Orientador: Carlos Fernando Salgueirosa de Andrade / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-05T12:43:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Silva_GilciaAparecidadeCarvalho_D.pdf: 2420692 bytes, checksum: 389c3c5a059387fa98ae9be752bd8f0e (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: Mosquitos pertencentes aos gêneros Culex, Aedes, Anopheles, Mansonia, Psorophora e Coquillettidia são susceptíveis à infecção por Dirofilaria immitis (Leidy, 1856), podendo transmitir o filarídeo aos cães e gatos. Os vetores de D. immitis no Brasil são conhecidos apenas nos Estados do Rio de Janeiro e do Maranhão, fazendo-se necessária a investigação da susceptibilidade e da competência vetorial de espécies existentes nos demais Estados brasileiros. O presente trabalho teve por finalidade verificar a freqüência de infecção por D. immitis em cães domiciliados na Região Metropolitana do Recife, bem como avaliar a susceptibilidade e a competência vetorial de Culex quinquefasciatus Say, 1823, Aedes aegypti Linnaeus, 1762 e Ae. albopictus Skuse, 1894 provenientes de área endêmica e não endêmica para a transmissão desse filarídeo, em condições experimentais. A resposta imune humoral (melanização) apresentada pelos mosquitos expostos à infecção também foi avaliada. Para a realização do inquérito epidemiológico, 816 amostras de sangue canino foram coletadas nas áreas costeiras da Região Metropolitana do Recife e no município de Bezerros, agreste do Estado de Pernambuco. As amostras sangüíneas foram analisadas por meio de teste parasitológico para a pesquisa de microfilárias de D. immitis, utilizando-se o método modificado de Knott. Para a avaliação da competência vetorial Cx. Quinquefasciatus população RECIFE, Ae. aegypti populações RECIFE, UNICAMP e linhagem ROCKFELLER e Ae. albopictus população RECIFE foram criados em insetário sob condições controladas (28 '+ ou ¿' '1 GRAU C¿ e 80 ' + ou ¿' 5% de umidade relativa do ar). As fêmeas das espécies estudadas foram alimentadas com sangue canino contendo diferentes densidades de microfilárias de D. immitis, por meio de membrana artificial confeccionada com pele fresca de animal. Para Cx. quinquefasciatus, que é uma espécie ornitofílica, foi utilizada pele de codorna, e para Ae. aegypti e Ae. albopictus a membrana artificial foi confeccionada com pele de rato. Os resultados obtidos no estudo mostraram freqüência de 3,61%, 7,89% e 7,69% de cães infectados na Ilha de Itamaracá, Igarassu e Recife, respectivamente. Após as infecções experimentais, observou-se que a mortalidade de Cx. quinquefasciatus não foi influenciada pela exposição a diferentes densidades de microfilárias de D. immitis (F = 0,0615, p>0,05) e os índices encontrados variaram de 8,9% a 36,25%. Os índices de eficiência vetorial (IEV) apresentados por Cx. quinquefasciatus população RECIFE variaram de 7,8% a 56,5%. Em relação à razão de infecção, o maior índice foi encontrado no grupo de fêmeas expostas a densidade de 1913 microfilárias/ml, entretanto, não foi influenciado pela taxa de ingurgitamento das fêmeas (F=3,2937, p>0,05). Por meio de melanização, Cx. quinquefasciatus população RECIFE, limitou a intensidade do parasitismo, promovendo o equilíbrio da relação parasito-hospedeiro e deste modo passando a ser um excelente vetor de D. immitis na Região Metropolitana do Recife. Dentre as espécies de Aedes estudadas, verificou-se que a população RECIFE de Ae. aegypti apresentou maior mortalidade (70,7%) ao final dos experimentos, apresentando diferença estatisticamente significante (p<0,01) em relação à linhagem ROCKFELLER, população UNICAMP e Ae. albopictus população RECIFE, que não diferiram entre si (p>0,05). Em relação ao índice de eficiência vetorial (IEV) foi detectado um índice de 7,4% para a linhagem ROCKFELLER e uma variação de 20,0% a 53,8% para as populações de Ae. aegypti e 25,2% para Ae. albopictus população RECIFE. O maior número de larvas de D. immitis infectantes na probóscide foi apresentado por Ae. albopictus população RECIFE, além de uma baixa mortalidade. Desta forma, esta população mostrou-se susceptível ao filarídeo e por apresentar baixa mortalidade, foi considerada como a melhor vetora. Ae. aegypti população RECIFE não apresentou reação de melanização e apresentou mortalidade acentuada, enquanto que Ae. aegypti população UNICAMP e linhagem ROCKFELLER mostraram-se refratárias à infecção por D. immitis / Abstract: Mosquitoes belong to the genus Culex, Aedes, Anopheles, Mansonia, Psorophora and Coquillettidia are susceptible to infection of Dirofilaria immitis (Leidy, 1856) and some of them serve as vectors heartworm disease in dogs and cats. Although the potential vectors of canine heartworm in Brazil have been recorded only in Rio de Janeiro and Maranhão State and no more date are available. The objective of this study was to verify the frequency of heartworm infection in dogs in metropolitan region of Recife and also identify under experimental conditions their ability of Culex quinquefasciatus Say, 1823, Aedes aegypti Linnaeus, 1762 and Ae. albopictus Skuse,1894 from enzootic and non enzootic areas to become infected with and transmit D. immitis. After the experimental infection of mosquitoes, the melanization response to larvae of D. immitis also was evaluated. The survey study were performed on a total of 816 dogs from costal areas of Metropolitan Region of Recife and Bezerros County, located in agreste area of Pernambuco State. Whole blood samples were collected from all animals and were examined for the presence of microfilariae of D. immitis by the modified Knott test. To verify the vector competence of Cx. quinquefasciatus RECIFE population, Ae. aegypti RECIFE, UNICAMP populations and also