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Diapriinae (Hymenoptera, Diapriidae) da estação ecológica de Jatí, no município de Luiz Antônio /Oliveira, Ana Lígia Santos de. January 2014 (has links)
Orientador: Nilza Maria Martinelli / Coorientador: Nelson Wanderley Perioto / Banca: Sérgio Antônio De Bortoli / Banca: Juliano Fiorelini Nunes / Resumo: Diapriidae é cosmopolita e composta por cerca de 200 gêneros e duas mil espécies distribuídas por três subfamílias: Diapriinae, Belytinae e Ambositrinae. Para o Brasil são relatados cerca de 30 gêneros e 80 espécies. Diapriinae agrupa 50 gêneros distribuídos em três tribos: Psilini, Spilomicrini e Diapriini. Este estudo teve como objetivo identificar os Diapriinae coletados em áreas de Cerrado, Cerradão e Mata Ciliar na Estação Ecológica de Jataí (EEJ), em Luiz Antônio, SP, Brasil; As amostragens foram realizadas na EEJ com armadilhas Malaise e Moericke, durante dezembro de 2006 a novembro de 2009. o material biológico coletado foi encaminhado ao Laboratório de Sistemática e Bioecologia de Parasitoides e Predadores (LSBPP) da APTA, em Ribeirão Preto, SP triados e identificados com o auxilio de Masner e Garcia (2002). Foram obtidos 2610 (1621 fêmeas/62,1% e 989 machos/37,9%) exemplares de Diapriinae de 20 gêneros, dentre os quais 634 exemplares de Doliopria Kieffer (24,29% do total coletado), 492 de Coptera Say (18,85%), 323 de Trichopria Ashmead (12,38%), 306 de Idiotypa Förster (11,72%), 297 de Acanthopria Ashmead (11,38%), 281 de Basalys Westwood (10,77%), 192 de Spilomicrus Westwood (7,36%), 19 de Leucopria Masner & Garcia (0,73%), 18 de Entomacis Förster (0,69%), 11 de Szelenyiopria Fabritius (0,42%), dez de Monelata Förster (0,38%), oito de Megaplastopria Ashmead (0,31%), cinco de Ortona Masner & Garcia (0,19%), três de Caecopria Masner e de Pentapria Kieffer (0,11% cada), dois de Mimopria Holmgren, de Omopria Masner & Garcia e de Paramesius Westwood (0,08% cada) e um de Labidopria Wasmann e de Mimopriella Masner & Garcia (0,04% cada). As armadilhas Malaise capturaram 1378 espécimes de Diapriinae (52,8% do total coletado), resultado que diferiu estatisticamente (p< 0,0001) dos observados com as armadilhas Moericke 1232 (47,2%). A maior quantidade de ... / Abstract: Diapriidae is cosmopolitan, include about 200 genera e 2000 species described in three subfamilies: Diapriinae, Belytinae e Ambositrinae. To Brazil are described about 30 genera e 80 species. Diapriinae get into 50 genera in three tribes: Psilini, Spilomicrini e Diapriini. This research aimed to study the Diapriinae of Brazilian savannah, riparian vegetation and savannah woodland vegetation from Estação Ecológica de Jataí (EEJ), Luis Antonio municipality, at São Paulo State, Brazil; In each ambient, the samples were taken with two Malaise traps (Townes 1972) and two sets of five yellow pan traps, between December 2006 and November 2009, the biological material was sent to the Laboratório de Sistemática e Bioecologia de Parasitoides e Predadores (LSBPP) da APTA, Ribeirão Preto, SP, where were identified the subfamilies and genera of Diapriidae through the identification keys proposed by Masner e Garcia (2002). Were collected 2610 (1621 female /62,1% e 989 male /37,9%) of Diapriinae of 20 genera, among which 634 of Doliopria Kieffer (24,29% of the total collected), 492 Coptera Say (18,85%), 323 Trichopria Ashmead (12,38%), 306 Idiotypa Förster (11,72%), 297 Acanthopria Ashmead (11,38%), 281 Basalys Westwood (10,77%), 192 Spilomicrus Westwood (7,36%), 19 Leucopria Masner & Garcia (0,73%), 18 Entomacis Förster (0,69%), 11 Szelenyiopria Fabritius (0,42%), 10 Monelata Förster (0,38%), 8 Megaplastopria Ashmead (0,31%), 5 Ortona Masner & Garcia (0,19%), 3 Caecopria Masner and Pentapria Kieffer (0,11% each), 2 Mimopria Holmgren, 2 Omopria Masner & Garcia and 2 Paramesius Westwood (0,08% each) and 1 Labidopria Wasmann and 1 Mimopriella Masner & Garcia (0,04% each). The Malaise trap captured 1378 of Diapriinae (52,8% of the total collected), result that was statistically different (p< 0,0001) of the observed with yellow pan traps 1232 (47,2%). The largest amount of Diapriinae was ... / Mestre
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Desenvolvimento de um método de classificação taxonômica de dados de metagenomasPilan, José Rafael January 2017 (has links)
Orientador: José Luiz Rybarczyk Filho / Resumo: Na análise de dados metagenômicos temos duas perguntas básicas que podemos fazer: “Quem são?” e “O que estão fazendo?” os microorganismos de uma determinada amostra. Para responder a primeira pergunta utiliza-se a análise taxonômica de microorganismos. Existem diversos software que utilizam diferentes metodologias para atingir essa finalidade. Esses métodos são divididos em duas categorias principais: composicional e alinhamento por similaridade. O que diferencia os métodos são principalmente o tempo para ser realizada a análise, poder computacional e eficiência na identificação dos reads. Nesse trabalho propomos um novo método por composição que utiliza cinco assinaturas genômicas e suas combinações para identificação dos reads: concentração de GC (Guanina/Citocina), entropia de dipletes, entropia de tripletes, entropia de tetrapletes e abundância total de dinucleotı́deos. Utilizamos um conjunto de dados referente a 3055 genomas completos de bactérias provenientes do NCBI (National Center for Biotechnology Information)que foram fragmentados em dois grupos: teste e controle. Os grupos foram fragmentados em tamanhos de 50-1000pb com partições de tamanho 50pb, buscando se aproximar dos tamanhos de reads normalmente gerados pelos equipamentos de sequenciamento de nova geração. O desempenho da metologia foi avaliado por medidas de sensibilidade, especificidade, precisão e média harmônica em comparação aos resultados do grupo teste com o grupo controle. Dentre as combinações anal... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre
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Estudo taxonômico e filogenético de Mezilaurus Taub. (Lauraceae) lato sensu com restabelecimento de Clinostemon Kuhlm. & A. Samp. / Taxonomic and phylogenetic study of Mezilaurus Taub. (Lauraceae) lato sensu and reinstatement of Clinostemon Kuhlm. & A.SampAlves, Flávio Macêdo 23 September 2011 (has links)
Este trabalho teve como objetivo testar o monofiletismo de Mezilaurus e a relação deste com os gêneros do \"grupo Mezilaurus\" (sensu Rohwer & Rudolph 2005), incluindo um número maior de táxons do que os tratamentos anteriores, além de revisar os limites morfológicos entre as espécies deste gênero. O \"grupo Mezilaurus\" (sensu Rohwer & Rudolph 2005), emergiu em filogenias prévias como monofilético, composto pelos gêneros Anaueria, Chlorocardium, Mezilaurus, Sextonia e Williamodendron. O trabalho baseou-se em sequências dos marcadores moleculares trnH-psbA e ITS de nove espécies de Mezilaurus e 15 espécies de grupos-externos. Análises de Parcimônia e Bayesiana foram empregadas com os marcadores separadamente e combinados. Os resultados obtidos demonstraram o \"grupo Mezilaurus\" como não monofilético e posicionamento incerto de Chlorocardium e Anaueria. Os Mezilauroides (sensu Rohwer & Rudolph 2005), com Mezilaurus, Sextonia e Williamodendron emergiu como monofilético, entretanto, o gênero Mezilaurus, atualmente circunscrito, não é monofilético e, uma de suas espécies, M. mahuba, surgiu como grupo-irmão de Sextonia. Por essa razão, a espécie foi removida de Mezilaurus e restabelecida como Clinostemon. Com base nessa nova circunscrição, foram realizadas as revisões taxonômicas de Mezilaurus e Clinostemon, baseadas em coleta de material botânico em expedições de campo e análises de aproximadamente 550 espécimes de exsicatas, oriundas de cerca de 60 herbários. Mezilaurus (15 espécies) e Clinostemon (1 espécie) compartilham folhas congestas no ápice dos ramos, produto de seu crescimento rítmico apositivo, flores bissexuadas, três estames férteis, representando a terceira série do androceu, anteras biloceladas e fruto com cúpula de pateliforme a plana com tépalas persistentes. Clinostemon, entretanto, apresenta anteras encurvadas e um par de glândulas nos filetes. Foram realizadas sinonimizações, lectotipificações e a descrições de quatro novas espécies de Mezilaurus para a ciência, elaboradas chaves de identificação, descrições morfológicas, além de comentários taxonômicos, fenológicos e de conservação e disponibilizadas ilustrações das espécies dos dois gêneros. / This study aimed to test the monophyletism of Mezilaurus and its relation within the \"Mezilaurus group\" clade (sensu Rohwer & Rudolph 2005), including more taxa than the previous treatments, and to revise the morphological boundaries between the species of the genus. The \"Mezilaurus group\" had emerged as monophyletic in previous phylogenies, with Anaueria, Chlorocardium, Mezilaurus, Sextonia, and Williamodendron. The work was based in the molecular markers trnH-psbA and ITS of nine Mezilaurus species, and 15 species from the outgroup. Parsimony and Bayesian analysis were performed with the markers both separately and combined. The results demonstrate that the \"Mezilaurus group\" is not monophyletic and uncertain position of Chlorocardium and Anaueria. The Mezilauroids, containing Mezilaurus, Sextonia, and Williamodendron, arose as monophyletic, although the Mezilaurus genus, as currently defined, is not monophyletic and M. mahuba emerged as sister of Sextonia. Therefore, it was necessary to remove M. mahuba of its circumscription, and reinstate this species as Clinostemon. Based on this circunscription, were carried out the taxonomic revisions of Mezilaurus and Clinostemon, based on collecting botanical specimens in expeditions, and analisys of 550 specimens of exsiccates from about 60 herbaria. Mezilaurus (15 species) and Clinostemon (1 species) have rythmic branching with distally clustered leaves, bisexual flowers, three fertile stamens, representing the third androecial whorl, 2-locular anthers, fruit with a minute discoid cupule, and persistent tepals. However, Clinostemon has recurved anters and one par of glands at the base of filaments. Synonymizations, lectotypifications, description of four new species of Mezilaurus to science, keys, morphologic descriptions, fenological aspects and conservation, taxonomic commentaries and ilustrations are presented for the two genera.
