Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Educação, 2010. / Submitted by wiliam de oliveira aguiar (wiliam@bce.unb.br) on 2011-06-20T17:59:16Z No. of bitstreams: 1 2010_MariadeNazaréRodrigues.pdf: 594274 bytes, checksum: 1007725bcd7218755259e4bb7a120f76 (MD5) / Approved for entry into archive by Elna Araújo(elna@bce.unb.br) on 2011-06-21T00:19:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_MariadeNazaréRodrigues.pdf: 594274 bytes, checksum: 1007725bcd7218755259e4bb7a120f76 (MD5) / Made available in DSpace on 2011-06-21T00:19:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_MariadeNazaréRodrigues.pdf: 594274 bytes, checksum: 1007725bcd7218755259e4bb7a120f76 (MD5) / O objetivo deste trabalho foi identificar e analisar as práticas organizacionais, para implementação do IFPA no sentido de identificar as manifestações culturais. Para tal, foi necessário levantar o contexto histórico do IFPa; identificar as práticas de implementação do IFPa e identificar os pontos facilitadores e dificultadores para implementação das novas práticas. Para isso, utilizou-se práticas de estudo de caso, tendo realizado análise documental e descritiva. Os dados foram coletados por meio de entrevista com oito dirigentes representando os campi. Para se obter o DSC usou-se o software QUALIQUANTSOFT. A entrevista foi realizada baseada a partir de um roteiro construído por meio das relações hierárquicas: Concentração do poder, tomada de decisão e participação. Na análise documental foi do período de 1909 até 2008, quando o CEFET-Pa se transforma em IFPA, chegou-se aos seguintes resultados: a) relações hierárquicas, caracterizada pela centralização, baixa participação dos atores na vida da instituição, personalismo e baixa autonomia. Na análise do Discurso do Sujeito Coletivo-DSC observou-se as relações hierárquicas caracterizadas na análise descritiva por meio das percepções dos dirigentes, obtidas pelas entrevistas percebeu-se as práticas advindas da implementação principalmente a inovação administrativa, com maior autonomia para tomadas de decisões, com instância colegiada como a criação do Colégio de Dirigente e o Conselho Superior e inovação tecnológica diversificação nos meios de comunicação, tendo como função básica: regulação, motivação, expressão emocional e informação; amparada pela Lei 11.892 aumentando o potencial de mudança organizacional. Identificou-se os seguintes pontos facilitadores para a implementação: credibilidade de uma instituição centenária; possibilidade de oferta de curso em todos os níveis e modalidade de ensino; plano de carreira; escolha da localização dos campi; estrutura física completa dos campi e contratação de recursos humanos; atuação do colégio de dirigente, autonomia orçamentária e diálogo com os atores sociais; novas parcerias; novos financiamentos; descentralização de poder; presença do reitor e pró-reitorias nos campi. Os pontos dificultadores identificados foram baixa velocidade da internet; meio de transporte deficitário; corpo docente insuficiente e inexperiente; dificuldade de deslocamente entre os municípios, meio de transporte deficitário; falta de definição de papeis dos atores; aligeiramento do processo de implementação e remanejamento de servidor. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The objective of this work was identify and analyze the organizational practices for the implementation of IFPA, this way identifying its cultural manifestations. In order to do it, it was necessary to learn its historical context, identify the practices of implementation of IFPA, identify the facilitating and difficult aspects for the implementation of new practices. Case studies were used as well as documents and descriptive analysis. The data were collected through interviews with eight directors representing the campuses. The Collective Subject Discourse (DSC) was obtained through the software QUALIQUANTSOFT. The interview was made based on a script on hierarchical relationships: power concentration, decision taking and participation. The document analysis included the period from 1909 to 2008, when CEFET-Pa changed to IFPA, reaching the following results: a) hierarchical relationships characterized by centralization, low participation of actors in institution life, personalism and low autonomy. While analyzing the DSC, hierarchical relationships characterized in the descriptive analysis were observed through the perceptions of directors expressed in the interviews in which the practices originated by the implementation were perceived especially the administrative innovation with higher autonomy for the decision taking like the creation of the Directors College and the High Council, technological innovation, diversification in the means of transportation, having as basic functions: regulation, motivation, emotional expression and information, anchored on the law 11892, that increases the potential of organizational change. The following facilitating points for the implementation were identified: reliability of a centenary institution; possibility of offering courses in all levels and kinds; career plan; choice of campuses location; full physical structure of campuses and human resources hiring; actuation of the Directors College; budget autonomy and dialogue with social actors; new partnerships; new sponsorships, power discentralization; presence of rector and pro-rector in the campuses. The difficult points identified were internet low speed, inefficient means of transportation, insufficient and inexperienced body of teachers, difficult in moving among the cities; indefiniteness in the role of actors; fast implementation process and servant change.