ROCKFELLER strain and Ae. albopictus RECIFE population, the mosquitoes were reared under constant insectary conditions (28 '+ or ¿' '1 DEGREE C¿ and 80 '+ or ¿' 5% relative humidity). Females mosquitoes, were exposed to blood¿s dog with diferents density of D. immitis microfilariae by artificial feeding apparatus made by fresh animal skin. For this puporse, ornithophilic Cx. quinquefasciatus was feeding by skin quail menbrane, and for the Ae. aegypti and Ae. albopictus the artificial membrane was made by rat skin. The results of the survey study showed 3.61%, 7.89%, and 7.69% of heartworm infection frequency in dog from Itamaracá Island, Igarassu and the city of Recife respectively. The mortality of Cx. Quinquefasciatus RECIFE population observed in the vector competence study did not show influence of different density of microfilariae of D. immitis (F = 0.0615, p>0.05) and the mortality rate was 8.9% to 36.25%. The vector efficiency (VE) rates of Cx. quinquefasciatus RECIFE population were 7.8% to 56.5%. The higher infection rate was showed in females feeding with blood containing 1913 mf/ml, but no influence was observed in engorged females. The melanization response observed in Cx. quinquefasciatus was important for vector survival by limiting the number of larvae, acting as an important mechanism of parasitic-host interactions. The data indicate that the Cx. quinquefasciatus RECIFE population should is an excelent vector of D. immitis at metropolitan region of Recife. Significant difference (p<0.01) was observed in the mortality rates between the RECIFE population of Ae. aegypti, UNICAMP population, ROCKFELLER strain, and Ae. albopictus RECIFE population. Although no difference were observed between Ae. aegypti ROCKFELLER, UNICAMP and Ae. albopictus RECIFE population. The vector efficiency (VE) rates of Ae. aegypti and Ae. albopictus RECIFE population were 7.4% to 53.8% and 25.2% respectively. Not only the high number of infective third stage larvae of D. immitis in mouth of mosquitoes but also low mortality was observed in Ae. albopictus RECIFE population. This data showed that this specie is the best vector of heartworm infection in the study area. No melanization response was observed in Ae. Aegypti RECIFE population but high mortality was reported. The UNICAMP population and ROCKFELLER strain of Ae. aegypti were refractory to infection to D. immitis / Doutorado / Doutor em Parasitologia

Orientadores: Lair Zambon, Carmen Silvia Passos Lima / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-09T12:57:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Honma_HelenNaemi_M.pdf: 6073042 bytes, checksum: 8de4d548610b680b2101397d10fc9e52 (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: A citocromo P- 450 1A1 (CYP1A1) é uma importante enzima do metabolismo carcinogênico, em virtude da regulação polimórfica, a CYP1A1 é um marcador genético promissor para susceptibilidade de certas malignidades, particularmente o câncer de pulmão (CP). A primeira variação detectada (chamada de m1 ou *2A) foi a transição de T?C no exon 7 com 1194pb, criando um sítio de clivagem para a enzima MspI. Esta alteração foi mais prevalente em Asiáticos do que em Caucasóides. Os genes GSTM1, GSTT1 e GSTP1 vem sendo estudados extensivamente em relação ao CP, pois estão relacionados com a perda completa ou redução da atividade de certos xenobióticos metabolizados por enzimas. O genótipo variante Val/Val do gene GSTP1*B tem uma maior atividade para com o epóxido diol hidrocarbono e BPDE, portanto um menor potencial de detoxificação, resultando em um grande risco para o câncer. O objetivo deste estudo foi analisar a susceptibilidade dos genes polimórficos para o risco em CP e a correlação dos genótipos com as interações das variáveis clínicas. Para cumprir tais objetivos, o DNA genômico de 200 pacientes com CP e 264 doadores de sangue (controles), foram analisados por meio da reação em cadeia da polimerase (PCR) e digestão enzimática. Freqüências similares da deleção homozigótica dos genes polimórficos isolados GSTM1 (45,5% vs 48,1% p= 0,14), GSTT1 (13,5% vs 12,9% p=0,54), GSTM1/T1 ambos nulos (6,0% vs 4,9% p=0,83), da variante Val/Val do gene GSTP1 (12,5% vs 11,4% p=0,87) e da variante CYP1A1*2A (5,5% vs 3,4% p= 0,69) foram observadas em pacientes e controles. Não foram observadas diferenças significativas entre as freqüências de todos estes genótipos. Os resultados sugerem que os genótipos isolados e combinados não influenciaram o risco para CP, mas podemos sugerir que na população Afro-Brasileira estudada, há indícios de uma associação dos genótipos hetero/ variante do gene CYP1A1*2A e GSTs possam levar a uma maior susceptibilidade para o CP / Abstract: Cytochrome P-450 A1 (CYP1A1 ) is an important enzyme of carcinogen metabolism. Due to polymorphic regulation, CYP1A1 is a biomarker of genetic susceptibility to certain malignancies, especially lung cancer (LC). The first detected variation, named m1 or *2A, was a T-to-C transition in exon 7, with 1194bp, which produced a breakage point for the MspI enzyme. Originally, more Asians than Caucasians presented with LC. Intensive studies have shown that GSTM1, GSTT1 and GSTP1 genes are related to LC, which may lead to whole loss or certain hazard reduction. The GSTP1 Val/Val variant genotype has a strong activity, especially along with hydrocarbon diol epoxide and BPDE, leading to detoxification potency. The purpose of this study was to analyze the susceptibility of polymorphism genes to LC risk and the correlation of genotypes with clinical variations. In order to achieve these objectives, the genomic DNA of 200 patients with LC and 264 blood donors (controls) were analyzed through PCR and enzymatic digestion. Similar frequencies of homozygotic deletion of polymorphic isolated genes were observed in patients and controls, as follows: GSTM1 (45.5% vs 48.1%, p= 0.14), GSTT1 (13.5% vs 12.9%, p= 0.54), GSTM1/T1 both null (6.0% vs 4.9%, p= 0.83), GSTP1 gene Val/Val variant (12.5% vs 11.4%, p= 0.87) and the CYP1A1*2A variant (5.5% vs 3.4%, p= 0.69). The differences observed among the frequencies of all combined genotypes were not significant. The final results suggested that isolated and combined genotypes did not influence LC risk; on the other hand, there is a high susceptibility for LC in African-Brazilian people with CYP1A1*2A and GSTs hetero/variant genotype / Mestrado / Clinica Medica / Mestre em Clinica Medica

