Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:31Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-07-14Bitstream added on 2014-06-13T18:07:39Z : No. of bitstreams: 1 pimenta_aa_me_jabo.pdf: 812305 bytes, checksum: 2fd82a6d311a3f9f18b9ce56914d04a5 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais (FAPEMIG) / Avaliou-se características morfológicas, patogênica e molecular de 33 isolados monospóricos de Colletotrichum gloeosporioides, obtidos de tecidos de manga com sintomas de antracnose. Adicionalmente avaliou-se também a sobrevivência do fungo em panículas e sua incidência em frutos coletados de mangueiras de 24 propriedades rurais, de dois tipos de condução: BC (Baixo custo, com até 15 pulverizações anuais de fungicidas) e AC (Alto Custo acima de 15 pulverizações anuais). Com base na morfologia os 33 isolados foram identificados como C. gloeosporioides, com predominância de conídios cilíndricos e/ou obclavados e apressórios lobulados ou fracamente lobulados. O aspecto das colônias variou com o isolado, assim como a velocidade de crescimento, em diferentes temperaturas. Mediante inoculação em folhas de mangueiras das cultivares Tommy Atkins e Espada Vermelha foi verificado que todos os isolados foram patogênicos, com diferenças quanto aos níveis de patogenicidade. A incidência nas áreas de BC variou de 52,2% a 58,5%, enquanto que nas de AC essa o foi de 26,00% a 39,8%. No estudo de sobrevivência, avaliado mediante a determinação da incidência de antracnose em ramos terminais, com e sem panículas, foi verificado que essa se deu na ordem de 3,6% a 10,2%, respectivamente. Mediante estudo molecular, com análise da região ITS1-5.8S-ITS2 amplificada, foi verificado que todos os isolados enquadraram-se na espécie C. gloeosporioides, com 100% de similaridade. / Morphological, pathogenic and molecular characteristics of 33 monosporic isolates of Colletotrichum spp. were evaluated in a greenhouse and laboratory. These were obtained from mango tissues which presented anthracnose symptoms. The fungus survival on panicles and its incidence in fruits on 24 farms were also evaluated under two types of management: LC (Low cost, up to 15 yearly fungicide sprays) and HC (High Cost, over 15 sprays per year). Based on the morphological characteristics, the 33 isolates were identified as C. gloeosporioides, presenting cylindrical and / or obclavated predominant forms of conidia and weak lobulate appressoria. The appearance of the colonies varied based on the isolate and growth rate at different temperatures. Upon inoculation in the cultivars mango leaves, Tommy Atkins and Espada Vermelha found that all isolates were pathogenic, having differences in pathogenicity levels. The incidence of the LC areas ranged from 52.2% to 58.5%, while in the HC was from 26.0% to 39.8%. In the survival study, which was measured by determining the incidence of anthracnose in the terminal branches with and without panicles, the ranges determined were from 3.6% to 10.2%, respectively. By molecular analysis of the ITS1-5.8S-ITS2 amplified region, it was found that all isolates are framed in the species C. gloeosporioides, with 100% similarity.

Made available in DSpace on 2017-07-10T17:40:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_Tese_Agostinho_Zanini.pdf: 1552242 bytes, checksum: 19a3b323f45b864108a7684038f3e39b (MD5) Previous issue date: 2014-08-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The cochineal Dysmicoccus sp. has been observed in the culture of the cassava, Manihot esculenta Crantz, in Central Southern Brazil, and there is no information about its biology, population fluctuation, and behavior in this culture. Thus, the aims of this study were to evaluate the biology and population fluctuation of this insect, as well as to evaluate the biological parameters in several cassava cultivars. Both studies were developed at the Laboratory of Biological Control, at the State University of Marechal Cândido Rondon, under controlled conditions. The population fluctuation was developed in the Experimental Field cultivation areas of the Agronomic Institute of Parana (IAPAR). For the studies performed in the laboratory, nymphs not older than one day were inserted into transparent PVC cages and attached to the tuberous roots. The experimental design was completely randomized, obtaining the average of embryonic, nymphal, pre-ovipositional, ovipositional, and longevity stages, according to which the fertility life chart was determined, in which the Cascuda cultivar was used as a substrate. In order to evaluate the cassava cultivars, this process was performed using the Santa Helena, Baianinha, IAC 90, and Cascuda cultivars. The data was submitted to an analysis of variance, and the averages were compared by means of Tukey s test with a probability 5%. To observe the population fluctuation, the samplings were carried from November, 2011 to November, 2013, cultivated with White Starch, Baianinha and Cascuda, each one cultivated in the space of one hectare. The samplings were