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Detecção e caracterização molecular de um fitoplasma do grupo 16SrIII associado ao amarelo da videira na região serrana do Rio Grande do Sul

Santos, Ronize Rohr dos 07 August 2015 (has links)
A videira (Vitis spp.) é uma das frutíferas mais cultivadas no mundo, tendo grande importância sócio-econômica no Brasil, principalmente na Região Serrana do Rio Grande do Sul. Inúmeras doenças acometem a videira afetando a produção vitícola e gerando prejuízos econômicos nas regiões produtoras. Uma destas doenças é o amarelo da videira, que tem associação com fitoplasmas. Esses procariotos, desprovidos de parede celular habitam e se multiplicam nos vasos do floema das plantas e na hemolinfa dos insetos vetores. No Brasil, há relatos da presença de fitoplasmas infectando videiras nos estados de São Paulo e Paraná. No Rio Grande do Sul, já foi verificado infectando macieiras, bem como a presença de seus possíveis insetos vetores, cigarrinhas do grupo Cicadellidae como parte da entomofauna vitícola. Nos últimos ciclos de produção, videiras apresentando sintomas de fitoplasmose vem sendo observadas nos vinhedos da Serra Gaúcha. O objetivo do presente estudo foi confirmar a presença de fitoplasmas infectando videiras na Região Serrana do Rio Grande do Sul, bem como classificar os fitoplasmas encontrados quanto ao grupo e subgrupo ao qual pertencem. Foram coletados, nos anos de 2014 e 2015, ramos e raízes de plantas que apresentavam sintomas como avermelhamento ou clorose das folhas em videiras tintas e brancas, respectivamente, enrolamento dos bordos foliares, superbrotamento de ramos, encurtamento de entrenós, necrose de nervuras e definhamento. O DNA total foi extraído e utilizado para detecção de fitoplasmas por meio de Nested-PCR com os primers R16 mF2/R16 R1, P/P7 ou P1/Tint na primeira reação e R16 F2n /R16 R2 na segunda reação. Para identificação molecular os produtos da segunda reação, fragmentos correspondentes à região 16S rDNA, foram sequenciados e as sequências geradas foram alinhadas entre si. Uma seqüência representativa dos fitoplasmas encontrados foi utilizada para análise de RFLP in silico, com 17 enzimas de restrição, e análise filogenética. Fitoplasmas foram verificados em quatro amostras oriundas de três videiras sintomáticas. As sequências alinhadas apresentavam 99% de similaridade com sequencias de fitoplasmas depositadas no GeneBank. A partir da avaliação dos perfis de restrição gerados pelo RFLP in silico e a análise filogenética, pode-se concluir que os fitoplasmas encontrados pertencem ao grupo 16SrIII, e ao subgrupo 16SrIII-J. Dessa forma, o presente estudo confirma a presença de fitoplasmas infectando videiras na Região Serrana do Rio Grande do Sul, indicando a ocorrência do amarelo da videira, doença até então não diagnosticada na região. / Submitted by Ana Guimarães Pereira (agpereir@ucs.br) on 2016-02-22T12:41:30Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao Ronize Rohr dos Santos.pdf: 2096147 bytes, checksum: 52d3fdc210d2e34e4fcc1976c0c4920e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-22T12:41:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Ronize Rohr dos Santos.pdf: 2096147 bytes, checksum: 52d3fdc210d2e34e4fcc1976c0c4920e (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. / The grapevine is one of the most cultivated fruit trees in the world, having great socio-economic importance in Brazil, particularly in the highlands of Rio Grande do Sul. Numerous diseases affect grapevine worldwide, interfering in grape production and generating economic losses. One of these diseases is the grapevine yellow, whose etiologic agent is a phytoplasma. These wall-less prokaryotes live and multiply in phloem vessels of plants and hemolymph of insect vectors. In Brazil, there are reports of the presence of phytoplasma infecting grapevines in the states of São Paulo and Paraná. In Rio Grande do Sul has been found infecting apple trees, causing the apple rubbery wood disease, as well as the presence of their possible insect vectors in vineyards, leafhoppers of the Cicadellidae group. In recent cycles of production, grapevines showing typical symptoms of phytoplasma infection had been observed in the vineyards of the highlands of Rio Grande do Sul. This study aimed to confirm the presence of phytoplasma infecting grapevines in vineyards of the highlands of Rio Grande do Sul and rank the phytoplasmas on the group and subgroup to which they belong. Branches and roots of plants showing symptoms such as, reddening or yellowing of leaves on red or white cultivars respectively, leaf downwards rolling, proliferation of axillary buds resulting in a witches’ broom behavior, abnormal internodes elongation, phloem necrosis and stunting, were sampled during the years 2014 and 2015 vintage. Total DNA was extracted and used for phytoplasmas detection by nested PCR with primers mF2 R16/R16 R1, P1/P7 and P1/Tint in the first reaction and F2n R16/R16 R2 in the second reaction. For molecular identification the second reaction product, corresponding to the region 16S rDNA fragments were sequenced and generated sequences were aligned. A representative sequence of grapevine phytoplasma was used for RFLP analysis in silico, with 17 restriction enzymes, and phylogenetic analysis. Phytoplasmas were detected in four samples deriving from three symptomatic vines. The aligned sequences showed 99% similarity with phytoplasma sequences deposited in GeneBank. The RFLP patters and the phylogenetic analysis, allowed concluding that the phytoplasmas found belongs to the group16SrIII, and 16SrIII- J subgroup. Thus, this study confirms the presence of phytoplasma infecting grapevines in the highlands of Rio Grande do Sul, indicating the occurrence of grapevine yellow disease hitherto none diagnosed in the region.