A leishmaniose visceral constitui grave doença infecciosa causada por um protozoário parasita intracelular obrigatório. Alguns fatores podem alterar a gravidade das manifestações clínicas, sendo um deles a predisposição genética. Este estudo investigou polimorfismos dos genes TGFB1, IL8 e IL6, que são citocinas relacionadas com o desencadeamento e a gravidade da doença, visando identificar fatores de susceptibilidade. Os polimorfismos TGFB1 -509 C/T e TGFB1 +869 T/C, IL8 -251A/T e IL6 -174G/C foram analisados por PCR-RFLP, em 198 pacientes com leishmaniose visceral (LV), 98 indivíduos com infecção assintomática (teste de hipersensibilidade tardia - DTH+) e 100 indivíduos sem evidências de infecção (DTH-). O alelo T na posição -509 do gene TGFB1 conferiu risco duas vezes maior de desenvolver LV ou ser positivo para o teste DTH (p = 0,007, OR = 1,9 [1,19-3,02]), em comparação com indivíduos DTH-. Os resultados sugerem uma associação do polimorfismo TGFB1 -509C/T com a susceptibilidade à LV, podendo contribuir para o desencadeamento da doença clínica. / Visceral leishmaniasis is a serious protozoan infectious disease caused by an obligate intracellular parasite. Some factors can affect the severity of the clinical manifestations; one of which is genetic susceptibility. This study investigated polymorphisms in the TGFB1, IL8 and IL6 genes, which are cytokines related with the onset and severity of the disease, to look for genetic susceptibility factors. Polymorphisms at TGFB1 -509C/T and +869T/C, and IL8 - 251A/T and IL6 -174G/C were analyzed by a PCR-RFLP technique, in 198 patients with Visceral Leishmaniasis (VL), 98 individuals with asymptomatic infection (positive delayed-type hypersensitivity, DTH+) and 100 individuals with no evidence of infection (DTH-). The T allele of the TGFB1 polymorphism in position -509C/T conferred a two risk fold to develop LV or to be DTH+ (p=0.007; OR=1.9 [1.19 - 3.02]) when compared with DTH- individuals. We suggest the TGFB1 -509C/T polymorphism is associated with susceptibility to LV and may contribute to development of the clinical disease.

Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2016-09-12T20:26:04Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Raimundo Lima da Silva Junior - 2008.pdf: 5070455 bytes, checksum: 3393ae35ddba4af1c14d43ce110ef279 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-09-15T12:45:04Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Raimundo Lima da Silva Junior - 2008.pdf: 5070455 bytes, checksum: 3393ae35ddba4af1c14d43ce110ef279 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-15T12:45:04Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Raimundo Lima da Silva Junior - 2008.pdf: 5070455 bytes, checksum: 3393ae35ddba4af1c14d43ce110ef279 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2008-05-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The larynx is a tubular organ of the aerodigestive tract whose main function is the production of voice, in addition to tasks related to the protection of the lower airways and swallowing food. The squamous cell carcinoma presents itself as a multifactorial disease and epigenetic being influenced by environmental factors, behavioural and relate to the individual. Several polymorphic genes that encode enzymes involved in the biotransformation of the carcinogens have been associated to the development of cancer, especially in squamous cell carcinoma of head and neck. The CYP1A1m, GSTM1 and GSTT1 genes which catalyzes the oxidation of PAHs in phenolic and epoxides products. The purpose of this study was to evaluate the epidemiological data of patients diagnosed with squamous cell carcinoma of the larynx from the Cancer Registry of Population basis of Goiânia and from Association of Cancer Combat in Goiânia, analyzing data from 63 medical records followed in a period of 6 year; establish the allelic profiles of the gene CYP1A1m, GSTM1 and GSTT1 in casecontrol groups investigating the degrees of suscetibility of patients diagnosed with squamous cell carcinoma (SCC) of the larynx, according to smoking and alcoholism habits. In total 112 samples were evaluated, 63 from patients with SCC of the larynx and 49 patients in the control group. The CEC of the larynx was about 3,5 times more frequent in men than in women. The rate of survival on general was approximately 66% to 6 years. The smoking and ethilic habits associated have a significantly lower survival. No significant differences were found in the staging analysis and treatment of patients. Were found allelic frequencies of CYP1A1m1 of 52,4% (34/62) and 63,3% (31/49) for the wild allele T and 44,4% (28/62) and 34,7% (18/49) for the mutant allele C. There were no statistically significant associations between allelic variants and genotypic CYP1A1m1 with squamous cell carcinoma of the larynx. Positive genotypic frequencies were observed for the genes GSTM1 and GSTT1 of 41.3% (26/63) and 54.0% (34/63) to the patients with laryngeal cancer, and 49,0% (24/49) and 