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Identificación molecular de fuentes de alimentación en vectores virales (Díptera: Culicidae) provenientes de zonas endémicas de arbovirosis en LoretoPalermo Infante, Pedro Miguel January 2017 (has links)
Identifica las fuentes de alimentación en mosquitos colectados en áreas endémicas de arbovirosis en el Departamento de Loreto utilizando herramientas moleculares, y evalúa la presencia de arbovirus en tales mosquitos. De enero a marzo del 2009, los mosquitos son recolectados en las provincias de Alto Amazonas y Datem del Marañón, utilizando trampas de luz CDC, cebo humano y mochilas aspiradoras. Un total de 125 mosquitos colectados con evidencia de sangre son identificados usando claves dicotómicas, homogenizados individualmente, sometidos a extracción de DNA y amplificación de PCR utilizando 3 sets de primers consenso dirigidos al gen del citocromo b de mamíferos, aves y reptiles. El rendimiento del ensayo molecular es previamente validado usando DNA extraído de sangre de vertebrados conocidos. Se obtienen amplicones de PCR en 115 (92%) mosquitos, y son secuenciados para identificar al potencial hospedero. Psorophora albigenu, Ochlerotatus. serratus y Och. fulvus tienen comportamiento de alimentación ecléctico, Culex (Melanoconiom) vomerifer y Cx. (Aedinus) amazonensis se alimentan de ratas espinosas. Cx. (Mel.) dunni y Cx. (Mel.) occosa se alimentan de un gato y un oso perezoso respectivamente. Ps. cingulata, Mansonia humeralis, Anopheles oswaldoi s.l, An. benarrochi tienen comportamientos antropofílicos. Éste es el primer estudio que identifica fuentes de alimentación en Cx. (Mel.) spp., Ps.albigenu, Och. serratus, Och. fulvus, y que soporta sus roles como vectores en el ciclo de transmisión de alfavirus en la Cuenca Amazónica del Perú. / Tesis
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Aislamiento, caracterización y evaluación de la capacidad antimicrobiana de actinomicetos asociados a hormigas cortadoras de hojas (Formicidae: Myrmicinae: Attini)Gutierrez Espinoza, Cindy Abigail January 2017 (has links)
Aisla, caracteriza y determina la capacidad antimicrobiana de actinomicetos asociados a hormigas cortadoras de hojas frente a bacterias (Escherichia coli ATCC 25922, Klebsiella pneumoniae ATCC 700603, Staphylococcus aureus ATCC 25923, S.aureus ATCC 6538, Bacillus subtilis ATCC 6633, Enterococcus faecalis ATCC 51922) y levaduras (Candida albicans ATCC 98028, C.albicans ATCC 7516, C.albicans ATCC 10231, C.tropicalis ATCC 7206, C.parapsilosis ATCC 7307). Se aislan 30 actinomicetos, en su mayoría caracterizadas fenotípicamente como Streptomyces sp. Los actinomicetos HAA-16 y HAA-17 presentaron porcentajes de inhibición significativos (87% y 86% respectivamente) frente a C. albicans ATCC 10231. Asimismo, el actinomiceto HAA-4 presenta actividad inhibitoria de amplio espectro frente a bacterias (S. aureus ATCC 25923 y E. faecalis ATCC 51922) y la levadura (C. albicans ATCC 7516). Los extractos orgánicos de la cepa HAA-17 obtenidos con acetato de etilo y diclorometano presentan la mayor actividad antifúngica frente a las levaduras del género Candida. Asimismo, la Concentración Mínima Inhibitoria (CMI) del extracto de acetato de etilo de HAA-17 fue de 3,25 mg/mL frente a C. albicans ATCC 7516 y C. parapsilosis ATCC 7307. El análisis de la región parcial ADNr 16S revela la presencia de cepas pertenecientes al género Streptomyces. En conclusión, los actinomicetos asociados a hormigas cortadoras de hojas Atta cephalotes son excelentes productores de compuestos bioactivos capaces de inhibir microorganismos patógenos de importancia clínica, confirmando su potencialidad de producir compuestos bioactivos de interés biotecnológico. / Tesis
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Ecología trófica de la lagartija Stenocercus ornatissimus (Girard, 1857) (Reptilia : Tropiduridae) en el valle del río RímacPérez Zúñiga, José Miguel January 2017 (has links)
