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I. Characterization of Sulfonated Phthalocyanines by Mass Spectrometry. II. Characterization of SIAA, a Streptococcal Heme-Binding Protein Associated with a Heme ABC Transport SystemSook, Brian R 22 April 2008 (has links)
Sulfonated phthalocyanines were characterized using capillary electrophoresis and mass spectrometry. Derivatives investigated included the copper, cobalt, zinc and metal-free sulfonated phthalocyanines. The electropherograms of commercially available copper phthalocyanine-3,4',4'',4'''-tetrasulfonic acid and 4,4',4'',4'''-tetrasulfonic acid were very different, consistent with the latter compound having a structure that is not fully sulfonated. Matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) and electrospray ionization (ESI) were used to characterize the sulfonated phthalocyanines. Mass spectral evidence was obtained for a pentasulfonated species of both the metal-free phthalocyanine and zinc phthalocyanine when these species were made by sulfonation of the metal-free phthalocyanine (followed by zinc insertion in the latter case). Many pathogenic bacteria require heme and obtain it from their environment. Heme transverses the cytoplasmic membrane via an ATP binding cassette (ABC) pathway. Although a number of heme ABC transport systems have been described in pathogenic bacteria, there is as yet little biophysical characterization of the proteins in these systems. The sia (hts) gene cluster encodes a heme ABC transporter in the Gram positive Streptococcus pyogenes. The heme binding protein (HBP) of this transporter is SiaA (HtsA). Several biophysical techniques were used to determine the coordination state, and spin state of both the ferric and ferrous forms of this protein. Identifiers from these techniques suggested that the heme is six-coordinate and low spin in both oxidation states of the protein, with methionine and histidine as axial ligands. The pKa of SiaA was determined, as were the reductive and oxidative midpoint potentials. Guanidinium titration studies of wild-type SiaA showed that the ferric state is less stable than the ferrous state. Free energy of unfolding values [ÄG(H2O)] for the oxidized and reduced proteins were 7.3 ± 0.8 and 16.0 ± 3.6 kcal mol−1, respectively. Denaturation of the histidine mutant H229A was not able to be followed via absorbance spectrometry, possibly due to the large amount of apoprotein present or to non-specific binding of the heme in the binding pocket. The biophysical characterization described herein will significantly advance our understanding of structure-function relationships in HBP.
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Contaminant fate and transport analysis in soil-plant systemsGoktas, Recep Kaya 20 January 2011 (has links)
The main objective of this study is to develop a modeling methodology that facilitates incorporating the plant pathway into environmental contamination models recognizing the fact that plants are dynamic entities that regulate their life cycle according to natural and anthropogenic environmental conditions.
A modeling framework that incorporates the plant pathway into an integrated water flow and contaminant transport model in terrestrial systems is developed. The modeling framework is aimed to provide a tool to analyze the plant pathway of exposure to contaminants. The model developed using this framework describes the temporal and spatial variation of the contaminant concentration within the plant as it is interacting with the soil and the atmosphere.
The first part of the study focuses on the integration of the dynamics of water and contaminant distribution and plant related processes within the vadose zone. A soil-plant system model is developed by coupling soil-water flow, contaminant transport, plant life-cycle, and plant pathway models. The outcome unifies single media continuous models with multimedia compartmental models in a flexible framework. The coupling of the models was established at multiple interfaces and at different levels of solution steps (i.e. model development phase vs. numerical solution phase).
In the second part of the study, the soil-plant system model is extended to cover large spatial areas by describing the environmental system as a collection of soil-plant systems connected through overland flow and transport processes on the ground surface and through lateral interactions in the subsurface. An overland flow model is integrated with the previously coupled model of unsaturated zone soil-water flow and plant life-cycle by solving the flow model equations simultaneously within a single global matrix structure. An overland / subsurface interaction algorithm is developed to handle the ground surface conditions. The simultaneous solution, single-matrix approach is also adopted when integrating the overland transport model with the previously coupled models of vadose zone transport and plant pathway.