51,0% (25/49) for the control group, respectively. For the assessment of genotype GSTM1 (null) and GSTT1 (null), the patients if the case group had 58,7% (37/63) and 46,0% (29/63) of genotypes for GSTM1 null and GSTT1, while the patients in the control group showed 51,0% (25/49) and 40,8% (20/49). There was no statistically significance in associations of genotypic variants GSTM1 (null) and GSTT1 (null) with the larynx squamous cell carcinoma. In this context, an experimental study was accomplished in the intention of evaluating the function of the genes Cyp and Gst in the metabolism of the Cyclophosphamide. This study addressed the Cyclophosphamide toxicological evaluation and analysis of the polymorphism of Cyp2a29 and Gstp1 BALB/c genes in mice, correlating them with the toxicity of drugs through the assessment of organs commonly affected. It was determinated the DL50 of the 474mg/kg. Subsequently, another 40 mice were used on the assessment of the genetic polymorphism of genes Cyp2a29 and Gstp1. As for toxicity, cyclophosphamide caused reduction in body weight at different doses and kidneys, spleen, liver, heart and lungs. The animals that received a dose of 500mg/Kg died in 24 hours, three animals with a dose of 250mg/Kg died the end of one week. The evaluation of toxicity showed changes of varying degrees of congestion observed in the spleen, liver and heart. There were not found statistically significant differences between the frequencies of allelic and genotypic to Cyp2a29 and Gstp1 in groups of animals studied. This observation should be probably the characteristic line BALB/c are isogenic. Studies that make the use se of tests of genetic suscetibility, epidemic evaluation, combined to the evaluation anatomopathological they allow the study of the interaction genetic atmosphere and a possible standardization of various chemotherapy protocols for treatment. / A laringe é um órgão tubular do trato aerodigestivo cuja principal função é a produção da voz, além de funções relacionadas com a proteção das vias aéreas inferiores e deglutição alimentar. O carcinoma de células escamosas (CEC) de laringe apresenta-se como uma doença multifatorial e epigenética sendo influenciada por fatores ambientais, comportamentais e inerentes ao indivíduo. Vários genes polimórficos que codificam enzimas envolvidas na biotransformação de carcinógenos têm sido associados ao desenvolvimento de câncer, sobretudo no carcinoma espinocelular de cabeça e pescoço. Os genes CYP1A1m1, GSTM1 e GSTT1 são fundamentais no processo de detoxificação de Poli - Hidrocarbonetos Aromáticos (PHA) e de diversas moléculas endógenas, facilitando o seu metabolismo e excreção. Os objetivos do presente estudo foram de avaliar os dados epidemiológicos de pacientes diagnosticados com CEC da laringe do Registro de Câncer de Base Populacional de Goiânia (RCBP) da Associação de Combate ao Câncer em Goiás (ACCG), analisando os dados de 63 prontuários acompanhados num período de 6 anos; estabelecer os perfis alélicos dos genes CYP1A1m1, GSTM1 e GSTT1 em grupos caso-controle investigando os graus de suscetibilidade dos pacientes diagnosticados com CEC de laringe, segundo hábitos tabagistas e etilistas. Ao total foram avaliadas 112 amostras, sendo 63 provenientes de pacientes com CEC da laringe e 49 de pacientes do grupo controle. O CEC da laringe se mostrou cerca de 3,5 vezes mais freqüente em homens que em mulheres. A taxa de sobrevida relativa geral foi de aproximadamente 66% para 6 anos. Os hábitos tabagista e etilista concomitantes apresentam uma sobrevida consideravelmente menor. Foram encontradas freqüências alélicas para CYP1A1m1 de 52,4% (34/62) e 63,3% (31/49) para o alelo selvagem T e 44,4% (28/62) e 34,7% (18/49) para o alelo mutante C. Não foram encontradas associações estatisticamente significativas das variantes alélicas e genotípicas CYP1A1m1 para o CEC da laringe. Quanto aos genes GSTM1 e GSTT1 foram observadas freqüências genotípicas positivas para os genes GSTM1 e GSTT1 de 41,3% (26/63) e 54,0% (34/63) para os pacientes com carcinomas laríngeos, e de 49,0% (24/49) e 51,0% (25/49) para o grupo controle, respectivamente. Para a avaliação do genótipo GSTM1 (nulo) e GSTT1 (nulo), os pacientes do grupo caso apresentaram 58,7% (37/63) e 46,0% (29/63) de genótipos nulos para GSTM1 e GSTT1, enquanto que os pacientes do grupo controle apresentaram 51,0% (25/49) e 40,8% (20/49). Não foram encontradas associações estatisticamente significativas das variantes genotípicas GSTM1 (nulo) e GSTT1 (nulo) para o CEC da laringe. Neste contexto, foi realizado um estudo experimental no intuito de avaliar o papel dos genes Cyp e Gst no metabolismo da ciclofosfamida. Tal estudo abordou avaliações toxicológicas da Ciclofosfamida e a análise do polimorfismo dos genes Cyp2a29 e Gstp1 em camundongos BALB/c e correlacionando-os com a toxicidade da droga através da avaliação dos órgãos comumente afetados. A DL50 da droga observada em 40 camundongos foi de 474mg/Kg. Posteriormente, outros 40 camundongos foram utilizados na avaliação do polimorfismo genético dos genes Cyp2a29 e Gstp1. Quanto à toxicidade, a ciclofosfamida ocasionou redução da massa corporal nos rins, baço, fígado, coração e pulmões. A avaliação da toxicidade demonstrou alterações de diferentes graus de congestão observados no baço, fígado e coração. Não foram encontradas diferenças estatisticamente significativas entre as freqüências alélicas e genotípicas de Cyp2a29 e Gstp1 nos grupos dos animais estudados. Estudos que preconizem a utilização de testes toxicológicos combinados à avaliação anatomopatológica e investigação da variabilidade genética permitem a padronização de protocolos de tratamento de diversos quimioterápicos.

