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Venomics of Sea Anemones: A Bioinformatic Approach to Tissue Specific Venom Composition and Toxin Gene Family Evolution.Macrander, Jason C. 26 September 2016 (has links)
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Mass Spectrometric Deconvolution of Libraries of Natural Peptide ToxinsGupta, Kallol January 2013 (has links) (PDF)
This thesis deals with the analysis of natural peptide libraries using mass spectrometry. In the course of the study, both ribosomal and non-ribosomal classes of peptides have been investigated. Microheterogeneity, post-translational modifications (PTM), isobaric amino acids and disulfide crosslinks present critical challenges in routine mass spectral structure determination of natural peptides. These problems form the core of this thesis. Chapter 2 describes an approach where chemical derivatization, in unison with high resolution LC-MSn experiments, resulted in deconvolution of a microheterogenous peptide library of B. subtilis K1. Chapter 3 describes an approach for distinction between isobaric amino acids (Leu/Ile/Hyp), by the use of combined ETD-CID fragmentation, through characteristic side chain losses. Chapters 4-6 address a long standing problem in structure elucidation of peptide toxins; the determination of disulfide connectivity. Through the use of direct mass spectral CID fragmentation, a methodology has been proposed for determination of the S-S pairing schemes in polypeptides. Further, an algorithm DisConnect has been developed for a rapid and robust solution to the problem. This general approach is applicable to both peptides and proteins, irrespective of the size and the number of disulfide bonds present. The method has been successfully applied to a large number of peptide toxins from marine cone snails, conotoxins, synthetic foldamers and proteins. Chapter 7 describes an attempt to integrate next generation sequencing (NGS) data with mass spectrometric analysis of the crude venom. This approach couples rapidly generated cDNA sequences, with high-throughput LC-ESI-MS/MS analysis, which provides mass spectral fragmentation information. An algorithm has been developed that allows the construction of a putative conus peptide database from the NGS data, followed by a protocol that permits rapid annotation of tandem MS data. The approach is exemplified by an analysis of the peptide components present in the venom of Conus amadis, yielding 225 chemically unique sequences, with identification of more than 150 sites of PTMs.
In summary, this thesis presents different methodologies that address the existing limitations of de novo mass spectral structure determination of natural peptides and presents new methodologies that permit for rapid and efficient analysis of complex mixtures.
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Neurotoxinas de anêmonas do mar como ferramentas para o estudo da fisiologia de canais voltagem - dependentes de potássio / Sea anemones neurotoxins as tools to study the physiology of voltage-gated potassium channelsOrts, Diego Jose Belato y 25 April 2013 (has links)
A peçonha das anêmonas do mar é uma fonte de compostos bioativos, incluindo toxinas peptídicas que são ferramentas para o estudo da estrutura e função dos canais voltagem dependentes de K+ (KV). Neste trabalho, quatro neurotoxinas foram purificadas da peçonha das anêmonas do mar Actinia bermudenesis e Bunodosoma caissarum. AbeTx1 e BcsTx4 possuem um motivo estrutural semelhante à das \"kappa-toxinas\" e análises funcionais e estruturais permitiram concluir que são os primeiros membros de um novo (tipo 5) de neurotoxinas de anêmonas do mar que atuam em canais KV. Por sua vez, a similaridade estrutural das toxinas BcsTx 1 e BcsTx2 nos permitiu inferir que estas são membros do já descrito tipo 1 (subtipo 1b) de neurotoxinas de anêmona que também atuam em canais KV. A caracterização funcional foi realizada utilizando-se diferentes subtipos de canais KV, expressos em ovócitos de Xenopus laevis e as medidas eletrofisiológicas foram feitas empregando-se a técnica de \"voltage-clamp\" com dois microelétrodos. AbeTx1, BcsTx1 e BcsTx2 (3 μM) apresentaram uma seletividade