Submitted by Ramon Santana (ramon.souza@ufpe.br) on 2015-03-11T19:15:47Z No. of bitstreams: 2 TESE Dyana Leal Veras.pdf: 6559035 bytes, checksum: 43988c4ed7fb791a6e593067fb17b1eb (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-11T19:15:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TESE Dyana Leal Veras.pdf: 6559035 bytes, checksum: 43988c4ed7fb791a6e593067fb17b1eb (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2014-02-24 / O objetivo deste trabalho foi determinar a ação in vitro de antibióticos β-lactâmicos em isolados de Klebsiella pneumoniae portadores dos genes blaKPC, blaSHV, blaTEM ou blaCTX-M, desenvolvendo embasamento teórico para futura proposição de novas combinações terapêuticas. Sete isolados de K. pneumoniae foram utilizados, sendo 3 clínicos, 2 de comunidade e 2 de microbiota. Os isolados clínicos e de comunidade são portadores de genes codificantes de ESBL ou KPC e os de microbiota de -lactamases clássicas. Os genes de resistência foram identificados por PCR e seqüenciados utilizando primers específicos. A primeira fase deste estudo identificou os efeitos ultra-estruturais causados por -lactâmicos in vitro nos isolados clínicos e de microbiota de K. pneumoniae. Os isolados clínicos foram submetidos a concentrações clinicamente relevantes de ceftazidima, cefotaxima, aztreonam e/ou imipenem e os isolados de microbiota a ampicilina e amoxicilina, para análise pela Microscopia Eletrônica de Transmissão (MET) e Varredura (MEV). Diferentes alterações morfológicas e ultra-estruturais foram identificadas, como filamentação celular, perda de material citoplasmático e deformação dos septos de divisão, após submissão aos antibióticos, tanto nos isolados clínicos de K. pneumoniae como nos obtidos de microbiota. A segunda fase deste estudo determinou a influência destes antibióticos na produção de cápsula polissacarídica (CPS) nos isolados clínicos e de comunidade de K. pneumoniae. Os isolados foram submetidos a concentrações clinicamente relevantes de cefotaxima, ceftazidima, aztreonam e/ou imipenem para analise pela MET, utilizando citoquímica de carboidratos. Todos os isolados tiveram confirmação da presença da região promotora do operon envolvido na produção de CPS, identificado através de PCR e sequenciamento. A ceftazidima e o aztreonam foram capazes de inibir a produção de CPS nos isolados de K. pneumoniae produtores de ESBLs mas não no isolado produtor de KPC, o qual teve sua síntese fortemente inibida apenas pelo imipenem. A cefotaxima não interferiu na produção de CPS em nenhum dos isolados analisados. Nossos resultados demonstraram que antibióticos -lactâmicos possuem ação residual in vitro nos isolados analisados, sugerindo que a produção de ESBL e KPC por isolados de K. pneumoniae não são capazes de evitar completamente a interação de antibióticos β-lactâmicos com as PBPs bacterianas. Podemos concluir ainda que a ceftazidima, o aztreonam e o imipenem, podem ser capazes de inibir a produção de CPS em isolados clínicos e de comunidade de K. pneumoniae, contribuindo para diminuir a expressão do fator de virulência mais importante desta espécie bacteriana.