A ferrugem alaranjada da cana-de-açúcar, causada pelo fungo Puccinia kuehnii, é atualmente a doença que mais preocupa o setor sucroenergético brasileiro, devido a sua introdução recente no país e aos prejuízos causados em indústrias canavieiras ao redor do mundo. A doença é controlada com variedades resistentes e por isso há a necessidade de maiores informações sobre a reação das cultivares mais importantes no Brasil. Os objetivos deste trabalho foram: (i) avaliar a reação de variedades de cana-de-açúcar à ferrugem alaranjada, em condições de infecção natural no campo; (ii) determinar a melhor época para avaliação da doença; (iii) estabelecer um método, em casa de vegetação e com inoculação artificial do patógeno, para seleção rápida de variedades com resistência no campo. Dezessete variedades foram avaliadas quanto às suas reações a P. kuehnii em dois experimentos de campo, plantados em abril e julho de 2011; neste último, após a colheita em maio de 2012, a cana-soca também foi avaliada. Para multiplicar e uniformizar a distribuição do inóculo, a variedade suscetível SP89-1115 foi usada como bordadura e plantada entre os blocos e em duas linhas, dividindo cada experimento ao meio. Avaliou-se a severidade da doença a cada 15 dias e, a partir destes dados, calculou-se a área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD) e obteve-se a severidade máxima da doença. Para identificar o melhor período de avaliação, realizou-se análise de correlação entre a AACPD e cada levantamento de severidade. Em casa de vegetação, seis variedades com reações distintas à doença, com base nos resultados obtidos no campo, foram inoculadas com uma suspensão de 104 urediniósporos viáveis mL-1 de P. kuehnii, com auxílio de pulverizador manual, 60 dias após o plantio. As plantas foram mantidas por 24 horas em câmara de orvalho e, posteriormente, transferidas para casa de vegetação. Foram determinados os períodos de incubação e latência, o número de pústulas por cm2 e a severidade da doença. Oito das 17 variedades avaliadas no campo mostraram alta resistência à doença. As cultivares RB72454 e SP89-1115 foram as mais suscetíveis, seguidas da SP79-2233; por isso, o cultivo das mesmas não é recomendado. As variedades RB925211, SP81-3250, RB855156 e RB92579 tiveram reação intermediária, sendo que as duas primeiras apresentaram maiores níveis da doença. Avaliações realizadas no mês de março foram as que mais se correlacionaram com a AACPD, portanto este é o melhor período para determinar a reação de variedades de cana-de-açúcar à ferrugem alaranjada. O comportamento das variedades em casa de vegetação foi semelhante ao observado no campo, especialmente em relação às cultivares suscetíveis e resistentes. Assim, o método aplicado em casa de vegetação mostrou potencial para selecionar, em poucos dias, cultivares com resistência à doença no campo, além de economizar espaço, mão de obra e de ser facilmente executado. / Currently, sugarcane orange rust, caused by Puccinia kuehnii, is the disease that most concerns the Brazilian sugarcane industry, due to its recent introduction in the country and the damage caused to sugarcane industries all over the world. The disease is controlled with resistant varieties; hence there is a need for more information about the reaction of the major cultivars in Brazil. The objectives of this work were: (i) to evaluate the reaction of sugarcane varieties to orange rust in field, under natural infection conditions; (ii) to determine the best time for disease assessment; (iii) to establish a method in greenhouse, based on artificial inoculation, for rapid selection of field resistant varieties. Seventeen varieties were studied in two field experiments, planted in April and July 2011; in the latter, after the harvest in May 2012, the ratoon was also evaluated. The susceptible variety SP89-1115 was used as border and planted between the blocks in two lines, dividing each experiment in two halves in order to multiply and standardize the inoculum in the area. Disease severity was evaluated every 15 days and the area under disease progress curve (AUDPC) was calculated and the maximum disease severity was obtained. To identify the best time for disease assessment, a correlation analysis between the AUDPC and each disease severity assessment was done. In greenhouse, six varieties with different reactions to the disease based on results obtained in field were inoculated with a suspension of 104 viable urediniospores mL-1 of P. kuehnii with a manual sprayer 60 days after planting. Plants were maintained in dew chamber for 24 hours and afterwards they were transferred to the greenhouse. The incubation and latent period were determined as well as the number of pustules cm-2 and disease severity. Eight out of 17 varieties evaluated in field showed high disease resistance. The varieties RB72454 and SP89-1115 were the most susceptible, followed by SP79-2233; therefore, their commercial cultivation is not recommended. The varieties RB925211, SP81-3250, RB855156 and RB92579 had intermediate reaction, with the first two showing higher disease levels. Evaluations performed in March showed the highest correlation with AUDPC, thus this period is the best for determining sugarcane reaction to orange rust. The varieties reaction in greenhouse was similar to that observed in the field, particularly in relation to susceptible and resistant cultivars. So, the method applied in greenhouse showed potential to select, in a few days, field disease-resistant varieties, besides saving space and labor and being easily implemented.