de atividade para os subtipos de KV1.1-KV1.3, KV1.6 e Shaker IR, ao passo que a BcsTx4 (3 μM) é somente capaz de bloquear a corrente dos subtipos de KV1.1, KV1.2 e KV1.6. Os mecanismos de ação envolvidos na seletividade da atividade e na potência com que estas se ligam aos seus alvos biológicos foram discutidos com base nos resultados obtidos e análises fisiológicas permitiram propor que estas toxinas atuam como \"armas\" para defesa contra predadores e/ou para captura de presas / The sea anemones venom is a rich source of bioactive compounds, including peptide toxins which are tools for studying the structure and function of voltage-dependent channels K+ (KV). In this work, four neurotoxins were purified from the venom of the sea anemones Actinia bermudenesis and Bunodosoma caissarum. AbeTx1 and BcsTx4 have a structural motif similar to that of kappa-toxins and functional and structural analysis showed that they are the first members of a new type (type 5) of sea anemone neurotoxins acting on KV channels. Moreover, the structural analysis of BcsTx1 and BcsTx2 toxins allowed us to conclude that they are members of the previously described type 1 (subtype 1b) of sea anemone neurotoxins. Functional characterization was performed by means of a wide electrophysiological screening on different KV channels using oocytes of Xenopus laevis and electrophysiological measurements were performed employing the voltage-clamp technique. AbeTx1, BcsTx1 and BcsTx2 (μM) showed a selective activity for KV1.1-KV1.3, KV1.6 and Shaker IR, while BcsTx4 (3 μM) only blocks KV1.1, KV1.2 and KV1.6. The mechanisms involved in potency and selectivity were discussed based on the results obtained and physiological analyses have provided new insights on the role of these toxins in the physiology of the sea anemones
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Veneno de Bothrops jararaca modificado com mPEG (monometoxipolietileno glicol) para elaboração de um adjuvante complexado à partícula antigênica / Modify Bothrops jararaca venom with mPEG (monometoxi polietilenglicol) for adjuvante complexed to antigenic particleStephano, Marco Antonio 28 November 2005 (has links)
Enzimas, biofármacos e produtos de origem biológica de modo geral sempre foram obstáculos para o uso terapêutico. Isto em função dos riscos de reação adversa que poderiam ocasionar bem como a indução de uma resposta imunológica desejável ou não. A utilização do monometoxipolietileno glicol (mPEG) conjugado a proteínas e enzimas trouxe novas perspectivas de utilização de substâncias naturais como substâncias farmacológicas ativas, pois o fato de estarem conjugadas a um polímero inerte atribui uma nova estrutura físico-química a essas substâncias, diminuindo consideravelmente os riscos de anafilaxia e a biodegradação por formação de complexos antígeno-anticorpo. Os estudos das variáveis inseridas no fenômeno de formação da estrutura mPEG e proteína, como também os novos sistemas de fornecimento de fármaco-químicos, trouxeram subsídios para o desenvolvimento deste trabalho no que se refere ao fornecimento de antígeno para o sistema imunológico. Este trabalho demonstrou que o mPEG pode ser utilizado como adjuvante e ao mesmo tempo como indutor de mecanismos de tolerância imunológica. Esta modulação ocorre em função da concentração de mPEG conjugado a molécula protéica, de modo que baixas concentrações de aminas conjugadas levam a um mecanismo de adjuvanticidade com aumento da produção de Il-4 e IL-5 e consequentemente aumento da produção de anticorpos quando comparados ao antígeno somente. Por outro lado os mecanismos de tolerância foram demonstrados pelo aumento da produção de IL-2, INF-γ e TNF-α quando concentração de mPEG ultrapassa a de 30% das aminas livres demonstrando uma ativação de células Th1. Também ficou demonstrado que a utilização do mPEG pode ser uzadopara diminuir ou até mesmo eliminar a atividade tóxicas de venenos peçonhentos. Pois durante os experimentos realizados houve uma diminuição de no mínimo de 50% da toxicidade. / Enzymes, biopharmaceutics and biological products in general way had always been obstacles for the therapeutically use. This in function of the risks of adverse