As interações que ocorrem entre as bactérias e amebas podem dar-se através de relações mútuas, onde ambos os organismos se beneficiam da associação ou parasitárias, em que um organismo se beneficia em detrimento do outro. Quando esses organismos compartilham o mesmo ambiente, pode resultar em algumas alterações, seja no crescimento dos organismos, nos padrões de adaptação, na morfologia, no seu desenvolvimento ou até mesmo na sua capacidade para sintetizar proteínas e outras substâncias. No presente estudo, avaliou-se a interação entre Acanthamoeba polyphaga e Staphylococcus aureus (MRSA) através de um modelo de cocultivo em diferentes tempos de incubação. A partir deste, 89% das células amebianas permaneceram viáveis após contato com a bactéria. O isolado bacteriano foi visualizado no interior da ameba através de microscopia confocal e de fluorescência em até 216 horas de cocultivo, sendo considerado um microrganismo resistente à ameba. O contato de A. polyphaga com S. aureus (MRSA) não demonstrou alteração fenotípica da ameba através dos testes fisiológicos de osmo e termotolerância. O lisado da cultura amebiana aumentou o crescimento de S. aureus (MRSA) nos diferentes tempos de incubação, porém houve diferença significativa apenas entre o controle e 96 horas de cocultivo. O crescimento de S. aureus (MRSA) foi inibido ao longo dos tempos de incubação pelo efeito do sobrenadante da cultura amebiana apresentando diferença significativa entre o controle e 96 horas de cocultivo, sugerindo-se que A polyphaga tenha secretado algum tipo de metabólito, que inibiu o crescimento da bactéria. A interação dos microrganismos não apresentou alterações significativas no perfil de susceptibilidade aos antibióticos testados. S. aureus (MRSA) permaneceu viável em cistos de A. polyphaga, reforçando a hipótese de que Acanthamoeba pode desempenhar um papel crucial na propagação de S. aureus (MRSA) na comunidade e ambiente hospitalar. O maior percentual de amebas encistadas deu-se em 96 horas de incubação quando cocultivadas com o isolado de S. aureus (MRSA), apresentando um aumento progressivo deste percentual a cada período de incubação. A partir disso, estudos devem intensificar-se para melhor compreender os mecanismos de virulência envolvidos na interação entre ambos os microrganismos. / The interactions that occur between bacteria and amoebae can give through mutual relations, where both organisms benefit from the association or parasitic in which one organism benefits at the expense of the other. When these organisms share the same environment, can result in some changes in the growth of organisms, in adaptation patterns, in morphology, development or even in their ability to synthesize proteins and other substances. In the present study, we evaluated the interaction between Acanthamoeba polyphaga and Staphylococcus aureus (MRSA) using a coculture model at different incubation times. From this, 89% of amoebic cells remain viable after contact with the bacteria. The bacterial isolate was visualized inside the amoeba through confocal microscopy and fluorescence for up to 216 hours of cocultivation, being considered a resistant microorganism to the amoeba. The contact of A. polyphaga with S. aureus (MRSA) showed no phenotypic changes of amoeba through physiologic osmo or thermotolerance tests. The lysate of amoebic culture increased the growth of S. aureus (MRSA) in the different incubation times, but there was a significant difference only between the control and 96 hours of cocultivation. The growth of S. aureus (MRSA) has been inhibited over the incubation times for the effect of amoebic culture supernatant showing a significant difference between the control and 96 hours of coculture, suggesting tha A. polyphaga has some kind of secreted metabolites inhibiting the growth of bacteria. The interaction of microorganisms showed no significant changes in the susceptibility profile of the tested antibiotics. S. aureus (MRSA) remained viable cysts of A. polyphaga, reinforcing the hypothesis that Acanthamoeba can play a crucial role in the spread of S. aureus (MRSA) in the community and hospital. The highest percentage of encysted amoebae occurred in 96 hours of incubation when cocultured with the isolate of S. aureus (MRSA), with a progressive increase in this percentage to each incubation period. From this, studies should be intensified to better understand the virulence mechanisms involved in the interaction between these two organisms.