performed every fifteen days, and 10 plants were collected randomly, in zigzag, and the cochineals quantified. A graphic descriptive analysis was developed based on the average number of nymphs, adults, as well as egg masses, including the precipitation average (mm) and minimum and maximum temperatures (oC). The results indicated that the female presented three nymphal instars, with a duration of 31.1 days, pre-ovipositional period of 21.2 days, and oviposition of 11.6 days, with a fecundity of 219.9 eggs, fertility 97.8%, and embryonic period of 5.4 days. The male presented four instars with a duration of 33.3 days and winged adult stage with a longevity of 3.5 days. The period to complete a generation was of 55.6 days, the net reproduction rate was of 155.3 times and the necessary time for the population to double was of 7.6 days. There was the occurrence in the development of Dysmicoccus sp. when fed with the cultivar IAC 90, showing variations in the Nymphal and pre-oviposition periods, if compared to the others cultivars. It was verified that the precipitation and temperature influenced the population fluctuation of the cochineal, occurring population growth in the period when the precipitations were low and the temperatures remained high / A cochonilha Dysmicoccus sp. tem sido observada na cultura da mandioca, Manihot esculenta Crantz, na região Centro Sul do Brasil, sobre a qual não se tem informações sobre sua biologia, flutuação populacional e comportamento nesta cultura. Assim, os objetivos deste estudo foram avaliar a biologia e a flutuação populacional deste inseto, bem como, avaliar os parâmetros biológicos em diferentes cultivares de mandioca. Ambos os estudos foram realizados no Laboratório de Controle Biológico da Universidade Estadual de Marechal Cândido Rondon, em condições controladas. A flutuação populacional foi realizada em áreas de plantio do Campo Experimental do Instituto Agronômico do Paraná (IAPAR). Para os estudos realizados no laboratório, ninfas com até um dia de vida foram inseridas em gaiolas de PVC transparente e fixadas nas raízes tuberosas. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado, obtendo-se as médias dos períodos embrionário, ninfal, pré-oviposição, oviposição e longevidade, com os quais se determinou a tabela de vida de fertilidade, sendo utilizado como substrato a cultivar Cascuda. Para a avaliação das cultivares de mandioca este procedimento foi realizado com as cultivares Santa Helena, Baianinha, IAC 90 e Cascuda. Os dados foram submetidos à análise de variância, sendo as médias comparadas pelo teste de Tukey a 5% de probabilidade. Para o acompanhamento da flutuação populacional, as amostragens foram realizadas no período de novembro de 2011 a novembro de 2013, sendo as áreas cultivadas com Fécula branca, Baianinha e Cascuda, com um hectare para cada cultivar. As amostragens foram quinzenais, retirando-se 10 plantas ao acaso, com caminhamento em zigue-zague e as cochonilhas quantificadas. Foi realizada análise gráfica descritiva baseada no número médio de ninfas, adultos e posturas, com as médias de precipitações pluviométricas (mm) e temperaturas máximas e mínimas (°C). Os resultados indicaram que as fêmeas apresentaram três ínstares ninfais, com duração de 31,3 dias, período de pré-oviposição de 21,2 dias e de oviposição 11,6 dias, com fecundidade de 219,9 ovos, fertilidade 97,8% e período embrionário de 5,4 dias. Os machos apresentaram quatro ínstares com duração de 33,3 dias e fase adulta alada com longevidade de 3,5 dias. O tempo para completar uma geração foi de 55,6 dias, a taxa líquida de reprodução foi de 155,3 vezes e o tempo para que a população se duplique foi de 7,6 dias. Ocorreu interferência no desenvolvimento de Dysmicoccus sp. quando alimentada com a cultivar IAC 90 apresentando variações nos períodos ninfal e de pré-oviposição quando comparada às demais cultivares. Verificou-se que a precipitação e temperatura influenciaram na flutuação populacional da cochonilha, ocorrendo aumento da população, no período em que as precipitações foram baixas e quando as temperaturas se mantiveram altas

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:39:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 745259 bytes, checksum: d378fcf86e7bec345e93ab6ddc5b11c8 (MD5) Previous issue date: 2011-07-07 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Wheat (Triticum spp.) is a grass grown and used as an energy source worldwide being cultivated in several regions of Brazil. However, some diseases severity and ineffective chemical control have been threatening Brazilian wheat production. Among the diseases, the blast of wheat caused by the fungus Pyricularia grisea, is gaining a prominent role, being able to reduce crop yields by up to 70%. Chemical control of the disease has been unsatisfactory and there is little information on genetic resistance available in the literature. Resistance is the best way to control diseases by both economically and environmentally advantages. Given these facts, the objective of