Dentre os bacilos Gram-negativos não fermentadores (BGNNF), Acinetobacter baumannii, complexo Burkholderia cepacia, Pseudomonas aeruginosa e Stenotrophomonas maltophilia se destacam devido à ampla capacidade de adaptação, as quais podem habitar uma grande variedade de ambientes e adquirir resistência a uma grande variedade de antimicrobianos. A resistência aos ?-lactâmicos ocorre principalmente pela produção de enzimas do tipo ?-lactamases, as quais são capazes de clivar o anel ?-lactâmico. O objetivo do presente estudo foi isolar bactérias pertencentes a esses gêneros, determinar o perfil de resistência aos antimicrobianos através dos métodos de disco difusão e da concentração inibitória mínima (CIM) e investigar a presença de genes codificadores de ?-lactamases. Foram isolados 60 BGNNF, sendo 24 pertencentes ao complexo B. cepacia, 13 P. aeruginosa, 13 S. maltophilia e 10 A. baumannii obtidos de diferentes amostras de solo provenientes de diferentes estados e cidades das cinco regiões do Brasil. Dentre os isolados, 50 (83,3%) foram não suscetíveis a pelo menos um ?-lactâmico e altas CIMs para as cefalosporinas de amplo espectro foram detectadas. Diferentes genes codificadores ?-lactamases de importância clínica foram pesquisados, e um total de 70 foram detectados, como blaSHV, blaGES, blaOXA-1-like, blaPER, blaVEB, blaCTX-M-Gp1, blaCTX-M-Gp9, blaKPC, blaVIM e blaNDM, sendo que, a maior prevalência foi do blaSHV (46%). Este é o primeiro relato no mundo de uma bactéria isolada do solo com o gene blaKPC e o primeiro relato no Brasil e o segundo no mundo de uma bactéria isolada do solo portadora do gene blaNDM-1. O grande número de genes codificadores de ?-lactamases encontrados indica uma grande disseminação destas enzimas em bactérias isoladas do solo. / Among the nonfermenting Gram-negative bacilli (NFGNB), Acinetobacter baumannii, Burkholderia cepacia complex, Pseudomonas aeruginosa and Stenotrophomonas maltophilia stand out due to the large adaptation capacity, which can inhabit a wide variety of environments and acquire resistance to a wide variety of antibiotics. Resistance to ?-lactam antibiotics occurs mainly by the production of ?-lactamase, which are capable of cleaving the ?-lactam ring. The aim of the present study was to isolate bacteria belonging to these genera, to determine the antimicrobial resistance profile through disc diffusion and minimum inhibitory concentration (MIC) methods and to investigate the presence of ?-lactamase encoding genes. Sixty NFGNB were obtained, being 24 belonging to the B. cepacia complex, 13 P. aeruginosa, 13 S. maltophilia and 10 A. baumannii from different soil samples from different states and cities of the five Brazilian regions. Among the isolates, 50 (83.3%) were not susceptible to at least one ?-lactam antibiotics and high MICs for the extended-spectrum cephalosporins were detected. Different ?-lactamase encoding genes of clinical importance were investigated, and 70 were detected, such as blaSHV, blaGES, blaOXA-1-like, blaPER, blaVEB, blaCTX-M-Gp1, blaCTX-M-Gp9, blaKPC, blaVIM and blaNDM, with the highest prevalence being blaSHV (46%). This is the first report in the world of blaKPC gene in bacteria isolated from soil and the first report in Brazil and the second in the world of blaNDM-1 gene in bacterium isolated from soil. A large number of ?-lactamase encoding genes found indicates a large spread of these enzymes in bacteria isolated from soil.

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Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-12-12Bitstream added on 2014-06-13T19:08:57Z : No. of bitstreams: 1 antonio_t_me_araiq.pdf: 609701 bytes, checksum: da17caf99f88297148973c0dd3d64e83 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Os grupos de antibióticos mais importantes clinicamente são os dos b-lactâmicos, aminoglicosídeos e tetraciclinas. Streptomyces clavuligerus produz vários compostos b- lactâmicos, com destaque para os antibióticos envolvidos na rota biossintética da cefalosporina C (penicilina N, deacetoxicefalosporina C e cefamicina C) e o ácido clavulânico (AC) que, embora não tenha atividade biológica significativa, é um potente inibidor de b-lactamases (penicilinases e cefalosporinases). A cefamicina C (CefC) é uma 7-metoxi-cefalosporina que apresenta maior atividade que a cefalosporina C (CPC), produzida somente por fungos, por ser resistente a b-lactamases. Apesar das rotas biossintéticas de AC e CefC serem completamente independentes em S. clavuligerus, são controladas pelo mesmo elemento multifuncional (ccaR), o que dificulta a indução da produção de um ou outro composto durante o processo fermentativo. No presente trabalho, procurou-se obter maiores concentrações de CefC manipulando-se componentes em meio solúvel de cultivo de S. clavuligerus, selecionados dentre compostos que, segundo a literatura, atuam como agentes reguladores da síntese daquele antibiótico. As fermentações foram realizadas em frascos agitados (28ºC, 260 rpm) para selecionar fontes de C e de N e, então, avaliar o processo no melhor meio-padrão, variando-se concentrações combinadas de L-lisina (10 a 108 mM) e -cetoglutarato (3 a 110 mM) através de metodologia de planejamento experimental. A presença de -cetoglutarato acarretou em aumento indesejável de pH, afetando negativamente o processo e os melhores resultados (entre 300 e 400 mg CPC totais/L após 72 horas de fermentação) foram obtidos no meio adotado como meio-controle, contendo amido e extrato protéico de semente de algodão como principais fontes de C e N, respectivamente, e L-lisina. / The most important groups of antibiotics, from a clinical standpoint, are -lactams, aminoglycosides and tetracyclines. Streptomyces clavuligerus produces several -lactam compounds, primarily the antibiotics involved in the biosynthetic route of cephalosporin C (penicillin N, deacetoxycephalosporin C and cephamycin C) and clavulanic acid (CA), which, despite its slight biological activity, is a potent inhibitor of -lactamases (penicillinases and cephalosporinases). Cephamycin C (CMC) is a 7-methoxycephalosporin with higher bioactivity than cephalosporin C (CPC) because it is more resistant to -lactamases. Although the biosynthetic routes of CA and CMC are completely independent in S. clavuligerus, they are controlled by a common multi-functional element (ccaR), which hinders induction of the production of one or the other compound during the fermentation process. In this work, we sought to obtain higher concentrations of CMC by handling compounds in a soluble medium of S. clavuligerus, which were selected from compounds that, according to the literature, act as regulating agents in the synthesis of that antibiotic. Fermentation was carried out in flasks under shaking (28ºC, 260 rpm), in order to select sources of C and N. The process was then evaluated in the best standard medium, by varying combined concentrations of lysine (10 to 108 mM) and -ketoglutarate (3 to 110 mM) using an experimental planning methodology. The presence of -ketoglutarate caused an undesirable increase in pH, negatively affecting the process. The best results (between 300 and 400 mg/L of total CPC after 72 h of fermentation) were obtained in the medium used as the control, which contained starch and cottonseed protein extract as main sources, respectively, of C and N, and L-lysine.