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Estudos taxonômicos de espécies do gênero Culex (Diptera: Culicidae) da região neotropical, utilizando a subunidade I do gene mitocondrial citocromo oxidase / Taxonomic relationships among neotropical species of genus Culex (Diptera: Culicidae) inferred from Cytochrome C Oxidase I mitochondrial gene sequencesSilva, Bruna Demari e 24 September 2009 (has links)
Diversas espécies de mosquitos do gênero Culex Linnaeus são vetores de nematóides que causam filariose linfática (Wuchereria bancrofti) e de vários arbovírus, incluindo o Vírus do Nilo Ocidental (VNO) que causa encefelites em animais e humanos. Embora seja o maior gênero da família Culicidae, com 763 espécies conhecidas, pouco se sabe sobre a taxonomia e as relações filogenéticas do grupo. Considerando-se a grande diversidade de espécies do gênero Culex, as dificuldades para a identificação morfológica, devidas principalmente ao fato das fêmeas serem morfologicamente muito similares, o presente trabalho teve como objetivos: (1) Solucionar problemas relacionados à nomenclatura; (2) Estimar as relações filogenéticas entre espécies de diferentes subgêneros; (3) Examinar o monofiletismo de subgêneros da Região Neotropical; (4) Estimar as relações evolutivas entre subgêneros neotropicais; (5) Estimar a posição filogenética do gênero Lutzia em relação à Culex; (6) Discutir sobre a utilização do gene citocromo c oxidase da subunidade I (COI) para o gênero Culex. Foram analisadas sequências correspondentes a um fragmento de 478 pares de bases do gene COI de 36 indivíduos pertencentes a 16 espécies do gênero Culex. Foram avaliadas espécies de quatro subgêneros, Culex, Phenacomyia, Melanoconion e Microculex e uma espécie do gênero Lutzia. As sequências do gene COI foram comparadas através das análises de Máxima Parcimônia, Máxima Verossimilhança e Bayesiana. Os resultados das análises das sequências de COI, utilizando ao modelo de Kimura 2-parâmetros, de Culex dolosus, Culex mollis e Culex imitator, demonstram a presença de divergências intraespecíficas altas (3,1%, 2,3% e 3,5%, respectivamente). Os valores do modelo Kimura 2-parâmetros indicam que esses taxa podem representar complexos de espécies. As topologias de MV, MP e Bayesiana mostraram que tanto o gênero Culex como o subgênero Culex são parafiléticos, pois o primeiro não inclui o gênero Lutzia e o segundo exclui o Phenacomyia. Os resultados indicam que Lutzia é subgênero de Culex e Phenacomyia um grupo monofilético do subgênero Culex. O marcador molecular COI foi de fácil utilização e análise, provando ser ferramenta útil para estudos filogenéticos e para a taxonomia molecular de Culex / Species of the genus Culex Linnaeus mosquitoes have been pointed out as the main vectors of lymphatic filariases. Furthermore, they are important vectors of encephalitis across the world, including the West Nile Virus. Although being the major genus in Culicidae family, with 763 valid species, Culex, in a taxonomic and phylogenetic sense, is one of the least known. Considering the great diversity of species of mosquitoes in this genus, and the fact that females of several species are vary similar morphologically, the present study aimed to: (1) Solve problems related to nomenclature (2) estimate the phylogenetic relationships of species used in the work; (3) examine the monophyly of subgenera of the Neotropical Region; (4) estimate the evolutionary relationships between neotropical subgenera; (5) estimate the phylogenetic position of the genus Lutzia in the Culex, (6) discuss the use of the gene cytochrome c oxidase subunit I (COI) to the genus Culex. We analyzed sequences corresponding to a fragment of 478 base pairs of the COI gene of 36 individuals belonging to 16 species of the genus Culex. Species were evaluated in four subgenera, Culex, Phenacomyia, Melanoconion and Microculex and one species of the genus Lutzia. The COI gene sequences were compared using analysis of Maximum Parsimony, Maximum Likelihood and Bayesian. The results of the analysis of the COI sequences, used the model of Kimura 2-parameters of Culex dolosus, Culex mollis and Culex imitator, demonstrate the presence of high intraspecific divergence (3.1%, 2.3% and 3.5% respectively). These values indicate that these taxa may represent complexes of species. The topologies of ML, MP and Bayesian showed that both genus Culex as subgenus Culex are paraphyletic because the first does not include the genus Lutzia and the second excludes the Phenacomyia subgenus. The results indicate that Lutzia is a subgenus of Culex and Phenacomyia is a monophyletic group of subgenus Culex. The molecular marker COI was easy to use and analyzing, proving to be useful tool for phylogenetic studies and the molecular taxonomy of Culex
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Revisão sistemática e análise filogenética de Sadocus Sørensen, 1886 (Opiliones, Gonyleptidae, Pachylinae) / Systematic revision and cladistic analysis of the genus Sadocus Sørensen, 1886 (Opiliones, Gonyleptidae, Pachylinae)Silva, Marília Pessoa 14 December 2016 (has links)