reaction that could cause as well as the induction of a desirable immunological reply or not. The use of the monomethoxypolyethylene glycol (mPEG) conjugated proteins and enzymes brought new perspectives of natural substance use as active pharmacology substances, therefore the fact to be conjugated to an inert polymer had given to a good new physical-chemistry structure of these substances, diminishing the risks of anaphylaxis and the biodegradation for of complexes antigen-antibody formation. However the new studies of the inserted variable in the phenomenon of structure mPEG and protein formation as the system of supply of pharmacology-chemistries had also brought subsidies for the development of this work as for supply of antigen for the immune system. This work demonstrated that the MPEG can be used as adjuvant and at the same time as inductive of mechanisms of immunological tolerance. This modulation occurs in function of the concentration of conjugated MPEG the protein molecule, in way that low conjugated concentrations of amine with consequence take to a mechanism of adjuvant effect with increase of the production of Il-4 and IL-5 and increase antibodies production when compared with the antigen only. On the other hand the tolerance mechanisms had been demonstrated by the increase of the IL-2 production, INF-γ and TNF-α when MPEG concentration exceeds 30% of the free amines demonstrating activation of Th1 cells. Also he was demonstrated that the use of the toxic MPEG can be used to diminish or even though to eliminate the activity of poisons. Therefore during the carried through experiments it had a reduction of at the least of 50% of the toxicity.
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Papel das citocinas IL-5 e IL-17A na diferenciação de células produtoras de anticorpos de vida longa (ASC) induzida pelo veneno do peixe Thalassophryne nattereri / The role of IL-5 and IL-17A in the differentiation of long-lived antibody secreting cells (ASC) induced by Thalassophryne nattereri fish venomGrund, Lidiane Zito 15 September 2009 (has links)
O veneno do T.nattereri induz uma resposta de memória com a diferenciação de células B B220neg, indicativo de células produtoras de anticorpos de vida longa (ASC). Para avaliar o efeito do veneno na diferenciação de ASCs, camundongos BALB/c foram imunizados e sacrificados nos dias 21, 28, 48, 74 e 120 para avaliação de anticorpos plasmáticos e células B no peritônio, baço e medula óssea. O veneno induziu intensa esplenomegalia, formação de centros germinativos e persistentes níveis de anticorpos específicos IgG1, IgG2a e IgE anafilática. Células B1a e ASC apareceram rapidamente e a população de ASC CD138pos foi dividida em três subtipos (B220highCD43high, B220lowCD43low, e B220negCD43high) que persistiram em diferentes níveis em todos compartimentos. Finalmente, por métodos de neutralização nós sugerimos um papel importante da IL-5 e IL-17 A no desenvolvimento de ASC B220neg e na população B1a e mais ainda, a produção de TNF-a, IL-1b, IL-6, KC bem como a retenção do veneno nas células dendríticas foliculares parece promover os mecanismos para manutenção das ASCs. / T. nattereri fish venom induces a memory immune response with the differentiation of B cells B220neg, an indicative of long-lived antibody-secreting cells - ASC. To assess the effect of the venom on differentiation of ASCs, BALB/c mice were immunized with venom and sacrificed at days 21, 28, 48, 74 and 120 to evaluate plasmatic antibodies and B cell subtypes in peritoneum, spleen and bone marrow. The venom promoted splenomegaly, germinal centers formation and persistent levels of specific antibodies IgG1, IgG2a and anaphylactic IgE. B1a cells and ASC emerged rapidly and CD138pos ASCs can be divided into three subsets (B220high CD43high, B220low CD43low, and B220neg CD43high) that persist at different levels in all compartments. Finally, by neutralization methods we suggested an important role for IL-5 and IL-17A on development of B220neg ASCs and B1a population and moreover the production of TNF-a, IL-1b, IL-6, KC as well as the venom retained in follicular dendritic cells seem to provide mechanisms to explain the maintenance of ASCs.