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Respostas fisiológicas à aplicação de reguladores vegetais e nutrientes em videira 'crimson seedless' /

Amaro, Amanda Cristina Esteves, 1985. January 2014 (has links)
Orientador: João Domingos Rodrigues / Banca: Elizabeth Orika Ono / Banca: Gisela Ferreira / Banca: Osvaldo Ferrarese Filho / Banca: Stella Consorte Cato / Resumo: O presente trabalho objetivou avaliar o efeito da aplicação foliar da mistura de auxina (Ax), citocinina (CK) e giberelina (GA), isolada ou combinada com a mistura de nutrientes, cobalto (Co) e molibdênio (Mo), em videira 'Crimson Seedless', buscando analisar seus efeitos na duração da atividade fotossintética das folhas e no metabolismo e desenvolvimento da planta, bem como no aumento da produção e qualidade de frutos. Os experimentos foram desenvolvidos no município de Juazeiro - BA, Brasil, em blocos casualizados, com quatro tratamentos e seis blocos. Os tratamentos foram: T1 - Testemunha; T2 - CK+Ax+GA 1,8L ha-1; T3 - CK+Ax+GA 1,8L ha-1 + Co+Mo 1,0L ha-1; e T4 - CK+Ax+GA 1,8L ha-1 + Co+Mo 1,5L ha-1. As aplicações foram realizadas em três fases: primórdio de inflorescência, bagas chumbinho, e alongamento de bagas. No primeiro experimento, avaliou-se a duração da atividade fotossintética das folhas, através de avaliações nas trocas gasosas em folhas marcadas logo após a brotação, até o final do ciclo. No segundo experimento, foram avaliadas as trocas gasosas, atividades de enzimas antioxidantes, teores de carboidratos e clorofilas aos 3, 5, 7, 14 e 21 dias após a 1ª aplicação; aos 1, 3 e 5 dias após a 2ª aplicação e aos 1, 3, 5, 7, 14, 21 e 28 dias após a 3ª aplicação (DAA). Assim, as plantas mantiveram a atividade fotossintética durante todo o ciclo, até o final das avaliações, aos 133 dias após a brotação das folhas. Entretanto, observou-se que a aplicação de reguladores vegetais e nutrientes antecipou o momento em que as folhas atingiram a taxa de assimilação de CO2 máxima, indicando que esses tratamentos otimizaram o processo fotossintético. Ao mesmo tempo, as taxas de assimilação de CO2 e eficiência de carboxilação começaram a apresentar maior eficiência após 14 DAA, assim como maiores teores de clorofilas, carotenoides e ... / Abstract: The present study aimed to evaluate the effect of foliar application of auxin (Ax), cytokinin (CK) and gibberellin (GA) mixture, isolated or combined with the cobalt (Co) and molybdenum (Mo) mixture, in 'Crimson Seedless' grapevine, analyzing their effects on photosynthetic activity duration, metabolism and development of the plant, as well as increase production and fruit quality. The experiments were conducted in Juazeiro - BA, Brazil, in a randomized block design with four treatments, six blocks, with four plants each. Treatments were: T1 - Control; T2 - CK+Ax+GA 1.8L ha-1, T3 - CK+Ax+GA 1.8L ha-1 + Co+Mo 1.0L ha-1, and T4 - CK+Ax+GA 1.8L h-1 + Co+Mo 1.5L h-1. The treatments applications were carried out in three phases: inflorescence primordial stage, when berries were with 6 to 8 mm in diameter and berries elongation. In the first experiment, the photosynthetic activity duration was assessed by evaluating gas exchanges in leaves that were marked soon after sprouting, until the end of the cycle. In the second experiment, were evaluated gas exchanges, antioxidant enzymes activities, levels of carbohydrates and chlorophyll at 3, 5, 7, 14 and 21 days after the 1st application, at 1, 3 and 5 days after 2nd application and at 1, 3 , 5, 7 , 14, 21 and 28 days after the 3rd application (DAA). Thus, plants maintained their photosynthetic activity during the whole cycle, until the end of evaluations, for 133 days after sprouting leaves. However, it was observed that the application of plant growth regulators and nutrients anticipating the moment when the leaves reached the maximum absorption rate of CO2, indicating that these treatments have optimized the photosynthetic process. At the same time, rates of CO2 assimilation and carboxylation efficiency began to show greater efficiency after 14 DAA, as well as higher levels of chlorophylls, carotenoids and sugar concentrations, as in the 1st far as ... / Doutor
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Detecção e caracterização molecular de um fitoplasma do grupo 16SrIII associado ao amarelo da videira na região serrana do Rio Grande do Sul

Santos, Ronize Rohr dos 07 August 2015 (has links)