Publicación a texto completo no autorizada por el autor / Evalúa la ecología trófica de la lagartija Stenocercus ornatissimus en el valle del río Rímac. Se analizaron los contenidos estomacales de 105 individuos que incluyen juveniles, machos y hembras, en épocas seca y húmeda para realizar comparaciones de las dietas. Determina el número, volumen y frecuencia de cada tipo de ítem alimentario para cada estómago analizado. Se analizó el número total de presas consumidas, riqueza, amplitud de nicho trófico y diversidad, composición de grandes categorías de ítems alimentarios, perfiles de diversidad, superposición trófica y análisis multivariados. Se determinó que es necesario realizar un esfuerzo de muestreo mínimo de 23 estómagos analizados para una adecuada evaluación de riqueza y diversidad de la dieta de S. ornatissimus. Se registraron 16 ítems alimentarios en términos numéricos y 19 ítems en términos volumétricos. La dieta de S. ornatissimus es principalmente insectívora, siendo los ítems más importantes Hemíptera, Hymenóptera alado y hormigas. También se registró un bajo consumo de material vegetal, 6.3% del total de volumen consumido. La especie de saurio estudiada presentó una alta amplitud de nicho trófico, que caracteriza a especies de dietas generalistas y oportunistas, debido parcialmente a la ausencia de especies de saurios potencialmente competidoras. No se observan diferencias entre las dietas de juveniles y adultos, o entre machos y hembras, que se explicarían por las semejanzas en el tamaño corporal, estrategia de forrajeo y espectro de recursos alimentarios disponibles. Por otro lado, se observaron diferencias en las dietas de S. ornatissimus entre las épocas seca y húmeda, que estarían explicadas por la fluctuación de recursos alimentarios entre épocas en ambientes andinos. No se registraron diferencias en el tamaño corporal entre sexos, como ha sido reportada en otras especies del género. Por otro lado, se observa una diferencia entre tamaños corporales entre meses que puede evidenciar el inicio de la época reproductiva antes de octubre. No se observó una relación entre el tamaño corporal y el número de ítems alimentarios o volumen consumidos, ni con la riqueza de ítems. Se aportan nuevas aproximaciones metodológicas para el análisis de la dieta de saurios y nuevos conocimientos sobre la ecología trófica de S. ornatissimus que van a sustentar las acciones de investigación y conservación de esta especie endémica. / Tesis
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Effects of fouling and organic matter wastes from marine aquaculture on the macrofauna and biogeochemistry of sedimentsCasado-Coy, Nuria 09 June 2021 (has links)
La industria de la acuicultura se está expandiendo debido a la demanda de alimentos por el crecimiento de la población. En 2019, en España, la producción alcanzó 342.867 toneladas y un valor de primera venta de 501 millones de euros (APROMAR 2020). Las principales especies producidas fueron los mejillones (77%), la lubina (8%) y la dorada (4%), todas especies cultivadas en zonas costeras. Las principales estructuras donde se cultivaban estas especies son bateas y long lines para mejillones (4.793 instalaciones) y jaulas flotantes para lubina y dorada (43 instalaciones) (APROMAR 2020). Ambos cultivos producen enriquecimiento por MO y acumulación de restos de valva de mejillón en los sedimentos marinos. Sin embargo, existe una falta de conocimiento para poder entender todas las consecuencias ecológicas de la interacción entre el enriquecimiento por MO y la acumulación de valvas de mejillón en los ecosistemas bentónicos, ya que aunque se ha estudiado en profundidad el efecto del enriquecimiento por MO sobre los sedimentos (Holmer et al. 2005a; Apostolaki et al. 2007; Holmer et al. 2007), los efectos de acumulación los restos de valva de mejillón en los ecosistemas de sedimentos apenas se han investigado (Newell 2004; Wilding 2012; Wilding and Nickell 2013). Por lo tanto, para mejorar el conocimiento de los impactos de la acuicultura y sus interacciones en los sedimentos, los objetivos generales de la presente tesis doctoral han sido: Capítulo 2) Analizar el efecto de la bioturbación en