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Parâmetros genéticos populacionais como indicadores de sustentabilidade em populações naturais de pimenta rosa - Schinus terebinthifolius RADDI. (Anacardiaceae) no baixo curso do rio São Francisco - SE/AL / POPULATIONAL GENETIC PARAMETERS AS SUSTAINABILITY INDICATORS IN NATURAL POPULATIONS OF RED PEPPER Schinus terebinthifolius RADDI (Anacardiaceae), IN LOW SÃO FRANCISCO RIVER-SE/AL.

Carvalho, Sheila Valéria álvares 25 June 2009 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The conservation of forest species requires the prior knowledge of genetic parameters belonging to the population, to help to design strategies for this purpose. This study aimed to evaluate genetic parameters and suggest indicators of sustainability in populations of Schinus terebinthifolius Raddi. aiming the conservation and maintenance of diversity in this species. In analysis of the study area, were selected 20 descriptors, and these suggested 20 indicators of sustainability for the area. Tender vegetal leaves were sampled in five populations located on the shores and islands of São Francisco River, and the material collected from 15 individuals for each population. In the DNA extraction it was used tender leaves of individuals and 2% CTAB method. We applied 20 primers of 10 bases of arbitrary sequence in amplification, the products were separated in agarose gel at 1% submitted to horizontal electrophoresis, stained with ethidium bromide and visualized in ultraviolet light. The presence and absence of bands were used to construct a binary matrix for the analysis of genetic parameters. In each population the percentage of polymorphic loci ranged from 32.92% to 45.34%. The average gene diversity of Nei was 0.37. The total genetic variation observed, 63.60% corresponded to variation among populations, and 36.40% within populations. The gene flow (Nm) estimated was 0.28. Thus the conclusion is the populations are genetically isolated, and analyzed the genetic parameters can be used as indicators of sustainability of the area. / A conservação de espécies florestais requer o conhecimento prévio de parâmetros genéticos pertencentes às populações, para se traçar estratégias para este fim. Assim, este trabalho teve como objetivo avaliar parâmetros genéticos e sugerir indicadores de sustentabilidade em populações de Schinus terebinthifolius Raddi. visando à conservação e manutenção da diversidade nesta espécie. Em análise da área de estudo, foram selecionados 20 descritores, e destes sugeridos 20 indicadores de sustentabilidade da área. As amostragens foram realizadas em cinco populações localizadas nas margens e ilhas do Rio São Francisco, sendo coletado material de 15 indivíduos para cada uma das populações. Na extração do DNA, empregou-se folhas tenras dos indivíduos e o método CTAB 2%. Foram usados 20 oligonucleotídeos de 10 bases de sequência arbitrária nas amplificações, cujos produtos foram separados em gel de agarose 1% submetidos à eletroforese horizontal, corados com brometo de etídio e visualizados em luz ultravioleta. A presença e a ausência de bandas foi usada para a construção de uma matriz de binária para a análise dos parâmetros genéticos. Em cada população a porcentagem de locos polimórficos variou de 32,92 a 45,34%. A diversidade média gênica de Nei foi de 0,37. Da variação genética total observada, 63,60% correspondeu à variação entre as populações; e, 36,40% dentro das populações. O fluxo gênico (Nm) estimado foi de 0,28. Desta forma conclui-se que as populações encontram-se isoladas geneticamente e os parâmetros genéticos analisados podem ser utilizados como indicadores de sustentabilidade da área.