Orientador: Maria de Lourdes Ribeiro de Souza da Cunha / Resumo: As infecções do trato urinário (ITU) estão entre as doenças infecciosas mais comuns na prática clínica, e Staphylococcus saprophyticus se destaca como o segundo agente etiológico mais isolado nessas infecções. Esse estudo objetiva caracterizar o perfil clonal, os fatores de virulência e o perfil de resistência aos antimicrobianos em isolados planctônicos e em biofilme de S. saprophyticus isolado de amostras de urina de pacientes com infecção do trato urinário, além de comparar a identificação de espécies de ECN obtida no Vitek 2 e no Maldi-TOF MS com a identificação genotípica. Foram utilizadas no estudo amostras de S. saprophyticus isoladas da urina de diferentes pacientes. As amostras utilizadas no estudo foram obtidas em estudo prospectivo conforme isolamento no Laboratório de Microbiologia do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu (HC-FMB) nos anos de 2013 e 2014, e comparadas com um banco de amostras previamente coletadas em 2008. As amostras foram coletadas de paciente procedentes de enfermarias, ambulatórios, pronto-socorro e unidades básicas de saúde de Botucatu e região. Foram estudadas 217 amostras de ECN de pacientes com ITU. A concordância do sistema automatizado Vitek 2 com o ITSPCR foi de 84,8%, com sensibilidade e especificidade de 98% e 100%, respectivamente. Maldi-TOF MS identificou corretamente todas as amostras de ECN. Os resultados obtidos através da análise de PFGE permitiram identificar 41 perfis distintos, entre os quais foram encont... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor

GONÇALVES, M. H. R. B. Análise da associação dos marcadores cagT, LEC e oipA funcional e não funcional do Helicobacter pylori em afecções gástricas. 2015. 65 f. Tese (Doutorado em Farmacologia) - Faculdade de Farmácia, Odontologia e Enfermagem, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2015. / Submitted by Erika Fernandes (erikaleitefernandes@gmail.com) on 2017-02-16T15:22:57Z No. of bitstreams: 1 2015_tese_mhrbgoncalves.pdf: 2117891 bytes, checksum: 5e06f32a5a690624261d19c255b29315 (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Fernandes (erikaleitefernandes@gmail.com) on 2017-02-16T15:23:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_tese_mhrbgoncalves.pdf: 2117891 bytes, checksum: 5e06f32a5a690624261d19c255b29315 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-16T15:23:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_tese_mhrbgoncalves.pdf: 2117891 bytes, checksum: 5e06f32a5a690624261d19c255b29315 (MD5) Previous issue date: 2015-12-15 / The Helicobacter pylori is a bacterium that colonizes the gastric mucosa of human beings. The chronic infection caused by this pathogen is strongly associated with an increased risk for gastric illnesses different, ranging from chronic gastritis and peptic ulcer for two types of gastric cancer, adenocarcinoma and lymphoma of the lymphoid tissue associated to mucosa. The aim of this study was to evaluate the association of cagT markers, LEC, functional and nonfunctional oipA in patients with disorders of gastritis, ulcers and stomach cancer. Genotyping of the strains was performed by PCR. Were evaluated 181 patients attended at the University Hospital Walter Cantídio, 87 (48.1%) men, 94 (51.9%) women, with ages ranging from 18-90 years, mean age of 53 + 17.8 years, with a positive diagnosis for H. pylori infection, these 48 carriers of gastric cancer, 69 patients with peptic ulcer and 64 with gastritis. The prevalence of the genotypes studied was: 145/181 (80.1%) cagT, 83/181 (45.9%) LEC 81/181 (44.7%) oipA and oipA"on"34/81.In the group of patients with gastric cancer was observed that the most frequent genotype was the cagT 43/48 (89,5%), followed by the oipA gene "on" 10/18 (55.6%) and LEC 17/48 (35.4%). In the group of patients with peptic ulcer genotype was the most frequent cagT 62/69 (89.8%), followed by gene LEC, 34/69 (49.3%) and the oipA"on" 13/31 (41.9%). In the group of patients with the most frequent genotype gastritis was cagT 40/64 (62.5%), followed by gene LEC 32/64 (50.0%) and the oipA "on" 11/32 (34.4%). Furthermore, by the presented data there is no association of H. pylori and gender and or age of the patients.The genetic study of the markers of H. pylori infection and its relationship with the gastric disorders is essential to establish the profile of virulence of strains and thus elucidate the clinical outcomes variables involved with this infection. / O Helicobacter pylori é uma bactéria que coloniza a mucosa gástrica de seres humanos. A infecção crônica causada por este patógeno está fortemente associada a um risco aumentado de doenças gástricas diferentes, variando de gastrite crônica e úlcera péptica para dois tipos de câncer gástrico, adenocarcinoma e linfoma do tecido linfóide associado à mucosa. O objetivo do presente estudo foi avaliar a associação dos marcadores cagT, LEC e oipA funcional e não funcional em pacientes portadores das afecções gastrite, úlcera e câncer gástrico.Foi realizada a genotipagem das cepas por meio da técnica de PCR. Foram avaliados 181 pacientes, atendidos no Hospital Universitário Walter Cantídio, sendo 87(48,1%) homens, 94(51,9%) mulheres, com idade variando de 18-90 anos, com média de 53 + 17,8 anos, com diagnóstico positivo para a infecção por H. pylori. Destes, 48 portadores de câncer gástrico, 69 pacientes com ‘úlcera péptica e 64 com gastrite. A prevalência dos genótipos estudados foi: 145/181 (80,1%) cagT, 83/181 (45,9%) LEC, 81/181 (44,7%) oipA, e oipA“on”34/81 (41,9%).No grupo dos pacientes com câncer gástrico observou-se que o genótipo mais frequente foi o cagT 43/48 (89,6%), seguido do gene oipA “on” 10/18 (55,6%) e LEC 17/48 (35,4%). No grupo dos pacientes com úlcera péptica o genótipo mais frequente foi o cagT 62/69 (89,8%), seguido do gene LEC; 34/69 (49,3%) e oipA”on” 13/31 (41,9%). No grupo dos pacientes com gastrite o genótipo mais frequente foi cagT 40/64 (62,5%), seguido do gene LEC 32/64 (50,0%) e oipA “on” 11/32 (34,4%). Não houve associação significativa dos genótipos do H. pylori com gênero, nem com faixa etária dos pacientes. O estudo genético dos marcadores de H. pylori e sua relação com as afecções gástricas é fundamental para se estabelecer o perfil de virulência das cepas e assim elucidar os variáveis desfechos clínicos envolvidos com essa infecção.