la capacidad metabólica de los sedimentos a lo largo de un gradiente de enriquecimiento por MO derivado de la acuicultura marina. Capítulo 3) Investigar la interacción entre el enriquecimiento por valva de mejillón y por MO derivado de la acuicultura en flujos biogeoquímicos de sedimentos marinos. Capítulo 4) Comprobar el efecto del enriquecimiento por valva de mejillón y por MO procedente de la acuicultura en la capacidad de bioturbación de la comunidad de la macrofauna de los sedimentos marinos. Las principales conclusiones de esta tesis son: 1. Los sedimentos bioturbados, al promover las condiciones óxicas, pueden amortiguar las consecuencias negativas relacionadas la limitación de oxígeno producidas por el aporte extra de materia orgánica de la actividad acuícola. 2. La prevalencia de condiciones óxicas a través de la bioturbación de la macrofauna puede disminuir la importancia de las vías anaeróbicas de mineralización de la materia organica del sedimento bajo la influencia de la acuicultura, limitando la capacidad metabólica del sedimento. 3. En sedimentos bioturbados, su capacidad metabólica puede no seguir una relación lineal con el nivel de enriquecimiento por materia orgánica derivado de la actividad acuícola, aumentando la acumulación de contenido de MO en el sedimento a altas tasas de aporte de la materia orgánica. 4. Analizar la capacidad metabólica de los sedimentos podría ser una herramienta relevante para predecir la respuesta de los sedimentos frente al enriquecimiento de materia orgánica de los sistemas de acuicultura. 4. El análisis de la capacidad metabólica de los sedimentos puede ser una herramienta relevante para predecir la respuesta de los sedimentos frente al enriquecimiento por materia orgánica derivada de la acuicultura. 5. Los restos de valva de mejillón procedentes de los sistemas acuícolas sobre sedimentos arenosos sin macrofauna, en condiciones de enriquecimiento por materia orgánica, pueden disminuir la tasa de liberación de amonio a la columna de agua, limitando las consecuencias ecológicas negativas derivadas de la eutrofización. 6. Los restos de valva de mejillón, procedentes de los sistemas acuícolas, en sedimentos arenosos contaminados por materia orgánica pueden reducir la acumulación de los subproductos de vías metabólicas anaeróbicas, mejorando el estado ecológico del sedimento impactado. 7. Los restos de valva de mejillón, procedentes de los sistemas acuícolas, pueden modificar la comunidad de la macrofauna de los sedimentos arenosos en áreas oligotróficas, triplicando su abundancia y biomasa, y promoviendo la abundanica de familias con mayor capacidad de bioturbación, específicamente las familias Nassaridae y Nereididae. El efecto de los restos de valva de mejillón en la comunidad de la macrofauna bentónica está modulado por las características del sedimento, específicamente por el tamaño del grano y el contenido natural de materia orgánica. No se han obtenido efectos negativos significativos de los restos de valva de mejillón sobre la comunidad de sedimentos macrofaunales y sobre sus parámetros fisicoquímicos. 10. Los restos de valva de mejillón procedentes de los sistemas acuícolas, que suelen tratarse como un producto de desecho, podrían utilizarse para mitigar los efectos negativos de la contaminación por materia orgánica en los sedimentos marinos, particularmente en sitios defaunados. 11.Mantener los restos de conchas de mejillón derivados del sistema de acuicultura en sedimentos arenosos podría beneficiar la capacidad de bioturbación de la comunidad de la macrofauna que podría mejorar el metabolismo aeróbico de los sedimentos, reduciendo el coste de su gestión de extracción del sedimento y previniendo las posibles perturbaciones asociadas. / La parte experimental de la presente tesis doctoral ha sido costeada por el proyecto del Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades títulado "IMPLICACIONES ECOLOGICAS DE FONDOS MARINOS BIOGENICOS ARTIFICIALES: ACUMULOS DE RESTOS DE BIVALVOS COMO HERRAMIENTA DE MITIGACION ORGANICA Y SUMIDERO DE CARBONO" (CGL2015-70136-R).