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O uso de método de relacionamento de dados (record linkage) para integração de informação em sistemas heterogêneos de saúde: estudo de aplicabilidade entre níveis primário e terciário / The use of record linkage method for integration heterogeneous information systems in health: a study of applicability between primary and tertiary

Katia Mitiko Firmino Suzuki 21 September 2012 (has links)
O relacionamento de dados record linkage, originou-se na área da saúde pública e atualmente é aplicado em várias outras áreas como: epidemiologia, pesquisa médica, criação de ensaios clínicos, na área de marketing, gestão de relacionamento com o cliente, detecção de fraude, aplicação da lei e na administração do governo. A técnica consiste no processo de comparação entre dois ou mais registros em diferentes bases de dados e as principais estratégias de record linkage são: manual, deterministic record linkage (DRL) e probabilistic record linkage (PRL). Este estudoteve como objetivo aplicar o record linkage em bases de dados heterogêneas, utilizadas pela rede de atenção à saúde do município de Ribeirão Preto e identificar entre elas a melhor estratégia a ser adotada para a integração de bases de dados na área da saúde. As bases de dados da secretaria Municipal de Saúde de Ribeirão Preto (SMS-RP) e do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (HCFMRP/USP) foram objeto deste estudo, tendo como critério de inclusão apenas os registros de pacientes em que o município de residência informado correspondia ao município de Ribeirão Preto e o atendimento tivesse ocorrido na Unidade Básica Distrital e de Saúde (UDBS) - Centro Saúde Escola Joel Domingos Machado\" (CSE-Sumarezinho) nos anos de janeiro de 2006 a agosto de 2008 e no HCFMRP/USP. Foi selecionada uma amostra aleatória simples resultando em um conjunto de 1.100 registros de pacientes na base de dados do CSE-Sumarezinho e de 370.375 registros na base de dados do HCFMRP/USP. Foram, então, selecionadas quatro variáveis de relacionamento (nome, nome da mãe, sexo e data de nascimento). As estratégias adotadas foram: DRL exato, DRL com discordância em uma variável de relacionamento, e baseada em funções de similaridades (Dice, Levenshtein, Jaro e Jaro-Winkler) e, por fim, PRL. A estratégia DRL exato resultou em 334 registros pareados e na abordagem com discordância de uma variável foram 335, 343, 383 e 495, sendo as variáveis discordantes sexo, data de nascimento, nome e nome da mãe respectivamente. Quanto ao uso das funções de similaridades, as que mais se destacaram foram Jaro-Winkler e Jaro. Quanto à acurácia dos métodos aplicados, o PRL (sensibilidade = 97,75% (CI 95% 96,298,8) e especificidade = 98,55% (CI 95% 97,0-99,4)) obteve melhor sensibilidade e especificidade, seguido do DRL com as funções de similaridade Jaro-Winkler sensibilidade = 91,3% (CI 95% 88,793,4) e especificidade = 99% (CI 95% 97,6-99,7)) e Jaro (sensibilidade = 73,1% (CI 95% 69,476,6) e especificidade = 99,6% (CI 95% 98,5-99,9)). Quanto à avaliação da área sob a curva ROC do PRL, observou-se que há diferença estatisticamente significativa (p = 0,0001) quando comparada com os métodos DRL com discordância da variável nome da mãe, Jaro-Winkler e Jaro. Os resultados obtidos permitem concluir que o método PRL é mais preciso dentre as técnicas avaliadas. Mas as técnicas com a função de similaridade de Jaro-Winkler e Jaro também são alternativas viáveis interessantes devido à facilidade de utilização apesar de apresentarem o valor de sensibilidade ligeiramente menor que o PRL. / The record linkage originated in the area of public health and is currently applied in several other areas such as epidemiology, medical research, establishment of clinical trials, in the area of marketing, manager customer relationships, fraud detection, law enforcement and government administration. The technique consists on the comparison between two or more records in different databases and their key strategies are: manual comparison, Deterministic Record Linkage (DRL), and Probabilistic Record Linkage (PRL).This study aimed to apply the record linkage in heterogeneous databases, used by the network of health care in Ribeirão Preto and identify the best strategy to be adopted for the integration of databases in health care. The databases that were evaluated in this study were of the Municipal Health Department of Ribeirão Preto (SMS-RP) and of the Clinical Hospital of the School of Medicine of Ribeirao Preto (HCFMRP/USP) having as inclusion criterion only the records