O gênero Sadocus Sørensen, 1886 é revisado pela primeira vez e uma análise cladística foi feita para testar seu monofiletismo e suas relações internas, além disso, a chave de identificação das espécies é apresentada. Uma nova classificação é proposta baseada nos resultados da análise cladística. São reconhecidas cinco espécies válidas das 5 espécies válidas das 14 nominais, sendo quatro sinonímias propostas: Sadocus bicornis (Gervais, 1849) em Sadocus asperatus (Gervais, 1847), S. conspicillatus Roewer, 1913, S. exceptionalis (Mello-Leitão, 1946) e S. guttatus Sørensen, 1902 em S. polyacanthus (Gervais, 1847) e S. calcar (Roewer, 1913) em Gonyleptes horridus Kirby, 1819; duas Species inquerendae: S.allermayeri (Mello-Leitão, 1945) e S. nigronotatus (Mello-Leitão, 1943) e duas transferidas para outros gêneros: Roeweria brasiliensis (Soares & Soares, 1949) e Metagyndes planiceps (Guérin-Méneville, 1838). Além é feita a descrição de Metagyndes sp.n., exemplar usado por Roewer na redescrição da espécie Metagyndes planiceps (Guérin-Méneville, 1838), que se tratava de uma espécie diferente da descrição original. A matriz de dados utilizada na análise cladística possui cinco terminais de Sadocus e mais 15 terminais como grupo externo, compreende 53 caracteres baseados na morfologia masculina, sendo 18 pertencentes a estruturas morfológicas externas presentes no escudo dorsal e tergitos livres, dois pertencentes a quelícera, dois pertencente ao pedipalpo, 20 pertencentes as pernas e 11 pertencentes a genitália. A análise resultou em uma árvore mais parcimoniosa com 195 passos (C.I.= 32; R.I.=45) cuja otimização aplicada foi ACCTRAN. Sadocus constitui um clado monofilético e pectinado, sustentado por duas sinapomorfias: formato gama triangular do escudo dorsal e bula da quelícera lisa / The genus Sadocus Sørensen, 1886 is revised for the first time and a cladistic analysis was performed to test its monophyly and internal relationships, a dicotomous key of species was presented. A new classification based on cladistic analysis is proposed. Five species are considered valid of the 14 nominal species currently recognized, being synonymyzed are, Sadocus bicornis (Gervais, 1849) as Sadocus asperatus (Gervais, 1847), S. conspicillatus Roewer, 1913, S. exceptionalis (Mello-Leitão, 1946) and S. guttatus Sørensen, 1902 as S. polyacanthus (Gervais, 1847), and S. calcar (Roewer, 1913) as Gonyleptes horridus Kirby, 1819; two Species inquerendae: S. allermayeri (Mello-Leitão, 1945) and S. nigronotatus (Mello-Leitão, 1943), and two transferred to other genus: Roeweria brasiliensis (Soares & Soares, 1949) and Metagyndes planiceps (Guérin-Méneville, 1838). The description of Metagyndes sp.n. is made, a specimen that Roewer used for the redescription of the species Metagyndes planiceps (Guérin-Méneville, 1838), it was a different example of the original description. The cladistic analysis was performed with five species of Sadocus and the outgroup is composed of fifteen species. The character matrix comprises 53 morphological characters from males, 18 characters are of external morphological features of the dorsal scute and free tergites, two of the chelicerae, two of the pedipalp, 20 of the legs and 11 of the genitalia. The analysis resulted in one most parsimonious tree with 195 steps (C.I.= 32; R.I=45) and the ACCTRAN optimization was applied. Sadocus is a monophyletic and pectinate group clade, supported for two synapomorphies: the Gamma triangular shape of dorsal scutum and a smooth chelicerae bula
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Sistemática de Syngonanthus / Systematics of SyngonanthusWatanabe, Mauricio Takashi Coutinho 19 June 2015 (has links)
Esta tese consta de três capítulos nos quais são abordados questões relacionadas à sistemática de Syngonanthus (Eriocaulaceae). No primeiro capítulo são apresentadas novidades taxonômicas, com descrições de novas espécies do gênero, incluindo a primeira espécie de flor exclusivamente trímera e bissexual da família. No segundo capítulo, uma análise filogenética com amostragem expandida de Syngonanthus é apresentada, para tentar elucidar questões relacionadas ao posicionamento do gênero em Paepalanthoideae; verificação e sustentação de classificações infragenéricas anteriores; e correlação de grupos bem sustentados com padrões morfológicos. O último capítulo é composto por uma revisão taxonômica de Syngonanthus sect. Carphocephalus, um dos grupos morfologicamente mais complexos no gênero. A revisão constou de um total de 13 espécies, nos quais foram propostos novos sinônimos, lectotipificações e descrição de novos táxons. / This thesis consists of three parts involving systematics of Syngonanthus (Eriocaulaceae). The chapter I consists on taxonomic novelties, with descriptions of new species, including the first species with exclusively trimerous and bisexual flowers in the family. The second chapter is the phylogenetic study of Syngonanthus with expanded sampling This study is an attempt to clarify issues related to the placement of Syngonanthus in Paepalanthoideae; to check the support and previous infrageneric classifications; and to correlate well supported groups with morphological patterns. The chapter three consists on a taxonomic revision of Syngonanthus sect. Carphocephalus, one of the most complex groups in the genus. The revision consisted of a total of 13 species. It has been proposed new synonyms, lectotypifications and description of new taxa.