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Estructura del fitoplancton en ambientes lénticos altoandinos de la región central del Perú durante un ciclo anualRoa Castro, Karen Melissa January 2017 (has links)
Publicación a texto completo no autorizada por el autor / Determina la composición y abundancia del fitoplancton en tres ambientes lénticos de la región central del Perú (embalse de Yuracmayo, laguna Ticticocha y laguna Marca), en dos periodos climáticos específicos (época seca y lluviosa) y determina su correlación con algunos parámetros fisicoquímicos. Para la colecta de muestras se filtraron 80 L de agua en la zona litoral de cada ambiente con una red de fitoplancton de 10 µm e inmediatamente se fija en formaldehído al 4%, y se miden algunos parámetros fisicoquímicos. En el laboratorio se evalúa la composición y abundancia fitoplanctónica con la cámara de Sedgwick Rafter, utilizando un microscopio invertido. Se calcula los índices de Shannon Wiener-H´, equidad-J´ y dominancia-D. Los datos se analizan con métodos de clasificación (CLUSTER) y ordenación (nMDS), pruebas de hipótesis (ANOSIM) y la prueba de correlación de variables ambientales y biológicas (BIOENV). Se registran 131 taxa de fitoplancton distribuidos en 52 familias, 35 órdenes, 13 clases y 7 phyla. La comunidad de fitoplancton no varía significativamente a nivel temporal y sí a nivel espacial; la composición de especies está representada por Bacillariophyceae y Chlorophyceae, especialmente en la época lluviosa; en relación a la abundancia, las Fragilariophyceae y Bacillariophyceae predominan en la época seca y lluviosa lo que se refleja en la alta dominancia mostrada en algunas estaciones, por ello sus valores de diversidad y equidad son bajos. Finalmente, se hallan altas correlaciones entre el fitoplancton y las variables conductividad eléctrica y sólidos disueltos totales. Se logra demostrar que las variables fisicoquímicas son fundamentales para comprender la presencia y abundancia de las especies fitoplanctónicas de los ambientes evaluados. / Tesis
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Análisis biogeográfico de Carollia brevicauda y C. perspicillata (Chiroptera: Phyllostomidae)Ruelas Pacheco, Dennisse Cinthya January 2017 (has links)
Publicación a texto completo no autorizada por el autor / Los murciélagos colicortos Carollia brevicauda y C. perspicillata están entre los mamíferos más comunes del Neotrópico y están ampliamente distribuidos. Diversos autores han reportado gran variabilidad entre sus poblaciones; sin embargo, frecuentemente ambas especies son confundidas entre sí en las determinaciones. Diversos estudios se han realizado para comprender sus patrones de distribución y dispersión ya que se encuentran a ambos lados de los Andes. Lo que se pretendes es analizar los patrones biogeográficos de Carollia brevicauda y C. perspicillata, para ello, se propone una caracterización morfológica que permita diferenciarlas, se analiza las poblaciones de ambas especies para probar el rol de barrera de la Depresión de Huancabamba (DH) ubicada entre los Andes de Perú y Ecuador, y finalmente se prueba el rol de los Andes como barrera en la dispersión de ambas especies. / Tesis
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A Socio-Ecological and Economic Approach to Tropical tuna Fisheries in the Mozambique ChannelNataniel, Anildo Naftal 27 September 2021 (has links)