this study was to evaluate the resistance to blast of wheat genotypes for later use in breeding programs. It was obtained 10 different isolates of the cereal producing regions in Brazil. The isolates were transferred to PDA medium (potato dextrose agar) and after development and cleansing of the colonies were transferred to OA medium (oatmeal and agar) and maintained at a temperature of about 25 ° C and light regime of 12 hours for 10 days for sporulation of the fungus to occur. The concentration of the fungus used in the inoculations was adjusted to 1.2 x 105 spores / mL. In the first experiment, plants were inoculated when they had four leaves. The plants were kept under controlled conditions at 25° C and evaluated seven days after inoculation. Plants were classified according to the type of infection and later was calculated the Resistance Spectrum Relative (RSR) (percentage of isolates that the genotype expressed resistance) and the Disease Index (DI) (resistance of a genotype using all range of types of infection). The DI values were considered different (p≤0,05) if their confidence intervals (95%) did not overlap. Genotypes IVI 04033, VI 07443, VI 07505, IVI 04028, VI 07157, VI 04026, VI 98053 and VI 07160 were susceptible to more than 80% of isolates. Five varieties and four lines had a RSR greater than 50% and DIs smaller than 0.6. Among the lines stood out VI 04098 and VI 07094 with RSR greater than 80%, equating to the variety IPR 85. In the second experiment conducted under field conditions, inoculation was done staggered, according to the cycle of the genotypes, when plants reached the stage of 58-60 in Zadoks scale (1974), being applied 1L of suspension of P. grisea at a concentration of 1.2 x 105/mL per plot. Productivity was assessed by harvesting each plot area (3 m2). Disease incidence was assessed by the percentage of infected spikes and severity was assessed by the percentage of infected spikelets in each spike.The yield ranged from 879 to 3983 kg / ha, the incidence of the disease ranged from 0.86 to 84.24% and the severity ranged from 0.48 to 65.29%. Seven genotypes were classified as MR, three genotypes as MS and nine as S. The highlights were the cultivars CD 116, CD 104, IPR 85 and line VI 07094 with yields exceeding 3000 kg / ha and severity lower than 6%. The three variables yield, incidence and severity showed significant correlation with each other. / O trigo (Triticum spp.) é uma gramínea cultivada e utilizada como fonte de energia no mundo todo, sendo cultivado em várias regiões do Brasil. No entanto, a severidade de algumas doenças e o controle químico ineficaz, vêm ameaçando a triticultura brasileira. Entre as doenças, a brusone do trigo causada pelo fungo Pyricularia grisea, vem ganhando um papel de destaque, podendo reduzir a produtividade das lavouras em até 70%. O controle químico da doença tem sido insatisfatório e existem poucas informações sobre resistência genética disponível na literatura. O uso da resistência é a melhor maneira de controle de doenças, tanto pelas vantagens do ponto de vista econômico, quanto ambiental. Diante desses fatos, o objetivo deste trabalho foi avaliar a resistência de genótipos de trigo à brusone para posterior uso em programas de melhoramento genético. Foram obtidos 10 isolados de diferentes regiões produtoras do cereal no Brasil. Os isolados foram repicados para meio BDA (batata, dextrose e Agar) e após desenvolvimento e purificação das colônias foram transferidos para meio AV (aveia e Agar), sendo mantidos sob temperatura de aproximadamente 25ºC e regime de luz de 12 horas, durante 10 dias, para que ocorresse esporulação do fungo. A concentração do fungo empregada nas inoculações foi ajustada para 1,2 x 105 esporos/mL. No primeiro experimento, as plantas foram inoculadas quando apresentavam quatro folhas. As plantas foram mantidas em condições controladas a 25ºC e avaliadas sete dias após a inoculação. As plantas foram classificadas conforme o tipo de infecção e, posteriormente, foram calculados o Espectro de Resistência Relativo (ERR) (porcentagem de isolados que o genótipo expressou resistência) e o Índice de Doença (ID) (resistência de um genótipo usando toda a gama de tipos de infecção). Os valores de ID foram considerados diferentes (p≤0,05) caso seus intervalos de confianças (95%) não se sobrepusessem. Os genótipos IVI 04033, VI 07443, VI 07505, IVI 04028, VI 07157, VI 04026, VI 98053 e VI 07160 apresentaram suscetibilidade a mais de 80% dos isolados. Cinco cultivares e quatro linhagens apresentaram ERR maior que 50% e IDs menores que 0,6. Dentre as linhagens, destacaram-se VI 04098 e VI 07094 com ERR maiores que 80%, se equiparando a variedade IPR 85. No segundo experimento, conduzido em condições de campo, a inoculação foi feita de forma escalonada, de acordo com o ciclo dos genótipos de trigo, quando as plantas atingiram o estádio 58-60 da escala de Zadoks (1974), sendo aplicado 1L de suspensão de conídios de P. grisea na concentração de 1,2 x 105/mL por parcela. A produtividade foi avaliada pela colheita de cada parcela útil (3 m2). A incidência da doença foi avaliada pela porcentagem de espigas infectadas e a severidade foi avaliada pela porcentagem de espiguetas infectadas em cada espiga. A produtividade variou de 879 a 3983 kg/ha; a incidência da doença variou de 0,86 a 84,24% e a severidade variou de 0,48 a 65,29%. Sete genótipos que foram classificados como MR, três genótipos como MS e nove como S. Destacaram-se as cultivares CD 116, CD 104, IPR 85 e a linhagem VI 07094 com produtividades superiores a 3000 kg/ha e severidades menores que 6%. As três variáveis: incidência, produtividade e severidade, apresentaram correlação significativa entre si.