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Análise dos constituintes de baixa massa molecular de quatro venenos do gênero Bitis e suas atividades biológicas. / Analysis of the low molecular mass constituents from the venom of four species of the Bitis genus and biological activities.Kodama, Roberto Tadashi 07 August 2015 (has links)
Na África subsaariana, as serpentes do gênero Bitis são de extrema importância, pois suas vítimas apresentam sintomas como dano local, hemorragia e uma severa hipotensão. Este trabalho identificou moléculas capazes de inibir a atividade da enzima conversora de angiotensina I (ECA) presentes no veneno de quatro serpentes do gênero Bitis. Para isto, as porções de baixa massa molecular desses 4 venenos foram fracionadas em RP-HPLC e as frações com boa inibição sobre a atividade da ECA foram analisadas por espectrometria de massas. Foram identificados 34 oligopeptídeos ricos em prolina (PRO), sendo 8 sintetizados e suas constantes de inibição (Ki) determinadas. Em testes com substratos naturais da ECA, angiotensina I e bradicinina, foi constatada a maior inibição da hidrólise da angiotensina I por quatro PROs. Todos os PROs in vivo reduziram a pressão arterial, e seis deles aumentaram a frequência cardíaca em ratos Wistar. Com isto, conclui-se que existem toxinas no veneno de serpentes do gênero Bitis responsáveis pela hipotensão. / In the sub-saharian Africa, snakes from the Bitis genus are of extreme medical importance, since its victims show symptoms as local tissue damage, hemorrhage and a severe hypotension. This work identified molecules that inhibit the angiotensin I converting enzyme (ACE) in the venom of 4 snakes from the Bitis genus. The low molecular portions of the venom of these snakes were fractionated in RP-HPLC and the fractions that efficiently inhibited the ACE activity were analyzed by mass spectrometry. 34 proline-rich oligopeptides were identified, 8 of them synthesized and had their inhibition constants (Ki) determined. In tests using natural substrates of ACE, angiotensin I and bradykinin, the angiotensin I hydrolysis were better inhibited by four PROs. In vivo tests results showed that all PROs decreased the mean arterial pressure and six of them increased the heart rate. Therefore, we can conclude that there are toxins present in the venom of Bitis capable of cause hypotension.
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Veneno de Bothrops jararaca modificado com mPEG (monometoxipolietileno glicol) para elaboração de um adjuvante complexado à partícula antigênica / Modify Bothrops jararaca venom with mPEG (monometoxi polietilenglicol) for adjuvante complexed to antigenic particleMarco Antonio Stephano 28 November 2005 (has links)
Enzimas, biofármacos e produtos de origem biológica de modo geral sempre foram obstáculos para o uso terapêutico. Isto em função dos riscos de reação adversa que poderiam ocasionar bem como a indução de uma resposta imunológica desejável ou não. A utilização do monometoxipolietileno glicol (mPEG) conjugado a proteínas e enzimas trouxe novas perspectivas de utilização de substâncias naturais como substâncias farmacológicas ativas, pois o fato de estarem conjugadas a um polímero inerte atribui uma nova estrutura físico-química a essas substâncias, diminuindo consideravelmente os riscos de anafilaxia e a biodegradação por formação de complexos antígeno-anticorpo. Os estudos das variáveis inseridas no fenômeno de formação da estrutura mPEG e proteína, como também os novos sistemas de fornecimento de fármaco-químicos, trouxeram subsídios para o desenvolvimento deste trabalho no que se refere ao fornecimento de antígeno para o sistema imunológico. Este trabalho demonstrou que o mPEG pode ser utilizado como adjuvante e ao mesmo tempo como indutor de mecanismos de tolerância imunológica. Esta modulação ocorre em função da concentração de mPEG conjugado a molécula