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Educação, Programa de Pós-Graduação em Educação, 2013. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2014-02-05T12:04:51Z No. of bitstreams: 1 2013_TarcisioAraujoKuhnRibeiro.pdf: 1166326 bytes, checksum: ba116429010ecc3920e4be1d09a0c6b9 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-02-05T12:41:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_TarcisioAraujoKuhnRibeiro.pdf: 1166326 bytes, checksum: ba116429010ecc3920e4be1d09a0c6b9 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-02-05T12:41:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_TarcisioAraujoKuhnRibeiro.pdf: 1166326 bytes, checksum: ba116429010ecc3920e4be1d09a0c6b9 (MD5) / Este trabalho analisa a Política Pública que originou os Institutos Federais de Educação, Ciência e Tecnologia e sua inserção na Política Pública nacional de Ciência, Tecnologia e Inovação. Ambas são objeto da pesquisa, que demonstra como os Institutos Federais estão participando e contribuindo com a política de Ciência, Tecnologia e Inovação no Brasil. Para tanto, o trabalho contempla uma revisão bibliográfica dos principais conceitos relacionados, faz um histórico da agenda pública da ciência e tecnologia no Brasil e discute a visões dos formuladores e implementadores da Política Pública dos Institutos Federais. Como parte da pesquisa empírica são apresentados números dos Núcleos de Inovação Tecnológica vinculados aos Institutos e entrevistas com dirigentes dos Institutos e do Ministério da Educação, para demonstrar os resultados concretos da ação dos Institutos no fomento à produção científica e tecnológica. Ao final, a pesquisa traz reflexões sobre as perspectivas dos Institutos para atuação na Política Pública de Ciência, Tecnologia e Inovação, e faz um debate sobre a tendência teórica da policy network, no sentido de colocar em evidência as contribuições desta teoria para o estudo e articulação das políticas públicas de educação profissional no Brasil. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / This paper analyzes the Public Policy that led the Institutos Federais de Educação, Ciência e Tecnologia (IFs) and its inclusion in national Public Policy of Science, Technology and Innovation. Both are the subject of research, which shows how the IFs are participating and contributing to policy Science, Technology and Innovation in Brazil. For both, the work includes a literature review of key concepts related, makes a historic of the public agenda of science and technology in Brazil and discusses the views of policymakers and implementers of Public Policy of the IFs. As part of the empirical research are presented numbers of Technological Innovation Centers connected to IFs and interviews with leaders of the Institutos Federais and the Ministry of Education, to demonstrate concrete results from the action of the IFs in fostering scientific and technological production. At the end, the research reflects on the prospects of the IFs to act on Public Policy for Science, Technology and Innovation, and makes a discussion on the theoretical tendency of policy network, in order to highlight the contributions of this theory to the study and articulation of public policies on vocational education in Brazil.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação, 2013. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2014-02-19T13:44:11Z No. of bitstreams: 1 2013_RonaldoRigoni.pdf: 29314095 bytes, checksum: 6fa363124874c6673aaf642bd22e11c5 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-03-31T14:07:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_RonaldoRigoni.pdf: 29314095 bytes, checksum: 6fa363124874c6673aaf642bd22e11c5 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-03-31T14:07:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_RonaldoRigoni.pdf: 29314095 bytes, checksum: 6fa363124874c6673aaf642bd22e11c5 (MD5) / A integridade e confiabilidade de conteúdos multimídia tornaram-se um desafio perante o fácil acesso às informações e à grande gama de softwares disponíveis para edição e editoração. A literatura classifica os métodos de adulterações de mídias digitais em duas classes: ativos e passivos. Os métodos passivos consistem na análise de catacterísticas típicas dos conteúdos adulterados, enquanto que os métodos ativos utilizam uma marca d’água ou uma assinatura digital para detecção de adulterações. Em particular, o uso de técnicas de marca d’água digital é uma das abordagems mais promissoras para detecção de adulterações em mídias digitais. Diversas técnicas de detecção de adulterações foram propostas na literatura. No entanto, todas as técnicas concentram-se na detecção de uma pequena gama de adulterações. O objetivo deste trabalho é o desenvolvimento de uma técnica de proteção contra adulterações em imagens e vídeos utilizando uma técnica de inserção de marca d’água digital com o algoritmo por modulação do índice de quantização (QIM). O sistema proposto é capaz de detectar adulterações locais, globais e temporais apresentando bom desempenho. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The integrity of multimedia content, such as images, videos and audios, have become a challenge because of the easy access to information and the wide range of software available for edition. The literature classifies tampering of digital media methods in two types: active and passive. Passive methods analyse the intrinsic caracteristics of the media to detect tampered areas. The active methods use a watermarking algorithm or a digital signature for tampering detection. Using a watermarking algorithm is one of the most promising ways for the detection of tampering or any modification on the media. Several techniques are proposed in the literature for different types of digital tampering detection. However, most techniques concentrate on a small range of tampering detection. The goal of this work is to develop a technique for tampering protection in images and videos using a watermarking technique combined with a Quantization Index Modulation algorithm (QIM). The proposed system is capable of detecting local, global and temporal tampering and presents good performance.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Departamento de Engenharia Elétrica, 2014. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2014-04-15T13:13:40Z No. of bitstreams: 1 2014_TainaBorgesAndradeGarrido.pdf: 5153253 bytes, checksum: 24bb24a97464b34e15acf8a3b9b6ab0d (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-07-22T13:38:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_TainaBorgesAndradeGarrido.pdf: 5153253 bytes, checksum: 24bb24a97464b34e15acf8a3b9b6ab0d (MD5) / Made available in DSpace on 2014-07-22T13:38:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_TainaBorgesAndradeGarrido.pdf: 5153253 bytes, checksum: 24bb24a97464b34e15acf8a3b9b6ab0d (MD5) / A qualidade da imagem está associada a capacidade do Sistema Visual Humano (SVH) perceber degradações. Muitas métricas de qualidade se utilizam da comparação com a imagem original para mensurar a qualidade da imagem degradada. Estas métricas são conhecidas como métricas com referência ou referenciadas. Infelizmente, em aplicações práticas nem sempre se dispõe da imagem de referência para a avaliação da qualidade. Dessa forma, muitas pesquisas têm sido desenvolvidas com a finalidade de criar e implementar métricas de avaliação objetivas sem-referência ou não referenciadas. Naturalmente, por não utilizar a referência (original) para estimar a qualidade, estas métricas são menos precisas que as métricas com referência. Neste contexto, o presente trabalho tem o objetivo de melhorar o desempenho de métricas de qualidade sem-referência disponíveis na literatura. Com este fim, apresentamos uma proposta de aperfeiçoamento destas métricas utilizando modelos computacionais de atenção visual. Com este objetivo, foram empregadas estratégias de combinação da imagem degradada com os respectivos mapas de saliência gerados pelos modelos de atenção visual. Os experimentos realizados através de simulações computacionais apontam que enfatizar as áreas mais relevantes (ou mais salientes) da imagem é uma estratégia eficaz para melhorar o desempenho de métricas existentes. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Image quality is frequently associated with the ability of the Human Visual System (HVS) to perceive degradations. In the last few years, several image quality metrics have been proposed that use the original image (or reference) to estimate image quality. These metrics are known as full-reference (FR) metrics. Unfortunately, the reference is not always available in practical application. The alternative consists of using no-reference (NR) image quality metrics that blindly estimate the quality of an image, without having access to the original image. These metrics, in general, have a lower performance when compared to FR image quality metrics. The goal of this work is to improve the performance of no-reference image quality metrics using visual attention computational models. With this goal, we present strategies that consist of combining the test image with saliency maps generated by visual attention models. Experimental results indicate that the proposed approach can be an effective strategy for improving the performance of existing objective metrics.