GONÇALVES, M. H. R. B. Análise da associação dos marcadores cagT, LEC e oipA funcional e não funcional do Helicobacter pylori em afecções gástricas. 2015. 65 f. Tese (Doutorado em Cirurgia) - Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2015. / Submitted by Erika Fernandes (erikaleitefernandes@gmail.com) on 2017-02-23T13:16:41Z No. of bitstreams: 1 2015_tese_mhrbgoncalves.pdf: 2117891 bytes, checksum: 5e06f32a5a690624261d19c255b29315 (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Fernandes (erikaleitefernandes@gmail.com) on 2017-02-23T13:16:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_tese_mhrbgoncalves.pdf: 2117891 bytes, checksum: 5e06f32a5a690624261d19c255b29315 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-23T13:16:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_tese_mhrbgoncalves.pdf: 2117891 bytes, checksum: 5e06f32a5a690624261d19c255b29315 (MD5) Previous issue date: 2015-12-15 / The Helicobacter pylori is a bacterium that colonizes the gastric mucosa of human beings. The chronic infection caused by this pathogen is strongly associated with an increased risk for gastric illnesses different, ranging from chronic gastritis and peptic ulcer for two types of gastric cancer, adenocarcinoma and lymphoma of the lymphoid tissue associated to mucosa. The aim of this study was to evaluate the association of cagT markers, LEC, functional and nonfunctional oipA in patients with disorders of gastritis, ulcers and stomach cancer. Genotyping of the strains was performed by PCR. Were evaluated 181 patients attended at the University Hospital Walter Cantídio, 87 (48.1%) men, 94 (51.9%) women, with ages ranging from 18-90 years, mean age of 53 + 17.8 years, with a positive diagnosis for H. pylori infection, these 48 carriers of gastric cancer, 69 patients with peptic ulcer and 64 with gastritis. The prevalence of the genotypes studied was: 145/181 (80.1%) cagT, 83/181 (45.9%) LEC 81/181 (44.7%) oipA and oipA"on"34/81.In the group of patients with gastric cancer was observed that the most frequent genotype was the cagT 43/48 (89,5%), followed by the oipA gene "on" 10/18 (55.6%) and LEC 17/48 (35.4%). In the group of patients with peptic ulcer genotype was the most frequent cagT 62/69 (89.8%), followed by gene LEC, 34/69 (49.3%) and the oipA"on" 13/31 (41.9%). In the group of patients with the most frequent genotype gastritis was cagT 40/64 (62.5%), followed by gene LEC 32/64 (50.0%) and the oipA "on" 11/32 (34.4%). Furthermore, by the presented data there is no association of H. pylori and gender and or age of the patients.The genetic study of the markers of H. pylori infection and its relationship with the gastric disorders is essential to establish the profile of virulence of strains and thus elucidate the clinical outcomes variables involved with this infection. / O Helicobacter pylori é uma bactéria que coloniza a mucosa gástrica de seres humanos. A infecção crônica causada por este patógeno está fortemente associada a um risco aumentado de doenças gástricas diferentes, variando de gastrite crônica e úlcera péptica para dois tipos de câncer gástrico, adenocarcinoma e linfoma do tecido linfóide associado à mucosa. O objetivo do presente estudo foi avaliar a associação dos marcadores cagT, LEC e oipA funcional e não funcional em pacientes portadores das afecções gastrite, úlcera e câncer gástrico.Foi realizada a genotipagem das cepas por meio da técnica de PCR. Foram avaliados 181 pacientes, atendidos no Hospital Universitário Walter Cantídio, sendo 87(48,1%) homens, 94(51,9%) mulheres, com idade variando de 18-90 anos, com média de 53 + 17,8 anos, com diagnóstico positivo para a infecção por H. pylori. Destes, 48 portadores de câncer gástrico, 69 pacientes com ‘úlcera péptica e 64 com gastrite. A prevalência dos genótipos estudados foi: 145/181 (80,1%) cagT, 83/181 (45,9%) LEC, 81/181 (44,7%) oipA, e oipA“on”34/81 (41,9%).No grupo dos pacientes com câncer gástrico observou-se que o genótipo mais frequente foi o cagT 43/48 (89,6%), seguido do gene oipA “on” 10/18 (55,6%) e LEC 17/48 (35,4%). No grupo dos pacientes com úlcera péptica o genótipo mais frequente foi o cagT 62/69 (89,8%), seguido do gene LEC; 34/69 (49,3%) e oipA”on” 13/31 (41,9%). No grupo dos pacientes com gastrite o genótipo mais frequente foi cagT 40/64 (62,5%), seguido do gene LEC 32/64 (50,0%) e oipA “on” 11/32 (34,4%). Não houve associação significativa dos genótipos do H. pylori com gênero, nem com faixa etária dos pacientes. O estudo genético dos marcadores de H. pylori e sua relação com as afecções gástricas é fundamental para se estabelecer o perfil de virulência das cepas e assim elucidar os variáveis desfechos clínicos envolvidos com essa infecção.