Enterobactérias produtoras de AmpC cromossômica, especialmente Citrobacter, Serratia, Providencia, Proteus e Morganella, entre outros, são patógenos oportunistas e estão implicados em infecção relacionada a assistência à saúde. Uma vez que mecanismos de resistência adquiridos a antibióticos são cada vez mais frequentemente encontrados nesses micro-organismos, o gerenciamento das infecções causadas por eles tem sido desafio para a escolha da antibioticoterapia, pois existem poucos dados fenotípicos e moleculares sobre essas espécies. O objetivo deste trabalho foi a investigação de genes de resistência adquiridos (mediados por plasmídeos) aos antibióticos beta-lactâmicos de amplo espectro e quinolonas, bem como a determinação da epidemiologia molecular das enterobactérias produtoras de AmpC cromossômica, isoladas de pacientes ambulatoriais e internados em hospital universitário. Foram estudadas e comparadas bactérias isoladas em 2007 e 2016 durante o período de cinco meses em cada ano. Foi investigada fenotipicamente a produção de ESBL e AmpC associadas à resistência aos beta-lactâmicos de amplo espectro. Adicionalmente, também foram pesquisados genes de resistência adquiridos aos beta-lactâmicos de amplo espectro e quinolonas tão bem como plasmídeos carreando tais genes. Foram encontrados dois genes blaSHV-5 e um blaCTX-M-2, além de, um gene qnrS2, dois qnrB6, dezenove genes qnrD1 e vinte e um aac(6\')-Ib, sendo que desses oito apresentaram a variante aac(6\')-Ib-cr. O gene qnrD1 já estava presente no hospital estudado antes do primeiro relato do gene no Brasil. Sequenciamento de plasmídeos carreando gene qnrD1 mostra que pelo menos dois plasmídeos distintos estão envolvidos em sua disseminação. Por PFGE foi possível observar que não houve disseminação clonal dos isolados bacterianos no hospital nos períodos estudados. Foi determinada a epidemiologia molecular comparativa das bactérias do estudo. Este conhecimento torna-se fundamental para que, haja informações consistentes sobre as bactérias do estudo, fornecendo subsídio para o tratamento dos pacientes e contribuindo para o melhor prognóstico e gerenciamento das infecções bacterianas. / Enterobacteria producing chromosomal AmpC, especially Citrobacter, Serratia, Providencia, Proteus and Morganella, among others, are opportunistic pathogens implicated in nosocomial infections. Since antibiotic resistance mechanisms are increasingly found in these microorganisms, the management of infections caused by them has been challenging on choosing the antibiotic therapy, as there are few phenotypic and molecular data on these species. The aim of this study was the investigation of acquired (plasmid-mediated) resistance genes to broad-spectrum beta-lactam antibiotics and quinolones, as well as the determination of the molecular epidemiology of chromosomal AmpC-producing enterobacteria isolated from outpatients and inpatients in a university education hospital. Bacteria isolated in 2007 and 2016 during the five-month period each year were studied and compared. The production of ESBL and AmpC associated with resistance to broad-spectrum beta-lactams was phenotypically investigated. In addition, acquired resistance genes from broad-spectrum beta-lactams and quinolones were also screened as well as plasmids carrying such genes. Two blaSHV-5 genes and one blaCTX-M-2 were found, in addition to one qnrS2, two qnrB6, nineteen genes qnrD1 and twenty-one aac(6\')-Ib, of which eight presented the aac(6\')-Ib-cr variant. qnrD1 gene was already present in the hospital studied before the first report of such gene in Brazil. Sequencing of plasmids carrying qnrD1 gene shows that at least two distinct plasmids are involved in its dissemination. Through PFGE it was possible to observe that there was no clonal dissemination of the bacterial isolates in the hospital during the periods studied. Comparative molecular epidemiology of the bacteria in the study was determined. This knowledge becomes critical for consistent information about the bacteria in the study, providing subsidy for the treatment of patients and contributing to the better prognosis and management of bacterial infections.