protéica, de modo que baixas concentrações de aminas conjugadas levam a um mecanismo de adjuvanticidade com aumento da produção de Il-4 e IL-5 e consequentemente aumento da produção de anticorpos quando comparados ao antígeno somente. Por outro lado os mecanismos de tolerância foram demonstrados pelo aumento da produção de IL-2, INF-γ e TNF-α quando concentração de mPEG ultrapassa a de 30% das aminas livres demonstrando uma ativação de células Th1. Também ficou demonstrado que a utilização do mPEG pode ser uzadopara diminuir ou até mesmo eliminar a atividade tóxicas de venenos peçonhentos. Pois durante os experimentos realizados houve uma diminuição de no mínimo de 50% da toxicidade. / Enzymes, biopharmaceutics and biological products in general way had always been obstacles for the therapeutically use. This in function of the risks of adverse reaction that could cause as well as the induction of a desirable immunological reply or not. The use of the monomethoxypolyethylene glycol (mPEG) conjugated proteins and enzymes brought new perspectives of natural substance use as active pharmacology substances, therefore the fact to be conjugated to an inert polymer had given to a good new physical-chemistry structure of these substances, diminishing the risks of anaphylaxis and the biodegradation for of complexes antigen-antibody formation. However the new studies of the inserted variable in the phenomenon of structure mPEG and protein formation as the system of supply of pharmacology-chemistries had also brought subsidies for the development of this work as for supply of antigen for the immune system. This work demonstrated that the MPEG can be used as adjuvant and at the same time as inductive of mechanisms of immunological tolerance. This modulation occurs in function of the concentration of conjugated MPEG the protein molecule, in way that low conjugated concentrations of amine with consequence take to a mechanism of adjuvant effect with increase of the production of Il-4 and IL-5 and increase antibodies production when compared with the antigen only. On the other hand the tolerance mechanisms had been demonstrated by the increase of the IL-2 production, INF-γ and TNF-α when MPEG concentration exceeds 30% of the free amines demonstrating activation of Th1 cells. Also he was demonstrated that the use of the toxic MPEG can be used to diminish or even though to eliminate the activity of poisons. Therefore during the carried through experiments it had a reduction of at the least of 50% of the toxicity.
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Planejamento baseado na estrutura da metaloprotease BPMP-I e avalia??o de tiossemicarbazonas ativas contra a pe?onha da serpente Bothrops pauloensis / Structure-based planning Of BPMP-I metalloprotease and evaluation Of thiosemicarbazones active against The snake venom Bothrops PauloensisFerreira, Francis Barbosa 04 August 2016 (has links)
Submitted by Celso Magalhaes (celsomagalhaes@ufrrj.br) on 2017-05-17T11:44:30Z
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Previous issue date: 2016-08-04 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / In this work, semi and thiosemicarbazones selected from the LaDMol-QM library, were used
to study their interactions with a metalloproteinase from the snake Bothrops pauloensis
(BpMP-I) by molecular modelling and enzymatic inhibition assays with the toxin. The
crystalographic structure of BaPI (PDB code: 2W12) was used as a mold to build the 3D
model of BpMP-I by homology modeling. The theorical model of BpMP-I showed good
quality parameters and was used in a subsequent molecular modeling study. The
thiossemicarbazones showed better molecular docking results and in vitro enzymatic
inhibitions assays than semicarbazones. Studies by semi-empirical methods indicate a positive
enthalpy of interaction, suggesting that the enzyme inhibition by these compounds must be a