MOREIRA, C. A. Estudo de sensibilidade do biofilme de Burkholderia pseudomallei a antibióticos de uso clínico e farnesol. 2013. 115 f. Tese (Doutorado em Microbiologia Médica) - Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2013. / Submitted by Erika Fernandes (erikaleitefernandes@gmail.com) on 2016-10-03T15:38:15Z No. of bitstreams: 1 2013_tese_camoreira.pdf: 2691368 bytes, checksum: 33ff8ee13ee8b744ebce1f67d391647c (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Fernandes (erikaleitefernandes@gmail.com) on 2016-10-03T15:38:53Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_tese_camoreira.pdf: 2691368 bytes, checksum: 33ff8ee13ee8b744ebce1f67d391647c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-03T15:38:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_tese_camoreira.pdf: 2691368 bytes, checksum: 33ff8ee13ee8b744ebce1f67d391647c (MD5) Previous issue date: 2013-09-27 / The melioidosis is an emerging infectious disease, especially in northeastern Brazil, with serious international implications, as well as a public health problem. Caused by the bacillus Burkholderia pseudomallei, this infection appears from tables asymptomatic to severe and often fatal frames. The high mortality rate of the disease (20-50%) make it a priority for global health agencies. In Brazil, cases of melioidosis were first reported in 2003 in Tejuçuoca municipality in Ceará. Since then, new cases of melioidosis were diagnosed in six other municipalities in Ceará. B. pseudomallei is intrinsically resistant to many antibiotics and recent studies have described cases of antimicrobial resistance used in the treatment of melioidosis. The investigation of the biofilm forming capacity of B. pseudomallei seems to be essential, since the biofilm allows the development of microcolonies within a protected environment, which relates to the environmental protection, adhesion, colonization, immune evasion and bonding the environmental cell. Therefore, the development of therapeutic alternatives antibiofilm, including new drugs is needed. Indeed, this study aimed to characterize the strains of B. pseudomallei of LAPERE collection as the biofilm production capacity and sensitivity in planktonic growth and biofilm. Selected drugs were ceftazidime (CAZ), doxycycline (DOX), imipenem (IPM), amoxicillin / clavulanate (AMC) and trimethoprim / sulfamethoxazole (SXT); and farnesol (FNS). All strains were classified as biofilm producers, being divided into: hard (5 strains), moderate (3 strains), and low (1 strain). Mean values ​​of minimum inhibitory concentration (MIC), minimum inhibitory concentration of biofilm (MBIC) and concentration minimum biofilm eradication in (MBEC) for these strains were determined for AMC (MIC 10.2 / 5.1 mg / L, 21 MBIC 3 / 10.6 mg / L and MBEC 27.6 / 13.8 mg / L) to CAZ (MIC 5.6 mg / L, MBIC 120.4 mg / L and MBEC 419.6 mg / L) to doxorubicin (MIC 0.28 mg / L, MBIC 1.3 mg / L and MBEC 3.8 mg / L) to IPM (MIC 0.597 mg / L, MBIC ≥ 256 mg / L and MBEC> 256 mg / G) to SXT (MIC 1.25 / 23.75 mg / L, MBIC ≤ 0.5 / 9.5 mg / L and MBEC <0.72 / 13.72 mg / L), and NSF (MIC and MBIC equal to 150 uM / L). The data obtained show especially for the inhibitory potential of three antibiotics studied - AMC, DOX and SXT and farnesol against strains of B. pseudomallei associated with biofilm. However, further studies are needed to investigate the mechanisms of action of these drugs on the biofilm, as well as the design of in vivo experiments to confirm the significance of these findings clinically. Moreover, the growth of these strains melanin formation conditions and biofilm showed that this combination makes them more resistant strains to the action of imipenem and farnesol. / A melioidose é uma doença infeciosa emergente, notadamente no nordeste do Brasil, com sérias implicações internacionais, assim como um problema de saúde pública. Causada pelo bacilo Burkholderia pseudomallei, esta infecção se apresenta desde quadros assintomáticos a quadros graves e frequentemente fatais. As altas taxas de mortalidade da doença (20 a 50%) a tornam uma prioridade para orgãos globais de saúde. No Brasil, casos de melioidose foram relatados pela primeira vez em 2003, no município de Tejuçuoca no Ceará. Desde então, novos casos de melioidose foram diagnosticados em outros seis municípios cearenses. B. pseudomallei é intrinsecamente resistente a muitos antibióticos e estudos recentes já descrevem casos resistência aos antimicrobianos utilizados no tratamento da melioidose. A investigação da capacidade de formação de biofilme por B. pseudomallei parece ser fundamental, já que o biofilme permite o desenvolvimento de microcolônias dentro de um ambiente protegido, o qual se relaciona com a proteção ambiental, adesão, colonização, evasão do sistema imune e ligação a células ambientais. Portanto, o desenvolvimento de alternativas terapêuticas antibiofilme, incluindo novas drogas, é necessário. Com efeito, este estudo teve como objetivo caracterizar as cepas de B. pseudomallei da coleção do LAPERE quanto à capacidade de produção de biofilme e sensibilidade em crescimento planctônico e em biofilme. As drogas selecionadas foram: ceftazidima (CAZ), doxiciclina (DOX), imipenem (IPM), amoxicilina/clavulanato (AMC) e sulfametoxazol/trimetoprim (SXT); e farnesol (FNS). Todas as cepas foram classificadas como produtoras de biofilme, sendo divididas em: forte (5 cepas), moderada (3 cepas), e fraca (1 cepa). Valores médios de concentração inibitória mínima (MIC), concentração inibitória mínima em biofilme (MBIC) e concentração de erradicação mínima em biofilme (MBEC) para estas cepas foram determinados para AMC (MIC 10,2/5,1 mg/L, MBIC 21,3/10,6 mg/L e MBEC 27,6/13,8 mg/L), para CAZ (MIC 5,6 mg/L, MBIC 120,4 mg/L e MBEC 419,6 mg/L), para DOX (MIC 0,28 mg/L, MBIC 1,3 mg/L e MBEC 3,8 mg/L), para IPM (MIC 0,597 mg/L, MBIC ≥ 256 mg/L e MBEC > 256 mg/L), para SXT (MIC 1,25/23,75 mg/L, MBIC ≤ 0,5/9,5 mg/L e MBEC < 0,72/13,72 mg/L), e para FNS (MIC e MBIC iguais a 150 µM/L). Os dados obtidos apontam especialmente para o potencial inibitório de três dos antibióticos estudados - AMC, DOX e SXT, e farnesol contra cepas de B. pseudomallei associadas a biofilme. Todavia, são necessários novos estudos para investigar os mecanismos de ação dessas drogas sobre o biofilme, bem como o delineamento de experimentos in vivo para confirmar a significância desses achados clinicamente. Ademais, o crescimento dessas cepas em condições de formação de melanina e biofilme evidenciou que esta associação torna as cepas mais resistentes à ação de imipenem e farnesol.