En este estudio se analizan los efectos de las condiciones oceanográficas sobre la captura agregada de las tres principales especies de túnidos tropicales considerando las dos estrategias de pesca principales de la flota española de cerco, es decir, la pesca sobre dispositivo artificiales de agregación de peces (FADs) y banco libre (FSC). Además, para cada estrategia de pesca, se investiga el desplazamiento de la agregación de captura bajo los efectos del cambio climático utilizando la captura de atún Katsuwonus pelamis como indicador biológico, y se discuten las implicaciones sociales y económicas del impacto climático sobre los países costeros alrededor del Canal de Mozambique. El atún Katsuwonus pelamis es el recurso pesquero ecológico más importante que sustenta las necesidades sociales y económicas de los países costeros del MZC y, por tanto, las predicciones de puntos críticos para mediados y finales de siglo bajo diferentes escenarios de cambio climático son resultados que deben ser considerados en los planes de conservación y gestión de este recurso. Además, se analizaron las tendencias en las capturas de atún de las flotas industrial y artesanal y el impacto de su interacción. El objetivo general de esta investigación de tesis es mejorar nuestro conocimiento sobre los factores clave que impulsan la dinámica de las pesquerías de túnidos tropicales en el MZC, bajo un contexto que combina la acción e interacción de la flota de cerco industrial y la pesca a pequeña escala. Para el desarrollo del objetivo general, se han definido y resumido objetivos específicos de la siguiente manera: (i) investigar las relaciones entre los factores ambientales y la acumulación de cardúmenes de túnidos tropicales en hábitats marinos capturados por la flota Española de cerco sobre FADs o sobre FSC en el Canal de Mozambique; (ii) investigar la dinámica temporal y predecir los hábitats espaciales para la agregación de cardúmenes de túnidos o puntos críticos para la pesca en relación con sus preferencia ambientales;, (iii) investigar los cambios de distribución y agregación del Katsuwonus pelamis frente a los escenarios futuros de concentraciones representativas (RCP) de cambios climáticos para 2050 y 2100. (iv) discutir los cambios en las tasas de captura y socioeconómicos que afectan a las comunidades pesqueras considerando la incertidumbre asociada al cambio climático en el Canal de Mozambique; (v) describir las interacciones socioecológicas y socioeconómicas entre la pesca industrial y los sectores de la pesca en pequeña escala en las aguas costeras, en base a la información disponible de las pesquerías de Mozambique; (vi) explorar, desde el punto de vista ecológico, el efecto que ejercen la flota industrial en las poblaciones objetivo, así como el impacto socioeconómico en la pesca a pequeña escala, siendo esta, además, más vulnerable al cambio climático a lo largo de la costa de Mozambique. Los datos científicos utilizados en el análisis de capturas y esfuerzo de la flota española de cerco en el área del Canal de Mozambique se obtuvieron de las bases de datos del Instituto Español de Oceanografía (IEO) para el período de Febrero de 2003 a Junio de 2013 a partir de los cuadernos de pesca de la flota de cerco española, una vez corregida la composición específica de las capturas a partir de los datos detallados de la flota y el muestreo de puertos. Los datos de captura y esfuerzo de los cuadernos de pesca contienen información de los lances de pesca para FADs y FSC. Paralelamente a los datos de pesca, los datos ambientales para la misma subárea del MZC y el mismo periodo de tiempo se obtuvieron del consorcio MyOcean-Copernicus EU (marine.copernicus.eu) en formato netCDF. Finalmente, las conclusiones de estas tres etapas de investigación fueron las siguientes: (i) Entre las condiciones oceanográficas que determinaban los puntos críticos de captura para ambos tipos de pesca de cerco (FSC y FADs) en el canal de MZC se encontraban la temperatura de la superficie del mar y su variabilidad, la productividad, la altura de la superficie del mar y la las interacciones de las variables espaciales y temporales. Sin embargo, las corrientes geostróficas mostraron un efecto significativo solo para la acumulación de captura pescable en los FADs. El efecto