IIntrodução A utilização excessiva de antimicrobianos na medicina humana, veterinária e agricultura resultou no aparecimento da resistência bacteriana. Este fenômeno gera problemas de saúde pública que podem resultar na reemergência de doenças infecciosas. O uso de antibióticos, principalmente de forma profilática, tornou-se prática na aquicultura, como ocorre no Brasil, onde a regulamentação para o uso de medicamentos veterinários é ineficiente. Além disso, há evidências da transferência de organismos resistentes para humanos por meio do consumo de produtos de origem animal, quando, durante a fase de criação e produção destes foram administrados antibióticos. Objetivo Pesquisar a ocorrência de genes de resistência a antibióticos em filés de tilápia comercializados em supermercados do município de São Paulo SP. Material e Métodos Foram coletadas 10 amostras de filé de tilápia e realizada a pesquisa de coliformes termotolerantes como indicadores das condições higiênico-sanitárias do alimento. Em seguida, as amostras foram inoculadas em Caldo Lúria 0,5 por cento e o DNA total das bactérias cultivadas nesse meio foi extraído por meio de choque térmico para pesquisa de genes de resistência aos antibióticos -lactâmicos e tetraciclinas pela PCR. Os genes identificados pela PCR foram confirmados pelo sequenciamento. Resultados Em 100 por cento das amostras analisadas o resultado para coliformes termotolerantes foi < 3 NMP.g-1. Na pesquisa de genes de resistência a -lactâmicos, o gene blaOXY-5 foi detectado em 90 por cento das amostras, blaTEM-1b em 20 por cento , blaLEN-16 em 10 por cento , blaSHV-28 em 10 por cento , blaKPC-2 em 20 por cento , blaMOX-6 em 10 por cento e blaCphA em 60 por cento . Os genes de resistência a tetraciclinas identificados foram tetB em 10 por cento das amostras, tetC em 20 por cento , tetD em 80 por cento , tetE em 50 por cento , tetG em 60 por cento , tetO e tetS em 10 por cento cada e tetW em 20 por cento . Conclusões Em 90 por cento das amostras foi identificada a presença de genes de resistência aos antibióticos -lactâmicos e tetraciclinas, demonstrando uma grande circulação de resistência bacteriana na aquicultura e verificando a necessidade de legislação e fiscalização mais atuantes no controle do uso de antibióticos na aquicultura / IIntroduction The excessive use of antimicrobials in human medicine, veterinary medicine and agriculture has resulted in the emergence of bacterial resistance. This phenomenon creates public health problems that may result in the re-emergence of infectious diseases. The use of antibiotics, mainly prophylactically, has become a practice in aquaculture, including Brazil, where the legislation for the use of veterinary drugs is inefficient. Furthermore, there is evidence of transmission of resistant organisms to humans through consumption of animal products, especially when the antibiotics have been administered during the raising and production of these animals. Objective To search for the occurrence of antibiotics resistance genes in tilapia fillets commercialized in supermarkets in São Paulo city - SP. Material and Methods 10 tilapia fillet samples were collected and submitted to fecal coliform search as an indicator of the sanitary conditions of the food. Then, the samples were inoculated into Luria broth 0,5 per cent and the total DNA was extracted from growing bacteria by thermal shock for the search of resistance genes to -lactam and tetracyclines antibiotics by PCR. The genes identified by PCR were confirmed by sequencing. Results In 100 per cent of samples the result was < 3 NMP.g-1 for fecal coliform organisms. In the study of -lactam resistance genes, blaOXY-5 gene was detected in 90 per cent of samples, blaTEM-1b in 20 per cent , blaLEN-16 in 10 per cent , blaSHV-28 in 10 per cent , blaKPC-2 in 20 per cent , blaMOX-6 in 10 per cent and blaCphA in 60 per cent . The tetracyclines resistance genes identified were tetB in 10 per cent of samples, tetC in 20 per cent , tetD in 80 per cent , tetE in 50 per cent , tetG in 60 per cent , tetO and tetS in 10 per cent each and tetW in 20 per cent . Conclusions 90 per cent of the samples showed the presence of -lactam and tetracyclines resistance genes, demonstrating a high circulation of bacterial resistance in aquaculture and verifying the need for more active law and surveillance in controlling the use of antibiotics in aquaculture.