entropy-driven process. The results were used together to select the LDQM-IN-23 compound
and propose rationally designed modifications to improve the interactions with the toxin. The
study of the catalytic site of BpMP-I showed that there is an adjacent pocket with amino
groups of the peptide bonds available for interaction. All results were used together to design
structural changes, aiming the enhancing of the interaction with toxin. Therefore, was
proposed the insertion of the carboxyl group with different spacers, containing 2 (LDQM-IN-
23b) and 3 methylene groups (LDQM-IN-23c). The docking results and semi-empiric
optimization showed that there was a considerable improvement in the interaction for the
modified compounds. The modified compounds were synthesized and tested for biological
and enzymatic inhibition activity. It was observed that the IC50 values have improved: the
original molecule, LDQM-IN-23 has an IC50 of 3,011 ?M and the modified molecules have
IC50 of 79.12 (LDQM-IN-23b) and 1.77 ?M (LDQM-IN-23c). These molecules were tested
for inhibition of hemorrhagic activity induced by Bothropoidin, a P-III class
metalloproteinase, and by the B. pauloensis whole snake venom. The three molecules can
inhibit the hemorrhagic activity induced by isolated toxin and whole venom, and LDQM-IN-
23c showed higher efficiency compared with the other two, and in a rate of 1:10 (w/w
venom/inhibitor) the inhibition of the hemorrhagic activity was 100%. A molecular docking
study of this lead compound with Snake Venom Metalloproteases (SVMPs) from different
snake species and genera showed that this molecule can effectivelly interact with these
SVMPs. / Neste trabalho, foram utilizadas semi e tiossemicarbazonas, selecionadas na quimioteca do
LaDMol-QM (Dequim-UFRRJ), para o estudo das intera??es destas com o s?tio ativo de uma
metaloprotease da pe?onha da serpente Bothrops pauloensis por modelagem molecular e
ensaios de inibi??o da atividade enzim?tica e biol?gica sobre a toxina. A estrutura
cristalogr?fica de uma metaloprotease (BaPI) complexada com um inibidor (um
peptideomim?tico) (c?digo PDB 2W12) foi utilizada como molde para a constru??o do
modelo 3D da metaloprotease da pe?onha de B. pauloensis (BpMP-I). O modelo 3D te?rico
da BpMP-I, in?dito para esta toxina, apresentou bons par?metros de qualidade, sendo
considerado adequado para estudos de planejamento de ligantes baseado na estrutura. As
tiossemicarbazonas obtiveram melhores resultados, quando comparados com os resultados
das semicarbazonas, tanto para os ensaios de docagem molecular quanto para estudos de
inibi??o da atividade enzim?tica in vitro. Estudos por m?todos semiemp?ricos indicam uma
entalpia de intera??o positiva, sugerindo que a inibi??o enzim?tica por estes compostos deve
ser um processo controlado entropicamente. Os resultados foram utilizados para selecionar o
derivado LDQM-IN-23 e propor modifica??es estruturais planejadas racionalmente, visando
melhorar a intera??o deste com a toxina. O estudo do s?tio catal?tico da metaloprotease
mostrou que esta possui uma cavidade adjacente com grupos amino das liga??es pept?dicas
dispon?veis para intera??o. Foi proposta, ent?o, a inser??o de um grupo carboxilato com
diferentes espa?adores, 2 (LDQM-IN-23b) e 3 grupos metileno (LDQM-IN-23c). Os
resultados de docagem e otimiza??o semi-emp?rica mostraram que houve uma melhora
consider?vel na intera??o dos ligantes modificados, os quais foram sintetizados e testados
para as atividades de inibi??o enzim?tica e biol?gica. Na inibi??o enzim?tica, houve melhora
da CI50 com o aumento do espa?ador. O composto LDQM-IN-23 tem CI50 de 3011,00 ?M e
os compostos modificados possuem a CI50 de 79,12 (LDQM-IN-23b) e 1,77 ?M (LDQM-IN-
23c). Estes compostos foram testados para a inibi??o da atividade hemorr?gica in vivo
induzida pela Botropoidina, uma metaloprotease da classe P-III, e pela pe?onha bruta de B.