O principal objetivo desta pesquisa consistiu em avaliar os métodos empregados em análises de risco a escorregamentos e aplicar uma proposta metodológica de avaliação de risco a escorregamentos, por meio de técnicas de avaliação de terreno com abordagem integrada dos fatores geoambientais envolvidos, visando contribuir à prevenção e mitigação dos riscos e à gestão ambiental da região litorânea. A proposta metodológica de avaliação de risco a escorregamentos foi aplicada, com uso do SIG SPRING, em uma área teste no município de Ubatuba, SP. Os atributos e parâmetros analisados quanto à influência nos escorregamentos foram os seguintes: declividade, forma de vertentes, grau de dissecação, densidade de lineamentos, material inconsolidado e disponibilidade hídrica. Dentre estes fatores considerados para análise da suscetibilidade a escorregamentos, verificou-se que a declividade exerce maior influência, seguida pela forma de vertente e pelo grau de dissecação. O mapa de suscetibilidade a escorregamentos obtido expressa o potencial natural do terreno em desenvolver estes processos. Quanto ao mapa de perigo a escorregamentos representa a probabilidade da ocorrência do processo em função da suscetibilidade do terreno, do potencial de indução do uso do solo e da probabilidade de ocorrer a precipitação considerada crítica para deflagração do escorregamento. Neste trabalho considerou-se o risco como uma função do perigo, da vulnerabilidade e do dano potencial. O mapa de risco a escorregamentos produzido indica os níveis dos danos sociais e econômicos esperados se houver a ocorrência do processo. Nesta avaliação final do risco considerou-se a população como o elemento em risco, por isso, esta análise contemplou apenas as áreas ocupadas por moradias. / The main objective of this research was the evaluation of different methods employed in landslide risk analysis and the application of a methodological proposal of landslide risk evaluation based on terrain evaluation techniques. These techniques present an approach of integrated geoenvironmental factors and have the purpose of contributing to the prevention and mitigation of such risks and also to the environmental management of coastal regions. The methodology of landslide risk evaluation was applied by the use of GIS SPRING, in a test area in the Ubatuba municipality, SP. The analyzed attributes and parameters related to landslides were: declivity, slope forms, degree of erosion, alignment density, unconsolidated material and water disponibility. Among the considered factors for the landslide susceptibility analysis, it was observed that the declivity has a major influence followed by the slope form and by the degree of erosion. The map of susceptibility to landslides obtained express the natural terrain potential in developing these processes. The map of landslide danger represents the occurrence probability of the process related to the terrain susceptibility, to the induction potential of land use and to the probability of occurrence of rain considered critical for the landslide deflagration. In this work the risk was considered a function of danger, vulnerability and potential harm. The produced map of landslide risk indicates the expected levels of social and economic harm in case a process is observed. In the final evaluation of risk it was considered the population as risk element, therefore this analysis only considered the inhabited areas.

Orientadores: Mariangela Ribeiro Resende, Maria Luiza Moretti / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-24T01:04:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ferrari_MichelaDeLuca_D.pdf: 2448021 bytes, checksum: 102166bb9666827fb2f7de549ded2752 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: O resumo poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: The complete abstract is available with the full electronic document / Doutorado / Clinica Medica / Doutora em Clínica Médica

Introdução: O complexo Acinetobacter baumannii-calcoaceticus (ACB) inclui as espécies: A. baumannii, A. calcoaceticus, A. pittii e A. nosocomialis. As infecções causadas pelas diferentes espécies do ACB, principalmente A. baumannii tornam-se cada vez mais graves com a emergência de cepas resistentes a quase todos os antimicrobianos incluindo os carbapenêmicos, principalmente devido à produção de oxacilinases. O objetivo desse estudo foi identificar as diferentes espécies do complexo Acinetobacter baumanniicalcoaceticus (ACB) e determinar a prevalência de oxacilinases em isolados resistentes aos carbapenêmicos obtidos de quatro estados brasileiros. Materiais e métodos: No período de abril a outubro de 2013, avaliamos 92 isolados identificados previamente como ACB complexo, resistente aos carbapenêmicos de quatros estados brasileiros: Paraná, Rio de Janeiro, Rio Grande do Sul e São Paulo. Os isolados foram submetidos a identificação utilizando o equipamento MALDI-TOF MS (Bruker Daltonics®, Bremen, Germany) e após, comparados com o sequenciamento do gene gyrB. Uma amostra de conveniência de 11 isolados não-A. baumannii também foram submetidas à identificação no sistema MALDI-TOF e ao sequenciamento. A avaliação da suscetibilidade foi determinada pelo método de disco difusão para os antimicrobianos: amicacina, ampicillina-sulbactam, cefepime, ceftazidima, gentamicina, piperacilina-tazobactam e para polimixina por microdiluição em caldo. Foi realizado ensaio de PCR multiplex para avaliação de genes de resistência: OXA-23-like, OXA-24-like, OXA-51-like, OXA-58-like e OXA-143. Resultados: Oitenta e nove (97%) isolados clínicos foram identificados como A. baumannii pelo sistema MALDI-TOF e confirmados pelo sequenciamento do gene gyrB. O sistema MALDI-TOF identificou corretamente 8/11 (72,7%) das