IIntrodução A utilização excessiva de antimicrobianos na medicina humana, veterinária e agricultura resultou no aparecimento da resistência bacteriana. Este fenômeno gera problemas de saúde pública que podem resultar na reemergência de doenças infecciosas. O uso de antibióticos, principalmente de forma profilática, tornou-se prática na aquicultura, como ocorre no Brasil, onde a regulamentação para o uso de medicamentos veterinários é ineficiente. Além disso, há evidências da transferência de organismos resistentes para humanos por meio do consumo de produtos de origem animal, quando, durante a fase de criação e produção destes foram administrados antibióticos. Objetivo Pesquisar a ocorrência de genes de resistência a antibióticos em filés de tilápia comercializados em supermercados do município de São Paulo SP. Material e Métodos Foram coletadas 10 amostras de filé de tilápia e realizada a pesquisa de coliformes termotolerantes como indicadores das condições higiênico-sanitárias do alimento. Em seguida, as amostras foram inoculadas em Caldo Lúria 0,5 por cento e o DNA total das bactérias cultivadas nesse meio foi extraído por meio de choque térmico para pesquisa de genes de resistência aos antibióticos -lactâmicos e tetraciclinas pela PCR. Os genes identificados pela PCR foram confirmados pelo sequenciamento. Resultados Em 100 por cento das amostras analisadas o resultado para coliformes termotolerantes foi < 3 NMP.g-1. Na pesquisa de genes de resistência a -lactâmicos, o gene blaOXY-5 foi detectado em 90 por cento das amostras, blaTEM-1b em 20 por cento , blaLEN-16 em 10 por cento , blaSHV-28 em 10 por cento , blaKPC-2 em 20 por cento , blaMOX-6 em 10 por cento e blaCphA em 60 por cento . Os genes de resistência a tetraciclinas identificados foram tetB em 10 por cento das amostras, tetC em 20 por cento , tetD em 80 por cento , tetE em 50 por cento , tetG em 60 por cento , tetO e tetS em 10 por cento cada e tetW em 20 por cento . Conclusões Em 90 por cento das amostras foi identificada a presença de genes de resistência aos antibióticos -lactâmicos e tetraciclinas, demonstrando uma grande circulação de resistência bacteriana na aquicultura e verificando a necessidade de legislação e fiscalização mais atuantes no controle do uso de antibióticos na aquicultura / IIntroduction The excessive use of antimicrobials in human medicine, veterinary medicine and agriculture has resulted in the emergence of bacterial resistance. This phenomenon creates public health problems that may result in the re-emergence of infectious diseases. The use of antibiotics, mainly prophylactically, has become a practice in aquaculture, including Brazil, where the legislation for the use of veterinary drugs is inefficient. Furthermore, there is evidence of transmission of resistant organisms to humans through consumption of animal products, especially when the antibiotics have been administered during the raising and production of these animals. Objective To search for the occurrence of antibiotics resistance genes in tilapia fillets commercialized in supermarkets in São Paulo city - SP. Material and Methods 10 tilapia fillet samples were collected and submitted to fecal coliform search as an indicator of the sanitary conditions of the food. Then, the samples were inoculated into Luria broth 0,5 per cent and the total DNA was extracted from growing bacteria by thermal shock for the search of resistance genes to -lactam and tetracyclines antibiotics by PCR. The genes identified by PCR were confirmed by sequencing. Results In 100 per cent of samples the result was < 3 NMP.g-1 for fecal coliform organisms. In the study of -lactam resistance genes, blaOXY-5 gene was detected in 90 per cent of samples, blaTEM-1b in 20 per cent , blaLEN-16 in 10 per cent , blaSHV-28 in 10 per cent , blaKPC-2 in 20 per cent , blaMOX-6 in 10 per cent and blaCphA in 60 per cent . The tetracyclines resistance genes identified were tetB in 10 per cent of samples, tetC in 20 per cent , tetD in 80 per cent , tetE in 50 per cent , tetG in 60 per cent , tetO and tetS in 10 per cent each and tetW in 20 per cent . Conclusions 90 per cent of the samples showed the presence of -lactam and tetracyclines resistance genes, demonstrating a high circulation of bacterial resistance in aquaculture and verifying the need for more active law and surveillance in controlling the use of antibiotics in aquaculture.