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-12-05T12:55:30Z No. of bitstreams: 1 Matheus Silva e Silva.pdf: 927208 bytes, checksum: b577e7fbf3a3419012f5dc12beda0cda (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-05T12:55:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Matheus Silva e Silva.pdf: 927208 bytes, checksum: b577e7fbf3a3419012f5dc12beda0cda (MD5) Previous issue date: 2015-07-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / One of the most economic importance crops in Brazil, the sugarcane (Saccharum spp.) cultivation is severely affected by several biotic and abiotic factors. Within the biotic one the damage caused by Meloidogyne species points out due to lesions in parasite roots resulting in decreases of productivity. The non-availability of root-knot nematode resistant varieties becomes more serious after reduction in nematicides use, increasing efforts in turn resistant varieties a possible alternative. Therefore, the objectives of the present work was screening promising sugarcane genotypes for M. incognita and M. javanica resistance (Study 1) and determine the resistance mechanisms involved through evaluation of penetration, development and reproduction of the nematodes in the selected material (Study 2), under greenhouse. In Study 1, evaluations were carried out 120 days after inoculation with 9000 eggs per plant and based on host development and nematode reproduction. There was significant difference (P≤0.05) within genotypes for all plant development and nematode reproduction variables. Although all genotypes were susceptible (FR≥1.0) to M. incognita and M. javanica, in some of them the reproductive factor (FR) was lower than the control. In Study 2, five genotypes were inoculated with 20000 eggs per plant and evaluations carried out at 5, 10, 15, 20, 40 and 60 days after inoculation. There was difference in nematode penetration among genotypes, and despite juveniles of both nematode species penetrated all genotypes at five days after inoculation, nematode development significantly differed among clones. At 60, but 45, days after inoculation eggs were evident in the genotypes. Reduced penetration and development rates were demonstrate by the genotypes RB041594 e RB071095. / De relevante importância econômica para o Brasil, o cultivo da cana-de-açúcar (Saccharum spp.) sofre grande influência de diversos fatores bióticos e abióticos. Dentre os bióticos, destacam-se os danos causados por espécies de Meloidogyne, devido às lesões nas raízes parasitadas, resultando em redução de produtividade. A não disponibilidade de variedades resistentes aos nematoides das galhas tornou-se mais séria com a redução do uso de nematicidas, intensificando os esforços para tornar a resistência varietal uma alternativa possível. Dessa forma, o objetivo do presente estudo foi selecionar genótipos RB de cana-de-açúcar promissores para o desenvolvimento de variedades resistentes a M. incognita e M. javanica (Estudo 1) e determinar os mecanismos de resistência envolvidos avaliando-se a penetração, desenvolvimento e reprodução das espécies de nematoides no material selecionado (Estudo 2), em condições de casa de vegetação. No estudo 1, as avaliações foram realizadas 120 dias após a inoculação com 9000 ovos por planta e fundamentaram-se no desenvolvimento do hospedeiro e na reprodução dos nematoides. Houve diferença significativa (P≤0,05) entre os genótipos RB para todas as variáveis de desenvolvimento da planta, e para ambas as espécies de Meloidogyne. Todos os genótipos foram suscetíveis (FR≥1,0) à M. incognita e M. javanica, entretanto, em alguns o fator de reprodução foi inferior ao do tratamento controle. No Estudo 2, cinco genótipos foram inoculados com 20.000 ovos por planta e as avaliações realizadas aos 5, 10, 15, 20, 40 e 60 dias após a inoculação. Houve diferença entre os genótipos avaliados com relação à penetração de juvenis de segundo estádio. Cinco dias após a inoculação foi visualizado juvenis no interior das raízes de todos os tratamentos, mas o desenvolvimento dos nematoides diferiu significativamente entre os clones. Aos 45 dias após a inoculação não foi evidenciada a presença de ovos em nenhum dos genótipos testados, o que só ocorreu aos 60 dias após a inoculação. Reduzidas taxas de penetração e desenvolvimento foram demonstradas pelos genótipos RB 041594 e RB071095.