The model developed is applied to various environmental contamination scenarios where the effect of the presence of plants on the contaminant migration within environmental systems is investigated.
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Diurnal Trends in Water Status, Transpiration, and Photosynthesis of SaltcedarWilliams, Mary Ellen, Anderson, Jay E. 16 April 1977 (has links)
From the Proceedings of the 1977 Meetings of the Arizona Section - American Water Resources Assn. and the Hydrology Section - Arizona Academy of Science - April 15-16, 1977, Las Vegas, Nevada / Relative water content (RWC), water potential (P), and gas exchange were measured on saltcedar at the Bernardo, New Mexico, lysimeter site. RWC and s were closely correlated; but, water potential measurements, taken with a pressure bomb, were more convenient and reliable. RWC and r decreased sharply from sunup until about 0900, when minimum values of about -26 bars T or 80% RWC were reached. Water status then remained constant or improved slightly through late afternoon. Transpiration rates typically remained high until about noon and then began a steady, gradual decrease that continued throughout the afternoon. The data suggest that water stress may be a factor in initiating stomatal closure; however, transpiration continued to decline despite a constant or improved leaf water status. Maximum net photosynthetic rates occurred by 0900, and depressions throughout the remainder of the day were largely accounted for by increased leaf temperatures. Afternoon depressions in transpiration and photosynthesis occurred in twigs held at constant temperature and relative humidity, suggesting that a diurnal rhythm may be involved in control of gas exchange. Water status of plants growing on the lysimeters was comparable to that of plants in adjacent natural stands; gas exchange rates were slightly higher for the lysimeter-grown plants.
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OCT1-mediated cellular drug uptake and interactions between drug transport and drug metabolism / OCT1-mediated cellular drug uptake and interactions between drug transport and drug metabolismSaadatmand, Ali Reza 25 October 2012 (has links)
No description available.
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The effect of grassland botanical composition and (co-) grazing cattle and sheep on herbage production and sward nutrient utilisation / Der Effekt von botanischer Grasland-Zusammensetzung und (gemeinsam) grasenden Rindern und Schafen auf Futterproduktion und Nährstoffnutzung der GrasnarbeSeither, Melanie 11 July 2011 (has links)
No description available.
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Effects of tree species composition on fine root biomass and dynamics in the rhizosphere of deciduous tree stands in the Hainich National Park (Thuringia) / Effects of tree species composition on fine root biomass and dynamics in the rhizosphere of deciduous tree stands in the Hainich National Park (Thuringia)Jacob, Andreas 21 November 2012 (has links)
No description available.
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Präradiotherapeutische Dosimetrie mittels einer einzigen Uptake-Messung / Dose planning of radioiodine therapy by a single uptake measurement of benign thyroidal diseaseAppold, Ulrike 11 March 2014 (has links)
Vor jeder Radioiodtherapie (RIT) sowohl bei Patienten mit einer funktionell relevanten Schilddrüsenautonomie als auch bei Patienten mit einem Morbus Basedow schreibt der Gesetzgeber in Deutschland eine individuelle Dosimetrie zu Vermeidung einer unnötigen Strahlenbelastung vor. Das Ziel des Radioiodtests ist es, eine möglichst genaue Vorhersage der individuellen Radioiodkinetik zu treffen.
Ziel dieser Arbeit war es neben der theoretischen Begründung und Beschreibung der 1-Punkt-Messung, den Nachweis der Machbarkeit und Effektivität dieses neuen dosimetrischen Ansatzes im klinischen Kontext zu führen. In einem weiteren Schritt wurden die klinischen Ergebnisse der hier ausgewerteten Patienten mit publizierten Daten verglichen. Desweiteren wurden Einflussfaktoren auf den Erfolg bzw. Misserfolg der RIT evaluiert.
Dieser neue dosimetrische Ansatz nach Prof. Luig verwendet eine späte Uptake-Messung nach 7 Tage und geht von einem krankheitsspezifischen Erreichen der Aktivitätsmaxima in der Schilddrüse aus.