Submitted by Diogo Misoguti (diogo.misoguti@gmail.com) on 2016-08-08T18:42:52Z No. of bitstreams: 1 Publico-20160808.pdf: 1416606 bytes, checksum: 61ffaff6596a702eeebabe55ae7c3578 (MD5) / Approved for entry into archive by Diogo Misoguti (diogo.misoguti@gmail.com) on 2016-08-08T18:43:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Publico-20160808.pdf: 1416606 bytes, checksum: 61ffaff6596a702eeebabe55ae7c3578 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-08T18:43:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Publico-20160808.pdf: 1416606 bytes, checksum: 61ffaff6596a702eeebabe55ae7c3578 (MD5) Previous issue date: 2009 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Objetivos: Avaliar (i) o perfil de sensibilidade aos antimicrobianos e caracterizar os tipos de β-lactamases de espectro ampliado, entre isolados clínicos de Klebsiella spp. (KSP); (ii) os mecanismos de resistência em isolados clínicos de Klebsiella pneumoniae (KPN) que apresentaram diminuição de sensibilidade aos carbapenens; (iii) a acurácia do teste de Hodge para detecção de carbapenemases Material e Métodos: Foram avaliadas 167 amostras de KSP isoladas do primeiro episódio de infecção de corrente sanguínea (ICS) de pacientes hospitalizados em 15 centros médicos de diferentes regiões do país, participantes do programa de vigilância SCOPE Brasil, entre junho de 2007 e dezembro de 2008. Todas as amostras foram submetidas a re-identificação e teste de sensibilidade pelo sistema automatizado BD Phoenix. As amostras foram classificadas em dois grupos de acordo com a sensibilidade in vitro aos agentes β-lactâmicos e detecção de ESβL: (i) KSP produtora de ESβL e (ii) KSP não produtora de ESβL. As amostras representativas do grupo KSP produtora de ESβL foram submetidas a testes fenotípicos e moleculares. Os principais tipos de β-lactamases foram caracterizados pela reação em cadeia da polimerase (PCR), seguido pelo sequenciamento dos produtos amplificados. Testes adicionais foram realizados para o subgrupo KPN produtora de ESβL e resistente a ertapenem (KPN-ESβL-RE). Resultados: As espécies mais comuns foram K. pneumoniae (n=158), seguida por K. oxytoca (n=8) e K. ozaenae (n=1). Altas taxas de resistência aos antimicrobianos foram constatadas, sendo que 56,3% das amostras foram classificadas como produtoras de ESβL. As ESβL mais frequentes foram CTXM-2, CTX-M-15, SHV-5 e SHV-12. Isolados clínicos contendo concomitantemente dois tipos de ESβL (CTX e SHV) foram detectados somente nas regiões Nordeste e Sudeste. O mecanismo de resistência detectado nas amostras KPN-ESβL-RE foi a produção de cefotaximase, associada à alteração das porinas OmpK35 e/ou OmpK36. O teste de Hodge apresentou baixa acurácia nessas amostras. Conclusões: Evidenciamos a disseminação de CTX-M-2 e a emergência de CTX-M-15, associada a alterações nas porinas OmpK35 e OmpK36 em amostras de KSP isoladas de ICS em hospitais brasileiros. Nenhuma carbapenemase foi detectada / Objectives: To evaluate (i) the antimicrobial susceptibility profile of Klebsiella spp. (KSP) clinical isolates and characterize the extended spectrum β-lactamases. (ii) the resistance mechanisms in Klebsiella spp. clinical isolates that showed decrease of carbapenem susceptibility. (iii) the accuracy of the Hodge Test for carbapenemase activity detection. Material and Methods: 167 KPS strains were evaluated in this study. The strains were isolated from the first bloodstream infection episode of patients hospitalized at 15 medical centers from different regions of the country participating of SCOPE Brazillian surveillance program, between June, 2007 and December, 2008. The isolates were re-identified and susceptibility tested by the automated system BD Phoenix and classified in two groups according antimicrobial susceptibility profile and ESβL detection: (i) KSP ESβL-producing and (ii) KSP ESβL-non-producing. KSP ESβL-producing were submitted to phenotypic and molecular tests. The β-lactamase types were characterized by PCR, followed by DNA sequencing. Additional tests were performed for ertapenem resistant K. pneumoniae ESβL-producing (KPN-ESβL-ER). Results: The most common species were K. pneumoniae (n=158), followed by K. oxytoca (n=8) and K. ozaenae (n=1). High rates of antimicrobial resistance were observed and 56.3% of isolates were classified as ESβL-producing. The most frequent ESβL were CTX-M-2, CTX-M-15, SHV-5 and SHV-12. Clinical isolates with two ESβL types (CTX and SHV) were only detected in the northeast and southeast regions. The resistance mechanism detected in the KPN-ESβL-ER isolates was the cefotaximase production associated with OmpK35 and/or OmpK36 porin alteration. The Hodge test showed low accuracy in these isolates. Conclusions: We showed the dissemination of CTX-M-2 and emergence of CTX-M-15, associated with OmpK35 and OmpK36 porin modification, in KSP strains isolated from bloodstream infection in Brazilian hospitals. No carbapenemase was detected. / FAPESP: 2006/57700-0