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Revisão das seções Acarporophytum, Aristata e Macrospora do gênero Batrachospermum (Rhodophyta, Batrachospermales) /Garcia Filho, Auro Silva. January 2014 (has links)
Orientador: Orlando Necchi Junior / Banca: Luis Henrique Branco / Banca: Valéria Cassano / Resumo: As três seções do gênero Batrachospermum - Acarposporophytum (com uma única espécie, B. brasiliense Necchi), Aristata (B. beraense Kumano, B. cayennense Montagne, B. longiarticulatum Necchi e B. turgidum Kumano) e Macrospora (B. equisetifolium Montagne, B. hypogynum Kumano & Ratnasabapathy e B. macrosporum Montagne) têm sido demonstradas como monofiléticas em estudos filogenéticos envolvendo pelo menos um representante de cada seção. As seguintes hipóteses foram testadas: 1) as seções Acarposporophytum, Aristata e Macrospora constituem grupos monofiléticos dentro do gênero Batrachospermum; as seções têm sido demonstradas como monofiléticas em estudos filogenéticos e com a adição de maior número de espécies e populações essa tendência deverá ser confirmada; 2) A maioria das espécies atualmente reconhecidas em cada seção com base em caracteres morfológicos será corroborada pelos dados moleculares. A presente revisão das três seções teve como objetivos: 1) inferir as relações filogenéticas, bem como os limites de variação intraespecíficas, das espécies dentro e entre as seções, bem como com outras seções do gênero, foram utilizados os caracteres morfológicos diagnósticos atualmente aceitos e três marcadores moleculares - rbcL, gene plastidial que codifica a subunidade grande da RUBISCO; região de "barcode" do gene mitocondrial cox1, que codifica a subunidade 1 da enzima citocromo c oxidase; e UPA - gene plastidial "universal plastid amplicon"; 2) elaborar estudo de revisão para as três seções por meio da realização dos caracteres taxonômicos diagnósticos para espécies desses grupos, à luz dos novos dados moleculares. Foram analisadas 19 amostras provenientes das regiões sudeste, centro-oeste, norte e nordeste do Brasil, além dos espécimes-tipo de cada seção e sequências disponíveis no "GenBank" para cada um dos marcadores utilizados. Os caracteres diagnósticos para o... / Abstract: he three sections of the genus Batrachospermum - Acarposporophytum (with the single species B. brasiliense Necchi), Aristata (B. beraense Kumano, B. cayennense Montagne, B. longiarticulatum Necchi and B. turgidum Kumano) and Macrospora (B. equisetifolium Montagne, B. hypogynum Kumano & Ratnasabapathy and B. macrosporum Montagne) - have been shown to be monophyletic in phylogenetic studies involving at least one member of each section. The following hypotheses were tested: 1) the sections Acarposporophytum, Aristata and Macrospora represent monophyletic groups within the genus Batrachospermum; the sections have been shown to be monophyletic and closely related in previous studies and with the addition of more species and populations this trend will be confirmed; 2) most species currently recognized in each section on the basis of morphological characters will be corroborated by molecular data. This revision of the three sections has the following aims: 1) to infere phylogenetic relationships and the intra-specific limits of variation of the species within and between sections, as well as with the other sections of the genus; the investigation used the morphological diagnostic characters currently applied and three molecular markers - rbcL, the plastidial gene encoding the large sub-unit of RUBISCO; the barcode region of the mithocondrial gene cox1, encoding sub-unit 1 of cythochorme c oxidase; and UPA, plastidial universal plastid amplicon; 2) to carry out a revisional study of the three sections by means of the reevaluation of taxonomic diagnostic characters for species within these groups, in the light of new molecular data. Nineteen new samples were analysed from the southeast, mid-west, north and northeast regions of Brazil, as well as the type specimens of each species and the sequences available in GenBank for each molecular marker. The diagnostic characters for section circumscription and species identification within the sections... / Mestre
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Filogenia e sistemática de Schinus L. (Anacardiaceae), com revisão de um clado endêmico das matas nebulares andinas / Phylogeny and systematics of Schinus L. (Anacardiaceae), with revision of a clade endemic to the Andean cloud forestsLuz, Cintia Luiza da Silva 03 July 2017 (has links)
Pouca atenção tem sido direcionada para Schinus L., gênero americano conhecido sobretudo pelas suas espécies cultivadas e invasoras. Na América do Sul Austral é o gênero da família Anacardiaceae com maior riqueza específica, constituído por cerca de 42 espécies distribuídas em ampla diversidade de habitats, principalmente os áridos ou semi-áridos, estendendo-se também às florestas nebulares dos Andes e do domínio da Mata Atlântica. A mais completa revisão do gênero foi realizada por Fred Alexander Barkley, botânico norte-americano, em 1957, que reconheceu dois subgêneros, S. subg. Schinus e S. subg. Duvaua, sendo o último subdividido em duas seções. Estudos subsequentes indicaram inconsistências morfológicas na circunscrição dessas categorias infragenéricas e a delimitação de várias espécies ainda é complicada. Até o momento, Schinus foi pouco amostrado nos estudos filogenéticos da família, uma vez que não