MAIA, K. C. S. C. Marcadores de virulência do Helicobacter pylori em crianças e adolescentes residentes em uma comunidade de Fortaleza. 2015. 77 f. Dissertação (Mestrado em Cirurgia) - Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2015. / Submitted by Erika Fernandes (erikaleitefernandes@gmail.com) on 2017-05-12T13:29:56Z No. of bitstreams: 1 2015_dis_kcscmaia.pdf: 3185347 bytes, checksum: cea4102b239ee541c3a0365f6f9593c9 (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Fernandes (erikaleitefernandes@gmail.com) on 2017-05-12T13:30:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_dis_kcscmaia.pdf: 3185347 bytes, checksum: cea4102b239ee541c3a0365f6f9593c9 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-12T13:30:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_dis_kcscmaia.pdf: 3185347 bytes, checksum: cea4102b239ee541c3a0365f6f9593c9 (MD5) Previous issue date: 2015-09-29 / The Helicobacter pylori infect about half of the world’s population and is related to the development of gastric disorders. The infection is generally acquired during childhood and the bacterium demonstrates a high level of genotypic diversity, the expression of various genes that confer greater virulence strains. The aim of this study was to evaluate genetic markers of virulence of H. pylori strains in children and adolescents resident in the Community Parque Universitario in Fortaleza, Ceara. The gastric juice, for the culture and the DNA extraction of H. pylori, was collected from Enterotest. The genotyping of strains was carried out by the PCR technique. We evaluated 94 individuals, of which 61 (64.9%) H. pylori positive by culture and PCR for gene ureA, 30 (49.2%) males and 31 (50.8%) females. The age ranged 08-18 years, mean age of 12,82 + 3,052. The prevalence of genotypes was: 50/61 (82.0%) cagA, 26/61 (42.6%) cagE, 18/61 (29.5%) babA2, 14/61 (23.0%) homA, 13/61 (21.3%) homB, 31/61 (50.8%) homA/homB. There was no significant association of H. pylori genotypes with the genre, neither with age range of individuals. There was also no association of cagA with other genotypes, although it noted a strong association with homB (p = 0.057). The prevalence of cagE, babA2, and hom was much lower than that described in the literature for children and symptomatic adults, suggesting that, after infection in childhood, the individual strains may change during the course of infection. / O Helicobacter pylori infecta cerca de metade da população mundial e apresenta forte relação com as principais afecções gástricas. A aquisição desta bactéria ocorre principalmente na infância, e a mesma demonstra um alto nível de diversidade genotípica, pela expressão de vários genes que conferem maior patogenicidade a esse microorganismo. O objetivo do presente estudo foi avaliar marcadores genéticos de virulência das cepas de H. pylori em crianças e adolescentes residentes na comunidade Parque Universitário em Fortaleza, Ceará. O suco gástrico, utilizado para cultivo e extração do DNA do H. pylori, foi colhido através do Enteroteste. A genotipagem das cepas foi realizada através da técnica de PCR. Participaram do estudo 94 indivíduos, dos quais 61 (64,9%) foram positivos para H. pylori através da cultura e do PCR para o gene ureA, sendo 30 (49,2%) do gênero masculino e 31 (50,8%) do feminino. A idade variou de 08 a 18 anos, com média de 12,82 + 3,052. A prevalência dos genótipos estudados foi: 50/61 (82,0%) cagA, 26/61 (42,6%) cagE, 18/61 (29,5%) babA2, 14/61 (23,0%) homA, 13/61 (21,3%) homB, 31/61 (50,8%) homA/homB. Não houve associação significativa dos genótipos do H. pylori com gênero, nem tampouco com a faixa etária dos indivíduos. Também não houve associação de cagA com os demais genótipos, embora note-se uma forte tendência de associação deste com homB (p = 0,057). A prevalência encontrada para cagE, babA2 e hom foi abaixo do descrito na literatura para crianças e adultos sintomáticos, sugerindo que, após a infecção na infância, as cepas do indivíduo podem sofrer alterações durante o curso da infecção.