A videira (Vitis spp.) é uma das frutíferas mais cultivadas no mundo, tendo grande importância sócio-econômica no Brasil, principalmente na Região Serrana do Rio Grande do Sul. Inúmeras doenças acometem a videira afetando a produção vitícola e gerando prejuízos econômicos nas regiões produtoras. Uma destas doenças é o amarelo da videira, que tem associação com fitoplasmas. Esses procariotos, desprovidos de parede celular habitam e se multiplicam nos vasos do floema das plantas e na hemolinfa dos insetos vetores. No Brasil, há relatos da presença de fitoplasmas infectando videiras nos estados de São Paulo e Paraná. No Rio Grande do Sul, já foi verificado infectando macieiras, bem como a presença de seus possíveis insetos vetores, cigarrinhas do grupo Cicadellidae como parte da entomofauna vitícola. Nos últimos ciclos de produção, videiras apresentando sintomas de fitoplasmose vem sendo observadas nos vinhedos da Serra Gaúcha. O objetivo do presente estudo foi confirmar a presença de fitoplasmas infectando videiras na Região Serrana do Rio Grande do Sul, bem como classificar os fitoplasmas encontrados quanto ao grupo e subgrupo ao qual pertencem. Foram coletados, nos anos de 2014 e 2015, ramos e raízes de plantas que apresentavam sintomas como avermelhamento ou clorose das folhas em videiras tintas e brancas, respectivamente, enrolamento dos bordos foliares, superbrotamento de ramos, encurtamento de entrenós, necrose de nervuras e definhamento. O DNA total foi extraído e utilizado para detecção de fitoplasmas por meio de Nested-PCR com os primers R16 mF2/R16 R1, P/P7 ou P1/Tint na primeira reação e R16 F2n /R16 R2 na segunda reação. Para identificação molecular os produtos da segunda reação, fragmentos correspondentes à região 16S rDNA, foram sequenciados e as sequências geradas foram alinhadas entre si. Uma seqüência representativa dos fitoplasmas encontrados foi utilizada para análise de RFLP in silico, com 17 enzimas de restrição, e análise filogenética. Fitoplasmas foram verificados em quatro amostras oriundas de três videiras sintomáticas. As sequências alinhadas apresentavam 99% de similaridade com sequencias de fitoplasmas depositadas no GeneBank. A partir da avaliação dos perfis de restrição gerados pelo RFLP in silico e a análise filogenética, pode-se concluir que os fitoplasmas encontrados pertencem ao grupo 16SrIII, e ao subgrupo 16SrIII-J. Dessa forma, o presente estudo confirma a presença de fitoplasmas infectando videiras na Região Serrana do Rio Grande do Sul, indicando a ocorrência do amarelo da videira, doença até então não diagnosticada na região. / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. / The grapevine is one of the most cultivated fruit trees in the world, having great socio-economic importance in Brazil, particularly in the highlands of Rio Grande do Sul. Numerous diseases affect grapevine worldwide, interfering in grape production and generating economic losses. One of these diseases is the grapevine yellow, whose etiologic agent is a phytoplasma. These wall-less prokaryotes live and multiply in phloem vessels of plants and hemolymph of insect vectors. In Brazil, there are reports of the presence of phytoplasma infecting grapevines in the states of São Paulo and Paraná. In Rio Grande do Sul has been found infecting apple trees, causing the apple rubbery wood disease, as well as the presence of their possible insect vectors in vineyards, leafhoppers of the Cicadellidae group. In recent cycles of production, grapevines showing typical symptoms of phytoplasma infection had been observed in the vineyards of the highlands of Rio Grande do Sul. This study aimed to confirm the presence of phytoplasma infecting grapevines in vineyards of the highlands of Rio Grande do Sul and rank the phytoplasmas on the group and subgroup to which they belong. Branches and roots of plants showing symptoms such as, reddening or yellowing of leaves on red or white cultivars respectively, leaf downwards rolling, proliferation of axillary buds resulting in a witches’ broom behavior, abnormal internodes elongation, phloem necrosis and stunting, were sampled during the years 2014 and 2015 vintage. Total DNA was extracted and used for phytoplasmas detection by nested PCR with primers mF2 R16/R16 R1, P1/P7 and P1/Tint in the first reaction and F2n R16/R16 R2 in the second reaction. For molecular identification the second reaction product, corresponding to the region 16S rDNA fragments were sequenced and generated sequences were aligned. A representative sequence of grapevine phytoplasma was used for RFLP analysis in silico, with 17 restriction enzymes, and phylogenetic analysis. Phytoplasmas were detected in four samples deriving from three symptomatic vines. The aligned sequences showed 99% similarity with phytoplasma sequences deposited in GeneBank. The RFLP patters and the phylogenetic analysis, allowed concluding that the phytoplasmas found belongs to the group16SrIII, and 16SrIII- J subgroup. Thus, this study confirms the presence of phytoplasma infecting grapevines in the highlands of Rio Grande do Sul, indicating the occurrence of grapevine yellow disease hitherto none diagnosed in the region.