espécies não-A. baumannii. Em relação a polimixina B, a maioria do isolados (96,7%) foram sensíveis (CIM ≤ 2 μg/mL) sendo que apenas 3 (3,3%) isolados apresentaram CIM ≥ 4 μg/mL para esse antimicrobiano. Quanto a presença das oxacilinases, 80 (87%) dos isolados apresentaram OXA-23-like e esses foram procedentes dos 4 estados avaliados. No entanto, foram identificados 12 (13%) isolados produtores de OXA-24-like sendo todos procedentes do Rio Grande do Sul, Paraná e São Paulo. Conclusão: Neste estudo foi possível constatar que o sistema MALDI-TOF identifica corretamente a espécie de A. baumannii mas apresentou limitações para identificação das espécies de A. nosocomialis e A. pittii. Observamos elevadas taxas de resistência aos antimicrobianos e a disseminação de OXA-23 em todos os estados avaliados. Além disso, Identificamos pela primeira vez a presença da enzima OXA-24-like em isolados de A. baumannii no sul do Brasil. / Introduction: The Acinetobacter calcoaceticus-baumannii complex (ACB) includes species: A. baumannii, A. calcoaceticus, A. pittii and A. nosocomialis. Infections caused by different species of the ACB, especially A. baumannii became increasingly severe, with the emergence of strains resistant to almost all antibiotics including carbapenems, primarily due to the production of oxacilinases. The aim of this study was to identify the different species of Acinetobacter calcoaceticus-baumannii complex (ACB) and to determine the prevalence of oxacilinases in isolates resistant to carbapenems obtained from four Brazilian states. Material and Method: Between April to October 2013, we analized 92 strains previously identified as ACB complex, resistant to carbapenems from four Brazilian states: Paraná, Rio de Janeiro, Rio Grande do Sul and São Paulo. The isolates were subjected to identification using MALDITOF MS System (Bruker Daltonics®, Bremen, Germany) and to sequencing of the gyrB gene. A convenience sample comprising 11 isolates of non-A. baumannii were also submitted to identification in MALDI-TOF system, and sequencing. The evaluation of the susceptibility was determined by disk diffusion method for the following antimicrobials: amikacin, ampicillin-sulbactam, cefepime, ceftazidime, gentamycin, piperacillin-tazobactam; for polymyxin we used the broth microdilution method. A multiplex PCR assay was performed to evaluate the resistance genes: OXA-23-like, OXA-24-like, OXA-51-like, OXA- 58-like and OXA-143. Results: Eighty-nine (97%) clinical isolates were identified as A. baumannii by MALDI-TOF system, and confirmed by sequencing of the gyrB gene. The MALDI-TOF system correctly identified only 8/11 (72.7%) of non-A. baumannii isolates. In relation to polymyxin B, the majority of isolates (96.7%) were susceptible (MIC ≤ 2 μg/mL) and only 3 (3.3%) of the isolates showed MIC ≥ 4 μg/mL for this antimicrobial. Regarding the presence of oxacilinases, 80 (87%) isolates presented OXA-23-like and these were obtained from the 4 states evaluated. Furthermore, 12 (13%) isolates producing OXA-24-like were identified, all from Rio Grande do Sul, Paraná and São Paulo. Conclusion: In the present study, we were able to determine that the MALDI TOF System correctly identifies the species of A. baumannii and has limitations for identification of A. nosocomialis and A. pittii. We notice high rates of antimicrobial resistance and the spread of OXA-23 in all states evaluated. Moreover, for the first time we identified the presence of the enzyme OXA-24- like in isolates of A. baumannii in southern Brazil.

Orientadores: Mariangela Ribeiro Resende, Maria Luiza Moretti / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-14T14:58:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ferrari_MichelaDeLuca_M.pdf: 2800534 bytes, checksum: 6c0f0dc17633a5c05f98eaf42e330cb7 (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: Os objetivos do presente estudo foram estimar a prevalência de resistência do M. tuberculosis aos fármacos de primeira linha entre pacientes com tuberculose diagnosticados no Hospital de Clínicas da Unicamp e avaliar o desempenho do método de microdiluição em placa com [3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)- 2,5diphenyl-tetrazolium bromide] (MTT) comparado ao Bactec MGIT 960®. No período foram notificados 360 casos de tuberculose. Destes 211 casos apresentaram cultura positiva para Mycobacterium sp, sendo incluídos 105 casos, nos quais foi identificado o M. tuberculosis. Dentre estes pacientes a apresentação pulmonar da TB ocorreu em 64,8% e co-infecção pelo HIV em 37,1%. A prevalência de resistência a qualquer fármaco foi de 6,7%; multidrogarresistência (RMP e INH) e resistência a INH e SM foram detectadas em 1%, em 3,8% e em 3,8% dos casos, respectivamente. Todos os isolados foram susceptíveis ao EMB. A resistência primária foi encontrada em quatro casos e resistência adquirida em três. Houve associação entre tratamento prévio e resistência (p=0,0181), as demais variáveis estudadas não foram associadas. Dentre os 119 isolados de M. tuberculosis incluídos para a avaliação do desempenho do MTT, ocorreu concordância de 100% para INH e EMB entre os métodos MTT e Bactec MGIT960®, de 99% para RMP (sensibilidade: 90%), enquanto que para SM houve concordância inferior aquela apresentada pelos outros fármacos (95,2%; sensibilidade: 90,9%). A prevalência de resistência entre os casos novos atendidos no Hospital de Clínicas da Unicamp no período de estudo foi de 3,8% para isoniazida, 1% para rifampicina, 3,8% para etambutol e 1% multidrogarresistente. Resistência a qualquer fármaco foi observada em 6,7% dos casos. O método colorimétrico com MTT apresentou bom desempenho e representa uma alternativa acurada, simples e de reduzidos custos, viável e sustentável para locais