REIS, A. C. M. Fatores de virulência e produção de biofilme de Bacteroides fragilis isolados da microbiota intestinal de cães. 2013. 87 f. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Médica) - Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2013. / Submitted by Carolinda Oliveira (ppgmm@ufc.br) on 2017-07-27T12:53:54Z No. of bitstreams: 1 2013_dis_acmreis.pdf: 83159321 bytes, checksum: 8a4f3a15527a5e48751e49ec6d7dbc42 (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Fernandes (erikaleitefernandes@gmail.com) on 2017-07-27T15:17:11Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_dis_acmreis.pdf: 83159321 bytes, checksum: 8a4f3a15527a5e48751e49ec6d7dbc42 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-27T15:17:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_dis_acmreis.pdf: 83159321 bytes, checksum: 8a4f3a15527a5e48751e49ec6d7dbc42 (MD5) Previous issue date: 2013-01-08 / Bacteroides fragilis is part of the fecal microbiota of animals, yet it is the most pathogenic species of the genus Bacteroides. The transformation these microrganisms commensals in pathogens agents is mainly due to its virulence factors. This microorganism has been isolated from several infections in dogs. Considering the pathogenic potential of B. fragilis and its importance in veterinary medicine, this study was designed to evaluate the virulence factors and biofilm formation of Bacteroides fragilis isolated from fecal samples from dogs. The samples used in this study were collected at the Veterinary Clinic of the State University of Ceará and processed at the Laboratory of Bacteriology of the Federal University of Ceará. Were phenotypically analyzed the virulence factors (production of hemolysins and hemagglutinins, hydrophobicity, the presence of the enzyme β-lactamase and capsule) and biofilm production of 13 strains of B. fragilis. To determine the pattern of sensitivity to clindamycin, metronidazole, chloramphenicol and penicillin was used in agar dilution technique. In vitro assays for detection of biofilms were performed by the methods Congo Red agar and Accession in microplates. All strains of B. fragilis showed capsule and produced no haemolysis. Regarding the production of hemagglutinin, 38% of the strains showed hemagglutination when used canine blood and 15% in human blood (A+). Of the strains studied, 7% had a cell surface hydrophobic. In total, 61% of the strains showed β-lactamase test positive. As regards the production of biofilm was observed by the method of strokes that 12 (92.3%) of the biofilm producers were isolated by the method and Adhesion microplates, it was found that eight (61.5%) strains were able to produce biofilm. All isolates were susceptible to metronidazole and resistant to penicillin and chloramphenicol. The rate of clindamycin resistance was 69.2%. This study showed that species B. fragilis isolated from normal canine microflora showed major virulence factors for pathogenicity, they possess the ability to form biofilms and show a high rate of resistance to clindamycin. / Bacteroides fragilis faz parte da microbiota fecal de animais, contudo é a espécie mais patogênica do gênero Bacteroides. A sua transformação de um microrganismo comensal para agente patogênico deve-se principalmente aos seus fatores de virulência. Este micro-organismo tem sido isolado de diversas infecções em cães. Considerando o potencial patogênico de B. fragilis e sua importância na medicina veterinária, o presente trabalho foi elaborado com o objetivo de avaliar os fatores de virulência e formação de biofilme de Bacteroides fragilis isolados de amostras fecais de cães. As amostras utilizadas neste estudo foram coletadas na Clinica Veterinária da Universidade Estadual do Ceará (UECE) e processadas no Laboratório de Bacteriologia da Universidade Federal do Ceará (UFC). Foram analisadas fenotipicamente os fatores de virulência (produção de hemolisinas e hemaglutininas, hidrofobicidade, presença da enzima - lactamase e cápsula) e produção de biofilme de 13 cepas da espécie B. fragilis. Para determinação do perfil de sensibilidade a clindamicina, metronidazol, cloranfenicol e penicilina foi utilizada a técnica de diluição em Agar. Os ensaios in vitro para detecção de biofilme foram realizados pelos métodos Agar Vermelho Congo (AVC) e Adesão em microplacas. Todas as cepas de B. fragilis apresentaram cápsula e não produziram hemólise. Com relação à produção de hemaglutininas, 38% das cepas são capazes de aglutinar sangue canino e 15% em sangue humano (A+). Das cepas estudadas, 7% apresentaram uma superfície celular hidrofóbica. No total, 61% das cepas produziram teste da - lactamase positivo. Quanto a produção de biofilme, foi observado pelo método do AVC que 12 (92,3%) dos isolados eram produtores de biofilme e por meio do método de Adesão em Microplacas, verificou-se que 8 (61,5%) cepas foram capazes de produzir biofilme. Todos os isolados foram sensíveis ao metronidazol e cloranfenicol e resistentes à penicilina. A taxa de resistência à clindamicina foi de 69,2%. Esse estudo mostrou que espécies de B. fragilis isolados da microbiota normal de cães apresentaram fatores de virulência importantes para sua patogenicidade, possuem a capacidade de formar biofilme e demonstram uma alta taxa de resistência a clindamicina.

Os Enterococcus spp. apresentam uma natureza ubiquitária que lhes permite sobreviver em diversos nichos ecológicos. Estudos envolvendo enterococos isolados de animais marinhos são escassos. Em razão disso, este trabalho teve como objetivo isolar, identificar, avaliar o perfil de suscetibilidade aos antimicrobianos, a presença de fatores de virulência e a diversidade genética de enterococos isolados de amostras fecais de pinguins-de-magalhães (Spheniscus magellanicus) encontrados no Litoral Norte do Rio Grande do Sul, Brasil. No total, 172 enterococos foram isolados e identificados como E. faecalis (43%), E. faecium (33,7%), E. hirae (12,8%) e E. mundtii (10,5%). Cento e quatorze isolados foram sensíveis aos dez antimicrobianos testados. Fenótipos de resistência foram encontrados para ciprofloxacina (28,5%), eritromicina (25%), norfloxacina (14,5%) e tetraciclina (4,6%). Todos os isolados resistentes à tetracilina apresentavam o gene tet(M) e apenas dois não apresentaram o tet(L). O gene erm(B) não foi detectado nos resistentes à eritromicina. Genes de virulência, gelE e ace (43%) e asa (35,5%) foram detectados nos E. faecalis. A atividade de gelatinase foi verificada em 64 isolados. A maioria dos enterococos foi fraco formador de biofilme. A análise dos perfis gerados por PFGE revelou um grande número de clones. Em conclusão, os enterococos compõem a microbiota do trato gastrintestinal dos pinguins-de-magalhães e a detecção de determinantes de resistência e virulência indica que os enterococos podem constituir um reservatório de tais características e, sendo o ambiente marinho um meio de disseminação, é importante considerar o potencial deste gênero em ocasionar riscos à saúde desses animais e à do ecossistema marinho. / Enterococcus spp. shows a ubiquitous nature that enables survival in different ecological niches. Studies involving enterococci isolated from marine animals are scarce. For this reason, this study aimed to isolate, identify, evaluate the antimicrobial susceptibility profile, the presence of virulence factors and the genetic diversity of enterococci isolated from fecal samples of magellanic penguins (Spheniscus magellanicus) found in the North coast of Rio Grande do Sul, Brazil. Overall, 172 enterococci were isolated and identified as E. faecalis (43%) E. faecium (33.7%), E. hirae (12.8 %) and E. mundtii (10.5%). One hundred and fourteen isolates were susceptible to the ten tested antimicrobials. Resistance phenotypes were found for ciprofloxacin (28.5%), erythromycin (25%), norfloxacin (14.5%) and tetracycline (4.6%). The tetracycline resistant isolates showed the tet(M) gene and only two isolates didn’t present tet(L). The erm(B) gene wasn’t detected in erythromycin resistant isolates. Virulence genes, gelE/ ace genes (43%) and asa (35.5%) were found only in E. faecalis. The gelatinase activity was observed in 64 strains. The majority of enterococci were weak biofilm formers. The analysis of the profiles generated by PFGE has revealed a large number of clones. In conclusion, enterococci compose the microbiota of magellanic penguins and the detection of resistance and virulence determinants indicates that enterococci may constitute a reservoir of such characteristics and, as the marine environment is a way of dissemination, it is important to consider the potential of this genus in cause health risks of these animals and the marine ecosystem.