Made available in DSpace on 2016-01-26T18:56:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Inae Braga.pdf: 459668 bytes, checksum: 71106398a364205dfc2654bc4ad75136 (MD5) Previous issue date: 2013-08-08 / Approximately 80-90% of grassland areas in Brazil consist of the forage Urochloa, genus and the apomictic species Urochloa brizantha [syn. Brachiaria brizantha (Hochst. ex A. Rich.) Stapf.] the most used. Some genotypes of Urochloa have being widely used with a wrong nomenclature, even for species as for cultivars. In this way, the Urochloa cultivar identification is primordial for breeding programs and seed production. Considering the importance of genetic purity in comercialized seed lots, the present study aimed to investigate the potential of ISSR markers for discrimination of U. brizantha (Xaraés; Piatã, Basilisk; MG4; MG5; Marandú) in order to determine the degree of contamination of seed lots. ISSR markers showed a low degree of polymorphism . However, results showed it is possible to identify cultivars in pure samples of seeds Urochloa, requiring only ten primers. The cultivar Basilisk was confirmed as U. brizantha cultivar. It was not possible to differentiate samples intentionally contaminated at levels stipulated in the work. Further studies with other primers and other contamination levels will be important to detect varietal mixtures in cultivars U. brizanhta. / Aproximadamente 80 a 90% das áreas de pastagens no Brasil são constituídas por forrageiras do gênero Urochloa, sendo a espécie apomítica Urochloa brizantha [syn. Brachiaria brizantha (Hochst. ex A. Rich.) Stapf.] a mais utilizada. Alguns genótipos de Urochloa têm sido amplamente distribuídos com a nomenclatura equivocada, tanto para espécies como para cultivares. A identificação dos cultivares de Urochloa é fundamental para os programas de melhoramento e produção de sementes. Considerando a importância da pureza varietal em lotes de sementes comercializadas, o presente trabalho teve o objetivo verificar o potencial dos marcadores ISSR para a discriminação de U. brizantha (Xaraés; Piatã, Basilisk; MG4; MG5; Marandú) com a finalidade de determinar o grau de contaminação de lotes de sementes. Os marcadores ISSR apresentaram um baixo grau de polimorfismo. Todavia, os resultados mostraram ser possível identificar os cultivares em amostras puras de sementes de Urochloa, sendo necessários somente dez primers. O cultivar Basilisk foi confirmado como U. brizantha. Não foi possível diferenciar amostras contaminadas propositalmente nos níveis estipulados no trabalho. Novos estudos com outros primers e outros níveis de contaminação serão importantes para detectar misturas varietais em cultivares de U.brizantha.

Made available in DSpace on 2016-07-18T17:51:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Inae Braga.pdf: 459668 bytes, checksum: 71106398a364205dfc2654bc4ad75136 (MD5) Previous issue date: 2013-08-08 / Approximately 80-90% of grassland areas in Brazil consist of the forage Urochloa, genus and the apomictic species Urochloa brizantha [syn. Brachiaria brizantha (Hochst. ex A. Rich.) Stapf.] the most used. Some genotypes of Urochloa have being widely used with a wrong nomenclature, even for species as for cultivars. In this way, the Urochloa cultivar identification is primordial for breeding programs and seed production. Considering the importance of genetic purity in comercialized seed lots, the present study aimed to investigate the potential of ISSR markers for discrimination of U. brizantha (Xaraés; Piatã, Basilisk; MG4; MG5; Marandú) in order to determine the degree of contamination of seed lots. ISSR markers showed a low degree of polymorphism . However, results showed it is possible to identify cultivars in pure samples of seeds Urochloa, requiring only ten primers. The cultivar Basilisk was confirmed as U. brizantha cultivar. It was not possible to differentiate samples intentionally contaminated at levels stipulated in the work. Further studies with other primers and other contamination levels will be important to detect varietal mixtures in cultivars U. brizanhta. / Aproximadamente 80 a 90% das áreas de pastagens no Brasil são constituídas por forrageiras do gênero Urochloa, sendo a espécie apomítica Urochloa brizantha [syn. Brachiaria brizantha (Hochst. ex A. Rich.) Stapf.] a mais utilizada. Alguns genótipos de Urochloa têm sido amplamente distribuídos com a nomenclatura equivocada, tanto para espécies como para cultivares. A identificação dos cultivares de Urochloa é fundamental para os programas de melhoramento e produção de sementes. Considerando a importância da pureza varietal em lotes de sementes comercializadas, o presente trabalho teve o objetivo verificar o potencial dos marcadores ISSR para a discriminação de U. brizantha (Xaraés; Piatã, Basilisk; MG4; MG5; Marandú) com a finalidade de determinar o grau de contaminação de lotes de sementes. Os marcadores ISSR apresentaram um baixo grau de polimorfismo. Todavia, os resultados mostraram ser possível identificar os cultivares em amostras puras de sementes de Urochloa, sendo necessários somente dez primers. O cultivar Basilisk foi confirmado como U. brizantha. Não foi possível diferenciar amostras contaminadas propositalmente nos níveis estipulados no trabalho. Novos estudos com outros primers e outros níveis de contaminação serão importantes para detectar misturas varietais em cultivares de U.brizantha.

Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-21T13:28:55Z No. of bitstreams: 1 Onildo Nunes de Jesus.pdf: 2414715 bytes, checksum: 214b16bf3a641fd0b947a2db75756cec (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-21T13:28:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Onildo Nunes de Jesus.pdf: 2414715 bytes, checksum: 214b16bf3a641fd0b947a2db75756cec (MD5) Previous issue date: 2006-02-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Banana genetic breeding at Embrapa Cassava and Tropical Fruits has carried out great efforts in trying to obtain banana cultivars resistant to most pests and diseases and with good agronomic characteristics, once most of the existing cultivars are tall in height and susceptible to most diseases. In this attempt, great financial and intellectual efforts are required for the obtainment of new hybrids that present desirable characteristics. With the creation of the Cultivar Protection Law, the right to protect a cultivar being released, with the emission of a Cultivar Certificate, was instituted. Therefore, the characterization of new genotypes becomes necessary in order to minimize the risk of unlawful acquirement of cultivars being released. The actual characterization being accepted, is the one based in morphological descriptors, even though the isoenzime pattern has also been used. The characterization of the genotypes with morphological and isoenzimatic descriptors, present some limitations, for they are influenced by the environment and therefore, the use of DNA descriptors acting directly in the plant genome presents another tool to overcome these problems. The objective of the present work was to use two types of descriptors: morphological and molecular (RAPD and SSR) in thediscrimination of banana cultivars being recommended by Embrapa Cassava and Tropical Fruits. The morphological descriptors were made up of 12 quantitative and sixty-one qualitative characteristics. For the molecular characterization, 48 RAPD primers and 34 microsatellite primers were used. The results concluded that the application of the qualitative and quantitative descriptors showed a broad genetic variability between the genotypes studied, but the Preciosa, Pacovan Ken and Garantida cultivars presented little perceptible differences, being perceptible only at DNA level. The descriptors based on microsatellites were superior to the others due to their repeatability and high discriminating power, enabling the definition of molecular patterns for some of the cultivars evaluated. With the selected primers in addition to the ones indicated, the creation of a molecular data bank for varietal identification takes its first steps. / O melhoramento genético de bananeira da Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical vêm conduzindo esforços na tentativa de obter cultivares de bananeira resistentes às principais pragas e doença com boas características agronômicas, uma vez que a maioria das cultivares existentes apresenta porte elevado, além de serem suscetíveis às principais doenças. Nessa tentativa, grandes esforços financeiros e intelectuais são requeridos para a obtenção de novos híbridos que apresentem características desejáveis. Com a criação da Lei de Proteção de Cultivares, foi instituído o direito a proteção da cultivar que é efetivada mediante a emissão de Certificado de Cultivar. Para tal, torna-se necessário caracterizar os novos genótipos, para minimizar os riscos da apropriação indevida dos mesmos e maximizar a eficiência dos programas de melhoramento e a utilização do germoplasma elite. A caracterização atualmente aceita é a baseada em descritores morfológicos, embora padrões de izoenzimas têm sido também usados. A caracterização dos genótipos com descritores morfológicos e izoenzimáticos, apresenta algumas limitações por ser influenciada pelo ambiente, portanto, a utilização de descritores de DNA atuando diretamente no genoma da planta, apresenta-se como solução para contornar estes problemas. O presente trabalho teve como objetivo utilizar dois tipos de descritores: morfológico e molecular (RAPD e SSR),na diferenciação de cultivares de bananeira recomendadas pela Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical. Os descritores morfológicos constituíram-se de 12 características quantitativas e 61 características qualitativas. Para a caracterização molecular, utilizou 48 primers de RAPD e 37 primers de microssatélites. Os resultados permitiram concluir que a aplicação dos descritores qualitativos e quantitativos mostrou uma ampla variabilidade genética entre os genótipos estudados, mas as cultivares Preciosa, Pacovan Ken e Garantida apresentaram pouca diferença, diferença esta perceptível somente em nível de DNA. Os descritores baseados em microssatélites foram superiores aos demais pela repetibilidade e alta capacidade discriminatória detectada, permitindo definir padrões moleculares para algumas cultivares avaliadas. Com os primers selecionados, somados aos já indicados, tem-se o inicio da criação de um banco de dados moleculares para a identificação varietal de bananeiras.