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A vitivinicultura relacionada à indicação de procedência Farroupilha : perfil, identificação de gargalos e definição de demandas e transferência de tecnologia

Taffarel, Joao Carlos 18 July 2013 (has links)
A vitivinicultura brasileira vem se transformando muito nos últimos 20 anos e a abertura da economia, na década de 90, trouxe incertezas para o setor vitivinícola, que foi induzido a criar novas estratégias de competitividade. O município de Farroupilha é o terceiro maior produtor de uvas do Rio Grande do Sul e o maior produtor de uvas moscatéis para processamento. Essa condição estimulou a criação da Associação Farroupilhense dos Produtores de Vinhos, Espumantes, Sucos e Derivados (AFAVIN), com foco e objetivo de divulgar e defender os produtos elaborados no município, para os quais foi definido como estratégia de inovação e competitividade o desenvolvimento de uma Indicação Geográfica de produtos de qualidade e identidade regional. Nesse contexto, a dissertação objetivou analisar a vitivinicultura vinculada à AFAVIN com o fim de propor estratégias de ação e transferência de tecnologias como subsídio para melhorar a qualidade dos produtos, agregar competitividade e sustentabilidade à cadeia produtiva da região e para consolidar o processo de desenvolvimento da IP Farroupilha, pois nem sempre as empresas e os produtores estão preparados para mudanças. Para o estudo foi criada metodologia para levantamento das informações de vinícolas e de propriedades fornecedoras de uvas, bem como sua análise, identificando os principais gargalos, as demandas de Transferência de Tecnologia, de Pesquisa e Desenvolvimento e de políticas institucionais (que não dependam somente de TT e/ou P&D), que possam contribuir para o desenvolvimento da IP Farroupilha. Este estudo é inovador e a análise dos resultados permitiu caracterizar as propriedades vitícolas e as vinícolas vinculadas à AFAVIN, propondo ações para consolidar o processo de desenvolvimento da IP Farroupilha, melhorando a qualidade dos produtos, agregando competitividade e sustentabilidade à cadeia produtiva da região. / The brazilian viticulture faced a huge transformation in the last 20 years, especially after the economic changes in the in the 90’s decade. The new scenarios brought uncertainties to the viticulture sector that stimulated the adoption of competitiveness strategies. The city of Farroupilha is the third biggest grape producer of Rio Grande do Sul and the biggest muscat grape for processing producer. This condition stimulated the creation of Associação Farroupilhense dos Produtores de Vinhos, Espumantes, Sucos e Derivados (AFAVIN), focused on the promotion of innovation and competitiveness strategies for the development of a geographic indication of quality products and regional identity. Within this context, the dissertation analyzed the viticulturists linked to AFAVIN with the purpose to identify opportunities for technology transfer as a way to improve the quality of products and aggregate competitiveness and sustainability to the regional production chain and to consolidate the developing process of Farroupilha Geografical Indication (IG). For this study, wineries and grape producers were analysed in order to identify the main bottlenecks and demands for technology transfer, research and development and application of institutional policies that can contribute for the development of Farroupilha IP. This study the results allowed the characterization of the viticulture properties and the wineries linked to AFAVIN, proposing actions to consolidate the process of development of Farroupilha IP in order to improve the quality of products, aggregate competitiveness and sustainability to the regional production chain.
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Simbiose micorrízica arbuscular em porta-enxertos de videira (Vitis spp.)

LEMOS, Ivanice Borges 31 January 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:02:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Avaliou-se a simbiose micorrízica na rizosfera de porta-enxertos de videira IAC (313, 572 e 766), SO4, 420A, Paulsen e Harmony, no campo localizado em Petrolina, PE, em 2004 e 2006. Em 2004, a densidade de glomerosporos (DG) na rizosfera variou de 26 a 82, enquanto que em 2006 houve diminuição, variando de 5 a 98/100 g de solo. A colonização micorrízica (CM) avaliada apenas em 2006, variou de 24,4 a 64,6 %. A produção de glomalina foi maior em 2004, variando de 2,42 a 4,05 mg/g e diminuindo em 2006 para 0,01 a 0,05 mg/g de solo. Foram identificados 26 táxons de FMA na rizosfera, sendo as espécies de Glomus predominantes. Os FMA formam simbiose, com os porta-enxertos e diferenças significativas na associação podem estar relacionadas aos genótipos. Objetivando verificar a eficiência micorrízica no crescimento e nutrição de videira var. Harmony foi realizado um experimento com duas espécies de FMA (mistura de Entrophospora infrequens e G.etunicatum e com Glomus etunicatum) e 4 níveis de P (0, 20, 40 e 60 mg de P). Após 120 dias, foram avaliadas: área foliar, biomassa seca (BS) e fresca (BF) aérea e radicular, conteúdo nutricional, CM e DG. Houve efeito da inoculação, da adubação fosfatada e interação entre esses fatores. As médias de CM e a DG alcançaram 25,39% e 6,49 glomerosporos/50 g de solo, respectivamente, sem diferenças significativas entre as espécies de FMA testadas. G. etunicatum promoveu maior crescimento das plantas, enquanto a inoculação com mistura de E. infrequens propiciou maior conteúdo de nutrientes na raiz
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Adubação orgânica e nitrogenada em videira cv. syrah no vale do submédio São Francisco /