e países com limitados recursos. / Abstract: This cross-sectional, hospital-based study conducted between January 2006 and March 2008 sought to estimate the resistance of M. tuberculosis to first-line drugs among patients with tuberculosis confirmed by culture at a Brazilian hospital and evaluate the performance of the [3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyl-tetrazolium bromide] (MTT) microplate assay in comparison to the Bactec MGIT 960. During the study period were reported to the surveillance system 360 tuberculosis cases, 211 out of these were confirmed by positive culture for Mycobacterium sp and 105 out of these had M. tuberculosis isolated on culture and were included to the prevalence study. Pulmonary involvement was present in 64.8% of cases and HIV co-infection was found in 37.1%. The prevalence of M. tuberculosis resistance was 6.7%; multidrug-resistance [rifampin (RMP) and isoniazid (INH)] and resistance to INH and streptomycin (SM) were detected in 1%, in 3.8% and in 3.8% of cases, respectively. All isolates were susceptible to ethambutol (EMB). The resistance was primary in four cases and acquired in three cases. Previous treatment was associated with resistance (p=0.0181). Among 119 isolates of M. tuberculosis included to the MMTT performance evaluation, there was 100% observed agreement for INH and EMB between the MTT and Bactec MGIT 960¿ methods. For RMP, the observed agreement was 99% (sensitivity: 90%), and for SM, the level of agreement was lower (95.2%; sensibility 90.9%) than those of the other drugs. The prevalence of M. tuberculosis resistance among the new cases during the study period was 6.7%; multidrug-resistance and resistance to INH and streptomycin (SM) were detected in 1%, in 3.8% and in 3.8% of cases, respectively. The colorimetric method with tetrazolium (MTT) represents an accurate, simple and low cost alternative that is both viable and sustainable for settings with limited resources. / Mestrado / Ciencias Basicas / Mestre em Clinica Medica

Orientador: Carmen Silvia Passos Lima / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-26T16:24:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RinckJunior_JoseAugusto_D.pdf: 4925898 bytes, checksum: cf6e78a6e4ad84c7bbe48d34d75fdae6 (MD5) Previous issue date: 2015 / Resumo: As glutationa S-transferases (GSTs) são enzimas detoxificantes. Os genes GSTM1 e GSTT1 são polimórficos e quando deletados perdem a expressão enzimática. As proteínas codificadas pelos genes XPD são responsáveis pelo reparo de lesões do DNA causadas pela luz solar. Polimorfismos nestes genes também podem codificar proteínas com funções comprometidas, em especial o Lys751Gln e o Asp312Asn do gene XPD. Ainda não é claro o papel dos polimorfismos destes genes no risco de melanoma cutâneo (MC) ou se estão associados com os aspectos clínicopatológicos. Foram incluídos 489 indivíduos (231 pacientes, 258 controles). A genotipagem foi realizada por reação em cadeia da polimerase e digestão enzimática. O risco de MC esteve aumentado em 2,00 (IC 95%: 1,05-3,81, P= 0,03) vezes em portadores do genótipo GSTT1 nulo + Asp/Asn + Asn/Asn do XPD Asp312Asn. O GSTT1 nulo elevou o risco de MC metastático em 3,75 (IC 95%: 1,48-9,44, P= 0,006) vezes e se combinado ao GSTM1 nulo em 7,33 (IC 95%: 2,09-25,68, P= 0,003) vezes. O alelo 312Asn elevou o risco de MC no tronco ou membros em 1,80 (IC 95%: 1,19-2,73, P= 0,005) vezes e do subtipo extensivo superficial ou nodular em 1,80 (IC 95%: 1,14-2,84, P= 0,01) vezes. Os genótipos Asn/Asn + Gln/Gln elevou o risco de MC de níveis I, II ou III de Clark em 2,46 (IC 95%: 1,12-5,37, P= 0,02) vezes. Os genótipos GSTM1 nulo + GSTT1 nulo (HR: 3,18; IC95%: 1,21-8,36, P= 0,01) e o genótipo GSTT1nulo + Gln/Gln (HR: 5,93; IC95%: 1,53-22,91, P= 0,01) estiveram associados a maior risco de morte. Concluímos que os referidos polimorfismos em combinações específicas podem aumentar a susceptibilidade ao MC e influenciar suas características clínicopatológicas e sobrevida / Abstract: The glutathione S-transferases (GST) are detoxifying enzymes; the GSTM1 and GSTT1 genes are polymorphic and when deleted lose enzyme expression. The XPD proteins are responsible for DNA damage repair caused by sunlight. Polymorphisms (SNPs) in XPD genes may also result proteins with impaired function, in particular Lys751Gln and Asp312Asn. However It¿s not entirely clear whether the SNPs of these genes influence the risk of cutaneous melanoma (CM) or are associated with clinic pathological aspects of this disease. In the present study 489 individuals were included (231 patients and 258 controls). Genotyping was performed by polymerase chain reaction and enzyme digestion. The risk of MC was increased 2.00-fold (95% CI: 1.05-3.81, P= 0.03) in carriers of the GSTT1 null combined with Asp/Asn + Asn/Asn genotype of XPD Asp312Asn. The GSTT1 null genotype and GSTT1 null + GSTM1 null genotype increased the risk of metastatic MC by 3.75-fold (95% CI: 1.48-9.44, P= 0.006) and 7.33-fold (95% CI: 2.09-25.68, P= 0.003), respectively. The allele 312Asn increased the risk of MC in the trunk or limbs in 1.80-fold (95% CI: 1.19-2.73, P= 0.005) and superficial spreading or nodular subtype in 1.80-fold (95%: 1.14-2.84, P= 0.01). The combined Asn/Asn + Gln/Gln genotype raised the risk of MC in Clark¿s level I, II or III in 2.46-fold (95% CI: 1.12-5.37, P= 0.02). The genotype GSTM1null + GSTT1 null (HR: 3.18; 95% CI: 1.21-8.36, P= 0.01) and GSTT1 null + Gln/Gln (HR: 5.93; 95% CI: 1.53-22.91, P= 0.01) were predictive of lower overall survival. In conclusion, polymorphisms in specific genes combinations may increase susceptibility to MC and influence their clinic pathological features and survival / Doutorado / Clinica Medica / Doutor em Clínica Médica