dinámico de las variables oceanográficas ambientales sobre la acumulación de captura de túnidos tropicales a lo largo del Canal de Mozambique varía según el modo de pesca FAD y FSC. Los modelos predijeron hábitats preferidos para peces asociados con FADs entre 10ºS y 18ºS, con el núcleo, en general, en la costa noroeste de Madagascar. Las predicciones para el hábitat preferido en FSC muestran que el núcleo se encuentra principalmente en la parte norte del Canal de Mozambique y también cerca de la costa de Mozambique entre las latitudes 10ºS a 16ºS. El modelo predijo un caladero de pesca parcialmente superpuesto entre los FADs y la el FSC, a pesar de la diferencia en las variables oceanográficas seleccionadas por cada modelo aditivo generalizado para establecer hábitats de pesca preferidos a lo largo del canal de Mozambique.(ii) En relación de la captura de K. pelamis bajo el escenario climático, los hallazgos sugieren que las variables biofísicas afectan la distribución de las capturas de barrilete en el MZC y que la distribución de las especies se verá afectada por el cambio climático, particularmente en la parte norte, con posibles implicaciones en las comunidades pesqueras locales e internacionales. El modelo proyectó la distribución del K. pelamis e bajo escenarios de cambio climático optimista (RCP2.6) y pesimista (RCP8.5). El escenario optimista proyectaba que las capturas de K. pelamis se desplazarían hacia la parte sur del Canal de Mozambique, entre las latitudes 19ºS y 25ºS, para el 2050, y que el cambio de distribución sería menor o sin cambios entre 2050 y 2100. En el peor de los casos (RCP8.5), los caladeros potenciales de pesca se proyectaron en latitudes >20ºS para 2050, y se pronosticó que probablemente se producirían anomalías positivas en latitudes <20ºS entre 2050 y 2100. Además, para fines del siglo XXI, se observan signos de una alta distribución de las capturas. se espera fuera del MZC en latitudes >25ºS hacia las regiones templadas. Dado que se prevé que el cambio climático afectará la pesca de barrilete en el MZC, puede generar desafíos socioeconómicos para las comunidades pesqueras. Los estados costeros en el área de MZC deben fortalecer la gobernanza y promover políticas para construir resiliencia y aumentar la capacidad de adaptación de las pesquerías locales, nacionales y regionales para reducir su vulnerabilidad a los impactos climáticos. (iii) Las capturas nominales de atún han ido disminuyendo con el tiempo en Mozambique, independientemente de si los peces son capturados por flotas industriales o pescadores en pequeña escala. La competencia entre las flotas industriales y los pescadores en pequeña escala para maximizar las capturas y los beneficios de las especies de túnidos de alto valor comercial, como el rabil, el listado y el patudo hayan contribuido, muy probablemente, a generar esta tendencia decreciente, ya que los mismos stocks se capturan en diferentes regiones del océano Índico occidental (costa y alta mar) y por todo tipo de artes durante la migración estacional y espacial de las tres especies de túnidos tropicales. La existencia de tal interacción entre flotas industriales y pescadores locales a pequeña escala y la tendencia decreciente de los stocks tiene mayores consecuencias sobre los pescadores locales dada su mayor vulnerabilidad. Por lo tanto, es importante fortalecer la aplicación de la separación legal ya existente de las áreas de extracción entre la pesca artesanal e industrial. Es importante evitar la explotación excesiva del atún en las aguas nacionales de Mozambique y al mismo tiempo establecer acuerdos de pesca que apoyen el desarrollo socioeconómico del país. Los futuros acuerdos deberían ser socialmente justos, viable ecológicamente y estar respaldados por un buen asesoramiento de gestión sobre la sostenibilidad de las tasas de explotación.