Made available in DSpace on 2016-04-04T12:35:26Z (GMT). No. of bitstreams: 2 natalia_gomes_ioc_mest_2014.pdf: 3321973 bytes, checksum: 59b3c4b51a637c1e44229ae143291433 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2014 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A doença de Chagas é uma doença negligenciada causada pelo protozoário parasita Trypanosoma cruzi, o qual afeta cerca de 6-8 milhões de pessoas em áreas endêmicas da América Latina. As diferentes cepas envolvidas na infecção, e sua distribuição regional, tem sido sugeridas como causa das diferentes manifestações clínicas, resposta ao diagnóstico e eficácia terapêutica. A ecto-NTPDase é uma enzima localizada na superfície externa da membrana plasmática do T.cruzi, que hidrolisa nucleotídeos tri e difosfatados. Estudos anteriores têm relacionado esta enzima à infectividade e virulência de tripanosomatídeos, além de sugerir um papel importante na captação de purinas pelos parasitos. Neste trabalho avaliamos os níveis de mRNA para a TcNTPDase-1 por RT-PCR, em diferentes isolados do parasito (Dm28c- T.cruzi I; Y- T.cruzi II; 3663- T.cruzi III; 4167- T.cruzi IV; LL014- T.cruzi V; CL-14- T.cruzi VI- avirulenta), em formas não-infectantes (epimastigotas) e infectantes (tripomastigotas e amastigotas). Os ensaios de PCR em Tempo Real foram realizados com oligonucleotídeos desenhados para amplificar uma sequência de 111pb do gene TcNTPDase-1 e, como controles endógenos, uma sequência de 268pb do gene da TcCalmodulina e uma sequência de 100pb do gene TcGAPDH foram utilizados. Nós observamos que epimastigotas das cepas Y, 3663, 4167 e LL014 apresentaram os mesmos níveis de expressão do gene TcNTPDase-1 que o clone CL-14, avirulento Por outro lado, o clone Dm28c expressou 7,2\F0B11,5 vezes mais o gene desta enzima que o clone CL-14. Além disso, observamos que as formas infectantes tripomastigota e amastigota apresentaram, respectivamente, uma expressão 22,5\F0B15,6 e 16,3\F0B13,8 vezes maior que a forma epimastigota. Observamos também que durante a curva de crescimento de formas epimastigotas a 28°C e 37°C a expressão deste gene aumenta gradativamente com o tempo de cultivo, sendo mais pronunciado a 37°C, sugerindo que o choque-térmico e o longo período de cultivo pode aumentar a expressão do gene da TcNTPDase-1. Em conjunto, nossos dados sugerem que a TcNTPDase-1 estaria envolvida nos processos de infectividade do T.cruzi, bem como adaptação do parasita a temperatura do hospedeiro vertebrado. Devido sua importância para o T.cruzi, a TcNTPDase-1 apresenta potencial para ser avaliada como possível alvo para quimioterapia da Doença de Chagas / Chagas disease is a negl ected illness caused by the parasite protozoan Trypanosoma cruzi , which affects 6 - 8 million people in endemic areas of Latin America . The distinct strains involved in infection, in conjunction with the regional distribution, have been suggested to cause di fferent clinical manifestations and therapeutic efficiency in Chagas Disease. The ecto - NTPDase is an apyrase located on the outer surface of T. cruzi plasma membrane - that hydrolyzes tri - and/or di - phosphate nucleotides . Previous studies related this enzyme to the infectivity and virulence of the parasite , and suggest an important role in the uptake of purines . In this study, we evaluate the mRNA levels for the e cto - NTPDase I by RT - PCR in distinct isolated parasites (Dm28c - T. cruzi I; Y - T. cruzi II; 3663 - T. cruzi III; 4167 - T. cruzi IV; LL014 - T.cruzi V ; CL - 14 - T. cruzi VI - avirulent ) , in non - infective forms (epimastigotes) and infective forms (amastigotes and trypomastigotes) . The Real Time PCR assays were performed with primers designed to amplify a 111b p seq uence in the TcNTPDase - 1 gene and, as endogenous controls, a 268bp sequence in the TcCalmoduline gene and a 100bp sequence in the Tc GAPDH gene were used. We observed that the epimastigotes of strain s Y, 3663, 4167 e LL014 expressed the same levels of the g ene of TcNTPDase - 1 that the CL - 14 clone, avirulent. On the other hand, the Dm28c clone expressed 7 . 2  1 . 5 times higher the gene of this enzyme that the C L - 14 clone. Surprisingly, w e observed that the trypomastigote and amastigote presented expression levels , respectively, 22 . 5  5 . 6 and 16 . 3  3 . 8 time s higher than the epimastigote form. Moreover, following the epimastigotes growth curve at 28°C e 37°C , we also observed that the expression of TcNTPDase - 1 increases with the days of growth, and this increase is mo re pronounced at 37°C , suggesting that heat shock and long - term cultivation could increase TcNTPDase - 1 gene expression . In conjunction, our results suggest the role of TcNTPDase - 1 on T. cruzi infectivity and adjustment to stress conditions s uch as nutrients starvation and heat shock. Due to its importance for T. cruzi , TcNTPD ase - 1 has the potential to be e valuated as a possible target for chemotherapy of Chagas Disease .