of patients in the county of residence reported corresponded to the city of Ribeirão Preto and care had taken place in the Basic District Health Unit (UDBS) - School Health Center \"Joel Domingos Machado\" (CSE-Sumarezinho) included in the years from January 2006 to August 2008 and in the HCFMRP/USP. Held to select a simple random sample resulted in a set of 1,100 patient records in the database of the CSE-Sumarezinho and 370,375 records in the database of HCFMRP/USP. Then there was the selection of four linking variables (name, mother\'s name, gender and birth date). The strategies adopted were: the exact DRL, DRL with one variable where the linking is disagreement, applied with similarity functions (Dice, Levenshtein, Jaro, and Jaro-Winkler), and, finally, PRL. The strategy of the exact DRL resulted in 334 matched records and strategy in dealing with disagreement of one variable were 335, 343, 383 and 495, to the following variables discordant gender, birth date, name and mother\'s name, respectively. Regarding the use of similarity functions which most stood out were Jaro and Jaro-Winkler. Regarding the accuracy of the methods applied, the PRL obtained better sensitivity and specificity (sensitivity = 97,75% (CI 95% 96,298,8) and specificity = 98.55% (95% CI 97.0 to 99.4)), followed by the DRL with the similarity functions Jaro-Winkler (sensitivity = 91.3% (95% CI 88.7 to 93.4) and specificity = 99% (95% CI 97.6 to 99, 7)) and then by Jaro (sensitivity = 73.1% (95% CI 69.4 to 76.6) = 99.6% and specificity (95% CI 98.5 to 99.9)). The evaluation of the area under the ROC curve in the PRL, was observed that there is statistically significant difference (p = 0.0001) if it is compared with the DRL methods when there is disagreement in the variable mother\'s name, as well as for Jaro and for Jaro-Winkler. The results indicate that the PRL method is most accurate among the techniques evaluated. Although the techniques with the similarity function of Jaro-Winkler and Jaro were also interesting viable options due to the ease of use, although having the sensitivity value slightly smaller than the PRL.
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Um estudo das transformações geométricas no plano via congruência e semelhança de figuras planas / A study of geometric transformations on the plane via congruence and similarity of plane figures

Assunção, Ricardo Gomes 27 May 2015 (has links)
Submitted by Cássia Santos (cassia.bcufg@gmail.com) on 2015-10-28T13:45:05Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ricardo Gomes Assunção - 2015.pdf: 6739728 bytes, checksum: acac71431ba03e643835eeb3648e99ae (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-10-28T14:42:46Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ricardo Gomes Assunção - 2015.pdf: 6739728 bytes, checksum: acac71431ba03e643835eeb3648e99ae (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-10-28T14:42:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ricardo Gomes Assunção - 2015.pdf: 6739728 bytes, checksum: acac71431ba03e643835eeb3648e99ae (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-05-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The aim of this paper is to study the isometries and homotheties, known geometric transformations of the plane, by means of the congruence and similarity of plane geometric figures. In order to explore and facilitate the understanding of the concepts of these two geometric transformations, some activities with congruent and similar geometric figures are proposed in a manageable teaching materials which were created for this purpose, called isometric plane, and also in GeoGebra software. These activities were applied to a first-year high school class of the Instituto Federal Goiano - Campus Uruta´ı, and some comments (observed results) about this application, they are presented. / Este trabalho visa estudar as isometrias e homotetias, conhecidas transforma¸c˜oes geom´etricas do plano, por meio da congruˆencia e semelhan¸ca de figuras geom´etricas planas. Afim de explorar e facilitar o entendimento dos conceitos dessas duas transforma¸c˜oes geom´etricas, algumas atividades com figuras geom´etricas congruentes e semelhantes s˜ao propostas num material did´atico manipul´avel criado para esse fim, denominado plano isom´etrico, e, tamb´em, no software GeoGebra. Essas atividades foram aplicadas para uma turma de primeiro ano de ensino m´edio do Instituto Federal Goiano - Campus Uruta´ı, e, alguns coment´arios (resultados observados) acerca dessa aplica¸c˜ao, s˜ao apresentados.