pauloensis. Os tr?s compostos conseguiram inibir a atividade hemorr?gica induzida pela
toxina isolada e pela pe?onha, sendo que o composto LDQM-IN-23c mostrou maior
efici?ncia, quando comparado com os outros dois, e para a propor??o de 1:10 (m/m
pe?onha/inibidor) a inibi??o da atividade foi de 100%. Foi realizado um estudo de docagem
deste composto l?der com outras metaloproteases de pe?onha de serpentes (SVMPs ? Snake
Venom Metalloproteinases), de esp?cies e g?neros diferentes, mostrando que este ligante
consegue interagir com outras SVMPs e ? um candidato para inibir a atividade hemorr?gica
de SVMPs presentes na pe?onha, n?o s? de B. pauloensis, mas de outras serpentes
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Conformationally Constrained Nucleosides : Design, Synthesis, and Biochemical Evaluation of Modified Antisense OligonucleotidesVarghese, Oommen P. January 2007 (has links)
This thesis is concerned with synthesis, structure and biochemical analysis of chemically modified oligonucleotides with potential therapeutic applications. The three types of chemical modifications described here are: (a) A North-East locked 1',2'-azetidine nucleoside (b) A North locked 2',4'-cyanomethylene bridged nucleoside and (c) A 2',4'-aza-ENA-T nucleoside. The synthesis of the 1',2'-azetidine fused nucleosides was described using two different approaches. A highly strained 2',4'-cyanomethylene locked nucleoside was synthesized but could not be converted to the phosphoramidite derivative due to instability during derivatization. The key cyclization step in the aza-ENA-T nucleoside synthesis gave rise to two separable diastereomers due to chirality at the exocyclic nitrogen. Conversion of diastereomer 55 to 56 occurred with a large free energy of activation (ΔG‡ = 23.4 kcal mol-1 at 298 K in pyridine-d5). Of the two isomers the equatorial NH product was more stable than the axial one due to reduced 1,3 diaxial interactions. As a result, all NH axial product was converted to the equatorial isomer during subsequent steps in the synthesis. NMR and ab initio experiments confirmed the North-East structure of the 1',2'-azetidine locked nucleoside and North conformation of aza-ENA-T locked nucleosides with a chair conformation of the piperidine ring. The amino modified nucleosides were incorporated into different positions of a 15mer oligonucleotide. The azetidine modified AONs did not form stable duplexes with complementary RNA (ΔTm ~-1 to -4 °C), but they performed better than previously synthesized isosequential 1',2'-oxetane modified oligonucleotides. The 2',4'-aza-ENA-T modified oligonucleotide, on the other hand, showed excellent target affinity with complementary RNA (ΔTm ~+4 °C). The azetidine and aza-ENA-T modified oligonucleotides showed significant stability in the presence of human serum and snake venom phosphodiesterase (3'-exonuclease) as compared to the unmodified native sequence. The singly modified 15mer oligonucleotides were also subjected to RNase H promoted digestion in order to evaluate their potential as effective antisense agents. The effective enzyme activity (kcat/Km) was found to be lower in the modified AONs due to reduced enzyme-substrate binding. However, the catalytic activity of RNase H with these modified-AON:RNA duplexes were higher than observed with the native duplex.
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Avaliação da qualidade da Apitoxina de Apis mellifera e sua estabilidade na formulação de uso tópico. / Evaluation of Apis mellifera Apitoxin quality and its stability in topical formulation.ABRANTES, Allyson Fortunato de. 25 April 2018 (has links)
Submitted by Johnny Rodrigues (johnnyrodrigues@ufcg.edu.br) on 2018-04-25T14:31:12Z
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Previous issue date: 2015 / O veneno da abelha, a apitoxina, consiste de uma mistura complexa de
compostos nitrogenados, constando de uma maior parte proteica(Melitina) e
menor fração por: Apamina, adolapina, fosfolipase A2, hialuronidase e
peptídeos MCD. Trata-se de um líquido transparente, com odor característico,
amargo e que apresenta pH básico (4,5 a 5,5), usado pelas abelhas como
elemento de defesa e que seca facilmente em temperatura ambiente. A
Melitina é o componente predominante no veneno apresentando,
aproximadamente, 50 % da matéria seca, trata-se de uma proteína de elevado
potencial anti-inflamatório, sendo considerada o principal agente da apitoxina
na terapia da artrite reumática. Junto com a apamina, a melitina estimula os