Rocha, Marlon Gomes da, 1978. January 2013 (has links)
Orientador: Luís Henrique Bassoi / Banca: Roberto Lyra Villas Bôas / Banca: Hélio Grassi Filho / Banca: Davi José Silva / Banca: Antonio Odair Santos / Resumo: A grande maioria dos solos cultivados com videira no Brasil apresenta baixo teor de matéria orgânica e alguma limitação à nutrição da planta. Hipoteticamente, esses solos teriam uma pequena capacidade de suprimento de nitrogênio, sendo necessária correções com aplicação de fertilizante nitrogenado mineral ou orgânico para que as plantas tenham condições de expressar seu potencial produtivo. O N assim como outros nutrientes, pode afetar o crescimento vegetativo da videira de vinho, a produção e a composição do mosto, influenciando na qualidade do vinho. Assim, este trabalho teve como objetivo avaliar o efeito da adubação orgânica e nitrogenada na produção e no comportamento ecofisiológico da videira de vinho cv. Syrah no Vale do Submédio São Francisco. O experimento foi conduzido na Embrapa Semiárido, em Petrolina - PE, em um Argissolo Vermelho Amarelo Eutrófico Latossólico de textura média. As videiras plantadas em 31 de abril de 2009 no espaçamento de 1 x 3 m, foram conduzidas no sistema de espaldeira. A irrigação foi realizada por um sistema de gotejamento e o manejo realizado com base na evapotranspiração da cultura. Os tratamentos foram constituídos de 2 doses de AO (0 e 30 m3 ha-1) e 5 doses de N (0, 10, 20, 40 e 80 kg ha-1) aplicada via fertirrigação, dispostos em blocos casualizados com 5 repetições. Os tratamentos foram dispostos em parcelas subdivididas, sendo que o AO constituiu as parcelas e as doses de N as subparcelas. Em 3 ciclos de produção (13 de abril a 9 de agosto de 2010, 10 de novembro de 2010 a 28 de fevereiro de 2011, e 10 de maio a 9 de setembro de 2011), foram realizadas a avaliação da produção e da composição química das uvas, o monitoramento dos teores de nutrientes no solo e nas folhas, a determinação do índice de clorofila nas folhas, a determinação da... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The majority of the soils cultivated with vine in Brazil have low organic matter content and many limitations to plant nutrition. Hypothetically, these soils have little capacity to supply nitrogen, and the application of mineral or organic nitrogen fertilizer is necessary to make the vines able to show their production potential. The nitrogen as well as other nutrients can affect the vegetative growth of the vine, wine production and wine composition, influencing the wine quality. This study aimed to evaluate the effect of organic and nitrogen fertilzation in the grape production and ecophysiological behavior of vine cv. Syrah in the Lower Middle São Francisco Valley, Brazil. The experiment was carried out at Embrapa Tropical Semi-Arid, in Petrolina, State of Pernambuco, Brazil, in a Argissolo Vermelho Amarelo Eutrófico Latossólico, medium texture. Vines were planted on April 31, 2009, at a spacing of 1 x 3 m, and were conducted in an espalier system. Water was applied by a drip irrigation system and the water management was based on crop evapotranspiration. The treatments consisted of 2 organic fertilizer rates (0 and 30 m3 ha-1) and five N rates (0, 10, 20, 40 and 80 kg ha-1) applied by fertigation. The randomized block design was used, with 5 replications. The treatments were arranged in split plots with the organic fertilizer rates composing the main plots and N rates composing the subplots. In three growing seasons (April 13 to August 9, 2010, November 10, 2010 to February 28, 2011, and May 10 to September 9, 2011) the evaluation of grape production and its chemical composition, monitoring of soil and plant nutrient levels, determination of leaf chlorophyll content, and the determination of the soil apparent electrical conductivity (ECa) were performed. The amount of nutrients added by organic fertilizer resulted in a significant accumulation... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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ESTAÇÃO AGROMETEOROLÓGICA EXPERIMENTAL AUTOMATIZADA E INTEGRADA A SOFTWARES PARA CÁLCULO DE ESTIMATIVAS DE DORMÊNCIA EM PESSEGUEIROS E VIDEIRAS / ESTAÇÃO AGROMETEOROLÓGICA EXPERIMENTAL AUTOMATIZADA E INTEGRADA A SOFTWARES PARA CÁLCULO DE ESTIMATIVAS DE DORMÊNCIA EM PESSEGUEIROS E VIDEIRAS

Pasternak, Wilian Diogo 30 November 2016 (has links)
Made available in DSpace on 2017-07-21T14:19:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Willian Diogo Pasternak.pdf: 1415220 bytes, checksum: 1af88a553b3e39efd02021996506fa2e (MD5) Previous issue date: 2016-11-30 / The dormancy period of a plant consists of the period during which its development is suspended, being inactive. In some cases, the breakdown of dormancy does not occur naturally, requiring the break of this period, through the application of chemical or natural products. However, monitoring air temperature and relative humidity data specifically in the production environment has proven to be an expensive process. Using agrometeorological stations of meteorological institutes does not return exact data of the plantation. This work contributes to the peach and grapevine dormancy period analysis process by presenting a low cost experimental agrometeorological station capable of collecting temperature and relative humidity data. Integrated to this station, a software is provided to calculate the period of dormancy in peach trees and vines using the Utah methods, North Carolina, Modified Utah, Modified North Carolina and Cold Units. The station was developed employing the Atmel ATmega 328P microcontroller. The software was developed using WebServices technology and the Java programming language. Two agrometeorological stations were