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Invenire: um método evolucionário para combinar resultados das técnicas de sistemas de recomendação baseado em filtragem colaborativa / Invenire: an evolutionary approach for combining results of recommender systems techniques based on collaborative filtering

Silva, Edjalma Queiroz da 20 August 2014 (has links)
Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2014-12-18T18:42:03Z No. of bitstreams: 2 Dissertacao - Edjalma Queiroz da Silva - 2014.pdf: 3244366 bytes, checksum: 7c2506e59c6f1ebdc4608a6ff2ac207d (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2014-12-22T11:15:25Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao - Edjalma Queiroz da Silva - 2014.pdf: 3244366 bytes, checksum: 7c2506e59c6f1ebdc4608a6ff2ac207d (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-12-22T11:15:25Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao - Edjalma Queiroz da Silva - 2014.pdf: 3244366 bytes, checksum: 7c2506e59c6f1ebdc4608a6ff2ac207d (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2014-08-20 / Recommendation systems function as a guide, helping users to discover products of interest. There are various techniques and approaches in the literature that enable the generationofrecommendations.Thisisinterestingbecauseitemphasizesthediversityof options;ontheotherhand,itcancausedoubtthesystemdesigneraboutwhichisthebest techniquetouse.Eachoftheseapproacheshasparticularitiesanddependsonthecontext to be applied. Therefore, the decision to choose between the techniques is complex to be done manually. This work proposes an evolutionary approach for combining results of recommendation techniques (Invenire) in order to automate the choice of techniques and get fewer errors in recommendations. To evaluate the proposal, experiments were performed with a dataset from MovieLens and some Collaborative Filtering techniques. The results show that the combining methodology proposed in this paper performs better than any one collaborative filtering technique separately in the context addressed. The improvement varies from 3,6% to 118,99% depending on the technique and the experiment executed. / Sistemas de Recomendação funcionam como um conselheiro, comportando-se de tal formaaorientaraspessoasnadescobertadeprodutosdeinteresse.Existemváriastécnicas eabordagensnaliteraturaquepermitemgerarrecomendações.Issoéinteressanteporque enfatiza a diversidade de opções; por outro lado, pode causar dúvida para o projetista do sistema sobre qual é a melhor técnica para usar. Cada uma destas abordagens tem particularidades e dependem do contexto para serem aplicadas. Assim, a decisão de escolher entre técnicas se torna complexa para ser feita manualmente. Este trabalho propõe uma abordagem evolutiva para automatizar a busca pela melhor combinação de resultados de técnicas de Sistemas de Recomendação e produzir menos erros nas recomendações.Paraavaliaraproposta,foramrealizadosexperimentoscomumconjunto de dados daMovieLens e algumas das técnicas de Filtragem Colaborativa. Os resultados mostramqueametodologiadecombinação,propostanestetrabalho,temumdesempenho melhor do que qualquer uma das técnicas isoladas de filtragem colaborativa no contexto abordado.A melhora varia de3,6%a 118,99%dependendo da técnica e do experimento executado.