La sélection variétale a pour objectif la génération de variétés toujours plus performantes pour des caractères agronomiques d'intérêt. Pour les caractères quantitatifs, qui sont sous contrôle génétique polygénique, la sélection variétale consiste à réunir progressivement dans les nouvelles variétés des allèles favorables pour un maximum de gènes. Les processus de sélection évoluent, notamment par l'intégration des progrès concernant les connaissances génétiques et outils biotechnologiques. La sélection génomique est une méthode qui peut prédire la valeur génétique d'individus à partir de données génomiques et d'un modèle d'effets génétiques appris sur une population de référence. Nos études ont porté sur la possibilité d'insérer la sélection génomique dans le processus de sélection pour en augmenter l'efficacité. Notre sujet a été appliqué à un programme privé qui vise l'obtention de variétés de soja performantes pour le rendement et le contenu des graines en protéines, pour répondre à un besoin de protéines d'origine végétale. Des études génétiques sur une population de lignées générées lors de cycles de sélection successifs ont mis en évidence une structuration génétique en deux sous-populations qui ne sont pas "hermétiques". Nous avons étudié par échantillonnages de populations de test la précision de prédiction obtenue dans nos deux groupes avec différents modèles de GS : des modèles GBLUP additifs avec différentes populations d'apprentissage, puis des modèles d'architectures génétiques plus complexes. Les précisions de prédiction de nos modèles étaient proches les unes des autres. Cependant, nos résultats suggèrent que le modèle GBLUP le plus adapté pour obtenir des prédictions précises au sein de nos deux groupes est un modèle appris sur une population représentative du groupe à prédire et comprenant une composante additive et une composante épistatique additive x additive. Nous avons mis en place une application de la GS dans un cycle de sélection en cours de réalisation. Nous avons estimé le potentiel des croisements de départ par simulation de descendants virtuels et prédiction génomique de leurs performances, ce qui nous a permis de choisir trois populations biparentales prometteuses à l'intérieur desquelles nous avons effectué une sélection sur la base de prédictions génomiques. Nous avons développé un outil permettant de simuler des schémas de sélection sur plusieurs cycles consécutifs. Il s'agit d'un outil flexible et générique du point de vue de la définition des schémas de sélection. Cet outil permet notamment de comparer le gain génétique obtenu avec deux schémas différents à partir d'une même population de départ et d'un même modèle des effets génétiques et environnementaux agissant sur l'expression phénotypique d'un caractère. Avec cet outil, nous avons étudié la précision d'évaluation et les composantes de la variance de deux modèles GBLUP (avec ou sans modélisation de l'épistasie) après simulation de différentes architectures génétiques. Nous avons également comparé le schéma de sélection classique et différents schémas incluant une utilisation de la GS. Avec une comparaison sur un cycle, nous n'avons pas observé de gain à utiliser des schémas intégrant la GS pour augmenter l'efficacité de sélection de nouvelles variétés, à coût constant. Par contre, nous avons observé un gain à utiliser la GS pour choisir les croisements en début de cycle : la valeur génétique moyenne des lignées produites augmente de cycle en cycle. Concernant les alternatives au schéma de sélection classique du soja, des études plus approfondies seront nécessaires. Elles permettront notamment d'inclure la simulation des étapes de sélection sur le contenu des graines en protéines et d'étudier la question du gain génétique à long terme. / Varietal selection aims at the generation of increasingly more performing varieties for agronomic traits of interest. In the case of quantitative traits, which are under polygenic genetic control, varietal selection consists in gradually joining together in the new varieties favorable alleles for a maximum number of genes. Selection processes are evolving, in particular by integrating advances in genetic knowledge and biotechnological tools. Genomic selection is a method that can predict the genetic value of individuals from genomic data and a model of genetic effects learned on a reference population. Our studies have focused on the possibility of including genomic selection in the selection process to increase its efficiency. Our subject has been applied to a private program aimed at obtaining soybean varieties performing for yield and seed protein content to meet a need for proteins of plant origin. Genetic studies on a population of lines generated during successive breeding cycles have shown genetic structuration in two subpopulations that are not "hermetic". We studied by samplings of test populations the prediction accuracies obtained within our two groups with different GS models: additive GBLUP models with different learning populations, and then models of more complex genetic architectures. The prediction accuracies of our models were close to one another. However, our results suggest that the most suitable GBLUP model for obtaining accurate predictions within our two groups is a model learned on a population representative of the group to be predicted and including an additive component and an additive x additive epistatic component. We have implemented an application of GS in a selection cycle in progress. We evaluated the potential of initial crosses by simulation of virtual descendants and genomic prediction of their performances, which allowed us to select three promising biparental populations within which we made a selection based on genomic predictions. We have developed a tool to simulate selection schemes over several consecutive cycles. It is a flexible and generic tool from the point of view of selection schemes definition. This tool makes it possible, in particular, to compare the genetic gain obtained with two different schemes starting from a same starting population and from a same model of genetic and environmental effects acting on the phenotypic expression of a trait. With this tool, we studied evaluation accuracy and variance components of two GBLUP models (with or without epistasy modeling) after simulation of different genetic architectures. We also compared the classic selection scheme and different schemes including a use of GS. With a comparison on one cycle, we did not observe any gain in using schemes integrating GS to increase efficiency of selection of new varieties, at constant cost. On the other hand, we observed a gain in using GS to choose crosses at the beginning of cycle: mean genetic value of produced lines increases from one cycle to another. Regarding alternatives to the traditional soybean selection scheme, further studies will be required. In particular, they will include simulation of selection stages on seed protein content and study of long-term genetic gain.