Existe una amplia variedad de técnicas usadas actualmente en la clínica fonoaudiológica para modificar el grado de tensión muscular en el área de voz. Sin embargo, no existen estudios que avalen el uso de una u otra en función de su efectividad. El presente estudio pretende comparar el efecto de dos técnicas de relajación sobre la calidad de la voz de 11 pacientes adultos con patología vocal funcional u orgánica que presentaron tensión supra o infrahioídea aumentada al momento de su evaluación. Se trata de sujetos cuya primera consulta se realizó durante el periodo comprendido entre mayo y octubre del año 2005 en el Servicio de Otorrinolaringología del Hospital Clínico de la Universidad de Chile. A cada paciente se le realizó una evaluación electromiográfica y fonético acústica antes y después de la aplicación una de las técnicas de relajación utilizadas en este estudio (masoterapia y movilización pasiva de segmentos). Los resultados no fueron significativos en demostrar la eficacia de una de las técnicas sobre la otra en función de la mejora en la calidad vocal de los sujetos en estudio. Sin embargo, este estudio sienta un precedente en cuanto a la medición objetiva del grado de tensión muscular supra e infrahioídea y su relación con la calidad vocal. / There exists a wide variety of techniques used nowadays in the fonoaudiological clinic to modify the degree of muscular tension in the area of voice. Nevertheless, there do not exist studies that support the use of one or another depending on its efficiency. The present study tries to compare the effects of two relaxing techniques in 11 subjects that suffer organic or functional vocal pathology increased to the moment of its evaluation. They are subjects which first consultation was realized during the period included between May and October of 2005 in the Service of Otolaryngology of the University of Chile Clinical Hospital. To every patient an electromiographic and phonetic-acoustic evaluation carried out before and after the application one of the relaxing techniques used in this study (massoterapy and passive mobilization of segments). The results were not significative in the demonstration of the efficiency of one of the techniques or the other one depending on the improvement in the vocal quality of the subjects in study. Nevertheless, this study sits a precedent for the objective measurement of the degree of muscular tension supra and infrahioid and its relation with the vocal quality.

O presente trabalho apresenta os atuais requisitos de desempenho para janelas, bem como os critérios de desempenho a serem atendidos, e que estão prescritos na Norma \"NBR10821:2000 - Caixilho para edificação - Janelas\". Através dos Programas Setoriais da Qualidade de Esquadrias de Alumínio e de PVC foram possíveis as análises dos requisitos de desempenho, de seus respectivos resultados e critérios de aprovação, nas quais foram verificados problemas de interpretação do texto normativo, de capacitação laboratorial, nos métodos e nos procedimentos de ensaios que não permitiam adequada avaliação de conformidade do produto. A partir dessas análises, este trabalho propõe-se a dar subsídios para uma revisão da citada norma brasileira. Desta forma, procura-se além de fornecer subsídios para a revisão da NBR10821, contribuir para a orientação no desenvolvimento de produtos na área de componentes e no desenvolvimento de projetos. / This present work shows the current development requirements for windows, as well as the development criteria to be met and complied with standard \"NBR10821:2000 - Windows - Specification\". The aluminium and PVC frames Sectorial Quality Program made it possible to perform the development requirements analyses from its respective results and approval criteria, in which there were the some problems of prescriptive text interpretation of laboratorial capacitation, in methods and procedures that didn\'t allow an adequate evaluation of the product conformity. From this analyses, this work has the purpose of subsidizing a review of Brazilian standard previously mentioned. Therefore, is is demanded not only provide subsidies for the NBR 10821 review, but also to contribute for directions in product development in the components field and project development as well.

Orientadores: Carlos Roberto de Souza Filho, Laerte Guimarães Ferreira Junior / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Geociencias / Made available in DSpace on 2018-08-10T13:23:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nunes_GustavoManzon_D.pdf: 36857548 bytes, checksum: 70db72622f53387a3b3daa1b2a6ac19d (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: O conhecimento da biodiversidade amazônica, em especial o relacionado à sua cobertura vegetal, tem sido alvo de amplos estudos envolvendo a investigação de seus processos ecológicos-evolutivos e o seu funcionamento como um conjunto integrado e complexo de unidades biológicas. O desenvolvimento de tecnologias e metodologias no campo do Sensoriamento Remoto, cada vez mais vem se tornando essencial