolated from human cases of enteric and extraintestinal occurred during the period 1970 to 2008 of different regions of Brazil were selected, based on records in the database from Enterobacteria Laboratory of IOC / FIOCRUZ, RJ, samples prevalent phage type 193 in order to recognition of epidemic clones. We selected 553 strains of Salmonella ser. Typhimurium phage type 193 represented by 91, 65, 70 and 327 samples concerning the 1970s, 1980s, 1990s and the period from 2000 to 2008, respectively. In a global analysis of the sensitivity of these strains, 52% had one or more antibiotic resistance markers included in the profile ACSSuT. This resistance profile was found complete in 20.9% of isolates and the remaining 21.9%, sensitive to all drugs tested, especially in the period 2000 to 2008, represented by 121 samples (37.0%) compared the 327 cultures of that time. The highest percentage of resistance was observed in the samples of the 70 (99%) being the profile ACSSuT detected in 35.2% of isolates, emphasizing that all strains were isolated from gastrointestinal processes occurring in São Paulo city. Over the four decades of study, we describe a breaking point between the prevalence of resistance and susceptibility in the transition between the 1980s and 1990s. Although the number of isolates of Salmonella ser. Typhimurium phage type 193 has increased in the last period, the percentage of mono-and multidrug resistance to antimicrobial agents stood at high level (63.0%). The analysis of polymorphism obtained after macrorestriction with the enzyme XbaI showed that isolates in the 1990s showed a high percentage of similarity (&#8805; 85%) with strains isolated recently (2000-2008) and are grouped in the same subclusters. Moreover, the strains of the 1970s fall into subclusters independent, although the percentage of similarity between such subclusters and the other is &#8805; 70%, the same was observed for the strains isolated during the 1980s. In conclusion, this study showed that the prevalence of human isolates of Salmonella ser. Typhimurium phage type 193 in Brazil has been progressing since the 1990s, while the detection of R model (ACSSuT) is decreasing and evaluation by PFGE indicated the presence of multiple profiles macrorestriction in phage type 193, however with high percentages of similarity, suggesting some clonality in view the period between isolation and analysis

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