constituía o grupo alvo desses estudos e, por isso, as hipóteses sobre a monofilia do gênero e o entendimento das relações entre suas espécies ainda é muito limitado. Nesse contexto, esta tese teve como objetivos principais testar a monofilia de Schinus e das categorias infragenéricas e investigar as relações filogenéticas no gênero. No primeiro capítulo, apresentamos a filogenia de Schinus baseada em sequências de DNA de 11 marcadores, sendo nove nucleares e dois plastidiais. A amostragem baseou-se na última revisão taxonômica do gênero e incluiu 47 táxons de Schinus, além de 48 espécimes de gêneros de Anacardiaceae proximamente relacionados a esse gênero. Foram realizadas análises filogenéticas individuais e combinadas utilizando inferências Bayesiana, máxima parcimônia e de máxima verossimilhança. Elaboramos uma matriz morfológica, incluindo caracteres vegetativos anatômicos, baseada na análise de materiais herborizados e fixados provenientes de coletas a campo estrategicamente realizadas em pontos selecionados da ampla distribuição do grupo focal, para obtenção de amostras de todos os táxons conhecidos de Schinus. A reconstrução de estados ancestrais de vários caracteres morfológicos foi realizada pelo critério de parcimômia, utilizando como base a árvore filogenética proveniente da análise combinada Bayesiana. Essa reconstrução morfológica teve como principais objetivos: 1. buscar um entendimento mais amplo sobre as relações interespecíficas em Schinus e entre gêneros proximamente relacionados, 2 identificar caracteres morfológicos e possíveis sinapormofias dos principais clados, e 3. discutir as hipóteses sobre a evolução de caracteres estruturais em Schinus. As análises filogenéticas demonstraram que Schinus é um gênero monofilético fortemente sustentado, no entanto, as categorias infragenéricas S. subg. Duvaua sect. Duvaua and S. subg. Duvaua sect. Pseudoduvaua emergiram polifiléticas, sendo homoplásticos os caracteres tradicionalmente utilizados na sua circunscrição. Os resultados evidenciaram oito principais linhagens fortemente sustentadas em Schinus, sendo que as espécies de folhas compostas (pinadas) constituem as três primeiras linhagens a divergirem, formando um grado, e as espécies de folhas simples emergem agrupadas em um grande clado bem sustentado, o qual apresenta cinco linhagens principais, também com boa sustentação. No entanto, as relações interespecíficas dentro de alguns clados permanece pouco resolvida. As reconstruções de estados ancestrais demonstram que alguns atributos morfológicos e anatômicos foliares são relevantes na caracterização e possivelmente sinapomorfias de algumas linhagens. No entanto, a maioria dos caracteres, principalmente os tradicionalmente empregados nas circunscrição de grupos em Schinus, demonstram um nível alto de homoplasia. De acordo com as novas evidências provenientes desse estudo, apresentamos no primeiro capítulo uma nova classificação seccional em Schinus, assim como chave de identificação para as oito seções, lista de espécies compondo cada seção, além de comentários taxonômicos, de distribuição geográfica e sobre ecologia. As seções propostas nesse estudo podem ser caracterizadas pela combinação de um conjunto de caracteres morfológicos associados à distribuição geográfica, uma vez que elas correspondem a linhagens alopátricas ou ecologicamente distintas. O estudo filogenético constitui a primeira fase de uma série de estudos sistemáticos que estão planejados e visam realizar o tratamento taxonômico de todas as seções de Schinus. Por isso, no segundo capítulo desta tese apresentamos a revisão taxonômica de S. sect. Myrtifolia, um clado notável de espécies de folhas simples que podem alcançar as mais elevadas altitudes dentre as espécies de Anacardiaceae (até 3900 m de altitude). Os 11 táxons que compõem essa seção são em sua maioria endêmicos das Yungas e florestas Tucumano-Bolivianas, e outras duas espécies também ocorrem em áreas de pre-Puna, Puna e nos vales secos interandinos da Argentina, Bolivia e Peru. Apesar das reconstruções morfológicas demonstrarem que a maioria dos caracteres morfológicos apresentam um elevado grau de homoplasia, o que torna difícil a diagnose dos principais clados, S. sect. Myrtifolia é a única seção que apresenta flores tetrâmeras e frutos lateralmente achatados, atributos incomuns e, portanto, aqui apontados como possíveis sinapormofias deste clado. Suas espécies foram reconhecidas anteriormente em S. subg. Duvaua sect. Pseudoduvaua, exceto por S. microphylla, a qual foi reconhecida como membro de S. subg. Duvaua sect. Duvaua. Problemas de delimitação específica existentes em S. sect. Myrtifolia têm sido negligenciados, uma vez que a maioria dos estudos taxonômicos no gênero frequentemente têm se limitado a destacar as dificuldades taxonômicas em S. subg. Duvaua sect. Duvaua. O presente estudo morfológico evidencia um número significante de problemas de circunscrição taxonômica, principalmente entre S. andina e S. myrtifolia. As análises morfológicas detalhadas de um considerável número de exsicatas mostraram quatro novas espécies, as quais são descritas neste trabalho. Apresentamos chave de identificação para as espécies, descrições morfológicas, sinonímia, tipos nomenclaturais, incluindo três lectotipificações, duas combinações novas, ilustrações, mapas de distribuição e avaliação do estado de conservação de todas as espécies. As novidades taxonômicas apresentadas aqui, referentes às