na análise, discriminação e monitoramento de vastas áreas dominadas pela Floresta Tropical. Esta tese buscou avaliar os aspectos relacionados à potencialidade das imagens dos sensores Moderate Resolution Imaging Spectroradiometer (MODIS)/Terra, Advanced Spaceborne Thermal Emission and Reflection Radiometer (ASTER)/Terra e Synthetic Aperture Radar (SAR)/R99-B, para a discriminação de fitofisionomias existentes nas Reservas de Desenvolvimento Sustentável Amanã e Mamirauá (RDSA e RDSM). A partir de processamentos realizados com os dados do sensor MODIS, Produto MOD13 ¿ Índices de Vegetação EVI (Enhanced vegetation ÍNDEX) e NDVI (Normalized Difference Vegetation Index), foi avaliado o comportamento sazonal/temporal de quatro fitofisionomias existentes nas RDSA e RDSM, entre os anos de 2004 e 2005. Com este estudo, foi possível concluir que (i) os índices de vegetação foram sensíveis às características estruturais e fisionômicas do geossistema estudado; (ii) o EVI apresentou a melhor resposta para a discriminação de fitofisionomias, (iii) é possível discriminar ¿endmembers¿ temporais para as distintas classes florestais, os quais podem servir como importantes referências para trabalhos futuros envolvendo a dinâmica da paisagem. Às imagens do sensor ASTER, nos intervalos espectrais do visível (0.52-0.69 µm), infravermelho próximo (0.78-0.86 µm) e infravermelho de ondas curtas (1.60 a 2.43 µm), foram aplicadas técnicas de classificação espectral adaptadas para os dados deste sensor (Spectral Angle Mapper (SAM) e Mixture Tuned Matched Filtering (MTMF)), além do NDVI. Através da técnica SAM foi possível a discriminação de seis fitofisionomias predominantes na RDSA. Através da técnica MTMF, que envolve um algoritmo de classificação mais robusto, informações equivalentes foram obtidas. Foi possível ainda a associação e detecção dos padrões espectrais da cobertura vegetal, mostrando a estreita relação com o índice NDVI. Utilizando-se dados do sensor aerotransportado SAR R99-B, adquiridos na banda L (1,28 GHz), em amplitude e com quatro polarizações (HH, VV, HV e VH), avaliou-se a distinção de fitofisionomias de floresta de várzea existentes em ambientes da RDSA e RDSM, com a aplicação do algoritmo Iterated Conditional Modes (ICM), de classificação polarimétrica pontual/contextual. Os resultados mostraram que o uso das distribuições multivariadas em amplitude, conjuntamente com uma banda de textura, produziu classificações de qualidade superior àquelas obtidas com dados polarimétricos uni/bivariados. Essa abordagem permitiu a discriminação correta de três classes vegetacionais de interesse, comprovando o potencial dos dados do SAR-SIPAM e do algoritmo ICM no mapeamento da cobertura vegetal da Amazônia / Abstract: The knowledge of the Amazon biodiversity, especially that related to its vegetation cover, has been the subject of several studies involving the investigation of its ecological-evolutional processes and its dynamics as an integrated and complex set of biological units. The development of Remote Sensing technologies and methodologies is becoming increasingly essential in the analysis and monitoring of vast areas dominated by the Amazon rainforest. Thus, this study seeks to evaluate the capability of data generated by the Moderate Resolution Imaging Spectroradiometer (MODIS)/Terra, the Advanced Spaceborne Thermal Emission and Reflection Radiometer (ASTER)/Terra and the Synthetic Aperture Radar (SAR)/R99-B sensors, in discriminating phytophysiognomies found in the Amanã and Mamirauá Sustainable Development Reserves (RDSA and RDSM). Product MOD13, derived from MODIS data processing, comprising the Vegetation Indices EVI (Enhanced vegetation Index) and NDVI (Normalized Difference Vegetation Index), was used to evaluate the seasonal/temporal behavior of four existing phytophysiognomies in RDSA and RDSM between 2004 and 2005. Results showed that (i) the vegetation indices were sensitive to the structural characteristics of the approached ecosystem and phytophysiognomies; (ii) the EVI index best discerned among the phytophysiognomies; (iii) temporal endmembers were distinguished for different classes of forests and may serve as important references for future work involving the dynamics of the landscape. ASTER data, including visible (0.52-0.69 µm), nearinfrared (0.78-0.86 µm) and shortwave infrared (1.60-2.43 µm) bands were processed through advanced spectral classification techniques, such as the Spectral Angle Mapper (SAM) e Mixture Tuned Matched Filtering (MTMF), besides NDVI. The SAM method allowed the recognition of six dominant phytophysiognomies in the RDSA. The MTMF, which involves a more robust spectral unmixing method, provided equivalent results. Using ASTER data, it was also possible to demonstrate the close relation between the spectral patterns and the NDVI values for the vegetation cover. By means of L band (1.28 GHz), full polarimetric (HH, VV, VH, HV), SAR-amplitude data acquired with the SAR R99-B sensor, distinctions among flooded forest phytophysiognomies in the RDSA and RDSM was pursued. The Iterated Conditional Modes (ICM) algorithm was employed to perform the local/contextual polarimetric classification of the data. Results showed that the use of multivariate distributions in amplitude with a band of texture produced classifications of superior quality in relation to those obtained with the uni / bivariate polarimetric data. This approach allowed the correct discrimination of three vegetation classes of interest, proving the potential of the SAR data and the algorithm ICM in forest mapping in the Amazon / Doutorado / Análise Ambiental e Dinâmica Territorial / Doutor em Geografia