In dieser retrospektiven Auswertung wurde die Daten von 169 Patienten ausgewertet, die im Zeitraum von April 2006 bis Dezember 2008 in der Nuklearmedizin der UMG aufgrund einer funktionellen Autonomie oder einer Immunogenen Hyperthyreose einer präradioiodtherapeutischen Dosimetrie mittels einer einzigen Uptake-Messung unterzogen wurden. Die Erfolgsrate nach einmaliger RIT lag bei Patienten mit einer Autonomie bei 92,2% und bei Patienten mit einem Morbus Basedow bei 85,7%. Als statistisch signifikanter Einflussfaktor für den Misserfolg einer RIT zeigte sich bei beiden Krankheitsbildern ein erhöhter Technetiumsuppressionsuptake (TcTUs).
Zusammenfassend liegt der Vorteil 1-Punkt-Messung beim Radioiodtest in der guten Durchführbarkeit und vor allem in seiner klinischen Effizienz.
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Photosynthetic capacity and nitrogen nutrition of Ecuadorian montane forest treesWittich, Bärbel 09 April 2013 (has links)
Mit zunehmender Meereshöhe werden die Wachstumsbedingungen in tropischen Bergregionen im Allgemeinen ungünstiger, was sich in einer sinkenden Nährstoffverfügbarkeit, sinkenden Temperaturen und sinkendem CO2-Partialdruck zeigt. In tropischen Bergregenwäldern führen verminderte Abbauraten in größeren Höhen einerseits zu dicken organische Auflageschichten und andererseits in Kombination mit verminderten Mineralisierungs- und Nitrifizierungsraten zu Veränderungen in der Verfügbarkeit der verschiedenen Stickstoffformen, und es gibt Nachweise einer Limitierung der Produktivität dieser Wälder durch Stickstoff. Auf welche Weise sich die Photosynthesekapazität (Amax) tropischer Bäume einerseits und die Stickstoffaufnahmekapazität und Präferenz für einzelne Stickstoffformen andererseits an die veränderten Umweltbedingungen entlang von Höhengradienten adaptieren ist nicht genau bekannt.
Die vorliegende Untersuchung wurde in drei tropischen Bergregenwäldern durchgeführt, die entlang eines Höhengradienten auf 1000, 2000 und 3000 m ü. NN in Südequador liegen. Das Ziel war es, (1) die Photosynthesekapazität ausgewachsener tropischer Bäume entlang eines Höhengradienten mit Hilfe von Gaswechselmessungen zu bestimmen und die Effekte von Temperatur, CO2-Partialdruck und Nährstoffverfügbarkeit auf die Photosynthese zu quantifizieren und (2) Veränderungen in der Verwendung von Nitrat, Ammonium und organischen Stickstoffquellen durch tropische Waldbäume mit der Meereshöhe mittels einer Tracer-Untersuchung mit stabilen Isotopen an Jungpflanzen zu untersuchen.
Mittelwerte der lichtgesättigten Photosyntheserate (Asat) auf Bestandeseben betrugen 8.8, 11.3 und 7.2 µmol CO2 m-2 s-1, die der Dunkelatmung (RD) 0.8, 0.6 und 0.7 µmol CO2 m-2 s-1 jeweils auf 1000, 2000 and 3000 m Meereshöhe, ohne einen signifikanten Höhentrend. Die Einordnung unserer Daten in den Kontext eines pantropischen Asat-Datensatzes von tropischen Bäumen (c. 170 Arten an 18 Standorten unterschiedlicher Meereshöhe) zeigte, dass das flächenbezogene Asat in tropischen Bergen im Mittel 1.3 µmol CO2 m-2 s-1 pro km Höhenzunahme abnimmt (bzw. 0.2 µmol CO2 m-2 s-1 pro K Temperaturabnahme). Die Abnahme von Asat trat auf, obwohl die Blattmasse je Fläche mit der Höhe zunahm. Eine verminderte Photosyntheserate und eine reduzierte Bestandesblattfläche bewirken gemeinsam eine Verringerung der Kohlenstoffaufnahme des Kronenraums mit der Meereshöhe in tropischen Bergregionen.