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Caracterização morfoagronômica de progênies de guaranazeiro

Fajardo, Juan Daniel Villacis 26 February 2016 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-11-30T15:17:06Z No. of bitstreams: 1 Tese - Juan D. V. Fajardo.pdf: 1097421 bytes, checksum: 1917d39a17d14e35ca1fed4547529859 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-11-30T15:17:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese - Juan D. V. Fajardo.pdf: 1097421 bytes, checksum: 1917d39a17d14e35ca1fed4547529859 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-11-30T15:17:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese - Juan D. V. Fajardo.pdf: 1097421 bytes, checksum: 1917d39a17d14e35ca1fed4547529859 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-30T15:17:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese - Juan D. V. Fajardo.pdf: 1097421 bytes, checksum: 1917d39a17d14e35ca1fed4547529859 (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The guaraná (Paullinia cupana var. Sorbilis (Mart.) Ducke) is a native plant valued by Amazonian peoples, especially by Sateré-Maue tribe in northern Amazon region on the border with the state of Pará. Research shows that guaraná has stimulating and therapeutic properties that make it an important input for chemical refrigerants, pharmaceutical, and cosmetics. The aim of the study was to evaluate genetic, estimate variance components for morphological characteristics, and production of guaraná progenies. In the experiment conducted in the city of Maués-Am / EMBRAPA were evaluated 36 progenies brothers guaraná means in experimental design of randomized blocks with two replications and six plants per plot for agronomic characters and fruit yield (g.plant-1.year-1) arranged in two rows of three plants, spaced 5 m x 5 m. The analysis of quantitative character production (g.plant-1.year-1) was based on the average production over six years. The average of the best individual production was 28,355 g.plant-1.year-1, which is ten times higher than the state average productivity. Progenies have enough genetic diversity for selection of progeny and senior individuals with controlled crossings or intercross could generate a base population with high productivity and sufficient genetic diversity increases the likelihood of recovery of superior genotypes. / O guaranazeiro (Paullinia cupana var. sorbilis (Mart.) Ducke) é uma planta nativa valorizada pelos povos Amazônicos, especialmente pela tribo Sateré- Maué no norte da região Amazônica, na fronteira com o estado do Pará. As pesquisas mostram que o guaraná tem propriedades estimulantes e terapêuticas o que o tornam um importante insumo para as indústrias químicas de refrigerantes, farmacêuticas, e cosméticos. O objetivo do estudo foi avaliar valores genéticos, estimar componentes de variância para caracteres morfoagronômicos, e da produção de progênies de guaranazeiro. No experimento conduzido na cidade de Maués-Am/EMBRAPA, foram avaliadas 36 progênies de meios irmãos de guaranazeiro em delineamento experimental de blocos ao acaso com duas repetições e seis plantas por parcela para os caracteres agronômicos e produção de frutos (g.planta-1.ano-1) dispostas em duas fileiras de três plantas, no espaçamento de 5 m x 5 m. A análise do caráter quantitativo Produção (g.planta-1.ano-1) foi baseado na média da produção ao longo de seis anos. A média da produção do melhor indivíduo foi de 28.355 g.planta-1.ano-1, que é dez vezes maior do que a produtividade média estadual. As progênies apresentam diversidade genética suficiente para a seleção de progênies e de indivíduos superiores que com cruzamentos controlados ou intercruzamentos poderiam gerar uma população base com alta produtividade e diversidade genética suficiente aumentando a probabilidade de recuperação de genótipos superiores.