designed and installed, one in Guarapuava and another in Ponta Grossa, both cities of the state of Paraná. The data collections at both stations were compared to other stations in the region and data were considered satisfactory. The softwares developed for the correct functioning of the station, as well as the software to calculate the period of dormancy in peach trees and vines, return correct and adequate data for decision making. / O período de dormência de uma planta consiste no período durante o qual o seu desenvolvimento é suspenso, ficando esta inativa. Em alguns casos a quebra de dormência não acontece de forma natural, sendo necessária a quebra desse período, por meio da aplicação de produtos químicos ou naturais. Todavia, monitorar dados de temperatura e umidade relativa do ar especificamente no ambiente de produção, tem se mostrado um processo caro. Já ao usar estações agrometeorológicas de institutos meteorológicos não retornam dados exatos da plantação. Este trabalho contribui com o processo de análise de período de dormência de pessegueiros e videiras ao apresentar uma estação agrometeorológica experimental, de baixo custo, capaz de coletar dados de temperatura e umidade relativa do ar. Integrado a esta estação é disponibilizado um software para cálculo do período de dormência em pessegueiros e videiras por meio dos métodos Utah, Carolina do Norte, Utah Modificado, Carolina do Norte Modificado e Unidades de Frio. A estação foi desenvolvida empregando o microcontrolador Atmel ATmega 328P. Já os softwares foram desenvolvidos aplicando a tecnologia WebServices e a linguagem de programação Java. Duas estações agrometeorológicas foram projetadas e instaladas uma em Guarapuava e outra em Ponta Grossa, ambas cidades do estado do Paraná. As coletas dos dados em ambas as estações foram comparadas a outras estações das regiões e os dados foram tidos como satisfatórios. Os softwares desenvolvidos para o correto funcionamento da estação, bem como o software para cálculo do período de dormência em pessegueiros e videiras retornam respostas corretas e adequadas para auxiliar na tomada de decisão sobre a aplicação ou não de produtos para quebra de dormência em pessegueiros e videiras.
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Avaliação de uma região hotspot do gene citocromo b para resistência aos fungicidas inibidores da quinona oxidase (QoI) em patógenos de uva Niágara Rosada / Evaluating a hotspot region of the cytochrome b gene related to the resistance to quinone oxidase inhibitor (QoI) fungicides in pathogens of Niagara Rosada grapevine

Moraes, Nathália de 26 August 2016 (has links)
A videira é uma das plantas mais antigas cultivadas pela humanidade, sendo que no Brasil a uva é a terceira fruta com maior volume de produção, atrás apenas do cultivo das bananas e das laranjas. Apesar da produção rentável, principalmente aos pequenos produtores, o parreiral é susceptível a várias doenças cujo manejo compromete até 59% dos gastos do produtor. No estado de São Paulo, dentre as doenças, três têm destaque: a antracnose (causada pelo Sphaceloma ampelinum), o míldio da videira (causado pelo Plasmopara viticola) e a ferrugem (causada pelo Phakopsora euvitis). Os produtores utilizam controle químico de forma intensa e preventiva, chegando a 100 aplicações de fungicidas em um ciclo de até 120 dias. Os principais fungicidas utilizados são os inibidores da quinona oxidase (QoI), que agem impedindo o transporte de elétrons do citocromo b ao citocromo c1 na cadeia respiratória da mitocôndria. Porém, existem relatos de resistência ao fungicida aplicado no campo em diversos países. As substituições G143A, G137R e F129L na sequência da proteína citocromo b impedem que o fungicida se ligue ao seu sítio alvo. As mutações que levam às substituições estão localizadas em uma das regiões chamada hotspot do gene citocromo b (cytB). Visto que, pela carência de estudos, a resistência genética a esses fungicidas nunca foi relatada no Brasil, o objetivo principal desse trabalho foi sequenciar e caracterizar a região hotspot em isolados de míldio, ferrugem e antracnose provenientes de parreirais do estado de São Paulo. Foram selecionados 35 isolados de 11 locais diferentes; desses, 11 isolados de míldio foram considerados geneticamente resistentes, pois apresentam a mutação para o resíduo alanina na posição 143, e 4 isolados foram considerados geneticamente sensíveis. Os dois isolados de ferrugem selecionados também foram considerados geneticamente sensíveis. Pela estratégia de Genome Walking foi possível sequenciar 65% do gene cytB de um dos isolados brasileiros de P. viticola; foram encontrados poucos polimorfismos e nenhum íntron na sequência analisada. Os resultados obtidos com esse estudo podem servir de suporte para a tomada de decisões de manejo mais adequadas para a realidade da viticultura brasileira; além disso, são importantes para futuros estudos sobre a evolução do patógeno com a pressão seletiva exercida pelos fungicidas. / Grapevine is one of the most ancient cultivated plants and its fruit, grape, is notably important in Brazil, since it is the third most produced, only behind banana and citrus. Although it is rentable especially to smallholders, the vineyard is often attacked by several pathogens and the damages induced by them can compromise up to 59% of the producers\' expenses in order to keep the diseases under control. In Sao Paulo state there are three important diseases that attack vineyards: anthracnose (caused by Sphaceloma ampelinum), downy mildew (caused by Plasmopara viticola) and rust (caused by Phakopsora euvitis). Pest management practices used by the producers relies on intensive and preventive use of fungicides, in which the culture is sprayed 