Der Phosphorgehalt pro Blattmasse war der Faktor, der Amax entlang des Höhengradienten hauptsächlich beeinflusste, während die Effekte von Blattstickstoff, Temperatur und CO2-Partialdruck nicht signifikant waren. Amax erfuhr einen teilweisen und RD einen vollständigen homöostatischen Ausgleich als Reaktion auf die Verminderung von Temperatur und CO2-Partialdruck in größeren Höhen, was hauptsächlich durch eine stark reduzierte spezifische Blattfläche (SLA) und die daraus entstehende Zunahme von Blattstickstoff und -phosphor je Blattfläche bedingt war, während keine Zunahme der Karboxylierungseffizienz festgestellt wurde. Wir schlussfolgern, dass die Verminderung von SLA und Gesamtblattfläche mit der Meereshöhe die Kohlenstoffaufnahme von tropischen Wäldern in großen Meereshöhen deutlich stärker bestimmen als adaptive physiologische Modifizierungen des Photsyntheseapparates.
Jungpflanzen von sechs Baumarten unterschieden sich hinsichtlich ihrer Präferenz für verschieden Stickstoffformen, allerdings schienen weder das Amonium- und Nitratvorkommen im Boden noch die Meereshöhe die Präferenz zu beeinflussen. Zwei Arten (jeweils die, mit den höchsten Wachstumsraten) bevorzugten Amonium gegenüber Nitrat, während die restlichen vier Arten Nitrat und Amonium mit ähnlichen Raten aufnahmen, wenn beide Stickstofformen verfügbar waren. Nach der Gabe von 15N13C-Glyzin zeigte sich bei drei Arten eine signifikante Akkumulierung von 13C in der Biomasse (zwei Arten mit arbuskulären Mykorrhiza und eine Art mit Ektomykorrhiza) zusätzlich zu einer signifikanten Akkumulierung von 15N, was darauf hindeutet, dass Bäume in tropischen Bergregenwäldern organische Stickstoffverbindungen unabhängig vom Typ ihrer Mykorrhizierung aufnehmen können.
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Moisture absorption characteristics and effects on mechanical behaviour of carbon/epoxy composite : application to bonded patch repairs of composite structuresWong, King Jye 18 June 2013 (has links) (PDF)
Le travail présenté dans ce mémoire avait pour objectif d'étudier le processus de la pénétration d'eau dans les composites en carbone/époxyde dans un premier temps, et dans un deuxième temps, d'étudier l'effet de la prise en eau par ces matériaux sur les performances mécaniques des composites et leur joints collés. L'intégration de ces phénomènes physiques dans la modélisation numérique est d'une grande importance dans la prédiction de la durabilité d'une structure en composite subissant un vieillissement hygrothermique. Par conséquent, ce travail consiste non seulement en des observations expérimentales, mais aussi en des simulations numériques. Des corrélations entre les résultats obtenus permettent d'une part de mieux comprendre ce qui se passe dans un système composite avec l'assemblage collé soumis à des charges mécaniques, de l'initiation d'endommagement jusqu'à la rupture finale ; d'autre part, de valider un modèle numérique robuste dans le but de la conception et de l'optimisation. Les originalités de ce travail se situent à différents niveaux en proposant : 1. un nouveau modèle de diffusion à deux-phases permettant de mieux décrire l'effet de l'épaisseur des stratifiés sur la pénétration de l'eau; 2. un nouveau modèle RPM " Residual Property Model " afin de prévoir la dégradation des propriétés mécaniques due à la prise en eau ; 3. une nouvelle loi de traction-séparation linéaire-exponentiel pour décrire la courbe-R observée dans les essais DCB en mode I pur sur les composites stratifiés afin de les intégrer plus facilement dans les modèles numériques
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Methods of condom distribution as a possible barrier to condom uptake : a study among sexually active clients at Settlers Hospital GrahamstownMegafu, Sylvester Onyechi 03 1900 (has links)
Thesis (MPhil (Industrial Psychology. Africa Centre for HIV/AIDS Management))--University of Stellenbosch, 2011. / ENGLISH ABSTRACT: This study examines the methods of condom distribution as a potential barrier to condom uptake among sexually active clients at the out-patient unit of Settlers hospital.