Orientador: Antonio de Goes / Banca: Nelson Sidnei Massola Junior / Banca: Jaime Maia dos Santos / Resumo: Avaliou-se características morfológicas, patogênica e molecular de 33 isolados monospóricos de Colletotrichum gloeosporioides, obtidos de tecidos de manga com sintomas de antracnose. Adicionalmente avaliou-se também a sobrevivência do fungo em panículas e sua incidência em frutos coletados de mangueiras de 24 propriedades rurais, de dois tipos de condução: BC (Baixo custo, com até 15 pulverizações anuais de fungicidas) e AC (Alto Custo acima de 15 pulverizações anuais). Com base na morfologia os 33 isolados foram identificados como C. gloeosporioides, com predominância de conídios cilíndricos e/ou obclavados e apressórios lobulados ou fracamente lobulados. O aspecto das colônias variou com o isolado, assim como a velocidade de crescimento, em diferentes temperaturas. Mediante inoculação em folhas de mangueiras das cultivares Tommy Atkins e Espada Vermelha foi verificado que todos os isolados foram patogênicos, com diferenças quanto aos níveis de patogenicidade. A incidência nas áreas de BC variou de 52,2% a 58,5%, enquanto que nas de AC essa o foi de 26,00% a 39,8%. No estudo de sobrevivência, avaliado mediante a determinação da incidência de antracnose em ramos terminais, com e sem panículas, foi verificado que essa se deu na ordem de 3,6% a 10,2%, respectivamente. Mediante estudo molecular, com análise da região ITS1-5.8S-ITS2 amplificada, foi verificado que todos os isolados enquadraram-se na espécie C. gloeosporioides, com 100% de similaridade. / Abstract: Morphological, pathogenic and molecular characteristics of 33 monosporic isolates of Colletotrichum spp. were evaluated in a greenhouse and laboratory. These were obtained from mango tissues which presented anthracnose symptoms. The fungus survival on panicles and its incidence in fruits on 24 farms were also evaluated under two types of management: LC (Low cost, up to 15 yearly fungicide sprays) and HC (High Cost, over 15 sprays per year). Based on the morphological characteristics, the 33 isolates were identified as C. gloeosporioides, presenting cylindrical and / or obclavated predominant forms of conidia and weak lobulate appressoria. The appearance of the colonies varied based on the isolate and growth rate at different temperatures. Upon inoculation in the cultivars mango leaves, Tommy Atkins and Espada Vermelha found that all isolates were pathogenic, having differences in pathogenicity levels. The incidence of the LC areas ranged from 52.2% to 58.5%, while in the HC was from 26.0% to 39.8%. In the survival study, which was measured by determining the incidence of anthracnose in the terminal branches with and without panicles, the ranges determined were from 3.6% to 10.2%, respectively. By molecular analysis of the ITS1-5.8S-ITS2 amplified region, it was found that all isolates are framed in the species C. gloeosporioides, with 100% similarity. / Mestre

Alfalfa is one of the most valuable of our forage crops. A dependable source of seed is therefore a primary essential to the success of our present system of agriculture. More than 70 million pounds of alfalfa seed are required each year in the United States to maintain the present hay and pasture acreage of this crop; and the annual demand for seed would increase to more than 100 million pounds if the acreage were expanded to the extent recommended for soil conservation and a balanced agricultural security.