100 times per vineyard\'s growth cycle (that last approximately 120 days). One of the most used fungicides are the quinone oxidase inhibitors (QoI), that act by blocking the electron transport chain at the mitochondria binding at the Qo site of the cytochrome b (cytB) complex. However, there are several reports of the presence of resistant strains in different countries. Resistance is caused by the aminoacids substitutions F129L, G137R and G143A in the cytochrome b protein sequence, that prevent the fungicide molecule binding to its target site. The mutations in the cytB gene that lead to these substitutions are harbored in a region called hotspot for fungicide resistance. Since this type of study was never reported in Brazil, the main purpose of this work was to sequence and characterize the hotspot region of different isolates from anthracnose, downy mildew and rust. Thirty five isolates from eleven different locations were choosen for the study. Eleven of them harbored the mutation that lead to the substitution G143A; these were then considered genetically resistant to the QoI fungicides. On the contrary, four downy mildew and the two rust isolates were considered sensitive to the QoI fungicides, since none of the aminoacids substitutions were observed. Also, by using a technique named Genome Walking it was possible to sequence 65% of cytB gene from a Brazilian downy mildew isolate. In this sequence were found few polymorphisms and none intron. These study findings are unique for Brazilian isolates and might be useful to provide reliable support for the pest management decisions regarding the reality that is found at the vineyards in Brazil. Furthermore, the results presented here are important to the comprehension of pathogen\'s evolution when suffering from a selective pressure caused by the intensive use of fungicides.
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Épocas de poda na videira Niagara Rosada em Santa Rita do Araguaia - GO / Pruning times in the grapevine Niagara Rosada in Santa Rita do Araguaia Goiás

MARTINS, Wesley Alves 24 July 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2014-07-29T14:42:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Weslwy alves martins.pdf: 1658428 bytes, checksum: 034cb01372fc23e0a439a66aedfd973a (MD5) Previous issue date: 2007-07-24 / The experiment was carried out in Santa Rita do Araguaia Goiás, in a commercial orchard settled in the Sperafico Site, with total area of 1,7 ha, placed on BR-364 Rd, Km 372, from Goiânia to Cuiabá. This trial with the grapevine Niagara Rosada was done from October 2007 to October 2008. The aim of the research was to study the characteristics of the cultivar Niagara Rosada (Vitis labrusca L.) undergone ten pruning times in Santa Rita do Araguaia GO. The cycle duration (pruning harvest) varied from 121 to 141 days for the 10 pruning times. The pruning times presented differences in the sum of degree-days needed to complete the cycle in the same site. The pruning times did not affect the form of the bunches significantly. Nevertheless, they affected the size of the bunches significantly, especially pruning time P9 (5/10/2008) with 11,60cm and P10 (5/24/2008). The largest berry diameter was found in the pruning times P1 (10/24/2007) and P2 (11/09/2007), with 18,60mm and 18,0mm respectively, patterns considered appropriate for cultivation of Niagara Rosada . The different pruning times showed influence on soluble solids levels, with the highest average of 18.4 ºBrix for pruning time P8 (4/26/2008). However, there was significant variation for the acidity titratable, and for the Ph, the highest value was 4.0, in pruning times P8, P9 and P10. The highest yield was obtained in pruning times P7 (3/28/2008) with 12,63 t ha and P10 (5/24/2008) with 12,12 t ha. Taking into account the thermal requirements and the cycle of the grapevine Niagara Rosada in Santa Rita do Araguaia, it is possible to estimate the date for each of the phenological sub- periods, as well as to predict harvest time. / O experimento foi desenvolvido no município de Santa Rita do Araguaia Goiás, em pomar comercial instalado no Sítio Sperafico, com área total de 1,7 ha, localizado na rodovia BR-364, km 372 no sentido Goiânia-Cuiabá. A condução do experimento com a videira Niagara Rosada foi durante o período de outubro de 2007 a outubro de 2008. O presente trabalho teve por objetivo estudar as características da cultura da uva Niagara Rosada (Vitis labrusca L.) submetida a dez épocas de poda no município de Santa Rita do Araguaia GO. A duração do ciclo produtivo (poda colheita) variou de 121 a 141 dias para as 10 épocas poda. As épocas de poda apresentaram diferenças no somatório de graus-dia necessários para completar o ciclo no mesmo local. As épocas de podas não afetaram significativamente a forma dos cachos, entretanto, afetaram significativamente o tamanho dos cachos, com maior destaque para as épocas E9 (10/05/08) com 11,60cm e E10 (24/05/08). O maior diâmetro de baga foi encontrado nas podas E1 (24/10/07) e E2 (09/11/07) com médias de 18,60mm e 18,0mm respectivamente, médias consideradas adequadas para a Niagara Rosada. As diferentes épocas de poda exerceram influência sobre os teores de sólidos solúveis, com uma maior média de 17,40 ºBrix para época E8 (26/04/08). Todavia, houve variação significativa acidez titulável, e para o pH, o valor mais elevado foi 4,0, nas podas E8, E9 e E10. A maior produtividade foi verificada para as épocas E7 (28/03/08) com 12,63 t/ha e E10 (24/05/08) com 12,12 t/ha. Conhecendo-se a exigência térmica e o ciclo da videira Niagara Rosada em Santa Rita do Araguaia, é possível estimar a data em que ocorrerá cada um dos subperíodos fenológicos e prever a época de colheita.