espécies de S. sect. Myritfolia, representam uma tentativa de demonstrar a complexidade morfológica e evidenciar problemas de identificação de espécies levando em consideração uma amostragem grande e revisão nomenclatural cuidadosa. Dessa forma, esperamos destacar a gama de variação morfológica, principalmente entre S. andina e S. myrtifolia, táxons pouco estudados até o momento. Em suma, o estudo filogenético de Schinus, realizado pela primeira vez com uma amostragem abrangente de todas as linhagens componentes do gênero, oferece oportunidades para novos estudos taxonômicos, evolutivos e biogeográficos no gênero. Em particular, análises biogeográficas associadas à diversificação desse gênero e táxons relacionados de Anacardiaceae parecem muito promissoras para ampliar o conhecimento sobre a história das formações vegetacionais da América do Sul Austral / Schinus, a genus best known by its few cultivated and invasive species, is the largest genus of Anacardiaceae in southern South America. It is remarkably diverse compared to closely related genera, with approximately 42 species, most of which occur in several arid vegetation types and extending into Andean and Atlantic moist forests. The most comprehensive taxonomic revision of the genus dates to 1957, which recognized S. subg. Schinus and S. subg. Duvaua, the latter of which was further divided into two sections. Subsequent studies have highlighted morphological inconsistencies in this infrageneric classification, and species delimitation remains a challenge. Schinus has been poorly sampled in previous phylogenetic studies of Anacardiaceae, and thus any assumptions about its monophyly and relationships (particularly among its species and infrageneric categories) remain untested. This thesis aimed to test the monophyly of Schinus and its infrageneric circumscriptions, and also investigate the phylogenetic relationships. In the first chapter, we present the phylogenetic relationships of all Schinus species using nine nuclear and two plastid DNA sequence regions, most of them developed recently for Commiphora (Burseraceae). The maximum parsimony, maximum likelihood, and Bayesian inference included 47 taxa based on the latest taxonomic revision of the genus, and 48 specimens of Anacardiaceae genera closely related to Schinus. We also constructed a morphological dataset, including vegetative anatomical features, based on analysis of herbarium specimens and fresh material obtained through fieldwork, and compared these characters to hypotheses based on molecular evidence in order to: 1. achieve a better understanding of the relationships among its species and to related genera, 2. identify morphological characters and putative synapomorphies for major clades, and 3. discuss hypotheses regarding the evolution of structural traits in the group. Our analyses strongly support the monophyly of Schinus, but also indicate that its infrageneric groups S. subg. Duvaua sect. Duvaua and S. subg. Duvaua sect. Pseudoduvaua are polyphyletic and have been defined using homoplastic characters. The phylogenetic relationships that emerged from our analyses include eight strongly supported lineages (except for S. sect. Atlantica), in which compound-leaved taxa were the earliest diverging lineages, forming a grade of three strongly supported clades, and the largest Schinus clade consists of simple-leaved species, and has five well-supported main lineages. However the relationships among closely related species remain unclear in some clades. Ancestral state reconstructions demonstrate that some morphological and leaf-anatomical characters are valuable in characterizing some lineages, and may serve as potential synapomorphies to define these clades. By contrast, most of the traits that have traditionally been used to circumscribe groups in Schinus show high levels of homoplasy. In light of these results, we present in the first chapter a novel sectional classification of Schinus, an identification key for the sections and comments on the taxonomy, geographic distribution and ecology. The eight monophyletic sections proposed here are recognized by a combination of character states associated with geographic distribution, corresponding to lineages that are mostly allopatric or at least ecologically distinct. This study is the first phase of a long-term effort to produce systematics studies and taxonomic review for all species of Schinus. In this way, we present in the second chapter the taxonomic revision of S. sect. Myrtifolia, a remarkable simple-leaved clade in which species reach the highest elevations within Anacardiaceae (up to 3,900 m altitude). The 11 species of this section are mostly endemic of Yungas and Tucumán-Bolivian forests, and two species also occur in pre-Puna, Puna and dry inter-Andean valleys from Argentina, Bolivia and Peru. The fact that most of the morphological traits present high levels of homoplasy, the diagnosis of the main clades within Schinus is a challenge, except for S. sect. Myrtifolia whose species have tetramerous flowers and fruits laterally compressed, unusual character states that seem to be putative synapomorphies of this section. Its members were previously placed in S. subg. Duvaua sect. Pseudoduvaua, except for S. microphylla, a species recognized as belonging to S. subg. Duvaua sect. Duvaua. Delimitation issues have been neglected in species of this section, since most studies have focused on taxa belonging to