sistemas adrenal e pituitário a produzirem cortisol e outros esteroides naturais,
que tem relevante papel na terapia da artrite, bem como na indústria
cosmecêutica. A apitoxina foi coletada no apiário El-Shaday, Assentamento
Rosário, Agrovila Canudos do município de Ceará-Mirim/RN, a coleta da
amostra se deu utilizando o método de choques elétricos através de eletrodos
de aço inox conectados a uma bateria e lâminas de vidro posicionado no
alvado da colmeia que retêm a apitoxina após a picada da abelha. O apiário
produz dois tipos de apitoxina, classificada como tipo 01, pura, e tipo 02,
beneficiada. Foram realizados testes de citotoxicidade, quantificação proteica e
eletroforese, em ambas as amostras, a fim de avaliá-las e comparar os dois
tipos de apitoxina.Na apitoxina 01 foi realizada a concentração inibitória
mínima. As amostras também foram incorporadas em duas bases
dermatológicas, Gel carbopol® e Emulsão aniônica para que fossem avaliadas
a estabilidade Preliminar e Acelerada das formulações.A apitoxina tipo 01,
apresentou 77,83% de proteínas, uma concentração inibitória mínima a partir
de 1,0% e toxicidade de 962,60 µg/mL; Os testes na apitoxina 02 apresentaram
um teor proteico de 51,87% e uma citotoxicidade 154,82 µg/mL resultados
possivelmente afetados pela contaminação ainda presente neste tipo de
amostra após o beneficiamento. A eletroforese demonstrou que a apitoxina
apresenta o mesmo perfil proteico, independente do processo de extração.
Porém, a apitoxina tipo 02, aponta a diferença de uma unidade que não se
revelou neste produto. As formulações mantiveram-se estáveis durante todo
período de avaliação de sua estabilidade, 90 dias, onde foram avaliados pH,
viscosidade, caracteres organolépticos, espalhabilidade, nas três diferentes
condições de armazenamento: temperatura ambiente, 5 °C e 40 °C, exceção
feita à emulsão aniônica conservada à 40 °C em que perdeu estabilidade a
partir do trigésimo dia. / The bee venom, the apitoxin, is a complex mixture of nitrogenous compounds,
having largely represented by melittin protein and a smaller fraction consisting
of: Apamin, adolapina, phospholipase A2, hyaluronidase and peptides MCD. It
is a transparent liquid, with characteristic odour, bitter and that presents basic
pH (4.5 to 5.5), used by bees as a defense and that dry easily at room
temperature. The Melittin is the predominant component in poison showing
approximately 50% of the dry matter, it is a high protein anti-inflammatory
potential, being considered the main agent of apitoxin on rheumatic arthritis
therapy. Along with the apamin, melittin stimulates the adrenal and pituitary
systems to produce cortisol and other steroids, which has important role in
arthritis therapy, as well as in the cosmeceutical industry. The apitoxin was
collected in the Apiary El-Shaday, Settlement, Agrovila Straws of municipality of
Ceara – Mirin/ RN. sample collection occurred using the method of electric
shocks through electrodes of stainless steel connected to a battery and glass
blades positioned at the hive entrance of the hive that retain the apitoxin after
bee sting. The Apiary produces two types of apitoxin, classified as type 01,
pure, and type 02 milled. Cytotoxicity tests were performed, and protein
quantification in both samples in order to evaluate them and compare the two
types of apitoxin, on 01 was still held the apitoxin minimum inhibitory
concentration. The samples were also incorporated into two bases, carbopol
Gel ® skin and anionic emulsion for primary and Accelerated stability evaluated
formulations. The apitoxin type 01, 77.83% protein, introduced a minimum
inhibitory concentration from 1% and toxicity of 962.60 µ g/mL; Tests on
apitoxin 02 presented a protein content of 51.87% and a cytotoxicity 154.82
µ/mL results possibly affected by the contamination still present in this sample
type after the processing. Electrophoresis showed that apitoxin features the
same protein profile, regardless of the extraction process. However, the apitoxin
02 type, presents the difference in a unit that didn't report revealed in this
product. The wording remained stable throughout assessment period of its
stability, 90 days, where they were evaluated pH, viscosity, organoleptic
characters, spreadability, in three different storage conditions: room
temperature 5° C and 40° C, except the anionic emulsion stored at 40° C that
lost stability from the 30th day.
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