Apesar de ser principalmente um colonizador da pele e mucosas, Staphylococcus epidermidis, juntamente com outros estafilococos coagulase negativos, tornou-se um importante patógeno oportunista, responsável por infecções nosocomiais associadas ao uso de dispositivos implantáveis. O fator mais importante na patogênese de infecções estafilocócicas associadas a estes dispositivos é a habilidade do patógeno de formar um biofilme bacteriano, sendo que a presença dos genes ica, aap e atlE é considerada importante para a sua formação. Este estudo compara diferentes métodos para a detecção de formação de biofilme em S. epidermidis isolado de cateter venoso central (CVC). Dois métodos fenotípicos foram realizados: o teste da microplaca, considerado o padrão ouro e o teste com ágar Congo Red (ACR). No método genotípico, através da técnica de PCR, foi verificada a presença dos genes icaA, icaD, aap e atlE. Das 166 amostras analisadas, 107(64%) produziram biofilme pelo teste da microplaca, sendo 17 fortes, 23 moderadas e 67 fracas produtoras, enquanto 90(54%) produziram biofilme pelo teste com ACR. Foi verificada a presença dos genes icaA e icaD em 97% (104/107) das amostras produtoras de biofilme pela microplaca; em 77% foi identificado o gene aap e em 92% o gene atlE. Os genes icaA e icaD foram considerados os marcadores mais confiáveis na identificação molecular de biofilme porque apresentaram maior sensibilidade (97%) quando comparados com os demais genes. A ausência de genes icaA e icaD em três isolados produtores de biofilme através do teste da microplaca, chamados de “ica-independente”, sugerem a presença de um mecanismo alternativo de formação de biofilme, como a proteína Aap, que pode substituir funcionalmente PIA como uma adesina intercelular. A alta prevalência do gene atlE entre os isolados deste estudo pode ser explicada pelo fato de a proteína AtlE ser um importante fator para a aderência em superfícies plásticas como CVC. Porém a sua presença nem sempre implica em formação de biofilme. Este estudo confirma a importância do operon ica na formação do biofilme e nas infecções relacionadas a cateter, uma vez que a maioria das amostras produtoras de biofilme isoladas de CVC carreavam tal gene. / Although Staphylococcus epidermidis is essentially a colonizer of skin and mucous membranes, it has become an important opportunistic pathogen among other coagulasenegative staphylococci, and it is responsible for nosocomial infections associated to indwelling medical devices. The most important factor in the pathogenesis of staphylococcal device-related infections is the pathogen ability to produce a biofilm, and it has been demonstrated that ica, aap and atle genes are important to its production. The present study compares different detection methods of biofilm formation in isolates of S. epidermidis from central venous catheter (CVC). Two phenotypic methods were performed: the microtiter plate test, considered a golden standard, and Congo red agar test. Through a genotypic method, using the PCR technique, it was verified the presence of icaA, icaD, aap and atlE genes. Using the microtiter plate assay, biofilm formation was observed in 107 of 166 analyzed samples (64%, including 17 strong, 23 moderate and 67 weak producers) while the Congo Red agar (CRA) plate assay reveled 90 (54%) biofilm producers. The presence of icaA and icaD genes was verified in 104 of the 107 biofilm producers samples identified through the microtiter assay (97%), while 77% presented aap gene and 92% presented atlE gene. Compared to other genes, icaA and icaD presented the higher sensibility (97%) and were considered the most reliable markers for molecular identification of biofilm producers. The absence of icaA and icaD genes in three biofilm-producing isolates identified through the microtiter assay (the “ica-independent”) suggests the existence of an alternative mechanism for biofilm formation, such as the Aap protein, that can be a functionally substitute for PIA as an intercellular adhesin. The high occurrence of atlE gene among the isolates in this study may be due to AtlE protein being an important factor for adherence to plastic surfaces, such as CVC, but the presence of this gene does not always results in biofilm formation. The present study corroborate the importance of ica operon in biofilm formation and in catheter-related infections, since most of the biofilm-producing sample isolates from CVC presented these genes.