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Isolamento de microssatélites e análise genética de ararinha-azul (Cyanopsitta spixii, Aves, Psittaciformes) / Isolation of microsatelites and genetic analysis of Spix\'s macaw (Cyanopsitta spixii, Psitaciformes, Aves)

Rafaella Sávia Monteiro 19 June 2015 (has links)
A ararinha-azul (Cyanopsitta spixii) é uma das aves mais ameaçadas do mundo e está extinta na natureza. Estudos estão sendo realizados para o manejo e conservação em cativeiro para futura reintrodução. Microssatélites são marcadores moleculares úteis para estimar parentesco entre indivíduos. Esse dado pode ser utilizado para minimizar os efeitos deletérios da endogamia e a perda de diversidade genética do plantel do programa de reprodução em cativeiro, recomendando pares reprodutivos. O presente estudo teve como objetivos identificar microssatélites polimórficos específicos para acessar o nível de diversidade genética da espécie e estimar o parentesco entre pares de aves para auxiliar o manejo genético da população. O genoma de um indivíduo foi parcialmente sequenciado na plataforma 454 GS FLX (Roche). Foram desenhados 25 pares de primers, sendo 20 para dinucleotídeos e cinco para tetranucleotídeos. Dezenove microssatélites puderam ser amplificados e foram testados quanto ao nível de polimorfismo em 12 indivíduos selecionados. Desses, 14 microssatélites foram polimórficos. Também foram usados dados de microssatélites heterólogos nas análises. Dois microssatélites apresentaram desvio do equilíbrio de Hardy-Wenberg e cinco microssatélites foram excluídos devido à presença de desequilíbrio de ligação. A probabilidade de exclusão de paternidade quando um parental é conhecido foi de 94,8% e a probabilidade de identidade foi de 0,00000793. A riqueza alélica média foi de 2,49 alelos por microssatélite, confirmando a baixa diversidade genética da espécie. Alguns alelos já foram perdidos no plantel atual em cativeiro. A população tem valor de índice de parentesco médio similar àquela de, no mínimo, primos de primeiro grau e alguns dos fundadores são muito aparentados. Alguns potenciais casais com baixo índice de parentesco r podem vir a ser importantes para o programa de reprodução em cativeiro. / Spix\'s macaw (Cyanopsitta spixii) is one of the most endangered birds of the world and is extinct in the wild. Several coordinated studies are being conducted for its management and conservation in captivity for future reintroduction. Microsatellites are useful markers to estimate relatedness between individuals. This information can be used to minimize the deleterious effects of inbreeding and loss of genetic diversity of captive birds, recommending less closely related pairs for the breeding program. The present study aims to identify specific polymorphic microsatellites to assess the levels of genetic variability of the species and the genetic relatedness among birds for the genetic management of the population. The partial genome of an individual was sequenced on a 454 GS FLX (Roche) platform. Twenty-five pairs of primers were designed, being 20 for di- and five tetra-nucleotide microsatellites. Nineteen microsatellites were amplified and tested in 12 selected individuals. Fourteen microsatellites were polymorphic. Heterologous microsatellites were also used in the analyses. Two microsatellites were not in Hardy-Weinberg equilibrium and five presented linkage disequilibrium. Exclusion paternity probability when one parental is known was 94.8% and identity probability was 0.00000793. Mean allele richness was 2.49 alleles per microsatellite, confirming the low genetic diversity of the species. The current captive population has lost some alleles. The mean relatedness among individuals was, at least, similar to the one between first cousins and some founders are very closely related. Based on the relatedness index, some unrelated potential couples can become important for the captive program.
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Princípio da similaridade para classes de campos vetoriais complexos / Principle of similarity for class of complex vector fields

Sabrina Graciela Suárez Calcina 26 February 2014 (has links)
Esta dissertação trata do Princípio da similaridade para as soluções das equações da forma L\'OMEGA\' = A(z) ·\'OMEGA\' + B(z) · \'BARRA\' \'omega\' , sendo L um campo vetorial complexo não singular e A,B \'PERTENCE\' \'C POT. sigma\' (\'R POT. 2\'), com 0 < \'sigma\' < 1. Aqui são apresentados resultados para o campo vetorial elítico L = \'PARTIAL SUP\' \'\'PARTIAL\' z e para classes de campos vetoriais elíticos degenerados / This dissertation deals with the Similarity principle for solutions of equations of the form L \'omega\' = A(z) · \'omega\' + B(z) · \' BARRA\' \'omega\' where L is a nonsingular complex vector field and A,B \'IT BELONGS\' \'C POT. sigma \' (\'R POT. 2\'), with 0 < \'sigma\' < 1. Here are presented results for elliptic vector field and for classes of degenerate elliptic vector fields