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Dieta de tres especies de Gastrotheca (Anura: hemiphractidae) del PerúHerrera Alva, Valia Esther January 2018 (has links)
Publicación a texto completo no autorizada por el autor / Analiza la dieta de tres especies de anuros del género Gastrotheca relacionadas filogenéticamente: Gastrotheca excubitor, Gastrotheca griswoldi y Gastrotheca nebulanastes. Se estudió la composición cualitativa (tipos de presas) y cuantitativa (número de presas) de la dieta de las tres especies. Se tomó medidas morfométricas a los individuos (longitud del cuerpo y ancho de la cabeza) y se aplicaron lavados estomacales a los especímenes capturados. Se evaluó la oferta alimenticia mediante trampas de caída y de intercepción de vuelo. Se calculó el valor de la importancia relativa (IRI) de cada presa tomando en cuenta la edad, el sexo y la temporalidad; y se comparó por especie. Los resultados revelaron que no existe influencia de la morfología del anuro con la elección del tamaño de las presas. El análisis de la dieta mostró el registro de 8 a 10 taxa de artrópodos en el contenido estomacal. G. griswoldi, al igual que G. nebulanastes, se alimenta fundamentalmente de coleópteros y no registran diferencias según sexo o edad, solo se evidenció que G. griswoldi se alimenta de un mayor número de presas de mayor tamaño durante la temporada húmeda. Por otra parte, G. excubitor tiene como ítem fundamental a larvas de insectos y presentó una variación en el volumen consumido según el sexo, siendo los machos quienes consumieron mayor número de presas y de mayor tamaño, no obstante, no hubo diferencias según la temporalidad. El IRI mostró que el consumo de piedras es significativamente diferente según el sexo, siendo las hembras las que consumieron este recurso casi exclusivamente durante la temporada húmeda. La selectividad de las presas fundamentales en G. excubitor y G. nebulanastes fueron medianamente positivas. Finalmente, se concluye que G. excubitor (Levins = 6.02), G. griswoldi (Levins = 4.02) y G. nebulanastes (Levins= 5.15) son especies generalistas. / Tesis
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The role of marine offshore protected areas in protecting large pelagics. Practical case: Cocos Island National Park (Costa Rica) / El papel de las áreas marinas protegidas en alta mar en la protección de grandes pelágicos. Caso práctico: Parque Nacional Isla del Coco (Costa Rica)González-Andrés, Cristina 26 February 2021 (has links)
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Sistemática, procesos de especiación, estrategias reproductivas y estructura genética en Ruppia / Systematics, speciation processes, reproductive strategies and genetic structure in RuppiaMartínez-Garrido, Jose 07 July 2017 (has links)
Las plantas acuáticas del género Ruppia habitan lagunas costeras, salinas, humedales y aguas salinas interiores, jugando un papel ecológico clave. Estos sistemas se caracterizan por variaciones extremas de las condiciones ambientales tales como salinidad, temperatura e inundación. La compleja historia evolutiva del género Ruppia ha dificultado la delimitación de especies en el género. Estas especies han desarrollado una gran diversidad de estrategias biológicas para sobrevivir en estos ambientes extremos, tales como ciclos de vida anuales y perennes, reproducción sexual y propagación vegetativa, estrategias de polinización epihidrófila e hidroautogámica, así como autofecundación y fecundación cruzada. Además, existen diferentes vectores que pueden facilitar el flujo de genes entre las poblaciones, incluyendo corrientes marinas, aves acuáticas y peces. Estas características biológicas de Ruppia tienen una influencia importante en sus patrones de especiación, diversidad genotípica y genética, y su estructura poblacional. Por lo tanto, los análisis genéticos proporcionan información importante para delimitar especies y taxones dentro de este género, evaluar la diversidad e identificar procesos y flujos que