OLIVEIRA, Jonathas Sales de. Sensibilidade a antifúngicos, atividade exoenzimática e produção de biofilme por cepas de Candida tropicalis de origem animal. 2013. 73 f. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Médica) – Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2013. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2015-10-26T13:14:07Z No. of bitstreams: 1 2013_dis_jsoliveira.pdf: 1514038 bytes, checksum: 3a341580d1179e9935016a3b2969f3c8 (MD5) / Approved for entry into archive by denise santos(denise.santos@ufc.br) on 2015-10-26T13:27:28Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_dis_jsoliveira.pdf: 1514038 bytes, checksum: 3a341580d1179e9935016a3b2969f3c8 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-10-26T13:27:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_dis_jsoliveira.pdf: 1514038 bytes, checksum: 3a341580d1179e9935016a3b2969f3c8 (MD5) Previous issue date: 2013 / In recent years there has been a significant increase in the incidence of fungal infections caused by Candida species. Although C. albicans be considered the principal representing of the genus, other species have been gaining prominence. C. tropicalis, for example, has been associated with serious invasive cadidiases, being the first or second type of non-Candida albicans Candida most commonly isolated in humans with candidemia and candiduria and is frequently isolated from healthy animals and animals with candidiasis. To establish infection, C. tropicalis expresses many virulence factors such as the secretion of enzymes phospholipases and proteases, biofilm production, among others. This study aimed to evaluate the in vitro antifungal susceptibility profile and production of virulence factors in strains of C. tropicalis (n=100) isolated from several animal species. The strains were subjected to in vitro susceptibility testing by broth microdilution test, M27-A3 protocol, standardized by the Clinical and Laboratory Standards Institute against amphotericin B, itraconazole and fluconazole. We also evaluated the virulence attributes, such as proteases and phospholipases production and biofilm formation. Regarding the susceptibility of C. tropicalis strains, 38% were resistant to itraconazole, 40% were resistant to fluconazole and 34% were resistant to both azoles. None of the strains were resistant to amphotericin B. Regarding the production of proteases, 84% of the strains secreted these enzymes in the medium with pH 5.0, whereas only 40% of the strains were active at pH 3.5. Only 8% of the strains produced phospholipases. The strains showed different pattern in biofilm production, which 63,2% were strong producers, 17,6% were moderate producers, and 13,3% were weak producers. In sumary, the C. tropicalis strains isolated from animals showed high rate of resistance to azoles and expressed important virulence factors, indicating a potential threat to human and animal health. / Nos últimos anos houve um aumento significativo na incidência de infecções fúngicas causadas por leveduras do gênero Candida. Apesar de C. albicans ser considerada a principal representante do gênero, outras espécies vêm ganhando destaque. C. tropicalis, por exemplo, tem sido associada à cadidíases invasivas graves, sendo a primeira ou segunda espécie de Candida não-albicans mais comumente isolada em candidemia e candidúria em humanos, além de ser frequentemente isolada da microbiota de animais saudáveis e com candidíase. Para estabelecer a infecção, C. tropicalis expressa diversos fatores de virulência, como a secreção de enzimas protease e fosfolipase, a produção de biofilme, dentre outros. O presente trabalho buscou avaliar o perfil de sensibilidade antifúngica in vitro e produção de fatores de virulência de cepas de C. tropicalis (n=100) isoladas de diferentes espécies animais. As cepas foram submetidas a teste de sensibilidade in vitro por meio do método de microdiluição em caldo, protocolo M27-A3, padronizado pelo Clinical and Laboratory Standards Institute, frente anfotericina B, itraconazol e fluconazol. Foram avaliados ainda os atributos de virulência: produção de enzimas proteases e fosfolipases e produção de biofilme. Quanto ao perfil de sensibilidade das cepas de C. tropicalis, 38% foram resistentes a itraconazol, 40% resistentes a fluconazol e 34% foram resistentes a ambos os derivados azólicos. Nenhuma cepa apresentou resistência a anfotericina B. Quanto a produção de proteases, 84% das cepas secretaram estas enzimas em meio com pH 5,0, enquanto somente 40% das cepas foram ativas em pH 3,5. Somente 8% das cepas produziram fosfolipases. As cepas apresentaram padrão diferenciado na produção de biofilme, em que 63,2% foram consideradas fortes produtoras, 17,6% foram consideradas moderadas produtoras e 13,3% foram consideradas fracas produtoras. Em suma, os isolados de C. tropicalis provenientes de animais apresentaram resistência a derivados azólicos e expressaram fatores de virulência importantes, indicando potencial risco à saúde humana e animal.