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Explorando conceitos da teoria de espaços métricos em consultas por similaridade sobre dados complexos / Exploring concepts of metric space theory in similarity queries over complex data

Ives Renê Venturini Pola 25 August 2010 (has links)
Estruturas de indexação para domínios métricos são úteis para agilizar consultas por similaridade sobre dados complexos, tais como imagens, onde o custo computacional da comparação de dois itens de dados geralmente é alto. O estado da arte para executar consultas por similaridade está centrado na utilização dos chamados \"Métodos de Acesso Métrico\" (MAM). Tais métodos consideram os dados como elementos de um espaço métrico, onde apenas valem as propriedades fundamentais para que um espaço seja considerado métrico, onde a única informação que os MAMs utilizam é a medida de similaridade entre pares de elementos do domínio. No campo teórico, espaços métricos são extensamente estudados e servem de base para diversas áreas da Matemática. No entanto, a maioria dos trabalhos que têm sido desenvolvidos em Computação se restringem a utilizar as definições básicas desses espaços, e não foram encontrados estudos que explorem em mais profundidade os muitos conceitos teóricos existentes. Assim, este trabalho aplica conceitos teóricos importantes da Teoria de Espaços Métricos para desenvolver técnicas que auxiliem o tratamento e a manipulação dos diversos dados complexos, visando principalmente o desenvolvimento de métodos de indexação mais eficientes. É desenvolvida uma técnica para realizar um mapeamento de espaços métricos que leva à atenuação do efeito da maldição da dimensionalidade, a partir de uma aplicação lipschitziana real baseada em uma função de deformação do espaço das distâncias entre os elementos do conjunto. Foi mostrado que uma função do tipo exponecial deforma as distâncias de modo a diminuir os efeitos da maldição da dimensionalidade, melhorando assim o desempenho nas consultas. Uma segunda contribuição é o desenvolvimento de uma técnica para a imersão de espaços métricos, realizada de maneira a preservar a ordem das distâncias, possibilitando a utilização de propriedades no espaço de imersão. A imersão de espaços métricos no \' R POT. n\' possibilita a utilização da lei dos cossenos e assim viabiliza o cálculo de distâncias entre elementos e um hiperplano métrico, permitindo aumentar a agilidade à consultas por similaridade. O uso do hiperplano métrico foi exemplificado construindo uma árvore binária métrica, e também foi aplicado em um método de acesso métrico, a família MMH de métodos de acesso métrico, melhorando o particionamento do espaço dos dados / The access methods designed for metric domains are useful to answer similarity queries on any type of data, being specially useful to index complex data, such as images, where the computacional cost of comparison are high. The main mecanism used up to now to perform similarity queries is centered on \"Metric Acess Methods\" (MAM). Such methods consider data as elements that belong to a metric space, where only hold the properties that define the metric space. Therefore, the only information that a MAM can use is the similarity measure between pairs of elements in the domain. Metric spaces are extremelly well studied and is the basis for many mathematics areas. However, most researches from computer science are restrained to use the basic properties of metric spaces, not exploring the various existing theorical concepts. This work apply theoretical concepts of metric spaces to develop techniques aiding the treatment and manipulation of diverse complex data, aiming at developing more efficient indexing methods. A technique of mapping spaces was developed in order to ease the dimensionality curse effects, basing on a real lipschitz application that uses a stretching function that changes the distance space of elements. It was shown that an exponential function changes the distances space reducing the dimensionality curse effects, improving query operations. A second contribution is the developing of a technique based on metric space immersion, preserving the distances order between pairs of elements, allowing the usage of immersion space properties. The immersion of metric spaces into \'R POT. n\' allow the usage of the cossine law leading to the determination of distances between elements and a hiperplane, forming metric hiperplanes. The use of the metric hiperplanes lead to an improvement of query operations performance. The metric hiperplane itself formed the binary metric tree, and when applied to a metric access method, lead the formation of a family of metric access methods that improves the metric space particioning achieving faster similarity queries