actúan a distintas escalas temporales y espaciales. Los objetivos principales de esta tesis son: inferir los procesos evolutivos y biológicos de especiación y diversificación, y evaluar la prevalencia y estructura poblacional de especies Europeas del género Ruppia. Esta tesis se centra principalmente en las zonas costeras de la Península Ibérica, debido a la alta diversidad de especies de Ruppia registradas en esta zona geográfica, y al hecho de que en muchas ocasiones es posible encontrar poblaciones de diferentes especies en simpatría. Para alcanzar estos objetivos, en el Capítulo I, se desarrollaron y validaron diez nuevos marcadores moleculares polimórficos (es decir, microsatélites) para Ruppia cirrhosa. Adicionalmente se obtuvo amplificación cruzada con otros dos microsatélites descritos anteriormente para R. maritima. Estas herramientas moleculares son importantes para el estudio de plantas clonales y se han utilizado junto con secuencias nucleares y del cloroplasto en los siguientes capítulos. En el Capítulo II, se estudió la sistemática del género Ruppia en Iberia considerando criterios morfológicos, marcadores nucleares altamente variables (microsatélites) y secuencias nucleares (ITS) y del cloroplasto (psbA-trnH). Al realizar la filogenia utilizando marcadores con diferentes tiempos de mutación y mecanismos hereditarios, pudo identificarse el importante papel de la hibridación y la introgresión en la historia evolutiva de este género. De las tres especies tradicionalmente descritas en la Península Ibérica, se observó que R. drepanensis y R. cirrhosa se situaron en el mismo clado filogenético tanto para los marcadores nucleares como para los cloroplastos, por lo que pueden considerarse especies hermanas. R. maritima está incluida en un clado más distante filogenéticamente, apoyado por ambos marcadores. Además, dos nuevas entidades genéticas fueron identificadas, R. cf. maritima y "R. híbrido", las cuales mostraron algunas incongruencias entre los árboles filogenéticos del núcleo y del cloroplasto, así como una combinación de alelos de microsatélites que sugieren la existencia de efectos de hibridación y/o introgresión. En el Capítulo III, mediante el estudio de microsatélites en diferentes poblaciones de R. cirrhosa de la Península Ibérica y Sicilia, se detectó una fuerte estructura genética poblacional. En términos generales, se registró un bajo nivel de flujo génico, el cual fue más importante entre poblaciones geográficamente cercanas o ubicadas en el mismo cuerpo hidrológico. Además, se evaluaron diferentes hipótesis para explicar la conectividad entre las poblaciones a través de correlaciones entre distancias geográficas y genéticas, sugiriendo que el vector de dispersión más probable entre las poblaciones de R. cirrhosa en la Península Ibérica son las aves acuáticas. Al compilar los resultados del Capítulo II y el Capítulo III, se evaluaron los efectos de diferentes estrategias reproductivas sobre la diversidad genotípica y genética de Ruppia. Todas las entidades genéticas mostraron elevadas tasas de reproducción sexual. En R. cirrhosa, los mayores índices de reproducción sexual se detectaron en los hábitats más inestables hidrológicamente. Estas perturbaciones podrían promover la germinación y el establecimiento de semillas por una baja competencia interespecífica por el espacio, la luz y otros recursos existentes en praderas menos densas. Los mayores valores de diversidad genética detectados en los epihidrófilos R. drepanensis, R. cirrhosa y probablemente en “R. híbrido” (ésto no se ha confirmado) que en la hidroautogámica Ruppia cf. maritima, sugieren una fuerte influencia del modelo de polinización sobre los patrones de diversidad genética. En el Capítulo IV, R. maritima fue identificada por primera vez en Cabo Verde (Isla de Santiago) a partir de análisis morfológicos y filogenéticos. Esta información amplía la distribución geográfica de esta especie al África Occidental.
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