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Avaliação de uma região hotspot do gene citocromo b para resistência aos fungicidas inibidores da quinona oxidase (QoI) em patógenos de uva Niágara Rosada / Evaluating a hotspot region of the cytochrome b gene related to the resistance to quinone oxidase inhibitor (QoI) fungicides in pathogens of Niagara Rosada grapevine

Nathália de Moraes 26 August 2016 (has links)
A videira é uma das plantas mais antigas cultivadas pela humanidade, sendo que no Brasil a uva é a terceira fruta com maior volume de produção, atrás apenas do cultivo das bananas e das laranjas. Apesar da produção rentável, principalmente aos pequenos produtores, o parreiral é susceptível a várias doenças cujo manejo compromete até 59% dos gastos do produtor. No estado de São Paulo, dentre as doenças, três têm destaque: a antracnose (causada pelo Sphaceloma ampelinum), o míldio da videira (causado pelo Plasmopara viticola) e a ferrugem (causada pelo Phakopsora euvitis). Os produtores utilizam controle químico de forma intensa e preventiva, chegando a 100 aplicações de fungicidas em um ciclo de até 120 dias. Os principais fungicidas utilizados são os inibidores da quinona oxidase (QoI), que agem impedindo o transporte de elétrons do citocromo b ao citocromo c1 na cadeia respiratória da mitocôndria. Porém, existem relatos de resistência ao fungicida aplicado no campo em diversos países. As substituições G143A, G137R e F129L na sequência da proteína citocromo b impedem que o fungicida se ligue ao seu sítio alvo. As mutações que levam às substituições estão localizadas em uma das regiões chamada hotspot do gene citocromo b (cytB). Visto que, pela carência de estudos, a resistência genética a esses fungicidas nunca foi relatada no Brasil, o objetivo principal desse trabalho foi sequenciar e caracterizar a região hotspot em isolados de míldio, ferrugem e antracnose provenientes de parreirais do estado de São Paulo. Foram selecionados 35 isolados de 11 locais diferentes; desses, 11 isolados de míldio foram considerados geneticamente resistentes, pois apresentam a mutação para o resíduo alanina na posição 143, e 4 isolados foram considerados geneticamente sensíveis. Os dois isolados de ferrugem selecionados também foram considerados geneticamente sensíveis. Pela estratégia de Genome Walking foi possível sequenciar 65% do gene cytB de um dos isolados brasileiros de P. viticola; foram encontrados poucos polimorfismos e nenhum íntron na sequência analisada. Os resultados obtidos com esse estudo podem servir de suporte para a tomada de decisões de manejo mais adequadas para a realidade da viticultura brasileira; além disso, são importantes para futuros estudos sobre a evolução do patógeno com a pressão seletiva exercida pelos fungicidas. / Grapevine is one of the most ancient cultivated plants and its fruit, grape, is notably important in Brazil, since it is the third most produced, only behind banana and citrus. Although it is rentable especially to smallholders, the vineyard is often attacked by several pathogens and the damages induced by them can compromise up to 59% of the producers\' expenses in order to keep the diseases under control. In Sao Paulo state there are three important diseases that attack vineyards: anthracnose (caused by Sphaceloma ampelinum), downy mildew (caused by Plasmopara viticola) and rust (caused by Phakopsora euvitis). Pest management practices used by the producers relies on intensive and preventive use of fungicides, in which the culture is sprayed 100 times per vineyard\'s growth cycle (that last approximately 120 days). One of the most used fungicides are the quinone oxidase inhibitors (QoI), that act by blocking the electron transport chain at the mitochondria binding at the Qo site of the cytochrome b (cytB) complex. However, there are several reports of the presence of resistant strains in different countries. Resistance is caused by the aminoacids substitutions F129L, G137R and G143A in the cytochrome b protein sequence, that prevent the fungicide molecule binding to its target site. The mutations in the cytB gene that lead to these substitutions are harbored in a region called hotspot for fungicide resistance. Since this type of study was never reported in Brazil, the main purpose of this work was to sequence and characterize the hotspot region of different isolates from anthracnose, downy mildew and rust. Thirty five isolates from eleven different locations were choosen for the study. Eleven of them harbored the mutation that lead to the substitution G143A; these were then considered genetically resistant to the QoI fungicides. On the contrary, four downy mildew and the two rust isolates were considered sensitive to the QoI fungicides, since none of the aminoacids substitutions were observed. Also, by using a technique named Genome Walking it was possible to sequence 65% of cytB gene from a Brazilian downy mildew isolate. In this sequence were found few polymorphisms and none intron. These study findings are unique for Brazilian isolates and might be useful to provide reliable support for the pest management decisions regarding the reality that is found at the vineyards in Brazil. Furthermore, the results presented here are important to the comprehension of pathogen\'s evolution when suffering from a selective pressure caused by the intensive use of fungicides.

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