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Artrópodes ectoparasitos de roedores do sudeste do Brasil = uma abordagem ecológica dos fatores que influenciam as abundâncias e as similaridades das faunas de ectoparasitos / Arthopod ectoparasites of rodents in Southeastern Brazil : an ecological approach of the factors influencing the abundances and similarities of ectoparasite fauna

Fernandes, Fernanda Rodrigues, 1983- 19 August 2018 (has links)
Orientador: Arício Xavier Linhares / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-19T01:31:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Fernandes_FernandaRodrigues_D.pdf: 1975248 bytes, checksum: d23780751c399131a44ca6f88c69adb5 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: Parasitismo é considerado uma interação interespecífica antagonística, em que uma espécie (parasito) vive dentro ou sobre outra espécie (hospedeiro), obtendo dela parte de, ou todos seus nutrientes e em geral, causa algum grau de injúria à espécie hospedeira. Por um processo coevolutivo, os artrópodes parasitos desenvolveram mecanismos para aumentar sua aptidão explorando seus hospedeiros mamíferos, por outro lado, estes se esforçam para maximizar sua própria aptidão, minimizando o efeito negativo da infestação por parasitos. Devido muitos padrões da ecologia dos parasitos estarem intimamente ligados à ecologia do hospedeiro, o presente trabalho teve como objetivo investigar a influência do sexo, tamanho corporal e local de ocorrência dos hospedeiros na abundância de ectoparasitos, bem como, a influência da filogenia e sobreposição geográfica dos hospedeiros na similaridade de fauna de ectoparasitos. Os principais resultados obtidos foram: 1. A abundância de ectoparasitos Anoplura em Oligoryzomys nigripes é influenciada pelo sexo e local de ocorrência do hospedeiro; 2. A abundância de ectoparasitos Acari (Mesostigmata) em Oligoryzomys nigripes é influenciada pela massa corporal do hospedeiro; 3. As similaridades das faunas de ectoparasitos estão correlacionadas com a filogenia dos hospedeiros / Abstract: Parasitism is considered an antagonistic interspecific interaction where one species (the parasite) lives in or on another species (the host) obtaining part of or all of its nutrients and normally causing some degree of injury to the host. Through the coevolutionary process, arthropod parasites have developed mechanisms to increase their fitness by exploiting their mammalian hosts, on the other hand, the hosts strive to maximize its own fitness by minimizing negative effects of infestation by parasites. Because many patterns of parasite ecology is intimately related to the ecology of the host, this study aimed to investigate the influence of host sex, body size and locality in ectoparasite abundance, as well as, the influence of phylogeny and geographical overlap of the hosts in ectoparasite fauna similarity. The main results are: 1. The abundance of Anoplura ectoparasites on Oligoryzomys nigripes is influenced by host sex and locality; 2. The abundance of Acari (Mesostigmata) ectoparasites on Oligoryzomys nigripes is influenced by host body mass; 3. The similarities of ectoparasite fauna is correlated with host phylogeny / Doutorado / Doutor em Ecologia
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Analysis of similarity and differences between articles using semantics

Bihi, Ahmed January 2017 (has links)
Adding semantic analysis in the process of comparing news articles enables a deeper level of analysis than traditional keyword matching. In this bachelor’s thesis, we have compared, implemented, and evaluated three commonly used approaches for document-level similarity. The three similarity measurement selected were, keyword matching, TF-IDF vector distance, and Latent Semantic Indexing. Each method was evaluated on a coherent set of news articles where the majority of the articles were written about Donald Trump and the American election the 9th of November 2016, there were several control articles, about random topics, in the set of articles. TF-IDF vector distance combined with Cosine similarity and Latent Semantic Indexing gave the best results on the set of articles by separating the control articles from the Trump articles. Keyword matching and TF-IDF distance using Euclidean distance did not separate the Trump articles from the control articles. We implemented and performed sentiment analysis on the set of news articles in the classes positive, negative and neutral and then validated them against human readers classifying the articles. With the sentiment analysis (positive, negative, and neutral) implementation, we got a high correlation with human readers (100%).

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