S. subg. Duvaua sect. Duvaua. The present morphological study reveals a significant number of taxonomic circumscription problems, especially between S. andina and S. myrtifolia. Detailed morphological analyses of numerous exsiccatae reveals four new species which are described herein. We provide identification key, descriptions, synonyms, nomenclatural types, including three designations of lectotypes, two new combinations, illustrations, distribution maps, and comments on nomenclatural, distribution and preliminary conservation assessments of all species. The taxonomic novelties here presented in Schinus sect. Myrtifolia contribute to disentangle the complexity of the group and its misidentified species, taking into account the morphological traits of a virtually complete sampling and a careful nomenclatural revision. In this way we hope to have evaluated all range of morphological variation, especially within S. andina and S. myrtifolia, which has been overlooked until now. In summary the phylogenetic study of Schinus provided here including a much broader sampling of all lineages in the genus, offers opportunities for further taxonomic, evolutionary and biogeographical studies in Schinus. The biogeographical investigations associated with the diversification of Schinus and closely related taxa from Anacardiaceae seem to be promising and may contribute to new insights into the history of southern South American biota
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Diversidade de ácaros Gamasina (Mesostigmata) edáficos em sistema de plantio direto e sistema de integração lavoura, pecuária e floresta (ILPF) no estado do Mato Grosso /Castro, Matheus Cardoso de. January 2019 (has links)
Orientador: Raphael de Campos Castilho / Resumo: Atualmente há pouco conhecimento sobre o impacto dos sistemas de cultivo sobre a diversidade da fauna edáfica, incluindo dos ácaros predadores Gamasina (Mesostigmata). O primeiro passo para entender a influência das práticas agrícolas na biota do solo é justamente conhecer a diversidade de organismos destes ambientes. Sendo assim, o objetivo desta pesquisa foi conhecer, determinar e comparar a diversidade de ácaros Gamasina (Mesostigmata) edáficos em plantios de soja em sistema de plantio direto e em sistema de cultivo integração lavoura, pecuária e floresta (ILPF), localizados no bioma Cerrado, no estado do Mato Grosso. Amostras de folhedo e solo foram coletadas em cultivos de soja em uma área em sistema de plantio direto com apenas um cultura (SPD) e em uma área área com sistema ILPF, também em plantio direto. Os resultados indicaram que a maior abundância de ácaros foi encontrada em sistema SPD em relação ao sistema ILPF. A maior abundância encontrada nas amostras de solos nos dois sistemas de cultivo foi da família Rhodacaridae, enquanto para as amostras de folhedo foram as famílias Laelapidae e Macrochelidae. Observou-se que o fator floresta do sistema ILPF não apresentou diferencial em relação ao sistema SPD. Tal fato pode ter ocorrido devido as mesmas atividades de tratos culturais ocorrerem em ambas as áreas, além da possibilidade de o tempo de implantação de ILPF ser curto. A espécie Gamasellodes sp. nov. foi encontrada no estudo e descrita, sendo disponibilizada a c... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Currently knowledge about the impact of cropping systems on the diversity of edaphic fauna is incipient, including Gamasina (Mesostigmata) predatory mites. The first step to understand the influence of agricultural practices on soil biota is to know the diversity of organisms in these environments. Thus, the objective of this research was to know, determine and compare the diversity of edaphic Gamasina (Mesostigmata) mites in soybean crops under no-tillage system and in crop, livestock and forest integration system (ILPF), in the Cerrado biome, in the state of Mato Grosso. Litter and soil samples were collected from soybean crops in an area under no-tillage system (SPD) and in an area with ILPF system, also under no-tillage. The results indicated that the higher abundance of mites was found in SPD in relation to ILPF. The highest abundance of edaphic mites found on soil samples in both cropping systems was from the Rhodacaridae family, while the litter samples were the families Laelapidae and Macrochelidae. It was observed that the forest factor of the integrated crop, livestock and forestry system did not differ in relation to the SPD. This fact could have occurred due to the same crops activities occurring in both areas, besides the possibility of the time of implantation of the ILPF system to be short. In addition, a new species has been found. The species Gamasellodes sp. nov was found in the study and described, and the identification key for species in the world of Gama... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Contribución al estudio de los hemípteros (Insecta, Heteroptera, Familia Miridae).Goula, Marta 01 January 1986 (has links)
La presente tesis realiza un estudio en profundidad de la familia Miridae (Insecta, Heteroptera) de las zonas del Montseny, Montserrat y Garraf (Cataluña). Este estudio incluye aspectos morfológicos, biométricos, sistemáticos, faunísticos, biogeográficos y ecológicos. La tesis incluye el catálogo exhaustivo de los "Miridae" de Cataluña, describiendo un total de 120 especies, una de las cuales es nueva para la ciencia.
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