A progressão das neoplasias sólidas é um processo complexo, não segue uma seqüência universal e é caracterizada pela marcada heterogeneidade tumoral na ocasião do diagnóstico. Anormalidades cromossômicas, mutações somáticas e alterações epigenéticas estão entre as principais alterações celulares decorrentes da instabilidade do genoma destas neoplasias. Essa instabilidade tem importantes implicações clínicas, pois impõe dificuldades ao desenvolvimento de novos biomarcadores tumorais, tais como a baixa recorrência de mutações somáticas causalmente relacionadas ao desenvolvimento do câncer e a grande diversidade amostral. Neste trabalho estudamos alterações citogenéticos e moleculares com objetivo de caracterizar padrões de diversidade tumoral. Os resultados demonstraram que a diversidade cariotípica é específica para cada tipo de tumor e que os tumores de menor diversidade apresentam estatísticas populacionais com melhor sobrevida (79 tipos de tumores; n=12787). Além disso, desenvolvemos novos métodos computacionais baseados na teoria da informação com objetivo de mapear a diversidade de expressão gênica dos mecanismos de estabilização do genoma. Os resultados obtidos sugerem que redes de genes de apoptose e do sistema de reparo por excisão de nucleotídeos estão funcionalmente alteradas em neoplasias sólidas, com aumento da diversidade de expressão gênica e diminuição da abundância de transcritos (14 tipos de tumores; n=492). A implicação deste achado é que ele fornece evidências em favor da instabilidade genômica ao nível dos nucleotídeos, um tipo de disfunção que causa aumento da taxa de mutação somática e que está caracterizada apenas em modelos teóricos e experimentais ou em raros casos de desordens hereditárias. Por fim, a padronização dos métodos computacionais desenvolvidos resultou em duas patentes de invenção (aplicadas ao diagnóstico/prognóstico de neoplasias sólidas) e em dois produtos tecnológicos na forma de programas de computador distribuídos com licença de código aberto (aplicados ao estudo da diversidade citogenética e molecular). Endereço de acesso: http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/ / The progression of solid tumors does not follow a universal sequence and it is characterized by marked tumor heterogeneity. Chromosomal abnormalities, somatic mutations and epigenetic alterations are among the major cellular changes associated to genome stability impairments, which contribute substantially to this heterogeneity. The cancer genome instability has important clinical implications, since it imposes technical problems for tumor biomarker development, such as the low recurrence of somatic mutations causally related to cancer and the great sample diversity. Here, we considered different types of cytogenetic and molecular changes in order to characterize different patterns of tumor diversity. The results showed that the karyotypic diversity is specific to each tumor type and that tumors with lower diversity present better population statistics – five-year survival rates (79 types of tumors, n = 12787). Furthermore, we developed new computational methods based on information theory concepts in order to map the diversity of gene expression networks of genome maintenance mechanisms. The results suggest that two gene expression networks - apoptosis and nucleotide excision repair (NER) - are functionally altered in solid tumors, with increased gene expression diversity and decreased transcript abundance (14 types of tumors; n=492). The implication of this finding is that it provides evidence in favor of genomic instability at nucleotide level, a type of dysfunction that can increase the somatic mutation rate, which is soundly characterized only in theoretical and experimental models, or in rare inherited disorders. Finally, the standardization of the computational methods developed here gave rise to two patents (applied to the diagnosis / prognosis of solid tumors) and two bioinformatics applications released under open source license (designed for cytogenetic and molecular diversity studies). Availability: http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/

As doenças lisossômicas de depósito (DLD) são erros inatos do metabolismo causadas pela deficiência de uma proteína, normalmente uma enzima, que resulta no depósito de lipídios nos lisossomos. Neste trabalho, nos propusemos a avaliar uma metodologia para a investigação bioquímica das DLDs. Amostras em papel filtro apresentam um menor volume de sangue coletado e uma maior facilidade quanto ao transporte e acondicionamento. Tivemos por objetivos estabelecer fatores pré-analíticos em amostras de sangue em papel filtro (SPF) tais como: efeito de anticoagulantes, temperatura de armazenamento e estabilidade ao longo do tempo para as enzimas b-galactosidase (b-gal), hexosaminidase total (Hex t), alfa-galactosidase (GLA), arilsulfatase B (ASB) e alfa-glicosidase (GAA). Também foi realizada a miniaturização e a correlação das metodologias em estudo. Descrevemos ainda nossa experiência no rastreamento das DLD em SPF em uma população de alto risco. Amostras de sangue de indivíduos