Submitted by Liliane Ferreira (ljuvencia30@gmail.com) on 2018-08-08T13:21:02Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Andressa Liberal Santos - 2018.pdf: 2603632 bytes, checksum: 0a1312a46fb6a806189f5479682576a2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Rejected by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com), reason: Olhe a citação : Dissertação (Mestrado em Biologia da Relação Parasito-Hospedeiro (IPTSP)) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2018. on 2018-08-08T13:28:59Z (GMT) / Submitted by Liliane Ferreira (ljuvencia30@gmail.com) on 2018-08-09T11:46:17Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Andressa Liberal Santos - 2018.pdf: 2603632 bytes, checksum: 0a1312a46fb6a806189f5479682576a2 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-08-09T12:21:53Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Andressa Liberal Santos - 2018.pdf: 2603632 bytes, checksum: 0a1312a46fb6a806189f5479682576a2 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-09T12:21:53Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Andressa Liberal Santos - 2018.pdf: 2603632 bytes, checksum: 0a1312a46fb6a806189f5479682576a2 (MD5) Previous issue date: 2018-06-28 / Enterobacteria are microorganisms involved with bacteria and the health of women with care. Treatment of bacterial infections is most often done with the use of antibiotics and one of the major classes of antimicrobials is one of the β-lactams. Among the main mechanisms of resistance to the observational β-lactam antibiotics: alteration of the antimicrobial target; alteration of β-lactam permeability; Flow pumps and the entry of enzymatic signals that destroy the β-lactate totally or with the development of an alternative metabolic pathway. These enzymes are known as beta-lactamases and are encoded by specific genes. Thus, the objective of this study was to correlate the resistance profile of enterobacteria, using phenotype methodologies and identifying 14 genes that encode as beta-lactamase enzymes: blaOXA genes; blaIMP; blaNDM; blaSME; blaDHA; blaCMY, blaTEM, blaKPC, blaSPM, blaCTX-M, blaVIM, blaSIM, blaGim and blaSHV. The phenotypic methodologies used were the Antimicrobial Sensitivity Test for Disk-Diffusion (antibiogram), and complementary tests for the detection of resistance mechanisms of beta-lactamases (ESBL, MBL, AmpC and Carbapenemase). The molecular methodology used was Real Time PCR using the Sybr Green system. Among the results found in the tests it was observed that 74.28% were resistant to ampicillin, 34.28% were resistant to aztreonam, 62.85% were resistant to amoxicillin associated with clavalunate, 51.42% were resistant to ceftazidime, 41 , 42% were resistant to cefoxitin, 54.28% were resistant to cefazolin, 44.28% were resistant to cefepime, 41.42% were resistant to cefuroxime, 8.57% were resistant to cefuroxime, 35.71% were resistant an imipenem and 41.42% were resistant to piperacillin associated with tazobactam. Among the total samples, the mechanism of resistance that presented the highest expression was ESBL (17.14%). The genes studied that were detected in a greater number of genera were blaGIM and blaSIM (66.66% of the samples). The gene that was amplified in a smaller number of samples was blaVIM (16.66%). It is concluded that although there is a low correlation between the methodologies analyzed, the levels of antimicrobial resistance in enterobacteria are high and worrying, and a way to minimize the accelerated emergence of resistance includes the development or improvement of techniques that generate diagnoses with high efficiency and speed. / As enterobactérias são microrganismos envolvidos com infecções bacterianas adquiridas na comunidade e nos ambientes dos cuidados com a saúde. O tratamento das infecções bacterianas na maioria das vezes é realizado com a utilização de antibióticos e uma das maiores classes de antimicrobianos é a dos β-lactâmicos. Entre os principais mecanismos de resistência aos antimicrobianos β-lactâmicos observa-se: alteração do alvo antimicrobiano; alteração da permeabilidade ao β-lactâmico; bombas de e-fluxo e a presença