This study was quantitative and it utilised a self-administered questionnaire. A total of 60 sexually active clients comprising of 30 women and 30 men all aged 18 years and above with a prior HIV/AIDS prevention knowledge at the out-patient unit of Settlers hospital formed part of the study. Data was analysed using descriptive analysis and chi square.
The responses given by the participants provide an understanding of the perceptions about the methods of condom distribution as a potential barrier to condom uptake and use. Evidently the methods of condom distribution have an impact on the likelihood of condom uptake at the out-patient unit of Settlers hospital and a certain method of condom distribution (placement of condoms in private spaces) is also preferred to another ( condom display in the waiting area).
Although the study sample (n=60) was too small to make a representative and definite conclusions, the findings seem to suggest the method of condom distribution is important in condom promotion for increased uptake. Despite the high level of HIV/AIDS prevention knowledge among the study participants there seems to be real barriers to condom uptake and use. However there is a need for policy-makers and stake-holders to ensure that effective condom distribution methods are encouraged and implemented. Finally it would be useful to invest further in research to not only identify more barriers to condom uptake at the hospital but also establish barriers to condom uptake and use in the society where our people live. This was beyond the scope of this study. / AFRIKAANSE OPSOMMING: Hierdie studie vors die verspreidingsmetodes na wat die beskikbaarheid van kondome vir seksueel-aktiewe pasiënte van die buitepasiënt-afdeling by die Setlaars-hospitaal op Grahamstad moontlik kan kortwiek.
Die studie was kwantitatief van aard en is deur middel van 'n self-geadministreerde vraelys uitgevoer. Sestig (60) seksueel-aktiewe pasiënte – 30 vroue en 30 mans – van 18 jaar en ouer, by die buitepasiënt-afdeling van bovermelde hospitaal, wat almal voor hulle deelname aan die studie voorkomingskennis van MIV/Vigs opgedoen het, het deel aan die studie gehad. Data is geanaliseer deur gebruikmaking van beskrywende analise en “chi-square.”
Die deelnemers se antwoorde bied begrip oor die persepsies rondom die verspreidingsmetodes as moontlike belemmering vir die beskikbaarheid en gebruik van kondome. Klaarblyklik het die metodes van kondoomverspreiding by die Settlers-hospitaal se buitepasiënt-afdeling 'n impak op die waarskynlike gebruik daarvan. 'n Spesifieke verspreidingsmetode – die plaas van kondome in privaatruimtes – word verkies bo 'n ander waar kondome in die wagarea van die hospital se buitepasiënt-afdeling beskikbaar gestel en as't ware uitgestal word.
Hoewel die studiemonster (n=60) te klein was om verteenwoordigende en klinkklare gevolgtrekkings te formuleer, dui afleidings daarop dat die metode van kondoomverspreiding belangrik is vir die bevordering en bekendstelling van kondoomgebruik. Ondanks die hoë vlak voorkomingskennis oor MIV/Vigs onder deelnemers aan die studie, wil dit voorkom of daar besliste hindernisse bestaan wat betref kondoombeskikbaarheid en –gebruik. En daar is beslis 'n heersende behoefte dat beleidmakers en betrokkenes behoort te verseker dat doeltreffende kondoomverspreidingsmetodes bevorder en toegepas word. Ten slotte kan dit nuttig en raadsaam wees om verder in navorsing te belê, nie alleen om nog hindernisse rondom kondoomgebruik by die bovermelde hospital te identifiseer nie, maar ook maatreëls in plek te stel ter bevordering van kondoombeskikbaarheid en –gebruik in die gemeenskappe waar ons mense hulleself bevind. Laasvermelde was nie binne die raamwerk van hierdie studie nie.
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