normais (controles) foram coletadas em tubos com anticoagulantes EDTA, heparina, ou diretamente impregnados em papel filtro e armazenadas em diferentes temperaturas (-20, 4, 25 e 37ºC) e tempos (3, 10, 17 e 180 dias). Através da determinação da atividade enzimática em SPF por técnicas fluorométricas chegamos aos seguintes resultados: não houve diferença significativa entre os diferentes métodos de coleta do estudo para nenhuma das enzimas pesquisadas. Com relação ao efeito da temperatura e do tempo foi possível determinar que aos três dias de armazenamento, em todas as temperaturas estudadas e para todas as enzimas, as atividades permaneceram estáveis. A partir deste tempo cada enzima demonstrou um efeito diferente ao longo do tempo para as diversas temperaturas estudadas. Existem aquelas que não sofrem variação em sua atividade até 180 dias de armazenamento nas temperaturas estudadas (Hex t e GLA), aquelas que só vão diminuir sua atividade aos 180 dias em todas as temperaturas (ASB) ou somente a 37°C (b-gal) ou ainda aquela que diminui constantemente sua atividade a partir de 10 dias de armazenamento em todas as temperaturas (GAA). Se o objetivo for medir a atividade de todas as enzimas no mesmo papel filtro, então o melhor será armazenar o papel filtro por no máximo 10 dias em qualquer uma das temperaturas estudadas. Este tempo pode ser estendido até 180 dias em qualquer das temperaturas se formos analisar somente as atividades enzimáticas da Hex t, GLA e b-gal. O estudo de correlação das amostras de papel filtro de 1,2mm e 3mm de diâmetro para as enzimas alfagalactosidase, arilsulfatase B e alfa-glicosidase resultou nos coeficientes 0,994; 0,900 e 0,957; respectivamente. Isto demonstra que podemos diminuir o picote de papel sem perda da qualidade do ensaio. Por fim realizamos um rastreamento para as doenças de Pompe, Fabry, Mucopolissacaridose I e VI em 205 amostras de pacientes de alto risco, onde foi observado uma freqüência de 2,9% para estas DLDs após a utilização da metodologia pesquisada. Nossos resultados mostram a viabilidade na medida da atividade enzimática em SPF, o que facilita a coleta, envio e armazenamento das amostras para a triagem destas doenças lisossômicas. / Lysosomal storage diseases (LSD) are inborn errors of metabolism caused by deficiency of a protein, usually an enzyme, which results in storage of lipids in lysosomes. In this work, we have proposed a methodology for the biochemical investigation of LSD. Dried blood spot samples on filter paper (DBS) have a lower volume of blood collected and ease about the transport and storage. The aims of the study for pre-analytical factors on DBS were: to investigate the effect of anticoagulants, storage temperature and stability over time for the enzymes b-galactosidase (b-gal), total hexosaminidase (Hex t), alphagalactosidase (GLA), arylsulfatase B (ASB) and alpha-glucosidase (GAA). We also made the miniaturization and the correlation of the methodologies under study. Also describe our experience in LSD screening on DBS in a high-risk population. Blood samples from normal individuals (controls) were collected in tubes with anticoagulant EDTA, heparin, either directly impregnated on filter paper and stored at different temperatures (-20, 4, 25 and 37ºC) and times (3, 10, 17 and 180 days). The enzymatic activities in DBS were determined by fluorometric techniques and we achieved the following results: no significant difference between the different collection methods was observed for any of the enzymes. Regarding the effect of temperature and time it was determined that the three days of storage at all temperatures studied and for all the enzymes, the activity remained stable. From this time each enzyme showed a different effect over time for various temperatures. There are enzymes that do not suffer variations in their activity until 180 days of storage at temperatures studied (t- Hex and GLA), there are those that will slow down their activity after 180 days at all temperatures only (ASB) or only at 37°C (b-gal ) or only that is constantly decreasing its activity after 10 days of storage at all temperatures (GAA). If the goal is to measure the activity of all enzymes in the same DBS, then it is best to store the DBS for a maximum of 10 days in any of the temperatures studied. This time can be extended to 180 days in any of the temperatures if we consider only the enzymatic activities of t-Hex, GLA and b-gal. The correlation study of samples of DBS of 1.2 mm and 3 mm in diameter for the enzyme GLA, ASB and GAA resulted in the coefficients 0.994, 0.900 and 0.957, respectively. This shows that we can decrease the paper punch without losing the quality of the test. Finally we performed a screening for Pompe disease, Fabry disease, Mucopolysaccharidosis I and VI in 205 samples of DBS of high-risk patients. This screening revealed a frequency of 2.9% of these LSD after using the methodology researched. Our results demonstrated the feasibility for measurement of enzymatic activity in DBS, which facilitates the collection, sending and storage of samples for the screening of these lysosomal disorders.