de mecanismos enzimáticos que destroem o β-lactâmico totalmente ou parcialmente com desenvolvimento de uma via metabólica alternativa. Essas enzimas são conhecidas como beta-lactamases e são codificadas por genes específicos. Dessa forma, o objetivo deste estudo foi o de correlacionar o perfil de resistência das enterobactérias, utilizando metodologias fenotípicas e identificar 14 genes que codificam as enzimas beta-lactamases: genes blaOXA; blaIMP; blaNDM; blaSME; blaDHA; blaCMY, blaTEM, blaKPC, blaSPM, blaCTX-M, blaVIM, blaSIM, blaGIM e blaSHV. As metodologias fenotípicas utilizadas foram o Teste de Sensibilidade aos Antimicrobianos por disco-difusão (antibiograma), e testes complementares para detecção dos mecanismos de resistência das beta-lactamases (ESBL, MBL, AmpC e Carbapenemase). A metodologia molecular utilizada foi a PCR em Tempo Real, utilizando o sistema Sybr Green. Entre os resultados fenotípicos encontrados nas bactérias observou-se que 74,28% foram resistentes a ampicilina, 34,28% foram resistentes a aztreonam, 62,85% foram resistentes a amoxicilina associado ao clavalunato, 51,42% foram resistentes a ceftazidima, 41,42% foram resistentes cefoxitina, 54,28% foram resistentes a cefazolina, 44,28% foram resistentes a cefepime, 41,42% foram rsistentes a ceftriaxona, 8,57% foram resistentes a cefuroxima, 35,71% foram resistentes a imipenem e 41,42% foram resistentes a piperacilina associada tazobactam. Entre o total de amostras, o mecanismo de resistência que apresentou maior expressão foi o ESBL (17,14%). Os genes estudados que foram detectados em um maior número de gêneros foram o blaGIM e o blaSIM (66,66% das amostras). O gene amplificado em menor número de amostras foi o blaVIM (16,66%). Conclui-se que apesar de haver baixa correlação entre as metodologias analisadas, os níveis de resistência a antimicrobianos em enterobactérias são altos e preocupantes e uma maneira de minimizar a acelerada emergência de resistência é desnvolver e aprimorar técnicas de diagnósticos com alta eficiência e rapidez.

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:30:31Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo3565_1.pdf: 5205665 bytes, checksum: d3f5d67863a34c85659602984a49cb65 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Klebsiella pneumoniae é uma enterobactéria responsável por uma alta incidência de infecções hospitalares, causadas geralmente por linhagens portadoras de multirresistência e produtoras de &#61538;-lactamases de amplo espectro (ESBL). Este trabalho teve como objetivo determinar os genes envolvidos na formação de beta-lactamases clássicas e ESBLs em isolados de K. pneumoniae de Recife-PE, Brasil, assim como investigar o efeito ultra-estrutural causado por diferentes concentrações de antibióticos beta-lactâmicos, em isolados de K. pneumoniae produtores de diferentes tipos de betalactamases. Foram analisados 52 isolados de K. pneumoniae quanto a presença dos genes blaSHVe blaTEM, originados da microbiota normal e de infecções na comunidade e hospitalares e para a investigação do gene blaCTX-M foram utilizados 19 isolados clínicos de K. pneumoniae que apresentaram resistência a cefalosporinas de terceira geração ou ao aztreonam. Os MICs dos isolados foram determinados frente aos antibióticos ceftazidima, cefotaxima e aztreonam. Dois isolados de infecção nosocomial de K. pneumoniae foram submetidos a diferentes Sub-MICs de ceftazidima, cefotaxima e aztreonam para a análise pela Microscopia Eletrônica de Transmissão e de Varredura (MET e MEV). O gene blaSHV foi detectado em 16 isolados hospitalares, 4 da comunidade e 9 da microbiota, enquanto o gene blaTEM foi detectado em 18 isolados hospitalares, 4 da microbiota e 2 da comunidade. Através do sequenciamento de DNA, o gene blaCTX-M2 foi detectado em três isolados resistentes tanto a ceftazidima quanto a cefotaxima. Adicionalmente, foi encontrada uma nova variante SHV em um dos isolados e a presença de duas variantes anteriormente relatadas a SHV-28 e a SHV-108. As análises dos 2 isolados de K. pneumoniae pela MET e MEV mostraram grandes alterações morfológicas e ultra-estruturais dos isolados, quando submetidos aos diferentes Sub-MICs de ceftazidima e cefotaxima. *Nossos resultados mostram que isolados de K. pneumoniae portadores de diferentes &#946;-lactamases e resistentes a diferentes antimicrobianos podem sofrer alterações ultra-estruturais significativas quando submetidos a Sub-MICs da droga, o que poderia possibilitar uma melhor atuação do sistema imune de um paciente infectado com esta espécie bacteriana